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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0262900 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0262900.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | F-box family protein; TAIR: AT1G21760.1 F-box protein 7; Swiss-Prot: sp|Q9XI00|SKI32_ARATH F-box protein 7; TrEMBL-Plants: tr|I3SX02|I3SX02_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0262900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:64372420..64381424) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TACCTAGATCTAGAACTGAAATGCTCGGATTGAGTAGTTCTTGCCATTGAGACGAACTAATATTTGCTATATTTTAAGGG ACAAAAACATATTTATTTTTTAATCTAATTTGAAAATTATAATAACTAAATATTGTATTATATATTTTCATTTTCATTTT CAATATAGTAAAAACAACAATTTCTTAAAATATTAAAGCTTATCCAATAATGCATCGGGACGCAATTGGTGAACAATTTC ATTCTGGTGTCAAAATGGGACCAATGTCCTTGTTTCGTACCAGGTGATTAACCTTCAAACGCCGTCGTTTTAAGAGAGGC AGTTCTGTTATGCAATGGTTACCGTTTTACCTGAACAATTTCTTTCGTTCTCTTCTCTGCTTTGTTCTTCTCAATTTTCC TGAGAATTTCGTGAACGAACCTCACTCTGCATATCCGCTATGGCTTCAGGTTCAGGTAAACGTCGATTTCGTGAACCGCT TCTCTCTTCATGTTCCACAACGTTCAATTTTTGGAATTGTGTGCATCTATTCATACACTAATTGATTATTCAAAGTTAGT TTCTTTTTGATATTCTGGGTTCTGGGTATCAATTAATTTTATTGATTTTGATATGGGTTTTTTGAATTTTGGGTAAATTG TGAATTTGAGATCAGCGCTTTTGCTGAATATGCATGTATGGTAGTTTAATTTTCTGAAATTGGTTTTCCGTGAACGAGTA ATTAACCTTGAAAGTGCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATCACTGGTATGTTAATGTGCATTGAAGTGTATC TTTGTCTTTTTCTGCAGATTTCGCTTTAGCATCCTCTTCTGAACTCGAGTCAATTTTGAGGTTGAAGACTGTTGATTACT TTGTGACCAGGAGGCCATGGCTTGGTATGTGTCACGTTGCTACAATGGTTATTTTGGCATGTTTTTTCTTCTTTTATCTA TTGTTTTCTTGTATTGTATCATTTGCTTCGTTCAGATGTTTGGTCGAATTCACTTCCTATTGTTTCTAACTTTGTATGTA TTTTGTTTCAGATCTTTATGGAATTAATGTGAGACCTGTTGCACCATTTGGAAGTATAAGTAGAAAGCCTTATGTGGATT CTGCACTTATACATCGTTGCTTACCGGATGAGCTGCTCTTTGAGGTATTTCACATCATCATGTTACAATTTTTGGTCATG AGTTCTTGATAGTGAATAGAGAGACAGGATAGGAAATATAATCTGTAGGACTACTTACTATGTGCTGTATGGTTTCTACT TAAGATCAGTAATATATGATCTAAGTATTTAGGTGGTGGGACTGAATGGTTGTGTTTATGAAATGATTTTAGAACACATT AAAAACTTTTATCTCCAACACTGGAAATTTAAGAGGTCACCATTTTTATATTCTTGAAATCAAATCTTCTCTTTCTCTGA CTCTAACATGCGCACACACACCTGCCCACCACTCTTAAAACTACATGATAATAGTTTTAAAATTATTATTGGTTCTATCT ACAGCTTTGAGCACATAAACTGTCCCTAAATTAGGAACCAGAATATGGATTTGAAACTTGTATGAAACTCTCTTTTAGGC