Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0313100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0313100.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class; TAIR: AT5G41980.1 nuclease; Swiss-Prot: sp|Q9M2U3|ALPL_ARATH Protein ALP1-like; TrEMBL-Plants: tr|A5BND9|A5BND9_VITVI Putative uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0313100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:75730811..75737523) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTTTTTGGTGTTTGGCTTTGAGGTACCCCTAGTACCTCTTCATATATATTATACTTTTGCATACCAAAAAAAAACTCAA AGATATGACATCTAACTTTGTGAAATTGGACAAGTTTGATGGAGACAATTTTAACCGATGGTAGAAAAAGATGCAATTCC TCCTTACAACCTTGAAAGTGGTGTATGTTCTGAACACCACAAGACCATTAGAGAAGGACAATGAAACCATGACTGAAACA AGAGGAAGATCAAATGGGATCAATCACACATATGAATAGAGGTTAGTACCCACAACCTTTCTAACTTGTGAAGACTATAA ATTCTTAAGACTCATCTTCTACATGCTTTAGTATGATTAAGTTTACATGTGATATCATAGCATGTGTTAGAGAATTGGTA GTTTTCCTTTAATGGTGATTTTGAACCATGGATAATGTCTTGAAATTTCTATTAATGTTTTTGAGAACTTAAGTATATTG ATTTTCTGCTGCATGAGATTATGTGATTGCTGCAATATAAAATTATTAATGTTCATGTTTGAATTTGTTTGATTTTCATT CCTTATACATGAATGAATGATGTTATGATATTAGAGTTAATTGTTTATATCATAAGAACACATAATTTTTTATGATTTCT GCTGCATAATTGCAAAATGAATTGAGTTGTAATGATTGACATCATCTATGTGATGTACATCAGTTGATGATATTTATTGT CATAAATTTACTGAAAATCTACTGTGATAGTGATGTTTTGGAAATGGACTCAAATATGGGTAATAAAACTTGAAAACTAG TAGATCTTCTACCAGGACCCAAACCAATAGGTTGTAAATGGATTTTTAAAAGGAAAATGAAAGTTGATGGCACTATTGAT AAATTTAAGACTAGACTTATTGCTAAAGAATTTACACAAAATTAAGGTATTGATTATTTTGATACTTATGCACCTGTTGC AAGAATTGCATCAATTAGAGTGCTATGGGCACTAGCTTCCATTTATAAATATGCAATTCATCAAATGGATTTTAAAACTG CTTTCCTAAACGGAGAGTTGGATGAAGAGGTGTATATGAAACAACCTGAAGGGTTTGTTACCAAAGGACAAGAACATAAA ATGTGTAAATTGACTAAGTCGTTATATTCGTTAAAACAAGCACCCAAACAATGGCACAAAAAGTTTGCTTAAGTTGTGCT TGCTAATGGATATAAAATAAATAAATCTGAAAAATGAATAGTAAATTTCAAAATGGAAAAGATGTTATGATTTGTTTATA TGTGTATGATATATTAATCTTTGAGACTAATTTAAATGATGTAGAAAAGACTAAATCTTTCCTATCCAAAAGTTCTGATA TGAAAGATCAAGGTGAAACAGATATGATTTTAGGAATTAAAATCATAAGAGATGGTGAGAGTATTGGTTTATCCCAATCT CACAATATTGAGAAAGTACTTAAGAAATTTGATCATTTTGATTGCAAATCAGTTTCTGCCCCTTTTGATCAAAATACTAA TTTACAACCACATAAGGGATGTCCTATAGCACAACTTGAATATTCAAAGGCAATCAGATGTTTAATGTATGTCATGACCT GAACTAGACCTGATATTGCATATGTTGTTGTTAGGTTAAGTCGATATACATGTAATCCAAGTAAAGATCATTGGCATGCT GTTAATAGAGTATTGAAATACTTGAAAGGGACAATTGATTATAGTTTGACCTATAATGGTTATCATTCAGTTTTGGAGGG ATATACAGATGTCAGTTGGGTAACTTATGTAGAAGATCATGCTTCCACTAGTGGATGGAACTTCAACCTTTGTGGAGGTG