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LotjaGi6g1v0090700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0090700
Transcript ID LotjaGi6g1v0090700.1
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description LMBR1 domain-containing 2; TAIR: AT5G65290.1 LMBR1-like membrane protein; Swiss-Prot: sp|Q54Q92|LMD2A_DICDI LMBR1 domain-containing protein 2 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|G7J381|G7J381_MEDTR LMBR1 integral membrane-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0090700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:19512212..19526837) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TGCGTGATAATTATTTTTGAAGGGAGTTTTATGCGTGATAAATTGGTATTGAAATAAGATTGATGGAGGTCTTTATGTCA AGAAGGAAAGCAAAACTTGAAGCACGGGAGAATCACTTCAATTAATTAATCAAGCATAAAGCGAAACTGAGTTGCTTTTC ACGCCGGAGACGACGGTGGCGGCGGCAACCGTCTAGCTTCAGCGACGCTCCTTCGAAGTTGGCGGTGCTGGTTCCCACTT GAAGTGACGTGTGGCGCACCTAACCTCTTAGGTGCGCGCACTTCAACGCGTGGTTTCGTTTCCGATCTATGATCTATCTC TCTGAATTCTGATCATTGAAGAAGAGAGATGTGGGTGTTTTACCTGATCTCGCTACCTCTAACAACTGGCATGGTGCTTT TCACCTTGAGGTACTTCGCTGGCCCTGATGTTCCTCGCTACGTGCTTTTCACTGTTGGATACACCTGGTTTTGCTCCCTC TCTGTCATCATCCTCGTCCCCGCGGACATTTGGGCGGTACCGTCTTCCGATTCTGCTACTTCATTGATCTTCAATTCAGT TATTGTTTAATTCACACTAAAGAATTTCATTTTTATTCTTGGTAGTAGTAGTTTCAATTTTTCTGCTGTAATTTGTTGTG TTGATTGCACATTTGTTTAATTCAGCTTCGATTGTTAGGGTTGCAGAGTGAGATTTTTAGGAATTTTGAAACAATGTGTG TGTTTGGAAACCTAGTAGCAAGTATGTTGGGGGAAGTAGTTATTCTTCGCGAAGTTACTACTGCTAGCTAGTAGCTATTG TGGGGAGTGAAGTGATTCTGTAAAGTTTAAATGTGAAACCAAATATACTAATTGGGTGGGATGTGTGATTAGTATAGAAG TGAAAACTTAATAAAGACTCTCACACATGACTAGTTCTTTTCTGATTGCGTTGTTACTATACCATTGTCGTGATGGAGAA AATTGCTATACAATTGACTAATGAATGCACGGGTTATATGGGGGCTTTACATGCTGATAAATAGCATAAAAAAGGCTAGT GACAAATGCATAGATTATGAGTAACTCTGCCCAAACTAATGTCCTCGTCTTAGAAGAAACTAAAATTTCAAAAACGGGCT TGGATATGGAGAAAATAGGAACAGTTGGGTTTCGATTTAGAAACTGGAAGAAAGATTTACCTTTTGTAAGGGAAATAGTG TGCATAGTTTTGACAAAAGGTTATTCAACCTCCATATTATGGACAGGGTACTTTTATCATTTATGGTTTTTTATTCTTTA GTTAAGCTTGTGTCAATTAAATCCAGGTTGTTATTGCGTCTTCTTTACTATTAATTAGTTTGACAGTTTTTTGGTTAATG CAGAAACTATTTTATCTTATTCAAAAGGAAGAGTTTTGGATCTTTGTTTTTTTGATTAATTGAAGAACTAAAACTGCATT ATTTCATTCATTAATGATGTTTTTGTGACAAATACAGACGATGTCTTCTCACTCTGAGAATGGAGGTATCTCTTTCTTTT GGAGCTGGTCATATTGGAGTACATTTTTGCTTACCTGGTACGCTTCTTGTTACCCTGTAAAATTTATATGATTATATGTT GCATTACTTTCACATCCTTCTGTGTACTTCAACTGAATTGTATTGTTTAGCAAGGAAGGCCAATTGTCTACCATATTTTG GTTGATTGTCTACCATGTGAGATACCTGCTTTGCTCTCTCATGGCTTGACTGTCGAACATTCCTCCAGGATTCTCTGTTT GAGTCTATGATGTTATGTATCTGATATATAATGGGATTGAGCTGCAATGACTCTTCAATGTGAAAAATGTCTTTAATCTT CGTAACATCAACCCATATTTGATTGTATTAATATTATTCTCCTTTGATTGACAGTTAGCACTATCTTTTTGTATCTCTGC 