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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0647100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0647100.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Diphthine--ammonia ligase; TAIR: AT3G04480.1 endoribonuclease; Swiss-Prot: sp|Q9USQ7|DPH6_SCHPO Diphthine--ammonia ligase; TrEMBL-Plants: tr|I1N8C3|I1N8C3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0647100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:120453336..120464648) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCCTGAATAGTAAAGTCTGAAATCCCCAAATTGATTTCACTTGTTCAACCTTCCTATCACCTTACGCTCACAGCGCCGC CGTTCGCCGCCGTTCGTGAATCGGGGGAGACCATCAAAGGATTTGCAAAACCTGAAGTGGAGACCCTTCTCTGGAAGCAG GATTCGTGACCTAATTCTCTCCAATTATCAGCTGCTGCTGCTGCCACCAACGATGAAGGTGGTTGCACTCGTTAGCGGCG GCAAAGACAGTTGCTATGCCATGATGAAAGCTATTCACTATGGCCACCAAGTTTGTTCTCTTCTTTTCCTTTTCCCATTT CTCTATATCAAAATTGATTATCGTTTTCACCTTCAAATCCCTTTTTCTAATTATAGATTGTTGCATTGGCCAATTTGCTT CCGCTTGATGATTCTGTGGATGAGCTCGACAGCTACATGTACCAAACTGTATGCCCCCATTTCTCTTTTCCTCTTTCCAA TCTCCATTTTGTTCTTGCTGGCTCAATTTTGAAAAAAAAATTTGCATTTTTGTATCTGGTAAAAAAAAGTATTTTTTAGA TAAATGATGATATTAGAATGGTGACAGGCCTGATAATACAGCAGGGTTTATGAATAAAGTCAGAAAGTTTAATCTTTTGC TGGTATATTTAGGCATTGCAAGATGTCTATAAGAGCTAGTGCAATTATACTCATTGATGGTTTTAGGCTTTTATTAGCTT CAGAGAATGATGGGGAGTTAGGGACACTGTTATCTCTACTTAAAATTTGTGTGGCTTCTACTTTTTTGTTGCTGAAGTTT GATTATGAGATATTTTCTGTTGCTTTTTTCATTGCACTTTAAACATCCCTAATCAAAGGTGGGGGGTGGGGGGTTTTCCT GAAATGTTGGTGTGCTGTGTCTTCTGATTTGATGATTGCAGGGTACACTAAGAGTGTAGTTTTAGTGTGTTTAGGGATAT 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GTGAAGTTTATAACACAGGAGAAGTGCTCATTTGGTGTCCCATCCCGTAGTACAGTTGAAATGCCTTTAGCAGAAATGGG TTTAAGCAAAGCCTACATTGAAGTTTTGGTAGCAAATAATAAAGATAAAAGAGTTTTGCATGTGCAAAGTATTTCCAGTT GGGCACCTAGTTGCATTGGGCCATACAGCCAGGTAAACTCCATGGCTTTCAGCAGTTAATTATTTATCAATGGAACATCA AGATTGCATGTGGTATCTGTATCCTGTTTCATTATATCTTTGTGAAAATTTACTTGGGACTAGTTTATCAATGATGATTT ATAAATATCTCCTTATGTTGTATATTGATCGAAGAAATTTACATATTGATTGAAGAAATAAGGTAAATGGAAACCCCTTT AACATAAATTAAATAGGAAATTAACATTGATTTGATTTGATTCAATATAGTAAGATATGTCAGACTGTGAGGTAGACATG