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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0090700 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0090700.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | LMBR1 domain-containing 2; TAIR: AT5G65290.1 LMBR1-like membrane protein; Swiss-Prot: sp|Q54Q92|LMD2A_DICDI LMBR1 domain-containing protein 2 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|G7J381|G7J381_MEDTR LMBR1 integral membrane-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0090700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:19514135..19526489) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGTGGGTGTTTTACCTGATCTCGCTACCTCTAACAACTGGCATGGTGCTTTTCACCTTGAGGTACTTCGCTGGCCCTGA TGTTCCTCGCTACGTGCTTTTCACTGTTGGATACACCTGGTTTTGCTCCCTCTCTGTCATCATCCTCGTCCCCGCGGACA TTTGGGCGGTACCGTCTTCCGATTCTGCTACTTCATTGATCTTCAATTCAGTTATTGTTTAATTCACACTAAAGAATTTC ATTTTTATTCTTGGTAGTAGTAGTTTCAATTTTTCTGCTGTAATTTGTTGTGTTGATTGCACATTTGTTTAATTCAGCTT CGATTGTTAGGGTTGCAGAGTGAGATTTTTAGGAATTTTGAAACAATGTGTGTGTTTGGAAACCTAGTAGCAAGTATGTT GGGGGAAGTAGTTATTCTTCGCGAAGTTACTACTGCTAGCTAGTAGCTATTGTGGGGAGTGAAGTGATTCTGTAAAGTTT AAATGTGAAACCAAATATACTAATTGGGTGGGATGTGTGATTAGTATAGAAGTGAAAACTTAATAAAGACTCTCACACAT GACTAGTTCTTTTCTGATTGCGTTGTTACTATACCATTGTCGTGATGGAGAAAATTGCTATACAATTGACTAATGAATGC ACGGGTTATATGGGGGCTTTACATGCTGATAAATAGCATAAAAAAGGCTAGTGACAAATGCATAGATTATGAGTAACTCT GCCCAAACTAATGTCCTCGTCTTAGAAGAAACTAAAATTTCAAAAACGGGCTTGGATATGGAGAAAATAGGAACAGTTGG GTTTCGATTTAGAAACTGGAAGAAAGATTTACCTTTTGTAAGGGAAATAGTGTGCATAGTTTTGACAAAAGGTTATTCAA CCTCCATATTATGGACAGGGTACTTTTATCATTTATGGTTTTTTATTCTTTAGTTAAGCTTGTGTCAATTAAATCCAGGT TGTTATTGCGTCTTCTTTACTATTAATTAGTTTGACAGTTTTTTGGTTAATGCAGAAACTATTTTATCTTATTCAAAAGG AAGAGTTTTGGATCTTTGTTTTTTTGATTAATTGAAGAACTAAAACTGCATTATTTCATTCATTAATGATGTTTTTGTGA CAAATACAGACGATGTCTTCTCACTCTGAGAATGGAGGTATCTCTTTCTTTTGGAGCTGGTCATATTGGAGTACATTTTT GCTTACCTGGTACGCTTCTTGTTACCCTGTAAAATTTATATGATTATATGTTGCATTACTTTCACATCCTTCTGTGTACT TCAACTGAATTGTATTGTTTAGCAAGGAAGGCCAATTGTCTACCATATTTTGGTTGATTGTCTACCATGTGAGATACCTG CTTTGCTCTCTCATGGCTTGACTGTCGAACATTCCTCCAGGATTCTCTGTTTGAGTCTATGATGTTATGTATCTGATATA TAATGGGATTGAGCTGCAATGACTCTTCAATGTGAAAAATGTCTTTAATCTTCGTAACATCAACCCATATTTGATTGTAT TAATATTATTCTCCTTTGATTGACAGTTAGCACTATCTTTTTGTATCTCTGCTATTAATTCCATAATTCATAAGGCATGC ATGCATGCATGTAACATTTTTCCACTACAGAACAGACTTTGAGCTACAGTGGATTACTGGAAGTGATAATCAATAACACA TGATATAGTTATTATTTTACAAAATTTAGGTGGTTTGGTATATGTTTGTTTATGTTTCTAATTTTTTTTATGGCTACTCA TCATCTTCTCATGCGCTTGCCTACACGCTAAGCACAAATATCGCAAGGAAGTATTTGACTGGCTTTTTCTGATCAGTGAT