Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0655500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0655500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Alpha-L-arabinofuranosidase 1; TAIR: AT3G10740.2 alpha-L-arabinofuranosidase 1; Swiss-Prot: sp|Q9SG80|ASD1_ARATH Alpha-L-arabinofuranosidase 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0KHR7|A0A0R0KHR7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0655500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:121510154..121518841) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCTCACTCATATACACTTGAGACTCGGATCTGTGGTAATAGTTGACCACTAGTAATTTATTGAAATTTATCCTGTTAAAT TGTCTATAAATACCAGCCAAAAAGAAAAATAATGAAACCAGTACAGCTAATTAAAAGAATGGCTTTCTCAAAGACTTGTT GTGGTTTTCTTTCTCTCTTAGTGGCATGTGATCTTGCCTTTCAATGTTATGTTGCTGATGCTGCTGGAGATCAGACTTCA ACACTAACTGTAGATCTTAAATCTGCTGGAAGGCCGATTCCCGAAACTCTCTTTGGAGTATTTTATGAGGTTGGAAAGGG TTATAATCTTTGTAGATTCTTCAAATTTTTCAAAATGATAAGACATCAGAAAACATCTTAATTATGCCTTTCCTACTGAA ACTGAATTGATAGATTAGATTGGAAAGTTTTTTAGTTAAATATTTTTAAAAGTTTACTAAATTTTGAACTTCTTTAACAG GAAATTAATCATGCTGGCACCGGCGGATTATGGGCAGAGCTTGTGAACAATAGAGGTAACTAGTTTTCATATGAGTTTAA TAATTGTATGTGATCAGACACAAACATTCAATTAGGTTTTGTCGTATCATAATTAATAATTAATTTTTTTTTGAAAGTTG TAATTATTAATTAATTATTATTAATTAATAATTAAAATTGAAAAGTGAAAAAATAAGATATGATTAAATGTCTGTATAAA AATATATTAAATATTTTTTTGGTACTCTCAAAATCGTAATGATATCAAATTTAAGCAGAAAACATTTATCTACCATAATT CTTTAGAGCTTATGTTTCATTTTTATATGTCATTTCAACCTCCTCTTGCTAAATGACAAAATTAAAAAAAAAAAAACTCC AAGACACAATTTTCAAGTCTATTGAGAGTTCTAGAAATGATCAATAAGTTTAATCATTTGCTCCCAATTGCACAATTCTT ATATAAATTTGTGTTTCAGGTTTTGAAGCAGGAGGCACGCAAACTCCATCAAATATTGCCCCTTGGACTATAGTTGGAAA AGAATCCTTAGTTTTGTTGCAAACTGAACTTAGTTCTTGCTTTGAACGCAATAAAGTGGCATTGAGAATGGATGTGCTTT GTGACCAATGTCCTTCTGATGGTGTTGGTGTCTCTAATCCAGGTTATTGGGGCATGGTGAGAATAACTATTTAATATGTC GCATACAACCTCCTATCTCTTTGTTGTTTTGTTGTTCTTTCTTTAATTGATACTAAAAGTAAATTATTCGATGTGTTATA TACTACACGATATTTTTAAGGCTTAAATGCACTTTTAAACCCCCAAATTTACATTTTTTTGTAATTGTTGACCCTAATCT TATTTTTCTACGAAATGAGACCTTTTCCAGGCAATTTGCATGTAGAAGATGACTGGTCTTTTTTGCTTGGAGAGGGTCTC GGTTCGTAGAAAAATAAGATCAGGGTCAACAATCGCAAAAAATGTAAACTTGGGGTCAAAAGTGCATTTAAGCCTATTTT TAAATATATAAATATAAAAAATAATAAGAGATAAAATATTTAAAATTACGAAGGGTATACATCTAAATCATGGAGATGGA GTTTCTTAAATTAAAAAACTACAAAACAAACTATTTGAACTAAAATATTATATCGTTTGTCCTCGAAGTATAGCTCAAGT