TGACTTCAAGAGAATGAGATTATGTAATATGGTGATTATCCAATTTCAAATGCTTTTACTTTCAGGCTACCTTGCATGAC TGTATACTTCACATGGCTGGCCAATTGGGGCTCGACCCTCCTACAATGAATCTTTGCAGTGGAGGCCCTGGTGTTGAACT GGAACAAGCACTCAAAAACAGTGAAGCAGTGGCAAAATGTTTTAATTGTTCAATATCAACATCTGCAATCTCTTTTGTGA CATACTGTTCAAAACATGTCTCATCATCAGAGAGACTTGATATACAGACGAAACAAGAAACAAACCTTAGGAAGATGAAG ATCTCTGAGTTACAGGAGGGAAAAACACGCAAAACATTAGAACCCATGTTTCTTTATATCCTCGTTCCTGATCTACCTAA AAGGTAATATGTTGTAATCTAATTTTTAACTCTGCATTTTGTTTGATCAACGATATTCTCACTTTCATAGGTCCATTTAT ATATTTTTAGAAATTATCATCTGCAATCTGTTTATTAATTTTGAAAATGTCTTTCCTTTGGTATCTATTTACATTTGGTT TCACTGTTTTAAGATTCTGGACCTTAAGTTCAGTTTTCTCAACATAACTACAAATTAAGCTTCTCTGAAGGGGAAAGAAA ATCAACAAAATACAAACAAATATCTATTTGGTTCCATTGATATGTGATATTACAAGACCTGTTATCTGGATTCTTATTTT TGTTTTCCATTCTTTGTGTTGGGGTAAGGGGGTTTTATTGAGTCCTTGCATCTTTTTTTGGTTTTTGTTCTGTATAAATG CTCACAGTATTAATGTCGTTGATGTTCTAACATTTGTTGTTTTTCCAGAGCTTGTGTAGAAGTGAAGCCTGTTCTTTATG TTGAGGATGGAACAGATGTTAAGATTGAGACCATAACAGAAAAGTCTTGCGCCAAGACATCATCTTGTTGGGGTTTCAAG CAGGAAAGTTGGCATGATTCTTGCATTCAGAAATGTGTGATTTCTGGAAAGATATGTTCTGTTATATTGTCTATTTCAAG TGAGCTGGCTGCAAAGATATGTTCCGATTCTCTTCCTGCTGATTATGTCAATAATGGTCAACATCCTCTACCCAAGGCAT CAATGGAGAAGCTATTGAAGTTCTGCGTTTATCTTCTTGACACAGTTATAACAGATAATGACTTTGCCTGGGATGATATA ATGGTTCGTATACTTCTATAATATCATTACCGGATTTATTTCATTCCTTCATTTCATTCTTTATGGGTGTAGTGATCATA ATCTTTCTGACGGTAAAACTTTTTCAAATTATCTTATCATCCCATGCAGTGTTTGAGGTTCTACATCCCAGTGAGTCTTC AAATGTCAGTGGAGCTATTACAACCAATGTTCAACAATGCACTTTCTGAACTTTCTGAGATGAGTCAGAAGAGAGTTAAC 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CTAAGAAGTGCAACTATCTAGTGGATATAAATAATTTGTGAACTAATTTACTTATGAAAAAGTAAAGTCTCACATTGAGT AGTGTAGAGACCTTTGCTATCCAAGTCTCCTATAAAATTGAAAGTTGAGTTGAAAACAAATCATACGAAAACACAAATTC AGTATAATAGAGAAATAGTATAAATCCTCCAAGGGAATAAGGTAACATAAGATCTTCAGGCAAATATTAGCTTCAGTCGC TTTTCTTGTTATTTTGTGAGCGTGTGAGAGTTCATTGAATTTTTTCTTGTTAAAACCGTTTATACACTTTTCTATTACTT TTCTCCTTTTATTACCACATTTATAATAGTTAGTGTCCATTTTAAGCTACCCGGATGATAGAAAGAGTATCCATTATTAT CCACCACATTTCCTTGGAACCTACTTGGTACATAATCCTGTGCGATAGAGAGATCAACCTCTGGTTGTATGATGAAAAAG