GCAAATTTCCTTATATATTTAACTTATTTATCCTAAGCAGGGCTGTGGTGCCCCTTATTCAGGGTTTCGAAGATGCTGGG GATTTCACTGTATCAGAAAGATTGAAGACTAGTGTACATGTTAACTTGGTCTTCTATCTAATTGTGGGATCCATTGGCCT TTTCGGACTTGTTCTTCTCATTATGATGCACAGAAGCTGGTAGGTTCTCATCCTCCAAACCTTATTTTTATTCTCGTTTT AGTTTTTTTTTGTAGGATGATGTTTGCTCCAAGTTCTTGTTGCCTGTATATCTGTTTAAATTTTTATTTTCTAACTTCCT ATGATCTCCTCAAAGACACATGCATGACAACTAGTTTCTTATTGATTATTTACTCTGCCATATGTGGATTTGTGGATATG CTTTGCTAATAATGTTGGGCTGCATGCTTTGTTATGAGTGACTGATGTATTCATGAAAATTGAACCTGTACAGACCTCAA ACGCACATGCACTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCACTCTCCCTCTCTGTATGAGGAAATATTTAATAAACTACTCTATCTGA TTAAGCAATTGATTTGCAAAGTTCAGATTTCACATTGCCTTTGTGAGGACATTTCAGAATATGGAAGACCCTCAATATGT CATCTGTGCAAGATGTGGGTATACAATAATATAGATACCTGAAAAATAGTGAGGTCATTTGAAAGAAAGTACAGTTAATC TTATTGGGTTGTCAAGACCACGGCAGGGCCATGTATAACCTCACCATTCACGTGGTTCCTAAGGACTCCCACTAGGGTAC CTAAGGGGAAAGTAATGGTGTGTTACATCAGAGTTTTAAGCCCCCTTATCAGGAACTTGCAAGAAAATGTCCCAACCAAG TGAACTAGGATCACAGGATACATTTAATTTTAGTGGGTTGTCCCACAGCAGGGCCAAGCAGAGCTCCACCATCGAAGTGC TGCCTAAGGATTCCTTCTATGGTACCTGAAGGGGTGGGGGGGGGGAGGGAAATTGATGGTGTTTAACCTCAGAGTTTTGA ATCCCCTACCATGAACTTGCAAGAAAATGTCTCAACCAAGTGAACTAGGCTCACAGGATAAATAAGTTACAGGTTTAAAT TTTACATGTTAGTCACAGATTTTCAATAAGGAGAATCCTTTTTGTTATGAAGGATAGGTGCCACGAAACATAAGAACAGA GGTTCTGTTTGATTTCTGTCAAAACCATCTCCTTATAATTTTATTTTTTAATTAATATGTCCTTTTGAAAAAGATCAAAG CATTCAATTTTCAGTTCTTATGTTTCGTATCATACTATATAGCAATTCTCTTTCAATAATCAATAGCTTGTACGGTTTTT CAAGTCATTGACACAAATATCTGCTCGTTGTCTAATTGTTTGTCTCTTCCTTGTCATGATGTTCATGGTTGACAAGTTAA TACGCAATAAGGTTTTTTTCATATATATGTGTATTTATTTTTCGGGTTTATGTGATGCAATACCTTTTTATTTTGAATAT TTTTAATTGATTCATACTTCTGGAAGCAGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACT TGTTACTGGTGCATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCC GCCAAAAAGTACTTTCTCACAAAATTTCCCAAATGGCTGTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATT GTTGTAAGTGGTTCATTCTAGTGTCTGTTAAATTCATTTCTCATTTTACTGTTGTAGAAGAAGTTACTAAAAATTGATTA GTTGAAATTTTTTGGTTTTTGATTGTGCTCAATGTTGTCATATGGTCCATGAGATTTAACCCACCTAGTGGGAGGCTTGG TTGCTGCCCTGGAAGTTTTGTTAATCTTTCACTTGGTAGTGAGATAGAACTGCCTTTTTTTGCTTGTGATTTGTGTCATT 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CTTTGAGTGTATCAATTAGATTAGTGAAAATGAAATTGCTGTTTTGTTACATGGAGCCCTAACATGTTACATATTACATA AATAGGTCAATTACATGTGCTATTGAAGCTGGTTTGGTTAATAATTCTGGACATTAATTTCTATCCTTTAGTTTTACTTG GACTGGAAAGAGTTTCATTTTTGCTTCCTAGGCTCCTCGCATCTATTAATATGAAAAACCTTGTAAAATCTAGCTTTCTG ATTTATCCAGTGGCGAAATAGATTCCTTCTTGCCTTGTTTAGACCAGTGTTATCAAATAACGGCTATAGTGTAGCGGATT TTTGGCTAATCGCGACGCCGCTATTGCCCGCTATAGCGCGCTATTACCGCTATTTCCGCTACTCGCCGCCAAATAGCGGA