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LotjaGi1g1v0263200.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0263200
Transcript ID LotjaGi1g1v0263200.2
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description BTB/POZ domain-containing protein; TAIR: AT1G21780.1 BTB/POZ domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9XHZ8|Y1178_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At1g21780; TrEMBL-Plants: tr|I1KAC4|I1KAC4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0263200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:64479064..64504718) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTATCTCTTTCTTCTCTCTGTATTTACTTGTTCACTCTTTATTCATAAGAGTTCAGTCCCATTTGAAAATGCTGTAGGCA CACACAGAGTCCAACTTCAACCTCGTAGCTTCAGTCCTTCACTTTCTCCTCAGCCATGGTTGATGATAGGGTGGATACAA TTGGCCGATTAGCACAGTGGAAAGTCGACAACCTAGGACCTTCTTCCTGCAAAAAATCTGAACCGTTCAAGGTCGGACTC TGGAACTGGTACGTATCCCATTTTGAAGAATGTTATTTGAATGAGCTCGAAATCTTCAATTTGGTACCTTTTCCCTCTTT GATTCGCAGGTGCTTTTTGATAATAAGGAATCATCACCTCTTCATACATCTCTATCCAGAACCTTCTAGGGCTTCTAAGG AAAACCCACCTCATGCTCGAATTGTTCTTCGAATTTCCAATGCTGGGGTTGGTTCATCCCGCAAGTTTCACATTTCTCCT GGTATGATCTCCAATACCTGATAGATACCCTTCTTCTGTTTTGATCTTGTATTTTGTTTTTACTTTTTGAATTCACTTTT TATGTGGCTGATATTGGATGTATGCTCATTTTATTTGTAGAAATGGGGCAAAGGCATAAGCTTTTTTTGAAGCACAATTG AAAAGGTTTTGTTTTTTTTAATTGGGTGTGTTTTGGGTTTTAGGATTGGTTTGGTCAATGGTTATCTTTCTCATGGAGAT GATTCTGGCTATTGAGGGTCTGGGTTTCTAACTGTGAAATTTCTTTTTTCACATTTGTGCCTACTGCCTACATGTAAACT GACAAGAATTTTAGGTCAACCCTCCTGCCCTGCCCCCCATGAATTCAAGTTTGCAACTAAAGATTGTAAATAAAGAAGTT TGGCATTGCGATTACTTATAGCAGTTTGAAGGTTTATTATGATGTGCTGACACAGATTGTGCATTCGTTTCTGTTTGCTT 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AAAAAAAACAAAAATAGAAGGTACACGAAGGAGATGAAGCAATCAGGGGATGAAGAAGGGAACATAAGCAATTAAGCACA GCAAATTAGGAAGGAAACAAAAACAAAGAAGAAGGGGATGAAAGCAAATCATGAAGGAAGAAGGAAATGAAAAAAAAAAA AAAAAACAAACGCAGAGGAGAAGGTTACCCACGAGCCCACGAACGAAGGAGATGAGACACGCAGCGGCGACGCGAGCGGC GGCGCGAGACAGAGGCGCGGGCGGCGGCGCGAGACAGAGGCGCGGGCGGCGGCGCGAGGTTGAGAAGTATCCTTGAGTGA GGAAGAACGAAAGCAGAGGAGAGGACTGAGGAGAACGCAGGGAAGATAGAACGCAGAAGGTATAAAATTAGGTTTAGAAT