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LotjaGi1g1v0402800.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0402800
Transcript ID LotjaGi1g1v0402800.2
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description F-box protein family; TAIR: AT3G06240.1 F-box family protein; Swiss-Prot: sp|Q8GXC7|FBK50_ARATH F-box/kelch-repeat protein At3g06240; TrEMBL-Plants: tr|I3S190|I3S190_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0402800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:89173182..89201867) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AAAAGGGTGGGGCGCGCAGCCCCATAGGGGAGGCCCCAAACCCAACTCCCCATAACTCCAAATTGAAATGAAGGAAAACT CCTCCAATTTCACACAAGCCCAAAATCTATCTGAAAATTCATCATACGTTGCTTCCGTCGAAACCTGTTAACTCCCTCTC GACGCCGCCGCCGCCGCCAGAATACTTCGTCAAAAGCAGCGTCGAAACCCACGCTTACCCCTCCGATGGCCTCCCCGAGT TCAGCCCGTGCCTGCCTCTCAGTTAGCGACGCGCCGCCTTACTCTGTCCGTTCATCCATGTCCTCTGACGGTGCGAGTCC GCCGGAAGCCGCGTCTGTGTCTACCATCGAGGTAAATCATTTGATCGATCACAGTTGTAATTTGTAAACCCTAAACCCAA ACAACAATTGCTATTGCTACTGTATCTATCTATCAATCTCACTTTGTGAATTCAATTCAATTCAGATTCAGATTCAAACA CTGCATATTGACATGGATCGAGATTTGATAATTGAAATCCTTTTGAGGTTGCCGGTGAAGTCTATTGTACGATTCAAGGC TGTGTGCAAGTTATGGAGATCTCTCATATCCGATCCCCTATTTGCATCATTACATTTTCAACGTGCTGCTCCTTCACTCC TTTTCGCTGACTCTCATGCCATTCGAACCATTGACTTAGAGGGACCGCTTCAATCTCATCGTGTTTCTCAACCAATCAAT TGTCACTTTTTGTCTAATTATCATGATTTATCCTTGCCTCGTAACTGTATTTCGATTCACGGTTCGTGTAGAGGCTTTCT GCTAATCACCTGGATTAGGAATATTGGTCGTCGGCACCCGTGGAATGATAGTCTCTACCTGTGGAATCCATCCACACATG TCCACAAACCAATACCATCATCTCCTGTTGTTGACACCAATGTTTTTAGTCATCTATTTGGATTTGGTTACGATTCCTCG 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GAACCATGAGGTGAATCAGGAAGGGGGGAGTATAATGCTATTTACACTTACAATGTCAATTTTGGACTAAGATTGGATTA CTAGGCTCATATTTTGGTGAAGTACTTTTATGCTTTAAGAAGTAATCACTTGCTTGCACCTTGCAGTATTTATGTTCTCT TTCATTTTTCTTATATTAATATTGAATCTCAGGTTGGATAGAGTGGGATGGCGAGAGGATTGAGTTTGAAAATGCCCCAT CTTATTCAGAAAAGAACTGGGGCGGAGGATTCCCAAGAAAGTGGTTTTGGGTAAGTAATATTTTTATTCATGAAAGTATA