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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0261000 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0261000.6 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT4G03080.1 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 1; Swiss-Prot: sp|Q8L7U5|BSL1_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2SIQ5|A0A0B2SIQ5_GLYSO Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0261000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:56964341..56980263) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGGGTCGAAACCGTGGCTGCATCCTGCTCCTCCTTACCGACCACTTGAATCGCACTGGGACACCGATGAAGACGATCC TGGTCCTCGCTGTGGTCACACGCTCACTGCTGTAGCCGCCACCAAGTCGCGCGGTCCGCGCTTAATCCTCTTCGGCGGCG CCACCGCCATTGAAGGAGGATCTACTTCAGCTCCCGGCATTCGTACTTGCCTCTTCTCTCTCCCTTGAAATTCTCTCATT TTCTGTCAGTTTTCAACTGAAAGTCTCTTCTTCTGGTTTGCAGGATTGGCTGGAGTAACGAATTCCGTGCATTCTTATGA TGTTCAAACGAAGAAATGGACTCGGTTAGTTGATTTAAGCTTGCCCAGTTGTTGAATGTTTCTAATTTAGTTGATTTATG GTTCATTGTTGTAGAAAAGTTAAATTGAGTCTGTTGGGTGATTGAATTGCTACTCAAGTAATGATCTTTGGTTTATGGTT GTTTGTTCAGTCTTAAACCGGCCGGAGAGCCGCCGTCTCCTCGGGCTGCCCATGCTGCCGCGGCAGTTGGTACCATGGTC GTTTTTCAGGTGATTTTGGGTTAGGACTGAGATTTCATTTGATTGGGTTGATGGTGTAAGAGTTAGGACTTGACATTTGT TTTATTTTGTTTCGCTTGGCTAGGGTGGGATTGGTCCTGCTGGACATTCGACTGATGATATCTATGTGCTGGACTTGACC AATGACAAATACAAATGGCACAGGTGAGCTTGGTTGCAATTGACCAAGCTATTTTACTTTTTCCTACCAATTGCAATTTG ACAAAATTATGGGGTTAGTCAATGTTGCAATTAATTCGATTGTAGAGTCGTTGTACAAGGGATAGGACCGGGGCCTCGCT ACGGACATGTAATGGACTTGGTTGCTCAGAGATATCTCGTCACTGTCAGTGGAAATGATGGTGAGAGAAATTTATTTCCT 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0261000.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCGTCGTTGCCGCCATGCAGCAGCAGCTGTTGGTGTTCAAATCTATATCCACGGCGGTCTTAGAGGAGATACACTACT AGATGATTTCTTAGTGGCTGAAAATTCGCCATTTCAGCCTGACAATTCTCATGCGTTAACAGCTGAGAGAACATCACCTC TTACAAGTCCCAAATACAATCAGTCTAACTTCAGCTTGGATGGTACACAAGACGGACCCTCGTCTGGCGGCTCAGGTTTG ATATGTGTTCATTTTACCAGGATGGACAAACATTCGATGGAGAAACTGAGGGAGGCATCAGCTGCTGAAGCTGAGGCAGC GAGTGCGGTCTGGCAAGCTGTGCAAGCTATATCTGCGGAAGAAACTTCTGTGTCAGATGACAACTCACAAGCTGCAGAAA CCGTTTCAGATGGAAGCGATACAGAGGGAGATGTTCACCTTCATCCTAGAGCTGTTGTAGTTGCGAAAGAAACTGTAGGT AACCTAGGTGGAATGGTGAGACAATTGTCTCTGGATCAATTTGAAAATGAAAGCAGACGCATGGTTCCCATAATTTCGAC TTTGCTCAGGCCTCGCAACTGGAAAGCTCCTGTTAACAGACGGTTCTTCTTGGATTCGTATGAAGTGGGTGAGCTTTGCT ATGCTGCTGAGCAAATATTTATGCAGGAACAAACTGTTCTTCAGCTAAAAGCTCCAGTCAAAGTATTTGGTGATCTTCAT GGTCAGTTTGGTGATTTGATGCGGCTATTTGATGAATATGGATTTCCTTCAACTGCTGGAGACATCACGTATATTGATTA