GGTAAGAGTTAAAGGACATATGAGTTGGGTGGGGAAGGTTCAAGGATCAATCTCTAGATGATGTAATTTATATTTCCAAT GTAAAAAAAAATATTATATGGTTTGTGTATATGTGTTTCATGTGATTAATATGTTAATGTTTAAATTTTAAGTTCTGAAT TTTTTTTAATATTGACAATCTATGATTCATAAAACAAGTAATAGAAAGTTTTTTTCAAAAAATCATGTAAAATAATAATA TGTGAGATATTTAATATTGCAGCCCAGATTTTGGCTAGAAAACCTCCTTAGTCCTTGCTGAGGGAGGTTCGGTTTCTTGT AGGTTTTTTTTTCCGATTTTATTGGTTGGCTAGGGTCGGTTGTTTTTCTTGGGTCCTTAGATGGGTTTTGTTGGTTGTTT TAGCTTCTAGTCAGGTTTGTTTAGGCTTTGGGGTTGGGTTTTTTGGCGTATTCCCGGGCGCGAGGTTTTTCCTTGGTGGT TTTTCGGGCTCTTTCGAGATTGCTTCTTTTTTTATCCTTATGAGGAGGGTGTAAATCTTGCAAATTTCCTCATCTTTTAT TAATACACTTTTTTATTTTCGAAAAAAAAGAAGTTATGTAGTGCACTGGAAATGAGAGGAGATTATAATAAACTTATATA TTCTGGATAGAAAAGTTAAAACTTAACAATCGATTATATGTAGATTTGTGTCTTTGAAACAAGTGTTTCTTTTGCTTAGG AGTTTACTTTTCTTCATTACTAGGATTGAAATACTTTGCATCTTTTAACAACAAAATCTTGTTGCAGAATGTTGTGCAAA AAAAGGAATACAAAGTTGTCTTCTTTGTAAAATCAACGGGGTCGCTGGATATGACAATATCATTTAAAAAAGCAGAAGAT GGAGGGATATTGGCTTCTCAAAATGTCAAGTGAGTACCATGTTTTACCATCCAAGAGGAATTTTTTTTTGGAATATCAAA TATTGATTAAGAGGTAAAGGGTCTGGCTATAAACAAACAAAAAAAAGACCTTGAAAATACATGTCAGTTATGGGGATAAC AAGAACAAAAATCCCAAAATTTCCAAAGGATAAACCAAACCCCAAACCACCCTCAGAGGAAAACAGCAAAAGAATTAACA CTGAAATAAAGAGCAAAAGCCAAAAAGAACCACAAAACAAAACCAAAAGACATGAACCACAACCAAAGCCAAAAACAAAA GAAATCCCTAGTTTCAAGGAGAGGCCACCACTCCTTCATTTCTTTTACTAGGCCACAAGTAACCTCCTCATCACTTTCAT CAAATTCCAAACCAACAAATTTGGCAACAAGTCACGCCTTCTTTTCCCGCGTCACTTTCATTCAATAAAAATCATATCTT CAATAACTTACAAAATGTAGTTTCTTGTATAAGATATTTTACAAAATTATTAAATGATATTGCAGAGCTTCTGCATCAGA AGTTGCAAACTGGAAAAGGATGGAGCTTAAATTGGTACCCACTGCATCAAATCCTAAGGCAACTCTTCACTTAACAACAA CTCAAAAGGGTGTCATATGGTTAGACCAAGTGTCAGCTATGCCCGTAGACACTTTTAAGGTATGTCCCATCATGAATTTT CTCTTATATGATGAGACTTTTCTAGCTACATTCTCAAGCTCTAGCTTGAACATCATAAACTTTTTGTAACATTCAAATTT TTTCTTCTGATTATTTTCATTGAAAATTTAACTTAAACATGTCTTTGGTATAGGGACATGGTTTCCGAACAGACTTGGTC AACATGGTCTTAGAGTTGAAACCAGCCTTTATCAGATTTCCGGGTATGTATATAAAGCATAGTAAAATTCAAATATTTAA AAATATCATGTTATCGTATCTTTAGGGATATTTCTAGTAACTTGCGAGAATTTTATTATTTTTCTAAGAAAAATTGGTCA CTCTGAATTTTTCTAGAACAAAATTAAGTAAAAATATCAGGTATTTGGTGCATTATAAAGGTCTTTCTAATATAATATAA AAATTTAAACTAGATTCTTTTGAAAAATAATTTATGATAGAAAATAGTTAACTTGCAATGATAAATAAACCACAATATTA AAAAGATATTAAAACCTTTTAATTCTTAGAAAATAACTTTCAAAAAAAAAGAAATTTCTTAGAAAATAAAAAATATTAAA CTTGCGAGGATAAATAAACCACAATATCATTAAATTTAAAAATAAAAATATTATGACTAATATATTCTAGTATTGGTTAA