TCTTCTAAAGTTCATTAGCACATCAATTCCCTAGTTTGCTATGAATCTTAAGCCGTTGCTGATTGTATGCAATCAATTGC AAACCTTGTCTATTGAAAATTATGGTTAGAATGTTTTATTTCTTCAACATTATGTTTTATACTTCTAGAAAAATCAATTG TCTGTTAACAAGCTATAGACAGCAAGCACATAAGTCATGCTTCATTAGGCCTTGGAGACTGCAGGAGATGGAGTCCTTTT GTATTGTTATATTGAGATTCAATTATTCTCACCTTTGTTTGGATCAGTGCCTGTGCTTTTATATTTTTATGCATCTCAAA TTGTTAATGTTTCATGCAGGTTCAATGTAATGTTTTTGAAGGTGAGGGTGCTAGTGGAGAAATTGCACTTACAGCTGCTG GTGGATTGAGGCAAATTCCTGGGATAACCGAGACCTTCGAAAATGCTGCACTGGTACCTTCATGAAGCATTTGGCTATAA ATTTGATTCATTTCATAAATTTATTACACCAGGAAATAAATTTAAGACTACCTTTGAAATAAATGGTGCTAGTCATGGGA ATGACAAAAGGACCAGGACATATAACTAATTTGATTTCTCTTTTTGCCAAAATAACTGTTTCTGCTCTTGCTAGTTGTTC TCTTTGATAAAGACAAACTCTTGGGTGAGGATAAATACAGTCTTTTAATATCTTAAAATTTGTGCATAAATTGTATTACT GATACTTTACGGAAACATTTGTCCGCTGCTTAAAATCATAAGTGATGAAAAGAGTGATGTTAATATTTTGTATGAAGTGG TTTAATTAGATTGGTATTTCTTCTGAAATGTTCTAATTTGTATATCTAATGGTAGATGGTGCTTTCTTTCGTTTCACGTT GTGGTTATAAAATAAAAAAAGAATTTATGTTCTTCTTGTAAGATTTTTTGGGGTCTATTTGCCATCTTCTGTTGTTCACT GCATGCCATTAATCGTCCTCCTCTTGTTGTTATTATTATTATGATTGACTTTTCTTAATTTTTACTATGTTGCCAACTGG TGCAGATTGGAGTTCATTATGGTGGAAAATTTTATGAATTTGTGCCATGGAATGGTTTTGTTAACTGGGAAGTCACACCT TGGGGTTATTGGTTTATGTCTGCAGACAATGGCAGTTATCTGGTAATTATATCTTTCTAATCACGTTTTGTTTTTGCTGG TGGCCAAAAGCAATGTTGCATACACACATACACACGTGTTGTGGGTGGGGCATTATAGTTTTGCATCTCATTTGAACTTA TCAATATATAAACTATGGAGGCCTATTTGTTTTTAGAAAAAGTTTTAGTTTTCATTTCCAGTTTTTACTTTTAACTACTT TTTTTCACTTTGTTTCAAATTTCCTCAACAAAACTGAAAAAAAGAAAATGGAAACAAGGTGAAATTTTTATAATTAAAAT TAAGAGTATGAAATAAAAATAGAAATAGAACCCAAACAAATCCTAAATTTATGCTTTGTGCAACATAGTTGAACTTCTCA ATGCAGGAGAAAAATAATAATTTGATGGGACTTCTTTTGGCAAATGACATGAGTGTGTTTGTATTTACGTTCAAGTTGGT CAAAAACTCATTCACTCCAACGACACAAGAGACATGACACATTTTAACTGCCTTGTAATGTACGCTGACAGAAATCCGAA CACACTATTGTGGCAGGTTGAATTAGAAGCAAAAACAGATGATCCCGGTACTCCATTGCGTGCGCCAACATCAGAAGCAG GCCTTTCACAAGCTTGTAAAGACACATGTTTCGGAATTCTTACATTGAAAATATGGGAACGAAGATATGATGGCAGCAAG GGGAAGGTGACTTGTTATTCGCACACATAAATTGTTCTTACATTATGTTTAATGGAACATGTTAATGAAATGTTTGGTAA