Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0544700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0544700.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Heat shock protein; TAIR: AT4G25200.1 mitochondrion-localized small heat shock protein 23.6; Swiss-Prot: sp|P46254|HS22M_PEA Heat shock 22 kDa protein, mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|A0A072TL89|A0A072TL89_MEDTR Small heat shock protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0544700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:96073619..96086473) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGTTCATTTCGATACGGCCCAACACAAATTTAACAAAAAAAAAATCGGTATTAAATTTGCTTGCTCCCCAAGTAGTAGCA GAAACTTCCAGATTATCTCTGCTTCACTCTGGAACCTTCTGGACCTTCTACACTCTTCACTCTTCAGCATTGCCCTACTA TATATACTACACACTCTTCTCTCCCTCCATTCCAAAGCACACACCACAACACACATCTCTCTTCACTTGATCCATTCCTC TGCAATACAATGGCTTCCTCTCTCGCCGTGAAGCGCCTCCTCTCCTCCTCCGGCCACCTCTCCAGGTCTCTCTTCCGCCC CGCTGCTACTGCTTCTGCTTCCCGCTCTTTCAACACCAACGCCATGCGCCGCTACGACGAGGCTTCCGATGAAAGCGACG TCGACGTCGACCGCCGCTCTGACCGTCGCGCTGCACGCCGCGATGATTTCTTCTCAGGTAGTCGTTATCGCTCCGTTTCC ATCACAAATTTCATTTCAATTCCGATCTAGCTAGTACCGTAGTCACTGTTTTGTTGTTTCCGCACTCTTAGGTTTTGTGA TTTCATGCGTATTATAGCTATGTTACTCCAGATTGAATGGATTTATGTGACTAAGTAGATTTCAATTCGAGTTTTCCCCA ATTTCGATTCGATTTCTTGAACTAGATTAGAATTTTCAGTGATTGTTGCTAATTATTACCTTTGATTTGCCTAAATGAAG AAAATATTAGTAAATATATGTGTGATTTTGATGGATAATCATGTTTTACTTACTATAATCTTTCATGTAGTAATTGATTT TGATCTGTGTTGGTTACTCTGAACTCAATGGTGGTGATTTCAGTGATGTTTGATCTTGCATGGTTTGTGTAATTGCAGAT GTGTATGATCCATTTTCTCCAACTAGGAGCTTGTTCCAGGTTCTGAACACGGTGGATCAGCTCATGAACAGCCCCTTCAT CACTCCTCCAACCAGGAGTCTGAGCCAGGTTTTGAACACGGTGGATCAGCTCAAGAACAACCCTCGTGGAGCTCGAAACG GCTGGGATGCGCGAGAGACAGAGGATGCTCTGCTTCTGCGTGTGAACATGCCTGGGCTGGGAAAAGAGGATGTGAAGATT GCTGTGGAGCAGAACACGCTGACCATCAGGGGTGAAGGTCCAAAGGAAAGTGAGGAGGAGGTTGGTGGTGGTCTTCGCTA CACCAGCAGGATTGACTTGCCGGACAAGCTTTACAAGATTGATCAGATCAAAGCTGAGATGAAGAATGGTGTGCTCAAGG