CTTGTTTTTGGGAGATTATGTTGATCGAGGACAGCACAGCTTGGAAACCATTACCTTGCTACTTGCTCTTAAGATCGAAT ATCCTGAGAATGTTCATTTGATACGTGGAAACCATGAAGCTGCTGACATAAATGCACTATTTGGTTTTCGCATAGAGTGC ATTGAGAGAATGGGAGAAAATGATGGAATATGGGCATGGACGCGATTCAATCAACTTTTTAACTTTCTTCCACTAGCTGC TCTTATTGAAAAGAAAATTATCTGTATGCATGGTGGGATTGGAAGATCTATCAATTCGGTAGAACAGATAGAGAAGCTTG AGAGGCCCATAACAATGGATGCAGGATCCATCATTTTAATGGACCTTTTGTGGTCTGATCCCACAGAAAATGATAGTGTA GAGGGTTTGAGACCAAATGCTAGAGGGCCAGGGCTTGTCACTTTTGGGCCTGATCGTGTCACAGACTTCTGTAAGAGAAA TAAATTACAGCTCATAATAAGGGCCCATGAATGCGTCATGGATGGTTTTGAGCGATTTGCCCAGGGACAATTAATCACCC TTTTTTCCGCAACTAACTATTGCGGAACTGCAAACAATGCGGGAGCTATACTGGTAATTGGTAGGGGTTTGGTTGTGGTT CCAAAGTTGATTCATCCTATACCACCTCCCCTTCAGTCACCTGAAACATCTCCAGAGCGTGAACTTAATATTCAGAGGCC GCCAACTCCTACTAGGGGTCGACCACAGCCTGACCTTGATCGTGGCTCTCTAGCATATATATGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0261000.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRRCRHAAAAVGVQIYIHGGLRGDTLLDDFLVAENSPFQPDNSHALTAERTSPLTSPKYNQSNFSLDGTQDGPSSGGSGL ICVHFTRMDKHSMEKLREASAAEAEAASAVWQAVQAISAEETSVSDDNSQAAETVSDGSDTEGDVHLHPRAVVVAKETVG NLGGMVRQLSLDQFENESRRMVPIISTLLRPRNWKAPVNRRFFLDSYEVGELCYAAEQIFMQEQTVLQLKAPVKVFGDLH GQFGDLMRLFDEYGFPSTAGDITYIDYLFLGDYVDRGQHSLETITLLLALKIEYPENVHLIRGNHEAADINALFGFRIEC IERMGENDGIWAWTRFNQLFNFLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINSVEQIEKLERPITMDAGSIILMDLLWSDPTENDSV EGLRPNARGPGLVTFGPDRVTDFCKRNKLQLIIRAHECVMDGFERFAQGQLITLFSATNYCGTANNAGAILVIGRGLVVV PKLIHPIPPPLQSPETSPERELNIQRPPTPTRGRPQPDLDRGSLAYI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 527 | 527 | 7.0E-286 | – | |
| PANTHER | 1 | 527 | 527 | 7.0E-286 | – | |
| MobiDBLite | 38 | 75 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 121 | 137 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 121 | 146 | 26 | - | – | |
| Gene3D | 164 | 499 | 336 | 4.2E-111 | ||
| SUPERFAMILY | 182 | 496 | 315 | 4.88E-97 | – | |
| CDD | 184 | 486 | 303 | 0.0 | ||
| SMART | 204 | 488 | 285 | 5.5E-111 | ||
| Pfam | 232 | 439 | 208 | 3.9E-34 | ||
| PRINTS | 232 | 259 | 28 | 9.3E-63 | ||
| PRINTS | 267 | 294 | 28 | 9.3E-63 | ||
| PRINTS | 300 | 324 | 25 | 9.3E-63 | ||
| ProSitePatterns | 301 | 306 | 6 | - | ||
| PRINTS | 338 | 364 | 27 | 9.3E-63 | ||
| PRINTS | 368 | 395 | 28 | 9.3E-63 | ||
| PRINTS | 428 | 448 | 21 | 9.3E-63 | ||
| PRINTS | 450 | 466 | 17 | 9.3E-63 | ||
| MobiDBLite | 489 | 527 | 39 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0261000.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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