AATAAAAAGAAAAATATCATTTGATTGAATACTAATTAAAGAAAGAATTAATATTATTTTTTTATATTTAATATGAAAGC TTTAGAAAAATGTTGTCTTGTGAGCAAGATACATGTCTCATTGAAAAATAAATATGATAAAGTTGGTACTAGAAAGATTA TATATCAATGAAGGCATAAATAAATTTACTATATTTATTTAAACAATATAGGATCATTATTTTATTTTATTTTCAGACAT ATAAGTGATCTCCAAAACTTTATCTTATTGAACAATAAATATTAAGAATCTATCTATATATATTAGAAAAGAACAACTTC TAGCATGACGTGTCGCTCCCACAGGCCAAGTTAGTGACGTGTCGCTCCCAGATTAATTCTCATAAAAATTATTCCACGTG TCAATTTGTTAGAGGATATAATTTTCAATTGATATATATTTTAATTTTATATATTCTAACCTAATTAATTGATATTATTT TAGAAGATATAATTTTCAATTGATATATGTTTTAATTTTATATATTCTAAAATAATTGATTGATATTATTTTAAAAGATA AGATTTGGTCTCACCACAGTCCTTTCAAATTGGTGAAAGAGGGTATTTTGTTCTTCAAGACTTCATTTTAGGTTTCTGTT TCAATCTTCTTCATGAATTGATTTTGTTCTTCAACTAATTGTAAGATGTCATATGCTTTAAGGATTCCTGCTTTTATCTT CTTAATCAAAAGCAAAAGGATTGAAGATAAGAAAATCTTTTAGGGTGCAGAAGATTCACTAATTGGAAAAAAAATAACAC GTGTCATTCTCAGATTAATTCTCATAAAAAAATACATTTTAAAATTTTAGATTTGATTAGGATTTATGTTGTTTATTTCT TGATTTTATCTTAATTTATTTTTGATTTATTTTTAGAGTAAAAAAATACATTTTTAAATTTTAGATTTGATTAGGATTTA AGTGTTTTATTTCTTGATTTTATCTTAATTTATTTATTATTTATTTTTAGAGTATTAATTAATATATCCCAAACTTTTTT TTTAAAAAGAGTGAGTTTGAAAGCTATAGCTTAAGTTAATTTGTTAATATATTCCCAAATAATAATAATAATAATAATAA TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACATGTGTGTGCAGATATGGGCCGGTTGGGTACTAT AGTACCCATACCTGCACCCATACCCTCTAAAGGTGGAGAGCTTCGAGTTGCTACCCACGTGAGTATGGAGACGGGTACAT GTAATTTTTAAAAACGCGGGTATGGAGATGGTACTATAGTACCTACCCATTGTCATCCCTACTTAGTTGGAATAAACACA ATAATGTTATACTTTATGATATATCTTACACAATCCTGATTTGTGCTACTATCACATTAATTTTTTTTTAAGATTAATAT GTTGATAATTCCTTATATCTATGATTTGTGTTATCGTCTTCATATTTACAAAGAATGTGAAACGAGTTCCTCTTGGTCTC AATCGGGCTTAGAAGATAAGTCTTTATGTCCACTTTACTCATCAATTCTTACTTTTCTATTTCATTCGTTGTTTAATATA TTTTTAATAATCAAAGTATTAATTAATGTATCAAATACAATAGACATATTTTCCGTGCAACGCGCGGGTAAAAAACACTA GTAAGAATGAATACTAAAAGACAAAGTACACTTTTTGTTTTTCTACAGGTGGTTGTTTTATTGAAGGACAAACACTTAGA AACGCTTTCCGGTGGAAGGATAGTGTTGGACCATGGGAAGAGAGGCCTGGGCACTTTGGCGATGTTTGGGGTTCGTGGAC AGATGAAGGATTAGGTTATTTTGAAGGTCTTCAGGTAGGCCCATTTACTTGGATATAGACTGATGCCAATCATATTTTTT TTCTTTAAGAAATTCAATAGCTATTATACATTATATTCCTTTTGTAGCTTGCCGAGGACATTGGTGCAAAGCCAATTTGG GTATTCAACAATGGTATTTTCATGTTTATTTCTATCATTTTTGTTTGAGTTTTAGTATAGATTTAGAACCTTTGGTGACT TTAGCCTTCTGTTTGTGTTCAATTTCATGTTAAAGGCATCAGCCATACTGATCAAATTGATACAAGCGTCATCACACCTT TTGTCCAAGTATATTTTCTAACTCTTATTTTCCCATCCATTTTCAATTCTTTATCAAACAATGATATAATTTTTTTAATA