TCACTGTGCCTAAGATGAAGGAAGAGGAGAGGAGTGATGTGTTCAATGTCACGGTTGATTAGAATAACTTTTGATGATAT ATCAAGTGACTTATAACTTTGTTGAATGAACTTGCTTTTTGAGGGTATTTTGTGAATGGTGTCTGTTCCTCAGTTGTTAA CTTTGTTGAAAGTAATGAATTAACTTGTTGGTTAAATCTAATTCTTACCTTATGAATCAGAGGAAAATTCCAGCTCTGCT CTCAAATATTGTTTCTTTTTTCCCAATTATAGCTGTTGATATCTGAATAAGTTAATGAGCAACTCAATCCATGATTGTCA CTCTATTTTGTTGACCCCAAAAGCTCATATTTGGCCATGCCATCCATTCTCATTGTTGACCAAAATCTTAACCTTGTCTT CTTTCAGTGTGGGCCTATCCTTCGATTGACTAAAATGCCCTCTGATTTGAAGGAGTTGCTTACACTTTTGAAGTCAATGG TTAAGATAGTTTTTGAGGATATCATGATAAATACTCTTCTCTAATGATTAATGAGTATAAATGGTAACGACGCGGTCGTG AACCTAAATAGGGGTGGAAGCAGGGAATGGCATATAAGTGGCATATAAGTGAACACTTTATGTATTATTATTCTCTTGAA TAGAACAATTTATTATATGCTCCCAAGTGATTGAAAACCATCAAAATTCAAACATGCAAACAAATGATGGCACTGTGGCT TTCTCTGCACACAATTTTCTCAATAAATAAATTTTGTTTAGTTGACTCTCAATATATATACAATAAAGTTTAATGCATAC CTGATGGAGGTAGTACACTATTGAGAAATAAGAAGAGAAAAAATATTAAATGATAAATGTGAAGTGAACGAAAGCGATAT ATAAAAAAAAAAAAAAAGGATTTTCATGATGTATACATTTTTAGTAGTACACATATCATTAACGGGATATAAAACTTTGG CCACAAAAGATGGTTTTACCACATAATCAAAACCAAATCAGCCACAGCCAACACCATAATGAAATTATGAGTTTTATATT TTAACTGCCACTACAGCTTAAAAATATGTAAACTTAATACACTTCAGTGATATTTTAACTACCACTTTTTGCAGACTTTT TGGCCAGGAATGCCGCCTCATACGCCGGTTTGGTGTGGATTGAGGAGGTACCGCCTGAAGTTAATGTTTTTGTAACCGCA GACCTTTTGACTTCTATGCCCCTATTTAATTGATAGCAGGTTCTTTTCAAAAAAAAAAAAACTACCACTTTTTTGGTGCA AGTTAGTGAGGCTTAAATACAGGGAAAAGCCCAAATTGTTTGGTCACACAGAAAGCCCAAACGTTCACGAGGCTAAACAA AATCATGTGGTAACCAGTTCTAATCTACCAACAAAAATGTTGTTATTAAAAATGGTCAATTTAATAAAGAAAAAAAAATA CTCATTGCGAACCGTTAAATGTTAATAATTCTTCTCCTCACACCTATGACCTACCTACCTCTGCAACCAACATTCCCATA TCCTCCAAATCCAATAGCCGACAATGCAAAAGTCAAAAATGGTTTTCCCAAGCCACGGTATGAAATAGTACATCCACAGA ATTTTTCTGAAATTTACATCCACAAGATTTGAAAACCAAATAATAGATCACTGTTTGCAATGGAACTATTGTATCCTCAT GCCGACTTAATTTTACAATAATCTAGTGACTCGAAATTTAATCTTCTTCTAAGGAAGGACTAGTAAGCCCTTCTTATAAG GAAACGTCACTCAAGGTTACTAATCATTGCCGAACTCTCGTACCCAACAACCTCTCTCAAGTTATTTTCTTTAAGCTTGT CCCTTTGCTAACTTAGCTCCGAAGTGCTAACGTGGAGGCAACCGCCGGAGCCATTCAAACACCGTCACAGCATCGTCTGC