TGGTAGGATGGCTCCCCCAACATTTTCTTAAAAAATATATATAGTAAGTAGATAAAGATAATTTATCTAATACATGTTTT ACGGGTATAGCTTAAAGGGTCATCAAAACCAATTTGTGAACAATCAACCAATGGCATATTGCCATATTCTAAAGTGCTTA TTGCAGCGAGGATTCTAAACTAAGTCACAACTAAGGTTCAGGCTAGAAGTAAGCTAGCCATTCCCCTCTTGTTCATTTCC CCCCTTTTTAAGCTGTATACTAATACTAGCATAGGAAAAGTGGTACAAGGTTGGTCAGGATAGGTATGTATTTCAAAATA AATTTCTGAAAATTGTTTAGGTTCTCCTTCATTCCTTTGGGGTTAAATAGGGAAAGAATAAGTTAGCAACCCAAATTCAC CCACACTTAAAGTAGGAAAAGAAAAAATAAAAATAAGTGTTATGATAAATGACGTGAATTGATATTTGTATTAAATTTTT ATACATAAAACTATTGATTCATTTAGGATGAGTTATAGCCAATGTGGTAAGTTAGACAATCCAAAAAATTCCTACAATAT TTTCAAGTATTTATTGTAGGTAATTTCTTATAAATTCTTAAAATTATTTTTGTGAACAATTTTATATCAATATTAAATTT TGAATCCTAAATATATAATATAAGAATACATTTTTAAGTCATGTACCAAAAAATTATTTTGGCTTCCCCATAATTTTTGT TCAAAATCCATCCACCACTGGATAAAGGCGATATAGTAAAATGAGAAAATTAATAGAAAAGTAATAGAGTTGGATAGTAA AAGTGTCTACACTACTTGACGTGGACCTCAAATTTTATAACAAGTAGATTTTAAACTATTTTCATCCACAAGATGTGAGA ATTGGAGTTTTCTTAAGAAGTCTCACATCTATTAGTAAACCATTTTATAAAAGTTGAAGTTTCAGATAGGGTAGTGTAAA AATCTTTTAAATCCAAATCTATTATAAGCTTAAAAAAAATCTATTATAAAATGAAGAGTTAAGATTCAAAGCAATCACAC CAAAACAAAAATTCTTTTGAGTATCAAAGAGAGATAGAAGAAAGGATCGTATAGAGTAAGAGGAACATATGATTTCCAGG CACTAGTTAATTCAGCCGTTTATCTTTAGTTATAAGTGTCTGAGAGATTATTGTATTTGTGGTATCGTGATTTTTACACC TCACGTTGAAAACATTCTCAATGTGAGAAGTAAAAAACCACGAGAGCATGTTGGTGAAAATCTTCCACTATAAAGTAGGA TAACAAATACAGTAAATGTTCGTACGCTCACAAATAACTCAAGCAAAGCGATTGGATTTAACTTTTAAAGATAACCTAAT AGCTTGAAGTAAAAAACCTTTGAGTCCAAGCCCAGAAATATAGTCTTCATATGCATGAAGATCTTCCCCTTATTGTTAAG AGGATTTCTACTATCTCTCTTTTATGCTAAAGAGGATTTGTGTTTTGGTGTAAATTACTTTAAATCTCAACTTTTCATTA TATTTTGCATAGTAAATGTGTCTATACCTGATGTGGGATTTTATAAGAAGTTGATTTTTAAACTACTTTCATCCAAGAGA CGTGAGACTTGTTAGGAAAACCCCGACTGATTTGTTAATTTTGTCTTTAATTGGGGTTAACTTTAGAAGACCCACATCTA GTGGATTAAAATAATTTGTAAACCAACTTATAAAAGTTGAAGTTTCACATAAGATAGTGTAAAAACCCTTTCAATGCAAA TCTCTTATAAAATGAAGAGTTGAGATTGAAACCAAATCATAGCAAACAAAAATTCTTTTTAGTGTTAAAGAGAGATAGAA GATATCATACAATAGTTTAAGAGGAACATAAGATCTCTAGGCACAAGTTAAATTTAGTAGTTTTTCTTTATGTATTTGTG GTATTAAGGTTTTTACTCCTCACGTTGAAAACCTTCTCAATGTGAAAAGTAAAAATCCCAAGAGTATGTCGGTAAAAATC