TTCTTGGCTCACCGCGATCGCGATTTGATAACACTGGTTTAGACTAATTTATATATGTTAATGACTTGTTAACAGATGCA CTCCCATGGCCATGAGGATGGGGGCAATTGCCCGCACAAGATTTAAGAGTTCATTTGTAATACTCATACTTGATAGTAGA AGATTGCCCCATGATATTTTCTCAACTCTTAAAGTTTCCCTACTACAGATCCAACACTCTTAACACCTTTTTGTCAAAAA AAAAAAACTCAAACCTCATCAATTTTTTTCTCCTCTGTAGTATTGGAAACTCGTTACTCTCACATTATAAAACTAGTGTA AAAGTGTCAGTTTTTTATAATAAATTTAGTTTTTTTTAAACAGTATTGATGGTTAACCAAACAATGATAGGTGTCAATAA TATGAATGCAAAGAGCACATAGTACTTAGTACCAAGCTTGTTAATAGCGCGCCCTAGTGGTGCAATAGCGCTATAGCATA GCACCCTGGGGGTTAACCGCTACTCCACTATTCACCCTATTTGCCGCTATTGTCCGCTATAGCGCCGCAATAGCGCTCAA AATAGTGTTTTCTGGGCTTGCCGCTATGCTACGCTATCCGCGATTATGTTCATTTTAATTTTTTCAATGGAAAATTTTCT TAAAATAAAATTAACAATTGATCGAACATCTTCTCCTGAAATATGTAATGAATGGCTGATGACTGTTTACTTTATAGAGA GATTTTTTGTAGTGCCCAAAATAAATGTAGTAAAAACTCATTCAAATGTTTTCAGAATATTAAAACTTGTTGAAAATAAT TATATTATATATTTATATTTTTAATGAGAGTATATGATATATGCTTTTAGTGTTACAAATTTACACATGTCACCCCAACA ACTTAAAATTTCTTACTTCATCATTGTGTGTATATGTGTGTGGTTTTCCCCCACAACTTGAGATGTCTGGATCCGTCACT GTTAATGAGAGATATACCGCAGCTTTATTACTTAGTTGCAGCGCTTACTTCTGTCAAATCTGTACAAATAAGGTCTCTTA GATTTTTCCTTCAGCGGTAGCCAAACTTTATTTGGTATTGTTTCTTTTGCAGTGAGTATATGACTTATGTACTGGAAGCC CTTGAATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGATGGTTTGCTTCTAATTTTGTTTTCTATTT TGTTGGTTTTCCCAGCTTCAATATCATTCTATAATATATTACAGGTTCTTCGAGCTCATATTACATCATTTTTTTATGAT ATAACTTCAGGGAATATAATTCAAGCATTAGACCTGCTCGGACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGGTAAT AATGAGAATTATTATTAAATCTATATTATCCTAACTTCACTGAATATTACTTTTCTCTAATGAAATTTGATTATTGTTAG ATATCTTGTAAATAAGTAGGATATCTTTTATTTAAGTAGGATATCTTTTATTAATTGTAAATAGGTAGCATAGTCATTGT AAATAGGGTAACAATGATATTGTACATTGATTGCACCCAGTGTTGTCAAACCCGAATAGCAGGGCGTAGCAGCCGACCCC TATAATGCTATAGCGTATAGCGAGATGGCTGTATGCTGAATATTTTTATATATAGTTTATTTTATACTAAACACTATGCT TAAAAATGATAAAAAACACTCAAAATTCATGACATTCAAAAAGGAGATAGAGGTTGCTGGGATAGAAGAGATAACTAAAA AATAAAGGACTACAGCATAAACTAAGTAACTAATGGAGGCTGTTGTGATAAAAAAAAAAAAGATAGAGGCTGCTGGGATA AAAGTGATGCATGGTAGTTACTTAGAGACTAAAAGAGAATACAAATTGAAACAACACTGGCAGAATAAATAACCAGAAGA AAAAAAACAAAGCAGGCATTAGGGAAACAACAGAGAAGGATAGCAAGCTCAAGGATGCGAGAACAAAACTGGGTATTTGG GGATGCAGAGGTGTCGCTATAAGGTTGCTGGAAGGATGCCGGAGGCTGGTCAGAAGTGGTGTGCAAGCTAGAGTGCAGGA AGAATGGAGACACAGTGCTGGGCAGAGGTCGAAGTGAAGTATCAGAGAGGGGGATGTACTATAATGGGTTATTCTAACTT TTCCGAGGCAAAATTTCGTATCTACCCTCAAAAGGTTGCTCTAACAGTAAGATTTTAAGGGTAAAAGGGGTTTTTTCGAT AAACCATCAGAATAGTGCAGCATTTGTGATACAATTCCCACTATTCAGGCCAACCTATTGCGGCCGCAACAATGAGCCGC TCCACTTTTTGACATCCTTTTGCGGACAGTGGCTGCTCCGCTCCGCTCACCGCTATAGCATCGCTATTAACAACCCTGAT