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GGTCATTTGAAAGAAAGTACAGTTAATCTTATTGGGTTGTCAAGACCACGGCAGGGCCATGTATAACCTCACCATTCACG TGGTTCCTAAGGACTCCCACTAGGGTACCTAAGGGGAAAGTAATGGTGTGTTACATCAGAGTTTTAAGCCCCCTTATCAG GAACTTGCAAGAAAATGTCCCAACCAAGTGAACTAGGATCACAGGATACATTTAATTTTAGTGGGTTGTCCCACAGCAGG GCCAAGCAGAGCTCCACCATCGAAGTGCTGCCTAAGGATTCCTTCTATGGTACCTGAAGGGGTGGGGGGGGGGAGGGAAA TTGATGGTGTTTAACCTCAGAGTTTTGAATCCCCTACCATGAACTTGCAAGAAAATGTCTCAACCAAGTGAACTAGGCTC ACAGGATAAATAAGTTACAGGTTTAAATTTTACATGTTAGTCACAGATTTTCAATAAGGAGAATCCTTTTTGTTATGAAG GATAGGTGCCACGAAACATAAGAACAGAGGTTCTGTTTGATTTCTGTCAAAACCATCTCCTTATAATTTTATTTTTTAAT TAATATGTCCTTTTGAAAAAGATCAAAGCATTCAATTTTCAGTTCTTATGTTTCGTATCATACTATATAGCAATTCTCTT TCAATAATCAATAGCTTGTACGGTTTTTCAAGTCATTGACACAAATATCTGCTCGTTGTCTAATTGTTTGTCTCTTCCTT GTCATGATGTTCATGGTTGACAAGTTAATACGCAATAAGGTTTTTTTCATATATATGTGTATTTATTTTTCGGGTTTATG TGATGCAATACCTTTTTATTTTGAATATTTTTAATTGATTCATACTTCTGGAAGCAGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTG CCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGCATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGC 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GGTTTGCTTCTAATTTTGTTTTCTATTTTGTTGGTTTTCCCAGCTTCAATATCATTCTATAATATATTACAGGTTCTTCG AGCTCATATTACATCATTTTTTTATGATATAACTTCAGGGAATATAATTCAAGCATTAGACCTGCTCGGACTGGCAAGTT GGGGTCTGTATTTGATACTTTAGGTAATAATGAGAATTATTATTAAATCTATATTATCCTAACTTCACTGAATATTACTT TTCTCTAATGAAATTTGATTATTGTTAGATATCTTGTAAATAAGTAGGATATCTTTTATTTAAGTAGGATATCTTTTATT AATTGTAAATAGGTAGCATAGTCATTGTAAATAGGGTAACAATGATATTGTACATTGATTGCACCCAGTGTTGTCAAACC CGAATAGCAGGGCGTAGCAGCCGACCCCTATAATGCTATAGCGTATAGCGAGATGGCTGTATGCTGAATATTTTTATATA TAGTTTATTTTATACTAAACACTATGCTTAAAAATGATAAAAAACACTCAAAATTCATGACATTCAAAAAGGAGATAGAG GTTGCTGGGATAGAAGAGATAACTAAAAAATAAAGGACTACAGCATAAACTAAGTAACTAATGGAGGCTGTTGTGATAAA AAAAAAAAAGATAGAGGCTGCTGGGATAAAAGTGATGCATGGTAGTTACTTAGAGACTAAAAGAGAATACAAATTGAAAC AACACTGGCAGAATAAATAACCAGAAGAAAAAAAACAAAGCAGGCATTAGGGAAACAACAGAGAAGGATAGCAAGCTCAA GGATGCGAGAACAAAACTGGGTATTTGGGGATGCAGAGGTGTCGCTATAAGGTTGCTGGAAGGATGCCGGAGGCTGGTCA GAAGTGGTGTGCAAGCTAGAGTGCAGGAAGAATGGAGACACAGTGCTGGGCAGAGGTCGAAGTGAAGTATCAGAGAGGGG GATGTACTATAATGGGTTATTCTAACTTTTCCGAGGCAAAATTTCGTATCTACCCTCAAAAGGTTGCTCTAACAGTAAGA TTTTAAGGGTAAAAGGGGTTTTTTCGATAAACCATCAGAATAGTGCAGCATTTGTGATACAATTCCCACTATTCAGGCCA ACCTATTGCGGCCGCAACAATGAGCCGCTCCACTTTTTGACATCCTTTTGCGGACAGTGGCTGCTCCGCTCCGCTCACCG CTATAGCATCGCTATTAACAACCCTGATTGCACCTATTATATATAATATAATGGACTCCGCTATGTAGTTGAAACACACA GACTCAGCAAATGCCTCATGTGTCTTTTTTGTTATTCAACATTGTATCAAGAGCCTAACAAGAGGCAATTCTAATCCTAA TCCATGACTATCTGGTAGAGACCCATCATGTTTCATTTCCGGTTTCTAGACCTTTTGTGCTGTCTGGCATCATTCCGACA