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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0146300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0146300.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Sugar transporter, putative; TAIR: AT1G34580.1 Major facilitator superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q93Y91|STP5_ARATH Sugar transport protein 5; TrEMBL-Plants: tr|A0A151TZW9|A0A151TZW9_CAJCA Sugar transport protein 5; Found in the gene: LotjaGi1g1v0146300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:24828443..24859864) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTGGGGGATTCACCGCTGATTCTTCAGCCAATGATGGCGGCTTCAGCGGCAAAATTACAATCTCAGTTGTCATCACTTGC ATTGTTGCTGCCTCCGGTGGACTCATTTTCGGTTATGACATCGGAATTTCAGGTACACTTTCTTCAAATTTCATTTTTAT AAAGTAATTTGCAGTGAATATTAGGGTGCAATATAAGAAATGTGAGCTGATTAGTCACCAAATTTCTTGTGTACTCTGCA TCTCATAGTTTTGTACCTTGAATCCCTCTGTGCTCTTCCAATTTTTGCCCATCTTTCTGGATCCTTATTAGTATAATTTA TGTATGTTATACTTATTTGTGAATGGATAAATATATTTGGCTAGCCTCAATCGGTGACCGTTTAGTGCACTGACTGTCAC ACGAAAATTTAGTCTCCAAATATGAGAATACCTTAGTTTGAGAAGCCATGATAATTTGCTTTCATAATAAGGTATGCTTT GGGTCCTTGGAAATCAAGAACAGAATAATAAGGGGTTGCTACTAGCTAGCAATAATTGCAGAATTGAAGAGCTATTTTTT GGTAGTGTAATTAAACAATGTCAATATCCTACGTTTTGTGGGTTTCCTTTTCTGGTATTGAATTCGTACTCAGAAAGAGA AAGAGAAACCAAAGGGTAGTAGTTGGGGGACGTTTTTTCAAGCTATGATCGTTAGGTAATCACACTACTTGGACCAGCTA GTAATCAATTTTTTTTTCTTGTCACTACCCATTCGTCATGCAACTAACTTTTGGTTATCTTAGTAATATTTGGACCACAA GGTGAACCATTTTTCTTGCTGTCACTGTTATTAGTCTTCTTTTTTGACAATTCTGTTATTAGTCTACTTGTATGCTACTT GCACAATTGCACGGATTAATATTTATAATTTAAAGTAAACTATAGGGACCCTAAATTATAAATATCAAATGTTTCTGTGA 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AAGCCTTCCCCTTTGTGTTTCTCTTGTGAATTCTCTCTCCAAAAACCAAGTTATATCTGTTTTGATCTGAAAAGAGCCTT TTATAATGTGCTGTCACGGGCCTGGCCGCTGAGCGCCCCTTTTTGGCCGCTGAGCGGCCAGTTACTTCAGAGAAGGGTAA TTGCCACCGCCTTGGGCGCTGAGCGGCCTCTGCATACCGCTGGGCGCCCTGGGCTTCTTCAAATTCCTATTTTCTTGCCA AAACATGCCCTCTTCCTTGAATCTTCAATTCTACAATACACATTGAGATTAAAATCAAACTTAAGCACATCTTAGCCTAA AGTTCACCTATCAATAAGTTCTAATCAAAAGAAGTAGGATTTGATCAAGATTTATCATGAATTGACAAGGATAAATGCCT AAATTTCTCATCAAAATAGGTAAAATTGGCACTTATCAACATTCTTCCCACAGGAGAATAATTCCCGCGCTTTTGCCAAA ACATCATTATCCGACCAACCGCTTGCTTGCTGACGCTTAGCGGGGCATCATAAGCGCCAATCCATTTACCCAGTATTTTG TTCATATAATTCCAGCGGTTTCAGCATGCATTTTCATCACGCGGAGGATCGAATGAGCAATGCTCATTACAATACTCAAC