CAGTTTCTTGGGGTTCAAACAAACAAATTTGCATTGCCGACTCCACCATGGCTGCAGAGTTTATTGCTCTTGCTACAGGT AGTAAAAAGGATGAATGGCTAAGGAATTTATTATATGAGATGCCTATTTGGCCAAAACCAATGGCACCAGTATCCATACA TTGTGATAGTCAGTCCACACTATCAAAAGCATACCGCCAAGTATGTAGTCGAAAATCCAGGCATATTGGTTTAAGGCATA GCTATATGAAGGATTTAATTTCAAATGGAGTAATCTCCATAGTGTTCGTAAGAACTAAAAAGAATCTTGCAGATCCGTTG ACGAAAGGTCTGACAAAGGACATGATGTTGAAGACATCATTGGAGATGGGTCTCAAGCCTATATCTAATTGATCACCAAT AGTGGAAACCCAACTCACAATTAAGAAAAAATATTTTTTGAGTTCAATGATGAAAGTACACTCTAAGAATAAAGTAGTAG GATGAAGTTTTTCTTCTTAATAGACATATAACATATATTTGTTGGAATGCATAATTATGGGCGCATTTCTGATATAGTCT ACCTATATGATAATGAAGTGGGGCCGCTTCATGGAATTAAAGAGCTTGACTCTTAAATTCTCATTAAAAGATATGTGACA CAAGACCTTATTGAATGAGTCAAATCTAAAATTCTTTTGATAATACCGAGATTTCATGTCATCATGTGTAAGTTATGCAC ACTTGTTCTATTAAATAGTTGGTTCAAAACTTGTCTACCAATGTCTATTCGGGACAAGTGAAACTCATTATCTTACTACG TAATGGTTCAAATCGTAAGATACCATTATTGAAATCATGATATTTTCAGAAATATGGATTAAGTTATATTTTGTAAATGG TGGGGGATTATAAGAAATATTTCCAAAATATATAAACTTGGAATATGCAGTGTATTATTGATTATGTAAATTAATGTTCG AAACTTTATTAATATCTTGAGATGGTCTAGTGGTTGGTAACTCTTTATGCTACCTACATGTATTGGGTTCAAATCCTACC CGTTGGTGGTGAACATGAGATACTGGGGCACGAAATTGAGATCATCAAAACTAATTTCTCTCTTATTTACATTATTCTAA ATCATCATCCGCGGCGAATTGAACCTAAAGGTTAGTGTGCATACACGCTTTGAATCTTCAAGTGCTTCTGTCATCAACAT CCTCATCAGTCCAAGTGTTGCAGCATCTCCCCAACAGATTATTTCCCAACACAACCAATATTCTATTGATTTCGTCTCCA ACAGATTATTTCCCAACACAACTTATATTCTATTGATTTCGTCTCCAACTTAGCAATGTGATACTTCCTTTATATATGTT CAACACTCACTCTCAAGTTCAAGGCTTGTACTCAAGCGGGAACCTCATTGACCGTCGTTTTTATTTTTGGCTTATACTCC TTCAGAAGCTGAGTTTCAGGTCCCATAACTTTTCCCTTTTGTTGATATATTTTTCCTTAATGTTATAAATTATTGTAACA TTTCTATGTGACCCTGTTGGGTTCAGCTCTATATTTATTTTTATCCCTCAATCCTGATTCTATACATTATAACAATAATT TTATATATCATTTTCTCTCCTTATCTCTCTCCATATCCTGATTCTATCAGAACCTACCTGGCTGAACTTTCATCTAAATT TACCCAGATGGATCATGAATAGAGACATACCAAGACATAGGGCCCGTTTGGTGCACCGTATTAGGCCTGATTGTATAAGC TAATACAATACGTTATGGGCTTATCAAGTGTTTGGTGCTTACATCGTATTGGATTATTTTATCCATCAATCCTTCTAATA CATCAAAATGATGGATAATTTAATCCATCATCTAAAGGGAGGATAAGGCCTGATAAGTTTTGATGTATTAGCTACTTAAA AATATTCCAACCCTACCCTAGCCCCATTCATCTCGTAATCGCTCATCATGTTCTCCATCGACGTTCCTCTTCTGGCTTCT GTCACGTTCCTCTTCTAGCTTCCTCTCTTTGACGACTTGATTCATCTTCTTCCTCTTCTTTCTCCTCCATTATCAAGTAA GTTATTTTTCTCCATGGATATTTTACAATTTCTCACCTTATAATCTCTTCTGTTTTCTTTCATCGTTTACATCATCCTTG TTATGAAAATTGTTAATTTTCTTATATTGAAAATTGTTTGAGTAGTTTCTTTGTGTGGGATTTTGTTGGGTAAAATTCAT ATGTTGTGATGCCTCTGTGCATCGAGGGGGCAGTGGGGTGCCTATGTCCAATTCATATGTGGTTGATATTGTCTTCATAG AGGGGAATCTCTGTGGGTGTATGGTGATTAGAATTGTCTGGCTTAAATCAGTTTATGTCATATGTGCTGTGTTTATGCAG