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LotjaGi1g1v0571400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0571400
Transcript ID LotjaGi1g1v0571400.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description WD-repeat protein, putative; TAIR: AT3G09080.3 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q6DFF9|MABP1_XENLA Mitogen-activated protein kinase-binding protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0J369|A0A0R0J369_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0571400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:110510460..110523140) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AAGGTGTGTATATATCATTACCCTAAAAAATTTAATTTGTGCAAAATTCCCGCCACTCTCTCTTGGGTTCTCACTCTCTG TCTACAGTGACACCACGAAGCTCGTTCGCGAAGCTGAAGATGATCATCAAGGTCGTTTGACAAGGGATTCTTTCGTACTC TGATCAGAATGAAGCCCACTCGCAGATTCAACAAACCTAATACCGAAGAATCAAAGGTGTGTTTCATTTTCTCTCTTGTA AAACATTGTGCATTTTGATTTCCGGAGACATAAACCCTAAAACTGTTTGTTTTATGGCAAAATCGAGTTAGATACTGCGA ACTAAGTCAAAATTTTCCGTTAATTTTGTGTAGTGAGTAGTAATGGGTGTTCCTCATGTTTTAATCATAAATTTTTACAC TGTTTGTTTGGTTTTCCCTTCATTTTCAGCTGGTTTTGGAGGAAGTGATTGGATTAACAACGAAAAATGGCAATGGGTTG GCTTCGAATCCGTCGAGTTCCAAATGTGCTTATTTGGCAGGTTCTGTGGTGGTGATTTATGATGTGAGTTTGGGTATTCA ATCGCACCTCATGGTGTCTAATAGACCACCTAAGCCTTTGAGCTGTGTAGCTATGTCACGAGAGGGACGCTTTATTGCAG CTGGAGAGGTAAGGCTCAATTCTCCTATCTCCTATTTTTCTCGGTGTGCTAAATTGCTCTCGCAATTTCAACCTGGGTGT GGTGAAAGCTAAAGGTCTCCTCAAGAGTGCGGCTCTTAGGAATCGAACGCTATGTTTACAGTTTTCCTTTATTATTTATA TATTCTTTTTGCTAATATGAATCTTTATCTTCTTGGTTTATTTAAATTTTCTTGCACATAGTGTTTGGTTGCAGGGGAAT GGAGGGGAGGGGAGAGGTTTTTTTTTAAGTTATTATGTTTGGTTCATTTTTTAGGAGGGGAGGGGAGAGTTGTGTTTTTG 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TTAAAATAATCCTTGTTGGTTAAATTGGCCTTTTGATTATTATGTGCTTATTCTATATGGCCACTGGTTTCTAGTTTTCA AACTCTTTGCTATGATACGATAACCAGTGAGCATAGTATTATTTGTATGGCATTGAATGGTTTACTCAATGATTAACATT ATGCTTTTATTTTATACAGTTTTATGGTGCTTCATGATGTAGTGATAGCAGATAATGGTCATAAAATTTTGACGCAACAT CGTCAAAGGGCTTCACAATGTGGAGCTGTTTATGACATGGCTGTGGATCTGACATGCAAGACTATTGTAACAGTTGGGCA GGTAAAGTAGATGTTTGTTAGGAATGATTCTGATGTTGAAGTTCTAAGGTGCCTCCTTTGGGAACCTCCCGAGTAAATTC