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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0544700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0544700.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Heat shock protein; TAIR: AT4G25200.1 mitochondrion-localized small heat shock protein 23.6; Swiss-Prot: sp|P46254|HS22M_PEA Heat shock 22 kDa protein, mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|A0A1C6ZYA7|A0A1C6ZYA7_MEDSA Mitochondrial small heat shock protein 23; Found in the gene: LotjaGi3g1v0544700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:96073641..96086381) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTATCTCTGCTTCACTCTGGAACCTTCTGGACCTTCTACACTCTTCACTCTTCAGCATTGCCCTACTATATATACTACAC ACTCTTCTCTCCCTCCATTCCAAAGCACACACCACAACACACATCTCTCTTCACTTGATCCATTCCTCTGCAATACAATG GCTTCCTCTCTCGCCGTGAAGCGCCTCCTCTCCTCCTCCGGCCACCTCTCCAGGTCTCTCTTCCGCCCCGCTGCTACTGC TTCTGCTTCCCGCTCTTTCAACACCAACGCCATGCGCCGCTACGACGAGGCTTCCGATGAAAGCGACGTCGACGTCGACC GCCGCTCTGACCGTCGCGCTGCACGCCGCGATGATTTCTTCTCAGGTAGTCGTTATCGCTCCGTTTCCATCACAAATTTC ATTTCAATTCCGATCTAGCTAGTACCGTAGTCACTGTTTTGTTGTTTCCGCACTCTTAGGTTTTGTGATTTCATGCGTAT TATAGCTATGTTACTCCAGATTGAATGGATTTATGTGACTAAGTAGATTTCAATTCGAGTTTTCCCCAATTTCGATTCGA TTTCTTGAACTAGATTAGAATTTTCAGTGATTGTTGCTAATTATTACCTTTGATTTGCCTAAATGAAGAAAATATTAGTA AATATATGTGTGATTTTGATGGATAATCATGTTTTACTTACTATAATCTTTCATGTAGTAATTGATTTTGATCTGTGTTG GTTACTCTGAACTCAATGGTGGTGATTTCAGTGATGTTTGATCTTGCATGGTTTGTGTAATTGCAGATGTGTATGATCCA TTTTCTCCAACTAGGAGCTTGTTCCAGGTTCTGAACACGGTGGATCAGCTCATGAACAGCCCCTTCATCACTCCTCCAAC CAGGAGTCTGAGCCAGGTTTTGAACACGGTGGATCAGCTCAAGAACAACCCTCGTGGAGCTCGAAACGGCTGGGATGCGC GAGAGACAGAGGATGCTCTGCTTCTGCGTGTGAACATGCCTGGGCTGGGAAAAGAGGATGTGAAGATTGCTGTGGAGCAG AACACGCTGACCATCAGGGGTGAAGGTCCAAAGGAAAGTGAGGAGGAGGTTGGTGGTGGTCTTCGCTACACCAGCAGGAT TGACTTGCCGGACAAGCTTTACAAGATTGATCAGATCAAAGCTGAGATGAAGAATGGTGTGCTCAAGGTCACTGTGCCTA AGATGAAGGAAGAGGAGAGGAGTGATGTGTTCAATGTCACGGTTGATTAGAATAACTTTTGATGATATATCAAGTGACTT ATAACTTTGTTGAATGAACTTGCTTTTTGAGGGTATTTTGTGAATGGTGTCTGTTCCTCAGTTGTTAACTTTGTTGAAAG