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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0090700 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0090700.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | LMBR1 domain-containing 2; TAIR: AT5G65290.1 LMBR1-like membrane protein; Swiss-Prot: sp|Q54Q92|LMD2A_DICDI LMBR1 domain-containing protein 2 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|G7J381|G7J381_MEDTR LMBR1 integral membrane-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0090700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:19514135..19525357) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGTCTTCTCACTCTGAGAATGGAGGTATCTCTTTCTTTTGGAGCTGGTCATATTGGAGTACATTTTTGCTTACCTGGTA CGCTTCTTGTTACCCTGTAAAATTTATATGATTATATGTTGCATTACTTTCACATCCTTCTGTGTACTTCAACTGAATTG TATTGTTTAGCAAGGAAGGCCAATTGTCTACCATATTTTGGTTGATTGTCTACCATGTGAGATACCTGCTTTGCTCTCTC ATGGCTTGACTGTCGAACATTCCTCCAGGATTCTCTGTTTGAGTCTATGATGTTATGTATCTGATATATAATGGGATTGA GCTGCAATGACTCTTCAATGTGAAAAATGTCTTTAATCTTCGTAACATCAACCCATATTTGATTGTATTAATATTATTCT CCTTTGATTGACAGTTAGCACTATCTTTTTGTATCTCTGCTATTAATTCCATAATTCATAAGGCATGCATGCATGCATGT AACATTTTTCCACTACAGAACAGACTTTGAGCTACAGTGGATTACTGGAAGTGATAATCAATAACACATGATATAGTTAT TATTTTACAAAATTTAGGTGGTTTGGTATATGTTTGTTTATGTTTCTAATTTTTTTTATGGCTACTCATCATCTTCTCAT GCGCTTGCCTACACGCTAAGCACAAATATCGCAAGGAAGTATTTGACTGGCTTTTTCTGATCAGTGATGCAAATTTCCTT ATATATTTAACTTATTTATCCTAAGCAGGGCTGTGGTGCCCCTTATTCAGGGTTTCGAAGATGCTGGGGATTTCACTGTA TCAGAAAGATTGAAGACTAGTGTACATGTTAACTTGGTCTTCTATCTAATTGTGGGATCCATTGGCCTTTTCGGACTTGT TCTTCTCATTATGATGCACAGAAGCTGGTAGGTTCTCATCCTCCAAACCTTATTTTTATTCTCGTTTTAGTTTTTTTTTG TAGGATGATGTTTGCTCCAAGTTCTTGTTGCCTGTATATCTGTTTAAATTTTTATTTTCTAACTTCCTATGATCTCCTCA AAGACACATGCATGACAACTAGTTTCTTATTGATTATTTACTCTGCCATATGTGGATTTGTGGATATGCTTTGCTAATAA TGTTGGGCTGCATGCTTTGTTATGAGTGACTGATGTATTCATGAAAATTGAACCTGTACAGACCTCAAACGCACATGCAC TCTCTTTCTCTCTCTCTCTCACTCTCCCTCTCTGTATGAGGAAATATTTAATAAACTACTCTATCTGATTAAGCAATTGA TTTGCAAAGTTCAGATTTCACATTGCCTTTGTGAGGACATTTCAGAATATGGAAGACCCTCAATATGTCATCTGTGCAAG ATGTGGGTATACAATAATATAGATACCTGAAAAATAGTGAGGTCATTTGAAAGAAAGTACAGTTAATCTTATTGGGTTGT CAAGACCACGGCAGGGCCATGTATAACCTCACCATTCACGTGGTTCCTAAGGACTCCCACTAGGGTACCTAAGGGGAAAG TAATGGTGTGTTACATCAGAGTTTTAAGCCCCCTTATCAGGAACTTGCAAGAAAATGTCCCAACCAAGTGAACTAGGATC ACAGGATACATTTAATTTTAGTGGGTTGTCCCACAGCAGGGCCAAGCAGAGCTCCACCATCGAAGTGCTGCCTAAGGATT CCTTCTATGGTACCTGAAGGGGTGGGGGGGGGGAGGGAAATTGATGGTGTTTAACCTCAGAGTTTTGAATCCCCTACCAT GAACTTGCAAGAAAATGTCTCAACCAAGTGAACTAGGCTCACAGGATAAATAAGTTACAGGTTTAAATTTTACATGTTAG TCACAGATTTTCAATAAGGAGAATCCTTTTTGTTATGAAGGATAGGTGCCACGAAACATAAGAACAGAGGTTCTGTTTGA TTTCTGTCAAAACCATCTCCTTATAATTTTATTTTTTAATTAATATGTCCTTTTGAAAAAGATCAAAGCATTCAATTTTC