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LotjaGi1g1v0137200.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0137200
Transcript ID LotjaGi1g1v0137200.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Sentrin-specific protease; TAIR: AT1G09730.1 Cysteine proteinases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q8L7S0|ULP2B_ARATH Probable ubiquitin-like-specific protease 2B; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PKY4|A0A0B2PKY4_GLYSO Putative ubiquitin-like-specific protease 2B; Found in the gene: LotjaGi1g1v0137200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:22396208..22410231) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTTATTTCTCGTGAGCTTACATTATTTAAGGTGTGCTGACCCCTATGAAGTCTGAACCTATTCGCAACTGTTTCTTTGGC GCCCGAGTCACTGAGTCAGCTCGCCCGAGTGCGGAAGCCTAAACCCTTGTTCGGAATTGGGATTCAAGAATCAAGACCGC AACGATGAACGATTCACCGCGCAGAGATTCGGAATCGCTCGATTCCATGGATGCAGACCAGATTGCCACTGGGAACTTCA ATAGCCCTATCCTCCATGGTCAACCACACGAGTTTCTCGCTCCCGGTAAGACCAATTTCGCTAAACTTCCCTGTCACGCA ATGAAAACTTTTCGATTTGGTGTCAATTGATGTTTTTCTTGAGTCTAATGATGCTTGTAGCTGTTCTGTATGCTGTGTTT GTGTGTATTGGAATGGAATTGTATGAGTTCGAGTGTGAATTGAATTTGAGATTGAGAGGATGTAATTTGGAATTATTGTT ATTGGTATTGTTTTGTTTACCTTTTAGATGGGAATGTATGTGGGTTGTTGATAAAATTTGTGTGCTTCAATGAATCTTTA AAAAAAATTAAAAAATTTCACTGTTGTGTTCAGAGTTGATAGTTCATTCAATAACTTGAAGTGAGTGGTGAGCTTGGGAG AGATGGTGATTGGAGGAATTGAGGGGTGGAAACCCCTTGCATTGCGTTTGGAATCGTTAAATAATGGATATGGATTTAGG TAGAAATTGGTTCTACTCTGATTAGGCCAGATTTGAGTGGATTTCTTTATGGGGAAAACTTAGGTCAAGTGGTTTAAATC CATTATATCGAGTTTCTCAATCAAAATTTGCTACCTCATTATATAATGGACTTAATCACTTAAACGCCGCCGCCATTGTA GAAGTTGGTGAAGGAAGAAGCCACAGGGGTGTTGCTAGTGGACCCATTTCGGAACCGTGAAAACGTCAAAGTTCTCCAGT 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TTGGGGTGTGGGGTTGCTATTCCTTTTTGCTTACTTCACCTGATTTACTGCCTGCCAGTAAATGCAAACAAGCAAATGAA TAATTTTTAAACTACTGCATCATGAGTTAATTCTCCATATTTCTAAGTGCCAATTCTCCTCTCATCCATGCCTAGATTGG CACTCCATCTTTATAAATGCAAATTTCCCTCCTGATCCATGCCTAAACCTAAATTACAAGTGCCAATTACCCTCCGTTTG ACCTACATTTTTAATAGTTATACTACTTTTTTACAAATTATACAATTTTAAATCTAAAAAATAGGACTCAAATTGTTGCA GCAATTAATGAACTGTAAAACCGTCTTCTAGTGACTATGGTTCTAAGTTAATTGAACATACATCTATAGTGGTGAATTTT GTAATTTAGGACTACTTAGATAATATAGGATGTCCATATTTTTGCTAAGCATTATATTGAAACCTACAATTTGTAGCAGT