TAATGAATTAACTTGTTGGTTAAATCTAATTCTTACCTTATGAATCAGAGGAAAATTCCAGCTCTGCTCTCAAATATTGT TTCTTTTTTCCCAATTATAGCTGTTGATATCTGAATAAGTTAATGAGCAACTCAATCCATGATTGTCACTCTATTTTGTT GACCCCAAAAGCTCATATTTGGCCATGCCATCCATTCTCATTGTTGACCAAAATCTTAACCTTGTCTTCTTTCAGTGTGG GCCTATCCTTCGATTGACTAAAATGCCCTCTGATTTGAAGGAGTTGCTTACACTTTTGAAGTCAATGGTTAAGATAGTTT TTGAGGATATCATGATAAATACTCTTCTCTAATGATTAATGAGTATAAATGGTAACGACGCGGTCGTGAACCTAAATAGG GGTGGAAGCAGGGAATGGCATATAAGTGGCATATAAGTGAACACTTTATGTATTATTATTCTCTTGAATAGAACAATTTA TTATATGCTCCCAAGTGATTGAAAACCATCAAAATTCAAACATGCAAACAAATGATGGCACTGTGGCTTTCTCTGCACAC 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TTACAATAATCTAGTGACTCGAAATTTAATCTTCTTCTAAGGAAGGACTAGTAAGCCCTTCTTATAAGGAAACGTCACTC AAGGTTACTAATCATTGCCGAACTCTCGTACCCAACAACCTCTCTCAAGTTATTTTCTTTAAGCTTGTCCCTTTGCTAAC TTAGCTCCGAAGTGCTAACGTGGAGGCAACCGCCGGAGCCATTCAAACACCGTCACAGCATCGTCTGCCGCCAACATTCT ATTGTTCCCTTCCCACAGACTCTGTTGTATGGAGACTTGATTGAATTTGTCTTATCAAATCCATATATGTATTTACTATT TTTTTGAAACTATATAACATTATATTAAAATCAAATCGCCATAGAGGCCAGTACATCCGAAACCACCAAAAGGGTCCAAA GCTGGCGGAACCTCTTCAAGCCAAACAACGTTGGGAAACTTGGAGGAGTTATTTGCCAAGAAATCAGCTACTGAGTTACC AGAACGACGAACAAAAGATAAATCAAAACTAATAAAAGATGAGACTAAGTCTCTACAGTCATTCAAAACAGAAAATAAAT AAGATGCACCATGTTTGTTCTGCTTCCAAGCCTCAAAGAGTTGCAAACAATCCGTCTCAAGAATCACTCTAAAGAATCCA AGGTCTCTAGCCAAAGACAAACACCACCGGAACGCCATGGCCTCCGCCACAAGGGAAGAAGGAGCGCCAACGAGCCCGTG AGTAGCAGCAGCCATACCATCTCCACTGGAGTTTCTTGCAATTATACCCATTGCACCTGTTTTTGTCACATATATGTTTA GTAGCGATTTTCAACTGTTTTAATTAGTCACATATGTGTTTAGTAGCGATTTTCAACTGTATTAGTTTATACTTATATAA ACATTAGCAGCGAAAGAGATAGAAGAAAAAACAAGGGCACTGAATTGGGGAACAGGAAAATCATAGTTTATGTGTTACGT GAGGGTTTTCTAATAAAGTTTAATCTAAAGGTTAGAAATTTCTAATAGAGTTTGAATCATGTATTTAGTGTGGTTTTCCA TGACGCAAGGTTAATAATTAATTGTTTAGTTGATGGGTTTTTTGGATTGATTACAGTAATAAATGAACGTATTTAAGGTA TTAAAACCAATTTGTAATCACTAATTTTAAAAAATAAATGAACTTAACGTTGCCACTAATTTTTCTATTATAAAACAAAG ATTTAAAAACAATTAAAACTAATTAAAACTATTTAAAGAATAAAATAATTAATGGTATAATTAATTAAAATTTTGACTGA GTATTAATGTGCAATAAAATTTTCATAATTCAACTCAATTTAATGTCTTTTTCAAATCATATTTTTATTAAATAATAAAT TGGGGTCCTTTTTTTTAAATACGTGATTTATAAGGAGGAGATGACTAAAAAAAGCAGAGGCTTGAGAGATGCAAACTATA