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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0194000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0194000.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Formin-like protein; TAIR: AT5G07740.1 actin binding protein; Swiss-Prot: sp|Q9FLQ7|FH20_ARATH Formin-like protein 20; TrEMBL-Plants: tr|K7MKY5|K7MKY5_SOYBN Formin-like protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0194000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:38357335..38400933) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCCTCATTGCCACTTGGGTAATTCAAACCACATGTTATTCATATTTCCAACAAGCATAAATCAATTCAATTATGCATACT AGCTCAGAAAAATATGAGCACATAGAACGTATATGGGTTTTGTTAGGATTCTAAATGTCTAGGGGTTAGTTTATTTTAGG ATTTTATATTTTATTTTAGGAGTTGATCTTTTATTTTGGTTGGGTTATTGTTTATATTAAAGGCATCATTCAATGGATTG AAAAAAAATGTTGATTTCGCTAAACGAAATGTGAACTCAAAGAGATCCTTAGATGTTGGATTATAGATAAATTCTTTTGG TCTATGTTAATTCAAGAACTGCTATGTGGAGGTATATTCTTATATATATTAATTATGTTTCAGTATTTTTTGGAGCTGAT GAAAGTGCCTCGAGTGGAATCAAAATTAAGAGTTTTTGCTTTCAAGATTCAGTACGGTTGTCAGGTTTGGCAGTTTGTAA TATTTTTCTGAACTTGTTGTGGATTTGATTTCTTGCTTAACATATCGTTATCCCACTTTATGCAGATTACAGAGTTTAAG AGGAGTTTAAACACGGTGAACTCTGCCTGTGAAGAGGTATTTTGCTTATGAATCTAATAAAGATTATGTTGCTTGTATTT ATTTTACCTGCATCCTCTCTGGCTATAGGTCCGCAATTCGCTAAAACTGAAGGAGATTATGAAGAAAATTCTTTATTTGG GTAATACATTAAATCAAGGAACAGCAAGGGGTATGTCTTTTCCGTGACAGCAGTGTCTTCATCTTAATTCATTTCTGGTT ATAAATTACATATACTGTGCTAGTTCTCTCTAATTTTTTTGATAACAAGTTCTCTCTAATTTTATTATTTAGATCATTAT TGGCCCTTCATCTGTGTTAGCAACAAAAGTTGTGTTTTCTAGATCTGATATAATGTAAAATGTCCTGCTAATGGGAAAAT 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CTTCCTTGGTGAAGCTCGCGGCCTTGAGGAGAGAAAATGGAGGAGTTTTGTGTTTTTTTCTCACTTGTTTGCTATATATA GAAGATGGAAATTCGCGGGAAAATGAAAGTTTCGCGAATCTGATTTTTCCGGCGTCATTCTCCGTGAATTAATATATATG TTTTGGCAAAAGAATTCCAAAACTATAAAGAGGTCTCCTTGTATTCCGGCACAACCACTTCTTTTTCCACAAAGATTAGA CAAATTAGATTCCATCACCTACATTCCAAGCCAACAAGAAATCGCAAATTGAACATCAAAGTTGGATGCAAGTGTTATAC TCTCTACTCTCAAGTGTTTGGGCTTGTGTTTAATCATGCTTAAGCAACTCTCATCATCTCATGAAAACATGCATCTATCA