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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0135600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0135600.3 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Golgi-body localization protein domain isoform 1; TAIR: AT1G58250.1 HYPERSENSITIVE TO PI STARVATION 4; Swiss-Prot: sp|Q6IMT1|SAB_ARATH Protein SABRE; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0KZC9|A0A0R0KZC9_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0135600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:21856834..21892283) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATTAGTGGATATTAGAAGCAAAAAATTAGGTGGCAAAAACGCTGATGGAAAGACATTGCGTTGTTGTTGCTTGTTTTAC TCCTACAAATTTGGTCACTGAGCACCTCACGGAACGGATCATCATCCTCATAAAACACACTCTCAGCATTTCCTACCATG ATGCTTTCAAAGACCGAGTCTTTTTTGGTTGGCTCACGCTCCATGCATTTTCTTCAGAGAAATTTCATTTCATGTTTTTG AAGGATATGATTCAAAAGGACTTGTAGTCATTTTCCGGCGAGAAGTGATTTTCCACTACTCAAATGGCGTTTTCTCCTGC TAATTTCCTCTTTGTTTTCTTGCTGATTTGTGTTACGTTGTTGCTCGCGTTCATGTAAGTTCTCAATTCTCTAATCGTTG TTTTTAGTTTAATTGTTTTCGAACAATGGGTTCCTTGTAGTACTGATTGTTGTTTAAGCGGTATGGTGTAATCGAATGTT AGCAAATTGAATTGAATTTCAATTTCTCATGTCAAATTTTTGGGTTGAAATTGAAATCAGTTTGAAAAATGAATGGGTTG CTTTGAGGGTTGAAAATTCAGTAGTGAGTTGTGTCTACCATTTCACCACCAATGCATCTTGAAAGTGAATCGTATTCCAT GAATATGATATCTATCTATTGTGATTTATGGAATATATAACATATGGAATATGGTTTTGTTACCTCTCCAACTATCTCTC TGTTAGGTAGGATCTTAATTTGTTGCCCAAGCACTTGTTTGTTCAGGAGAAACTGATCCAATTCGGAGTTGTTGATGACT AAGTAAGAAACTAACTTCTAACTGAGCTAAATAATTCTGAAACTAACTAGTAACATTATACACAGTAAGTGTTGATCTAC CTCTTTCCCCTATAATCTAGTAAGTGTTGTTGAGCCCTTGCAATCATCAAATATTAATTCTAACAATGATCCTGAGATGG 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TAATCTAACATGTTATACTTTTTGTCAACCTCACTCAATGGTGTTCCAGTCTCTCAGGGCATTATTGTGTCTTCAAGAGA ATAAGCAACTCCTTCCAAACTCGTATATTCTCTTAGATAAACTCATTATTTGGATTCAACAGCAAGGAAACCAACTGTGC ACAATCTGAGCCATATGATGAGTTATTGTAAATAAGGAAACACCTGCTTTGAACTTTTAATATGGATAAATCTTGCAAAG CACAGAATGCAATAAGATAAGTTCAATGTCCATTTAACCATTTCATCAAACAATGGTGCGCATGAAAACTAGACGGGAAA TATGAAGAGAAATTAATTAAGCCATTTCAATGACGTGAATAGCAACAATAGCCATAGCCATAGATAGAGGTCTCATACTT GGTTCAACACAATGGAGACATACATAATTCACAGGACCCTATTTTCACATCAAAACGGCATCTGGTTCTGTCAATTTTAA