AATATCTCTCCAAAATGTTTCTCCTCTCTGGTTTTTCCCCACAACACTACTTGTTCCACAGTTAATCCACCCACTAATTA GCACCAAATTTTGTGCAGTGTTCCATGTTGGTGACTGGGTTTTCTTGCTCTTAGGAGTTGTATCCTCTTGATTTGGAGTG AATTGATTAGCAGCTGTCATGCCACCAAGAGTCATTTGTGTTAAAAATTCGGGAAATTCAGGTGCATCAACACTTGGAAA ATTTTCATTCACCATTGGCATATGACCACTAGACGGGGGTGTTTGAGATGGATATCTCATAGAGGGATGAAAGGATGACT 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TGGCTGTCACCCTGAAAGACAATGACTGACCAACAAAACAGAGTTTGACTGCCAGTTCTGACCCCAGTTTCTGCTCATAC TCTCATCCACCCCAGTTCTCTATTTTTATTAAGGAAGACTCAAAGAATATCCAGGGGTTAATTGTCGTATTCTTTTTCCA CAAATCCTCCAATCTGTTGCAGTATTGATCCAAACAGAGATGACAGGAAAAAGTCTTCATGTATATTCACACAAAAACAC AATGCAAGTGACATCCACCAAACCATAAAGAAAGCACCTAAAAAATGCACATATCTGTCATAAGCATCACACACCAAAAA TATATTAAAATGAATCCCTTCAAACTGGAACTCGCAATTCTTTGGAACAAAGCCTAAGATACCACCCCATTCACAATCAT GACAGATGGTTACATATATAAATATATAATTGTGGGTATTAAATACTAAATAGAAAATGGAAACAAAATAATCTACAATT TTAACAATAAAAGAAAATAGATGCTGGCCCCACATATCCCTCAGTGGTCCAGTCTATAAATTTGTTGCCATGCTCATATT AAAGATCATGAACTTCTTTATATACCCCAGAGAGAACTGAAACAGAACAACCACCAAAATGGCTGTTGGGGGATTCGCCG CTGATTCTTCAGCCAATGGCGGCGGCTTCAACGGAAAAATAACAATCTCAGTTGTCATCACTTGCATCGTTGCTGCTTCC GGTGGACTCATCTTTGGATATGACTTAGGAATTTCAGGTACACTTTTAAAAGTTTCCTTTTAATTGAGTACTAATTTGCA GTGAAGAGATTAGGGTGGACTATATGAAATGTGATGCATGGGTACTTGTGCATTGTATCTCTCAGATTTGTGCCGTGAAC AAAGCCTCTGTGCTCTTCCAATTTTTTGCCCATCCTTATTAGTATTTAAGCATTTTATACATATTTGTGAATGGACAAAT ATCTTTGGCTAGCCTCTACCGATTACCGCTTAGTGCGCTAACGGACTGTTACATGCAAAATTAGTGTCCGAATATGAGAA TACCTTGGTTCTGGGAGAAAACCAAGATAATTTGCTTTCATAATAAGGTCTGGTTTGGGTCCTTAGAAATCAAGAACAGA ATCAGAAGAGGTTGCTACTAGCTAGCAATAATTGCAGAATTGAAGAGCTAGATTTTGGTAGTGTAATTAAACCCCTACGT TTTTTTTCAAGCTATGAAGTATGAACGTTTGGTAATCACACTATTTAAGTAATAAATTTTTTTCTTGTCACTACATTCGT CATGCAACGAACTTTTGGTTATCACAAGGTGAACGATTTTTCTTGCTGTCACTGTTATTAGTCTACTTTTTTTTTTTTTT GACAGTCAACATAAACATTTCATTAAACAACAAGAGACATAATGTCTTTAAGTACAATGGATTGAATGCAAAAAGGAGTG AACCCAACCCAAACACAATTATCATTCTCCAAAGAGAACTTAGAGAGGTGATGGGCTACCATATTTGCATTTCTACTGAT ATGACTTATGAGTAAGGGAAAAGGATAAGAACCTACAGCTTAAGAACATGATATCCTGCATAATATAGTACTGATATGAA CCATGTGACGGATTATTTAACACAGCATCCACTGTTATTAGTCTACTTAGCTTGTATGCAACTTGCACATGTTGCACGTA TTAATATTTATAATTTATAGTCAATTGTAAGGACCCGAAATTATAAATATCAAATGTTTCTGTGAGATGATCAAAGTGGT ACTACAAGTCTTTTAAAGTCTATTTGGTTGATTAAATTAATTAGTCTTAGGAAGGGAGATTTAAAAAAGGGGAAAAAGTG