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LotjaGi1g1v0129900.6

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0129900
Transcript ID LotjaGi1g1v0129900.6
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-like kinase; TAIR: AT4G23180.1 cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 10; Swiss-Prot: sp|Q8GYA4|CRK10_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 10; TrEMBL-Plants: tr|I1NG71|I1NG71_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0129900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:20846415..20862176) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGGCGGATGAGTTCAACCAAGCGCTGAGGACTCACGTTTAAAGTATGCTACTGGAAATGTTTCTGGTCCAGATTTTCTAG ATTTGTATGGTCTGGTGCAGTGCACTCCTGATCTGTCTAGCCTTCAATGTGATGACTGCTTGTCTGGGGCTGTTGGAGAG TTGCCAGGATGTTGTGATAGTAAGATAGGTGGGAGAGTTATTAGACCAAGTTGTAATATTAGATATGAAATCAGCCCGTT CTATGAAACGCCGCCACCACCACCACCACCGCCATCCTTATCAACACCGCCAACTTCAGCATCCACTAATAATACTACCT CAGAAGGTACTGTCTCATTTTATTCAATGTTGTAGTTAAATCTGGGCCACCCAAAATGAACCAGGAGTTGACTTCATTCA TGTTTTTGGATTGTATACAAAATTACAAATATCCCACCAAGGATTCTGATTTGTGCAGGGAAGAGCAACACATCTAAAAT TATTGCAGTAGCCATAGCGGTTCCAGTTGTTGTTGTTGCTTTGCTGCTCATTTCTATCTGCATCTATTTAAGAGTGAAGA AGCAAAGAGAAAATGTTCAAAGTAAGTCCAAGGCCTCCAAGCATGAATTTACTGTCACTTGTCATGAACATAGTCTTATT AATTTTAAGGGATATACAATGACATAATTCATTTTGAGAACAAGTGTTGTTTGGATCAGCATTGTTAGAATTGATTGTTG ACAGATATAACTCAGATAAAATTGATGATGGTAAAATTGAGTTTAAAATGAAGGAGAAGCAGGGATTTAATGACATTTCC TTCTTGTTTCACATTTAGAAATTTTATCTTTCAATTTTCTTGTTTGGTTGTACTTATCATATAAAAAACTTATTTGTTTA ACCCAATTTCACAGTTCCTTCACAAGATGATGATGGTTATGATGATGAAATCATAACCAATGACTCACTGCAATTCAAGT 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TGGCTCGTTGAATGCTATCAGGATGTTGGACTTTCTTCCTTTAACATCGCGTCTGCGAGCTTTGTTGAGGGAGATTGTTG ATATTTCTACTCGATTGTAATACGTGTCTTTTCAGCATGTTGGCTGAGAGGCTAATATGTATGTTGATCACAAGCTTGCT TCTTTAGATTTGTGCCTGCAGTTTGCTCACCAAACCTAATCCTTGCTCCCTGCAGGCTGCAGAGCTTAATCCTTTTCTTG CTTTTGATAGGCATTGTTTGACTTTTGTACCTACATAGTGCAATTTTTTTTTTTAAATTACCAAACTAGTGTATATATTT TTTTAATTACATAACTGGGGTAAATCGCCACTACAAGTGGCGATACCCTTTTTTCTTTTATTTTTTTTATTGAAATCGCC ACTGTCAGTGGCGACATGCTCTTTTTATTAAAAAAAAGTTTCCATTCGTGACAGAAACAAATCCGTCACAGAATTCCAGT ATATACTCTAAAAGGAGTGACGGAATATGTTGAAAGAAGTTTTCCGTCGCTATATGACGGTTTTACTTTACGACGAAGTT CTGTCCGCCACAAAATCCGAGTTAATATTGCAAAATAACTAGTGACGGAATTTTGTCAGAGAATGTTAATTTGTGACATA ATTCTCTCTCCACATTGCGTCACAAATTCTTTATATATTATATACTAGTATATTGTGACGGATGTGTTTTCGTCACTAAA AAAGAAAGTGAAAAAAAAGAGCACGTCACATGGGCAGACCCATGTTGAGGCTAGGTGTGGCTAAAGCCACACCAGTTTTT TTTTTTTTTTTTTTAAAATTATATGCTTTCATTTTATATGCTCTCACAATTGTGTGTTACTTTCATTCTATTCTCTTTCT AATGTATTTGATATTGTGTCTGTTGTTCATATCTATGATGAAATTAATGTTCACTCAAATTACTGTGCTCGTCATGTCAT 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GAAATGAATGCTAAGATAGCAGATTTTGGCATGGCAAGACTGATTGTAGTGGATCAAACACAAGGAAATACGAGTAGAAT TGTTGGAACCTAGTAAGTGCTAGAATGTGTTAGAGCCTACTATTGTCATAAGAGCAAAATTTGAATCAACTAACAACTTT