ACTAACAACATCAATTTGATGCAACTAAACACCCCCATATCTAAAGTCTAAACTACTTCCTAGCCTCCATATCGACCATC ATACATGGTCCGGTGACGGCGTAGGTGGCTGAGAAAGCTCCACCTCCTCCGGTGGCACAACAACCGGCGGCTGCTGCTGG TCCCCCTGTGCTGCTGGTGTCCGCTGAGCTCGGAATGCGGCGCGGACCGCACCATAAAGAACCAATGCTAGGATCACCGC ACCAATGATGACGACGAGCGGGACTATCCACCACCATGATCGGTGGCCGAAGTCGTCCCGGAGCATCATCGAGCCTAACG GTGGTGGTATGGTGGGAGGCAAGGATCCGGACGACATTAGATGATGAGAGTAGAGAGAGCAAACTGGAGAGGAGGGAGGC AAGAGCTAAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0135600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGCATGAAACAGCCGCCCTCCACGATGCAACAAAAACTAGCACGCTACTGTTCTCTATTTCCTGAGAAGGTCAGCTT CAATCTGCCAAAGCTGAATGTGAGTTTCGTGCACTGCGAATATGGTCTTTCTGTTGAAAATAACATCATGGGCATCCAGT TGAAAAGCATCAAATCACGCTCCTTTAAAGATATCGGGGAGAGTACACGCCTTCATATTCAACTGGAGTTTAATGAAATT CATCTTCTTAGAGAAGCTAGTGCTTCCATCCTTGAGATATCGAAGGTGAATTTGGCCTCTTTTGTGTACGTACCGGTACA GTCCACCTCGCTTGTTAGAGCTGAAACTGAAATCAAGCTTGGAGGTTTACAATGCAATATCATAATGAACAGATTAAAGC CCTGGTTACTTCTCCACTTTTCTAAAAAGAAAAAAATTGTACTTCGGGAGGATGCTTCTGTTGTAAAGCCGAAATCAGCT GATAGCAAGACCATCACGTGGACATGTAAATTGTCAACTCCTCAGTTGACATTAATACTTTTTGATATGGAAGGTTCTCC AGTGTATCATGGTCGCTTACAATCAGCACATCTATCGGCAAACAACATTTCAAATATGGGGACTACAGTACACGTTGTGC TTGGTGAGTTAAATCTCCAGTTGGCTAATGAATATCAGGAATGTTTGAAAGAAAGCTTTTTTGGTGTGGAATCAAGTTCT GGCTCCATTATGCACATTACAAAGGTTACTTTGGATTGGGGGAAAAAGGACATGAAGTCCTCTGAAGAAGATGGTCCTAG GTGTATGATAGGCTTATCAGTTGATGTTACTAGCATGGGAGTTTATCTAACTTTCAAGCGTGTAGAATCATTCATATCAA CAGCAATATCCTTTCAAGCTCTATTGAAAAGCAAATCTACTTCGAAGAAAAAATCAACGCAGAGCCGAGGGAGTGTATCA AAAAGTTCAGGGAAGGGAACTCAAATGCTGAAATGCAATCTTGTGCAGTGTTCAATATATGTATTGGGAGAGACTGGATT AGAAAATACAGTTGTTCCAGATCCCAAGCGAGTCAATTATGGTTCTCAGGGTGGCAGAGTTATAATAAACACATCAGCAG ATGGTACCCCACGCAATGCAAAGATAGTATCCACTATTTCTGATGACTACCAGAAGCTAAAGTACTGTATCTCACTTGAA ATCATTCATTTTAAGCTATGTGTGAACAAGGAGAAAAAATCCACACAGATAGAACTTGAAAGGGCGAAATCTATCTATGA GGAATATATGGAGGAAAATAGGCCAGTAGCAAAAGTGGCTTTATTCGATTTGCAAAATGCTAAATTTGTAAAGCGCTTAG GTGGCCTTAAAGAAAACGCAGCCTGTTCCCTTTTCAGTGCTACTGACATTACAATGAGGTGGGAGCCTGATGTACATCTT TCGTTAATTGAACTTGTTCTCCAGCTGAAATTAATGGTACACAAAAGGAAGCTTCAGGAGCGTGGTAATGAACATGTGGA GGATATGAAAAATGAAGCAACTATGGAATCAAGGAATCTTGAAAAGAAGAAAGAATCTATTTTTGCTGTTGATGTGGAAA TGTTAAATATATCTGCTGAGCTAGGAGATGGAGTTGATGCTATGGTTCAGGTGCAGTCAATTTTCTCTGAGAATGCTCGT