ATATTATCTTTTGCTTAACGTCAATTTCAGGAAGCCCTTGATGGTATTGAGTTTGCCAGAGGTCCAGCCACTTCTAAATG GGGTTCTCTTAGAAAATCAATGGGGCACCCAGAGCCTTTTGACCTAAAGTATGTTGCTATTGGAAATGAAGATTGTGGGA AGAAAAACTACCTAGGTATGCACCCTTTTCTTTTTTTTTTACTGTCTTATTACTTGTCCATTGGATTCTACATACCCTAC ACGACTCTAGACAAATCCTTTTTATTCAAAGTTGTGTGAATACTTATATTAAATATTTCATGAATGAAAAAGATGAAATG AGATTAAACTAATATTTTTTAATTGTTTATTTATTAGGAAACTACTTAGCATTTTACAATGCTATACGAAAGGCTTATCC TGACATTCAAATGATTTCAAATTGTGATGCTTCTTCCAAGCCATTGGATCACCCAGCTGATTTGTATGATTATCATGTAA TATCTCATCTCTTATAATTGACTCTCATTTGACCAAAATAAAATAAAATAATTGACTCTCATAATTTAAAGTTTCATTTA CATTAAAATATAATGTGTATTTTTAGTTTTCATTTAGCCTTTCATCATCCTCTCACATTCTCTAAATTTCTTAACAGACA TACCCGAATAATCCTTCAAACATGTTCAACAACGCACATGTGTTTGATAAGACGCCCCGCAAAGGTCCAAAGGTATTTGT GATCCTCTTGAAACTCTATATACGATATCTTATTATGCACTTTGACACTTGAATTAATACATATGGTGATTTGAAACCGT GCAGGCTTTTGTGAGTGAATATGCTCTAGTTGGAGACCAACAAGCTAAGCTTGGAACTTTAATAGGAGGTGTCTCTGAAG CTGGGTTCCTTATTGGATTAGAAAAAAACAGGTTGATTTACGACACATTTATTAAAATATAGGAGTTGGTTACTTTATTA TTTTTAAAATTATTATATTGATTTGTACTTACAATTCTTTTTCTCATTTATGATGCAGTGACCATGTAGCAATGGCTGCG TATGCACCACTTTTTGTAAATGCGGATGATAGGAAGTATGTCTATTATATCTCGTAAATCTATAAAATAAATATCTCATT ATATACATGAAGTTATTAAAATAATAGACAAAATAGCAATAGAATATGCAAAAATATTTTACAATAAAGATTGTACTCGA ATTTTGAATTTAAATACAAAAGATAATAAATTTATAATTAGTTAGTAAAGTGCCTATTAGTACGTCAAGGCAATAATGAG ATGTAATTTTTTTACATTATAGGTGGAACCCGGATGCAATTGTTTTTAACTCCAATCAAGTTTATGGAACTCCTAGCTAC TGGGTGACACATATGTTTAAAGAGTCGAATGGAGCAACATTTCTTGCCTCAACACTTCAAACACCTGATCCTTCCTCATT TGATGCATCAACAATTCTTTGGCAAAATCCTCAAGATAAGAAAACTTACTTAAAAATAAAGGTAAGACAGTTTTATTCTT TTGTGTTTTTTAGCTAAATAGTTATAATAGGAGCATACTTGTATATCTTCCAATATTTTGATCTAATATTGATTTTTTTA CTATAACTTTTTTCACATGATATACTCACAATTGACATGATTAGGTTGCAAACTTGGGTAACAATCAAGTGAAACTCGGG ATTGTAGTTCACGGACTGGAAAGCTCAAAGATAATTGGGACAAAGACTGTGCTCACATCTAAAAATGCATTAGATGAGAA TACCTTCTTAGAACCAAGAAAGGTGTTGTCTTTCTCCCTATATGAACATATTATGCATATTTAGGCCAACATAAGGGTCT AATATCTAGTTAACTTAAGTTTATATATATGTTTGATAAAAAAATCTTATGTTTTTTTGTTTATTTTGTATACAGATCGT GCCACAACAAACTCCACTTGAGGAAGCAAGCGCAAACATGAATGTTGAACTTCCTCCTCTTTCAGTTACATCATTTGATA TATTAAAGTAGATAGGAGTATTTTACTTCTTAGAATGAATGAGGGGTCAAGACTAAAGCTTAGTTAAATAAATGTATATT TCTTTTACATAGATAAGATTTTAATTTAGCTCTTTCACAATGCAACTCATAAAGAAACAAGTAGATTATGCGATCAATTT TTTTAACAGCAATACTAACTTGAACTTAAGGGCCGCAATATCAAAGTTCTTTAATTATGTTCCGCATATTTCCCCTGTTT