ATGGCAGATCATATTGGACGTTTCAAGTGACATGGCAGCTCTAGAAGTTGGAGGAGGTCCATGGTTCAGCACTTGGAAAG GCAAGACGACAATGCCACCGGTCATTGGCCCTGCTCTTGGATTACCCGTAGACCTAGATGGCATTTTTAATGCGGTTCCT CTGTTTAAACCACCTGGTTTGTGATCAATTGGTTTATATCTTTCTTTCAGTTTGATTTGAAGTTTGTATAAACTCTCTCT TATAGCATGTTTGGTTTCATGGGTGGAATGATCCATAATCACCTCTAGTTAGAAGCCATAAGTTTTTGTAGTTTGTAAGT AATCATATATAAATTATGTCAACTTGTGAAGCCAAACAGCATTTAGTGAAGGCAGGTATTCAGAGAAAAGTTTAATGTTT ATATATAGAAAGATCAAAATGAAAAGAATTATCTGTTTACAATAAGTTTTATTAATATAAAAGATCAAAAATTAAGTAGA AAAAAAAGGAAATTAAGAAAGTAATAATAATAATAAGTCCCTTAACAAGAGGTTCTCTAACTCAGCGTCCGAAGCATCAA AACACTCGAACTCTAGACAACTCGAACTCTAGACAACGCACCACATGTACCAAGCTTCATGAGCATGTCCGCTGCAATGT TGCAACCCCTGTCAGATCCTGTTAGTGACAATTGTTCAACCCATGGTCAGTAGTGTCGGAATATCAAGCCTTTGATCAAC ACAGTCAAACTTCCTTCTGGACAACCTTCCTTGTATATAAAATTTTAACTATGTCTATGATAAAAAAACCCCTCAGATAT TTATTTAATCATAAATAGTTGTTAAAATTTATAATTTTTTATAACCATAAATTAAACAATAGAAGTAAGTGAATACAACT CGTGCGACACATGGTGAAAATATAATAAACATGAGTCGCATCGCCTTTGAAAATACGGTACCGCCCATAAGATTCGGTCA ATAGAAAACTCCTCAAAAAAATTTGGTTCATTTAGTATATAGTATTTGGGATTTGGGAATGATTTATATCTCATCCCACA TGGCATTAAGGAATCTCAACGTGTTTGGAATGAGTTAAATTAAAATGTGATTCTATGGCTTTATTTTACTTTAGGCCACA CCAGCAGAGACAACAATTGCAGCTTGTGCTTTTGATTAGTAGAAGCTGATCTCCTTGAACATCTAATCCTTATTGAGAGA AATCTATTTACTTAATGTGATTTTTAAACCTTAAGAGGATTAGACTCATAACTAACTTTGTATTGTAGTTACCTAATTGG GTATAGTATTTTACCGATTGAAATTTGATTCAAATTCATATCTTTTGTTATATAAGGATATATAAAATTATTGTACTATA AATTTATCCAGCTGTGTTTCAGATATGCCACATGTTTCACGAAATAAATAATTAGAGAGAGAGGGGTTCCACCATATCAT CACTTTTGAGCTAACTCGATCCACATTTGATAATCTCTTGGTCAATGAGCTAAAATGGTATTTGCAATTGAACTAATTTG CTAAAACTTCGGGTAAAAAATGTAATATTTTATATATCATCTAAAGTTTTGGTCCTTAATGACATGTGATATATTTAACA TGAGATGAAATGTAATGGTTAGTTAATGAGTTTTGATTCGTTTACTATATTATTTTTACAGCAAATATCTGCATTTCGTG GTGATTTATGACCGTCACAAACTACAATTAACCGGTGTACACAAATTGTTTTTTTAATTGTTATATCAAAAGGATGGTGC GTTGTATCCAATTATATGCGGTCCCTTTTTTTTTTTGTATAAATTCCAACCAGCAATAGGTCCTCCATTTCTCAAGTCCC