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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0654600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0654600.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein; TAIR: AT2G41050.1 PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein; Swiss-Prot: sp|Q12010|YPQ1_YEAST Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1; TrEMBL-Plants: tr|K7KEJ3|K7KEJ3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0654600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:121392919..121405129) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATTTTATTCAAAGGTAAAATCACTTATTTTTTTGTCTTGAAAACTGAATTAAGCATATCATCCAAACACGCTCTTAGAAC CATTCCATATATATACACAATGCCATTGCAGAATAGCTGTGGAACTTGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCGCCTCCACAAA AGGTGTTCATTCCTGGAATCCTTCTCATTCTCTCTCTCTTTCTCTTCCAAATCCAAAGTGACATGGTTGTGATTTTTCAT TTCCTTCATGAATTGGAATTCGATAGTTTTATTATTCTTCACCGAATTTGATGTTCTTAAGAATGTTCTGTTTCTTAGCG CTATTATTGCATTCTGAATATTCAATCTTTATTCTGATTCATCCCTTTTTCGCTTTGCTACCTTTTTGTTTCATCATAAC ATGAACCAACATCAAAGCAATTCATAAAGTGCAAACATTGCACATGAAAAAGGTTTTAGCTTTTTCAAGATAAACCCATG ATTCCTTTTTCTATTTGTTAGAGAATACCTTAACACTTTAAGCTTTTGAGATAATTGATTGTTTGACATGATATCCGAGA CTCGATGACCAAGCAGTCTTGAGTACGATCTCTGGCGCCCCCAATTCTTCTAATAAAAAAAAAAGAATTAAAGCACACGG TAGGCGGACATGTGCATTCTCCACGCTTCAAGCCCAAAAGGCTCTTGCGTGAAGGGGTGTGTTAGAGAAGTAATATAAAA TCATTCATGTGACCCTTACCTAACTTTTTGCGTACATGATTGAAATGTGCTTGATTGACAACTTTGGCTTTCTTCTGCCA CATTCTGAGTATCAATTGGTACTGCACTACTGCTAGTGATTGATTATTTGTTTCTTCATTTCTGGATTGTTGTAGGTATC AGCTCCTTTGGTGCAATGGGAGTCTTTGACTTTGAGAGCTCCACCCTCTCCCTTTGGACCAAAATGCATCTAAGCAGTGT GAGGGAGACAGCTTCTTTAACCTTAGGTGCAGTGAGTGTCTTTGTTTGGGTTGTTGCTGAGATACCTCAAATAATCACAA ACTACAGAACAAAATCAGCTGAAGGTCTCTCTGTCATTTTCTTGATCACATGGATAATTGGGTAAATTAGCTTTTCACTA GCATCTCCTGTGGATGCTTGCATTGAATTTTTTTTTTTATGGCATTTTACTATTATGATACAATTTATTTATATATTGTA GAGATCTATTCAACCTCTTTGGATGCTTGCTGGAACCTGCAACTGTGAGTGTCTCTAGTGTATCTTAAATATTTAATTAG CTTTCCTTCCTAATTATCGTCTCTATTAATATTCTACTCATCTTTGAATTCTTTGACTTTTGGATGATTTGGAAGGTCAA