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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0568200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0568200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Replication factor-A-like protein; TAIR: AT1G52950.1 Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein; Swiss-Prot: sp|Q65XV7|RFA1C_ORYSJ Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit C; TrEMBL-Plants: tr|I3S126|I3S126_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0568200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:110131738..110145462) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACATGTCAAATAATTTAACCTAATTAACCAAAATAAAACCTTTTAACAAATCTAATTCAAACCTAATCAACAAAATCAAT TCCCCCTCCCCAAATTAACCCCAATTCCCCTAAATCACCTATTCAGAAACACACCAATTTCAAACCTAATTTTTCTTCCA TCTAACCATCTTCATTGCATTCCAGATCCAAATGCAGGGAATGAACAATCATCTAAATCTAACAGAAACGCTTCTTCTTC TTCTGGAACCTTCCTCCTCATCACTCTCCTCTTCCCGGCGGCAGTTTCTCCACTGCCAATCCTCTTTGCCACTGACCCCA AAATCCTTAACCAGTTCAAGAAAGGCCTCGAAAAAACGGAGCTCCTTCCTTGGCCGGAACAAGGCGGTGAGCCATGTGGC ACCCCGCGTTGGGAGATGAGAGAGATCGAGAATGAGGAACCCAGGTGAGGGCTCCAAATTGAACGGCCCCTGGTGTTTTT TCGAAGTGGCTCCGTTTTCTGTTCCTCTTTTTTTCACTTGTAACACAGAATTTCGTTCCTCTTTCACCTGAGAATGCAAG TCTTGGTTTGAAATACCAACAGAAATTTGAGTCAGGTTTGGATTTAGTGCTTTTGGATTTCCTCTTCTTTGATTTCCCAT GCTTCGTTTTGCTTCTTTCTTTGGCGTGCTAGGCTAGGATTGATTCATGGGCCTATTTCTTTGTTTTTTTCACAATGTAC TGGATTCACTCTCAAATCTGCTATAGTACTGTAATTCCCCCATTTTTTGAGGTTGATGTGAGGAGAGGCTGCGGGAGAAA ACGCGAGAGGCTGAAGAGTTGGAATTGAAGAGGGTGGAAAGCAAGGGTTTGTATCGGAACCTTGTTGAGCATGTGGAATC ATTGAATTGTGAGGTGCAGGCTGAGAAATTAAAGAGAAATCGTTTAACTGAAGCTGATCTAGGAAGTGAAATTGTGTTTG ATGAGGGCCGAGAGAGAGTGGGTGAAGGTTGTGGTGGTCAGATCTTTTTTTTGTTATTTTGTTCTGATTCTTCAGTAGAT CATTACCACTGGGTGGGGGAGGTTAATGAAGATTGATATGGGTTTGGTTTTGATGGAGATGAAGATCATTTGGGAGGAAT TTTTTTTTTGTTAATTAGATTTGTGTTAGTAAGTTAATTATGATTAGTTAGCTTTTAGGGTTAATTAGGGGTCTGTTAAA TAAATAAAACTGATTTGTAATTTTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTCCTTGCCACATCAGCCTCATTTATCCAGTCATCA