CATTTCACTGATTTTCTTGAACAAATTAGATGTGTGAAACTTCAGAAATACAAAGGTTTATAGTTATGCACAAGAACAAT CTCTCAGATAGATTTACTGATGTATATTGTAGGTCTTTGCTCGAATGACTCCATATGACATGGGGAAAGCATCTTGTGTA TGTCGAAAATGGAAGTATACAATTCGTAACCCTGTATTTTGGCGCCATGCCTGCTTGAAGGCTTGGCAGGTAAACTCAAT AGAGGTTTTGAATATGGAACTTTTACTGTGAAAATCATAATTTCTGATTATTGAGGCTTTTTATGAAGTTTTCTGGAGTG 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ATACTATAATTGCAGGTTGAAGCTGCTGTCTTGTATCCAGGCTTGCGACCTACTGTTTTGAGGATACGCTTGAGGTATTT GACAAGTTTTCCTGAATAACATGTCTTGTTGAAAATTTAAGCAAATATCTTGAACCTCGGAAGAAATCATTTATTCATGG CTTAAATAAGTTTTTGGTCCCTATCCTTTACAAAATGCTTGGTTTTCGTCCCTCGCCGGAGCAAAGGTAGGTTTTAGTCC CTAACCTTTGCCAAAACATTTGGTTTTAGTCCCTCCGAAGCTTTAGGTCAACGCCGGAGCTCCGGCGGCCCATGTGGCAT GGCCACGTGGGATTAATAAATCCGACGTGGATTTTTTTTTTCATTTAAATATATAAAAAATCACATAATTTTTTTTGAAA AAAAACACATAATTAAACTAATAAACTAATCTAATTTTTTTATTTTTTTTTGAAAAACTAATGTAATTAACACAACTAAT TCAAACTTAATTAATCTAATTAACACATCTAAATAAAACCAATTTTATGTAACAAAAAAAAACCAATTTGTAAAAAAGAA AAACCAATTCAACACCATCATTCTTAGTTTCTCAAGTTCATTCCACATTTGCTCCTCACTGTGCATTCCCTTCACAAAAC TTTTGTGTCAAACACAACACCAGGCCCTGTCACCGATCCATTCCAGCACCTCTACTCCGGCGACCACCACACGCCACCCT TCGGACCCAGGCCCCCTGCGCCGCCGCACCGACATGCGCGACCAACACCCAGACCTCGTCGTGAGCTCTGTCTCTCTGTC TCTCTCACACACACACAGTCGATGCTTAGATCTGTGGTGCCATTCAAATCGAAGATGAACCCAGATCTGTGCAAGGAGGA AAGAACAAAGCCATTCATTTAGGTTGCGGGTTCTGGGTTGCGATGGGTGGAAGTTCTGGGTTCTTCGGGGTGGGGGTTGC 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ATGACCTTGGTGTTTGACAGTTTGTTTTCGGAAATACTACCATTGTTGGTTGACGTTCATGTATCATATGTGAGACTATT TATTCTATAACATATGTACGGAGTTTGAAGGTTAAGACCTGTGTGATGCAGGAAAAGTAGCAAAGGAAGAACAATAAGTT AATAGTCAATGAAGTTAGAACTTCAAAGGATGAAGTGGAAAAATTGAATATTAGGCCAAATCCTTAGAGTTTCTGTGATG TGTTATTTGGTAGCTAAGAAATTACTACAAATTACAGTTGTTCTCGAGGATATTTTTGTAGATGGGGGTTCTGATAAGCC TAGCATCGTAACCATCCAATCACATGTCTTGAGTAAATCACACTATCCTACATCCAACTTCATTGAAAGATTACATCCTC GTCACGTGACTTTCTATATGGCTTTGGAACAGCATAATTGATTGACAAGGAAAAACAAGGAACTGGAAACAGGCAACAGA GAAAACCTAGTCTGTTCAGACAAAATAAACTGCAAAGCTGTTTAAGGTTGATCCAAAACACAGATATTGGAGGGGTTAGT TGGACTGAACCCTTTTTAGCAATTAAATTAGATTCTAGTCTCCTTGGAGAAGTAGATTAACGTCTCGATTCTCGATTCCA AGTAATTTCATATTTTCGCCATAGAGATGGCAAGAAGCAACACTACACTGACAAGATGCAATTCAACTGTTGCAGAGAGT CAGATTTGAGGAGAATATTTTGAATTACAGTACTAAGATGCAATATCACAATTTAGCCTGCATATTAGATGTTTGATGAG