TAGGCTTGACAAGATTCTAACACACCAATTAAATTGAACAAATGCATACAAAGATCAAAGGACTTTTGAAGGTTGTAATG AGGCTAAGGTCAAGGAAGGATTTATGAAAGATATTCAGAGTTAAGACCTTAGGAAAAATAAGAGCAATGGGGAAAAATTC AAATTAAACTTACTCACAACCCCAAGAATTAACACATTCTTCCTTTTACAACTTCATTTTTTTCAACTTCCACTTCCTTT TCTTTCTTTAGTACCTTCCTTCACTTTGTAACTTCTCTTTTTTTATTTCTTTTTCTTTTTTGACATTTGCATATTTTTCC TTGTTTTTTCTTTCAACTTCTTTTCAGCTTGCTTACAATTTATCCTCAAGGAAGGCACCTCTTTTGAGCAACTTAGACCA TGCATTCAAATAAATCACCCCCGCACTTGTTGAATACTCATTCCCAAGTCAATTCCATAGCTCTTACATTTCCTAAGGTA AGGTGTCATCATTGTTTTTCACTTAGGCTTGTAATGAGCTACAAAAGAATGGAGATATTAGGCTCAAAGGGGCTAAAACA 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AATAAGCACGACTTTTTCAAAAATGTCTAGATTAATTAAAAGCGGCTTATGTGGAAAAATTGCTAATTTAGAACCACATT CTACATCCATCTTCTTAATTTCATCCCCTGCAAAACACTTCTTGAAATCATCCAACAACTTATTTTCTTCTTCACTATGA TAAATCTTCTCACTCTCATAAGTTCTATGTGGAAGAGGGAGATATATTTCTTGTTTGTTGTCCTCATCATTAGAATTAGC ATCAGAAGCAACATCGACTTCAAACTCATTAACATCACCAGAACCATCAGTGCTAGCATCAAGATGAGTATCAACACAAG GATTAACTTCATCATCAATCTCTGCATCAGCTTCATGTTGCAATGTGGGAGCGTGTGCAACTAGCTCGTTAACTGGAGCT TGTATATTCGCAGTATCTTGCAGGTGTTGATTAGCATTTGCATTGAGATTTGCAGACATTTGGTTCAACATGTCTTGAAT TTCTTGCAATATGGAAGGTTCCTCGTGTCGAGGTTGTTGAAACTGGGCTTGGTTTGCTTCATATTGCTTTGAAAGGTCTT CCAAAAATTGGGGTGGATCATTCCAAGGTTGATGGAATTCCTCTTGTGAATGATGTGGATCATGAAAAGGATATTGAAAT TCCTCTTGCAGGTAGTAGCATGGTGGTGCATAAATAGACTGTTGGAATTGCCCTTGTGGATGATAGCAAGGTTCACACCA AATATTTTCAAAATTCTCTTGTGGATAACATTGAGGTGACTCAAACTGTTGTTGATAGCTCTTGAGCAACATTTGTGTAA CAGAAAATTGTATCTCGTCGAGTTTGGCTTCTAGCTTATCAAGTTTAGCTTTCATCACTGCAAAAACTCCACAAACTAAC ACTTGTGATCCAATATTATCTTTTTTTTTCACCACAATAAAAAAGAAAAAAAAAACACGTTAGTAAAAAAAAGAAGAAAA AGAGTTCAACGTTAGTAAAATAAAACAAGAAAGAAATAAAGAAAACAAAAAAAAAAAAAAATTGAACGAGACCTGAAACA ATAAAAGGAAAAAAAAAGTTAGTAAAAGAAACAAATCTACTAATAATAATAAGAATAATAACTATGAAGGGAAAGGAGAC AGAAAAGATAGCAAAATAAAATAAAAGAGAGAAAAGATAGAGAAATAAGAAAGTGATAGTGATATAAAAATAAAAATAGG AAAGAGAATTAGAAGATATCAGATATGAATAAAAGATATGTGATAGATATAAAAGATATGGATATAAAATAAAAACACAA TCTAGAATCTAATAATTAAAAAAAAAATCAAGTGTGACTATAACAGCTGGTTCCTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTATTT ATTTTAATAAAAACGAAAATAAATTAAACAAAAAAGGGAAAAAAAATACTCTAAAAACAATTAATAATCACCAAAGTCCC