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LotjaGi1g1v0278200.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0278200
Transcript ID LotjaGi1g1v0278200.2
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Kinesin-like protein; TAIR: AT3G12020.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|F4J8L3|KN7K_ARATH Kinesin-like protein KIN-7K, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|K7MYH6|K7MYH6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0278200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:68101719..68120385) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGGGCATCCCATCACCATCGCTTCCAAGTCAAGGTAAGCCAAATAGCAACCTTCCATATTAATGCAAAACTGCTGCTATT GCTAAAAGATTATGCACTAATTTAATTTAATTTTTCTCCCTTTCTTCTCTGACTGAACTCTCTGACTCACACTTTCCCTT CTTCTCTTCCGGATCTATCCCAACACGATCTCCTCCAAAATGCACCTCTCATTCTGATTCTGATTCTGATTCTCTCCCTT TTAGGTCAATTTAAATCTTCCATTCTCATCTCATTTTCGCATCAATTTGCTTCTCCTTACGCTACCATTCACGCATTTTC CACTTTCTTTACCTAACCTCACCTCGCTTTGTTCCTTTACTCTTTCGATTTTCACTCTCAATTGAAATGACACTGCAATT TCTGTTGAATTTTGAAGGCTGAGTGTTAATGGCGTCGAAACAAGGACCGAAATCGAGGCGGTGCGGATCGACCAGCGGCG GCGGCGGAGTAAGAGGCGCTGCTGCGAATTCCCATTCCTCGTCGACAACTTCGAGTTCTAAGCAGTTTCAGGATGTCTCC GGTGGCGACGGTCAGAGCTCGCCGGCGTCTTCGTCTGCTCGGAGCAAGCCGCCGCAGCAGCATTTTTACCCGGAGGCTGA GCAGAGAACTAAAGAGAATGTCACTGTGACGGTTAGGTTTCGGCCTTTGAAGTAAGTGCGTTGTGGGTTGTGGTGTTTTT GTGTGGTTGTGTTCTTTGGATGTGGGTTAATTTGATTGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGCAGTCCAAGGGAGATTCG TCAAGGCGAGGAGATTGCTTGGTATGCGGACGGGGACACCATTGTGCGGAATGAGTATAACCCTTCCATTGCATATGCAT ACGGTACAATGTGCAAAACTCAAATTTCTATATAGGATTTTTTTGGGAGGGTGAAGTGTATATTATGAGTATAGTGCTTT 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ACTAGAGGGAGTTTGCAGTTCGATGGTTTTGACTTTTAATGGGATCTTGTAATGGTGGCTTCTGAGTTAATCCATTATTG CAATTTATTTACTTATATTAGGAGTGGCTTGAGGGAGAGGTGTGTAAAGGTTGTGTTGTTTGCAGGAAAGTGTGCTTTTC TCTTCCCCCTCCATCATTGTCCTTCTTGGTTCATAGCTCCTGTTTCCCCATTTGTACATCCACAAGTAATAGTCCTTCTT CTCCAGTTCTTCCAAATGTTATGCTAATTTAGTCCCCTTTTTTCCGGTACAGCTGATTTGGTTGGCAGATTGAGGGATAA CATTTAATATATGCTTAGAAAGTATCCCGTGAACCCAAAAAAAAAAAAACTTATAGCTTCAAATGTGTAATAAAAATGAA TTTGCGTTTGAGTTAATCCCTTTAACC 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0278200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCGTCGAAACAAGGACCGAAATCGAGGCGGTGCGGATCGACCAGCGGCGGCGGCGGAGTAAGAGGCGCTGCTGCGAA TTCCCATTCCTCGTCGACAACTTCGAGTTCTAAGCAGTTTCAGGATGTCTCCGGTGGCGACGGTCAGAGCTCGCCGGCGT CTTCGTCTGCTCGGAGCAAGCCGCCGCAGCAGCATTTTTACCCGGAGGCTGAGCAGAGAACTAAAGAGAATGTCACTGTG ACGGTTAGGTTTCGGCCTTTGAATCCAAGGGAGATTCGTCAAGGCGAGGAGATTGCTTGGTATGCGGACGGGGACACCAT TGTGCGGAATGAGTATAACCCTTCCATTGCATATGCATACGATCGTGTATTTGGTCCCACAACCACAACTCGTCATGTGT