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LotjaGi3g1v0240700.12

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0240700
Transcript ID LotjaGi3g1v0240700.12
Related isoforms 11
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase, putative; TAIR: AT3G58640.1 Mitogen activated protein kinase kinase kinase-like protein; Swiss-Prot: sp|Q05609|CTR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase CTR1; TrEMBL-Plants: tr|K7M2I9|K7M2I9_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0240700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:38957615..38972001) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AATGGGTAGGAAGCAATAGCTTCCTATAGGAGCTTGGCTCTGGTCAGTCTAGGAAAGGCTTTTCCTTCTCTGTAACGATT TCCAATTCATCAATAAACAATCCTGATTACTGTTTCATTGCTTTCAGTTCTATTTTCTGTTTTGGGTTTCCATCACTTCT CAATAACCTCTACCCATTCATGGATAATACATGTATCGTTTGACTTTGTTGCAGTATCCTGGTTCTTGCTGTAATGACTT TTCCGACTCATTTTACTGTTGCTAATTAATTTAATAATGTGCAGGAGACAAGACTCAAGGAACGTTTTGATAGTATTCCT ACCTTGGATGAGCTTCATGCTCTGGGTGGAGAGGGTTTAAGGGCTGATGTCATTCTTGTGGATTTAGAGAAAGATAAGAA GCTATCCATGGTGAAGCAACTGATTGTGACATTAGTCAAAGGATTAAACTCAAACCCAGCTGCAATAATTAAGAAGATAG CTGGATTAGTATGTATTTTACTATATCTTATTGCTTAGCTCTTGTTTTATGTAAATAAGGATATCCTAGTGTATCATTGT TGCTTCATTGTCATCGTTGGTATGTTAACTTTTCATTGTACAGGGATGTGTTCTATAATTTCAATGCATACTGTTTCAAA TAATGCAACTACTCAATTATATTGTCAACTAATTTTAAAATAGTCATACTATAGACTTTTCAAGGAATGAGTTAATTTAT TTTTATTTGCCTTGATATTTTTTTCTTTCTGATTTTAGTCCGCCTTAACTTTGTTTTTAAAGAAACCAATTCCTTATAAT TGTTAGTTATGAGTCGGTTGATGGGCATTACAGGGATTAGATCAATCATGTATTGGGAATTGGACTTTGTTTTAAGTGCC TCCTTTTATTTTTAGTTTATTTTCTAAGCTTAGTTAGAGGTCTTTTGCATTTATTTTGATCTCTATGTTTGTACAGGTTT 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CGTTGTTTTGTTGTTTTAATTGTGTATTGTCTTGTTTGTTTGCTGATTTATAAGTTGTTTGAATGTTGTGATAACACATG ATTATTCACTGTAGGGCTGTACGGGCAATGAATGAAACACTAAAGCAAAATCGTCTTCTGAGAGAACAAGGGGATGATAA CTCATTCTCCCATTCTCCAAACAACAGAAGTACTGATGCAAATCTTCAGAAAAATGTATGTCTGCATTATTTTGGTAACA GAGGAGTGTGATATTATTTAAACCTTCTTTCTATGTCTGTGCATCTTTCAGCATCTCATTGAACAATTCTCTATATCTTT CTTCTAAACTATATCTTTCACCTAGTGTTTTGATAGTCCTGATGAATTTGTACCCTTCATTTTGTTGACAGACTCACATT TCTCTCCTCATCTGTTTCTTGAAAATCATTTTTTGTGGTTTGCAGATTTCTTTATGCAGTTTTTGGTTTAAAGAAGGGGG GGAGAGGGATTTTAACTAGACATTCTCTTTGGTTGAGAGGAGCGATGTGAGGGATTTTGAACCTAATTTACTTTTATACC