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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi6g1v0090700 |
Transcript ID | LotjaGi6g1v0090700.1 |
Related isoforms 3 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | LMBR1 domain-containing 2; TAIR: AT5G65290.1 LMBR1-like membrane protein; Swiss-Prot: sp|Q54Q92|LMD2A_DICDI LMBR1 domain-containing protein 2 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|G7J381|G7J381_MEDTR LMBR1 integral membrane-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0090700 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:19512212..19526837) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGCGTGATAATTATTTTTGAAGGGAGTTTTATGCGTGATAAATTGGTATTGAAATAAGATTGATGGAGGTCTTTATGTCA AGAAGGAAAGCAAAACTTGAAGCACGGGAGAATCACTTCAATTAATTAATCAAGCATAAAGCGAAACTGAGTTGCTTTTC ACGCCGGAGACGACGGTGGCGGCGGCAACCGTCTAGCTTCAGCGACGCTCCTTCGAAGTTGGCGGTGCTGGTTCCCACTT GAAGTGACGTGTGGCGCACCTAACCTCTTAGGTGCGCGCACTTCAACGCGTGGTTTCGTTTCCGATCTATGATCTATCTC TCTGAATTCTGATCATTGAAGAAGAGAGATGTGGGTGTTTTACCTGATCTCGCTACCTCTAACAACTGGCATGGTGCTTT TCACCTTGAGGTACTTCGCTGGCCCTGATGTTCCTCGCTACGTGCTTTTCACTGTTGGATACACCTGGTTTTGCTCCCTC TCTGTCATCATCCTCGTCCCCGCGGACATTTGGGCGGTACCGTCTTCCGATTCTGCTACTTCATTGATCTTCAATTCAGT TATTGTTTAATTCACACTAAAGAATTTCATTTTTATTCTTGGTAGTAGTAGTTTCAATTTTTCTGCTGTAATTTGTTGTG TTGATTGCACATTTGTTTAATTCAGCTTCGATTGTTAGGGTTGCAGAGTGAGATTTTTAGGAATTTTGAAACAATGTGTG TGTTTGGAAACCTAGTAGCAAGTATGTTGGGGGAAGTAGTTATTCTTCGCGAAGTTACTACTGCTAGCTAGTAGCTATTG TGGGGAGTGAAGTGATTCTGTAAAGTTTAAATGTGAAACCAAATATACTAATTGGGTGGGATGTGTGATTAGTATAGAAG TGAAAACTTAATAAAGACTCTCACACATGACTAGTTCTTTTCTGATTGCGTTGTTACTATACCATTGTCGTGATGGAGAA AATTGCTATACAATTGACTAATGAATGCACGGGTTATATGGGGGCTTTACATGCTGATAAATAGCATAAAAAAGGCTAGT GACAAATGCATAGATTATGAGTAACTCTGCCCAAACTAATGTCCTCGTCTTAGAAGAAACTAAAATTTCAAAAACGGGCT TGGATATGGAGAAAATAGGAACAGTTGGGTTTCGATTTAGAAACTGGAAGAAAGATTTACCTTTTGTAAGGGAAATAGTG TGCATAGTTTTGACAAAAGGTTATTCAACCTCCATATTATGGACAGGGTACTTTTATCATTTATGGTTTTTTATTCTTTA GTTAAGCTTGTGTCAATTAAATCCAGGTTGTTATTGCGTCTTCTTTACTATTAATTAGTTTGACAGTTTTTTGGTTAATG CAGAAACTATTTTATCTTATTCAAAAGGAAGAGTTTTGGATCTTTGTTTTTTTGATTAATTGAAGAACTAAAACTGCATT ATTTCATTCATTAATGATGTTTTTGTGACAAATACAGACGATGTCTTCTCACTCTGAGAATGGAGGTATCTCTTTCTTTT GGAGCTGGTCATATTGGAGTACATTTTTGCTTACCTGGTACGCTTCTTGTTACCCTGTAAAATTTATATGATTATATGTT