TTGGGGATTTTTTAACTTAAAAAAAAAAAAAAAACCTTGACTCGGTGACTCGGTCCTGACTCGCGAGTCAACCGAGTCAG ACCGAGTCTGACCGAGTTTTGACCAAAAACGAGTCTGACAGCGAGTCGACTCGTTTTTCCTATGTAGACTCGCGAGTCTA CCGAGTCAGCGAGTTAACTCGCGAGTCTGACAACATTGGCCAAAGGTACACATAAATTTAGATACTTTCCCCAGAATATA AAAAGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGTTGCAATTTAGAAACAAACATTGCTGTTAATTGTGAGAAATTTTCAATATCTTTGT TGATTGCCTTTGCGAACAAGGAGTACTCTTGGCAGGTGACAATTGTCATCCTCAAATTTAGAATACAGATTAAACAATAT AAATGAGAACAATCAAATAGAACGTGGGTTTTAAGACCCGTTATCATAAATTTTGTACTCAAGCTAAAAATAATAGAAAT TAGAAAATCAACAGAAAGTAATAGCATACAAACAAAGAAAGTTGCAATGAAGAACTCAACAAATCAAACAGTTTTCTATA CCAAATATATCTTATACCATTCTAGAAGTTGGGGCTTTACGTCACAATCCTATTATATATCTAGTATTTGATCGCAATGA AGAAAATATAATCAGTTAGAAGTGCATGGAAGAATGCCTACATATCTAGAATTTCAATTATGAACGTGGAACCACGAAGC TTAAGAGTACACTCAAAGGGCAAAAGTTATGAACTAAAAAGAGAAAAAGAAAAAGCAACTCAAAAATATAGTATATTAAG AAAGCAAGTTGAAATGAACAACTCAACAAATCACATTAGTTTTCAATACCAATGCTAGAGTGAACATTAACCTTTTCAAA GTAACTACTGAAGAAGAAAAGGTTTGCTACTGCTTGATGTCTAGCATGCAAGGAAAGTGTCAAAGATGTGAAGTTTAAAT ATCCATGCCACTAGAGGAAGTACATCTGTTCATATCCACATTCATTAGACGAAATATCCATGCCACTAGAGGAAGTACAT ATGTTCATATCCACATTCATTAGACGAAACATGTTCATTCACACATAAGAACTTAAGGAGAAAAGGAACAGGTACACCTG CGAGACCTAAAGTCAGACTAAATAACCAATCATGCGAAGTATCTATTTACATGGGAAGAAAAATCCCATCATATAACAAA AGACAGGAAAAAAATCTTTCTTTTCCCCCCTTTTCTAATGAAGATGAAAGTTGCAGATTATCAACCACAACAGATCAATA TGAAGCTAATAAAATGCAAAGAATAAGAATGATGGCTGAACAAGGAGCAGTCAGCAGTATGTATAATACAATAACCTGCA TATAGCAGTTTAAACATCATCATCAATCCTGCAGTGTGACTTCACCACGTTCTATCTCTTTAATTCTGGACAATAGCTTA TCAGAACTAAGACTAGTGCATTTATATCCTGAGAGCCATCTGCAGACCTCTTGAAAAAGGAAAATATCTGCCAGAAAGTT GAATGCCTATATTATAATAAGGGGAAGATTGAACGACTACAGTTGCTTTTCTTACCAACTTCTTCTCCACTGTCTTCTAT CTTTGCGGGACTTTTCTGTTCGGTAGTCCACAAATGTGAAGGCAGGAGGGTCTTTTGTGATGGCAATTCAGCTATGAATA GAAGAGTTTGAGCCCAACCAGCATATTTACCATACTTAGTAACAAATGCCTCTGCAACACGATTACAGAGCTTTGGTGTC AACGAGGAACCTGCAAGCTCAGGTAAGATATACCTTTTGGCAATCTTCCCCAAGTTCCAAAATAATACATACAAATTAGC ATTTAACACTATAGAGTAATCAAATACAAAAATCTACTATATATGAGAATCAATAACGCGTGAAAATTAACTTTTTTGCA CAAACGAATTAAATTAACATAAGAGAAATTACAAACAAGAGGATCAGAAATCCTCTAAAGCTACAATGTATGTTGTACCC