TACCGGCAGAGAAGCCAAGAAGAATGTGTTTGACCGCTACAAATAAAACATAAGAATAATTTCATATAAATTAGTGGGGA ACTACTCACTTGTAAATCTTGTCATACTGTTGTTCAACAAGCTTTTATGAATGTTAAATTTGATCAATTCAAATGTGGGG TTAAAAGTTTTTAATGACTGGAAGCAAGTCTACAAAGTTTCTGCCGCTCAAAAATTTAAAAAACTAGCTTATACTTCGTC GAACGTCATTTTAACAAAAAAAAAATTTAGATGTTAGTATGTACTATCTAAGTTTTATGTGCAAAATGATTATCATATGA TTTATTATTTGATTAGATTTATTAAAATTATATCCTACAAAAAGTTATTAAATGGTGCAAGTGCTCTATAATGACTTCTA GAGGAAGTGGACCATCTCATATGTAAAACATTAAATCCTGATCTGTACAATATCCTACTAGGACTATATTTGTACCACAG TTACCTTTTGTTTTTGAAATATGTCAATAAAATCACTTAAAATAGTTACATGAAAATGAGAACATCATCATTAAAATAGA AAATATAATTACAATTGATGTATACCAATTTGATGTGCACTCTAAGCTTTTTATAGTTGTGGAAGATTTGACTGCATGAG TATGACAATTCTGTACTGAAAATTGGAATATAGAAAGTAAGGTTTGTTGGATTTTGCCTTAATGCCTTTTCCTATATAAT TATAGCTACAATTAAGTGTTTTCCACTAGGTGATGTTGGTTCAGATGACACAATTCTCTGTTACGGATAGTTGATAATTT CTACTTTTATTCTGTTGAAACTATCCTATCATGGAAGTATGAGTTGAACTTACATTTTGCACTATGCTTCTATGGATCTA CCTGTGCTATAGGTTGAGGGGAACAGCTACAGGGGCTAACAATCGGATGGATTTGATCTCACTTGTCACTAGTGGTGTGA ACAGTAATGAGGCAAGTGCTCCTGAGGAGGACATTCTTGGAGTTGTTGATGGATGGCAGGATGATGAAACACACAACCCA GATGTGCCAGCAGTCTCACATAAAAGGGGCATGACTCCCTTTGTCTTTGTTCCATTTGAAGAGGTACATTTTTGTCTCCC TTTTAGTCTTTTTCTATTGGCTTTCAGGCTTCAGCTACTGAATTGTTTATCAGTCCGTAGCTTCAGTGACAATTAAACTC TCCTTCTGTGTGAATGTTGTCTTGAATGGTTTTTAAACTAACATTATAGATAATTTTTTTTCCCAGAACTCTAGATTATG CTCTACTGTTTTTTATCAACGGGGTAATGCTCATATATGGTATCATGTTTTATCATCTTCTACTAGCCTCTAGTACATTG TGTTTGGAAAAGTTATTAAAATTGATTAATTTTCTGCTTAATTGCTGTTAAAAAAAGATTAACATGTGGTAAGAGCTTCC ACTAGTTACCTTGGATGATAGATTAATATTATCGATACCTATTTCTTTTTTCTTTTTTTAAATTTCTTTTGTTTTTATCT TTTGGTTTTAGGGGAGTATGTTAACTCAAGTGATGATACCCCACTAAAGGCAAAAAGTTAATTAAGAAAGCAAAAATTCT AAGTTAATTAAGAAAAAAAAAAGAATTCTTGGGTTCCTACTGAGCTTAAAGAAATCTGAATACTTCTAAAACATTTGCTT GTGTAGGTGGAGACATCTGTTTTGAATCTGCCTGTGGAGAAGATGGATTATTATGTACCTGGTTGAGTGGTGCTTCGGAA TAAAACTGGTTCTTTTGTTGTATGTATTTCATAATAAGTTCCAATATAAGGTCATGTATTAATGTGTGTGTAATGTATGA CAGTGCGACGATGAGATTGATTCACGTTGCTGAATCATCTTTAATGTTCTGCTCTATACTGCTAGATAAATGTAAAGACA ACGCTTTGTACATAACAGGAATAATTATAATTTGTTTAAATCATGGATTTACTGGATTCAGTTTTTGAGCATGGAAAACA AGATTGTTGTCACTGGTTAGCATTTTGTTTCACACAAACCTTGTATTGATATGTAATGCCCTGAAATTTGTCACATTTTT TTGGGGTTAAATTTATTAATTCTTCACCTGTAGTTTTTTGATTAAATTTAGTAGTGTGTTGTTTTGTAGTTTGAACTTCA TTTTGACGTTTATAATCTATTTTCACGTAATTATTTTATAAGTTTACATGCCAGTTTTTTAACAAGAAAGAGGAACCGGA