GCATTACTTTCACATCCTTCTGTGTACTTCAACTGAATTGTATTGTTTAGCAAGGAAGGCCAATTGTCTACCATATTTTG GTTGATTGTCTACCATGTGAGATACCTGCTTTGCTCTCTCATGGCTTGACTGTCGAACATTCCTCCAGGATTCTCTGTTT GAGTCTATGATGTTATGTATCTGATATATAATGGGATTGAGCTGCAATGACTCTTCAATGTGAAAAATGTCTTTAATCTT CGTAACATCAACCCATATTTGATTGTATTAATATTATTCTCCTTTGATTGACAGTTAGCACTATCTTTTTGTATCTCTGC 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GGTCATTTGAAAGAAAGTACAGTTAATCTTATTGGGTTGTCAAGACCACGGCAGGGCCATGTATAACCTCACCATTCACG TGGTTCCTAAGGACTCCCACTAGGGTACCTAAGGGGAAAGTAATGGTGTGTTACATCAGAGTTTTAAGCCCCCTTATCAG GAACTTGCAAGAAAATGTCCCAACCAAGTGAACTAGGATCACAGGATACATTTAATTTTAGTGGGTTGTCCCACAGCAGG GCCAAGCAGAGCTCCACCATCGAAGTGCTGCCTAAGGATTCCTTCTATGGTACCTGAAGGGGTGGGGGGGGGGAGGGAAA TTGATGGTGTTTAACCTCAGAGTTTTGAATCCCCTACCATGAACTTGCAAGAAAATGTCTCAACCAAGTGAACTAGGCTC ACAGGATAAATAAGTTACAGGTTTAAATTTTACATGTTAGTCACAGATTTTCAATAAGGAGAATCCTTTTTGTTATGAAG GATAGGTGCCACGAAACATAAGAACAGAGGTTCTGTTTGATTTCTGTCAAAACCATCTCCTTATAATTTTATTTTTTAAT TAATATGTCCTTTTGAAAAAGATCAAAGCATTCAATTTTCAGTTCTTATGTTTCGTATCATACTATATAGCAATTCTCTT TCAATAATCAATAGCTTGTACGGTTTTTCAAGTCATTGACACAAATATCTGCTCGTTGTCTAATTGTTTGTCTCTTCCTT GTCATGATGTTCATGGTTGACAAGTTAATACGCAATAAGGTTTTTTTCATATATATGTGTATTTATTTTTCGGGTTTATG TGATGCAATACCTTTTTATTTTGAATATTTTTAATTGATTCATACTTCTGGAAGCAGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTG CCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGCATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGC ATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTACTTTCTCACAAAATTTCCCAAATGGCTGTCAAACTCGATGA TGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTAAGTGGTTCATTCTAGTGTCTGTTAAATTCATTTCTCATTTTACTGT TGTAGAAGAAGTTACTAAAAATTGATTAGTTGAAATTTTTTGGTTTTTGATTGTGCTCAATGTTGTCATATGGTCCATGA GATTTAACCCACCTAGTGGGAGGCTTGGTTGCTGCCCTGGAAGTTTTGTTAATCTTTCACTTGGTAGTGAGATAGAACTG CCTTTTTTTGCTTGTGATTTGTGTCATTTTGATTAAAAAGAAAAAACTTATTCAATAACACCTTCCCTGAGTTGTATTTC TCCAATTGGCTTTATTTTAAGTTGTGGATACATTGGAAATATATTAATTTTGAAACTTGTATGCATAGCAGAAAATATGT ATAATAGAGCTGAGGTTATGCACTGTCTGATGTCTTGTTCCTTTCCTTCTCGTATAAAAGTTACTAGTAGTAATAGCTTG TTTGTGGCTAGTTATAGTAAGCTTTTGAGGGACATTCCAATTTACAATTGGGCATCTCCATCGATTCTACATGTCTGCCA TTTTGGCGAAAATGTTACTTGTGCCAGCAGTGCATCATTAGCGCTTGTGTTGCTCTCGAAAAGAAGCTGTGTAATATTGT ATTTGATCAATTATTTTGTATATGGAAGATCTCATGTGTATTATGTTTTTATTGGTTTGGGCCAGTGGGGTCACTGCAAA