ATATGATTATGTCTCTTTAATTTTTTCATTTAAATTGAGCTTGAACTTTGAAGTGGTTTATCTTCTTTATCTTTGAGAGA TTTTGTTTTAATACAACAATGAAAGCATTATCCCACTAAGTGGGGTAAGGCTATCTGGATCACACAACACCGTTGTGTTT TGTCAAAAACCAAGTTTTGTCGGATATTATTGACCATGAGGTTGCTTTTAATATTAAATAATATTTTCCAACATCTTTTC CCTCTACTCCTCTTCCTAGGACTAAGAACCATGTTATAAACCCTTCTCATCGGTGCCTAGAAAGGTCTTCTTTTCACATG TTCAAATCACCTTAACCGATTTTCTGTCATCTTCTCTTTGTTAAGTGCCACACCAATATCTCCCCGTATATGATCATTGC GCATCTATCATTTCTAGTGTGTCCACCCATGCATCTTTACTATTATTTGATTGAGTGATGAATTAAAATATAAAACAGCT 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ATTCTTCCCTTTGACCAAGTTGTTCATCCCCGCCGCCTCTGATACACTCCTCAAAACACCGTTTTCTCTCTCACCCCTCC TAACATTCTGCTTGCGCTCACTCGCGGTTCTTCTTCCATCACCTATGATCATCTCCTCTGATTTCAAGTACAACACATCC AACGACTCAACACTGCTATCCTTTTCGTGGCCCCCACCGCGTGAAGAAGATGGGGAGACAATAATCTGATGCTCTAACCT GTGCTCCCCGCTCATCATGCCCCTTAACGGCCCCACACTTTTCCCGGGAGACGCAACAGCATCCTCCAACTCCTCCAAAG ACCCCCTAAACGACGGCGTTTCGGCATCATTCTTCGGTGACTGTAAAACAATCTCTATAAACTCCTCCTCCCCCTCTCCG TCGGACGAGTCCCTCCCGGAGCCTCGCCGGTTTTCATTCTCCGGCAACACGCCGCCTTCGTCATTATTTCTCCCCCCTTC AATGATGTTATTGCCAAACGCTTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCCCTCGCGTCCTCCGCGAGACCTGCGTCTTCGCGGAGGA CTTTGTAGCGGCAGAGCGGGCACGTGGAATGTGCATGGAGCCACATGTCAACGCAATCCACGTGAAACGCGTGCCTGCAC TTTGGCAACAACCTTAGAACCTCACGTTCCTCAAACCCAGCGAGACAAACCGCGCAGTCAAGCCCATTTTTCCTTCCCCT CAGCGACCCAAACCGGAACTTCGGCAGCGATTCCACGACCTCACGGCCAACCCCGGAGTCCTTCCTCTGCTCAGACGACG CCGTCTCCGCCGTAGCAGCCTGGGAATTCCGGTCTCCCCTGGCGACGATCGTGCTGCTGCCGCTGCAGTGTTTAATGTAG AGGAGGAGGAGGAAGGAGAGGGAGAATGTGGTGGTCAGAACGCCGACCACCACTGCGGCGCTCGGCTTCAATGCATCCGA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0137200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAACGATTCACCGCGCAGAGATTCGGAATCGCTCGATTCCATGGATGCAGACCAGATTGCCACTGGGAACTTCAATAG CCCTATCCTCCATGGTCAACCACACGAGTTTCTCGCTCCCGTTTCCCAGGCAGGCAAGGTTTATGTAAAGGATGTTGCTA GTATTTCTAGCACTGATGTTGATGGAGTTAGGGGTAACTTTAATCTGGAAATGGGCCTAGACACATTACAAGACATGCTT GATAGCAAAAAGAATTCTGCGCTGGAAGCTGAGAAACTATCAAACTGCAGCACTCATGAAAATCAGCGTCATTTAAAATT AGATTTTCACAATTCTTTTGACCCAGAGGCAAAAGATGACTGTGGTGGTGTATCTTCACCTCAGACAAGTCAGATAGATC ATACCCCTTCAGAGTCTCCATCCAGAACTGAATCAGTTGATACTAATGAAGCTGATGAGTGCATTAATGAGAGCAATCCT