TAAAACAGTCTGTCCAAGTAGTTTGTGCATCTGTCAATTTGATAACATTATCACTCAATTTTCATATTCAGTGCTAATGG TTACTAATTTCATCATCATACATATAGGATAAGAAGATAAAGACTTTTGACATGGCTGCCCGGAAACTAATTAGGTCATA CAATCATGATAAAATTTTTGGGGAACCTATAAAGGTGAGCTTCATTCTTTGAAAATGATTGCAGACATCATCCTTCTTTA CCAGAAGCTAATAACATCAACAGGTTACAATGGACCCAAGCTGCACCTATGTGGTCTGCTCATTCTCAAACAAGTCCATC TGCATATATGACTTTCTAACCGGTGAGATGGTTTCCAAAGCAATGGGGCACGCTGAAATTGTTACTGGTGTCATCTTCTT GCCTGATTGCAAGCATATAGTTTCAGTGAGATTCTTTCATACTTAATGTTCTTTTTTCTCCGTACTTCTTTTAGAAACTA TAAGGCTTTATTATTTATTCAACTAATTTTTTTTAATTTTAGGAAATTAGTAATGCATATGTTCCCCTAAAACATTTTAG 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AATCAAAAGAAACACGGAACACATTAGGAGAAAAGTGCTGTCATGCTGTGTTGTCTGTTAAAATGGAATAAATCATTTGC CTTATTCATCTTGTTATTGGAGTATGTAAAGTATTTCTATTTGATTTGTGAATGATAATATTGTAGTGATGACATACCTT TACCAATCAAATATTTGTGATCAATGCAATCTCCTCAAACATATGCTTCCGCATACCACATTAGGTTACTGTTCCGACTA CTAACAAGATTTGCTTCTGCATAACCCTTTAGGTACTTGTTTGTGGCAACTACTAAGAACATGACAAATGTTTTAACATT TTCCTCTTCACCTTCTATTGATTAGGGATAGTATGAGATGGTTGGAAAATCACTATGGATTTTTAATGTCAAGATAGATC TATTTTACAATAAAAGGAATAATGTATTACATCACTGATTTTCTTTTGAGCTTGTCCCAGTAAAGCTGAAAAAGTCAACT CATCATGAGCAATGACATGAAAATAATTAATATGGTTCTAAATTCTAATGATAAAGTCTGCATATTTTCTACAGTTTGTG GGAGTGCCTTGTGTATCCTTGACCAGTTTGAGTGAATCAATCATTATAAAGTGAAATGCTTTAAGAATTCTTTGGGTTAA AAGGTATAACCGGAAAGGACTTTAAATGTCCATTACTGCTGTAAACTGATACAAATCCTACTCAATCGTAGTCAACCAAT AGTATTGGATGCATGCTATTGGAGAATCATGAATCTGTGTACATTCATTATCTGTTCATATGTGATTTTTCCCCTTGGAT GCCCTGTTCTGATTTTTGTACAATAGTTTCATGATTTTGTTCAGTATTTAAAAAATTTGCTCTAATCCTATAAATGATGC CTTATTGCAGGACAAGATAGTATAGTGATCAGTAAGGACCAGAACTCTAATGGGCTCAGTAGCCTTTGCAAGAATGAACA AATGGATGTTGTTCCAGACCAGCGTGTTTGTTGCGATGATAGTGATTTTTCTTGGTGTCCTGAACAAGATTCTGACAGAA AAGCAGAGCAGTTGCATTTGGGTGAATCTGGAAGTTTGTCAAAAACAACTCTTGAAGCTAACTCGGATAGTCCATGCTAT GAAGAAGACAGTGGTATCTTTAAGCGGCATTTTGGCAGCTTATCAAATACTCACAAGGTTAGTTACTTAGTTTTGCATGC ATTGCTGAGCTATTTTCTGGAATAGTAAAGAAGGAATTTAAAGATGAGTAAGGAAAGCAGTGTGTAAGTTTGAATTAAGA TCTCCTGATTTTGTCTGTTCTACTTCCCCTCTAGAGAACTTCTTGTAGGCTGCCTATAATTAAATTCAGAATGTAATTTT GGCAATAAAGCTCGTGTATACTGTTAATTATTTTTAAAATAAACAAAACCTGCTTTGAAAATATATTACTATGACAGTTT TTAGAAAAATGGTGATCAGGTCTGAACTGTTGGATCAATTGAGAGGAGTCTCCGTTCCCAACATGTCATGTATCACCTAA