CGCCAACATTCTATTGTTCCCTTCCCACAGACTCTGTTGTATGGAGACTTGATTGAATTTGTCTTATCAAATCCATATAT GTATTTACTATTTTTTTGAAACTATATAACATTATATTAAAATCAAATCGCCATAGAGGCCAGTACATCCGAAACCACCA AAAGGGTCCAAAGCTGGCGGAACCTCTTCAAGCCAAACAACGTTGGGAAACTTGGAGGAGTTATTTGCCAAGAAATCAGC TACTGAGTTACCAGAACGACGAACAAAAGATAAATCAAAACTAATAAAAGATGAGACTAAGTCTCTACAGTCATTCAAAA CAGAAAATAAATAAGATGCACCATGTTTGTTCTGCTTCCAAGCCTCAAAGAGTTGCAAACAATCCGTCTCAAGAATCACT CTAAAGAATCCAAGGTCTCTAGCCAAAGACAAACACCACCGGAACGCCATGGCCTCCGCCACAAGGGAAGAAGGAGCGCC AACGAGCCCGTGAGTAGCAGCAGCCATACCATCTCCACTGGAGTTTCTTGCAATTATACCCATTGCACCTGTTTTTGTCA CATATATGTTTAGTAGCGATTTTCAACTGTTTTAATTAGTCACATATGTGTTTAGTAGCGATTTTCAACTGTATTAGTTT ATACTTATATAAACATTAGCAGCGAAAGAGATAGAAGAAAAAACAAGGGCACTGAATTGGGGAACAGGAAAATCATAGTT TATGTGTTACGTGAGGGTTTTCTAATAAAGTTTAATCTAAAGGTTAGAAATTTCTAATAGAGTTTGAATCATGTATTTAG TGTGGTTTTCCATGACGCAAGGTTAATAATTAATTGTTTAGTTGATGGGTTTTTTGGATTGATTACAGTAATAAATGAAC GTATTTAAGGTATTAAAACCAATTTGTAATCACTAATTTTAAAAAATAAATGAACTTAACGTTGCCACTAATTTTTCTAT TATAAAACAAAGATTTAAAAACAATTAAAACTAATTAAAACTATTTAAAGAATAAAATAATTAATGGTATAATTAATTAA AATTTTGACTGAGTATTAATGTGCAATAAAATTTTCATAATTCAACTCAATTTAATGTCTTTTTCAAATCATATTTTTAT TAAATAATAAATTGGGGTCCTTTTTTTTAAATACGTGATTTATAAGGAGGAGATGACTAAAAAAAGCAGAGGCTTGAGAG ATGCAAACTATATATTTACTTTTTGGATGAAATTCAGCTGAAAATAGAGGTGGGTTTTGTTTATTACCTTAATGTCTCTG ATACCCTCTGCTTGAAGGGCAGAGTAGAGAGTTCTCATGGCAGGAACAAGGCCACGGATCATGTTGGTATCACCCCAATG AAGAACCTCGCTACCAACATTGATTCTCGTCTGAGGATGAAACGGCTTGATGTGAGTCACAACCCATTGGCGAGCAGAAT CAATGTTCCTAAGCGCAGCTATGTCGCCGTTGGGTGCCGTGACAGTAACACCGATGCCGGTGCCGGCGAAAGCCTGGAGG ATCTGCGGGTTCACATCGAAGATCTTGACGCGGTCGATGGTGGTCCGTGTCTTGAGGAAGTTGGCCACGGCGGCAGGTGG AGGGAGGTTGTCGCCGAGGGTGCCGTAGTTGACTCCGATGGCATGGACGGAGGTGGTGGTGGCGGCAAGGAGGAGGAGGA GGAAGGTTAAGGTGGTGGTGGTGGTGGCTATTGTAACGAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGATGTTAGAAAGTCACATACAA CGATGAGGATAGTTGAGTTCTAAAGACATATAGAACTCAACTAAGATATAGTTTTTTTTTTTCACTCAAGGGATCCATTC