ATAGGAGTGCTACTTGAAGGACTTATGCTTAGTTTTAGTGGGGCAAGAATTTTCAAGAGTAGTCGGATGCAAATTTCACG AGTTCCTAGTATATCTGCTAGTTCATCTGATGCAAACGGACCTGTAGCCACAACATGGGATTGGGTAATTCAAGGTCTTG ATGTTCACATTTGTTTGCCATACAGATTGCAATTGCGTGCTATTGATGATGCTCTTGAAGATATGTTGCGAGCTTTGAAG CTTATTGTTGCTGCAAAGACTAATCTGATTTTTCCTGTGAAGAAAGAGAGTTCTAAAGTTAAAAAACCTAGTTCAGTAAA ATTTGGATGCATTAAGTTTTTCATACGCAAGTTAATAGCTGATATTGAAGAGGAACCAATCCAGGGATGGCTTGATGAAC ACTACCAGCTGTTGAAGAAAGAAGCTGGTGAGTTAGCTGTCCGGTTAAACTTTCTAGATGAATATGTATTGAAGGCCAGG CAAGATCCAAAATCTACTGATGACAGCAATAATGCTTCTGAAGAAGGAAAAGTTGATTTTAATGATGTTGAGGTTGATGT AAATAATTCTTCAACTATTGAATCCATGCGAGAAGAAATTTATAAACGATCTTTCCGATCATACTACGAGGCATGCCAGA AGTTAGTATCATCTGAAAGCTCTGGTGCTTGTAAAGATGGCTTTCAAGCTGGTTTCAGACCCAGTGCCTCAAGGTCTTCT CTTCTTTCAATAACTGCAGTCGACTTAGATTTAAGTTTGATGAAAATTGCTGGTGGAGATGATGGGATGATTGATGTTGT GAGGAAGCTTGACCCTGTCTGTCTTGAATATGATATACCATTTTCTCGACTCTATGGGGCAGAGATTGCCTTAAACACAG GTTCTCTTGTGGTTCAGATTCGAAATTACACATTTCCTCTTTTCTGTGGAAGTTCCGGTAAATGTGAAGGTCGTCTTGTG TTGGCTCAGCAGGCAACTAGCTTTCAACCTCAAATACTTCAAGATGTGTATGTTGGGCGATGGAGAAAGGTGTGCTTGCT TCGATCAGCTAGTGGTACAACTCCACCTATGAAGACATACTCAGATTTGCCAATACATTTTCAGAAAGGTGAAGTTTCAT TTGGTGTGGGTTATGAGCCAGTTTTTGCTGATATTAGTTATGCTTTCACCGTGGTGCTACGGAGGGCTAATCTAAGTGTT AGGAATCCTGGCCCACTTATTATTCCACCGAAAAAGGAGCGGAGTTTGCCATGGTGGGATGACATGAGAAATTACATTCA TGGAAGAATTTCCTTATTATTTTCTGAAACAAGATGGAATTTTTTAGCAAGTACAGATCCTTATGAAAATCTTGATAAAC TTGAACTTGTGAGTAGCTCTATGGAAATTCACCAGTCAGATGGTAAGGTTCTTCTTTCTGCCAAAGATTTCAAGATTTTA TTGAGTAGTTTGGAGAGCTTGGCAAGAAAACATGGTTCCAAAATTCCAACTGGTGTCGCTGGTGCCTTTTTGGAAGCCCC AGTTTTTACAATTGAAGTTACAATGGACTGGGACTGTGACTCTGGAAAACCTTTGAATCATTTTTTATTTGCACTTCCAA TTGAAGGGAAACCTCGTGAGAAAGTATTTGATCCTTTTAGATCTACTTCTCTTTCCCTTCGGTGGAGCCTATCTTTTAGA TCCAGTCTTTCTTTGTCAGAAAAACAATGTCCATCCTCCATAGCAAGAGAGAGAATAGAAGGAGATGCTGCAGTATCTCA TCCTCATATTTTCCAGAATGTTTCACCTACTACCCCAACATTAAAATTCGGTGCCCATGATTTAGCATGGATTCTAAGAT TCTGGAATTTGAACTACCTTCCTCCCCATAAACTGCGCACCTTCTCACGTTGGCCTCGTTTTGGAGTTCCTAGAATTGTC AGATCAGGCAACCTTTCACTAGATAAAGTGATGACTGAATTTATGATTCGTATAGATTCTGCACCAATCTGTATGAAGAA CATGCCTTTACACGATGATGATCCAGCCAAAGGACTGACCTTCATGATGACAAAGCTAAAAATTGAATTATGTTTTGGTA