AAAAATGTGATATAAATTGTACCACCTGTTTGAAACCGTACCCAAAAACACCATAGAAAGGCTGAACTTGAGAACGAGTC TCATTAAAACTTTATTAGGAAAAACTCATTGAGATAAAAATCTAGTGAAGGAGAAAGAGTACTACATTCTCAAATGTTTC ATTGAAAAAAAGAACCACCAAAATACCCCATACCTTCCACCAAAAGAATTTTTTTTATCAACAAATGTTAGTAATGTTAG TATATTAATCCTTCCTCAGAGTTCGAGCCCTGAACCATTTACCCTTTACCCTCCCAAACCCTTTACCCTTTACCTTCATA TTTAAGTTAGAAGAGAAATTAAAAAGTCAAATTTACCTTCATATTTAATTTTGAAGTCGATCCTCTTTGGGTCCACCTTT GACTTCATGTTTGTTTATAAGCTCCTTTGACTTCATGTAAATATTTCCTTTATGAGGGGCTTGTCCTTATACTTTTATTT CTCATTAAATAAAGTTGTGTTTTAAAATAAAAACGAATGTGAAAAATAAACATAAAAACAAATCACTTTGACATAATTGA CATTTGAAAAAAGAATATAATGTAAAAAAAAGTTTTAAGTAATTAATAATTTGATGAGTTAAAAAGGATTGTCTAAGTAA CTATTGAGAATTCAAGTGCGGAGTTGGAGTCTCACATTGGTTAAGTATGGGTGAGGAGAAGAGTTTATAAGAGATGTGAC CCATAAACCTAATGCCTTAAGGTTTTGGGTTAAGATGTGGCGTCGAGATCTCTTGGTGTCTTGCTCATCGGCCCATGGGC TCCCCTATCTCCCCCAACAAAAGTGGTATCAGAGCCGATGGTTGATGTAGTCATGGTTACGGCTCCTTGTGTCGAAAGTC TTCCAAGCGGTTTGGCTAGGCGGCGGGTTCCGTTGACGCGGTGAAACGAACGGCGATGCAAGGGTGGATATGCTTCCGCG GAGGGGGGGCCATGATAATGTGGCGTTTACTCGCACTTGAGGGGGAGATTGTTGAGAATTCAAGTGCGGAGTTGGAGTCT 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TCAATTTTGATTTGAAAACTACTTTGTTATCTGAAATAAAAATCAAATTTAATTAAATATTTATATAAAAGATTAAATAT TTAAATATTTATATAAAACGTATAGTCATTAAACATTTAAACTCTTAGAGCATCATTATCCAAGAAACTCATTAGAGAAC TCATTAGAGTTTCTAATTTAAATTTTGGTAATGCCACGTCATTTAAACCACTTTAATAAACTCTACTCACATTTTACTTC AATCCAGAAATTCTAAAAAGTTTCTTAAATGGATCCCACAATATACCCCACTACTTTCTTGTAAATCCAGATACCTATTT ATTTGCTTTTTTATTTGTTTTTTATTTATTTTTTAATCATTAAATTTAGAAGAGAAACTTTGAGCAAAGTTTCTCTAGAA AGAAACTTTGGAGCAAAGTTGCTTGCCACGTGGAGAAACTTAATTTTCTGCAACAGTTAAAAAACTTTAGTTCAGATGAC ATGTCATAAAGAAACTCACAAAGTTTCTTTGTTGCTAATGCTCTAATATCTATATTTCAGGCTACCCCATTGTACCTATC AGAAATCGCTCCACCCAAATGGCGAGGTGCGTTCCTCACCGGCTTCAATTTCTTCAACGGAATCGGCGTGGTGGCCGCGA ACTGCATAAACTACGCAACCGCCAAGCACACATGGGGGTGGCGTCTCTCCCTCAGCCTCGCCGTCGTCCCCGCCACCATC ATGACCCTCGGCGCGTTCCTCATCCACGACACTCCCAGCAGCTTAGTCGACCGCGGCAAGATTGACCAAGCCAGACACGC GCTGCGCAAATCGCGAGGCTCCACCGTCGATGTGGAACCTGAACTGGAGCACGTGATTCTATCAACACATGTTGCAAAAA CTATGGAGCAGGAGAGTTTCATGACCATATTTGAGAAGCAGTATCGACCTCAGTTGGTGATGGCGTTTGCTATCCCTTTA TCTCAGCAGCTTACTGGGATCAACATTGTGGCGTTTTATGCACCTAATCTGTTTCAATCTGTGGGGTTTGGCAATGACTC TGCATTGCTTTCAGCTATTATATTGGGACTTGTCAACCTTGGTTCTATTTTGGTGTCTGGTGCTGTTGTTGATCGGTTTG