CTTAGTGGAAAGTATATTTGAGTCAATGTATGAGTAATTTTTTAAACTCATCCTCTCTCCCCTCTAAATCTCTCAAATAT TGGAGGGGAGCCAAATTGAGTGAGGAGGGACTTGGGCTTCCTCCATTCTCCTCCCCTTTGAAATATTCTCCATTTTACTC CAACCAAACCCTTATAGTTGACTTGGCTGTTGTCTGATGGAAATTTCTCTACGTTTGTCTTATCTTTTGCTTTGTTTCTT TTAATATTTTCCGCTCCATAATGATTTCCAGAGTTTTTTCTGTCACCCAAAATCTTTTACTTGCAATTTCTTATAGAGAC AGTTCTTATCTGAGTGATTTGTATTCGAAGAAAATTCAAATACTTAGGGAAGATTATGCAATGTACTGAAAAATTGAAAG ATGGTTTTGATCTGGTATAAGTGATGCCTGCCAAATAAAAATACATCTGGGTACCATGGGTTAATTACATAAAACAGAGT ATAAATCTAGAATAAGAAATGAACCTAGGCATCACACAATCTAGAAAGAGCTATATGCTGTTCTTTAAAGGCTGTTTTTA CCCCATGTAAAGGAATGCACTCCGGCCATTTAAATAGACCTTCTGTAATTTATCCCACTAATATTAAAATCCTAATTCTA TAAGGATTGAGACTCTAGTCTATACTAATGCTAAACCCATGAGGGAGATTTATAGATTCAAACAAAACTCAGTAACGCCT AAATAGCATAAACAAAACCCAAGTGCAATACTAGACCAGGAAATACAATAAACACAGAACTTCCCCTTTGATCCAAGTGC TATCCCAGACTAGGAAATACAACAAACACAAAACTGTCACTATGACATTCCTTATGACTAATGTCATACTATCTATATCA AAAGCTTAGGTTGTAAGGTGAAGACATATGAATGGCTTATATTATATTTCTGACATGCCCCTTCATGCAAGAGCCCTTTG CTTTTGAAGGTCGTGGGACATTGTGGACTGTACCTCATGCTGAAACTTAATTACTGATTAGAAGAATGGGGGCAAGCAAA GATTGAATTTTAGACCATTTGATCATAAATAATTTAATACTATATCATGAGCTGACTATCCCATAGCTGTTACTGAAGAC ACATCGATGGTTTTATATTATATTTCTATCAATCTAAGTCAAAAAGTAACACTTACTAACTCTAAGAACTGTAAATAGTT TTGTCTAAGCCAGAATATTGAGACAAATTAGTTTTAAACTTGCTCTTCATTTGGGCTAGTGCGTCCTGCATCAGGTTGGC CTTCCAATCCCAGCCCATTTAAAATTCTAGGTTGTATTGAATTTCCTGTTTTGTTTTTCATGATTGGTGATTGTTGGAAA 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AGTATCCTGACTCTAGTTTAAGATGGTGAATTTGTGAGAATGGGATTGATAGTGATGTGTTTTATAATGAATCATTAAAA TACCGAATGATGTGTTTGCTAAGAAATTATAGGGGGTTACAGCTCGTGGTATAACTCAAAATTATTGAGGTACATGTAGT AGGACCATTGTTGTCAAATATCCGCCACGGCGGAATTCTGGCAAGCCGCCATGGCCAATATTCTGCCATCCGCCATAAGT ATTTGTCAAATATGGCCTGGGCATAAGTGATGAGGACACATCATAAATGCAAAGTGTTCCGTAAAGATATACTTGCAAAA GAGATCAGGAATTCTGGATAATGAAATTTGAATCGGCCTAGATCAAAGAAAGAAGTTCTGTTGAATAAACCAAAATGTTC TGTTTTTAACATGATAGAAGGATACTATAGCTTACGGATGTGCTTTTCTTCTTCCTTGCTTTATTTAAACGTGGGGTAAC AAGGCTATAAAACGGAGATATGTAAAACGGATTGTTGCAGCTTTCTCCGATTACGCCGACCAAACATATGTCCGGGTTGT TGCAACTACATGTTCCTTATCAAGGTCATGTAAAACGGATTGTTGCAGCTTCCAAGGCTATAATCCCTTGCAACTACTTT AATGTGTGTTTCGTAATTTAGGGGCTGGTAATCATCTGTTTCTCAATGCTGTACTGTAAAACCTTTGGAACAAGCTTTTT GTATGTATGATTGCCTTGGTGTTTAAGTTACCTTCAAACACTTGATTTTATGTTTCTGGAGGTACAAGAAAGGAATATCT