CACCTCCCTCTCTCCCTCTTCCTCTCCCTCTCTGTTGGGCGTGTTGTGTGTTTGGGTGGATAAAGATGGCAGGTGGTAGG AGAATCTTGTCCATGTTTCTTGTGTCATTTATGTAGATTAATGCCCAATATGCATTTGTAAGTTGTACTTTGACACCACA AGTGCAAAGAAAAATTGCTAGAGCCAATCAAAAGGGACCTTATCTTGGTCTGATCATACCAAATACTTTTGAATTAGACC CTCTTCTTCAGAATTCAGACTACACTCCAAGTAAACTCACCATAGACTTTGCTGGTAAGTGCCATGTAATTTGACTATAT TATTAATACACTTACGATCCTAATTATGAGTACGACAAAAGCTATTACATCAATTATTGACACTTTCCATTTTTACAATT TTTTAATGAAGGAAGGAGATTTCGATTTGGAGCCATTGGCCACAAGCCTGTTATATTGGTCATAACGGGAATGGGCATGA TACACTTTTCTCATTTTCTCATTTTAGGCTATGATTAGACTCGTTAGTACGAACTTTTAGGGTTTTGAGAGCTTTTGTAA GGTTTCTCCTGGAAATTTTAGGTGCTATATTTTCTTTCTCTTGAATTCTTGATTATGGCCATGCTTAACTAAACTTCTTT TAGTACTTGGGTTGTGAATCCGTTTTGAACTATGTTTTGATTTGAATCTTTACTTATATGAGTTCTCTTTTCCAATCTTC GTAATTGAATCAATTTATATTGTTTATTCTTAAGTGCACGCAAGGAACTTGCTAACTTCTATGAGAACGGAAGTTGATTA GGAGTTAGGGTAATAATGATTCGATTCGATTAGGCGTTCCCTACTGCTTGATTCAAGAGTAGAACCTAGTTGCGTTGGTT AGTTTAATTAGGACTTAATCTTCAGTTCTCTGGTCTAGGTGCTCGTAAAACAGACTTAGTATTTGAATTGGAAGTCTAGG GCGTGTGAGTTGTCAACAACCTGGAATAAAGGCTAGATCGCCGAAGAGAGGTTTATTGAGTTCATATAAATATTGTTAAA ATTGAAGCGTAGGACAAATAGGTAAAACATACCCGGGTGCTATTTTTCCCAACTGAATTCTCAAATCTATTTAATTTTCC GTGTTACTTATTGCGTACAACATCACTACTTCTAAAATCTGAAATTGGTTTTTACTTTTATAAATCTAAATAAGAGAATT AATAGAAATTATTATTGAATCACAATCCTTGAGGGATCGATAATTTATTACTACGGGTAACTTTGTACACTTGCAAATGA GCTATCAGATAACAGGAACTCCAAATCCCACTTTCCACCCTATGTTATCTTGTATATAGACGACAAGTCGACAACACTTA AACCTAGCAGCGATGACACGGACACAACAGCATAGTACCAGCTGAGGTAGCTCTCTTTGATTACTGCATCTTTGTCCCTT TTACTTAACTGGTCTACACAAAAGGCTAACAAAGATGATCTTATGCCTCCCGCTCCAATGGACATTAGGGCAAAAGAAGA ATGCAAGATCAGAAGTTGTATAGTTGTAGGGGAACTGCAACTGTTGGCAAATTGGTTACACATTGGCCTTGATGTTGGAA ATAGAGTTGTTAGCTATAGAAGAACCATTCCATGCACAATCCCACTGTTAAAAATATAATATAAAAACCATTCATAAAGC TTAAGCTCTTTGAATAATTAGTTCTTAATATGGAATCAGAGTCTGTATATATGATCAAGTGGTCTAGAGTACGATTTTGA CATGATATCAGACTATCAGACTCTCTATGATCAAAGTGGTCTAGAATAGGAACCCAAAAGTTGAATTTCAGCACAAGGTA AGCGAGTATGTACATTATCCACGCTTCAAGCTAGTTGGCTTGCATGAGGGAGCGTGTTATAAAGAATGCATTGTTGGGCA