CCTGGTGATAGTTGAGTTCTATAGACATATAGTCTAGAATTCAATCTCTATGCGGTGCGTATAGTTCTACATTTGTTGGG AGATGTCTACCCATCTAGCGTGATTTCAGCGCCTCGAGGGATTAATCTTATGACTACCAACGGTGATGATACCGTGGGTG AAAAAAAAGTTTATTCTTTGACATTAAAATTAGTTTGGTGATCATGTAACCCATATATTTTTTTTTCATATTAGATTTGT TTTCGTCTTCTTTTTCGATACTCGGAAACTCAAATCAATGTCACGCTTCGAATCCGGATTGAGACCTAATACCCATGCCG GTTTGAACCCTAATTGAGACACGAAACTCAATTTAGGGATGGTGGTGCATCTTGATGGCAGTTGGCAATGGATAGAACAA GGTGTTTAGGGTGGTGGAAATTGATCTTGGGTGTGGAAGAGGAGAAGATGGTGGAAATTGATCTTGGGTGTGGAAGAGGA GAAGATTTATAGATTTTAAAAAGCTTTAGATTTTTCCTAACGTCAAGGTTCGAAACCTCTTTGGATATGGATTTTTGGGT GGAGGTGAATGGTTTTCCCATGAAACTTTTTTGGACATAGGTATGTAGCTTTGGGTGGAGATGGCATGTTGTTGACTTTT GGATTATGAAGAGAGTGATGAAGAAGATGAATTCATGAAATATTTTTTTCTTTAATTTATTTTGAATGGAATATTTGGTT AACTTTTGGATGGAAGATGACGGAAGAGCGATAAGAGAGCAAAAGTATTGCACTTGAATGAAGTGAGAGACATTCTTTTT GTGCAATTTTTTTATTTAAGGGCAAATATATGAATTTTAAAAGGTAACTAGAATTTATATATTTAATTGGTTAATTTAAA AAAATAAATTGAAATATGTTATTTAAATAAAAAAGTTATTTAAAATTGGATGCACATCCATTAAACTCAAACTATATCTT ATGTCGTAATCTTTTTTTTTGGTCGATAATCTTATCTTATTCTATCTATCAAAGTATATATATATATATATAATTTGAAA CTTGCGAGAAACAAAGTCATATTGAAGCTGTTGCAGGCCCACGAAAAAATAATCAATCTTGTATAAATAAATAAATAAAT AAATAGTTTGTAGATGTGGAAAGTTTGAGAACATTAAGATTAGGTTTGGTATTTGGGAACAACCAAGCCAAGCCACCAAC CTTGTTCGTTCCTCTTTGATTGATTGATGGAAATCGTAACCGATGTTTTCCCTTCCGAACTCGTAATAGAAATCTTGTCA TGGCTTCCTGTGTTGAGCTTGATACGATTCAAGTGCGTTTGCAAGTCATGGAAATCCCTCATCTCTCACAACAAAGCATT CGCCAAACTGCAATTGGAGAGAACATCGCTCAAAATCAACCACGTAATCCTCACCTCCTCTGACTCCTCCTTCATTCCGT GCTCTCTGCCTCGCTTGCTCGAGGAGCCTTCGTCGATTATGGACCAGGACCAGGACAGGTGCCTCCGTTTGGACAAGTTC GAGTACAACGAGGTCATTGGATCATGTAACGGTTTGATCTGTTTGCACGCCGATTATTGTGCTCCTGGCTTCTGTTTCCG GCCCTGTAACCCTTCCACGCGCTTGAGGTTCGACAAGTCACCACCCTTAGCCTCAATGGGTTCCAGTCTCAATTTTGGGT TCGGTTATGATGTTTCATGTGACACTTACAAGGTCAGTTCAAATTTCAATATCAATTTAATTAATAACTTTGATTCACTC ATGTTATCATTTATTATATTATTCTCTCTTTGCTAGGTTGTGGTGGTGGTGTCTCAGCTTCGTCTTCGGGGTCTAAGACT GTGCAAAACAATGCTTCATTCCATCGGTGATACTTGTTGGAGAGAGATTTTGAGCGTCCCTGACGTCCCAATTGAGTTTC