GGAGGTGATATACGTTGTCAGAAAGTAGTTTGGTTTATTTAGTTGGCATATATGTTTGCGATGCAATTTTAGGCAGAACT GTTATTGGGCTTTAGAAAAATATATAGTCCATTTGGCATGTTTGTGGCTTGTAGTCTGTGGCATATTGCTATATCAAGCG ATTGTGCTTGAGGGATGATTTATGATGAAATTTTTACTTGACCATTGATATATTATTCTTTTTCAGGCTTCTTTGGAGAA GTCTTCCGTGGTGTATGGAACGGCACAGATGTTGCTATCAAGGTTTTTCTGGAGCAAGATTTAACTGCTGAAAATATGGA AGATTTCTGCAATGAGATATCTATTCTGAGGTAGCTGGTTGTTTATATTCTGTTTGTCTGACTTCTTCTATCCAACATTT TCTGACTCTTTTTTTGAATTTGGTATTTGTTTTCCTCCAGCCGACTCCGACATCCTAATGGTAATCTCCAACATTTTGAC TATTTTTTTTTATAGTTATGGCTTTGCATTGATCTTGCATATTTTATTTCCTAGGTATGGTAATTAATTAAAGTGAATCT GCATGGGTTCCTTTTACTGATTCATAGTAAAATCTTCGATTCTCATGAGTATGAAAATAATACTATGCAGGCTTGAATGC TTGATTGCAAGAATATATCTTCCAGCACTTACCCTTCCAGTTGATCTGTTAGTTATTTATTAAGTGATGAAACTGTATGC AGTTATCTTATTTCTTGGTGCATGCACGAAGCCTCCACGTTTGTCAATGGTCACAGAATATATGGAGATGGGATCATTGT ATTACTTGATACATTTGAGTGGTCAAAAGAAAAAGCTCAGTTGGCGGAGGAGACTAAGGATGCTGCGTGACATATGCAAG TAAGATTAAGGTTATGCATAATTATCACAATGTCTGGCGTTTATGCTAAACAGATGTTACATATTAAATCTTTTCCTCTT CCAATAAATCATAAAGTCCCTGTCCATTCAATTTGTCAGTGTTTCATGACCTATTTTTTTTCTTTTCCAATTGGATGAAG AGGGTGATAAAAGTTTTTTTTTTTTCATCAGTCCTTTATTGAGACAGGTGTGATCCATAGTGAACAATGAAAAATGACTG ACTTTCCCCATCATGAAAGATAACTGAGACTTACTATTAAATAGAAGGTTTAGGCTTTACTACTGCATGTTATCAAATGC CAGATAACCTACCATTTCAGTGAAGCCATTATACGTTGAATCGAAATTGTGTTTTGTAAGACCACTGCCGGTGTAGACAA ATTTCTAGCGCTACCTCTTATTTTTACTATTAAATAATTTGGGTGGGGTTGTTTTACTTCATTTCGATGTAAATTTGTCT CCCCATATTGAAATGATTTCGTTTGATCTATGAAAACTGATGAGAACACCTTTGTTGTGTATAGGGGATTGATGTGCATA CACCGCATGAAGATTGTTCACCGTGATGTGAAAAGTGCAAATTGTCTGGTGAATAAGCATTGGACAGTGAAAATCTGTGA CTTTGGGCTTTCAAGAATAATGACAGATTCTAACATGAGAGATTGTTCGTCAGCTGGAACTCCAGAATGGATGGCTCCTG AACTCATCCGAAATGAACCTTTCTCTGAAAAATGTGATATCTTTAGCTTTGGGGTGATAATGTGGGAGCTCTGTACCCTG AACAGACCATGGGAAGGTGTACCACCTGAAAGGGTATAATATATTCAACAGATTTGTGCATTTTCCTTGATGACTTTTAC TTCTGTTGTGCAAGGCATTGAAAAATTTTCATTTTTTCTCTGCTGATGATCAGGTGGTCTATTCTGTTGCTAATGAAGGT TCCAGATTAGAGATTCCTGAAGGCCCGCTAGGCAGGCTGATTTCAGGTTCTACTTCTTTCCCTGTATCACATTTTGATGG CAGAACTTAGACCCATCCGGTTTAACTTAATTACTTCTGTTTATGTATATTTTTTTGTGCGCAGACTGTTGGGTAGAATC ACATGAGCGGCCGAGTTGTGATGAGATTCTTTCTCGTTTGGTGGACATCGAACACTCCTTGTGCTGA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0240700.12) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATAACTCATTCTCCCATTCTCCAAACAACAGAAGTACTGATGCAAATCTTCAGAAAAATATTTCTTTATTGCGTCCT