TCAAGTCCTGCATCTGATATTGCAGAGAATGGTTTATTTTATTCTTCATTGAATGGTTATGGATTGAATCACTGTGTAGC TGATTCTGACATGGATGATACAAATATGGAAGTTGTTCTTCATCCTGATTATGTTATATACCGGGATAATTATTGCATGG GGTTGAAGTTAACCTTTTCACAATATTGTATTCAAATCAATGATTCAACGGCATGTGAAAAGGAAGGGACCATTAATATT GAATGGGCGGTTGAGGATCTCATTGACATTAAGAGTCAATCATTTCAAAGTACTGGAATGGTTTTGATGACCCTTCGTTT AGTATCGAGTGATACAGTTCAGTCAAATAATGTTAGCTGCACTTCAGGGATTGATGAATTGAAGATTGCTATTGTTGATC ACAATTGGTCCTTCAGGCATAAGCAGATCACATCTCTTAATGAGAAATACCTAGCTATGTGGAGTACTTTGCTTGATATG GATGTGGAAGGTGATGAAAATCTTTCGCCGGCACCAAGATGCTACTTCCCAAATTTCCAGCAGCCTTTTGATGAAGTTGT CTATCCTAAAGGGGATCCAGATGCTGTTTCCCTAAGTAAGAGAGATGTTGATCTATTACAACCAGACACATTCGTCAATG ACACAGTTATTGATTTTTACATTCAATTTCTGAAGAATAAGATACAAGAGGAGGAAAAGTCTAGATTCCATTTTTTTAAT AGTTTTTTCTTTCGAAAGCTTGCTGATATGGACAAAAATCCATCTAGTGCTTCTGACGGCAAAGCAGCATTTCTACGTGT TCGTAAATGGACAAGAAAAGTGAACTTATTTGAAAAGGACTATATTTTCATACCTGTGAACTTCAATCTTCACTGGAGTT TAATAGTCATTTGTCATCCCGGCGAAGTGGTTAGTTTCAATGATAAAGAGCCAGACAAGTCACTTAGGGTACCCTGTATA TTGCATATGGATTCTATCAAAGGACTTCATAGTGGTTTGAAAAACCTTGTACAAAGTTATTTGTCGGAAGAATGGAAAGA GAGGAAGAAGGATGCATGTGCTGAAGACCTTTCATCAAGATTCTTGAATATGCGTTTTGTCCCCGTCATGTTACCGCAGC AAGAAAACTCTTATGATTGCGGCCTCTTTTTACTTCATTATCTGGAGCTCTTCCTTGCTGAAGCCCCTTTTAATTTCAAT CCATTCAAACTAACCAAGTTCTCCAACTTTCTCAATTCGGACTGGTTTCCACCTGCGGAGGCTTATCTAAAGCGAACTCT TATTCAGAGGTTAATCTTTGAACTTGTGGAAAACCATGGTTCACATGGAGGCTTTTCCTCTGATTACAGTGATGACCACC ACCACTCAGAAAATAATGACAACAGGACTGACGTTAATTGTCATGTACTAAATGGGGAGGCGTCAACGTCCCATTCTGGA CACGGAATAGAAATCACTCTATTGTCAGCATCTTCACCTGTAAATCCTCAATCTTTCAACACTTCAGGCATGGTTCTTAA GGAGCTTTTTGGACCAGGAACTACAGCAGGAACAACTTTACTTGGACAATGTCAATCTATTGACCAGCAATCATCTGACC TTGGTCCGAATGGTTCAATATTTACAATGGAGGGAAACGTAGATTTCAGTGAGCACCTTATGTATACAACTACAGATCCC AACTTTCAGCAAATCACTGGAATTTCGCCACTACCATGTTCGTTGCCATACTTACCCAAGGCTCATGGAAATGAGATTTC TCATGTACCACGAACTTCTCTACAAGCAGAGCACAACACCGAATCATCTCTAGATACAAGTTGTGCATCAGATGATTCAG ATGACATCGGGGTAATTGAAAATTGCGAAATTCGACATGAAGCAAGTTCATTGTATGAAGATGATCAAGGTGACAAAAAT TGTACATCCATAAAAAACGTTGAGCATTTGTCAGATATTACTGTTTCTGCTGCTATCAACTTGCCAATTGATTCCCTCGT GGAGATTTCTCAACACTCTAATGTGTGTGCTGGCATCAAGAATGGAGATCAACACCCGTCCTGCCTAGAGACACCAACAA TACAATTGGATGAAGTTTCTGATGCAATAGATGATAGCAGAACACCAACAGTACAATCGCATCAAGTTTCAGATGTAGTA