GTGGGATTTGTGTGTTTATGCAGTTTATTTTGTCAATTTAGTATGAGGATAATTCATTGAAATTTGCGTCTGTTATATGA CTTATATCTATAGTACTTTTGGCCTAAAACTTGACAATATCAATTCATTGAAATTTGACTAAAACATGTTAACTACTTCA CTCAAAGTCAGATTAAAATGAAAAGAGAAAGTGTCCACTGTACAAATCTACCTCAAATAATCTAAGTTAGTTGGTTTTAC TGGTAGTTGAGTTTACTAGTTTTTGTTTGGGTTGTCAATTGGTGTGAGATCGGTGGTTCGTGCGTGCTGGGGGGAGGGGG TGATATGTTTTATTGGAGGCTTTTGTGTCTTGTGTGGGGTGTTATGTTTTTGCAATTGTTTTGAAGTGTATGCTTGTTTT TTGTACTGTGTCTCTGCAATTGTTGTTATATTGTGTTATGTTTTTACCAAAATATACCTAGAACAAAATTAAGAGTTTGT AGTTGCTTGTGTTGTCCACTCAGAAGAAAGAAAGGTTAATAAGGAATTTTAATCAGTTAACTCTTTGCTTTATTAGTAAA TTTTAATCATTTAAGTTTTAAAGTTAAGAGTTAACTCTGCTTTATCCTATTTGTTTTGATCAGTTGTGTTTAGGGAGGTG TGGCATGAGAAAATTTAATATATGTTTTTTCTTATAAAAACCTAAGTTGCGATTTAGATTGTTAAATTATTTCTGAATTA AAGTATTTGTAGTTCAAATCTATAAATTACTTTGACAAGTATGATAAAAATTTGTTTCTATATATTGATTAAAGTATGAT CCTATGGAATAACTTGTATAGAATCAAAATTGTTTATGTATATAGCTTTTTAGATAATATTTTAAATTTTTTAAATTTTA GGTGAAATGGATCCTAGTAAAGGTTCTGGTCCAAATCAGTGGTTAAATGACCCTAATGAGTGGCTTAATAGTACAAGTGA GCTTCTCAATGCCTTGTCAACTTGTTTGATAATGGAACAAGCTTTTTTGGAGAAGACGATTGTATGTATTCTATCATACC TACAATTATGTCAGGTGGCTAAAAGGCAATATGAGAGGCTCCAAGAGAGACATACAATACCAAGGGTAAGAGAAGAATCA AGAGTGTCATTCATGAGTAGGCTAATAAATGATGATGTTACTTGTGTGGAACAGCTACGGATGGATACCAACACATTTCG TGTGTTGTGTTCTCTTCTACAAGTTCAGGGTAGGCTAAAGGAAGATGGGTTAGTGCCAATAGAAGAACAAGTTGCGATGT TTCTACACATATTGGCTCACCATGCTAAAAATCGTGTCATAAAATTTAAATTCCAAAGATCTGGAGAAACTGTTAGCAGA TACTTCAATTTAGTGTTAAGTTCTGTCTTAAGGTTGCAAAAGAATTTACTTAAAACACCAGATCCGATTCCTGAGGATTG CATTGACAATAGATGGAAATGGTTTAAGGTATGAATTACATTAGAGATATTTTTTCTTATTAATTATCATATCCTTTCTA CATATATAACTAAGATTTAACATTATTAAAAGGAGTTTCCTTATGTATTTTAGGGTTGTCTGGGGGCACTAGATGGAACT TATATTCGTATTAATGTCTCTGAGGTTGATAAACCAAGATATAGAAGTCGGAAAGGTGAAATTGCAACAAATGTCTTAGG AGTATGCTCACGAGACATGCAATTTATATATGTGCTACCAGGTTGGGAGGGTTCAGCTTCAGATGCTAGGGTGTTGCGTG ACGCAGTTAATAGGAGAAATGGTCTTAAGGTTCCTACAGGTACTAATATAATAACTACTAATATAATAACTGCATTCAAA TTCAATATTTTAATAAAATAAAATTAAATATTTAATTTATTTGTTATTGAAATAGGAAACTACTACTTGGTAGATGGTGG GTATACAAATGGAGAAGGGTTTCTTGCCCCTTATAGAGGAAGTCGATACCATCTTAGTGAGTGGAGACATCAACGTGTTC CAACAAATCCTAGAGAACTGTTCAACAAGCGACATGCTCAAGCTAGAAATGTGATAGAAAGAACATTTGGATTGCTGAAG ATGCGTTGGGCAATTCTCAGAAGTCCTAGCTACTCTGTTAAAACTCATAACCGAATAATTATTGCATGTTGCTTATTGCA TAATTTTATTAGGAGAGAAATGTCTGTAGATCCATTAGAAACAGAGTTGGAGAACATGCCTACCACTGAAGAGGTAGATG AACAACCACATGATAACATTGAAACTATTGAACCAAGTGCAGCTTGGACTGCATGGAGAGACGCTTTGGCAAATGAAATG TATAATGATTGGGTTAATCCTTGAGGCCACTTGTAGTGATTTTATGTCTGTTGAGTTTGTTTGATACACCTTGAAGTGAT