GCATCAGTGTGACCAAGGAACTTCGCAAAAAGCAATGTCGTTGCCGTCTTCGCCACAGAACTATAGAGGTCAAGCTTCTG AGAGAAGTGGGCCTTCAAGATATGGAGTGAATGATGAGACAGAATCGACTTGGAATAAAGTACTTGAATCCCCGATGTTC AATAATAGACCCCTACTAGCATATGAGGAATGGTATATTGATTTCTCAGAGATAACTGTTGGAACTCGTGTAGGGATTGG CTTCTTTGGAGAAGTCTTCCGTGGTGTATGGAACGGCACAGATGTTGCTATCAAGGTTTTTCTGGAGCAAGATTTAACTG CTGAAAATATGGAAGATTTCTGCAATGAGATATCTATTCTGAGCCGACTCCGACATCCTAATGTTATCTTATTTCTTGGT GCATGCACGAAGCCTCCACGTTTGTCAATGGTCACAGAATATATGGAGATGGGATCATTGTATTACTTGATACATTTGAG TGGTCAAAAGAAAAAGCTCAGTTGGCGGAGGAGACTAAGGATGCTGCGTGACATATGCAAGGGATTGATGTGCATACACC GCATGAAGATTGTTCACCGTGATGTGAAAAGTGCAAATTGTCTGGTGAATAAGCATTGGACAGTGAAAATCTGTGACTTT GGGCTTTCAAGAATAATGACAGATTCTAACATGAGAGATTGTTCGTCAGCTGGAACTCCAGAATGGATGGCTCCTGAACT CATCCGAAATGAACCTTTCTCTGAAAAATGTGATATCTTTAGCTTTGGGGTGATAATGTGGGAGCTCTGTACCCTGAACA GACCATGGGAAGGTGTACCACCTGAAAGGGTGGTCTATTCTGTTGCTAATGAAGGTTCCAGATTAGAGATTCCTGAAGGC CCGCTAGGCAGGCTGATTTCAGACTGTTGGGTAGAATCACATGAGCGGCCGAGTTGTGATGAGATTCTTTCTCGTTTGGT GGACATCGAACACTCCTTGTGCTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0240700.12) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MITHSPILQTTEVLMQIFRKIFLYCVLHQCDQGTSQKAMSLPSSPQNYRGQASERSGPSRYGVNDETESTWNKVLESPMF NNRPLLAYEEWYIDFSEITVGTRVGIGFFGEVFRGVWNGTDVAIKVFLEQDLTAENMEDFCNEISILSRLRHPNVILFLG ACTKPPRLSMVTEYMEMGSLYYLIHLSGQKKKLSWRRRLRMLRDICKGLMCIHRMKIVHRDVKSANCLVNKHWTVKICDF GLSRIMTDSNMRDCSSAGTPEWMAPELIRNEPFSEKCDIFSFGVIMWELCTLNRPWEGVPPERVVYSVANEGSRLEIPEG PLGRLISDCWVESHERPSCDEILSRLVDIEHSLC 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 33 354 322 5.7E-205
PANTHER 33 354 322 5.7E-205
MobiDBLite 37 65 29 -
SUPERFAMILY 73 346 274 1.11E-78
Gene3D 92 176 85 6.8E-31
ProSiteProfiles 98 354 257 40.16
SMART 98 347 250 7.1E-60
Pfam 99 346 248 7.4E-62
CDD 104 346 243 9.49725E-122
ProSitePatterns 104 125 22 -
PRINTS 172 185 14 1.4E-9
Gene3D 177 352 176 2.7E-54
PRINTS 211 229 19 1.4E-9
ProSitePatterns 217 229 13 -
PRINTS 258 268 11 1.4E-9
PRINTS 277 299 23 1.4E-9

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0240700.12, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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