AGTTCTTATGTTTCGTATCATACTATATAGCAATTCTCTTTCAATAATCAATAGCTTGTACGGTTTTTCAAGTCATTGAC ACAAATATCTGCTCGTTGTCTAATTGTTTGTCTCTTCCTTGTCATGATGTTCATGGTTGACAAGTTAATACGCAATAAGG TTTTTTTCATATATATGTGTATTTATTTTTCGGGTTTATGTGATGCAATACCTTTTTATTTTGAATATTTTTAATTGATT CATACTTCTGGAAGCAGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGC ATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTAC TTTCTCACAAAATTTCCCAAATGGCTGTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTAAGTGGT TCATTCTAGTGTCTGTTAAATTCATTTCTCATTTTACTGTTGTAGAAGAAGTTACTAAAAATTGATTAGTTGAAATTTTT TGGTTTTTGATTGTGCTCAATGTTGTCATATGGTCCATGAGATTTAACCCACCTAGTGGGAGGCTTGGTTGCTGCCCTGG AAGTTTTGTTAATCTTTCACTTGGTAGTGAGATAGAACTGCCTTTTTTTGCTTGTGATTTGTGTCATTTTGATTAAAAAG AAAAAACTTATTCAATAACACCTTCCCTGAGTTGTATTTCTCCAATTGGCTTTATTTTAAGTTGTGGATACATTGGAAAT ATATTAATTTTGAAACTTGTATGCATAGCAGAAAATATGTATAATAGAGCTGAGGTTATGCACTGTCTGATGTCTTGTTC CTTTCCTTCTCGTATAAAAGTTACTAGTAGTAATAGCTTGTTTGTGGCTAGTTATAGTAAGCTTTTGAGGGACATTCCAA TTTACAATTGGGCATCTCCATCGATTCTACATGTCTGCCATTTTGGCGAAAATGTTACTTGTGCCAGCAGTGCATCATTA GCGCTTGTGTTGCTCTCGAAAAGAAGCTGTGTAATATTGTATTTGATCAATTATTTTGTATATGGAAGATCTCATGTGTA TTATGTTTTTATTGGTTTGGGCCAGTGGGGTCACTGCAAAATAAGAATTGGAGCTTAATTATAGTTTATTTGTATAGGTT GCTCAAGCAACATCCAAGCAGATGTCCAAGCGTGATCCTTTGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATATGCTTGCTCA AATGGTATTGGGCTTACTTTATTTTATTAAGGATGTCTAAAAACACCTAAATTGTTTTCTTTGTTTAGATATAACCTTCA AATCTTCAGTTTAGGGAAGACCCATCCTTCAAACCACAAGGTGGCCAATTAGGGGAAAATGATATGGATTATGATACAGA TGAGAAGTCAATGGCAACACTAAGGCGTCATCTTCGAAAAGCTCGTGAGGAGTATTACAGATATAAAAGGTAAGCACATG GTCAATTGTGTTTGAGGTATTATTCATTAGAAAAGTTGTTTTTCAATCCTTCACCGCAGTTTCGGTAAATTTAATTCTTA TATTCTTACGATGAGTGAAAACATTTATTAGACCTATTTTTTATTTATTTTTTTATTCAGGTCAATGTCTTTGAGTGTAT CAATTAGATTAGTGAAAATGAAATTGCTGTTTTGTTACATGGAGCCCTAACATGTTACATATTACATAAATAGGTCAATT ACATGTGCTATTGAAGCTGGTTTGGTTAATAATTCTGGACATTAATTTCTATCCTTTAGTTTTACTTGGACTGGAAAGAG TTTCATTTTTGCTTCCTAGGCTCCTCGCATCTATTAATATGAAAAACCTTGTAAAATCTAGCTTTCTGATTTATCCAGTG GCGAAATAGATTCCTTCTTGCCTTGTTTAGACCAGTGTTATCAAATAACGGCTATAGTGTAGCGGATTTTTGGCTAATCG CGACGCCGCTATTGCCCGCTATAGCGCGCTATTACCGCTATTTCCGCTACTCGCCGCCAAATAGCGGATTCTTGGCTCAC CGCGATCGCGATTTGATAACACTGGTTTAGACTAATTTATATATGTTAATGACTTGTTAACAGATGCACTCCCATGGCCA TGAGGATGGGGGCAATTGCCCGCACAAGATTTAAGAGTTCATTTGTAATACTCATACTTGATAGTAGAAGATTGCCCCAT GATATTTTCTCAACTCTTAAAGTTTCCCTACTACAGATCCAACACTCTTAACACCTTTTTGTCAAAAAAAAAAAACTCAA ACCTCATCAATTTTTTTCTCCTCTGTAGTATTGGAAACTCGTTACTCTCACATTATAAAACTAGTGTAAAAGTGTCAGTT TTTTATAATAAATTTAGTTTTTTTTAAACAGTATTGATGGTTAACCAAACAATGATAGGTGTCAATAATATGAATGCAAA GAGCACATAGTACTTAGTACCAAGCTTGTTAATAGCGCGCCCTAGTGGTGCAATAGCGCTATAGCATAGCACCCTGGGGG