TCCAAAGGATAACATAAATCCACCCTTTTGCAGTCATCTTTCCCTCTTATACATCCAAATATGTTCACTGTATTGTACAT CTTAACACCCCACTCTATTACAAAAATGGGTTAAGTTGATATGCTTGCTGCATACTGTAACTATATCCAGCAAAGACCAT CAAAAGTTCAAAACAGAACTGCCAAAAGATCTTGATATGACAAGTTTCAACTAAAGGCAAGTGCTGATGAAAGGTAAAGA ACCTACCTTCCACACATGGGTGTCAACAGGAACGGCATGGTGTTGATCAAGTGAGAACAGAGCTATGCAAGCAGCAACTT TAGGACCCACTCCAGGTAGCGTAGAAAGGGCAGATATAACATCTTGAAGATCCAATTTACGAAGAGAACGAAGCCACTCT TCCCCTCCCTCAGGTTTCGATTGCAAAGCATTCACCGTGCCAATTATATACTTAGCCCTAGTAAAAAAACAATCACATTC ACAAATGTAATCGAAATAGTTAGTCATGACAATAAACAAATATCAGTACAGCTATCGAGCCAATTTAGATAAACTTGTCA GAAAATCACTCAAAAGAAAAGAAAACCTGAAATGATATATAATAAGAGAAATGTTGGGAATTCACTCTCTAACCCACTTT TTCCAACACATTCTTTCCTAATAGTTAAATTCATGTGGACCAACTAATAATGCGTTTTTACAATAAAAATTGTGTGTAGT TTTACAAAAGCTACTTATTTGAAGCTTAACTTTCAGGCAATTCTATTGCATAAGCGATTCTAGATCTCTTTTCCAACAAC AACAACAAAAGCCTTATCCCACTAAGTGAGGTCAGCTGGATCATACTACGCCATTGAGCTCGATCATGCACTAAATCACA TGAGTCTCACTTTCAATTTGGCGGGTCTCAATCCCACTCTAAGTTTGGTGGGATTCAAATGAATTCCAACTAATGAGTCA TAAACATCTATAAATCATAACCAACCAACCAATAAATGAATGTGTTGCTTTGCTAGCATTACTCTCTTATAAGTTATAAT AGTTACTATCTATAAACACCTACATATATCCAAAAGAAACAGAGCCATAGACCATAGTGATAGGGGTATGGAATGAACCT GTAACCAAAACCAGCATCTCTAAGCTGTTGCTCTGAGACCAATGAAAGCTGCTCCAAAGTAGGAAAAGCATGGAAGTGAA AATCACCAACTGGACCCAAGTAACTCCCAAGAGAGGAAACGTAATCAACCATCTTTGTAATCCTCCCAATGTTGTTGTTG GAAGAACACAGGAACTGAATCAAGCACTCAAAAGGGTCTTGCCTGAGCACCCGAGCACCACCCAAATGGCGAGCCAACTC GGCGAACCGGGCATCGGAATCCGAGAACACCTTCCACATATCAGCGAGCGAAACGCCGGCGTTGAGGAAGTCGAGCAAGG CCGTTCTGGCATCGGAGTGGGAACCGTCATCGGAGCGGGAGTGAAGGCAGTAGCAGACGTCGCCGTTTTGGAGATGCTTG AGGGATAGGAGGTGGTGGGAGCCGACGACGCCGGTGTACTGCAGAGGGGCGGTGTTTTTCCAGCGGAAGGTTTGGCCGGT GGGGAAGGTGAGCGGCAGTGAGAGCTCTTCGCGGGTCAGGTTCAGAGGGACCCAGTCGCGGGATTTTGCGGCGGTTTTGG AGTGGCGGGCTTGGGTTTGTGGCGTTGGAGGGGTGGAGGGAGGCGGTTTTGGGGATTGTCTTTTTCTCTTCATCACCGGC GGCGGCACTTGGATGGCTCGCAATCGCAAATTCAATGAATTCATTCCACGTTCTGATGTTTTGGGAGTAACTTAAACCAC CAATACATCTATCTACACACACCATCCCTCTTTTCAAAAAACCTAAACTACCCCTGACTTTAAATCTTTTTCACCATATC CCTTCTTGCTGCTTGCTCTAGTGGCGCCATACTTTCAAACTAGATAACGCATGGGTTTATTTATATGGAAATGCTAACTT