TCTAAGTATATTATTAATGTAGGATGCACAGTCAAAGTATTGAAAACAATATAAGAATTGTCCCTAAGTGAGCTCAAAAT TGAAAACAAAATAACTTGCATTCTGCTCCCCATAACTCCAAATTGAAATGAAGGAAAACTCCTCCAATTTCACACAAGCC CAAAATCTATCTGAAAATTCATCATACGTTGCTTCCGTCGAAACCTGTTAACTCCCTCTCGACGCCGCCGCCGCCGCCGC CGCCAGAATACTTCGTCAAAAGCAGCGTCGAAACCCACGCTTACCCCTCCGATGGCCTCCCCGAGTTCAGCCCGTGCCTG CCTCTCAGTTAGCGACGCGCCGCCTTACTCTGTCCGTTCATCCATGTCCTCTGACGGTGCGAGTCCGCCGGAAGCCGCGT CTGTGTCTACCATCGAGGTAAATCATTTGATCGATCACAGTTGTAATTTGTAAACCCTAAACCCAAACAACAATTGCTAT TGCTACTGTATCTATCTATCAATCTCACTTTGTGAATTCAATTCAATTCAGATTCAGATTCAAACACTGCATATTGACAT GGATCGAGATTTGATAATTGAAATCCTTTTGAGGTTGCCGGTGAAGTCTATTGTACGATTCAAGGCTGTGTGCAAGTTAT GGAGATCTCTCATATCCGATCCCCTCTTTGCATCATTACATTTTCAACGTGCTGCTCCTTCACTCCTTTTCGCTGACTCT CATGCCATTCGAACCATTGACTTAGAGGGACCGCTTCAATCTCATCGTGTTTCTCAACCAATCAATTGTCACTTTTTGTC TAATTATCATGATTTATCCTTGCCTCGTAACTGTATTTCGATTCACGGTTCGTGTAGAGGCTTTCTGCTAATCACCTGGA TTAGGAATATTGGTCGTCGGCACCCGTGGAATGATAGTCTCTACCTGTGGAATCCATCCACACATGTCCACAAACCAATA CTTTCATCTCCCGTTGTTGACACCAATGTTTTTGATCATCTATATGGATTTGGTTACCATTCCTCGACAGATGACTACTT GGTGGTTCGAGTGCCCGTTACGGACAGTCGCCAACCTACTCATTTACCAGATGTGCAGTTTTTCTCATTGAGAGCTAATA TGTGGAAATATGCCGAGGGTGTTGATTTGCCTCCCTTGACCACTATTTTTACTAGTACTGGGTTGCTCTTTAACGAGGCC ATTCACTGGGTGGTTACTAACTGGGTCGATGGTGTTACGACCATGTTTATTATTGCCTTTGATTTAATGGAAAAGAGACT CTTAGAGATACCCATGCCTCATGGTCTTCTTTTCCCTTGTTTTGAATTGTGGGTGCATGGAAGATTTTTAAGTCTATCAA TTATGCAGAGAGATGGTACATGTGAAATATGGGTTATGAAGAAATACAAAGTACAGACATCTTGGACCAAGACTCTTGTT CTATCTACGGAGATATATCACTTCCCAATATGCTCTACAAAAGGTGGTGATATTGTTATATATTCTGGATCAAAAGTAAA AAAGTATAGTGGTGAAGGAGTAGAACAAGAAGAACAACTAGAGTATCCGAACCATTGTGGTTTACTAGATGCATCAGTGC CCATATATACAGAGTCAATGCTTTCACTCCCTGATGTTAGCGACTGAAATCTCCACAAGAGCTTCGATTTGTAAGTAAGC TCCTCAACTTTCACTTTCAATTTGTTAGAAACACATTTATTTCCCTTTTAATATGCCTTCTATTATAGTTGTAATGTTTG TGGAGTTATAGTTCTAGTCGTTAAATATCTGGAGATTCATCCAAGCAGTAGGGAGTTTTTTAATGGCTTTTAGAGGCAAC TTTGGACTAACAATCCTAACCACAAAGACTCTAATAGTTGCTGTTTTGGTTTGGATTCTAACTTTGTGGAACCTTACTAT