GTCAAATCAATGGACTGTTTGTAGGTGGCTGTGTTAATTGGTTAGCAAACAAATTCGAGCCATTTGAGCAGTTGGTGATT GTTTCCCTTGACATGCGTCAAGAGGCATACCGGTTATTGTCACTACCTCAGGGTACTTCTGAGCTGCCTTCTGCTGAGAT ACAGGTTTTGGGGAATTGCCTTTGCCTTTTTTATGACTTTAAGAGAACCCATTTTGTTGCCTGGAAAATGAGTGAGTATG GAGTTCCAGAGTCTTGGACTCCTTTGCTGACTATCAGTTACGAACATCTTCGATGGGATCATCGTTTTTATCTTAATCAA TGGCTCATATGCTTGTGTGGAGATGGACACATCTTTATGCTCGCCAAAAAACAGAAATTGGTTATCATATATAATCTAAG TGATAATAGTGTGAAATATGTTGAACTTGCCAGCAACAAACTTTGGTTGGATGCCAATGATTATGTAGAGAGTCTGGTTT CACCATGTTAAGATTAAGCTCATCCGTGACAGTTTGTTTTTCCCAATTTATCTTTAATTATTATGTTATGTAAGAGGTGA TTACTGTTATTTAACTTTAATAAATTTACTAATTCGTCACTGACTTTATTGGCTGTTGTTAAGCTTCTTTGGTGCTTCAA AAGGTCGCAGATTAAGATGCTAGTTATTATAATTTGGACATATGCTTAGATAAAAGTGATTACTTTTAGAACATAATTTG TTGATTTTTTTTTATAAGCACATAATTTGTTGATAATTCCATATAGTTAGTTATTTTGTGTTTATCTAAACTGAAAACTT ATTTGTTTGCATAAGCGGATTATTTTAGCTAAAATATATTAAAACCATTCAAATTGTAAGGTGTGATTGATAGTACAAAA TAATTTATCTACCCTACTTAAATGCAGAAAAAGGCTAAACAACAGTGACAATTAAGAAAAGTAGCAGAGCAGATAATCAT AACAGATCAGTTCAAAAGGATTAGGACACGAGCGATTTTCATAGTAAAAGCTTGCCTTAATCTAATGCAATTGCAGATTT CATCCGAGTATTCAATTGTCATTTTTCTTATCTGCATAGCTAGACAGCACAAGCCTTTGCAGGAGAAGGTCTTTAGTATT TATTACAACATATATATTTGCAAACAACATTTGATAAATTGTATCCAACCCCAGATTTATTTCTGAGTTGAAACTGATAT AGTCAGGGAACAAGTAGTACGAGTGGTCACTGGCAGCCACCAGCTGCAAATCCAATCTTGGAATTGGCAACATCATAAGC CACCTTATATGTCTATTGGTGATAATTCCCTATAATGGCAATGGGGTTATTTTCAGCTTCCAGCAATGGCCAAACAAGTA ACTCCCTTGTCAAGTGCTATAAGGGTACTATAAGCCTTAAGTGGAAGATCAGCACCCCCACCAGATATCATTTGAATCTC AGGCATTAACACTATCCTTCAAACAAGAATCCAATATTGAAATTCCTGGTGCTTGTGTATACTTTTTGGACATCATCATC ACAAAAGAGTTGTTCTTCAGTGAGATATAAACTGGCATAGGTAGCCTTGTAATTACTGTACCAGAGTCTATGATAGTAGG CACCTTGTAACTTGATGCTGCTACTCCCAATGGCTTTCCTCCCACAGTAATATCTGTCAACTCCAGACAATATAAGCTGG GAAGCGTTGGGTTCTTAACCAAAGGAGTGAACTCGTATGATGATGATGATGATGATGTTGATGTCAATGACGACGTTCCA ATGGACAAGAAACCTTCATCGGAAGAGTTAGGAGCAGCAAAAGATGTGGGAAGCCTTCTCGGGGAAGGCAATAGGAGAAG GCATGACCAGATTGATTTTCTGGACACTTGTGCAAACATGGAGAGCTTGATTGTCCTGTCCACACCCAAATACACAACTT