GTCGGAGATTCTTGTTCATTGTTGGTGGCATTCAAATGTTTGTCTGTGAGGTAATTAACCAAATTTCTTACTTACTTCAA TTATTATTATTTAATCCCATATTAGGTGAATTAATGTGATTAAGATAGTGATTTTGGGAGCTAAAATATAATAATCTCTT TTCTTAATCTTTTATAAACAAAATTGTTAATCTAGTTAACATGAAGTTGTTTAATTTTTTTTATAGGCAGATGTTAGTTG GTAATTGTTAGTAAATTAGTTTCTTCGCCTGAGTTTGAACTCTAACCCTTCACCCTGCAAATCTCTTCATTTCCCTTAGC TCACCACCCTTCCCCATGAAGTTGTTTAATCCCTTAGGATACTCCCAAGTTGACAACATAGGTAGATTAGCATGACTATT ATATGGTCCTTACACACACTACAATCTACATAGCTAGAGTTGCAAGACTACTAATCTTTCATACATTCTTTTCGTTTTCT TTTTGCAAACAAAATGTGATTTCATCAATAAATTCTTGGACAAAGCCTTGGGAACAACCTTCCCAAATAGGTCATGTTAC ACTTAAAACAAGCAATAATCCATGAGGGCTAAAGTGCCTCGGATGTGTTATATTCCTGTTATCATAGTTTATAATGATAA AAAAGCGTACTTAATTACATTAGGAAACCCAAATTCATATAAAAGTATTAAAGCATTTAAGTTTACTTTGGAGAGAGGGT TGAGAAAAGGGATCCTTGGCTCTTTTTAATTCTTGAATGTGGTAGAAGGTTTTAGTGGAATGATGAGACAAGTTGTTAGT TTTTAAACTTGTTTAAAGGGTTTAAAACTGGTGGTGAAGGAGTGGTGATATAACTGTTACGATTTGTGAATGACACATTA TATAGTAGGGAGGCTTCTACTCAAAATGTATCGGTGATGAAGAGTGCATTGGGGTGTTTTGAATTAATATCTGGGTTAAA GGTGGAATTCTTTAAGAGCAAATTAGCAGGAATATCATCGGTGACAAATGAAATTCAGTGGTTTGCGTTGATATTATGGA GATCCTCTTTGTATATTAGGGTACATAGGAATGAATGATTCAGACACTGAAAAATAGACTTTCTTCTTGGAAGCATAAGA TTTAGGCGACTTCTACCGTACCCCCATTGTATGGTACACGACTAACGCGATTTGGTGTGTACTAATAGGGGACCGACACC TGACAACTTATTTAAATATTTGTTTCATTTTAAAACATATACGGAAAAAAGGAGAAAAAGACACTTAAATGTCATTGGTC CACTTCACCTATTGTATCATACCCCAACCAGGGACGGAACCAGAATAATAGGTACTGGGGGGCTAAAGTTCAGCACATAC TAAATAATTTTTTTATTGAACATGCACTGAATAAAACTTAAAATAACTAATGTATTAATGTATGCAATAAAAAACAAATA TCTTTTTTGTGTAAGAAATAAGTCCTCCTACTAAAGACAATCATTTTTTCCATCCACAAGGCTCAAATCTGATACTGCTG GATAATGATTAATAGTCGGAATACGAAACAGCCGAATTTAATGTATCAATGCTATAATGTATCAATGATTTATTCCTGTT TTGATCTGCTTTTGCTTAATTGTACACGTTAGTTTGATTCATTTCTGTACTATTTAGCAATGCTCTTCCTTGCTTAAGAG AAATTAAGCATGTACCACTTGAACCAACCACACTTTGGTAATAAAAAAACAAATATCATAAATTAATACACTTTGAAACC TCATACTCGGGACTCTTTCTTCTCTCGGTAGTTATCTTTTTAATCTTCACTTGACTGAAAAGAATTAAAAAGCAACTATT AATTGACTAACATGGTGATAAAGGAGCAGATCACTTTCACTTCGTAAAAAAGCTTTAGGCCTATTTTGTTATTGGATAGG GGGCGAGATTTCAATCCAGTATAATAGGATGTAGTTAAACAAAAATTTACAGAGGGGGGCGAATGCCCCTAATGTTTACT ACCTGGGTCCGTCCCTGACCCCAACTAAGTGTTGTGGTATCCTAGCAAGCAGCTAAGATTTATCCTTTAGAGGGAAAGTA TGTCTTATTGGGAGTTTTCTATCTTCTATTCCGCTTTTTTATCTCTCTATCTTTAAATTGCCAAAAGTGTTTCTAACCTG TGCGTAGTGGGGTTGGAGAGAAGACAATATATTGGGTGAAATGGTAAAATGTGTGTAGATGGAAGGAAGAAGGTATATAT