GCCTTCTCCAGCTAATTCCGCCGCTGCCCAACCACCGAGTCTATATATGGTCTCAAGCAATCTCATAGGGCTTGATTTTG GCAGATTTGGCACTGTTATTCAGTAGTTTGTGTCAAAATAACCACTTATCCCAAAAGTTTAAGCTGTTGGGTAAGGGCCA CATGAATGGTTTTATATTATATTCTAACACCCCCCTCACGCAAGAGCCCTTTGGGCTTGAAGCGTGGATGAATGCATAGG CCCACCTACCATGTGCTTAATTAAATTCCACTTTTTAATTAGAAAGTGAGGGGAGCAAGGATCAAACTCTAGACCTCTCA GTCTCAGCCATAGAGGCTCTGATACCATGTCATAATAACCACTTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAAGGGCCACAT GAATGGTTTTATATTATATTCTAATAGTTTGGTATGACAGAGTGAGGCTGATCAGTCATCTTTTTATCATCACTCAGCTG CTGGGTGTATATACTTGATTGTGTATGTGGATGGCATTGTCATTACAGGCACCGATCATCATGGAATCACACAAGTAAAA CAACTTTGTCATCACTTTCAGACAAAAGACCTTGGCAGACTTTGTTATTTCTTGGGCATAGAGGTTGCACAATCCAAACA AGGGATTGTGATTTCACAGAGAAAGTATGCTATGGATATTTTGGAGGAGACAAGATTGTTAAATGCCAAGCCAGTTGACA CACCTATGGATCCCAATGCCAAACTTAGGCCAGCTCAAGGGGAGCCACTCTCAGATCCAAAAACATATAGGAGATTAGTT GGAAATATGAATTATCTCACTGTTACTCACCCAAATGTTTCATTTTCTTTTAGTAAGGTAAGCAATTTCTTAATTCTCCA TGTGAAGGGCATTGAGAGGTTGTGATTCGCGTACTGAATTATATTAAAAGTGCTCCAGGAGAAAGGTTAATTGTACGAAG ATAAGGGACATGCACGAGTTGTAGGATACTCAGATGCATATTGGGTAGGTTCTCATTTTGATAGGAGATCCACCTCGGTA GTGTGTTTTCTTTGGTGATAACTTAATTTCCTAGAAGCGTAAGAAACAAAGCGTAGTGGTAAGAGAGAGCAGAAGGCATG AGAGAACTGGCTGCGATGATGGGCCATGTTATCGTATGTTGGGATAAAACCCATTCACATGGAACAAAAAGGAATATTCA AAGATTCACAAGGGATTTTGCAACTGCTTTGGGAAAGAGATATAGATGACATCCAAGCTATTGCTAAAACTGTGGAGTTG ACTACAGTTTTGGGCATTGAAAAAGAGCAGTGGGATCCTGGTGGACATTATTGTCTTCTTCCTGTATCACGGTTAACATT TCCAGATAGGAGGACTTTGGTGGGATTTTGTTTTAGGTATCTCAAGCTAGGACAAGGTCAATGCTTACGGGAGGAGTATT GATAGGTACCCCTAGTTAGTTAGTAGTTTTGGTTAGTTGATAAAGTTAGCCATATAGTTAGTAAGTTAAGAGAGTTAGTT CACTTAGTTGGGCTGTAGAGGAAGAAATATAATAAATAAGAGAGTTTAGGAGGATTACATATTTTGGGATAATTTGTAAT TGGAAATTGGCAGAAACTCAATAATATCAGCTTTCCTTTTTTCTTTAGTGCTAGAACCTATTAGTTTTCCACAATGCCTC ATGAACATTTTATCCTTTCTCTGTATTAAGATATTTATGAAAAATATAATTCTACGTACCCTACTAGCTCAGTTGCTTCC TATGTAAAGAGACCTCAATATTAACTCTATTTTACGTTTTTTTTATTTTGTGGTTAAAAGTTGCATATATGTATATAGAA ATTAGAAAATTAAATTGACATTCCTAGGTTTTTAATTGAGAGATTCTGAATATAGTATTGACAAATGGTGGAAGTCAATC TAATTTCCTCATGCATATGTTGCTTTTGGCTTAAAAGTTTCTTGAATTTCATCTGACTTCTGTGTTACCTTTCTCAATTA GTTCCTTGCTACTTTAATATTGCATTGTTTGATCGTGCAAGGATAGGTCTACATTTTCCTTTCTTTTATGATTTCCTATT TTGGTTAGAGGCATTGGACCCAGGCTTCTAAATAAATGGTACTTCTTCACAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAA ACAAGTTGAGAAAGGCTTGGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTA GCTTTGATTTATCACTTTTCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTAGACCAAGTCTTT TAGAGATATTTAGTATAATGGACATTGAGATGCTGTATATGTATTTAAAATACTTTTTTACGTTTTTAAAAGTTTTGGAT GAAGATTTCATTCTGAATTTTTTGTGAATCTACAACACTTAAAAGAAAATTGATTTTAGATGTTCTTGATGAAGATTTCA TTCTGGAAGTTCTGGAAATCTATAATATGTCGATGAAAATTGCTATCTCATACAAACTTCTTTGCGAAGAGTAAGATGGG