TGAGGTGTGCGCTCAACTTGTTTATAAGGGATGCTGATAATCATTAATGGTTATGCAACTTAATCATTAAGGGGACAGTT TGTGTTATTTTTCTTTCTGAATCTTTTGAAGTTAAATTTTCATAAGATAAATTTCCTCTTTGTCTCGTGACATAAACAGA TACTTTTGTCTATTATGATTTTACTCGCATGACAGGTATATTTTA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0262900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTCAGGTTCAGATTTCGCTTTAGCATCCTCTTCTGAACTCGAGTCAATTTTGAGGTTGAAGACTGTTGATTACTT TGTGACCAGGAGGCCATGGCTTGATCTTTATGGAATTAATGTGAGACCTGTTGCACCATTTGGAAGTATAAGTAGAAAGC CTTATGTGGATTCTGCACTTATACATCGTTGCTTACCGGATGAGCTGCTCTTTGAGGTCTTTGCTCGAATGACTCCATAT GACATGGGGAAAGCATCTTGTGTATGTCGAAAATGGAAGTATACAATTCGTAACCCTGTATTTTGGCGCCATGCCTGCTT GAAGGCTTGGCAGTTTTCTGGAGTGGTAGAAAACTATAAGATACTTCAGTCTAAATATGATGGCTCATGGCGGAAAATGT GGCTCTTACGACCAAGGTTGAGAACTGATGGTCTTTATGTGAGTAGAAATACCTACATTCGAGCCGGAGTTGCGGAGTGG AAAATCACTAATCCAGTTCATGTGGTTTGCTATTTTCGGTACATTAGATTTTTTCCTTCTGGGCGATTTCTTTACAAGAA TTCTTCTCAAAAGGTCAAGGATGTAGTGAAGTGCATGAACTTCCGATCATCTAAAGCAGAATGTGTTTTCGGTGGGAACT ACACATTGTCAGATGATAAGGTTGAAGCTGCTGTCTTGTATCCAGGCTTGCGACCTACTGTTTTGAGGATACGCTTGAGG TTGAGGGGAACAGCTACAGGGGCTAACAATCGGATGGATTTGATCTCACTTGTCACTAGTGGTGTGAACAGTAATGAGGC AAGTGCTCCTGAGGAGGACATTCTTGGAGTTGTTGATGGATGGCAGGATGATGAAACACACAACCCAGATGTGCCAGCAG TCTCACATAAAAGGGGCATGACTCCCTTTGTCTTTGTTCCATTTGAAGAGGTGGAGACATCTGTTTTGAATCTGCCTGTG GAGAAGATGGATTATTATGTACCTGGTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0262900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASGSDFALASSSELESILRLKTVDYFVTRRPWLDLYGINVRPVAPFGSISRKPYVDSALIHRCLPDELLFEVFARMTPY DMGKASCVCRKWKYTIRNPVFWRHACLKAWQFSGVVENYKILQSKYDGSWRKMWLLRPRLRTDGLYVSRNTYIRAGVAEW KITNPVHVVCYFRYIRFFPSGRFLYKNSSQKVKDVVKCMNFRSSKAECVFGGNYTLSDDKVEAAVLYPGLRPTVLRIRLR LRGTATGANNRMDLISLVTSGVNSNEASAPEEDILGVVDGWQDDETHNPDVPAVSHKRGMTPFVFVPFEEVETSVLNLPV EKMDYYVPG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 10 | 310 | 301 | 1.1E-86 | – | |
| PANTHER | 10 | 310 | 301 | 1.1E-86 | – | |
| Gene3D | 52 | 143 | 92 | 5.1E-12 | – | |
| ProSiteProfiles | 59 | 105 | 47 | 11.273 | ||
| Pfam | 63 | 108 | 46 | 8.1E-10 | ||
| SUPERFAMILY | 63 | 141 | 79 | 1.3E-16 | ||
| SMART | 65 | 105 | 41 | 1.7E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0262900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…