TGCCAATTCATCACTCGCCGGAGCTCCGGGCTCCGGCGAGGACCTGCTCCACACAAATTGCAAACGAGAGGACCCAAATT TGTAAATTTTCCGGGGAGGGACTGTGGATACCCATTTTTGTCCGGGTTAATAGTTTGAATTTAAAAACTATTAATAACTT AATTAAGGATATAAAGTTAGAGTGAACTCTATAGTATTAGTGATCAAGTGAGTTAATTTATTTTTGATTTCTTAACCATG TAACAATACTTAAAAAAAAAAAAGTGTGTGGTTAGTGGGCCTTTGGCCCACTTTCGACCAAAAATGGTAATAAGAAAGGA AAAAAAGAGGATCTGCCAAGTAAAACCAGAGAGTGTGTGGTTAGTGGGCCTTTAGCCCATTTTCGACCAAAAAATGCTCA TAAGAAGAAAATGATAAAATTGATATAAAAACAAAAGGAAAAGAAAAATAATAGGATAAAGATGATCAGCACAGCAAGTG GGTTCCGGATCCTTCTGAAGTAAGTATAGCCATCCCCTATAAATAGGAACTTTTTTTACTTTTCCAAGGGGCACAAAAAA AAGATTGAATACACAAAACATAGTTAATAAATATAAGCATGGTCTAATGAAAGAAAAACAGGGAGGAGCGTGATGGGTAT 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TACCCTTTAAAGTATGTGTTATCTCGCCCCATATATTGTACTGACAAGGGTATTTGTTGTAAAAACATCATTTAATGCTC TCTTGAAATGCTAAGTGGACAGTTAAATAGGAATAAAAAAAAAAGTAAATTACACTACACTACCTTAAGGTTTTCTTATA TGACACTAAACTCCAAACTTACTTAAATATTACACTCCACCCCACCCACTATTAATCACCTGCAAATTTATTTACCAATT CATTTTACCAATATTTTCTTGTGAATTTTTCTTCAAATTTGAGTAAATTTTTTGCAAAACTATACCTGCAAGTAATTCCA CAAATAATTAGTGCAATTACATTTTTTCCTTCTATTTTTTTGTCATTCCTTCTTCTTATATTCTTTTAACATGATCCTTA AAAAAACTTTATGTGAAGCCATGTGTGATAAATAAGTTAGATAGTTGCGTTTTTCAATCAACGAATGCATGATATTTACT TAACTTCTCATTTTAATGGTTTAGTAGTTGTAACTCATTTTCAAGGTGGCCGAATTATTGATTGCTTAGATTTTCAAGTT GGCAACTTGAACGAATCCTCCCACCTTTAAATTAAAATTAGTCATTCAAATTCATTGAAATAAAGCAGAAACGTTTTGAG AATAACACAATAAAATCGATTCGGAATCATAGCAATTTATAATTTTTAGTTTTCACAAAACTAATCTAAAGCAAACTAAA CTTCAATTCTTAAAACACTTGATTTTTTTTTTTAATGATCATTTTAAAAGAGAGAAAAAGGAAAGATTAAAAAAATAAAA GGAAAAATTGGAGAAAATTTCACTAATTATCTGTGGAATTACCTACAAATATAATTTTACATGAATTTGACTCAAACTTG AAAAGAAATTCGCAGGAAAATATTTTTGAAATAAATTGGTAACAAAATCCGCAGGTAATAAATAGTGGTGAGGTGGAGTG TAATATTTGAGTAAGTTTGGAGTTTAGTATCATATAGGGAAACCTAGGGGCGTAAGCGGGTATGGTCCGATCCGTGAATC CGATTAAACCGATCCAAACAGAACACATTATGGTTGGTTGAATTGGATCATTGGTTTGGTTCGGATTTTTTTTGTTGAAT CCGATCACCATCGGTTCGGGTATCGGATTTGAGGATTGAAAAACCGATCAATGCGAACCAACTCAATGTATTGAGATTTT