CTGTTGTTTCCGGTCTCTTAAAATCAGTTGGGTACTTGGGTATGAATTTCCAACAAGGTGCTGATTTGGGACATGCCGGG AGCATCTCAAACTGTTCACTGGTGGTTGTGGTGACTATTATTTGTAGGGTAATTATTGGATATAAGATTCTTTTTAAGGG TATCAGAGAAGTAGGTTGTTGTGTTGATTACTTCATTGATCATGTATCGTTCCTGGTGGGGTCTTGGTAGCGTTTGATTA CTTTCGGGTTGAATTGTATTGGAGTTAACTTAGGGGGGGGGGGGGGTGGTTGTGTTAAAGCATTAAGTTGAAGAAGGGTG TGGTATTTATTCTTTCTACGCAGAGAGCTGCCACAACTAGCGCAATCCAAATAGGCTTAGTTGTCCCTTGCTTTATTCTC GTTCTTGTAATGGGTTGAAGCATCTCTTATGCTTTTTATGCCTATTGACCTTTTAGAAAAAACAATTTAAGAGTTAGCCT CAAAGTGGGAGACTTAGGGTATAAGACATTACAACATTTGATTAAGTTGATTTATTGACTTTTTAAAGTAAGTAAACAGT ATTAATTGTTGTGTTGAATTACCTTATTAGAGGAGCTACTCTAAAGTGAGCTAAATCCTAGCCTCAAAGGGCACATGCCA CACCTAAATATTTAGAAAAAAATTCTAAGACGATACCGGGAACATTTCACATAACACTACCAATGCCAACTTATAGGATT AAAATCAAAAGGTTAAAAAGATGCTTTTCGGGTTGAATATTATTGGATTTTTTTTTAATTAGATTAAAATATGTCAAATC GAAACATGAAACATGTTTATTTTTGAGAAAGAAAAACTTAAATTTTCTTTTTCAAACCGACCTTGAACATTAGAGGGGTC TCTTACTACATAATTGTTGCTTGGTGGCCTAATTAAGGTTGAGAAAATTAAGTGTATATGTTATAAGCCTATAATACACT TGTAGAGTTGTACTAACTACTACAAATATGTGTGATGATTGTGAAGATTGCGGTGGCTGTTGTGCTAGCACTAGAGACAG GGGTACATGGTACAGAACACATGTCAAAAGGCAACACAATACTGGTACTGGTGTTAATGTGCTTCTACGCAGTAGGTTTT GGTGTTTCATGGGGCCCTCTTTGTTGGCTAATTCCAAGTGAGATTTTTCCCTTAAAAATCAGATCCACTGGGCAAAGCAT AGCAATTGCTGTGCAGTTCGTAGCCATATTTATTTTATCCCAAACATTCTTGACAATGTTGTGTCACTTTAAGTTTGGGG CTTTCCTATTCTATGCGGGTTGGATTGCAGTGAGCACGCTCTTTGTTTTTCTGTTCTTGCCTGAGACCAAAGGGATTCCT TTGGATTCAATGTACGCAATATGGGGCGAACACTGGTATTGGCGTCGGTTTGTTGTTAAAGAACAAGTTAACCAAGATAA TCATCCATGAGTTATGAGTACATGGTTAAGCAAAAGAAATGCAGTTATTTGCAATACAAGAATTGTGCGTGTCTATGTAC AATGAGAAACGCTTATTTAAGCATGTAGCATGTATGTACATTATTCCACTAAAGGAACTTATGTTTGTTTGCATCTTAGT TTTCTTTACCATAGTGCAGGGTGTGTACCTTTAGTGGTACATTTTACATTATATATCAAGTTACTCTAGGAGTTATATTC ACTATCCTCACCCTACATTTGCCAGCCATCTTCTCGAAGTGTGAGTGACTTCCCTCATGTTACAATTTGAAAGTAATATA ATACGTACCTTGTTGATATCTTTTCCAAATGCATCTTTGTAGTGATTCAAAGTAGCATTAATCTGGGCTCTGCTCCTTGT AGCCAAAATCCTGATGAGGTCGTCATCATTATAACTTATAAGCCTTATCTGTAAACTTCTCGTGCAGTAATTTTGCCTCA GATTTTGCCAGAGTCAATTTGACCTCATCTCCTTCATATCGGTAAGAACTCAGAGAGGTAGGAGGAGCTAAATCGCATTA ATGTACTCATGTGGTGTTAAAGTCAAACGATGGTGTCCTATACATTTTATCCTGATTTCCCGGATTATTTTTAGGCTTAA ATAAGTTTTTGGTCCCTAACCTTTACCATATTTTGGTTTTCGTCCCTCGCCGGAGCAAATGT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0146300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAACCATTTCTTGAAAAATTCTTCCCTGATGTGTTGAGAAAGGTTGCAAGCGTCGAAACGAACATGTACTGTGTGTA