TTGACTTATAAATATTTCATTTGCACCATCAATTAACTTCTCTCTTTTTTGTTTCATATTGGGAGATATTATTCATTACT GTAGAATGAGATAGGAGAGAAGAGTTCTAGTATTGTGTGCGTGTGTGTATTTCAACTGAAAAACCAAGTCTTATCCAAAT GTATTGCAACTAGTATGTACCCATCCTAATACTAACACTAACATAGTCATTCCCTAAGATTCTCCAATAATTAGTCACCA AAATAAGACTATCGTATTTTTGTTATCTCAAAAGGCTTTTGTTGGGAAAATACATGTGTGCTCTCAATAGCCTGTAATGT ACTATCTGTGTGATAGTCGATTGCGTGTATTACTCTCATACTTAAGAATCTCTTGTTGGTTCTGATTTTTCAGTGAGAAA GATGGGCAACAAAATAGAAAGGAAAGAAAATAAGAACACTCCACTTGTGTTTACTGAATTACAAAGATTCTGAGTAGAGA ATTTTCACCTTTACTGATCTAACTTTCATAACTATCTATTCGATTTTGTTTGTTTTCCCTTTAATCTTCCATGCAAATAC 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AAGTTTAAAAAAAATGTTTTTGCTTGGATGGAATAAAAGGAACTAAGGAAGTTGTGTTTAAAGCTAAAATTACCATAGGG CACATAGTATAAAGTAAAGAACGAAATGTGTTAGAGACGCTCAGTTAGTGAGAGTCTGTTAATTAGTGGGTGGTTTAGTA AGTGAGGCATGCTGCCTATAAATAGAGAGTTTAGGGTGAGTATTGATATCTTTTGGATCATTTTGGGGTTTGGGACTTAG GGAGAGTGGCTGAGTCTCTTCAATTACTCAGCAACCTTGTGTTTTTCTACGTTCAATACATCCAGTTCCTATCCAAATGC ATGGTGGGAAGTACAGTAAAATGCAAGTAAACTTAATTTTATGCAATGGGACAGTGATTAAGTTTCTTATACTAAAATTT AAGTTTAGCCATCGTAAACATAATTTAAACCAACCAGATATTGTATCCAAGCAAGATGGGAACTTTTAAACCTCAATTCT TTGAATGATAAAGGAAGTCTAACAGAGATTGAAGATAAAACAAACAGGTTCTAACTTCTAAGTAGCCATTTGTCTGAGGT ATCTTGTAGTTATTTGCATACCGCAGATAATCCATATCATTTAAAGCACAAAAAATAGTTCTCTCTTTTTTGTTTTAGCT ACTATATTAAATTTTTTTTTTATTAAAAATGGTTTTATACATGCCAAGAGTTTTGTGGCCATTTTTTCTTTATCTCTTGG GTGGTAGAGGAAGTTACAAAATACACTGTCATAACTCCTAATTAAAACCATTTTAAAGAAAATTTGTCAACAATTGTGAA CTAACTGAGATACTTTCAGTAAACTCTAATTGCCTAACATATTATTTTCATTTGTATTCTATCATTCCAAACACGGGCAG GCTGAGACACTGACAAAAGTTGAACAAGTGGAAAAAGTCAGGGATGCTGAACAGAGTAAAGAGTTTGATTATTTCAATAG 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GTTGTGATATTAAGTGTGAGTAAGTCACACGTTGGAAGATAAGGACAAGTTTGAGCACTTTATAAGTGAGAGGACCCATA CACCCTATGCCTTAAGGTTTTGGGTGAAAGATGTGGTTTCCAATCCACTTGTGGTTTTGTCTTTAGCCCAATGTGATGAT CCCCCGTAGTTTTAAGCATCTCCTTTGTCCCTAACAAACCTTTCCCATGTACTTTCCCATTCCTGGTGAATACATGACAT CCTTGTGCCCTTACAAAAGACTACAACGTCTGAACCAGTTAGTGCCCTCTGAATGTGTTATTCAAAATCTGAAACTTCTT GGTTATCAGTTGGCAATGACTAGGTCATCGTCGACTATGGGTGAGATAGTGACTTTAGATGACTAAAGATTCAGTCTTAA