ATGATGTTGCTGCTCAGAATGTCGTTAGTGGTGCTATGGAGGGCATCAATGGTACAGTCTTTGCCTATGGGGTAACAAGC AGTGGGAAGACTCATACAATGCATGGTGATCAAAGATCTCCTGGAATCATACCACTTGCTGTGAAGGATGCTTTTAGCAT TATCCAAGAGACACCAAACCGAGAGTTTCTCCTTCAAGTTTCATACTTGGAAATCTACAATGAGGTGGTTAATGACTTAT TAAATCCAGCAGGGCAGAACTTAAGAGTCAGAGAGGATGCTCAGGGAACCTTTGTTGAGGGAATAAAGGAAGAAGTTGTA CTCTCCCCTGCTCATGCCCTGTCCCTTATTGCAGCTGGAGAAGAGCACAGGCATGTTGGGTCCACAAACTTCAATGTACT CAGCAGCAGGAGCCATACGATATTTACCCTGACCATAGAGAGTAGTCCGTGTGGTGAAAATAGTGAAGGAGAAGCAGTAA CACTGTCACAACTGAATCTCATCGATCTAGCAGGTTCTGAGAGCTCTAAAGCTGAAACAACTGGCATGAGAAGGAGAGAA GGATCTTATATTAATAAAAGTCTTCTAACTCTTGGAACTGTTATTTCAAAATTGACTGAAGATAGAGCTAGTCACATACC TTATAGGGACTCCAAATTGACTAGAATACTTCAGTCTTCACTCAGTGGTCATGGACGTGTATCTCTCATTTGCACAGTAA CTCCTTCATCAAGTAGCACTGAAGAGACACATAATACATTGAAATTTGCTCACCGGGCAAAGCACATTGAGATACAAGCA GCACAAAACAAGATAATTGATGAGAAGTCACTTATCAAGAAATACCAGCAAGAGATTCAATGCTTGAAGGAAGAGTTGGA GCAATTAAAGAGGGGAATTGTCACCGTTCAGCCAAAAGATACTGGGGATGATGACATAGAGCTTCTAAAACAAAAGTTAG AAGATGGTCAAGTTAAGCTGCAATCCAGATTGGAACAAGAAGAAGAAGCTAAAGCTGCTTTGTTAGGCAGAATTCAACGG TTGACTAAGTTGATTTTAGTCTCCACAAAAGCATCACAGTCAACGAGATTTTCCAACAGGCCTGGCTCTCGTAGAAGACA TTCCTTTGGGGAAGAAGAGCTGGCATACCTTCCATACAAAAGGCGGGATTTAATATTAGACGAGGAAAATATTGATTTGT ATGTTAACCTGGAAGGTAATGCTGCAACATCTGATGATTCTTTTAAGGAGGAGAAAAAGACAAAGAAACATGGACTTCTA AATTGGTTGAAGTTGCGTAAACGAGATAGTTCCTTGATAGGATCTAGTGATAAATCTAGTGGAGCGAAATCTACTAGCAC ACCTTCTACACCTCAAGCAGAAAGTGGTAATAATGTTGGGTCAAGACTTTCCCATTCTCTACCTGCAGAAAGCTCTCCAT CTGCTGATCATATATCAGAGGCAATAGAGGATAAAGATCTTCATGAGGATAGTTTATTGGGACAAGAGACACCTTTGACA AGCACCAAATCAGTTGATCAGATTGATCTTCTAAGGGAACAGCATAAGATTTTATCTGGAGAAATGGCACTTCATTCAAG TGCTTTGAAGAGGCTGTCTGAGGAAGCAGCAAGAAATCCTCAGAATGGTCAGATTCATGTGGAGATGAAAAGGTTGAAAG ATGAAATTAAGTCGAAGAATGAACAAATAGATTTGCTGGAAAAGCGAATTTCTAGTCACTCCTTTGCTTCAGATAAGACA GATCAATCCGGAGTATCACATACTGTTGCTGAGCTGATAGCACAATTAAATGAGAAGTCTTTTGAACTTGAGGTCAAAGC AGCAGACAACCGTATAATTCAAGAACAGCTTAATCAGAAGATCTGTGAATTTGAAAGCCTGCAAGAAACAGTTGCCTCTT TCAAACAGCAACTTGCAGATGCATTAGAGTTAAGAAATTTCAATCCTGTAGACAATCATTTACAGCATTCCTCTGTAACC AACAACTATCATGGTGAACTTCACCTTGACAAGGGAAACATAAGCAACGCCAATGAAGGGATTCTTTTGCAGTCACAGAT AAGTGAGATAGAAGAGCTGAATCAGAAGGTAGCAGAACTAACAGAATCAAAGGAGCAGCTAGAGATTAGGAATCGGAAAC TGGCAGAAGAGAGTACATATGCTAAAGGGCTAGCTTCAGCTGCTGCTGTTGAGCTTAAGGCACTATCAGAAGAAGTTGCC AAACTCATGAACCATAACGAGAAACTAGCTGCGGAGCTAGCTGCGTCCAAGAATTCACCCACACAACGTAGAACTAGTGG AACAATCCAAAATGGGCGAAGGGAAAGTCATGTCAAACCTAGACGAAATGATCAGGGTGGATCAAACTCGGATACCAAGA GAGAATTGGCCTTGAGTAAAGAAAGGGAACAGTCATATGAAGCTGCTCTTTTAGAAAAAAATCAGAAAGAGGCCGAACTT CAAAGAAAGGTTGAGGAGTCAAAGCAAAGGGAAGCATACCTGGAAAATGAACTTGCCAACATGTGGGTTCTTGTGGCAAA GCTAAAAAAGTCACACGGAGCTGAAACTGATGTTTCAGGGTCGACTAGAGGGAGTTTGCAGTTCGATGGTTTTGACTTTT