TTAACCGCTACTCCACTATTCACCCTATTTGCCGCTATTGTCCGCTATAGCGCCGCAATAGCGCTCAAAATAGTGTTTTC TGGGCTTGCCGCTATGCTACGCTATCCGCGATTATGTTCATTTTAATTTTTTCAATGGAAAATTTTCTTAAAATAAAATT AACAATTGATCGAACATCTTCTCCTGAAATATGTAATGAATGGCTGATGACTGTTTACTTTATAGAGAGATTTTTTGTAG TGCCCAAAATAAATGTAGTAAAAACTCATTCAAATGTTTTCAGAATATTAAAACTTGTTGAAAATAATTATATTATATAT TTATATTTTTAATGAGAGTATATGATATATGCTTTTAGTGTTACAAATTTACACATGTCACCCCAACAACTTAAAATTTC TTACTTCATCATTGTGTGTATATGTGTGTGGTTTTCCCCCACAACTTGAGATGTCTGGATCCGTCACTGTTAATGAGAGA TATACCGCAGCTTTATTACTTAGTTGCAGCGCTTACTTCTGTCAAATCTGTACAAATAAGGTCTCTTAGATTTTTCCTTC AGCGGTAGCCAAACTTTATTTGGTATTGTTTCTTTTGCAGTGAGTATATGACTTATGTACTGGAAGCCCTTGAATTGGAA GATACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGATGGTTTGCTTCTAATTTTGTTTTCTATTTTGTTGGTTTTCC CAGCTTCAATATCATTCTATAATATATTACAGGTTCTTCGAGCTCATATTACATCATTTTTTTATGATATAACTTCAGGG AATATAATTCAAGCATTAGACCTGCTCGGACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGGTAATAATGAGAATTAT TATTAAATCTATATTATCCTAACTTCACTGAATATTACTTTTCTCTAATGAAATTTGATTATTGTTAGATATCTTGTAAA TAAGTAGGATATCTTTTATTTAAGTAGGATATCTTTTATTAATTGTAAATAGGTAGCATAGTCATTGTAAATAGGGTAAC AATGATATTGTACATTGATTGCACCCAGTGTTGTCAAACCCGAATAGCAGGGCGTAGCAGCCGACCCCTATAATGCTATA GCGTATAGCGAGATGGCTGTATGCTGAATATTTTTATATATAGTTTATTTTATACTAAACACTATGCTTAAAAATGATAA 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CTATATATGGTCTCAAGCAATCTCATAGGGCTTGATTTTGGCAGATTTGGCACTGTTATTCAGTAGTTTGTGTCAAAATA ACCACTTATCCCAAAAGTTTAAGCTGTTGGGTAAGGGCCACATGAATGGTTTTATATTATATTCTAACACCCCCCTCACG CAAGAGCCCTTTGGGCTTGAAGCGTGGATGAATGCATAGGCCCACCTACCATGTGCTTAATTAAATTCCACTTTTTAATT AGAAAGTGAGGGGAGCAAGGATCAAACTCTAGACCTCTCAGTCTCAGCCATAGAGGCTCTGATACCATGTCATAATAACC ACTTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAAGGGCCACATGAATGGTTTTATATTATATTCTAATAGTTTGGTATGACAG AGTGAGGCTGATCAGTCATCTTTTTATCATCACTCAGCTGCTGGGTGTATATACTTGATTGTGTATGTGGATGGCATTGT CATTACAGGCACCGATCATCATGGAATCACACAAGTAAAACAACTTTGTCATCACTTTCAGACAAAAGACCTTGGCAGAC TTTGTTATTTCTTGGGCATAGAGGTTGCACAATCCAAACAAGGGATTGTGATTTCACAGAGAAAGTATGCTATGGATATT TTGGAGGAGACAAGATTGTTAAATGCCAAGCCAGTTGACACACCTATGGATCCCAATGCCAAACTTAGGCCAGCTCAAGG GGAGCCACTCTCAGATCCAAAAACATATAGGAGATTAGTTGGAAATATGAATTATCTCACTGTTACTCACCCAAATGTTT CATTTTCTTTTAGTAAGGTAAGCAATTTCTTAATTCTCCATGTGAAGGGCATTGAGAGGTTGTGATTCGCGTACTGAATT ATATTAAAAGTGCTCCAGGAGAAAGGTTAATTGTACGAAGATAAGGGACATGCACGAGTTGTAGGATACTCAGATGCATA TTGGGTAGGTTCTCATTTTGATAGGAGATCCACCTCGGTAGTGTGTTTTCTTTGGTGATAACTTAATTTCCTAGAAGCGT AAGAAACAAAGCGTAGTGGTAAGAGAGAGCAGAAGGCATGAGAGAACTGGCTGCGATGATGGGCCATGTTATCGTATGTT GGGATAAAACCCATTCACATGGAACAAAAAGGAATATTCAAAGATTCACAAGGGATTTTGCAACTGCTTTGGGAAAGAGA TATAGATGACATCCAAGCTATTGCTAAAACTGTGGAGTTGACTACAGTTTTGGGCATTGAAAAAGAGCAGTGGGATCCTG