TTCCACATAAAGTAGGTTTAAAATACAATGAACTTTCATACGCTCCCTAAAAACTCAAGTAAAGTGGTTGAATTCAACTT TTCAAGATAACTTAATAGCTTGAAGTACAAAACCTTCGAGTCCAAGCTTAGATTACAGTCTTCATATGCATGGAGATCTT ACCTTCCCCTTATTCGCCAAGAGGATTTCTGTTTTGTGCTAAAGAAGATTTATGTTTACGTGTAGTTTACTTTCAATCTC AACTCTTCATTTTATAAGAGAGTTGGATAGTAAATATTTCTACACTGCCTGATGAGGGACTTCAGATTTTATAAGAAGTT TATTGTTAAACTACTTTCATCCACAAAATGTGAGAGTTGTTAGGGAAACCCCAATTAATTTGTTGGTTTTGCCTTTAATT GGGGTTTCCTTTAGAAGTAACATATTAGTGGATTGAAATAATTTGTAAACTAATTTATAAAAGTTGAAGTTTCACATACG ATAGTGTAAAAACCTTTAATATCTAAATCTATTGTAAAATAAAGAGTTAAGATTAAAAGCAAATCACACCAAAACTAAAA TTCTTTTGATAATTAAAGAGAGATAGAAGAAAACATCCTATAGAGTAAGAGTAACATAAGATCTCCATACACTATAAAAC ATGATATAATACAATAAATTTTAGATGTTTACAAAACAAGACAAGAAAAATGATTGAATCACACCTTTCAAACTGATCTG GCTACCTGAAGCTAAAGACCTTCAAGCTCGAGTCCTCATCTAAAACCTTCATATTCTCGGAGATCTTATCTTCCCCTTAT TCTCAAGGAAGAATTCCTATCTCTCTATTTTGTAATAAAGAGGAGAGGATTTGTGCCTTAGTGTGAGAAGGAAAATCCAC AAGACCAAGCCCCTGATAAACACATACATTAAATCATGATAAAATACAATAACTATCAGACGCTTACAAAATAAGACAAG AAAAAGGTTGAATCAGACCTCTCAAGCTAATATGGCATTCTAAAGCTAAAGATCTTCAAGCCCGAGTCCAGAGCTACAAC CTTCATATTATTTGATATCTTCTTTTCCCCTTATTCTCAAGTACGAATTCCAACCTCCCTTTTATAATAATGAGAATCTA TATTTTATTTTGAGAAGTAAAATACACGAGACCAAACCACTAATAAACTTACACGATAAGGCATAGTGAAATGTAACTAC TTTTAGACGCTTACAAAATAAGATCAGAGAAACGATTGAGTCAAACCTTTCAAGTTAATATGATAGCGTGAAGCTAAAAA TCTTCATGCCCGAGTCCAGATCTACAACCTATGCTTGGAGATATTCTCATCCTCTTATTCTCACTCTTTTATAATAAAGA GGATTTGTGTTTAAGTGTGAGAAGTAAAATCCACGAGACCACGCTACTAACAAACGAATACTATAAAGAATGATAAAATG CAATAATTATTAGATGCTTACAAAATAACACAAGAAAAACAATTGAATCAAACCTTTAAAGTGAATCTGATAGCTTGAAG CTAAAGACCCTCAACCCCGAGTCCAGATCTACGACTTTCATGTACCTAGAGATCTTTTCTTCCTGTTTTCCTCAAGGACG AATTTCTATCTCCCTTTTATAATAAAGAGGATTTACGTTTTAGTGTGAGAACTAAAATTTATGAGGCTAAACAACTGATA AACATACATTATAAAGCATGATAAAATGTAATAACCTTCCTACACTTACAAAATAAGACAAGATAAACGATTGAATCATA CCTTTCAAGCTAATATGACAACCTAAAGCTAAAAAGACCTTCAAGCCTGACTCCTGATCTACAACCTTCATGTGCCTCGA GATCTTCTCTTCCCTTTATTCTCAAGGACGAATTCTATCTCTCTTTTATAATAAAGAGGATTTGTGTTTTAGGGCGATAT GCTTTCAATCCAAATTCCTTATTTTATAAGCGAATTGAATAACGAATGTCTTTGCACTGACCGATGTGAGACTTCAAATT