GGTGTTTTCATTGAATTTGGAATTTTTTTTTATGGAACTTTCATTCAATTTGCTATGGATATATAAAATTTCC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0313100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGATCAATCACACATATGAATAGAGGTGAAATGGATCCTAGTAAAGGTTCTGGTCCAAATCAGTGGTTAAATGACCC TAATGAGTGGCTTAATAGTACAAGTGAGCTTCTCAATGCCTTGTCAACTTGTTTGATAATGGAACAAGCTTTTTTGGAGA AGACGATTGTATGTATTCTATCATACCTACAATTATGTCAGGTGGCTAAAAGGCAATATGAGAGGCTCCAAGAGAGACAT ACAATACCAAGGGTAAGAGAAGAATCAAGAGTGTCATTCATGAGTAGGCTAATAAATGATGATGTTACTTGTGTGGAACA GCTACGGATGGATACCAACACATTTCGTGTGTTGTGTTCTCTTCTACAAGTTCAGGGTAGGCTAAAGGAAGATGGGTTAG TGCCAATAGAAGAACAAGTTGCGATGTTTCTACACATATTGGCTCACCATGCTAAAAATCGTGTCATAAAATTTAAATTC CAAAGATCTGGAGAAACTGTTAGCAGATACTTCAATTTAGTGTTAAGTTCTGTCTTAAGGTTGCAAAAGAATTTACTTAA AACACCAGATCCGATTCCTGAGGATTGCATTGACAATAGATGGAAATGGTTTAAGGGTTGTCTGGGGGCACTAGATGGAA CTTATATTCGTATTAATGTCTCTGAGGTTGATAAACCAAGATATAGAAGTCGGAAAGGTGAAATTGCAACAAATGTCTTA GGAGTATGCTCACGAGACATGCAATTTATATATGTGCTACCAGGTTGGGAGGGTTCAGCTTCAGATGCTAGGGTGTTGCG TGACGCAGTTAATAGGAGAAATGGTCTTAAGGTTCCTACAGGAAACTACTACTTGGTAGATGGTGGGTATACAAATGGAG AAGGGTTTCTTGCCCCTTATAGAGGAAGTCGATACCATCTTAGTGAGTGGAGACATCAACGTGTTCCAACAAATCCTAGA GAACTGTTCAACAAGCGACATGCTCAAGCTAGAAATGTGATAGAAAGAACATTTGGATTGCTGAAGATGCGTTGGGCAAT TCTCAGAAGTCCTAGCTACTCTGTTAAAACTCATAACCGAATAATTATTGCATGTTGCTTATTGCATAATTTTATTAGGA GAGAAATGTCTGTAGATCCATTAGAAACAGAGTTGGAGAACATGCCTACCACTGAAGAGGTAGATGAACAACCACATGAT AACATTGAAACTATTGAACCAAGTGCAGCTTGGACTGCATGGAGAGACGCTTTGGCAAATGAAATGTATAATGATTGGGT TAATCCTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0313100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGSITHMNRGEMDPSKGSGPNQWLNDPNEWLNSTSELLNALSTCLIMEQAFLEKTIVCILSYLQLCQVAKRQYERLQERH TIPRVREESRVSFMSRLINDDVTCVEQLRMDTNTFRVLCSLLQVQGRLKEDGLVPIEEQVAMFLHILAHHAKNRVIKFKF QRSGETVSRYFNLVLSSVLRLQKNLLKTPDPIPEDCIDNRWKWFKGCLGALDGTYIRINVSEVDKPRYRSRKGEIATNVL GVCSRDMQFIYVLPGWEGSASDARVLRDAVNRRNGLKVPTGNYYLVDGGYTNGEGFLAPYRGSRYHLSEWRHQRVPTNPR ELFNKRHAQARNVIERTFGLLKMRWAILRSPSYSVKTHNRIIIACCLLHNFIRREMSVDPLETELENMPTTEEVDEQPHD NIETIEPSAAWTAWRDALANEMYNDWVNP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| Coils | 59 | 79 | 21 | - | – | |
| PANTHER | 95 | 387 | 293 | 1.0E-112 | – | |
| PANTHER | 95 | 387 | 293 | 1.0E-112 | – | |
| Pfam | 211 | 370 | 160 | 4.2E-27 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0313100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…