GATTATGTCTCATATGAGTCAAGGTTAGCATATCTTTGACTGAAATAACCAATTGAGAAACAAGTGTTACCAGATGCACT TAAACAACTTGGGGCATTGAGTATGGAGCCCTTGAGAGAGGAGCACTGAGAGGATGAACATGAAAAGGTTTTATGGGTCT TGGAAGTGGAAGAATTGAAGACGGGGCCAACCTGCACATGGTATAGTATGTAACACAAGGCTGGCACTGGAGCTGGAGCC AGGAGAGAGAGCTGCCAGTGTCTACAAGCATGGTAAAATACTTAGCAGGGGTCCCAATTCCTATTTTTACATAGTAATTT CCTGAGCCTATTGACAAACCTGATTTCAATTGTGTGTTCACAAGCTTTGAATGGTTAACTAATCTAGAAGAGGCGGTAGT ATCTGAATGGTTAACTAATCTGGAAAAGAGACCTGACACGCTCCTCATCTTTTATGAACATGCCAGAGAATGAAAATGGT AATATGGATTTTAGAGAGGAGTCAAGACCTGTAACATGATACAAATTGAGCTACATGCCAGCTTGCTTGTGCCTCAAATC ACTATCTGCAAAATGGATGGTTTGCAAGTTTAGACCTCATAATTACAAGCACAAATTCAGAATTTCATTCTAATATTGAA AAAACTCTAAACATTGCTGTCTTAAATTTGGTATCAAAGGTAACATTCTTGTAAATTAAAGAAAATTAAAAACTGCTAGA CAACAAAGGACACTAGAAGTTAATTATGGTGCGGCATATTAGCATAGTACAATCTCACAATGATTTTTTTTGCTTTTCAA TCAAGTTCTGAAATAGCTAGCAAGGTGTTGAGGTGCATATGCCTTCAAATTCCTTCACTAGAGAAGATGCTATTGCAAGA TGTGCCGAGAAAACAAGAAACCAGAAGAGGCTCATCCTATTTTGCTGGCTCTGCAAAATTGATTATGAGCTAGTTTCTTA CTCTTCCCTCAGCAGATACATGGTACACTAGAGCAACCAGAAACTTTTCCCTACCAATGAGGCAACTGAAAAATGTACAA AAATATTAGTTTATAGCATGGGGCCAAAGTTAAACTAGTGTCTTTAATTTGCAGCATTAGAGGATTGAATGCTTTAAATA CCCTCCAACCTGTTCGATATAATTCAGTTCGTTATATTTAATTATCTTTTATTATCTTCTGTTTTAGATAATTACTTATA GATATTGGTTTTAGATATTACTTATATTAGTAGGTTACTTGCTAATCAAGTAACCAGATAAGATTATATTTGTTTTGTTA ATTAAGGTCATATAATAGGACCAGACCGTATGTATTGTATTTTTTACGGATTTCAACAATAAAACAGGTTTTCTCCTATC TTTGTCTATCTCCCAGATTTTGTGTGTTAGTGCACTGTGAAACACTCGGACTAGATTATGTGACATGAGGTGAGGATCGC ATATGCAAGAATTGGGTTATTGGGTGCAAGGATTCAGGTGCTTTCCGTGGCTTGCAGTGAGTTTCTTCCTCAAGGATGGT CTCAATGTGGCACCTTCCACTCTCCAGCTTCTTCAGAATTCCGCCAATCTTCCCATGGTTGGTACACCCCTCTACGCTGT TGTTTCAGATTCTGTCTACATCTCTGGCCAGCATCGTGTTCCTTACATCGCCATTGGAGGTAATTGATAATTTATTGTTA TTGTGTGTATGATTATGAAATATGAATAGAAGGGTTTCATTCTTAGGAATAGGGTTTAATTTATTGTTAAAGCATAAAGG AAAAGGGAAGAGTAAAAAGGAGGATTGAGATTCCAGAATTTGGAATGGTTGGGTTTTCTTTGTGTATATAAAGGTATGAA