CGGCAACGGCGCCAATTTGACGAACGCGCTGTCGCGGGTGCGTGCCAAAGTATTCTGCTTTGAATGCAGTACAAGGTGTT GAACACCAGGATCGATCTCACAAGGACTCGGTGAAGTATTAATTGATAATAGAGTAAAACAAAGCAATTAAAAATGGGGT TTGATTGATTTGATTGTAAAGTAACAAACAAAACTTAAAAGAGATTTAATCAGATAAAAGAAAGTGTTAGTCATCGGATT ATAACATTCAAGTGCAACAAACCTTCATTGGTTACAAAAGATTAATTCTTCCTTATTGTTTCCCTAATTCGTGAGAGTTG ATTAACTAAGCGAAAATCAATTCACAGTTTCCTAAACTAAGCGATTAAGAAACAGTTACGAACTAACATGAACTAAGCGA ACATGTATCAACTCTTATTTCTAAAACTACGGAATTAAGCAAACCCTAGATCAGAAAAAGAGATGAAGAGAATTAATAAA GAAGAAATTTGCATTAAGAATTGAACGTCAAGTTAGCAAACACAAGAATATTAAAAATCCTAAGACTAACTATGGAGTTT AGCAACTCATACTAGAAAAGATGGAAAGATATGAGAGGGGAGGAGGTGATGTGGTGTAATGGTGAGGTCTAACAAAAGCC TAAAATCACTTATTTATACTAATAAATAAACTTGTTCATCAAGTAACAATCTTTGTTATCTAAATCTTTTCTAAATCTTC ACAAAATCGGGCTCACATAAAGGAGTAAGCTGCTGAACAATCAGGCATTCGCGGGTCCCACAAGAAGTCTGAATCTTCAA TTGAGGTAAACATGAGAGTTGTAACTCTTTAAGTCAGCTTCGCGGGCCTTCAATCGGATCCTAATTCGGAGTTCTGTAGC CCAAGATATGATCATTTTAGTGCAGACTGTTCCAGACTCGCAGGATTAGCGACAGCAACTTTGCAAGGCCATTTTGACCA TGTTAGAGGCTTGTTCTTCAATTGTGCTCAACATGAAAGTTGTAAGGCTTCGAGTTAGCTTTCCAACGACATATTATGGG CCTTATTTCAATATTTCTAGCTCCATATTCAACCTGTTCTAGCAAAACAGTCACAGAAACTAAAAGTGTAGAATTAAGCT CTTTTCCATCAATAATCCAAATAAACACTAATGGTCAAAACATGGCTAAGTCATAACAATTAAGCACAAAAATGTATATA ATGAAGCTTAGAAAGACACATGTAAAGTGCATTAATTATGTGCTTATCAACAACCATCATCAAAGTGACGATTCCCAGGT TTTTGTTCACACTTCTCCTCATCAAATTGTTAGACAAGACACGTTTACAGATTTTTTCCCTTCTCCTGTGAGCAATTCAC ACCTTGCAACAGTGGTACAACAACAATGTTTGTTCCCTGTTTGTGAAGAAACTCCTGCTTCTGGGCCGCCAGTTGTTGTG TCTACCCCGCTAACAAGTTCTTCACATAAAAGCTCTCAACGGTGACGCCCAAAAGGTAGTAAGAACAAGCCAAAACCGTT GCCAGATGATTTTTTGGAACCTGTTCCGGGGGAGGACGGAGTGTCGACTCGTGCACAACGAACGTGGCTTTTGGGGAAGA AGCTAGGTTTGAAGCCAAGAGGGTCTGAATCCTTGATGCTTAGAGGTTTAGAGGCTCAAATACGACAAAATCATCCTCAT CTCAGATAGTGAAGATGGTGCTTTGAGTCTTGCATCATGGTGATTTCTTGCAGCGGTTTTATGCAGGACTTTAAGTGGAT GGGAGGAGGATTTTTATGCAGCATTAAAGTGGTATTGTGGATAGGCGTCGAAGATGTTATTGATTTTGGACAGCAATGGG TATGCTATTTGATTGCCCGGAAGAATTTGTTTTTCAAGGCATTGCAAAACAGTTTGCTACTCGTTGTTGTTGATTCCGGG TGTTGGGTAGTTTGTGGGTAATTTGGATCGCCAGGGGATTGTACAACTGATCTGTTTCTTTGTAGTGGCATGGGTTTTTG