CTTCTGTTTGTATATCGATCAATGAGATATGACTTTTTCATTAGATACAGGCAGTCTTTTTCTCTTTTTTTTTTTATGAA AATAAACTTCCATTCCTTTTGGCTTAAGGCTGAACCAAATGCAAACAAATTGCTTATGGAATCTGATGTTGTGTCTTTGC TTCTGTAATATGCTTCTTCACATATACTATCTTTTTTTATAAAGGTTGTATAAATCACTTACCTTCAATTTTTTGCCCAG GTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGCATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTA CTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAACTTGCTTATGATATGCTCGTAAGTTTTTACTCATTTACTACTGCTGC TGCAATTATGACTACTTTATTTTTGCTTCTTGAATTGCCTATGCTCTCAAATGAATACCTGTTATATTTTATTCTTGATC CCAGGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTTCTAATAAAACGACT ATATTTGAAAAGGTACTCTTATCTAACAAATCTATTTGATTGTTGATTCTCTTTAAAATGTTTTTTTGACAATATTGTGG GGCACTGGGTGGAGTTCCATTTCCATATATTGCTTACTGTGATAGATCTTCTTGCTTATTACTTTGGCACTTATATTAAA TTAATTCCTAATAATCCTAGAAATTTCTTTTTCATTGGTTATAAGACTAGTCTATTATTTTGTTTACTTGTACTTATTTT CACATGCCTTTCGTATATTCTTTTATGATAATTTTTCTTCTCAGCTTGTAACTGTTAAATTATCTGAACTTTAGCCTCAG AACACTTTGGCTCCATCTCCTTAGTAATATTTTCTTATTATAATTTGGTGCGTGATTTGGCTATTACTGCAGAGAATGGG GAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAAATTTAACAAAATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTT TGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATTTTCTGGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGAT GATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATTTTACAAAGAGGTCTGAAACAAATTGAAACAAATTTTCCGTTGTT ACAACTTTAGTTCAAGTTACTCACTGAAAAAATCTTATCTAAATTTGTGATACTGACTTTGCCATACTTTTGATTGATTG ATTTTGCATTATTTGTAGAGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAAT TTTAATGGTGTTGATATTGAATCGGCAAACAATTTAATGGTATGTAGACATAACTTCAAAAAGGTGGAAGCAATCTTGTC TCACCTCCCATTTAGCCTCTCATCTCATAGTTTTGACAGATTCAACATATGACATTTGTTACTACTACAGTATAATCATT TTACACCTTAAACATTCAGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAACCAATGGACTGT CTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCTGCCATTAGAGAG CAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGATAAAGGCAGTAA TTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTTTCAAGGCCAACA TAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCTGAGTCCCTTGAT GAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAAGAGGGAAGCCAATACAG TATTTAAGGTCCCTCTAGATGACTTCCATCGTTTGGCAAGAGCTTAGAAGTGTAAAGTGCAATAGGATTGGGAATGCAGG TCCATAATATCATGTATAGAAATGGTAAATTTTTGAATGCTGTGCTTAGAGAAAAAAATATACATAAGGCCCCAATGCAG CCTGAAGATGGAATTGTCTGCTACACAAACTTCACTTTAGAAATCAATCACACAAAAACTAGCCGATAGTTAGACAGTAT ATATTTAAAATTGTGCCAGTACAGCATTACCGATGTTTTGCCTGGCTTAAATTCATAATTTTTTCCACTGACGAGTGACT TGGATTGCATTGCATTGTTTTGCGGAATGTCTTTAATGTTTTTCTAGCGAATTTACTCCTTGTTCATTGAATCTTGTGTA ATATCATGAATCGGAAGATTTATTTTGACTTGTGAATCGTATCATCTTATGTATTGTAGGATACAAACACACACAAAAAT