TATTTACTTTTTGGATGAAATTCAGCTGAAAATAGAGGTGGGTTTTGTTTATTACCTTAATGTCTCTGATACCCTCTGCT TGAAGGGCAGAGTAGAGAGTTCTCATGGCAGGAACAAGGCCACGGATCATGTTGGTATCACCCCAATGAAGAACCTCGCT ACCAACATTGATTCTCGTCTGAGGATGAAACGGCTTGATGTGAGTCACAACCCATTGGCGAGCAGAATCAATGTTCCTAA GCGCAGCTATGTCGCCGTTGGGTGCCGTGACAGTAACACCGATGCCGGTGCCGGCGAAAGCCTGGAGGATCTGCGGGTTC ACATCGAAGATCTTGACGCGGTCGATGGTGGTCCGTGTCTTGAGGAAGTTGGCCACGGCGGCAGGTGGAGGGAGGTTGTC GCCGAGGGTGCCGTAGTTGACTCCGATGGCATGGACGGAGGTGGTGGTGGCGGCAAGGAGGAGGAGGAGGAAGGTTAAGG TGGTGGTGGTGGTGGCTATTGTAACGAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGATGTTAGAAAGTCACATACAACGATGAGGATAG TTGAGTTCTAAAGACATATAGAACTCAACTAAGATATAGTTTTTTTTTTTCACTCAAGGGATCCATTCCCTGGTGATAGT TGAGTTCTATAGACATATAGTCTAGAATTCAATCTCTATGCGGTGCGTATAGTTCTACATTTGTTGGGAGATGTCTACCC ATCTAGCGTGATTTCAGCGCCTCGAGGGATTAATCTTATGACTACCAACGGTGATGATACCGTGGGTGAAAAAAAAGTTT ATTCTTTGACATTAAAATTAGTTTGGTGATCATGTAACCCATATATTTTTTTTTCATATTAGATTTGTTTTCGTCTTCTT TTTCGATACTCGGAAACTCAAATCAATGTCACGCTTCGAATCCGGATTGAGACCTAATACCCATGCCGGTTTGAACCCTA ATTGAGACACGAAACTCAATTTAGGGATGGTGGTGCATCTTGATGGCAGTTGGCAATGGATAGAACAAGGTGTTTAGGGT GGTGGAAATTGATCTTGGGTGTGGAAGAGGAGAAGATGGTGGAAATTGATCTTGGGTGTGGAAGAGGAGAAGATTTATAG ATTTTAAAAAGCTTTAGATTTTTCCTAACGTCAAGGTTCGAAACCTCTTTGGATATGGATTTTTGGGTGGAGGTGAATGG TTTTCCCATGAAACTTTTTTGGACATAGGTATGTAGCTTTGGGTGGAGATGGCATGTTGTTGACTTTTGGATTATGAAGA GAGTGATGAAGAAGATGAATTCATGAAATATTTTTTTCTTTAATTTATTTTGAATGGAATATTTGGTTAACTTTTGGATG GAAGATGACGGAAGAGCGATAAGAGAGCAAAAGTATTGCACTTGAATGAAGTGAGAGACATTCTTTTTGTGCAATTTTTT TATTTAAGGGCAAATATATGAATTTTAAAAGGTAACTAGAATTTATATATTTAATTGGTTAATTTAAAAAAATAAATTGA AATATGTTATTTAAATAAAAAAGTTATTTAAAATTGGATGCACATCCATTAAACTCAAACTATATCTTATGTCGTAATCT TTTTTTTTGGTCGATAATCTTATCTTATTCTATCTATCAAAGTATATATATATATATATAATTTGAAACTTGCGAGAAAC AAAGTCATATTGAAGCTGTTGCAGGCCCACGAAAAAATAATCAATCTTGTATAAATAAATAAATAAATAAATAGTTTGTA GATGTGGAAAGTTTGAGAACATTAAGATTAGGTTTGGTATTTGGGAACAACCAAGCCAAGCCACCAACCTTGTTCGTTCC TCTTTGATTGATTGATGGAAATCGTAACCGATGTTTTCCCTTCCGAACTCGTAATAGAAATCTTGTCATGGCTTCCTGTG TTGAGCTTGATACGATTCAAGTGCGTTTGCAAGTCATGGAAATCCCTCATCTCTCACAACAAAGCATTCGCCAAACTGCA