GATGATGAAATCACACGAGATGATGTTCAGATGATGGACCACTCGGAACCTGATAATTGTGAGGAACCAGCTGTAAAGAA GAGGCGGCTTACGCCGATGCAAGGCGAAAATGATGGAGTCCTGACCAAATCTAATTTATAG 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0137200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MNDSPRRDSESLDSMDADQIATGNFNSPILHGQPHEFLAPVSQAGKVYVKDVASISSTDVDGVRGNFNLEMGLDTLQDML DSKKNSALEAEKLSNCSTHENQRHLKLDFHNSFDPEAKDDCGGVSSPQTSQIDHTPSESPSRTESVDTNEADECINESNP SSPASDIAENGLFYSSLNGYGLNHCVADSDMDDTNMEVVLHPDYVIYRDNYCMGLKLTFSQYCIQINDSTACEKEGTINI EWAVEDLIDIKSQSFQSTGMVLMTLRLVSSDTVQSNNVSCTSGIDELKIAIVDHNWSFRHKQITSLNEKYLAMWSTLLDM DVEGDENLSPAPRCYFPNFQQPFDEVVYPKGDPDAVSLSKRDVDLLQPDTFVNDTVIDFYIQFLKNKIQEEEKSRFHFFN SFFFRKLADMDKNPSSASDGKAAFLRVRKWTRKVNLFEKDYIFIPVNFNLHWSLIVICHPGEVVSFNDKEPDKSLRVPCI LHMDSIKGLHSGLKNLVQSYLSEEWKERKKDACAEDLSSRFLNMRFVPVMLPQQENSYDCGLFLLHYLELFLAEAPFNFN PFKLTKFSNFLNSDWFPPAEAYLKRTLIQRLIFELVENHGSHGGFSSDYSDDHHHSENNDNRTDVNCHVLNGEASTSHSG HGIEITLLSASSPVNPQSFNTSGMVLKELFGPGTTAGTTLLGQCQSIDQQSSDLGPNGSIFTMEGNVDFSEHLMYTTTDP NFQQITGISPLPCSLPYLPKAHGNEISHVPRTSLQAEHNTESSLDTSCASDDSDDIGVIENCEIRHEASSLYEDDQGDKN CTSIKNVEHLSDITVSAAINLPIDSLVEISQHSNVCAGIKNGDQHPSCLETPTIQLDEVSDAIDDSRTPTVQSHQVSDVV DDEITRDDVQMMDHSEPDNCEEPAVKKRRLTPMQGENDGVLTKSNL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 25 25 -
PANTHER 35 906 872 0.0
PANTHER 35 906 872 0.0
Coils 73 93 21 -
MobiDBLite 116 167 52 -
MobiDBLite 123 144 22 -
MobiDBLite 152 167 16 -
Gene3D 348 593 246 3.8E-81
SUPERFAMILY 348 595 248 7.06E-51
ProSiteProfiles 356 551 196 28.45
Pfam 371 565 195 8.2E-39
Gene3D 396 528 133 3.8E-81
MobiDBLite 893 926 34 -
MobiDBLite 893 913 21 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Biological process Proteolysis The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds.
Molecular function Cysteine-type peptidase activity Catalysis of the hydrolysis of peptide bonds in a polypeptide chain by a mechanism in which the sulfhydryl group of a cysteine residue at the active center acts as a nucleophile.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0137200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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