TTTTTACATTAAGCTCAAACACTTTCAGCTCATTAGATTACATATTCATATTTGTATTAGAGATGTTAGTTTTATTTTGA TTATATGAACTGTGTTATTATCGAATGTTTTGTTCTTTAAAAATGTTAGATTTTTCTATATTTTTTATAATTTTTCACGT TTTTAGAATAATTTTCGTGCATATTTCCAAATGATCTTTTTTTTTTCAAATCCGACCATCCGAACCAAACCAATTCGATT GAGATTGGGTTGGTTTGGTTCGGGTTTGAAAGTAAAAATCATGAAATTCAAATCAACTCAAACCGAACATGTTTGATTGG TTCGGATATTTAAACACCCTAAATCCGAACCAACCCGGTCCGATTACACCCGGAAACCTCAATGTAGTGTAGTGTAATTT ACTCTAATAACAACCCTTTCGCTCCTAGCAACTAAATTGAGCTTTGAAATTTTAATCATAGATGACTTCTTTATTTCATG AGCATGCAAGCAATCTACTTTTGAATAATTAGCCGTTAAAAAATAAAGTTCAAAATGCAATTTCAATCAGATATATGATA ATTAGGGGTTATGATATATACATACCTCTCCACTTCTTTTCCACTTTCATTTGCTATTATTTCTCTTTTTTCTATCAATC AAATTACCTATCACATCTTTACTTTCTCTCTCCTTTCTTCCTATCTCTCTCTTCCTCCACCTTTCCACACCTAAAAAATG AGATGTGAAGATATAATAATTCGATAATTGATACAATGTGAAATTTGAATAACCGATCTATGACTATTTTAGGAGCAAAT CTACCGTTAATTAAAAAAAAAAAATTTATTTTGTGATTGAAGCTAGGCGCGATCAAAACATGAATAAAGATCAAAATGAA ATTTTAATCAGATACAGTAATTGATACAATTTTTTTTTTGTCTAAATGACTTGTGGCTATTTAGACACTTTTTGGTACAT GATAATTAATATAATTTGAAAATTTGAATAATTTTTTTTTGAATAAATGACTCTTTATGACAACAACAAAAAATGACTTT TCAGTTTGTTCCTAATATTAATTAGGCTTAATTGCACTTTTCATCCCTCATGTTAGACTCTTGTGCAATTTTGATCCCCT TTGTTTAAAATGAACAATTTTAGTACACCAAAGATCAAAACGTGACAATTAAGTCTTTCTGTTAGCTTCCGTCAAACTGT TAACAGAAATTGATGATGTGTCAAGTATATTAATATTTTATTACCATTTTAATATTTATTTTTCTTTTATTTTTAATAAT ACTTACAAGTCATCATCTTCTCCTTCCTTCACTCTCTCTATACTCTATCTCACCCCATCTCCTTAGCCCAGCCACTCTCA CCACCGCCCCTCCTCCTCCAACTCCTCCTCCTTAGCATCATCAAGGCTAGCCACTTTCACCAACAAATTGATACCAACAT CAAGGCCACTAATAAGAAGAGAAAATAGAAAAGAAACTCAGATCAACAACAAAATTCATTGTCCAGTTTATTTTCAGAAA AATCATAACGAAATCAACAGTTAAAGATGCAGGCTGAGATTCAAAACAAACACAAAAATCCTAGTTTCTTTCCAACCGCA AAACCCCCAATCTCTACTCCTCTCCTCCTTTATTCTCTGATTCCTCTCCTCCCTCTTCACCATCGCCTCCCTCAACCATC AACACAAATTCTGGATGTCGAAATTGAACTCGAGCAGGTTGTTGGAGAGAAAGATAGAAGTGAGAGTTTCAATCATCTCC ACCGTCACCCAAATGTTCTAGGTGCCGGAACCTCGCAAGGGTGGTGGAACCGCTTCAGATCACTCAAACCCTCACCACAA CCTCCTTCGCTGCCCTTTGCCACGGAGCCGACACAACCTCCACCGATCCAAGCCCAGAAACACCAGCCTCCACGATCCAG GCCCGGAAACACCGGTGTTCCACCGACAACAACTGCAGAAACAAAACCCCCAAAACTCAATCCAAACTCAAGATGAAGAA