TGCACCTATTATATATAATATAATGGACTCCGCTATGTAGTTGAAACACACAGACTCAGCAAATGCCTCATGTGTCTTTT TTGTTATTCAACATTGTATCAAGAGCCTAACAAGAGGCAATTCTAATCCTAATCCATGACTATCTGGTAGAGACCCATCA TGTTTCATTTCCGGTTTCTAGACCTTTTGTGCTGTCTGGCATCATTCCGACAGCCTTCTCCAGCTAATTCCGCCGCTGCC CAACCACCGAGTCTATATATGGTCTCAAGCAATCTCATAGGGCTTGATTTTGGCAGATTTGGCACTGTTATTCAGTAGTT TGTGTCAAAATAACCACTTATCCCAAAAGTTTAAGCTGTTGGGTAAGGGCCACATGAATGGTTTTATATTATATTCTAAC ACCCCCCTCACGCAAGAGCCCTTTGGGCTTGAAGCGTGGATGAATGCATAGGCCCACCTACCATGTGCTTAATTAAATTC CACTTTTTAATTAGAAAGTGAGGGGAGCAAGGATCAAACTCTAGACCTCTCAGTCTCAGCCATAGAGGCTCTGATACCAT GTCATAATAACCACTTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAAGGGCCACATGAATGGTTTTATATTATATTCTAATAGT TTGGTATGACAGAGTGAGGCTGATCAGTCATCTTTTTATCATCACTCAGCTGCTGGGTGTATATACTTGATTGTGTATGT GGATGGCATTGTCATTACAGGCACCGATCATCATGGAATCACACAAGTAAAACAACTTTGTCATCACTTTCAGACAAAAG ACCTTGGCAGACTTTGTTATTTCTTGGGCATAGAGGTTGCACAATCCAAACAAGGGATTGTGATTTCACAGAGAAAGTAT GCTATGGATATTTTGGAGGAGACAAGATTGTTAAATGCCAAGCCAGTTGACACACCTATGGATCCCAATGCCAAACTTAG GCCAGCTCAAGGGGAGCCACTCTCAGATCCAAAAACATATAGGAGATTAGTTGGAAATATGAATTATCTCACTGTTACTC ACCCAAATGTTTCATTTTCTTTTAGTAAGGTAAGCAATTTCTTAATTCTCCATGTGAAGGGCATTGAGAGGTTGTGATTC GCGTACTGAATTATATTAAAAGTGCTCCAGGAGAAAGGTTAATTGTACGAAGATAAGGGACATGCACGAGTTGTAGGATA CTCAGATGCATATTGGGTAGGTTCTCATTTTGATAGGAGATCCACCTCGGTAGTGTGTTTTCTTTGGTGATAACTTAATT TCCTAGAAGCGTAAGAAACAAAGCGTAGTGGTAAGAGAGAGCAGAAGGCATGAGAGAACTGGCTGCGATGATGGGCCATG TTATCGTATGTTGGGATAAAACCCATTCACATGGAACAAAAAGGAATATTCAAAGATTCACAAGGGATTTTGCAACTGCT TTGGGAAAGAGATATAGATGACATCCAAGCTATTGCTAAAACTGTGGAGTTGACTACAGTTTTGGGCATTGAAAAAGAGC AGTGGGATCCTGGTGGACATTATTGTCTTCTTCCTGTATCACGGTTAACATTTCCAGATAGGAGGACTTTGGTGGGATTT TGTTTTAGGTATCTCAAGCTAGGACAAGGTCAATGCTTACGGGAGGAGTATTGATAGGTACCCCTAGTTAGTTAGTAGTT TTGGTTAGTTGATAAAGTTAGCCATATAGTTAGTAAGTTAAGAGAGTTAGTTCACTTAGTTGGGCTGTAGAGGAAGAAAT ATAATAAATAAGAGAGTTTAGGAGGATTACATATTTTGGGATAATTTGTAATTGGAAATTGGCAGAAACTCAATAATATC AGCTTTCCTTTTTTCTTTAGTGCTAGAACCTATTAGTTTTCCACAATGCCTCATGAACATTTTATCCTTTCTCTGTATTA AGATATTTATGAAAAATATAATTCTACGTACCCTACTAGCTCAGTTGCTTCCTATGTAAAGAGACCTCAATATTAACTCT ATTTTACGTTTTTTTTATTTTGTGGTTAAAAGTTGCATATATGTATATAGAAATTAGAAAATTAAATTGACATTCCTAGG TTTTTAATTGAGAGATTCTGAATATAGTATTGACAAATGGTGGAAGTCAATCTAATTTCCTCATGCATATGTTGCTTTTG GCTTAAAAGTTTCTTGAATTTCATCTGACTTCTGTGTTACCTTTCTCAATTAGTTCCTTGCTACTTTAATATTGCATTGT TTGATCGTGCAAGGATAGGTCTACATTTTCCTTTCTTTTATGATTTCCTATTTTGGTTAGAGGCATTGGACCCAGGCTTC TAAATAAATGGTACTTCTTCACAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAAACAAGTTGAGAAAGGCTTGGCTGTTCTA CTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTAGCTTTGATTTATCACTTTTCTCCATTCT TATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTAGACCAAGTCTTTTAGAGATATTTAGTATAATGGACATTGA GATGCTGTATATGTATTTAAAATACTTTTTTACGTTTTTAAAAGTTTTGGATGAAGATTTCATTCTGAATTTTTTGTGAA TCTACAACACTTAAAAGAAAATTGATTTTAGATGTTCTTGATGAAGATTTCATTCTGGAAGTTCTGGAAATCTATAATAT GTCGATGAAAATTGCTATCTCATACAAACTTCTTTGCGAAGAGTAAGATGGGCTTCTGTTTGTATATCGATCAATGAGAT ATGACTTTTTCATTAGATACAGGCAGTCTTTTTCTCTTTTTTTTTTTATGAAAATAAACTTCCATTCCTTTTGGCTTAAG GCTGAACCAAATGCAAACAAATTGCTTATGGAATCTGATGTTGTGTCTTTGCTTCTGTAATATGCTTCTTCACATATACT ATCTTTTTTTATAAAGGTTGTATAAATCACTTACCTTCAATTTTTTGCCCAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATA TGTGCATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCA GTTAACTTGCTTATGATATGCTCGTAAGTTTTTACTCATTTACTACTGCTGCTGCAATTATGACTACTTTATTTTTGCTT CTTGAATTGCCTATGCTCTCAAATGAATACCTGTTATATTTTATTCTTGATCCCAGGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCC AGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTTCTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGGTACTCTTATCTAACA AATCTATTTGATTGTTGATTCTCTTTAAAATGTTTTTTTGACAATATTGTGGGGCACTGGGTGGAGTTCCATTTCCATAT ATTGCTTACTGTGATAGATCTTCTTGCTTATTACTTTGGCACTTATATTAAATTAATTCCTAATAATCCTAGAAATTTCT TTTTCATTGGTTATAAGACTAGTCTATTATTTTGTTTACTTGTACTTATTTTCACATGCCTTTCGTATATTCTTTTATGA TAATTTTTCTTCTCAGCTTGTAACTGTTAAATTATCTGAACTTTAGCCTCAGAACACTTTGGCTCCATCTCCTTAGTAAT ATTTTCTTATTATAATTTGGTGCGTGATTTGGCTATTACTGCAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTT GGGGATAAATTTAACAAAATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGT ATTTGATTTTCTGGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAG TAATTATTTTACAAAGAGGTCTGAAACAAATTGAAACAAATTTTCCGTTGTTACAACTTTAGTTCAAGTTACTCACTGAA AAAATCTTATCTAAATTTGTGATACTGACTTTGCCATACTTTTGATTGATTGATTTTGCATTATTTGTAGAGCGGTCTTG GCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAATTTTAATGGTGTTGATATTGAATCGGCAA ACAATTTAATGGTATGTAGACATAACTTCAAAAAGGTGGAAGCAATCTTGTCTCACCTCCCATTTAGCCTCTCATCTCAT AGTTTTGACAGATTCAACATATGACATTTGTTACTACTACAGTATAATCATTTTACACCTTAAACATTCAGGAGAGACAT GTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAACCAATGGACTGTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAG ATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCTGCCATTAGAGAGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGG CAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGATAAAGGCAGTAATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTG GCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTTTCAAGGCCAACATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACG GCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCTGAGTCCCTTGATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTT CTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0090700.