TTTTAAGGAAGTTGGTTTACAAGTAATTTTCATCTACTCGATGTGATACTTCTAAGCGAAATTTCAATAAATTTGTTGAG TTTCTCCTTAAAACTCTCAACTTTGCAAAATGT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0647100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGGTGGTTGCACTCGTTAGCGGCGGCAAAGACAGTTGCTATGCCATGATGAAAGCTATTCACTATGGCCACCAAAT TGTTGCATTGGCCAATTTGCTTCCGCTTGATGATTCTGTGGATGAGCTCGACAGCTACATGTACCAAACTGTTGGGCATC AAATTGTCGTCAGTTATGCTGAATGTATGGGATTGCCATTGTTCAGGAGGCGAATACAAGGATCAACAAGGCATCAGGAG CTTGGTTACAAAACAACTCAAGGTGATGAAGTCGAGGATATGTATATCTTGTTACGGGAAGTGAAAAGGCAGATACCCTC AGTTACCGCAGTATCTTCTGGAGCCATTGCATCTGACTATCAGAGACTGCGGGTGGAAAGTATTTGTTCAAGGTTAGGAC TTGTTTCTTTGGCATACTTATGGAAACAAGATCAGTCCTTGCTTCTCCAGGAAATGATTGCAAATGGAATTCTAGCTGTA ACTGTGAAGGTAGCTGCCATGGGTTTGGATCCTGCAAAGCACTTGGGTAAAGAATTAGCCTTCTTAAATTCTTATTTGCA CAAATTGAAAGAGCTATATGGAATCAATGTCTGTGGTGAAGGAGGGGAGTATGAAACATTAACACTTGATTGCCCACTGT TCACTAATGCTCGCATTGTGCTTGATGACTATCAAGTTGTGATGCACTCTTCAGATTCCATAGCTCCTGTTGGTATCCTT CATCCCTTGGCGTTTCATTTGGAAAGTAAGACAGATGTCCCGTCTTTAAAGTCACAAGACACAATACATGATATTTGTAT GCCGAAACTGGGATCTGTGTTTGAAGTGCACAGCAGTCTAGAAATATGTGAAGCTACGTGCAAGCCTGTAGATTATAGTG CTGATCCAATTGATGGTGTAAAACATAAATTTAACATCTCAAAAACGAATAACAAGAGCACATTCTCCATATGTTGCTGG TTGCAAGATTCAGGCAATGCAGGTTTGCAGGAAGATTTGACGATTGTTTTAGGGAAAATTGAATCACAATTAGCTGGCTT TGGTTTTGGTTGGGAGAATGTCCTCTATATTCACCTTTACATTGATGATATGAATAAGTTCTCTGAGGCAAATGAGACAT ATGTGAAGTTTATAACACAGGAGAAGTGCTCATTTGGTGTCCCATCCCGTAGTACAGTTGAAATGCCTTTAGCAGAAATG GGTTTAAGCAAAGCCTACATTGAAGTTTTGGTAGCAAATAATAAAGATAAAAGAGTTTTGCATGTGCAAAGTATTTCCAG TTGGGCACCTAGTTGCATTGGGCCATACAGCCAGGCTACCTTGCATGACTGTATACTTCACATGGCTGGCCAATTGGGGC TCGACCCTCCTACAATGAATCTTTGCAGTGGAGGCCCTGGTGTTGAACTGGAACAAGCACTCAAAAACAGTGAAGCAGTG GCAAAATGTTTTAATTGTTCAATATCAACATCTGCAATCTCTTTTGTGACATACTGTTCAAAACATGTCTCATCATCAGA GAGACTTGATATACAGACGAAACAAGAAACAAACCTTAGGAAGATGAAGATCTCTGAGTTACAGGAGGGAAAAACACGCA AAACATTAGAACCCATGTTTCTTTATATCCTCGTTCCTGATCTACCTAAAAGAGCTTGTGTAGAAGTGAAGCCTGTTCTT TATGTTGAGGATGGAACAGATGTTAAGATTGAGACCATAACAGAAAAGTCTTGCGCCAAGACATCATCTTGTTGGGGTTT CAAGCAGGAAAGTTGGCATGATTCTTGCATTCAGAAATGTGTGATTTCTGGAAAGATATGTTCTGTTATATTGTCTATTT