TGTCATTGTTGCTTGAGCATAGAGATAGAATAAGTTAACACTTTGTCAGCTTCCTTGGGAAGGAAATGTAGCATATCACA ATTCCTTCTAGGAAGTAGTTAACAGATCAATGGTTTTGAATAGATTTCTTTTTTTTCATTTTTAATAGAAGAAGGGGTAG AAAGAGTGGTGATAACTAATAAGGAATCATCCTAAGAAAAACTCTTAAGAAAGCTAGAGGTCAAGCAGAAACTAAGCTAA CCCCCCTAGCAAAACTAATTTCAAAATCGATCTCGTATTCCTCTGTGAATGTGCTGTAACTCTGGGGCAGAGTAGCATTT TGCTTCTTTGAGTCTCTATTTTTTCCTCTTTTATCTGTTATTATTCTTGATTCTGTTACTATAATTAGAGCATACATTTT TCTATAACTCAAGTGTAAATACCAGGAGCTATCAGATTCCTAGAAGTAAAGTAGTAAACAATGTCCTGAACACTAAAGAG AGGCCAAATCTGCTGTTCTGCACCAGAGTATGACTAAGGAAAAAGAGTAAAAGACCTTCCTTTAAAATCCAAGAATAGAA GTATGGTGATCTCACTGCCAATGAACATTTCCCCTCCTTATACATGGTCACTTGGGAACTGGGATAAGACGTTGTAGTTG GTTGTTGAGTGTTCGTTGATTTGAACATCAACTATTCAAAATAGAGACATTTGAATCAGCATTATCAGCTTTCCCTCTAA CCAGTTGTTTTTATTATACAGAAACCAGATACTGTTTTTAAATTTTTTAGTAAAAAAATTCACTGACCTTGGAGCTTGTA TTTTATTGTCTTCTATTGTGGACGAAGCAAAACTGATAATAACATTTATTCAAGCCAATGCTTAGTACAGTTTCCAAGAA CACAAGCAAACACCACTTGGAATTTGGAATGCTGAAAGTACTCTCTTCATTCTGAATTTGTTTATTTCAAGTGCTATTTT ACTGTAGCAATTGCTAACTGGAGTCTCACTGTTAGTTTAGTTCCGATACATCCGTTCTACAGAAATATGTGTATTAGGAT CGTGAACTTATACTTTATACTTTTTATCTAAAAACTTGAGTCTGCTAGTTGGTTTTACCATTGTAAATAATGAGTTTTGT TGTTTCCGTCACTCTTAGGTTTTGTGATTTCATGCGTATTATAGCTATGTTACTCCAGATTGAATGGATTTATGTGACTA AGTAGATTTCAATTCGAGTTTTCCCCAATTTCGATTCGATTTCTTGAACTAGATTAGAATTTTCAGTGATTGTTGCTAAT TATTACCTTTGATTTGCCTAAATGAAGAAAAAATTAGTAAATAGATGTGTGATTTTGATGGATAATCATGTTTTACTTAC TATAATCTTTCATGTAGTAATTGATTTTGATCTGTGTTGGTTACTCTGAACTCAATGGTGGTGATTTCAGTGATGTTTGA TCTTGCATGGTTTGTGTAATTGCAGATGTGTATGATCCATTTTCTCCAACTAGGAGCTTGTTCCAGGTTCTGAACACGGT GGATCAGCTCATGAACAGCCCCTTCATCACTCCTCCAACCAGGAGTCTGAGCCAGGTTTTGAACACGGTGGATCAGCTCA AGAACAACCCTCGTGGAGCTCGAAACGGCTGGGATGCGCGAGAGACAGAGGATGCTCTGCTTCTGCGTGTGAACATGCCT GGGCTGGGAAAAGAGGATGTGAAGATTGCTGTGGAGCAGAACACGCTGACCATCAGGGGTGAAGGTCCAAAGGAAAGTGA GGAGGAGGTTGGTGGTGGTCTTCGCTACACCAGCAGGATTGACTTGCCGGACAAGCTTTACAAGATTGATCAGATCAAAG CTGAGATGAAGAATGGTGTGCTCAAGGTCACTGTGCCTAAGATGAAGGAAGAGGAGAGGAGTGATGTGTTCAATGTCACG