ATTGGAGAGAACATCGCTCAAAATCAACCACGTAATCCTCACCTCCTCTGACTCCTCCTTCATTCCGTGCTCTCTGCCTC GCTTGCTCGAGGAGCCTTCGTCGATTATGGACCAGGACCAGGACAGGTGCCTCCGTTTGGACAAGTTCGAGTACAACGAG GTCATTGGATCATGTAACGGTTTGATCTGTTTGCACGCCGATTATTGTGCTCCTGGCTTCTGTTTCCGGCCCTGTAACCC TTCCACGCGCTTGAGGTTCGACAAGTCACCACCCTTAGCCTCAATGGGTTCCAGTCTCAATTTTGGGTTCGGTTATGATG TTTCATGTGACACTTACAAGGTCAGTTCAAATTTCAATATCAATTTAATTAATAACTTTGATTCACTCATGTTATCATTT ATTATATTATTCTCTCTTTGCTAGGTTGTGGTGGTGGTGTCTCAGCTTCGTCTTCGGGGTCTAAGACTGTGCAAAACAAT GCTTCATTCCATCGGTGATACTTGTTGGAGAGAGATTTTGAGCGTCCCTGACGTCCCAATTGAGTTTCGTCAAATCAATG GACTGTTTGTAGGTGGCTGTGTTAATTGGTTAGCAAACAAATTCGAGCCATTTGAGCAGTTGGTGATTGTTTCCCTTGAC ATGCGTCAAGAGGCATACCGGTTATTGTCACTACCTCAGGGTACTTCTGAGCTGCCTTCTGCTGAGATACAGGTTTTGGG GAATTGCCTTTGCCTTTTTTATGACTTTAAGAGAACCCATTTTGTTGCCTGGAAAATGAGTGAGTATGGAGTTCCAGAGT CTTGGACTCCTTTGCTGACTATCAGTTACGAACATCTTCGATGGGATCATCGTTTTTATCTTAATCAATGGCTCATATGC TTGTGTGGAGATGGACACATCTTTATGCTCGCCAAAAAACAGAAATTGGTTATCATATATAATCTAAGTGATAATAGTGT GAAATATGTTGAACTTGCCAGCAACAAACTTTGGTTGGATGCCAATGATTATGTAGAGAGTCTGGTTTCACCATGTTAAG ATTAAGCTCATCCGTGACAGTTTGTTTTTCCCAATTTATCTTTAATTATTATGTTATGTAAGAGGTGATTACTGTTATTT AACTTTAATAAATTTACTAATTCGTCACTGACTTTATTGGCTGTTGTTAAGCTTCTTTGGTGCTTCAAAAGGTCGCAGAT TAAGATGCTAGTTATTATAATTTGGACATATGCTTAGATAAAAGTGATTACTTTTAGAACATAATTTGTTGATTTTTTTT TATAAGCACATAATTTGTTGATAATTCCATATAGTTAGTTATTTTGTGTTTATCTAAACTGAAAACTTATTTGTTTGCAT AAGCGGATTATTTTAGCTAAAATATATTAAAACCATTCAAATTGTAAGGTGTGATTGATAGTACAAAATAATTTATCTAC CCTACTTAAATGCAGAAAAAGGCTAAACAACAGTGACAATTAAGAAAAGTAGCAGAGCAGATAATCATAACAGATCAGTT CAAAAGGATTAGGACACGAGCGATTTTCATAGTAAAAGCTTGCCTTAATCTAATGCAATTGCAGATTTCATCCGAGTATT CAATTGTCATTTTTCTTATCTGCATAGCTAGACAGCACAAGCCTTTGCAGGAGAAGGTCTTTAGTATTTATTACAACATA TATATTTGCAAACAACATTTGATAAATTGTATCCAACCCCAGATTTATTTCTGAGTTGAAACTGATATAGTCAGGGAACA AGTAGTACGAGTGGTCACTGGCAGCCACCAGCTGCAAATCCAATCTTGGAATTGGCAACATCATAAGCCACCTTATATGT CTATTGGTGATAATTCCCTATAATGGCAATGGGGTTATTTTCAGCTTCCAGCAATGGCCAAACAAGTAACTCCCTTGTCA AGTGCTATAAGGGTACTATAAGCCTTAAGTGGAAGATCAGCACCCCCACCAGATATCATTTGAATCTCAGGCATTAACAC TATCCTTCAAACAAGAATCCAATATTGAAATTCCTGGTGCTTGTGTATACTTTTTGGACATCATCATCACAAAAGAGTTG