GATGAACAGGTGAGAGGGAGGGAGAATTGAAGAAGAAGACAACCTCCATACCCTTCCCCTCTCGATCCCATGCAAAAGCA TCCAGATCTAAACCAGAGATAAAGAAGAAGGCGTTGAAGACGAACAGATCTGCAACGCTCGACCCAGATCCGCTGGGAAC CACCGTTAGAAGGGGGAGTCGTGGAGGAGGGGGAAGAGGGAAAGGATTTTGTGGAAAGGTAGGGGGAATATGATGGAAGG CACATATGGAGTCATGGAGGTGAAATGGTGGTCTGATGATGGAGTCATGAAGGTGGTGGTGGAAGAACGTGATGATGGAG TCATGAAGGTGATGGAGGCAGCAATATAATTTAGGGATTTTCAATTTTGTAATTAAGGTTTTAATTAGTTTTTCTTTTCT TCCTGAAAATGGGTTTTAATTAGTAAGTTTTAATTATATTCTGTTTATAAAAATTATATGTCAGCCAAGTGGAGTTCACA TCAATTAATGAGGATCCATGTCATAAGATGAGCGCCACGTAGGATAATTCCGTTTAAAATTGGACGGAGGTTAACAGAAG GACTCAATTGTCACATTTTGTTCTTTCGTGTACTAAAATTGCTCGTTTTAAACAAAGGGGGTCAAAATTGCACAAGAGTC TAACATCAGGGACGAAAAGTGCAATTAAGCCTTAATTAATTTACCATTCCTTGTAATAATTAAGACAACAACCCGACTCC AACAGTTGTATTTTCGGTAACAAACCTTGATTTCATCGCTTTCCACAAATCATTGCAGTTTGATTTTAACTATTCTGACA ATATTTACTTTAGCACTATATATATTCATCTCTCTAGTTATTTCACTATTCTTCCTCTAACTACATTCTAACAAGCCATA ATGAAGATGGAGAATGAGAAAGTTTTACTTGAAGATTTGATGTTTTCCATTTGTGCAAGGTTGCCTGTCAAGTCAGTCAT GCAATGTATGTGTGTCAACAAAGAATGGAACTCGTTCATCCAAAGTTCAACCTTTCCTCTTTGCCTGTCCTAGCCCCAAT GATTTACAAGTTCTGAATGTGTTTTTGGGACACCTGTCAATTCCAATCCATAAAGAGGTTCAAGATCACATTGAAGAACA GGTTTTTTCTGTGCCTACTAACCCTCCTTTTTAGGATTCAAATCTTGAATGGGTTACTTTGCATGCATGAAAGCCCGTGG AGGTAGAAAGCATAGTGAAATTGATTCAATTCAAATCTTGGCCTTGGTTGAAGGCAAAGCGAAAACACTTCTCAGATTGG AGTTTGAATCCTGTTACCTGCATCAAGATGTTGTAACAAGTTTTCTTTGAGGAAGTATTGGCTGCTACGTTCTTTTTCTG TTGTGGAGTTATATATTGGCAAAGCATGCTAGTAGAATGGGCATCTTATTTTTATTTTTTTCTGGAATGTGCCTACTATC ACAACTTTGGCATCTCTTTCTTTTCCCATATATTTCCTATTTCTTGTATCATGTTTATCTTATTTTCTTTGACTGATTTT TTCATTGTATTCGGGTTAGCTCCCTTGTGCTGTTTTGAATGCAATGTCTTGGCTTATCAAAATAAAAATAAAAAAATGAA AGCCCGTTTCCTTCCCCACTGCCCCCACCATTCATGTAGGGAATCTCACAACTCAAAGGATCGTTACCCTCCCTCAAGAT AACACGCTAGAGTTTGGTCCTGAAGTTTCAATTTTCACACATTTTGGATACGACCCTCTACATGATACATTCAAGGTGCT TAACTTCATCAACGATGCCAGTCTTTCTGAGGGTTCATATGAGTTGAGGATTTTGACTATTGGAGAATACGTGTGGAAGG TAATCTTTCCTGATGATTTTACTTTGAATCTTCATCGGTTAGAGTCCAAGGGTTTGTGCGTCAATGGTGCGATACATTGG