CAATGATACTGGTTGTGCTTAATTTGGTGTTAAATAGGGTGGTAGTTTTGAAGTGAGTGTCCAGTGTACTTGCTTGTTTG GGTATTGCAGATGTGCTGGTTTTTTTTGTAGGTTTTTCTTACCCAGTTGGAGAAGTCTCGTGGCTTGTGTGCTGGTTTAT GTGGAGAAATGGGGCTGAAATGTTGCTGGTGTGCTTTTATGTGATGGTTTGGCTGTTTTGTGTGACTAATTATGAAGACA CCAATTGCTGATTGGAGTGTGGTGGCGTGGTTGTTTTGGCAATGTTTGGGATATGGCTACAGGGGATTTTCTTGGCATTT GATGGTGGTGTTTTGTGCACATTAGAGGAATGGTTAATGCTTTGTTGTTGGTGGTTATGCACTTGGGCTGTTACAGTATG TTGTGGTGCCTTTTTAGTAAAAAATTCAAGTTTTGGTATTTAAGGATTGACACTCGCTGTTTTCAGTGTGTGATGTTTGG GTGGGCTGTGGTGTTGTTTTCTTTGTGTTGGTAGTGGCGTGCTTTGGGTTTGAGTACTCTTTTTTCTTACTAGGTTTTTT TTCCATTCGGTTTTTCCTTGTAAGGTTTTAATGAGGCTCATCCTCTCGGCTTAGCTATGCATAGGGGGTGATCTTTGGTC TTGTATGATGGTTATTCCTTACCATGAGAGGGATATTCTCATGGATTTATATCTTTCATTAATAATATCTTCTGTTTTCA AAAAAAAAATTAAAATTTATTTAATTATTTTAAATTTCCTTATTTAAAAAAAAACGAAAATAACATTTATTTCATAAAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0194000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAAGTGCCTCGAGTGGAATCAAAATTAAGAGTTTTTGCTTTCAAGATTCAGTACGGTTGTCAGATTACAGAGTTTAA GAGGAGTTTAAACACGGTGAACTCTGCCTGTGAAGAGGTCCGCAATTCGCTAAAACTGAAGGAGATTATGAAGAAAATTC TTTATTTGGGTAATACATTAAATCAAGGAACAGCAAGGGGATCTGCTGTTGGATTCAAGTTGGAAAGTCTTTTAAAGCTC ACTGATACTCGTGCTTCTAACAGTAGAATGACACTGATGCATTATCTTTGCAAGGTCCTAGCCGAAAAGTCTCCTGGACT CCTTGATTTTCACCTGGGCCTTGTTAGCTTGGAAACAGCCACTAAGGTTTTTCTTACCCAGTTGGAGAAGTCTCGTGGCT TGTGTGCTGGTTTATGTGGAGAAATGGGGCTGAAATGTTGCTGGTGTGCTTTTATGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0194000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKVPRVESKLRVFAFKIQYGCQITEFKRSLNTVNSACEEVRNSLKLKEIMKKILYLGNTLNQGTARGSAVGFKLESLLKL TDTRASNSRMTLMHYLCKVLAEKSPGLLDFHLGLVSLETATKVFLTQLEKSRGLCAGLCGEMGLKCCWCAFM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 129 | 129 | 1.0E-77 | – | |
| SUPERFAMILY | 1 | 131 | 131 | 1.83E-41 | – | |
| PANTHER | 1 | 129 | 129 | 1.0E-77 | – | |
| Pfam | 1 | 131 | 131 | 3.4E-44 | ||
| ProSiteProfiles | 1 | 152 | 152 | 29.688 | ||
| Gene3D | 1 | 138 | 138 | 3.5E-46 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0194000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…