GCTGGATGTAGTGAACTCCTTTTCAAAGATGGAAAGACTAATAGTTTCATATAGGTAACAACCATGGCAATATAATGACA CAAAACCTATCATTGATTACAATTCTAAGATGACAAGAATAGGATTAGGCTCACTCGAAAATGAAAGTAGGAAAATGGGT GATTTTATGCCTATTGTGATTTTGGTGGAGGGATAGGAGATCCTCTGCAATGAAATTCTAAAACTGAGTTGTTGGAAGCT GTACTGAAAAACCTTAATTATGGTTGTGGCTTTCGTTATGCTTTCAATTCATTCATTCATTACTACCCACAATGTGAAGA AAGATCCATTTATTATTTGAAAACAAACATATAGACATTTTAAATAGGTTTCTTTTACTAGAACAATGTGTGGAAATGAT GTACAAGAACAGTATTTAGACTTTTAATTCTTAATATCAAGTTAAGTTAAGGAATAATTGATCATGAGATGGATTGTCAC GAAACTTCTGTAATTCAGAAAAATCAATTTGCTACAAGTCCATGTTCATTTTACTATCTCAAACAGCTGCATATATCATG ATGTCATGATGAGGCTGCTAGATGGCAAAGTAATCTGCAGTGGTAGAAGAAGAATAAATTCAAGGGCATGTAATTTGATC CATTTTTGTGAGGCTCATCTAGGAAATAGTTCATATCACAACTAAGGGCATATTTGAATAAGAATCTCAAAAGGGTTACA AAATTATGGTTTGATCTCTTACTTTGGTTTCTCGTAATAGCACTTTGACAGATCTTAATATTGATTAGTTGGAAATGAAT TGGTATCAAATGTTGTTTCATATTGTTGATAGTGATGGACTTTTAATCTGCTATGTATTTTAAGCTTTAATCTAATGAGA GATTTTTTTAATTATAAGTATATGAAATGTTATGGTACTTATGATCTGAGTTTTTGTTATTGGTTTTGACTTTTGAGCAG CAGTTAGTGGGTCTGGTAGCATCATTCACGTATGTTGGTGAAGTGATCAATGAAAAATTGGGTCAAACAGAAGCTGAAAT CCTTCATTGAGGTCCATGGAGAAGAAAGGAAGCCATGGGGAGTCCATTAGGATCTTGACTACAAGGAGCGAAGACCCAGT TAATTTATATGAAGGATTACGAGCCCTATGGAGGTTTTATTTCAATTAATCAATTGATTTCAAATTATTGGAACAAATGT TTTATTTGTAATTTAATCTCTACAAATAATAGCTCGGTTAATTTATTTGTAATCAGAGTTTTTTTCTACATTCTCATTAT ATTTTGGATTAATGGTATATTAAACTATTTGTGTGACAACTTTTTTTAATTGTTAGAACATATATTTATATCAACTCACA TATTCAATTCTTGCATACTATACTTTCGTATACCTCACGTTATATGTTAAAAAAGTTCACGGGGACGAACAATTTGCACG TATAAATGAGGATGTTAAGATTTATAGTTGACAAACTTTTAAGTAAGGGGTAACATACGCACAGTCTAGGATTATCCGGA GTTTAATTGCATGTTTCAATTTAAATGGGGAGGAACATTTTTTGTT 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0402800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCCTCCCCGAGTTCAGCCCGTGCCTGCCTCTCAGTTAGCGACGCGCCGCCTTACTCTGTCCGTTCATCCATGTCCTC TGACGGTGCGAGTCCGCCGGAAGCCGCGTCTGTGTCTACCATCGAGATTCAGATTCAAACACTGCATATTGACATGGATC GAGATTTGATAATTGAAATCCTTTTGAGGTTGCCGGTGAAGTCTATTGTACGATTCAAGGCTGTGTGCAAGTTATGGAGA