ATAAGAATTGGAGCTTAATTATAGTTTATTTGTATAGGTTGCTCAAGCAACATCCAAGCAGATGTCCAAGCGTGATCCTT TGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATATGCTTGCTCAAATGGTATTGGGCTTACTTTATTTTATTAAGGATGTCTAA 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AACACTCTTAACACCTTTTTGTCAAAAAAAAAAAACTCAAACCTCATCAATTTTTTTCTCCTCTGTAGTATTGGAAACTC GTTACTCTCACATTATAAAACTAGTGTAAAAGTGTCAGTTTTTTATAATAAATTTAGTTTTTTTTAAACAGTATTGATGG TTAACCAAACAATGATAGGTGTCAATAATATGAATGCAAAGAGCACATAGTACTTAGTACCAAGCTTGTTAATAGCGCGC CCTAGTGGTGCAATAGCGCTATAGCATAGCACCCTGGGGGTTAACCGCTACTCCACTATTCACCCTATTTGCCGCTATTG TCCGCTATAGCGCCGCAATAGCGCTCAAAATAGTGTTTTCTGGGCTTGCCGCTATGCTACGCTATCCGCGATTATGTTCA TTTTAATTTTTTCAATGGAAAATTTTCTTAAAATAAAATTAACAATTGATCGAACATCTTCTCCTGAAATATGTAATGAA TGGCTGATGACTGTTTACTTTATAGAGAGATTTTTTGTAGTGCCCAAAATAAATGTAGTAAAAACTCATTCAAATGTTTT CAGAATATTAAAACTTGTTGAAAATAATTATATTATATATTTATATTTTTAATGAGAGTATATGATATATGCTTTTAGTG TTACAAATTTACACATGTCACCCCAACAACTTAAAATTTCTTACTTCATCATTGTGTGTATATGTGTGTGGTTTTCCCCC ACAACTTGAGATGTCTGGATCCGTCACTGTTAATGAGAGATATACCGCAGCTTTATTACTTAGTTGCAGCGCTTACTTCT GTCAAATCTGTACAAATAAGGTCTCTTAGATTTTTCCTTCAGCGGTAGCCAAACTTTATTTGGTATTGTTTCTTTTGCAG TGAGTATATGACTTATGTACTGGAAGCCCTTGAATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGAT GGTTTGCTTCTAATTTTGTTTTCTATTTTGTTGGTTTTCCCAGCTTCAATATCATTCTATAATATATTACAGGTTCTTCG AGCTCATATTACATCATTTTTTTATGATATAACTTCAGGGAATATAATTCAAGCATTAGACCTGCTCGGACTGGCAAGTT GGGGTCTGTATTTGATACTTTAGGTAATAATGAGAATTATTATTAAATCTATATTATCCTAACTTCACTGAATATTACTT TTCTCTAATGAAATTTGATTATTGTTAGATATCTTGTAAATAAGTAGGATATCTTTTATTTAAGTAGGATATCTTTTATT AATTGTAAATAGGTAGCATAGTCATTGTAAATAGGGTAACAATGATATTGTACATTGATTGCACCCAGTGTTGTCAAACC CGAATAGCAGGGCGTAGCAGCCGACCCCTATAATGCTATAGCGTATAGCGAGATGGCTGTATGCTGAATATTTTTATATA TAGTTTATTTTATACTAAACACTATGCTTAAAAATGATAAAAAACACTCAAAATTCATGACATTCAAAAAGGAGATAGAG GTTGCTGGGATAGAAGAGATAACTAAAAAATAAAGGACTACAGCATAAACTAAGTAACTAATGGAGGCTGTTGTGATAAA AAAAAAAAAGATAGAGGCTGCTGGGATAAAAGTGATGCATGGTAGTTACTTAGAGACTAAAAGAGAATACAAATTGAAAC AACACTGGCAGAATAAATAACCAGAAGAAAAAAAACAAAGCAGGCATTAGGGAAACAACAGAGAAGGATAGCAAGCTCAA GGATGCGAGAACAAAACTGGGTATTTGGGGATGCAGAGGTGTCGCTATAAGGTTGCTGGAAGGATGCCGGAGGCTGGTCA GAAGTGGTGTGCAAGCTAGAGTGCAGGAAGAATGGAGACACAGTGCTGGGCAGAGGTCGAAGTGAAGTATCAGAGAGGGG GATGTACTATAATGGGTTATTCTAACTTTTCCGAGGCAAAATTTCGTATCTACCCTCAAAAGGTTGCTCTAACAGTAAGA