TTTGGAAAATCATTGAAAAGGACCCGTGGGTGGTGGCACTTATGTCAGTTCTGTTTTATTTTCTCCCAATAAATTTCACA GCCCAAAGGTCTATTATAATAGTAATATGTTAACCTTTTTCTTATGGAAGTTGTGTTTGTAAATCACATTGAGCAATAAA AATGAAAACAGATTGTTATCCAACTCAGATCTCTGGATTTTGGATTCAAGAATTAAAGGTGTAAATATTAATTTCTTGAA AAATTAAAACCTTCTCCTGCATTGTGAAAAGCCGGAACTAATATTTTGGATATAAAAATGTATCTTACAAGGTTTGATCC AGCTTATAATTGTTTATTTTCCCCTTTTCTTACCCAATGTGTTATCTGTACAGAAAGAGTCAAGGAATTCGTTAGTTAGA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0571400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAAGCCCACTCGCAGATTCAACAAACCTAATACCGAAGAATCAAAGCTGGTTTTGGAGGAAGTGATTGGATTAACAAC GAAAAATGGCAATGGGTTGGCTTCGAATCCGTCGAGTTCCAAATGTGCTTATTTGGCAGGTTCTGTGGTGGTGATTTATG ATGTGAGTTTGGGTATTCAATCGCACCTCATGGTGTCTAATAGACCACCTAAGCCTTTGAGCTGTGTAGCTATGTCACGA GAGGGACGCTTTATTGCAGCTGGAGAGGCTGGAAGCCAGTCCTCAGTATTAGTATGGGATTCTTCTACTTTGTCTAATGT CTCTGAATTGAAAGGTCATCCATATAGAGTTGCATGCATTTGTTTCTCACCTAATGGTAAACATTTGGTATCTGTTGGGG GATATATTTACCTTTGGGACTGGCGAAGTGGAAAGCTGGTAACTAAGCTTCAAGCAACTTCATCGTGTTCTACTATCTCC AGTGTTGGCTTCTCATCAGATGCAAAATTTATTGTAACTGTTGGCAAAAAACACTTGAAATTCTGGACACTTGGATCATC TAGAAGTACTCGACAAAATGGTGGGCTGAGCAGAACCACATTAGAAATACATGAAAAGCTTACCAATCTTTCAATTCATA AAGAAGGCTCTTTTACAGCTATAGCCTTTTCTCCAGAGAGCAGTATCAGCAATGATAATTGTAAACGAGCTGGTGATTGC TTTCACATATATGCATTGACTGATTCAGGCATTTTGTGCCTAATCCGTTCTGGATTGACGATACAAAAGTCTGTGGCCTT GAAGGTTCAGAAAGCTTTTGCACTATCAACATCAGGAAAGCTAATTGCTTGTGCATGCAATAATGGGGAAGTCCAATTAT TTACCCCAATATCTCTAGAATATGTGGGCAGTATATTGTATTCAAAGGCCCAAAAGTTGTATGAAGAAAACAACAGTGTT TACCATGCTCTAGTTCTTGAACAAGATTTTCAACAGTCGCCTGCTCTGCCTGATGCAGTCGCATGCAAGTTTTCAGCCAC AGAAAAGCTTGTGGTTATTTACAGGGATCATAGTCTTTGCATCTGGGACATCCATGATGTGAATCAGGTCACCAAGTGTT TTATGCTAGTTTCACATTCTTCATGCATTTGGGATGTCAAGAATCTATGCTGTGAAAACATGCATGATCTGTCTTCTGTA TGCACTGCTAGAGGTTGTTCAGGGGGGGTTTCTTTTGCAACTTGCTCTGCTGATGGTACAATTAGACTGTGGGATATTGC TACGCAATCTGAATTATCAAAAAATGCTGAAGAGCTGAAGAGTGAACTATTGGGTTCTTCATGTTTAGTAAGTGCTGGGA CTTTTGAACGTGACACCGTTCAGTCAGATCTTACTAGTCAAGAGTTTCGATCTCTAGCTGTTAGTTCGGATGGAAAATAT CTTGCTGCTGGTGATTGTAAAGGAAACCTTCATATATACAACCTTCAAACATCAGAGTACACATGTTTTCAGGGTGCTCA