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTGGGTGTTTTACCTGATCTCGCTACCTCTAACAACTGGCATGGTGCTTTTCACCTTGAGGTACTTCGCTGGCCCTGA TGTTCCTCGCTACGTGCTTTTCACTGTTGGATACACCTGGTTTTGCTCCCTCTCTGTCATCATCCTCGTCCCCGCGGACA TTTGGGCGACGATGTCTTCTCACTCTGAGAATGGAGGTATCTCTTTCTTTTGGAGCTGGTCATATTGGAGCATGGCTGTG GTGCCCCTTATTCAGGGTTTCGAAGATGCTGGGGATTTCACTGTATCAGAAAGATTGAAGACTAGTGTACATGTTAACTT GGTCTTCTATCTAATTGTGGGATCCATTGGATGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTG GACTTGTTACTGGTGCATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACC ACCCGCCAAAAAGTACTTTCTCACAAAATTTCCCAAATGGCTGTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGC CATTGTTGTTGCTCAAGCAACATCCAAGCAGATGTCCAAGCGTGATCCTTTGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATA TGCTTGCTCAAATGTTTAGGGAAGACCCATCCTTCAAACCACAAGGTGGCCAATTAGGGGAAAATGATATGGATTATGAT ACAGATGAGAAGTCAATGGCAACACTAAGGCGTCATCTTCGAAAAGCTCGTGAGGAGTATTACAGATATAAAAGTGAGTA TATGACTTATGTACTGGAAGCCCTTGAATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGATGGGAAT ATAATTCAAGCATTAGACCTGCTCGGACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGAATTTTGCTGGAGATGCATT TTAAGGAAACAAGTTGAGAAAGGCTTGGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCT TTTGCCTAGCTTTGATTTATCACTTTTCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTGTTTG CTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGCATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTACTCACTG ACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAACTTGCTTATGATATGCTCGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAA CTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTTCTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCC CTTTCTTTGGGGATAAATTTAACAAAATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTT GACAGAGTATTTGATTTTCTGGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCC ATCAGGAGTAATTATTTTACAAAGAGAGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGG CAAGGAATTTTAATGGTGTTGATATTGAATCGGCAAACAATTTAATGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGAT GTAATTACCGAAGAAACCAATGGACTGTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCAT CAGTAACAAATATGCTGCCATTAGAGAGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTG CCAATTCCGTCCTTGATAAAGGCAGTAATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAG ACAGGATTTCAGAGTTTCAAGGCCAACATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTC TTGTGTGTCGTCATCTGAGTCCCTTGATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATG AAGAGGACTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0090700.