AAGCCATAAATAAAAAATATGGTATATATCTTACCTTTAAGAAGTGAGTCCAACCATTCTTTCAGTAATAAAACCATGAT GAAAATTGAGCTCACCAAATTTATTGTTACTTAAATTCTTCTGTTATTTTTTTTCCCTAGAACCATTTCATTGGTGGGAT AATTTCATCCTACCTTACTTCCCTCCCCATGGTGCTTGAGAAGAGAATTGCTGCCGATTCAAACTAAAATCAGCCTGACA CAATAAGACTCCATGGTGACAAGAAGGTTGTGGTTTTGGGTGCTCACCAGATCTAGCAGGCTTAAAACATCCACAGCTAG GAAGAATGGAATCCCTCAATTTAAAAAAAAAATTCTACACACTTCATATCTAAATAATGAATTTTATTACAAAATTAATT TAATTACACAGTATAAATGCAATTCTTTCTTAAAATACTTTTTCTAATTCAACAAAACACTGAAATTCCTGAATTGAGCA ACAACAGAAACATCACTCAATTATATGACATACATACACATATGTGACACAAGAATCATTAATTATCAATAAGCCACCCT GGAATTCACAACAGATACTCCTGTGTCTTTTCTCTTCAGTCTGAGAACCTTGGACCAGAAACCATCGCTCTTGCTCCTTC CCCTGCTGTTTCTCGTAGCAAAGGCAAGCGACTTGCTCTTCTTCAAGTTGTTAAACCCCAGAATGCATGAAGGGCCGGAA CCCATCGCGTGCGAACCGTTCCGGCGGAAGCGTTTTCGATGAACCGCCGAAGATACATCGTGGTTATTCGACGAGGCATG ATTCCTCGTTGAAGGCGAATCAGGCGACGAAATAGGAGAAGGAGAGTAGCAGATAATAGGTTCAATAGGGGAATTCGTGG TGTAGAGCTGAGATAGCTTGTCACTTAAGCAAAAGGAGCAAACACCTGGTACTTGTTTATGAACATTTCGATGCTCCTTG CACCACCCTGCTCTTGTAGCTTGTAATTCCGAGTAGTTCATCATCTTAACACAAGTTCCTCGGGAAAAAGTTGTGTTCAC AATTCAATTACACCAAATATGAAGAAAAGATAGATAAATGAGTGATATGATATGTGATATGATAGAAAATACAGAGAGAT CAAAAGAAAAATGAGTGAAAATGAGACACAAGATCAGAAAGTGAACTTTGTGAATGTATCAAAAATCAAAATTCTGATCA GACAGATCACAAAAGACAACCAATTGCAGTTGCAGATAGTATCAGTTTGGAACTCTGATCTTAACTTTATTGCTGTTGCT TTAAGTTTCTTGGTCACTCGTGCGTGCAGTGATTTATAGATTCATAAGTCAAAGATGCTAGCTAGGAGTTTGCTTAGGAC AACCGTGTTTCTAATTTGGCCGCTCTTAATTAAATGATATTATCGCTCTCAGCTATAGGAAAATTG 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0090700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTGGGTGTTTTACCTGATCTCGCTACCTCTAACAACTGGCATGGTGCTTTTCACCTTGAGGTACTTCGCTGGCCCTGA TGTTCCTCGCTACGTGCTTTTCACTGTTGGATACACCTGGTTTTGCTCCCTCTCTGTCATCATCCTCGTCCCCGCGGACA TTTGGGCGACGATGTCTTCTCACTCTGAGAATGGAGGTATCTCTTTCTTTTGGAGCTGGTCATATTGGAGTACATTTTTG CTTACCTGGGCTGTGGTGCCCCTTATTCAGGGTTTCGAAGATGCTGGGGATTTCACTGTATCAGAAAGATTGAAGACTAG TGTACATGTTAACTTGGTCTTCTATCTAATTGTGGGATCCATTGGCCTTTTCGGACTTGTTCTTCTCATTATGATGCACA GAAGCTGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGCATTTCTTCTT GGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTACTTTCTCACAA AATTTCCCAAATGGCTGTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTTGCTCAAGCAACATCCA AGCAGATGTCCAAGCGTGATCCTTTGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATATGCTTGCTCAAATGTTTAGGGAAGAC CCATCCTTCAAACCACAAGGTGGCCAATTAGGGGAAAATGATATGGATTATGATACAGATGAGAAGTCAATGGCAACACT AAGGCGTCATCTTCGAAAAGCTCGTGAGGAGTATTACAGATATAAAAGTGAGTATATGACTTATGTACTGGAAGCCCTTG AATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGATGGGAATATAATTCAAGCATTAGACCTGCTCGG ACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAAACAAGTTGAGAAAGGCTT GGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTAGCTTTGATTTATCACTTT TCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGC ATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAA CTTGCTTATGATATGCTCGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTT CTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAAATTTAACAAA ATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATTTTCTGGGAAG CTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATTTTACAAAGAG AGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAATTTTAATGGTGTTGATATT GAATCGGCAAACAATTTAATGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAACCAATGGACT GTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCTGCCATTAGAG AGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGATAAAGGCAGT AATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTTTCAAGGCCAA CATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCTGAGTCCCTTG ATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0090700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MWVFYLISLPLTTGMVLFTLRYFAGPDVPRYVLFTVGYTWFCSLSVIILVPADIWATMSSHSENGGISFFWSWSYWSTFL LTWAVVPLIQGFEDAGDFTVSERLKTSVHVNLVFYLIVGSIGLFGLVLLIMMHRSWTGSLLGFAMACSNTFGLVTGAFLL GFGLSEIPKSIWRNAEWTTRQKVLSHKISQMAVKLDDAHQELSNAIVVAQATSKQMSKRDPLRRYMDVIDDMLAQMFRED PSFKPQGGQLGENDMDYDTDEKSMATLRRHLRKAREEYYRYKSEYMTYVLEALELEDTMNNYERRKSTGWEYNSSIRPAR TGKLGSVFDTLEFCWRCILRKQVEKGLAVLLGIMSVAILLAEATLLPSFDLSLFSILIKSVRTQEMLVQVFAFVPLMYMC MCTYYSLFKIGMLMFYSLTPRQTSSVNLLMICSMVARYAPPVSYNFLNLIRLGSNKTTIFEKRMGNIDNAVPFFGDKFNK IYPLIMVTYTLLVASNFFDRVFDFLGSWKRYIFKTEDDDMDGLDPSGVIILQRERSWLEQGHKVGEQVVPLARNFNGVDI ESANNLMERHVEMKTNSDVITEETNGLSKSSREETSRYGSSREAISNKYAAIREQGGPASKRKAEEKNVASANSVLDKGS NSGGAPSSGLASTWLNMKTGFQSFKANIGAKKFLPIRQIQESNVSCVSSSESLDEIFQRLKGTSLDQNTYNEED 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 712 712 0.0
Phobius 1 5 5 -
PANTHER 1 712 712 0.0
Pfam 4 497 494 1.8E-88
TMHMM 4 23 20 -
Phobius 6 24 19 -
Phobius 25 30 6 -
TMHMM 30 52 23 -
Phobius 31 50 20 -
Phobius 51 69 19 -
TMHMM 67 89 23 -
Phobius 70 89 20 -
Phobius 90 109 20 -
Phobius 110 131 22 -
TMHMM 110 132 23 -
Phobius 132 142 11 -
TMHMM 142 164 23 -
Phobius 143 164 22 -
Phobius 165 345 181 -
Coils 257 284 28 -
Phobius 346 366 21 -
TMHMM 347 366 20 -
Phobius 367 385 19 -
Phobius 386 407 22 -
TMHMM 386 408 23 -
Phobius 408 427 20 -
Phobius 428 447 20 -
Phobius 448 480 33 -
TMHMM 481 498 18 -
Phobius 481 502 22 -
Phobius 503 714 212 -
MobiDBLite 580 602 23 -
MobiDBLite 614 647 34 -
MobiDBLite 633 647 15 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0090700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…