TTTTAAGGGTAAAAGGGGTTTTTTCGATAAACCATCAGAATAGTGCAGCATTTGTGATACAATTCCCACTATTCAGGCCA ACCTATTGCGGCCGCAACAATGAGCCGCTCCACTTTTTGACATCCTTTTGCGGACAGTGGCTGCTCCGCTCCGCTCACCG CTATAGCATCGCTATTAACAACCCTGATTGCACCTATTATATATAATATAATGGACTCCGCTATGTAGTTGAAACACACA GACTCAGCAAATGCCTCATGTGTCTTTTTTGTTATTCAACATTGTATCAAGAGCCTAACAAGAGGCAATTCTAATCCTAA TCCATGACTATCTGGTAGAGACCCATCATGTTTCATTTCCGGTTTCTAGACCTTTTGTGCTGTCTGGCATCATTCCGACA GCCTTCTCCAGCTAATTCCGCCGCTGCCCAACCACCGAGTCTATATATGGTCTCAAGCAATCTCATAGGGCTTGATTTTG GCAGATTTGGCACTGTTATTCAGTAGTTTGTGTCAAAATAACCACTTATCCCAAAAGTTTAAGCTGTTGGGTAAGGGCCA CATGAATGGTTTTATATTATATTCTAACACCCCCCTCACGCAAGAGCCCTTTGGGCTTGAAGCGTGGATGAATGCATAGG CCCACCTACCATGTGCTTAATTAAATTCCACTTTTTAATTAGAAAGTGAGGGGAGCAAGGATCAAACTCTAGACCTCTCA GTCTCAGCCATAGAGGCTCTGATACCATGTCATAATAACCACTTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAAGGGCCACAT GAATGGTTTTATATTATATTCTAATAGTTTGGTATGACAGAGTGAGGCTGATCAGTCATCTTTTTATCATCACTCAGCTG CTGGGTGTATATACTTGATTGTGTATGTGGATGGCATTGTCATTACAGGCACCGATCATCATGGAATCACACAAGTAAAA CAACTTTGTCATCACTTTCAGACAAAAGACCTTGGCAGACTTTGTTATTTCTTGGGCATAGAGGTTGCACAATCCAAACA AGGGATTGTGATTTCACAGAGAAAGTATGCTATGGATATTTTGGAGGAGACAAGATTGTTAAATGCCAAGCCAGTTGACA CACCTATGGATCCCAATGCCAAACTTAGGCCAGCTCAAGGGGAGCCACTCTCAGATCCAAAAACATATAGGAGATTAGTT GGAAATATGAATTATCTCACTGTTACTCACCCAAATGTTTCATTTTCTTTTAGTAAGGTAAGCAATTTCTTAATTCTCCA TGTGAAGGGCATTGAGAGGTTGTGATTCGCGTACTGAATTATATTAAAAGTGCTCCAGGAGAAAGGTTAATTGTACGAAG ATAAGGGACATGCACGAGTTGTAGGATACTCAGATGCATATTGGGTAGGTTCTCATTTTGATAGGAGATCCACCTCGGTA GTGTGTTTTCTTTGGTGATAACTTAATTTCCTAGAAGCGTAAGAAACAAAGCGTAGTGGTAAGAGAGAGCAGAAGGCATG AGAGAACTGGCTGCGATGATGGGCCATGTTATCGTATGTTGGGATAAAACCCATTCACATGGAACAAAAAGGAATATTCA AAGATTCACAAGGGATTTTGCAACTGCTTTGGGAAAGAGATATAGATGACATCCAAGCTATTGCTAAAACTGTGGAGTTG ACTACAGTTTTGGGCATTGAAAAAGAGCAGTGGGATCCTGGTGGACATTATTGTCTTCTTCCTGTATCACGGTTAACATT TCCAGATAGGAGGACTTTGGTGGGATTTTGTTTTAGGTATCTCAAGCTAGGACAAGGTCAATGCTTACGGGAGGAGTATT GATAGGTACCCCTAGTTAGTTAGTAGTTTTGGTTAGTTGATAAAGTTAGCCATATAGTTAGTAAGTTAAGAGAGTTAGTT CACTTAGTTGGGCTGTAGAGGAAGAAATATAATAAATAAGAGAGTTTAGGAGGATTACATATTTTGGGATAATTTGTAAT TGGAAATTGGCAGAAACTCAATAATATCAGCTTTCCTTTTTTCTTTAGTGCTAGAACCTATTAGTTTTCCACAATGCCTC ATGAACATTTTATCCTTTCTCTGTATTAAGATATTTATGAAAAATATAATTCTACGTACCCTACTAGCTCAGTTGCTTCC TATGTAAAGAGACCTCAATATTAACTCTATTTTACGTTTTTTTTATTTTGTGGTTAAAAGTTGCATATATGTATATAGAA