TGATGGAGAGATTCTTACATTAAGCTTTACCTCGTCCACCCAAGACATATTTGGGGAACTTGAAACAAGCAGTCACTTTC TTGCTTCTGGTGGACGAGATTGTATAATCCGCCTCTATGATGTAAAAAGAAATTTTGATCTCATTGGCAGCATTGATGAT CATTCGGCTGCAGTCACTTCTGTCAAAATTAGCAGCAACAGTTGCAAGATACTCAGTTGCAGTGTTGATAGTTTTATGGT GCTTCATGATGTAGTGATAGCAGATAATGGTCATAAAATTTTGACGCAACATCGTCAAAGGGCTTCACAATGTGGAGCTG TTTATGACATGGCTGTGGATCTGACATGCAAGACTATTGTAACAGTTGGGCAGGATAAGAAGATAAAGACTTTTGACATG GCTGCCCGGAAACTAATTAGGTCATACAATCATGATAAAATTTTTGGGGAACCTATAAAGGTTACAATGGACCCAAGCTG CACCTATGTGGTCTGCTCATTCTCAAACAAGTCCATCTGCATATATGACTTTCTAACCGGTGAGATGGTTTCCAAAGCAA TGGGGCACGCTGAAATTGTTACTGGTGTCATCTTCTTGCCTGATTGCAAGCATATAGTTTCAGTAGATGGTGATGGCTGT ATTTTTGTATGGAAATTGCCTTCTTCATTGTCTTCTAAGATATTGGAGAGAATATTGGAAAAAAATAATCCATTGTCTTC AAGAGGCTCAGCTCAATCTCCTACTTGTAGTCCTCTATCATTTAGCAAAGAGGAATGCCAGCACTCCAAGATCAATACTG AGGGTGTCTGGTCAATAAGGAACGGCAGTCAAAGTGGAGATGGAGTGCTTCATCCAAAAAGTTGTGATAGAGAGGCATCA CCTTTTAAATTTACTGTTTCAAGACTTCCTAAATGGGCACAAGCAAAAGTGACCAGCTGCAATAATGTATGCAAGAATCT TAATTGCACTTCATCAGAGGCATTTTCTCTTCCATCCCCAGAAGTTCAAATACCATCTGATCATGCTTCTGCATCGCCAG AGACTTTGAGCTCGCAATGTTCTTCAAGGCCTGGAGGTACTTTCAGCAACATTGCTTTGGACAACCATTGGTTCTCTGTT TACACTGTTTGTATGGATGCACTTTCCTCCCCAGAGATGCAGAATGTACTTGACATAAAGTTTCCACAGATTCCCGCAAG ACAAGATAGTATAGTGATCAGTAAGGACCAGAACTCTAATGGGCTCAGTAGCCTTTGCAAGAATGAACAAATGGATGTTG TTCCAGACCAGCGTGTTTGTTGCGATGATAGTGATTTTTCTTGGTGTCCTGAACAAGATTCTGACAGAAAAGCAGAGCAG TTGCATTTGGGTGAATCTGGAAGTTTGTCAAAAACAACTCTTGAAGCTAACTCGGATAGTCCATGCTATGAAGAAGACAG TGGTATCTTTAAGCGGCATTTTGGCAGCTTATCAAATACTCACAAGAAAGAGTCAAGGAATTCGTTAGTTAGAAGGTTTT CTGCAAGGTATACTGTGCAATGGGATTATTACCCAGGTGGCTGCAAGAAACTATTTAGCAGTCCTGTCAGGAATACGACA GATAGCAAGAGCTTTGCGGATGAAGCTGCAACTCATATTGTATCAGAAAACAGATCCTTGCTGGGGAAGGAAAGTGAGGA AGTGGGGAATTCTCCTGAACAGGAGCTAAAGAATTCAACACAAGGTTTGACAGATTCAACAACTGAATCTTTGATCATAT GCCCTGTGAAAGAAAATTCAGTTGACAATCAACTCCAGGTAGGTACAGATCAAAAGGAAGGTGACTGTGAAGGGAGTGAA CAAGAAGAAACTATAGCTGCATGCAAGAAAGCACTTGATAACTTGGACGCAGCAGCTGAGAGTGCGGTTCAATTATTTTT ACAATTAGAAATGCGTAATGGGGAAGATGTTTCGAGAGGATCTGGAGCTGAAATTCTGAATGAGGCAGCTGAACTACTTC