ACTCTCACTTAATTTTATGAATGAGTAATTTTTAATTAATACTTAAATTTTCTCTCTCCTATTTATTACTCTTCTTTCCC ATTCTCTTTCTTCTCCTTTTCCATAGAACCTCAATCACTCTTTCTATGTAGGAGTTAATGGAACTTTTTGTCATGAATTT TTCCAAAACGGCGTTACATGGCGTTTTGCTTCATGCAATTTGGTATAATTTTTTCAGTTTCAATTTGTCTAAATTGAACC ATTGCCCCTTATTTACCATCCCATTCTCTGATATCCATTTTTCCTCTGCAAAAACAATCCAACCACTGCCCCTTTTCCCT CACGACCTTTGCCGCCATGCCCATGATGACTACCGTCAAAATGAAGGTTTCACTCTGCCTCTTATGAATTTATGAAAGCA CATCAAAGAGGAAGCAATAAAGAACAGTGGTGAGGAATTTTACCCTCTGAAATTGGGGAAGTTGAAGACAAAGAAAGGTT GAACAATGTGATAAATGCAGAGAGAGAAAAATTGAGTTTTTAAATTAAATAAATTTGGAGGGATGACAAAATTACAAAGG TGACCCTCACTTTAATGACTTTTAAAAACAAAAGGTCGGTTAATTTGTCCTAAATGAAAATGTGTAGGTTGCTAACTTAC TCCTTCATGAAATGAAATCAAGTGGGAGTAAGTTAGCATTCCCCTATATGTATTAATATTAATTTTTATACTTTTTAATA TTAAAATAATTTTGACATTTAAAATTATATAATTCATAAATTTTAAAATATAAATTACATCCTAAAATATTTTCTTTCCT TAAGTCATTTTATTAATATGGGGATGTCTTTCTTATATGAGAATGATAAGAAAGATTTTGAGTCATTAGATTAAAATAAA CGAATTAGATTAAAAGACTCATTTAAGTGAGTCACGTGCAGGTGCTTTCTCTCCTTTTCCTAATCCTAATTCCCTGTTTT CTTAATCTTCCCTTGTTCTGGAAAAGATTTCCACCTCACGCTCCCTTGTTCGTCGAGCAACGCCGCACCGCCCACCACCT CCCCTTTCTTTGAGTTGCTCCGTGCTCGTTCATCGGAGGTTGTATCGCATCAATCGTTTAAAAAGTGCCAGAGCTAATTC AATTTCTATGCAAACCCCTGTTCATATCCTCACGTGTACCATTCTATTTTTCCACGTCTATAAAGATCAAATCTGACCAG CATCCAAGTTGAATTGCAGTCCCTGTAATGTTGTGGGGATCTTGTGTTTCTCTTCAATTTGAATTTGTGCTCCAATGGAT CTTAAATTATACAAATAAATGGGTAGAAAAGAAGAAAATGACACAAATAACTAGATAGATCTGAAATTGTTTTTATTTTC CTGAAGAAGGGGATTAGGAATAGTAGGAAAAGGAGAGAAAGCACCGTCACGTGACTCACTTAAATGAGTCAGTTAATCTA CTCCGTTTATTTTGATCTAATGACTCAAAAATTTTCTTATCATTCTCATATAAAAAAGATTTTCTCATAAGATACATCCC CTATATATATATATCAAATTAATTTTGTATTAAAAAAAATTAATTTATATTTATTTATGCATTTAATTTTTTTAATACTG TGCACATAATAAGAATTAAAAGTATATAACATATGTTTACCAAAAAGTATATAACATATAATCTATATCTATATACTATA GAAAAGAAGAACTCTGTGAGACCCACTTAAATGAGTTGACACTTCCAAGTTCACTCTCACCCACCCTCCTCTTTAGCTGA CAAGTGTCAAGCTCTAATTCATTTTAACTAATTTATGGCCAGATTAATTTCTCCTTGATTTTAGTTTTATGTCCAATCAT TGTCAAACATTCAAATAATCTTAAAATAACTTATTAATTGTTGTTTAATGATTTTTTAAACCGTTCATTAATGCTGAATC AAAAATCTCCATTCATCACAAATTACTTATGGAATAATCATTCAAAATATTATTCTATTTCATATATTTTTTTTAAACTA TCCTTTAATGCTAAAAACGGATTTTGGCTTTCGTTATACGATTTTTAATATTCCC 