TTCTTCAGTGAGATATAAACTGGCATAGGTAGCCTTGTAATTACTGTACCAGAGTCTATGATAGTAGGCACCTTGTAACT TGATGCTGCTACTCCCAATGGCTTTCCTCCCACAGTAATATCTGTCAACTCCAGACAATATAAGCTGGGAAGCGTTGGGT TCTTAACCAAAGGAGTGAACTCGTATGATGATGATGATGATGATGTTGATGTCAATGACGACGTTCCAATGGACAAGAAA CCTTCATCGGAAGAGTTAGGAGCAGCAAAAGATGTGGGAAGCCTTCTCGGGGAAGGCAATAGGAGAAGGCATGACCAGAT TGATTTTCTGGACACTTGTGCAAACATGGAGAGCTTGATTGTCCTGTCCACACCCAAATACACAACTTGATTATGTCTCA TATGAGTCAAGGTTAGCATATCTTTGACTGAAATAACCAATTGAGAAACAAGTGTTACCAGATGCACTTAAACAACTTGG GGCATTGAGTATGGAGCCCTTGAGAGAGGAGCACTGAGAGGATGAACATGAAAAGGTTTTATGGGTCTTGGAAGTGGAAG AATTGAAGACGGGGCCAACCTGCACATGGTATAGTATGTAACACAAGGCTGGCACTGGAGCTGGAGCCAGGAGAGAGAGC TGCCAGTGTCTACAAGCATGGTAAAATACTTAGCAGGGGTCCCAATTCCTATTTTTACATAGTAATTTCCTGAGCCTATT GACAAACCTGATTTCAATTGTGTGTTCACAAGCTTTGAATGGTTAACTAATCTAGAAGAGGCGGTAGTATCTGAATGGTT AACTAATCTGGAAAAGAGACCTGACACGCTCCTCATCTTTTATGAACATGCCAGAGAATGAAAATGGTAATATGGATTTT AGAGAGGAGTCAAGACCTGTAACATGATACAAATTGAGCTACATGCCAGCTTGCTTGTGCCTCAAATCACTATCTGCAAA ATGGATGGTTTGCAAGTTTAGACCTCATAATTACAAGCACAAATTCAGAATTTCATTCTAATATTGAAAAAACTCTAAAC ATTGCTGTCTTAAATTTGGTATCAAAGGTAACATTCTTGTAAATTAAAGAAAATTAAAAACTGCTAGACAACAAAGGACA CTAGAAGTTAATTATGGTGCGGCATATTAGCATAGTACAATCTCACAATGATTTTTTTTGCTTTTCAATCAAGTTCTGAA ATAGCTAGCAAGGTGTTGAGGTGCATATGCCTTCAAATTCCTTCACTAGAGAAGATGCTATTGCAAGATGTGCCGAGAAA ACAAGAAACCAGAAGAGGCTCATCCTATTTTGCTGGCTCTGCAAAATTGATTATGAGCTAGTTTCTTACTCTTCCCTCAG CAGATACATGGTACACTAGAGCAACCAGAAACTTTTCCCTACCAATGAGGCAACTGAAAAATGTACAAAAATATTAGTTT ATAGCATGGGGCCAAAGTTAAACTAGTGTCTTTAATTTGCAGCATTAGAGGATTGAATGCTTTAAATACCCTCCAACCTG TTCGATATAATTCAGTTCGTTATATTTAATTATCTTTTATTATCTTCTGTTTTAGATAATTACTTATAGATATTGGTTTT AGATATTACTTATATTAGTAGGTTACTTGCTAATCAAGTAACCAGATAAGATTATATTTGTTTTGTTAATTAAGGTCATA TAATAGGACCAGACCGTATGTATTGTATTTTTTACGGATTTCAACAATAAAACAGGTTTTCTCCTATCTTTGTCTATCTC CCAGATTTTGTGTGTTAGTGCACTGTGAAACACTCGGACTAGATTATGTGACATGAGGTGAGGATCGCATATGCAAGAAT TGGGTTATTGGGTGCAAGGATTCAGGTGCTTTCCGTGGCTTGCAGTGAGTTTCTTCCTCAAGGATGGTCTCAATGTGGCA CCTTCCACTCTCCAGCTTCTTCAGAATTCCGCCAATCTTCCCATGGTTGGTACACCCCTCTACGCTGTTGTTTCAGATTC TGTCTACATCTCTGGCCAGCATCGTGTTCCTTACATCGCCATTGGAGGTAATTGATAATTTATTGTTATTGTGTGTATGA