GTGGACATTATTGTCTTCTTCCTGTATCACGGTTAACATTTCCAGATAGGAGGACTTTGGTGGGATTTTGTTTTAGGTAT CTCAAGCTAGGACAAGGTCAATGCTTACGGGAGGAGTATTGATAGGTACCCCTAGTTAGTTAGTAGTTTTGGTTAGTTGA TAAAGTTAGCCATATAGTTAGTAAGTTAAGAGAGTTAGTTCACTTAGTTGGGCTGTAGAGGAAGAAATATAATAAATAAG AGAGTTTAGGAGGATTACATATTTTGGGATAATTTGTAATTGGAAATTGGCAGAAACTCAATAATATCAGCTTTCCTTTT TTCTTTAGTGCTAGAACCTATTAGTTTTCCACAATGCCTCATGAACATTTTATCCTTTCTCTGTATTAAGATATTTATGA AAAATATAATTCTACGTACCCTACTAGCTCAGTTGCTTCCTATGTAAAGAGACCTCAATATTAACTCTATTTTACGTTTT TTTTATTTTGTGGTTAAAAGTTGCATATATGTATATAGAAATTAGAAAATTAAATTGACATTCCTAGGTTTTTAATTGAG AGATTCTGAATATAGTATTGACAAATGGTGGAAGTCAATCTAATTTCCTCATGCATATGTTGCTTTTGGCTTAAAAGTTT CTTGAATTTCATCTGACTTCTGTGTTACCTTTCTCAATTAGTTCCTTGCTACTTTAATATTGCATTGTTTGATCGTGCAA GGATAGGTCTACATTTTCCTTTCTTTTATGATTTCCTATTTTGGTTAGAGGCATTGGACCCAGGCTTCTAAATAAATGGT ACTTCTTCACAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAAACAAGTTGAGAAAGGCTTGGCTGTTCTACTTGGTATCATG TCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTAGCTTTGATTTATCACTTTTCTCCATTCTTATAAAATCTGT GAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTAGACCAAGTCTTTTAGAGATATTTAGTATAATGGACATTGAGATGCTGTATAT GTATTTAAAATACTTTTTTACGTTTTTAAAAGTTTTGGATGAAGATTTCATTCTGAATTTTTTGTGAATCTACAACACTT AAAAGAAAATTGATTTTAGATGTTCTTGATGAAGATTTCATTCTGGAAGTTCTGGAAATCTATAATATGTCGATGAAAAT TGCTATCTCATACAAACTTCTTTGCGAAGAGTAAGATGGGCTTCTGTTTGTATATCGATCAATGAGATATGACTTTTTCA TTAGATACAGGCAGTCTTTTTCTCTTTTTTTTTTTATGAAAATAAACTTCCATTCCTTTTGGCTTAAGGCTGAACCAAAT GCAAACAAATTGCTTATGGAATCTGATGTTGTGTCTTTGCTTCTGTAATATGCTTCTTCACATATACTATCTTTTTTTAT AAAGGTTGTATAAATCACTTACCTTCAATTTTTTGCCCAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGCATGTGCA CATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAACTTGCTT ATGATATGCTCGTAAGTTTTTACTCATTTACTACTGCTGCTGCAATTATGACTACTTTATTTTTGCTTCTTGAATTGCCT ATGCTCTCAAATGAATACCTGTTATATTTTATTCTTGATCCCAGGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAA CTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTTCTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGGTACTCTTATCTAACAAATCTATTTGAT TGTTGATTCTCTTTAAAATGTTTTTTTGACAATATTGTGGGGCACTGGGTGGAGTTCCATTTCCATATATTGCTTACTGT GATAGATCTTCTTGCTTATTACTTTGGCACTTATATTAAATTAATTCCTAATAATCCTAGAAATTTCTTTTTCATTGGTT ATAAGACTAGTCTATTATTTTGTTTACTTGTACTTATTTTCACATGCCTTTCGTATATTCTTTTATGATAATTTTTCTTC TCAGCTTGTAACTGTTAAATTATCTGAACTTTAGCCTCAGAACACTTTGGCTCCATCTCCTTAGTAATATTTTCTTATTA TAATTTGGTGCGTGATTTGGCTATTACTGCAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAAATTT AACAAAATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATTTTCT GGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATTTTAC AAAGAGGTCTGAAACAAATTGAAACAAATTTTCCGTTGTTACAACTTTAGTTCAAGTTACTCACTGAAAAAATCTTATCT