CCCTAATTGTTGACAAGGTTAATGCTGTTGCTAGTTTGGTTCGATGTAGGAAGAACAAAAATTGTTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0571400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MKPTRRFNKPNTEESKLVLEEVIGLTTKNGNGLASNPSSSKCAYLAGSVVVIYDVSLGIQSHLMVSNRPPKPLSCVAMSR EGRFIAAGEAGSQSSVLVWDSSTLSNVSELKGHPYRVACICFSPNGKHLVSVGGYIYLWDWRSGKLVTKLQATSSCSTIS SVGFSSDAKFIVTVGKKHLKFWTLGSSRSTRQNGGLSRTTLEIHEKLTNLSIHKEGSFTAIAFSPESSISNDNCKRAGDC FHIYALTDSGILCLIRSGLTIQKSVALKVQKAFALSTSGKLIACACNNGEVQLFTPISLEYVGSILYSKAQKLYEENNSV YHALVLEQDFQQSPALPDAVACKFSATEKLVVIYRDHSLCIWDIHDVNQVTKCFMLVSHSSCIWDVKNLCCENMHDLSSV CTARGCSGGVSFATCSADGTIRLWDIATQSELSKNAEELKSELLGSSCLVSAGTFERDTVQSDLTSQEFRSLAVSSDGKY LAAGDCKGNLHIYNLQTSEYTCFQGAHDGEILTLSFTSSTQDIFGELETSSHFLASGGRDCIIRLYDVKRNFDLIGSIDD HSAAVTSVKISSNSCKILSCSVDSFMVLHDVVIADNGHKILTQHRQRASQCGAVYDMAVDLTCKTIVTVGQDKKIKTFDM AARKLIRSYNHDKIFGEPIKVTMDPSCTYVVCSFSNKSICIYDFLTGEMVSKAMGHAEIVTGVIFLPDCKHIVSVDGDGC IFVWKLPSSLSSKILERILEKNNPLSSRGSAQSPTCSPLSFSKEECQHSKINTEGVWSIRNGSQSGDGVLHPKSCDREAS PFKFTVSRLPKWAQAKVTSCNNVCKNLNCTSSEAFSLPSPEVQIPSDHASASPETLSSQCSSRPGGTFSNIALDNHWFSV YTVCMDALSSPEMQNVLDIKFPQIPARQDSIVISKDQNSNGLSSLCKNEQMDVVPDQRVCCDDSDFSWCPEQDSDRKAEQ LHLGESGSLSKTTLEANSDSPCYEEDSGIFKRHFGSLSNTHKKESRNSLVRRFSARYTVQWDYYPGGCKKLFSSPVRNTT DSKSFADEAATHIVSENRSLLGKESEEVGNSPEQELKNSTQGLTDSTTESLIICPVKENSVDNQLQVGTDQKEGDCEGSE QEETIAACKKALDNLDAAAESAVQLFLQLEMRNGEDVSRGSGAEILNEAAELLPLIVDKVNAVASLVRCRKNKNC 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

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ProSiteProfiles 90 192 103 10.601
SMART 103 140 38 2.9E-6
Pfam 106 140 35 0.0012
SMART 143 183 41 0.67
SMART 260 295 36 170.0
SMART 329 363 35 70.0
Gene3D 331 644 314 7.2E-37
Pfam 383 425 43 0.048
SMART 387 425 39 0.5
ProSiteProfiles 412 434 23 9.94
SUPERFAMILY 412 725 314 3.37E-47
SMART 457 494 38 1.4
ProSiteProfiles 462 734 273 19.776
SMART 496 547 52 0.054
SMART 551 590 40 0.0022
SMART 594 639 46 4.7
SMART 642 683 42 16.0
Gene3D 645 779 135 2.2E-11
SMART 686 725 40 1.1E-4
ProSiteProfiles 693 734 42 10.141
Pfam 695 725 31 0.27
MobiDBLite 1060 1082 23 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0571400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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