TTATGAAATATGAATAGAAGGGTTTCATTCTTAGGAATAGGGTTTAATTTATTGTTAAAGCATAAAGGAAAAGGGAAGAG TAAAAAGGAGGATTGAGATTCCAGAATTTGGAATGGTTGGGTTTTCTTTGTGTATATAAAGGTATGAATGTCATTGTTGC TTGAGCATAGAGATAGAATAAGTTAACACTTTGTCAGCTTCCTTGGGAAGGAAATGTAGCATATCACAATTCCTTCTAGG AAGTAGTTAACAGATCAATGGTTTTGAATAGATTTCTTTTTTTTCATTTTTAATAGAAGAAGGGGTAGAAAGAGTGGTGA TAACTAATAAGGAATCATCCTAAGAAAAACTCTTAAGAAAGCTAGAGGTCAAGCAGAAACTAAGCTAACCCCCCTAGCAA AACTAATTTCAAAATCGATCTCGTATTCCTCTGTGAATGTGCTGTAACTCTGGGGCAGAGTAGCATTTTGCTTCTTTGAG TCTCTATTTTTTCCTCTTTTATCTGTTATTATTCTTGATTCTGTTACTATAATTAGAGCATACATTTTTCTATAACTCAA GTGTAAATACCAGGAGCTATCAGATTCCTAGAAGTAAAGTAGTAAACAATGTCCTGAACACTAAAGAGAGGCCAAATCTG CTGTTCTGCACCAGAGTATGACTAAGGAAAAAGAGTAAAAGACCTTCCTTTAAAATCCAAGAATAGAAGTATGGTGATCT CACTGCCAATGAACATTTCCCCTCCTTATACATGGTCACTTGGGAACTGGGATAAGACGTTGTAGTTGGTTGTTGAGTGT TCGTTGATTTGAACATCAACTATTCAAAATAGAGACATTTGAATCAGCATTATCAGCTTTCCCTCTAACCAGTTGTTTTT ATTATACAGAAACCAGATACTGTTTTTAAATTTTTTAGTAAAAAAATTCACTGACCTTGGAGCTTGTATTTTATTGTCTT CTATTGTGGACGAAGCAAAACTGATAATAACATTTATTCAAGCCAATGCTTAGTACAGTTTCCAAGAACACAAGCAAACA CCACTTGGAATTTGGAATGCTGAAAGTACTCTCTTCATTCTGAATTTGTTTATTTCAAGTGCTATTTTACTGTAGCAATT GCTAACTGGAGTCTCACTGTTAGTTTAGTTCCGATACATCCGTTCTACAGAAATATGTGTATTAGGATCGTGAACTTATA CTTTATACTTTTTATCTAAAAACTTGAGTCTGCTAGTTGGTTTTACCATTGTAAATAATGAGTTTTGTTGTTTCCGTCAC TCTTAGGTTTTGTGATTTCATGCGTATTATAGCTATGTTACTCCAGATTGAATGGATTTATGTGACTAAGTAGATTTCAA TTCGAGTTTTCCCCAATTTCGATTCGATTTCTTGAACTAGATTAGAATTTTCAGTGATTGTTGCTAATTATTACCTTTGA TTTGCCTAAATGAAGAAAAAATTAGTAAATAGATGTGTGATTTTGATGGATAATCATGTTTTACTTACTATAATCTTTCA TGTAGTAATTGATTTTGATCTGTGTTGGTTACTCTGAACTCAATGGTGGTGATTTCAGTGATGTTTGATCTTGCATGGTT TGTGTAATTGCAGATGTGTATGATCCATTTTCTCCAACTAGGAGCTTGTTCCAGGTTCTGAACACGGTGGATCAGCTCAT GAACAGCCCCTTCATCACTCCTCCAACCAGGAGTCTGAGCCAGGTTTTGAACACGGTGGATCAGCTCAAGAACAACCCTC GTGGAGCTCGAAACGGCTGGGATGCGCGAGAGACAGAGGATGCTCTGCTTCTGCGTGTGAACATGCCTGGGCTGGGAAAA GAGGATGTGAAGATTGCTGTGGAGCAGAACACGCTGACCATCAGGGGTGAAGGTCCAAAGGAAAGTGAGGAGGAGGTTGG TGGTGGTCTTCGCTACACCAGCAGGATTGACTTGCCGGACAAGCTTTACAAGATTGATCAGATCAAAGCTGAGATGAAGA ATGGTGTGCTCAAGGTCACTGTGCCTAAGATGAAGGAAGAGGAGAGGAGTGATGTGTTCAATGTCACGGTTGATTAGAAT AACTTTTGATGATATATCAAGTGACTTATAACTTTGTTGAATGAACTTGCTTTTTGAGGGTATTTTGTGAATGGTGTCTG TTCCTCAGTTGTTAACTTTGTTGAAAGTAATGAATTAACTTGTTGGTTAAATCTAATTCTTACCTTATGAATCAGAGGAA AATTCCAGCTCTGCTCTCAAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0544700.