AAATTTGTGATACTGACTTTGCCATACTTTTGATTGATTGATTTTGCATTATTTGTAGAGCGGTCTTGGCTTGAACAAGG ACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAATTTTAATGGTGTTGATATTGAATCGGCAAACAATTTAATGG TATGTAGACATAACTTCAAAAAGGTGGAAGCAATCTTGTCTCACCTCCCATTTAGCCTCTCATCTCATAGTTTTGACAGA TTCAACATATGACATTTGTTACTACTACAGTATAATCATTTTACACCTTAAACATTCAGGAGAGACATGTCGAAATGAAG ACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAACCAATGGACTGTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAG CAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCTGCCATTAGAGAGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAA ATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGATAAAGGCAGTAATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGG CTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTTTCAAGGCCAACATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGA AAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCTGAGTCCCTTGATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAA ATACTTACAATGAAGAGGACTAA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0090700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTTCTCACTCTGAGAATGGAGGTATCTCTTTCTTTTGGAGCTGGTCATATTGGAGTACATTTTTGCTTACCTGGGC TGTGGTGCCCCTTATTCAGGGTTTCGAAGATGCTGGGGATTTCACTGTATCAGAAAGATTGAAGACTAGTGTACATGTTA ACTTGGTCTTCTATCTAATTGTGGGATCCATTGGCCTTTTCGGACTTGTTCTTCTCATTATGATGCACAGAAGCTGGACT GGAAGTCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGCATTTCTTCTTGGCTTTGGTTT GAGTGAAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTACTTTCTCACAAAATTTCCCAAA TGGCTGTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTTGCTCAAGCAACATCCAAGCAGATGTCC AAGCGTGATCCTTTGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATATGCTTGCTCAAATGTTTAGGGAAGACCCATCCTTCAA ACCACAAGGTGGCCAATTAGGGGAAAATGATATGGATTATGATACAGATGAGAAGTCAATGGCAACACTAAGGCGTCATC TTCGAAAAGCTCGTGAGGAGTATTACAGATATAAAAGTGAGTATATGACTTATGTACTGGAAGCCCTTGAATTGGAAGAT ACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGATGGGAATATAATTCAAGCATTAGACCTGCTCGGACTGGCAAGTT GGGGTCTGTATTTGATACTTTAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAAACAAGTTGAGAAAGGCTTGGCTGTTCTAC TTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTAGCTTTGATTTATCACTTTTCTCCATTCTT ATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGCATGTGCACATA CTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAACTTGCTTATGA TATGCTCGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTTCTAATAAAACG ACTATATTTGAAAAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAAATTTAACAAAATCTATCCACT TATTATGGTTACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATTTTCTGGGAAGCTGGAAGAGAT ATATTTTCAAAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATTTTACAAAGAGAGCGGTCTTGG CTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAATTTTAATGGTGTTGATATTGAATCGGCAAA CAATTTAATGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAACCAATGGACTGTCTAAAAGTT CGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCTGCCATTAGAGAGCAGGGAGGT CCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGATAAAGGCAGTAATTCCGGTGG AGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTTTCAAGGCCAACATAGGAGCCA AGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCTGAGTCCCTTGATGAGATATTT CAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0090700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSHSENGGISFFWSWSYWSTFLLTWAVVPLIQGFEDAGDFTVSERLKTSVHVNLVFYLIVGSIGLFGLVLLIMMHRSWT GSLLGFAMACSNTFGLVTGAFLLGFGLSEIPKSIWRNAEWTTRQKVLSHKISQMAVKLDDAHQELSNAIVVAQATSKQMS KRDPLRRYMDVIDDMLAQMFREDPSFKPQGGQLGENDMDYDTDEKSMATLRRHLRKAREEYYRYKSEYMTYVLEALELED TMNNYERRKSTGWEYNSSIRPARTGKLGSVFDTLEFCWRCILRKQVEKGLAVLLGIMSVAILLAEATLLPSFDLSLFSIL IKSVRTQEMLVQVFAFVPLMYMCMCTYYSLFKIGMLMFYSLTPRQTSSVNLLMICSMVARYAPPVSYNFLNLIRLGSNKT TIFEKRMGNIDNAVPFFGDKFNKIYPLIMVTYTLLVASNFFDRVFDFLGSWKRYIFKTEDDDMDGLDPSGVIILQRERSW LEQGHKVGEQVVPLARNFNGVDIESANNLMERHVEMKTNSDVITEETNGLSKSSREETSRYGSSREAISNKYAAIREQGG PASKRKAEEKNVASANSVLDKGSNSGGAPSSGLASTWLNMKTGFQSFKANIGAKKFLPIRQIQESNVSCVSSSESLDEIF QRLKGTSLDQNTYNEED
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 11 | 11 | - | – | |
| PANTHER | 4 | 655 | 652 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 4 | 655 | 652 | 0.0 | – | |
| Pfam | 10 | 440 | 431 | 1.2E-81 | ||
| TMHMM | 10 | 32 | 23 | - | – | |
| Phobius | 12 | 32 | 21 | - | – | |
| Phobius | 33 | 52 | 20 | - | – | |
| Phobius | 53 | 74 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 53 | 75 | 23 | - | – | |
| Phobius | 75 | 85 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 85 | 107 | 23 | - | – | |
| Phobius | 86 | 107 | 22 | - | – | |
| Phobius | 108 | 288 | 181 | - | – | |
| Coils | 200 | 227 | 28 | - | – | |
| Phobius | 289 | 309 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 290 | 309 | 20 | - | – | |
| Phobius | 310 | 328 | 19 | - | – | |
| Phobius | 329 | 350 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 329 | 351 | 23 | - | – | |
| Phobius | 351 | 370 | 20 | - | – | |
| Phobius | 371 | 390 | 20 | - | – | |
| Phobius | 391 | 423 | 33 | - | – | |
| Phobius | 424 | 445 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 424 | 441 | 18 | - | – | |
| Phobius | 446 | 657 | 212 | - | – | |
| MobiDBLite | 523 | 545 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 557 | 590 | 34 | - | – | |
| MobiDBLite | 576 | 590 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0090700.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…