TGATAGCGAGATCTTGACATTATTCACATCCTCCCTTTATCTAGCAGGGCTAGTGTCTACTCTCCTAGCCAGCCGAGTCA CCACGACATTGGGTCGGAGAAACACCATGATCTTGGGTGGTTGCATCTTTTTTGCTGGTGGTGCTATTAACGGTGCTGCT GAAAACAAAGCCATGCTCATCTTAGGTCGTATTTTATTGGGTTTTGGGCTCGGTTTCACTAATCAAGCTACCCCATTGTA CCTATCAGAAATCGCTCCACCCAAATGGCGAGGTGCGTTCCTCACCGGCTTCAATTTCTTCAACGGAATCGGCGTGGTGG CCGCGAACTGCATAAACTACGCAACCGCCAAGCACACATGGGGGTGGCGTCTCTCCCTCAGCCTCGCCGTCGTCCCCGCC ACCATCATGACCCTCGGCGCGTTCCTCATCCACGACACTCCCAGCAGCTTAGTCGACCGCGGCAAGATTGACCAAGCCAG ACACGCGCTGCGCAAATCGCGAGGCTCCACCGTCGATGTGGAACCTGAACTGGAGCACGTGATTCTATCAACACATGTTG CAAAAACTATGGAGCAGGAGAGTTTCATGACCATATTTGAGAAGCAGTATCGACCTCAGTTGGTGATGGCGTTTGCTATC CCTTTATCTCAGCAGCTTACTGGGATCAACATTGTGGCGTTTTATGCACCTAATCTGTTTCAATCTGTGGGGTTTGGCAA TGACTCTGCATTGCTTTCAGCTATTATATTGGGACTTGTCAACCTTGGTTCTATTTTGGTGTCTGGTGCTGTTGTTGATC GGTTTGGTCGGAGATTCTTGTTCATTGTTGGTGGCATTCAAATGTTTGTCTGTGAGATTGCGGTGGCTGTTGTGCTAGCA CTAGAGACAGGGGTACATGGTACAGAACACATGTCAAAAGGCAACACAATACTGGTACTGGTGTTAATGTGCTTCTACGC AGTAGGTTTTGGTGTTTCATGGGGCCCTCTTTGTTGGCTAATTCCAAGTGAGATTTTTCCCTTAAAAATCAGATCCACTG GGCAAAGCATAGCAATTGCTGTGCAGTTCGTAGCCATATTTATTTTATCCCAAACATTCTTGACAATGTTGTGTCACTTT AAGTTTGGGGCTTTCCTATTCTATGCGGGTTGGATTGCAGTGAGCACGCTCTTTGTTTTTCTGTTCTTGCCTGAGACCAA AGGGATTCCTTTGGATTCAATGTACGCAATATGGGGCGAACACTGGTATTGGCGTCGGTTTGTTGTTAAAGAACAAGTTA ACCAAGATAATCATCCATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0146300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKPFLEKFFPDVLRKVASVETNMYCVYDSEILTLFTSSLYLAGLVSTLLASRVTTTLGRRNTMILGGCIFFAGGAINGAA ENKAMLILGRILLGFGLGFTNQATPLYLSEIAPPKWRGAFLTGFNFFNGIGVVAANCINYATAKHTWGWRLSLSLAVVPA TIMTLGAFLIHDTPSSLVDRGKIDQARHALRKSRGSTVDVEPELEHVILSTHVAKTMEQESFMTIFEKQYRPQLVMAFAI PLSQQLTGINIVAFYAPNLFQSVGFGNDSALLSAIILGLVNLGSILVSGAVVDRFGRRFLFIVGGIQMFVCEIAVAVVLA LETGVHGTEHMSKGNTILVLVLMCFYAVGFGVSWGPLCWLIPSEIFPLKIRSTGQSIAIAVQFVAIFILSQTFLTMLCHF KFGAFLFYAGWIAVSTLFVFLFLPETKGIPLDSMYAIWGEHWYWRRFVVKEQVNQDNHP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 30 | 30 | - | – | |
| Gene3D | 1 | 441 | 441 | 1.5E-110 | – | |
| CDD | 1 | 425 | 425 | 4.67272E-170 | – | |
| ProSiteProfiles | 1 | 427 | 427 | 42.876 | ||
| PANTHER | 18 | 452 | 435 | 3.1E-230 | – | |