GGGGCAAGCAAAAGTATACTTTTGAAAGCAAGCGTGACCTTATTGATCTTGTGTACCAAGGTATTGACCTTCATATGCCC AAGGCTTTCCTAATCAAAGAAGACTGTGATAGTATTGCTAAGTTAGTTACCATGATACCAAAAAGCTCACAATCTGCATC AGATGATAAAATTCCCTCTGAAAAAGATTACATGATACAGAAAAGTCATGATGATGGATTTCTGTTATCCTGTGATTACT TTACTATAAGAAAACAGTCCCCAAAGGCTGATCCTGCTACGTTAGTTGCCTGGCATGAAGCAGGAAGAAGAAATGTTGAG AAGACATGTGTACAATCTGAGGGTGAACATCAGAGCGAAACTGATGAGCTTATGCGATCAGACCCAAGTGATGATGATGG GTACAATGTGGTAATAGCTGACAGTTGTCTACGTGTTTTTGTCTATAGTCTCAAGCTTTTATGGACTATTGGAAACAGAG ATGCTGTTTGTTCCTGGGTTGGTGGTCTATCTAAATCCTTCGAGCCTGCCAAGCCTTCTCCTTCCCGGCAGTATGCACAG AGAAAATTATATGAGGACAGTAAACAGAATGATGGAGCTGAAACCCATCAAGGTGATGCAGGTGAAACTCATCAAGATAA TGGATCTGAAACCCATCAAGATGATGGAGCTGAAACCCATCGAGGTGAAGGAGCTGAAACCCATCAAGATGATGAAGTTT CTAAATGCCTTCCTACGAGTAACATCTCAGAAACTTCCTCTTCTCTGGCTGCCGGGACTTCTGGATTACTTTCATCTCCA CCGCATTTTGTTAAGGTGGACAACTTGGCATCTGCTACGAATGAAAGTACAGATGATTCTGAGGAGGGGACTCGGCACTT CATGGTTAATGTTATTGAACCGCAGTTTAATCTTCACTCAGAGGATGCAAATGGTAGGTTCTTGCTTGCTGCAAGAAGTG GCCGCATTTTAGCCCAGTCATTTCATTCAGTCCTTCATGTTGGCTATGAGATGATTGAGCAAACAGACAGTACTACAAAT GTACATACTGGTGAATACCAGCCCGAAATCGCATGGAAAAGAATGGAGTTGTCTGTTATGTTGGAGCACGTGCAGGCCCA TGTCGCGCCAACAGATGTTGATCTAGGGGCTGGGGTGCAGTGGCTACCGAAAATTCTTAGAGGCTCTCCAAAAGTAGGGC GAACAGGTGCTCTTCTTGAGAGAGTTTTTATGCCTTGTGACATGTATTTCCGGTTCACAAGACACAAGGGAGGCACCCCA GAACTGAGAGTGAAGCCCTTGAAGGAGCTCATATTCAATTCTCATAATATAGCAGCAACAATGACTTCTCGCCAGTTTCA GGTCATGTTGGATGTGTTGAACAATCTTCTCTTTGCACGGCTTCCAAGGCCTAAAAAAAGTAGCTTATCACTTTCTGCCG AAGATGATGAAAATATCGATGAGGAAGCAGATGAGGTGGTACCTGATGGTGTTGAAGAGGTGGAACTTGCAAAAATCAAC CTCGAAAAGAAAGATAGGGAACGAAAGTTGCTTATCGATGATATATTGAAATTGTCTCTCTGGTGTGATCCTTCGACAGA TATAAACCCAGAAAAGGAAGCAGACTTTTGGATGGTAGATGGCGGAATAGCCATGCTGGTAAGAAATGAATTTTCTTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0135600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSMKQPPSTMQQKLARYCSLFPEKVSFNLPKLNVSFVHCEYGLSVENNIMGIQLKSIKSRSFKDIGESTRLHIQLEFNEI HLLREASASILEISKVNLASFVYVPVQSTSLVRAETEIKLGGLQCNIIMNRLKPWLLLHFSKKKKIVLREDASVVKPKSA DSKTITWTCKLSTPQLTLILFDMEGSPVYHGRLQSAHLSANNISNMGTTVHVVLGELNLQLANEYQECLKESFFGVESSS GSIMHITKVTLDWGKKDMKSSEEDGPRCMIGLSVDVTSMGVYLTFKRVESFISTAISFQALLKSKSTSKKKSTQSRGSVS KSSGKGTQMLKCNLVQCSIYVLGETGLENTVVPDPKRVNYGSQGGRVIINTSADGTPRNAKIVSTISDDYQKLKYCISLE