ATTAGAAAATTAAATTGACATTCCTAGGTTTTTAATTGAGAGATTCTGAATATAGTATTGACAAATGGTGGAAGTCAATC TAATTTCCTCATGCATATGTTGCTTTTGGCTTAAAAGTTTCTTGAATTTCATCTGACTTCTGTGTTACCTTTCTCAATTA GTTCCTTGCTACTTTAATATTGCATTGTTTGATCGTGCAAGGATAGGTCTACATTTTCCTTTCTTTTATGATTTCCTATT TTGGTTAGAGGCATTGGACCCAGGCTTCTAAATAAATGGTACTTCTTCACAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAA ACAAGTTGAGAAAGGCTTGGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTA GCTTTGATTTATCACTTTTCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTAGACCAAGTCTTT TAGAGATATTTAGTATAATGGACATTGAGATGCTGTATATGTATTTAAAATACTTTTTTACGTTTTTAAAAGTTTTGGAT GAAGATTTCATTCTGAATTTTTTGTGAATCTACAACACTTAAAAGAAAATTGATTTTAGATGTTCTTGATGAAGATTTCA TTCTGGAAGTTCTGGAAATCTATAATATGTCGATGAAAATTGCTATCTCATACAAACTTCTTTGCGAAGAGTAAGATGGG CTTCTGTTTGTATATCGATCAATGAGATATGACTTTTTCATTAGATACAGGCAGTCTTTTTCTCTTTTTTTTTTTATGAA AATAAACTTCCATTCCTTTTGGCTTAAGGCTGAACCAAATGCAAACAAATTGCTTATGGAATCTGATGTTGTGTCTTTGC TTCTGTAATATGCTTCTTCACATATACTATCTTTTTTTATAAAGGTTGTATAAATCACTTACCTTCAATTTTTTGCCCAG GTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGCATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTA CTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAACTTGCTTATGATATGCTCGTAAGTTTTTACTCATTTACTACTGCTGC TGCAATTATGACTACTTTATTTTTGCTTCTTGAATTGCCTATGCTCTCAAATGAATACCTGTTATATTTTATTCTTGATC CCAGGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTTCTAATAAAACGACT ATATTTGAAAAGGTACTCTTATCTAACAAATCTATTTGATTGTTGATTCTCTTTAAAATGTTTTTTTGACAATATTGTGG GGCACTGGGTGGAGTTCCATTTCCATATATTGCTTACTGTGATAGATCTTCTTGCTTATTACTTTGGCACTTATATTAAA TTAATTCCTAATAATCCTAGAAATTTCTTTTTCATTGGTTATAAGACTAGTCTATTATTTTGTTTACTTGTACTTATTTT CACATGCCTTTCGTATATTCTTTTATGATAATTTTTCTTCTCAGCTTGTAACTGTTAAATTATCTGAACTTTAGCCTCAG AACACTTTGGCTCCATCTCCTTAGTAATATTTTCTTATTATAATTTGGTGCGTGATTTGGCTATTACTGCAGAGAATGGG GAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAAATTTAACAAAATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTT TGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATTTTCTGGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGAT GATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATTTTACAAAGAGGTCTGAAACAAATTGAAACAAATTTTCCGTTGTT ACAACTTTAGTTCAAGTTACTCACTGAAAAAATCTTATCTAAATTTGTGATACTGACTTTGCCATACTTTTGATTGATTG ATTTTGCATTATTTGTAGAGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAAT TTTAATGGTGTTGATATTGAATCGGCAAACAATTTAATGGTATGTAGACATAACTTCAAAAAGGTGGAAGCAATCTTGTC TCACCTCCCATTTAGCCTCTCATCTCATAGTTTTGACAGATTCAACATATGACATTTGTTACTACTACAGTATAATCATT TTACACCTTAAACATTCAGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAACCAATGGACTGT CTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCTGCCATTAGAGAG CAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGATAAAGGCAGTAA TTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTTTCAAGGCCAACA TAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCTGAGTCCCTTGAT GAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAAGAGGGAAGCCAATACAG TATTTAAGGTCCCTCTAGATGACTTCCATCGTTTGGCAAGAGCTTAGAAGTGTAAAGTGCAATAGGATTGGGAATGCAGG TCCATAATATCATGTATAGAAATGGTAAATTTTTGAATGCTGTGCTTAGAGAAAAAAATATACATAAGGCCCCAATGCAG CCTGAAGATGGAATTGTCTGCTACACAAACTTCACTTTAGAAATCAATCACACAAAAACTAGCCGATAGTTAGACAGTAT ATATTTAAAATTGTGCCAGTACAGCATTACCGATGTTTTGCCTGGCTTAAATTCATAATTTTTTCCACTGACGAGTGACT TGGATTGCATTGCATTGTTTTGCGGAATGTCTTTAATGTTTTTCTAGCGAATTTACTCCTTGTTCATTGAATCTTGTGTA ATATCATGAATCGGAAGATTTATTTTGACTTGTGAATCGTATCATCTTATGTATTGTAGGATACAAACACACACAAAAAT AAGCCATAAATAAAAAATATGGTATATATCTTACCTTTAAGAAGTGAGTCCAACCATTCTTTCAGTAATAAAACCATGAT GAAAATTGAGCTCACCAAATTTATTGTTACTTAAATTCTTCTGTTATTTTTTTTCCCTAGAACCATTTCATTGGTGGGAT AATTTCATCCTACCTTACTTCCCTCCCCATGGTGCTTGAGAAGAGAATTGCTGCCGATTCAAACTAAAATCAGCCTGACA CAATAAGACTCCATGGTGACAAGAAGGTTGTGGTTTTGGGTGCTCACCAGATCTAGCAGGCTTAAAACATCCACAGCTAG GAAGAATGGAATCCCTCAATTTAAAAAAAAAATTCTACACACTTCATATCTAAATAATGAATTTTATTACAAAATTAATT TAATTACACAGTATAAATGCAATTCTTTCTTAAAATACTTTTTCTAATTCAACAAAACACTGAAATTCCTGAATTGAGCA ACAACAGAAACATCACTCAATTATATGACATACATACACATATGTGACACAAGAATCATTAATTATCAATAAGCCACCCT GGAATTCACAACAGATACTCCTGTGTCTTTTCTCTTCAGTCTGAGAACCTTGGACCAGAAACCATCGCTCTTGCTCCTTC CCCTGCTGTTTCTCGTAGCAAAGGCAAGCGACTTGCTCTTCTTCAAGTTGTTAAACCCCAGAATGCATGAAGGGCCGGAA CCCATCGCGTGCGAACCGTTCCGGCGGAAGCGTTTTCGATGAACCGCCGAAGATACATCGTGGTTATTCGACGAGGCATG ATTCCTCGTTGAAGGCGAATCAGGCGACGAAATAGGAGAAGGAGAGTAGCAGATAATAGGTTCAATAGGGGAATTCGTGG TGTAGAGCTGAGATAGCTTGTCACTTAAGCAAAAGGAGCAAACACCTGGTACTTGTTTATGAACATTTCGATGCTCCTTG CACCACCCTGCTCTTGTAGCTTGTAATTCCGAGTAGTTCATCATCTTAACACAAGTTCCTCGGGAAAAAGTTGTGTTCAC AATTCAATTACACCAAATATGAAGAAAAGATAGATAAATGAGTGATATGATATGTGATATGATAGAAAATACAGAGAGAT CAAAAGAAAAATGAGTGAAAATGAGACACAAGATCAGAAAGTGAACTTTGTGAATGTATCAAAAATCAAAATTCTGATCA GACAGATCACAAAAGACAACCAATTGCAGTTGCAGATAGTATCAGTTTGGAACTCTGATCTTAACTTTATTGCTGTTGCT TTAAGTTTCTTGGTCACTCGTGCGTGCAGTGATTTATAGATTCATAAGTCAAAGATGCTAGCTAGGAGTTTGCTTAGGAC AACCGTGTTTCTAATTTGGCCGCTCTTAATTAAATGATATTATCGCTCTCAGCTATAGGAAAATTG