CAAGTGAGCTGGCTGCAAAGATATGTTCCGATTCTCTTCCTGCTGATTATGTCAATAATGGTCAACATCCTCTACCCAAG GCATCAATGGAGAAGCTATTGAAGTTCTGCGTTTATCTTCTTGACACAGTTATAACAGATAATGACTTTGCCTGGGATGA TATAATGTGTTTGAGGTTCTACATCCCAGTGAGTCTTCAAATGTCAGTGGAGCTATTACAACCAATGTTCAACAATGCAC TTTCTGAACTTTCTGAGATGAGTCAGAAGAGAGTTAACAATGGCAAGGAGCCAATCTTCAACATAGTTCCTGTCATAGGT GCTGGTAGGTCTGCTTCATCCATGGATGATCTAGTAACCTGTGAATTACTGGCTCGGAAATTGTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0647100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKVVALVSGGKDSCYAMMKAIHYGHQIVALANLLPLDDSVDELDSYMYQTVGHQIVVSYAECMGLPLFRRRIQGSTRHQE LGYKTTQGDEVEDMYILLREVKRQIPSVTAVSSGAIASDYQRLRVESICSRLGLVSLAYLWKQDQSLLLQEMIANGILAV TVKVAAMGLDPAKHLGKELAFLNSYLHKLKELYGINVCGEGGEYETLTLDCPLFTNARIVLDDYQVVMHSSDSIAPVGIL HPLAFHLESKTDVPSLKSQDTIHDICMPKLGSVFEVHSSLEICEATCKPVDYSADPIDGVKHKFNISKTNNKSTFSICCW LQDSGNAGLQEDLTIVLGKIESQLAGFGFGWENVLYIHLYIDDMNKFSEANETYVKFITQEKCSFGVPSRSTVEMPLAEM GLSKAYIEVLVANNKDKRVLHVQSISSWAPSCIGPYSQATLHDCILHMAGQLGLDPPTMNLCSGGPGVELEQALKNSEAV AKCFNCSISTSAISFVTYCSKHVSSSERLDIQTKQETNLRKMKISELQEGKTRKTLEPMFLYILVPDLPKRACVEVKPVL YVEDGTDVKIETITEKSCAKTSSCWGFKQESWHDSCIQKCVISGKICSVILSISSELAAKICSDSLPADYVNNGQHPLPK ASMEKLLKFCVYLLDTVITDNDFAWDDIMCLRFYIPVSLQMSVELLQPMFNNALSELSEMSQKRVNNGKEPIFNIVPVIG AGRSASSMDDLVTCELLARKL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 1 | 241 | 241 | 2.07E-65 | – | |
| TIGRFAM | 1 | 231 | 231 | 1.1E-60 | ||
| Pfam | 1 | 230 | 230 | 1.5E-38 | ||
| PANTHER | 1 | 734 | 734 | 7.0E-268 | ||
| Gene3D | 1 | 157 | 157 | 1.9E-54 | ||
| CDD | 2 | 214 | 213 | 9.30277E-95 | ||
| Gene3D | 160 | 257 | 98 | 2.0E-28 | – | |
| Gene3D | 312 | 413 | 102 | 5.4E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 327 | 399 | 73 | 9.42E-9 | ||
| Pfam | 329 | 399 | 71 | 7.4E-7 | ||
| Gene3D | 414 | 562 | 149 | 1.8E-21 | ||
| SUPERFAMILY | 418 | 565 | 148 | 4.57E-15 | ||
| Pfam | 429 | 501 | 73 | 1.7E-7 | ||
| CDD | 436 | 560 | 125 | 5.10471E-26 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0647100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…