IIHFKLCVNKEKKSTQIELERAKSIYEEYMEENRPVAKVALFDLQNAKFVKRLGGLKENAACSLFSATDITMRWEPDVHL SLIELVLQLKLMVHKRKLQERGNEHVEDMKNEATMESRNLEKKKESIFAVDVEMLNISAELGDGVDAMVQVQSIFSENAR IGVLLEGLMLSFSGARIFKSSRMQISRVPSISASSSDANGPVATTWDWVIQGLDVHICLPYRLQLRAIDDALEDMLRALK LIVAAKTNLIFPVKKESSKVKKPSSVKFGCIKFFIRKLIADIEEEPIQGWLDEHYQLLKKEAGELAVRLNFLDEYVLKAR QDPKSTDDSNNASEEGKVDFNDVEVDVNNSSTIESMREEIYKRSFRSYYEACQKLVSSESSGACKDGFQAGFRPSASRSS LLSITAVDLDLSLMKIAGGDDGMIDVVRKLDPVCLEYDIPFSRLYGAEIALNTGSLVVQIRNYTFPLFCGSSGKCEGRLV LAQQATSFQPQILQDVYVGRWRKVCLLRSASGTTPPMKTYSDLPIHFQKGEVSFGVGYEPVFADISYAFTVVLRRANLSV RNPGPLIIPPKKERSLPWWDDMRNYIHGRISLLFSETRWNFLASTDPYENLDKLELVSSSMEIHQSDGKVLLSAKDFKIL LSSLESLARKHGSKIPTGVAGAFLEAPVFTIEVTMDWDCDSGKPLNHFLFALPIEGKPREKVFDPFRSTSLSLRWSLSFR SSLSLSEKQCPSSIARERIEGDAAVSHPHIFQNVSPTTPTLKFGAHDLAWILRFWNLNYLPPHKLRTFSRWPRFGVPRIV RSGNLSLDKVMTEFMIRIDSAPICMKNMPLHDDDPAKGLTFMMTKLKIELCFGRGKQKYTFESKRDLIDLVYQGIDLHMP KAFLIKEDCDSIAKLVTMIPKSSQSASDDKIPSEKDYMIQKSHDDGFLLSCDYFTIRKQSPKADPATLVAWHEAGRRNVE KTCVQSEGEHQSETDELMRSDPSDDDGYNVVIADSCLRVFVYSLKLLWTIGNRDAVCSWVGGLSKSFEPAKPSPSRQYAQ RKLYEDSKQNDGAETHQGDAGETHQDNGSETHQDDGAETHRGEGAETHQDDEVSKCLPTSNISETSSSLAAGTSGLLSSP PHFVKVDNLASATNESTDDSEEGTRHFMVNVIEPQFNLHSEDANGRFLLAARSGRILAQSFHSVLHVGYEMIEQTDSTTN VHTGEYQPEIAWKRMELSVMLEHVQAHVAPTDVDLGAGVQWLPKILRGSPKVGRTGALLERVFMPCDMYFRFTRHKGGTP ELRVKPLKELIFNSHNIAATMTSRQFQVMLDVLNNLLFARLPRPKKSSLSLSAEDDENIDEEADEVVPDGVEEVELAKIN LEKKDRERKLLIDDILKLSLWCDPSTDINPEKEADFWMVDGGIAMLVRNEFS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 5 | 1808 | 1804 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 5 | 1808 | 1804 | 0.0 | – | |
| Coils | 412 | 432 | 21 | - | – | |
| Coils | 503 | 526 | 24 | - | – | |
| SMART | 862 | 1010 | 149 | 8.3E-50 | ||
| Pfam | 912 | 1009 | 98 | 3.8E-5 | ||
| MobiDBLite | 1362 | 1385 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 1362 | 1383 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 1446 | 1518 | 73 | - | – | |
| MobiDBLite | 1446 | 1493 | 48 | - | – | |
| MobiDBLite | 1494 | 1515 | 22 | - | – | |
| Pfam | 1662 | 1775 | 114 | 1.5E-12 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0135600.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…