AA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0278200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MASKQGPKSRRCGSTSGGGGVRGAAANSHSSSTTSSSKQFQDVSGGDGQSSPASSSARSKPPQQHFYPEAEQRTKENVTV TVRFRPLNPREIRQGEEIAWYADGDTIVRNEYNPSIAYAYDRVFGPTTTTRHVYDVAAQNVVSGAMEGINGTVFAYGVTS SGKTHTMHGDQRSPGIIPLAVKDAFSIIQETPNREFLLQVSYLEIYNEVVNDLLNPAGQNLRVREDAQGTFVEGIKEEVV LSPAHALSLIAAGEEHRHVGSTNFNVLSSRSHTIFTLTIESSPCGENSEGEAVTLSQLNLIDLAGSESSKAETTGMRRRE GSYINKSLLTLGTVISKLTEDRASHIPYRDSKLTRILQSSLSGHGRVSLICTVTPSSSSTEETHNTLKFAHRAKHIEIQA AQNKIIDEKSLIKKYQQEIQCLKEELEQLKRGIVTVQPKDTGDDDIELLKQKLEDGQVKLQSRLEQEEEAKAALLGRIQR LTKLILVSTKASQSTRFSNRPGSRRRHSFGEEELAYLPYKRRDLILDEENIDLYVNLEGNAATSDDSFKEEKKTKKHGLL NWLKLRKRDSSLIGSSDKSSGAKSTSTPSTPQAESGNNVGSRLSHSLPAESSPSADHISEAIEDKDLHEDSLLGQETPLT STKSVDQIDLLREQHKILSGEMALHSSALKRLSEEAARNPQNGQIHVEMKRLKDEIKSKNEQIDLLEKRISSHSFASDKT DQSGVSHTVAELIAQLNEKSFELEVKAADNRIIQEQLNQKICEFESLQETVASFKQQLADALELRNFNPVDNHLQHSSVT NNYHGELHLDKGNISNANEGILLQSQISEIEELNQKVAELTESKEQLEIRNRKLAEESTYAKGLASAAAVELKALSEEVA KLMNHNEKLAAELAASKNSPTQRRTSGTIQNGRRESHVKPRRNDQGGSNSDTKRELALSKEREQSYEAALLEKNQKEAEL QRKVEESKQREAYLENELANMWVLVAKLKKSHGAETDVSGSTRGSLQFDGFDF 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 77 77 -
MobiDBLite 25 62 38 -
PANTHER 57 1001 945 0.0
PANTHER 57 1001 945 0.0
Gene3D 68 427 360 5.0E-123
SMART 75 404 330 6.5E-136
ProSiteProfiles 77 396 320 109.75
SUPERFAMILY 77 431 355 4.2E-111
CDD 77 396 320 1.2574E-180
Pfam 83 396 314 1.0E-104
PRINTS 148 169 22 1.3E-31
PRINTS 262 279 18 1.3E-31
ProSitePatterns 296 307 12 -
PRINTS 297 315 19 1.3E-31
PRINTS 346 367 22 1.3E-31
Coils 398 432 35 -
Coils 450 484 35 -
MobiDBLite 572 616 45 -
MobiDBLite 574 613 40 -
Coils 682 709 28 -
Coils 764 784 21 -
Coils 823 857 35 -
Coils 872 899 28 -
MobiDBLite 893 943 51 -
MobiDBLite 895 913 19 -
MobiDBLite 914 943 30 -
Coils 946 977 32 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Microtubule motor activity Catalysis of movement along a microtubule, coupled to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate (usually ATP).
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Microtubule-based movement A microtubule-based process that results in the movement of organelles, other microtubules, or other cellular components. Examples include motor-driven movement along microtubules and movement driven by polymerization or depolymerization of microtubules.
Molecular function Microtubule binding Interacting selectively and non-covalently with microtubules, filaments composed of tubulin monomers.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0278200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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