| PANTHER | 18 | 452 | 435 | 3.1E-230 | – | |
| TIGRFAM | 22 | 432 | 411 | 1.6E-95 | ||
| Pfam | 28 | 438 | 411 | 1.3E-100 | ||
| SUPERFAMILY | 28 | 432 | 405 | 7.32E-56 | ||
| Phobius | 31 | 50 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 31 | 53 | 23 | - | – | |
| Phobius | 51 | 61 | 11 | - | – | |
| Phobius | 62 | 80 | 19 | - | – | |
| Phobius | 81 | 85 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 86 | 108 | 23 | - | – | |
| Phobius | 86 | 108 | 23 | - | – | |
| PRINTS | 87 | 106 | 20 | 5.3E-23 | ||
| ProSitePatterns | 92 | 117 | 26 | - | ||
| Phobius | 109 | 119 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 118 | 140 | 23 | - | – | |
| Phobius | 120 | 141 | 22 | - | – | |
| Phobius | 142 | 146 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 147 | 169 | 23 | - | – | |
| Phobius | 147 | 170 | 24 | - | – | |
| Phobius | 171 | 233 | 63 | - | – | |
| Phobius | 234 | 257 | 24 | - | – | |
| PRINTS | 244 | 254 | 11 | 5.3E-23 | ||
| Phobius | 258 | 268 | 11 | - | – | |
| Phobius | 269 | 292 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 270 | 292 | 23 | - | – | |
| ProSitePatterns | 288 | 305 | 18 | - | ||
| Phobius | 293 | 298 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 299 | 321 | 23 | - | – | |
| Phobius | 299 | 321 | 23 | - | – | |
| Phobius | 322 | 336 | 15 | - | – | |
| TMHMM | 336 | 358 | 23 | - | – | |
| Phobius | 337 | 361 | 25 | - | – | |
| PRINTS | 340 | 361 | 22 | 5.3E-23 | ||
| Phobius | 362 | 372 | 11 | - | – | |
| PRINTS | 363 | 375 | 13 | 5.3E-23 | ||
| Phobius | 373 | 393 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 378 | 397 | 20 | - | – | |
| Phobius | 394 | 404 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 402 | 424 | 23 | - | – | |
| Phobius | 405 | 424 | 20 | - | – | |
| Phobius | 425 | 459 | 35 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Molecular function | Transmembrane transporter activity | Enables the transfer of a substance, usually a specific substance or a group of related substances, from one side of a membrane to the other. | ||
| Biological process | Transmembrane transport | The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0146300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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