GCAGTATTTACGGTTATTATTAGATAAAAAAACCACTCAGATACTTTCAGCCAATAGCTTATGCTCTTGCAATAGAAAAT TCATAACATGGTATCAAAGTAGTTATGTTCATGTAGTTTAAAATTCAATCCTTGTTGCCTTCATTCTTCTGAAAGAGACA TTAAATTTCAGCATGATATAGGGTGGGCCTGTAGATAGTCTGTGAATAAAGTCCAAAGGTAACATGCATGAAATATAAAA TCACTCATGACTCATGAGCTTCCCCTAATAGCTTAAGCATTGAAATTTTTGGTTCATAACTGTTAAATTGATTTTAAACT TTCAAGTATGTTAAAACAAAACTAAAATTAAATATACTTTTCCCTATTTATCTTGTCATCAATTCATATGGCAATTGCAG GTTAGTTGGGATCGGTTGTCAGAAAATGGCGAGTCAGGAAACAATAGCATTGGGACCTTCCTCGGTTGGGCAATGACATT TATGTATATGGGTGGAAGACTACCTCAAATTCTTTTAAATGTGAGTTATGTATTTATTTTCCAGTAGCTTAGGTTGGACA ACAGAGAAAATATCTGTTACTTCAGATAAGATTTTTTATTCTTTAACTGGTAATGAACTTCTTTTGTTAGTATATACTGG TAATGGACTTCAGTCATTCATCACGCCACTTATGAAGAAAATAATAGAATACAGAATGTTTTCCACATACATATACTAGA CAAGGATAAATGATAGTTTTTTGTTTTGGTATATTCCATGAGAACGTGGCCCATAGTATATTAGAAATTTTTAAATCATC TATAAGCTCCATATTATATTAAATCATGCACTTTAGCGGATTGTTTAAATTGATGCATTATTGTCATCAATTTTGCAGAT CAGAAGGGGGCATGTTCAGGTTAGGACTCGAACTATTAAAGCTATGATCTTATATGTATTTTATTATTGTTTATCATTAG CAACTGAAAACTCTGAGATAGAAGTATGGCAGAGAAATATCCTCCCTTCACATATCACTCTTATGAGAGCAGTAAAAGAT ATATATTGATTAACACATAGGGCAAGAGTTTAAAGTCTTTTTTTATGTGTAGGGCCTCAGTCCTTTCATGTTTCTATTTG CTTTAATTGGGAATGCTACTTATGTAGCAAGGTATGCTTCCGGTTTATATTATCTTCTCTACTTTAAGTCTGAGCACCAA AATGGTGTTTGCCAATTGAAAATATAGCCAAGGTGTGAAATTATCACATATATTCAACGAACATGTACTTTGTCTTTTTA TGCAGCATACTTGTTATCAGCTTGGATTGGTCAAGAATCGGACCAAATCTTCCATGGCTGGTAGATGCAGGAGGATGCGT TCTTCTTGATTCTTTTGTATCCTTTCTTCTATAGCTATCTTCTAACAAATTGTTCTTGCCACTTGCCAGAGAGAAATGGA TTCTACATAGTAAAAGTTATCTGTAGGATCAGGTAAGATAGCCTCAGAGATTAGCTTATGAACTTAAAAACGTATGTATA 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TTTTGTCTTAATGTGACTACAAATAAAGCAAGAAAAGGATCCTGTCTCAATTGGAAAAAGATGATCCAGCTTGGAACATG TAAGGCTTTGAGATTCATTAACAACTACAACAAAAGTTGTACTATTCTGGAACTTTAATTATCAATATTGATTGGAAGTT TGTTGGGCTATTTGGAATACTATGTAATGAAGGTTAGTTGTGTTTTAGCAAAGTAAAAAATGACAAATAGGAATTTAAAA ATAAAAAAAGAAAAATCGTCAAGGATGAAGTCATAAATAATGCTCTGTTTGTCTCCATCATATGTAGGTAAGCATGAAAA TTCAGAATTTACGCAGTGTCTTAATGATCATGATCAGTTATCAATTTTAAATCCAACATAACTTTGATCTGTTCAAAGCT TGGATCCCACGTCAAGCTGTGTTTATAAATTCATCTTGTATTTTTTTATAGAATAAAGAATACTGAATGAAAATATCTAC