TCTCTCATATCCGATCCCCTATTTGCATCATTACATTTTCAACGTGCTGCTCCTTCACTCCTTTTCGCTGACTCTCATGC CATTCGAACCATTGACTTAGAGGGACCGCTTCAATCTCATCGTGTTTCTCAACCAATCAATTGTCACTTTTTGTCTAATT ATCATGATTTATCCTTGCCTCGTAACTGTATTTCGATTCACGGTTCGTGTAGAGGCTTTCTGCTAATCACCTGGATTAGG AATATTGGTCGTCGGCACCCGTGGAATGATAGTCTCTACCTGTGGAATCCATCCACACATGTCCACAAACCAATACCATC ATCTCCTGTTGTTGACACCAATGTTTTTAGTCATCTATTTGGATTTGGTTACGATTCCTCGACAGATGACTACTTGGTGG TTCGAGTGCCCGTTACGGACGGTAACCAACCTACTCATTTACCAGATGTGCAGTTTTTCTCATTGAGAGCTAATATGTGG AAATATACCGAGGGTGTTGATTTGCCTCCCTTGACCACTATTGACCTTTGTCATGGATTGCTCTTTAACGAGGCTATTCA CTGGGCGGTTAGTAACTGGGTCGATGGTGTTACGAACATGTTTATTATTGCCTTTGATTTAATGGAAAAGAGACTCTTAG AGATACCCATGCCTCATGGTCTTCTTTTCCCTGGTTTTACTTTGTGGGTGCATGGAAGATTTTTAAGTCTATCAATTTTG CAGAGAGATGGTACATGTGAAATATGGGTTATGAAGAAATACAAAGTACTGACATCTTGGACCAAGACTGTTCTATCTAC GGGGAGCTTTCACTTCCCAATATGCTCTACAAAAGGTGGTGATATTGTTTTACATTCTGGAACAAAAGTGAAAAAGTATA GTGATGAAGGAGTAGAACAAGAAGAACAACTAGAGTATCCGAACCATTGTGGTTTACTAAATGCATCAGTGCCCATATAT ACAGAGTCAATGCTTTCACTCCCTGATGTTAGCGACTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0402800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MASPSSARACLSVSDAPPYSVRSSMSSDGASPPEAASVSTIEIQIQTLHIDMDRDLIIEILLRLPVKSIVRFKAVCKLWR SLISDPLFASLHFQRAAPSLLFADSHAIRTIDLEGPLQSHRVSQPINCHFLSNYHDLSLPRNCISIHGSCRGFLLITWIR NIGRRHPWNDSLYLWNPSTHVHKPIPSSPVVDTNVFSHLFGFGYDSSTDDYLVVRVPVTDGNQPTHLPDVQFFSLRANMW KYTEGVDLPPLTTIDLCHGLLFNEAIHWAVSNWVDGVTNMFIIAFDLMEKRLLEIPMPHGLLFPGFTLWVHGRFLSLSIL QRDGTCEIWVMKKYKVLTSWTKTVLSTGSFHFPICSTKGGDIVLHSGTKVKKYSDEGVEQEEQLEYPNHCGLLNASVPIY TESMLSLPDVSD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 34 34 -
MobiDBLite 17 34 18 -
PANTHER 48 405 358 4.3E-80
PANTHER 48 405 358 4.3E-80
Gene3D 51 88 38 4.4E-8
SMART 52 92 41 4.3E-5
SUPERFAMILY 52 107 56 1.31E-13
Pfam 53 87 35 3.5E-7
TIGRFAM 150 344 195 5.1E-17

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0402800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…