GTTGATTAGAATAACTTTTGATGATATATCAAGTGACTTATAACTTTGTTGAATGAACTTGCTTTTTGAGGGTATTTTGT GAATGGTGTCTGTTCCTCAGTTGTTAACTTTGTTGAAAGTAATGAATTAACTTGTTGGTTAAATCTAATTCTTACCTTAT GAATCAGAGGAAAATTCCAGCTCTGCTCTCAAATATTGTTTCTTTTTTCCCAATT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0544700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTCCTCTCTCGCCGTGAAGCGCCTCCTCTCCTCCTCCGGCCACCTCTCCAGGTCTCTCTTCCGCCCCGCTGCTAC TGCTTCTGCTTCCCGCTCTTTCAACACCAACGCCATGCGCCGCTACGACGAGGCTTCCGATGAAAGCGACGTCGACGTCG ACCGCCGCTCTGACCGTCGCGCTGCACGCCGCGATGATTTCTTCTCAGATGTGTATGATCCATTTTCTCCAACTAGGAGC TTGTTCCAGGTTCTGAACACGGTGGATCAGCTCATGAACAGCCCCTTCATCACTCCTCCAACCAGGAGTCTGAGCCAGGT TTTGAACACGGTGGATCAGCTCAAGAACAACCCTCGTGGAGCTCGAAACGGCTGGGATGCGCGAGAGACAGAGGATGCTC TGCTTCTGCGTGTGAACATGCCTGGGCTGGGAAAAGAGGATGTGAAGATTGCTGTGGAGCAGAACACGCTGACCATCAGG GGTGAAGGTCCAAAGGAAAGTGAGGAGGAGGTTGGTGGTGGTCTTCGCTACACCAGCAGGATTGACTTGCCGGACAAGCT TTACAAGATTGATCAGATCAAAGCTGAGATGAAGAATGGTGTGCTCAAGGTCACTGTGCCTAAGATGAAGGAAGAGGAGA GGAGTGATGTGTTCAATGTCACTGTGCCTAAGATGAAGGAAGAGGAGAGGAGTGATGTGTTCAATGTCACGGTTGATTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0544700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASSLAVKRLLSSSGHLSRSLFRPAATASASRSFNTNAMRRYDEASDESDVDVDRRSDRRAARRDDFFSDVYDPFSPTRS LFQVLNTVDQLMNSPFITPPTRSLSQVLNTVDQLKNNPRGARNGWDARETEDALLLRVNMPGLGKEDVKIAVEQNTLTIR GEGPKESEEEVGGGLRYTSRIDLPDKLYKIDQIKAEMKNGVLKVTVPKMKEEERSDVFNVTVPKMKEEERSDVFNVTVD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 222 | 222 | 5.5E-81 | – | |
| PANTHER | 1 | 222 | 222 | 5.5E-81 | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 30 | 30 | - | – | |
| Gene3D | 59 | 222 | 164 | 8.1E-24 | ||
| ProSiteProfiles | 116 | 223 | 108 | 23.038 | ||
| SUPERFAMILY | 116 | 213 | 98 | 3.84E-24 | ||
| CDD | 126 | 208 | 83 | 4.24298E-22 | – | |
| Pfam | 127 | 217 | 91 | 5.7E-17 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0544700.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…