TCATGGAAATTTTGTTTTCAAAAATATTATGCGTCCATGACCCAACAAAGTACACGACAAATTTGCGTTATGCTATCTAT CAATGAATTTGAGATAATTTTCATGCAAAATGTAGAAAAGGGCATGTATCTTTTTGTGAGCTTTAAGGCATTTAGGGTAT CTGGTGTTCAAACTGATAGAGTCCCAAAATTTCCAAAGCTAGGTTCTGTAGAGCATTGGTTTGATATGGTATTAGTCATC AAACAGTATCTAGAAGCTTGGCAATTGGCATGTCTTTCTGATTCCAACATTGTGAAAATAGCTTCTCTCCAAATTCTTGT TTGGATGAATGTATTGTTGTTTACTCAGATAATTAATGTTTGCTTTTCATGTTATTTAACAGCATTACTCATGCATTACC ATAAAGTATCTGTCAGCATTGTGCCAATTGTGCAATTATATTCTGCTTTATAATGCTGTCTTCTGTAGTTCATTTCACTT TCACTTGACCATAAATCTTACTGATTTTCTCCAGATCTTTATCACAGCAAGATTATTTCATAAAGCTGACATGGATGTTG ATAGCAATCTTTTAATCTCCACCAATTTGACCTACACATGTGAGCATGAAGCTGAATTGGTGAATGGTGATAACTGATTA ATTGTTGCAATAATCGGCCTAGTGACTAGAAAAAGGAAGTGATTCTGATCAATTTTGTTCTTGAGGTTGTTGCTTCCATT TTGCATTCCTCCTAACTTTGCTATTTGTTTACCTTGAGAATTTTGGCCAGATATTATAAGAATCAATTCATTTTTACTTG TAGATGCCCTTTATGAAGACATTACTTGAGTTGCCTTCAACTTTCAACCAGCACTCATGTTTTGTTGACCTAAATCTATT GACAACTAATGGAAAATTGTGCAATATGCTGCGATTTATGAAGTTTGGCTCTAAATCTGACTGTCCTTTACTAGCATTTG CTGCACATTGAGCTAAGATTTGTAATCAGCGCTCAGCAGACATGGTCAATTAGGCATCCTCTGTTATTATGATCAAATTC TGTTCACAACCCTCTCTGACATTGTTTGCATTTGTAAGGATCTTTCATCCTTTCTAACATAAATTTTACTGTCTATAGAA GCCAGCTTTCTTTCGACATTCAACTCAGCTATTACACAAGTAATTTAAATATAAGAAATAATCTTAGAGAATAAGGATGT TTTTTAGGGACAAAACTTACTTATAGGAGTACATATACTATACGTACTGTTTTTGTTGCTGATGAAAAATTCAATCCCCA CTTTCTTGATAACTTATCCCAACTCTTATGTTCCAAGGTATGTGTCATGTTCTAATTTGACAGCCGTAAAAATAACATAT TGTATCTAAGTCTTGTCCATTTTTTTGAGGGGTTTTGCGGAAATGGATCCCCTGCCATCACGAGTTCCCTAAATTCACAG TCTATGTATACTGTTTGATTGTGATGAAAAATCTGAGCCGACCAATTTAATCGGACAGCTCAGATATCTTAAATGTGTGA ATGTTGGGTGGCTCTGATTGCAGGGAACCCAAATCCGACTTTCCTGGGATGCAACCTTTCATGATTTATGTAGCAGGGGC AACTATTTCATGTACTTGTTTTCATAGGCTACAAGATCTTCAGTGGTAGCCTTAAGTGTGGGAAGCTTCACCCTTGGGGC TTCAGTGGCACCATAAGAGCCTTGAGGGCAGAACACAATGTACACTGATGCATCACGACCAAGTTCTAGATCATACACAC GCTGCCCTGCAGCATATTCCCCCATAAGTTGGTAAGATCTTTCTGATTGATCCATTGCAACACAAATGTCCTCACTACCT GTTCAAATTCAAAGGGGTTAAAAAAACAAATGCAATTTCTTCAAAACCAAACAGACCACTAGCAGGTTTGGATCAACTTA TTTTTCCTCAGAATCAATTCTGGTACCTAGAAGCTACTCAAGCAGCTTCTCTGCAGAGTTGATTTTGACTCAATTGTAGA GGGAATTCCAAAGACAGGTTGGAATTACTCACATGCTGCAAATTCTATCTGAGTCTGGTAAATAAAATCCAGAACTGCTG