CDS sequence (LotjaGi6g1v0090700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTGGGTGTTTTACCTGATCTCGCTACCTCTAACAACTGGCATGGTGCTTTTCACCTTGAGGTACTTCGCTGGCCCTGA TGTTCCTCGCTACGTGCTTTTCACTGTTGGATACACCTGGTTTTGCTCCCTCTCTGTCATCATCCTCGTCCCCGCGGACA TTTGGGCGACGATGTCTTCTCACTCTGAGAATGGAGGTATCTCTTTCTTTTGGAGCTGGTCATATTGGAGTACATTTTTG CTTACCTGGGCTGTGGTGCCCCTTATTCAGGGTTTCGAAGATGCTGGGGATTTCACTGTATCAGAAAGATTGAAGACTAG TGTACATGTTAACTTGGTCTTCTATCTAATTGTGGGATCCATTGGCCTTTTCGGACTTGTTCTTCTCATTATGATGCACA GAAGCTGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGCATTTCTTCTT GGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTACTTTCTCACAA AATTTCCCAAATGGCTGTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTTGCTCAAGCAACATCCA AGCAGATGTCCAAGCGTGATCCTTTGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATATGCTTGCTCAAATGTTTAGGGAAGAC CCATCCTTCAAACCACAAGGTGGCCAATTAGGGGAAAATGATATGGATTATGATACAGATGAGAAGTCAATGGCAACACT AAGGCGTCATCTTCGAAAAGCTCGTGAGGAGTATTACAGATATAAAAGTGAGTATATGACTTATGTACTGGAAGCCCTTG AATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGATGGGAATATAATTCAAGCATTAGACCTGCTCGG ACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAAACAAGTTGAGAAAGGCTT GGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTAGCTTTGATTTATCACTTT TCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGC ATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAA CTTGCTTATGATATGCTCGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTT CTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAAATTTAACAAA ATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATTTTCTGGGAAG CTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATTTTACAAAGAG AGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAATTTTAATGGTGTTGATATT GAATCGGCAAACAATTTAATGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAACCAATGGACT GTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCTGCCATTAGAG AGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGATAAAGGCAGT AATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTTTCAAGGCCAA CATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCTGAGTCCCTTG ATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0090700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MWVFYLISLPLTTGMVLFTLRYFAGPDVPRYVLFTVGYTWFCSLSVIILVPADIWATMSSHSENGGISFFWSWSYWSTFL LTWAVVPLIQGFEDAGDFTVSERLKTSVHVNLVFYLIVGSIGLFGLVLLIMMHRSWTGSLLGFAMACSNTFGLVTGAFLL GFGLSEIPKSIWRNAEWTTRQKVLSHKISQMAVKLDDAHQELSNAIVVAQATSKQMSKRDPLRRYMDVIDDMLAQMFRED PSFKPQGGQLGENDMDYDTDEKSMATLRRHLRKAREEYYRYKSEYMTYVLEALELEDTMNNYERRKSTGWEYNSSIRPAR TGKLGSVFDTLEFCWRCILRKQVEKGLAVLLGIMSVAILLAEATLLPSFDLSLFSILIKSVRTQEMLVQVFAFVPLMYMC MCTYYSLFKIGMLMFYSLTPRQTSSVNLLMICSMVARYAPPVSYNFLNLIRLGSNKTTIFEKRMGNIDNAVPFFGDKFNK IYPLIMVTYTLLVASNFFDRVFDFLGSWKRYIFKTEDDDMDGLDPSGVIILQRERSWLEQGHKVGEQVVPLARNFNGVDI ESANNLMERHVEMKTNSDVITEETNGLSKSSREETSRYGSSREAISNKYAAIREQGGPASKRKAEEKNVASANSVLDKGS NSGGAPSSGLASTWLNMKTGFQSFKANIGAKKFLPIRQIQESNVSCVSSSESLDEIFQRLKGTSLDQNTYNEED
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 712 | 712 | 0.0 | – | |
Phobius | 1 | 5 | 5 | - | – | |
PANTHER | 1 | 712 | 712 | 0.0 | – | |
Pfam | 4 | 497 | 494 | 1.8E-88 | ||
TMHMM | 4 | 23 | 20 | - | – | |
Phobius | 6 | 24 | 19 | - | – | |
Phobius | 25 | 30 | 6 | - | – | |
TMHMM | 30 | 52 | 23 | - | – | |
Phobius | 31 | 50 | 20 | - | – | |
Phobius | 51 | 69 | 19 | - | – | |
TMHMM | 67 | 89 | 23 | - | – | |
Phobius | 70 | 89 | 20 | - | – | |
Phobius | 90 | 109 | 20 | - | – | |
Phobius | 110 | 131 | 22 | - | – | |
TMHMM | 110 | 132 | 23 | - | – | |
Phobius | 132 | 142 | 11 | - | – | |
TMHMM | 142 | 164 | 23 | - | – | |
Phobius | 143 | 164 | 22 | - | – | |
Phobius | 165 | 345 | 181 | - | – | |
Coils | 257 | 284 | 28 | - | – | |
Phobius | 346 | 366 | 21 | - | – | |
TMHMM | 347 | 366 | 20 | - | – | |
Phobius | 367 | 385 | 19 | - | – | |
Phobius | 386 | 407 | 22 | - | – | |
TMHMM | 386 | 408 | 23 | - | – | |
Phobius | 408 | 427 | 20 | - | – | |
Phobius | 428 | 447 | 20 | - | – | |
Phobius | 448 | 480 | 33 | - | – | |
TMHMM | 481 | 498 | 18 | - | – | |
Phobius | 481 | 502 | 22 | - | – | |
Phobius | 503 | 714 | 212 | - | – | |
MobiDBLite | 580 | 602 | 23 | - | – | |
MobiDBLite | 614 | 647 | 34 | - | – | |
MobiDBLite | 633 | 647 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0090700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…