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTCCTCTCTCGCCGTGAAGCGCCTCCTCTCCTCCTCCGGCCACCTCTCCAGGTCTCTCTTCCGCCCCGCTGCTAC TGCTTCTGCTTCCCGCTCTTTCAACACCAACGCCATGCGCCGCTACGACGAGGCTTCCGATGAAAGCGACGTCGACGTCG ACCGCCGCTCTGACCGTCGCGCTGCACGCCGCGATGATTTCTTCTCAGATGTGTATGATCCATTTTCTCCAACTAGGAGC TTGTTCCAGGTTCTGAACACGGTGGATCAGCTCATGAACAGCCCCTTCATCACTCCTCCAACCAGGAGTCTGAGCCAGGT TCTGAACACGGTGGATCAGCTCATGAACAGCCCCTTCATCACTCCTCCAACCAGGAGTCTGAGCCAGGTTTTGAACACGG TGGATCAGCTCAAGAACAACCCTCGTGGAGCTCGAAACGGCTGGGATGCGCGAGAGACAGAGGATGCTCTGCTTCTGCGT GTGAACATGCCTGGGCTGGGAAAAGAGGATGTGAAGATTGCTGTGGAGCAGAACACGCTGACCATCAGGGGTGAAGGTCC AAAGGAAAGTGAGGAGGAGGTTGGTGGTGGTCTTCGCTACACCAGCAGGATTGACTTGCCGGACAAGCTTTACAAGATTG ATCAGATCAAAGCTGAGATGAAGAATGGTGTGCTCAAGGTCACTGTGCCTAAGATGAAGGAAGAGGAGAGGAGTGATGTG TTCAATGTCACGGTTGATTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0544700.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASSLAVKRLLSSSGHLSRSLFRPAATASASRSFNTNAMRRYDEASDESDVDVDRRSDRRAARRDDFFSDVYDPFSPTRS LFQVLNTVDQLMNSPFITPPTRSLSQVLNTVDQLMNSPFITPPTRSLSQVLNTVDQLKNNPRGARNGWDARETEDALLLR VNMPGLGKEDVKIAVEQNTLTIRGEGPKESEEEVGGGLRYTSRIDLPDKLYKIDQIKAEMKNGVLKVTVPKMKEEERSDV FNVTVD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 30 | 30 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 95 | 95 | 8.5E-79 | – | |
| PANTHER | 1 | 95 | 95 | 8.5E-79 | – | |
| Gene3D | 101 | 245 | 145 | 7.3E-24 | ||
| PANTHER | 118 | 246 | 129 | 8.5E-79 | – | |
| PANTHER | 118 | 246 | 129 | 8.5E-79 | – | |
| ProSiteProfiles | 139 | 246 | 108 | 23.284 | ||
| SUPERFAMILY | 140 | 236 | 97 | 4.19E-24 | ||
| CDD | 149 | 231 | 83 | 6.92993E-23 | – | |
| Pfam | 150 | 243 | 94 | 5.5E-17 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0544700.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…