CTACCATCTTTTTCCCCTGTTTTTTGTAATCATGTTCTCTTTGTGTTGCTTTGTCTCTTTATCAGCTTGTTATTTCTCTA TTGTATTTGGGCTTTAACACTTTTTATGTTATATTTGAATGCAATGATTTGACTAATAAAAAAATATTCCGCGAATTTCA TTTTCTTATATATATTACAAGACTATATTGGGATGTCATGTGTTTCATTGCACTCGTGACTAAGGCCTTGACGAAAAGTC CTACACATTCCAAGTTTATGAAAGACATTTTGTCAAATACGTACGAGG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0655500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAACCAGTACAGCTAATTAAAAGAATGGCTTTCTCAAAGACTTGTTGTGGTTTTCTTTCTCTCTTAGTGGCATGTGA TCTTGCCTTTCAATGTTATGTTGCTGATGCTGCTGGAGATCAGACTTCAACACTAACTGTAGATCTTAAATCTGCTGGAA GGCCGATTCCCGAAACTCTCTTTGGAGTATTTTATGAGGAAATTAATCATGCTGGCACCGGCGGATTATGGGCAGAGCTT GTGAACAATAGAGGTTTTGAAGCAGGAGGCACGCAAACTCCATCAAATATTGCCCCTTGGACTATAGTTGGAAAAGAATC CTTAGTTTTGTTGCAAACTGAACTTAGTTCTTGCTTTGAACGCAATAAAGTGGCATTGAGAATGGATGTGCTTTGTGACC AATGTCCTTCTGATGGTGTTGGTGTCTCTAATCCAGGTTATTGGGGCATGAATGTTGTGCAAAAAAAGGAATACAAAGTT GTCTTCTTTGTAAAATCAACGGGGTCGCTGGATATGACAATATCATTTAAAAAAGCAGAAGATGGAGGGATATTGGCTTC TCAAAATGTCAAAGCTTCTGCATCAGAAGTTGCAAACTGGAAAAGGATGGAGCTTAAATTGGTACCCACTGCATCAAATC CTAAGGCAACTCTTCACTTAACAACAACTCAAAAGGGTGTCATATGGTTAGACCAAGTGTCAGCTATGCCCGTAGACACT TTTAAGGGACATGGTTTCCGAACAGACTTGGTCAACATGGTCTTAGAGTTGAAACCAGCCTTTATCAGATTTCCGGGTGG TTGTTTTATTGAAGGACAAACACTTAGAAACGCTTTCCGGTGGAAGGATAGTGTTGGACCATGGGAAGAGAGGCCTGGGC ACTTTGGCGATGTTTGGGGTTCGTGGACAGATGAAGGATTAGGTTATTTTGAAGGTCTTCAGCTTGCCGAGGACATTGGT GCAAAGCCAATTTGGGTATTCAACAATGGCATCAGCCATACTGATCAAATTGATACAAGCGTCATCACACCTTTTGTCCA AGAAGCCCTTGATGGTATTGAGTTTGCCAGAGGTCCAGCCACTTCTAAATGGGGTTCTCTTAGAAAATCAATGGGGCACC CAGAGCCTTTTGACCTAAAGTATGTTGCTATTGGAAATGAAGATTGTGGGAAGAAAAACTACCTAGGAAACTACTTAGCA TTTTACAATGCTATACGAAAGGCTTATCCTGACATTCAAATGATTTCAAATTGTGATGCTTCTTCCAAGCCATTGGATCA CCCAGCTGATTTGTATGATTATCATACATACCCGAATAATCCTTCAAACATGTTCAACAACGCACATGTGTTTGATAAGA CGCCCCGCAAAGGTCCAAAGGCTTTTGTGAGTGAATATGCTCTAGTTGGAGACCAACAAGCTAAGCTTGGAACTTTAATA GGAGGTGTCTCTGAAGCTGGGTTCCTTATTGGATTAGAAAAAAACAGTGACCATGTAGCAATGGCTGCGTATGCACCACT TTTTGTAAATGCGGATGATAGGAAGTGGAACCCGGATGCAATTGTTTTTAACTCCAATCAAGTTTATGGAACTCCTAGCT ACTGGGTGACACATATGTTTAAAGAGTCGAATGGAGCAACATTTCTTGCCTCAACACTTCAAACACCTGATCCTTCCTCA TTTGATGCATCAACAATTCTTTGGCAAAATCCTCAAGATAAGAAAACTTACTTAAAAATAAAGGTTGCAAACTTGGGTAA CAATCAAGTGAAACTCGGGATTGTAGTTCACGGACTGGAAAGCTCAAAGATAATTGGGACAAAGACTGTGCTCACATCTA