GTAGATTTGGACAACGAGGTCCTCATAACATTCAATGTGGGACAAGAGCAATTCAGAAAGATTCCCATCACAGGTGAACA AGATTCACAGGAAGAAGACATGATCAGTTATGAGCTTCTTGAACTGGGTGGACATTTAAGTTTGGTGAAGTTCATGAAAA AGGGGCACATAGAGTTGTCAATTTTGAAGGACTACAAAAATCAGGTCTGATTTCAAGAAACGATCGAGCTACCGGATGCA CCTGCCATTGATGTACTACATCCACTTGTATGAAAACTTTACACGGAAGAGACCTTGTTGCTGCTTTACAGGGTGGATGA GGATGTCACCAGAGCTTATTACTATGATGTGAAAACAAGTCGCCATGTGAGTTTTCGTACAGATTTGAGATTAGGCGAAT TCCAATTGTTCCTTTAACAAGAAAACTTCATGCGTTTGTAGTAATCTTTTAGGGATGCATCGAATCAGTGTTTGTCTAGT GCCAAGTTTCTGTCTTTTGTTTGGGTTCGTTGGCCTTGTTGGTTGAAATGTTGGTGTAGCTGTGCAAGGTCGTTTTAATT TCTTGGTTCTTCGTCTATGGTGGTTATTACTATTAGTGTCTCTTTTTGGGATTTTGTCTGCAGGGTCCTGTTAATTGTTT TTTGGTTTTTGAGTTAATTTTTTAGTACCGTCTGAACTGAGACAGTTTCAAAACAGTCTCATACTTAAAAAATTAATGTT TTAATCTCAGTTAATCTGCATTTTTATATTTTATTTCATAAATTCCATAATGATAAATGAACCACTAAATTTATACGGTG ATGAAGTTGAATGTTATTAAGGTTTATGAGTTTGGGTTTAAGTCATAATTCGTGATAGTTTTTGGATTACTATATAAAAT ATTGATTGATGAAGATTAAAAATATAATTTGTTAAATGTTATGGGTTAAATTGTAATTTATTGTATCTTGATCTTCTGAA GAAAGTATAATAATGTAGATTAATTTGACTAAAATTTAGTGGCAAATCCTGTCGTACCCATAATATTTTTTGGGTGTGAT ACCCACATTAAGTTATTTAATAGATTATTACTACGTTGTTCAACGTAAAATTTACATTTTCAAATTTTATTTTACTTCTC AATTAACTTTATTCCATATAATTTATTTTTTAATGAAAAATGGATGAGTAGTGAAGAGAAACGATGATGGTGGCGATGCG CGTCAAATGACCATATTTGACTGAAGAACAAAGATTAAAAAATACAACAAACAAATTTCACATCTCTGGCAATGGAATAC TACATTACAACGATATAATAAAATCGAACTTTTTAACAGATATTTAAGTTATTACAACTAATTTAACTCATTTTGGGTAC CACGCCTTGAATTGACTCAAGGTATCACAGCAAGCACCAAATTTAGTTTAGTAAAATGTTGGTGTTGAAAGATTAAATAT CGTGATTGTTAAAAAATTAAAAATAGAAATATGGAATTAACACGTGCCATGAATTTATTGGTTGCATTTGAGACCGTTTA GAAATTGTCTCAAATGAGATAGTTTTCAATTCAACAACAAATCTATAACTAACTAAAGCTAGAGGGTTTTGGGCACTGTT CATCAAAAGAAATCTGCAAGGGCCGGGTCAAGGGTCGGGTCTTGGAGCGGGGTTTCCGTGTCCTGTGTAGAGATCCGAGT CGTACCTCCAAGGTAGGCAATATCTTCTCTGCAGATTGCAAATCATCTGCTGCAATTTTCCCCTCTTCCCCATTTACCCC CCTCTCTCATCTTCCTTCTCTATCATCTCCTACCATGGCAGCTATAAAAACCCAAACGGTGACCAGCCATTGGCACCGCT TGAGTCATCGAGTAATCCATCCGAAAGTCTTCTCGAAACTCCGATCTTTGATTGAGGTTTTTGTGTCATGGCGTCGTTGG