AAATCTCTTTCTCAAACTTATGGAATGGTCCATTAGAGAACTCCATCTTTCTCAGTTTACAAAGTCCCTCCCCCAACTCC ATCATAGCTCCTTTATGATTCTATTCAGACCAAGAACAGATTTAATTTTGACAACAACAAATAATCCAATCAAAACCATA CCATAGATAAAATGGAACATAACAAGACACAAACAAGTGATAGATAAAAACCTGGTTGGAGAGGTGATGAAAACCCACTG CACATTGCAGTATCCCATGAATCAGTGTTCTGGTGGGGTCTTCAGCATTGTGCCACAGGGCTTCAAGATAGTCATGGCAT TTGTAAAACTCTCCACCATTGAAGAGAGTCATTGCTTCATCAAAGGTGTGATTTTCATCAGCATCCTCATCTTCATCATC TTCTTCTTCAGTGAAATACCTGTAAGAAACAGCCAAGGGTTTGGTGTTTTTGCTTCTGTGATTCTGGGGCTGCTTTGAAC ATGTCAGTGAGTTGAAAAATGGTGGAATAAGAGGGATGGGATTATTGGGAGGAAGTAGGAGACAGCGTAGGGATGAGGTA TGGAAAACAGTTCTGAGAGAAGGGGGAAGAAGAGCCATAGAGGATGAATGGTGAGAAAAGCATTCTCTGGTTTAGTCATA TTCCCATTCATTCTTTATGTGGTGGTGGTGAAAGTCAGTGGCAAACAAGAAAACAAATAGTTTCTTTGCACTCTTGATTA GTATTTTCTCATATGACCACTTAAAAATCTCATGCCTAACTTACTGACTTAATTTTGATAATTCATTATTAGATTTAACA ATTACGATTTATTCTCCTCATTCTCACACAACACTATTCTGATAAATTACATCCTATACTTTTTTTGTAGTGGTAATTGG CGCAGTTCAATTTAGAACCATAGAAGATCGTGATTCACATTTATGTCTTTTTTGCGGTGCTATAAAATTAAAAGAAAATT TTTTTATATATATTATCATGATGCGGTTATTATCATCACATAGTCCAAAAT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0654600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGAGTCTTTGACTTTGAGAGCTCCACCCTCTCCCTTTGGACCAAAATGCATCTAAGCAGTGTGAGGGAGACAGCTTC TTTAACCTTAGGTGCAGTGAGTGTCTTTGTTTGGGTTGTTGCTGAGATACCTCAAATAATCACAAACTACAGAACAAAAT CAGCTGAAGGTCTCTCTGTCATTTTCTTGATCACATGGATAATTGGAGATCTATTCAACCTCTTTGGATGCTTGCTGGAA CCTGCAACTATTCCAACTCAATTATATACGGCAGTGCTGTATACAGTTATAACCGTTGCACTTGGTTCACAACACATTTA CTATGGTTACGTATATCCTCAATTAAAATACAAGAGACAGCTCGAGGCTGAGACACTGACAAAAGTTGAACAAGTGGAAA AAGTCAGGGATGCTGAACAGAGTAAAGAGTTTGATTATTTCAATAGAGGCACAGGTCGGAGTTCTCCTATTTCTCTTCCA GCACCCCCTCAAAGAATATCTACCGGAAGAGAATTATTCTACCAGTCAGCAAGATATCTATCCAGGAGTCATACTCCAAC AGCAGGATCCATCTTAGCCCAAAGAATGGCACCTAGTTCTCTTAATTTAGATTCTATACATGAGAACTTGCTTGGTTCAG CTGCTGCCACACAATCTGCACCAGCTTTGAAGATTAAAACTACTTTTTGTATTGTGTCAGCATTAACTTTTCTTGGTGCC ATCAATCTGCATCAATCCCTGGATAAAAGAATTAATCCCATGTTCTCAAACCCAAGACAACAATTTGTGATTTATGTTGG ACGAAAGCTTTTTCAGGTTAGTTGGGATCGGTTGTCAGAAAATGGCGAGTCAGGAAACAATAGCATTGGGACCTTCCTCG