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0263200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTTGATGATAGGGTGGATACAATTGGCCGATTAGCACAGTGGAAAGTCGACAACCTAGGACCTTCTTCCTGCAAAAA ATCTGAACCGTTCAAGGTCGGACTCTGGAACTGGTGCTTTTTGATAATAAGGAATCATCACCTCTTCATACATCTCTATC CAGAACCTTCTAGGGCTTCTAAGGAAAACCCACCTCATGCTCGAATTGTTCTTCGAATTTCCAATGCTGGGGTTGGTTCA TCCCGCAAGTTTCACATTTCTCCTGTTCAGGAAAAGCTGATTAAGACTGAAGATGACTTTGTTTGGACGGTTGATACTGC TCCCGTTGGCCGCTTCATTATTGATGTTGAGTTTCTAGACCTGAAGATATGCACTATGAAAGGTGAAGAAGCTAGTTCTA TATGGCCATCTGATGGAAATTTGCTATCCGTTGCAGCTCAAAGTAGTTCTCTTCATTGCCTCGCTCACATGTTTGATGAG GCCATACACGCTGACCTAACCATTATCACGGCTGACGGTACATTTAGAGCTCACAAGGCAGTTCGGTCGGCAAGTTCTCC TGTGTTCCAAAGCATGTTTCATCACGACCTGAAGGAAAAAGAGTCATCTACAATCCATATAGAAGACATGTCACTCGAAT CCTGCAAGGCTCTAATCAGCTACTTTTACGGAACAATTAAACAAGAAGATTTTTGGAAACACCGGCTTCCATTGCTCGCA GCAGCTAATAAATATGACATTGGAGGTTTGAAAGGTTGCTGTGAGGAAAGCCTTCTTGAAGATCTTAACTCAGGAAATGT TCTTCAGATGCTAAGTGAGGCTTGGTTTTATCAATTACATAAGTTAAAGAAAGAGTGTATGGTGTTCTTGTTTGAATTTG GTAAAATATATGATGTTAGTGGTGATGAAATGAATACCTTCTTCCAGCATGCAGATAAGGAGTTAATCGTGGAGATGTTT CAGGAGATGCTTACAATTCCGAACCCGGTAGATGAAACTTCAATTCACATAGGAAGAGGAAATCAGTATGGATGGAAGAT GATTGTTGGAGCTAACTTGAGTTGGCAAAGCTGGTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0263200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVDDRVDTIGRLAQWKVDNLGPSSCKKSEPFKVGLWNWCFLIIRNHHLFIHLYPEPSRASKENPPHARIVLRISNAGVGS SRKFHISPVQEKLIKTEDDFVWTVDTAPVGRFIIDVEFLDLKICTMKGEEASSIWPSDGNLLSVAAQSSSLHCLAHMFDE AIHADLTIITADGTFRAHKAVRSASSPVFQSMFHHDLKEKESSTIHIEDMSLESCKALISYFYGTIKQEDFWKHRLPLLA AANKYDIGGLKGCCEESLLEDLNSGNVLQMLSEAWFYQLHKLKKECMVFLFEFGKIYDVSGDEMNTFFQHADKELIVEMF QEMLTIPNPVDETSIHIGRGNQYGWKMIVGANLSWQSW 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 3 330 328 3.5E-174
PANTHER 3 330 328 3.5E-174
Gene3D 139 291 153 2.5E-34
SUPERFAMILY 148 260 113 3.53E-21
CDD 154 267 114 3.0729E-20
Pfam 156 260 105 9.1E-20
SMART 164 262 99 5.7E-16
ProSiteProfiles 164 223 60 15.39

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0263200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…