CTTCAAACTTGAATTCTGTTGCCAGCCTTTGTAATGGAAGAGAATCATGGAGGATCAAGGTCCGTGTTGTTAGGATGTGG GAGATGTGCCCAATTTCTGAGCCAGGGAAGCCCTTTGCTGTCCAGATGGTGTTAATTGATGCTGAGGTATGGTCTTATTC GGTTCATGTCTTAATCTGTATGAATTGCATCTATGTCAAAGCTGTATATTGCTTAATCTTTAGTGTTTAATTGTGTTTTC AGTAGTATTTTGTTGTTTATAATGCCAATTAGCTGATGGTGTATACTATGATGTGTGGCTATCACTATTTTTGGTTTTGA TTTTATACTGTTATGTATTAAAGAATGAGTTTTTCAGTTATTGGCAACTGTAGATGACTGTTTCTTATTTACAGGGCCAG AGAATTGAGGCCACTATCAGGAAATTGCTCATAAAGAAGTTGTTTGGTGAGATTGTTGAAGGAAACATATACAGGATAAC CTATTTTGCTGTGGTTCCTAATCTTGGAGTTTACAAGGCTGCTCGACATGAATTCAAGATCATCTTTAATAGCAGGACAA AGATAGTGCCTGAAGAATCCAATCTCATTCCTTTGTATGGATTTGCCTTTATGAACTCAGCTGAAATTTCTGACACCATG GGTGAATCTGAACATCTCATTGGTGGGTAATTTCATAGTTTCTATCTTATTGTTTGAGTAAGTTAGCTGCCCATTTTCAG GCCTTAATTTTAATTTGCTGCATATTTGTTAAAACAGATGTGATAGGATTGGTTACTGCAGTTTCCCGTGAGAAACAATA TACCAAAGGTGCAAATATTACAAGGATGATTGAGCTCCAGCTGACTGATCATAGGTATGGTGTACTCATGCTTGCACCAA TGATTCCCCACACAGTCTTTTATCCAAATACTTTTTAATACTTGGTTGTGTTGATTTAATTAGGGGAAGTGTCCAATGTA CCTTTTTTGGAAGCTATGTTGATGTTATTACTCATCATGTTCGAGAGAATGGACAAGCTATGCCGGTGGTTGTTATCCAG TTTGCTAAGATCAAGACTTTCAAAGGTTATTTGTGTGAAATATTTACATTCTATGCTACTTGACATCATTTGCACTAAAA CTGTTTGAATTCTAATAAAAATTTTGTTTGTAGGAAATGTTGTGATTCAGAATGTTATGCATGCTACAAGGATTATGTGG AATCATGAAATTCCAGAGGTTGTTGATTTCCGCAACAGGTGTGTGCACTATTAAATCCTTTTCATTTTCTGTACTCACTC TTGAATTTGATTCTTTGATTTATAATATTTATATTTTTTGGCACATATAAGCATTGCTCTCCATGGGATTGATCCTGATC TTCCCCTCACTGAGATTGAGGATGATGTGCGCGTCTTAACAATTGAAGAAGAATTTCTTACATTGTTCCCTAGGAAAAAA ATCCAAGAAGTGCATGAAACTGCTGAGGTATGTTTCCTGAATGCATTATAAACTCGACCAGAAAAAAGTGATCTGACCTG TTGTGAAATATTAGGCTGGGGTGTTTGTGGTGTATGCTAAGATTGCTGGACTGGTTGATGGTGAGAAATGGTGGTATTCA GCATGTCGCTGCCACCGTTCTGTGTCTGTTGAAGATGGCACATACTATTGCCCTGGATGTGACAGCAATGTGCTTGAAGT TACTCCACGGTTAGTTAGCTATTTTTGTATAGTCATGTGATTAGTTAGTTGTTACTATTTTACCACTTACTAATGCAGTG AATTTGATTCAGTTTTAGGGTCAAGGTAGAGGTGTCTGATGGAGAAGAGGATGCAAGTTTTGTCATGTTTGACACTGACT GCCAGAATGTGCTCACGAAAACATGCAAGGAGTTAGTTATTGGTTCAAAGGTATTGATTCTATTCCAATTTGCAAGTATT TGATGGTTGAAGTTATTTTATAATACTATTTATTTACTCCAGGTAAAAAGTAATTCTGAGTTGCCTCAAGTCCTGAAGAC