AAAATGCATTAGATGAGAATACCTTCTTAGAACCAAGAAAGATCGTGCCACAACAAACTCCACTTGAGGAAGCAAGCGCA AACATGAATGTTGAACTTCCTCCTCTTTCAGTTACATCATTTGATATATTAAAGTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0655500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKPVQLIKRMAFSKTCCGFLSLLVACDLAFQCYVADAAGDQTSTLTVDLKSAGRPIPETLFGVFYEEINHAGTGGLWAEL VNNRGFEAGGTQTPSNIAPWTIVGKESLVLLQTELSSCFERNKVALRMDVLCDQCPSDGVGVSNPGYWGMNVVQKKEYKV VFFVKSTGSLDMTISFKKAEDGGILASQNVKASASEVANWKRMELKLVPTASNPKATLHLTTTQKGVIWLDQVSAMPVDT FKGHGFRTDLVNMVLELKPAFIRFPGGCFIEGQTLRNAFRWKDSVGPWEERPGHFGDVWGSWTDEGLGYFEGLQLAEDIG AKPIWVFNNGISHTDQIDTSVITPFVQEALDGIEFARGPATSKWGSLRKSMGHPEPFDLKYVAIGNEDCGKKNYLGNYLA FYNAIRKAYPDIQMISNCDASSKPLDHPADLYDYHTYPNNPSNMFNNAHVFDKTPRKGPKAFVSEYALVGDQQAKLGTLI GGVSEAGFLIGLEKNSDHVAMAAYAPLFVNADDRKWNPDAIVFNSNQVYGTPSYWVTHMFKESNGATFLASTLQTPDPSS FDASTILWQNPQDKKTYLKIKVANLGNNQVKLGIVVHGLESSKIIGTKTVLTSKNALDENTFLEPRKIVPQQTPLEEASA NMNVELPPLSVTSFDILK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| Phobius | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| Phobius | 1 | 14 | 14 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 1 | 26 | 26 | 5.0 | – | |
| PANTHER | 10 | 656 | 647 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 10 | 656 | 647 | 0.0 | – | |
| Phobius | 15 | 26 | 12 | - | – | |
| Phobius | 27 | 37 | 11 | - | – | |
| Phobius | 38 | 658 | 621 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 217 | 548 | 332 | 1.24E-81 | ||
| Gene3D | 219 | 539 | 321 | 3.0E-81 | – | |
| SMART | 464 | 650 | 187 | 7.3E-50 | ||
| Pfam | 465 | 650 | 186 | 1.4E-33 | ||
| Gene3D | 540 | 656 | 117 | 2.3E-13 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | L-arabinose metabolic process | The chemical reactions and pathways involving L-arabinose, the D-enantiomer of arabino-pentose. L-arabinose occurs free, e.g. in the heartwood of many conifers, and in the combined state, in both furanose and pyranose forms, as a constituent of various plant hemicelluloses, bacterial polysaccharides etc. | ||
| Molecular function | Alpha-L-arabinofuranosidase activity | Catalysis of the hydrolysis of terminal non-reducing alpha-L-arabinofuranoside residues in alpha-L-arabinosides. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0655500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…