TTTTTACATTATCACTCAGTCATGTATTGATACTTTTACACTAACATGAAATCGAAATTAGAACTCTGCTATAAATACTA TCTGTCACATGTGACAATTGAAATAGTAAAAAACTTAACCTTTAACAGATCATAGCATTTATTGTTTACTAATTAAGTTT GTCCATGTTGGCATGTAGTGGATATATGGCACCAGAGTATTTAATGTATGGACAATTTTCAGTAAAATCAGATGTCTACA GTTTTGGAGTGCTGGTTCTTGAGATTATATGTGGCCAAAAAAACAGTGGCATTCGTCATGGCGAGAATGTGGAGGATCTC TTGAGTTTTGTAAGTCTTTCTTTTCTCACTGCTGTTTCTTCCTTGGCATTATGAATTAGAATATTAAGGGCTCCTAAACA TTAATATAGGACTGGAATACTTGACCTTGGCTTAATTAAGCGCTTATATGATAATAAATACTTTAATTTATAAGCTAACA TGGTAATTTATCAAAATAAGCTCAAAACAATTTATAGTTAGGTCATATGCTTAATCAAACACCAGCTTAAATGTTTTATG TTCAAATAAGTTTTTCTAAAAGCACCCTTAATAGTATACAGTTATTTATAAGTGAGAAAATTCTTGCAGGCCTGGAGAAA CTGGAGGGAGGGGACACCTACAAATATTATAGATCCAACATTAAACAACAGTTCAAGAAGTGAAATGATAAGATGCATTC ACATTGGTCTACTTTGTGTTCAAGAAAACATGGCCAATAGACCACCTATGGCTACCATTGCACTCATGCTTAGCAGCTAT TCTCTCACTCTACCAGTTCCTTCAGAACCTGGAAGTTTTATGGAGAGTAGAATTAGAAGCCTCCCAAACACCTCTTCGTC GGAAAATAATTCAGGGGCAACAAGATCAAGTGATTCCATGAATAAATCACCTCAAAAGTCAATAAATGAGGCTTCAATTA CTGAACTGTACCCTCGTTAATTAGATTCTGGTCATTGGGGTGATGATAGTATTCACTTATCATCAATGTTTCATCCAAAG TAGGAATGCCTTGGGATTTGCTTGAGCAAAGACTTGGTTAAATAGACCATGGATCTTATTTGTTTAAAGTTAATCAGAAA CTGTAATATAACATTCAATTGGTTTTGAAGTGTATGGTTTGAGAAGTTAGCTATGAGTTCCACTTGGTGCTCTTTCCACA CT 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0129900.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTGGGGATTGCTCGAGGCCTTCTCTACCTTCATGAGGATTCGCGATTGCGCATTATACATCGTGATCTCAAAGCAAG CAATATTCTCCTAGATGAAGAAATGAATGCTAAGATAGCAGATTTTGGCATGGCAAGACTGATTGTAGTGGATCAAACAC AAGGAAATACGAGTAGAATTGTTGGAACCTATGGATATATGGCACCAGAGTATTTAATGTATGGACAATTTTCAGTAAAA TCAGATGTCTACAGTTTTGGAGTGCTGGTTCTTGAGATTATATGTGGCCAAAAAAACAGTGGCATTCGTCATGGCGAGAA TGTGGAGGATCTCTTGAGTTTTGCCTGGAGAAACTGGAGGGAGGGGACACCTACAAATATTATAGATCCAACATTAAACA ACAGTTCAAGAAGTGAAATGATAAGATGCATTCACATTGGTCTACTTTGTGTTCAAGAAAACATGGCCAATAGACCACCT ATGGCTACCATTGCACTCATGCTTAGCAGCTATTCTCTCACTCTACCAGTTCCTTCAGAACCTGGAAGTTTTATGGAGAG TAGAATTAGAAGCCTCCCAAACACCTCTTCGTCGGAAAATAATTCAGGGGCAACAAGATCAAGTGATTCCATGAATAAAT CACCTCAAAAGTCAATAAATGAGGCTTCAATTACTGAACTGTACCCTCGTTAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0129900.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLGIARGLLYLHEDSRLRIIHRDLKASNILLDEEMNAKIADFGMARLIVVDQTQGNTSRIVGTYGYMAPEYLMYGQFSVK SDVYSFGVLVLEIICGQKNSGIRHGENVEDLLSFAWRNWREGTPTNIIDPTLNNSSRSEMIRCIHIGLLCVQENMANRPP MATIALMLSSYSLTLPVPSEPGSFMESRIRSLPNTSSSENNSGATRSSDSMNKSPQKSINEASITELYPR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SUPERFAMILY 1 202 202 1.25E-47
SMART 1 172 172 2.0E-4
ProSiteProfiles 1 172 172 25.432
Pfam 1 105 105 5.7E-28
Gene3D 1 175 175 2.1E-53
PANTHER 3 181 179 8.1E-79
PANTHER 3 181 179 8.1E-79
ProSitePatterns 19 31 13 -
MobiDBLite 184 230 47 -
MobiDBLite 188 223 36 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0129900.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…