ACTGATTGGGAAAGAGTTCCTCTTCAAAATTGAGAAATCAGCTGATCATGGTGCTAAGTATGATGATTCCTACAAGGTTA AGAAAGTATGTGCTGATCAGAATGTGATTGATCTGTTCAAGGATGCTGACAAAGTTAACACTCCCCAAAGGGTACGATTC CAGATGATAAACTGTCCTTGGGCTGTCTATTTGAGTGCTTAACTTATTCTTTTTATTATGTATATGTACAGTCAATCAAG GTGTCCAAGTTCCCCAATTTGGAAGATGGAGAAAGTAGCAACACTTCTCCTGGTATGGGTGGAATCTATTCTGGAAACAA ATTTGAGATTGATGCTGCTGTGAAGTCACTTGAGGACATATCTCCTTTAGGGAGTTTTGCTTCTCCATCCTTTGTTGAAG CCGATGATGGTGGTGCTTCCTGCCCCAAACCTGCCAAGAAACTAAAGATGAAGTGTGTGAAAATAGAGAAGGAGTAGTCA TGAATGGTAGAACTTTGCCTCGACTTGCTGGGGTTTAAATAATGTAGTTGGTTGTTTCAATGATGTTACATTCTTACCAA TGTATCACATTGTTCGTTTGTTTCTTTCTTTCCTTTTATGTTAGTGAACTGCATTGTGGTGAAGGTCTTTAGGTACTACT GTAATTTGTGTAGTGTATTTTGTGTAGTGTATGTTTACTAAAAACTGAGATGTGTTTACTCAGGTATGTCTAGGAGCGTG TGCTAACTAGCTCCATTATATGTATTAGTGTCTACTAAGCTATCTCCAGTAGGTAGAATGTGTACTCCATGTGCCTTAGA ATGAAACTATTGCTGCATGTATTCAATGGGTTTAATGGATGTAAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0568200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGTATGGAGCTGTGGGTAGTGTTTGTGGCTTTTGTCAAGGGCCAGAGAATTGAGGCCACTATCAGGAAATTGCTCAT AAAGAAGTTGTTTGGTGAGATTGTTGAAGGAAACATATACAGGATAACCTATTTTGCTGTGGTTCCTAATCTTGGAGTTT ACAAGGCTGCTCGACATGAATTCAAGATCATCTTTAATAGCAGGACAAAGATAGTGCCTGAAGAATCCAATCTCATTCCT TTGTATGGATTTGCCTTTATGAACTCAGCTGAAATTTCTGACACCATGGGTGAATCTGAACATCTCATTGATGTGATAGG ATTGGTTACTGCAGTTTCCCGTGAGAAACAATATACCAAAGGTGCAAATATTACAAGGATGATTGAGCTCCAGCTGACTG ATCATAGGGGAAGTGTCCAATGTACCTTTTTTGGAAGCTATGTTGATGTTATTACTCATCATGTTCGAGAGAATGGACAA GCTATGCCGGTGGTTGTTATCCAGTTTGCTAAGATCAAGACTTTCAAAGGAAATGTTGTGATTCAGAATGTTATGCATGC TACAAGGATTATGTGGAATCATGAAATTCCAGAGGTTGTTGATTTCCGCAACAGCATTGCTCTCCATGGGATTGATCCTG ATCTTCCCCTCACTGAGATTGAGGATGATGTGCGCGTCTTAACAATTGAAGAAGAATTTCTTACATTGTTCCCTAGGAAA AAAATCCAAGAAGTGCATGAAACTGCTGAGGCTGGGGTGTTTGTGGTGTATGCTAAGATTGCTGGACTGGTTGATGGTGA GAAATGGTGGTATTCAGCATGTCGCTGCCACCGTTCTGTGTCTGTTGAAGATGGCACATACTATTGCCCTGGATGTGACA GCAATGTGCTTGAAGTTACTCCACGTTTTAGGGTCAAGGTAGAGGTGTCTGATGGAGAAGAGGATGCAAGTTTTGTCATG