GTTGGGCAATGACATTTATGTATATGGGTGGAAGACTACCTCAAATTCTTTTAAATATCAGAAGGGGGCATGTTCAGGGC CTCAGTCCTTTCATGTTTCTATTTGCTTTAATTGGGAATGCTACTTATGTAGCAAGCATACTTGTTATCAGCTTGGATTG GTCAAGAATCGGACCAAATCTTCCATGGCTGGTAGATGCAGGAGGATGCGTTCTTCTTGATTCTTTTATTTTAATGCAGT TTATATACTTCCGCTGTTGGACCTCCTCACTCCTATAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0654600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGVFDFESSTLSLWTKMHLSSVRETASLTLGAVSVFVWVVAEIPQIITNYRTKSAEGLSVIFLITWIIGDLFNLFGCLLE PATIPTQLYTAVLYTVITVALGSQHIYYGYVYPQLKYKRQLEAETLTKVEQVEKVRDAEQSKEFDYFNRGTGRSSPISLP APPQRISTGRELFYQSARYLSRSHTPTAGSILAQRMAPSSLNLDSIHENLLGSAAATQSAPALKIKTTFCIVSALTFLGA INLHQSLDKRINPMFSNPRQQFVIYVGRKLFQVSWDRLSENGESGNNSIGTFLGWAMTFMYMGGRLPQILLNIRRGHVQG LSPFMFLFALIGNATYVASILVISLDWSRIGPNLPWLVDAGGCVLLDSFILMQFIYFRCWTSSLL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| PANTHER | 14 | 382 | 369 | 2.5E-154 | – | |
| PANTHER | 14 | 382 | 369 | 2.5E-154 | – | |
| Gene3D | 24 | 118 | 95 | 1.3E-8 | – | |
| Phobius | 25 | 43 | 19 | - | – | |
| Pfam | 27 | 82 | 56 | 2.5E-20 | ||
| TMHMM | 28 | 50 | 23 | - | – | |
| SMART | 40 | 71 | 32 | 7.0E-13 | ||
| Phobius | 44 | 54 | 11 | - | – | |
| Phobius | 55 | 76 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 57 | 79 | 23 | - | – | |
| Phobius | 77 | 87 | 11 | - | – | |
| Phobius | 88 | 110 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 89 | 111 | 23 | - | – | |
| Phobius | 111 | 227 | 117 | - | – | |
| Phobius | 228 | 247 | 20 | - | – | |
| Phobius | 248 | 284 | 37 | - | – | |
| Phobius | 285 | 303 | 19 | - | – | |
| Pfam | 289 | 348 | 60 | 6.4E-17 | ||
| SMART | 303 | 334 | 32 | 2.8E-9 | ||
| Phobius | 304 | 323 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 323 | 345 | 23 | - | – | |
| Phobius | 324 | 344 | 21 | - | – | |
| Phobius | 345 | 355 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 355 | 377 | 23 | - | – | |
| Phobius | 356 | 377 | 22 | - | – | |
| Phobius | 378 | 385 | 8 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0654600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…