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MWVFYLISLPLTTGMVLFTLRYFAGPDVPRYVLFTVGYTWFCSLSVIILVPADIWATMSSHSENGGISFFWSWSYWSMAV VPLIQGFEDAGDFTVSERLKTSVHVNLVFYLIVGSIGWTGSLLGFAMACSNTFGLVTGAFLLGFGLSEIPKSIWRNAEWT TRQKVLSHKISQMAVKLDDAHQELSNAIVVAQATSKQMSKRDPLRRYMDVIDDMLAQMFREDPSFKPQGGQLGENDMDYD TDEKSMATLRRHLRKAREEYYRYKSEYMTYVLEALELEDTMNNYERRKSTGWEYNSSIRPARTGKLGSVFDTLEFCWRCI LRKQVEKGLAVLLGIMSVAILLAEATLLPSFDLSLFSILIKSVRTQEMLVQVFAFVPLMYMCMCTYYSLFKIGMLMFYSL TPRQTSSVNLLMICSMVARYAPPVSYNFLNLIRLGSNKTTIFEKRMGNIDNAVPFFGDKFNKIYPLIMVTYTLLVASNFF DRVFDFLGSWKRYIFKTEDDDMDGLDPSGVIILQRERSWLEQGHKVGEQVVPLARNFNGVDIESANNLMERHVEMKTNSD VITEETNGLSKSSREETSRYGSSREAISNKYAAIREQGGPASKRKAEEKNVASANSVLDKGSNSGGAPSSGLASTWLNMK TGFQSFKANIGAKKFLPIRQIQESNVSCVSSSESLDEIFQRLKGTSLDQNTYNEED
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 5 | 5 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 694 | 694 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 694 | 694 | 0.0 | – | |
| TMHMM | 2 | 24 | 23 | - | – | |
| Pfam | 4 | 479 | 476 | 9.5E-72 | ||
| Phobius | 6 | 24 | 19 | - | – | |
| Phobius | 25 | 30 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 28 | 50 | 23 | - | – | |
| Phobius | 31 | 50 | 20 | - | – | |
| Phobius | 51 | 69 | 19 | - | – | |
| Phobius | 70 | 87 | 18 | - | – | |
| Phobius | 88 | 106 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 106 | 128 | 23 | - | – | |
| Phobius | 107 | 127 | 21 | - | – | |
| Phobius | 128 | 132 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 132 | 154 | 23 | - | – | |
| Phobius | 133 | 154 | 22 | - | – | |
| Phobius | 155 | 327 | 173 | - | – | |
| Coils | 239 | 266 | 28 | - | – | |
| Phobius | 328 | 348 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 329 | 348 | 20 | - | – | |
| Phobius | 349 | 367 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 368 | 390 | 23 | - | – | |
| Phobius | 368 | 389 | 22 | - | – | |
| Phobius | 390 | 409 | 20 | - | – | |
| Phobius | 410 | 429 | 20 | - | – | |
| Phobius | 430 | 462 | 33 | - | – | |
| TMHMM | 463 | 480 | 18 | - | – | |
| Phobius | 463 | 484 | 22 | - | – | |
| Phobius | 485 | 696 | 212 | - | – | |
| MobiDBLite | 562 | 584 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 596 | 629 | 34 | - | – | |
| MobiDBLite | 615 | 629 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0090700.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…