TTTGACACTGACTGCCAGAATGTGCTCACGAAAACATGCAAGGAGTTAGTTATTGGTTCAAAGGTAAAAAGTAATTCTGA GTTGCCTCAAGTCCTGAAGACACTGATTGGGAAAGAGTTCCTCTTCAAAATTGAGAAATCAGCTGATCATGGTGCTAAGT ATGATGATTCCTACAAGGTTAAGAAAGTATGTGCTGATCAGAATGTGATTGATCTGTTCAAGGATGCTGACAAAGTTAAC ACTCCCCAAAGGTCAATCAAGGTGTCCAAGTTCCCCAATTTGGAAGATGGAGAAAGTAGCAACACTTCTCCTGGTATGGG TGGAATCTATTCTGGAAACAAATTTGAGATTGATGCTGCTGTGAAGTCACTTGAGGACATATCTCCTTTAGGGAGTTTTG CTTCTCCATCCTTTGTTGAAGCCGATGATGGTGGTGCTTCCTGCCCCAAACCTGCCAAGAAACTAAAGATGAAGTGTGTG AAAATAGAGAAGGAGTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0568200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGMELWVVFVAFVKGQRIEATIRKLLIKKLFGEIVEGNIYRITYFAVVPNLGVYKAARHEFKIIFNSRTKIVPEESNLIP LYGFAFMNSAEISDTMGESEHLIDVIGLVTAVSREKQYTKGANITRMIELQLTDHRGSVQCTFFGSYVDVITHHVRENGQ AMPVVVIQFAKIKTFKGNVVIQNVMHATRIMWNHEIPEVVDFRNSIALHGIDPDLPLTEIEDDVRVLTIEEEFLTLFPRK KIQEVHETAEAGVFVVYAKIAGLVDGEKWWYSACRCHRSVSVEDGTYYCPGCDSNVLEVTPRFRVKVEVSDGEEDASFVM FDTDCQNVLTKTCKELVIGSKVKSNSELPQVLKTLIGKEFLFKIEKSADHGAKYDDSYKVKKVCADQNVIDLFKDADKVN TPQRSIKVSKFPNLEDGESSNTSPGMGGIYSGNKFEIDAAVKSLEDISPLGSFASPSFVEADDGGASCPKPAKKLKMKCV KIEKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 17 | 17 | - | – | |
| Phobius | 1 | 4 | 4 | - | – | |
| Phobius | 5 | 13 | 9 | - | – | |
| Gene3D | 13 | 75 | 63 | 2.2E-8 | – | |
| CDD | 14 | 71 | 58 | 2.09357E-14 | – | |
| Phobius | 14 | 17 | 4 | - | – | |
| PANTHER | 14 | 401 | 388 | 5.9E-83 | – | |
| Pfam | 14 | 74 | 61 | 3.3E-10 | ||
| PANTHER | 14 | 401 | 388 | 5.9E-83 | – | |
| Phobius | 18 | 485 | 468 | - | – | |
| Gene3D | 78 | 212 | 135 | 2.3E-21 | – | |
| SUPERFAMILY | 86 | 211 | 126 | 6.85E-16 | ||
| CDD | 104 | 203 | 100 | 2.75847E-12 | – | |
| Gene3D | 233 | 400 | 168 | 1.2E-17 | – | |
| SUPERFAMILY | 237 | 394 | 158 | 2.57E-19 | ||
| CDD | 246 | 383 | 138 | 1.34985E-25 | ||
| Pfam | 256 | 396 | 141 | 1.1E-13 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0568200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…