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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0664300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0664300.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Glutamate synthase, putative; TAIR: AT5G04140.1 glutamate synthase 1; Swiss-Prot: sp|Q43155|GLTB_SPIOL Ferredoxin-dependent glutamate synthase, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RUY7|A0A151RUY7_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0664300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:122593770..122618035) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACAACTAAACTAGTGTCATCCAGTTTAAATGTGGATTTCATTTAACTAATTTATGAAACTTTGATACTTTATAACTCCTA AATAAACTTTCTTTTATGCTGAATAGACTTTACATCTGTTTCTCATTGTATTCTTGCTCATAATTAGCAGTTTGCTTTGC TATTAATTTAAAGGGTGGTTCATTGGGTTATGGGTTATTTTACAAAATTGTTTCTCAATGCTCAAGTGATAAACTATTCA TGACTGTGGATGTAACCTACATGACAACGTGTTGGGTAATTCTAGTTACTTGTTGATCAGGTTGCAAACTTGGATGATAT ATTATCAGAAAGAGGAGCCTGTGGTGTTGGATTCATTGCCAATTTGGAAAATAAGGCATCACATGTAATTGTCAAGGATG CTTTAACTTCTTTAAGCTGTATGGAACATCGTGGTGGCTGTGGAGCGGATAATGACTCTGGTGATGGTGCTGGGCTGATG ACTGCAATTCCATGGGATCTATTCGACAATTGGGCTGACAAACAAGGGATTGCTTCCTTTGATAAGTTGCACACTGGTGT TGGAATGGTTTTCCTACCCAAAAGTGTAGAACTCTTGAATGAGGCCAAGAAAGGTAATAAGTGTTCTTATTTTGAAGGGC ATTATATAACTAACACCCTATTATGTCTTTGATTTTTATTGTTTCACTAAGATAAGGACGTTAAATTGTCTGTGGATAAT TTACATGTTGCATAATTTCTTTTTACTTTCTTTTTTGTGCTAGGCATTTTTTCTGTATTTCTCATTGATTCAGTACACAA TTCTTCTACATATCTCCCATGTACTCGTCAGTCGTCTCTCTCCAAAGATAACCTCCAAAGCCACTCCAAAAAGTCATTTC TAGCTGTTGGTGTCAACTTTTTCATGTTCTATGCTTTTGTAGGGCAGGGAGTCTGTTATTTTGTTGTTCAATGTATTGGA 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GTCATTGAATTGAATCCATGTAGCCAACCACACCTTGGGGGAAAACACTTTGTTATTGTTTTAATAAGGTTGAGCAAAAT GAGGCTGTCCTGAATCAATGCACCCTCTTATCACTGTAGTGAATGAAATGGATGTTTCTGTTTTATAGTACCTGTCTTGG ACCTTATTTTTTGGTTTGCTACATTGTTCTGATGTTTATTCGTGATGGTTTCCAGGGCATGGCGGGGGGTGAGCTAGTTG TGACTCCAGTCGACAATACAGGTTTTCAGCCTGAGGATGCAGCTATTGTGGGCAACACTTGCTTGTATGGGGCAACTGGT GGACAGGTTTTCATTAGAGGGAAGGCTGGGGAAAGATTTGCTGTCAGAAACTCACTTGCTGAAGCTGTGGTTGAAGGCAC AGGAGATCATTGTTGTGAGTACATGACCGGTGGCAGCGTGGTTGTCTTGGGAAAGTGAGTAATCTTTCTTTATCAGAGAT GTACCAGTCTTCTCCTCAACCTCTCTTTTTCTGTGTAACTGTTCAACCTTCATTGAAGGAAATCATGTAAGCTAACTGAG GCTTTCACATATTTTGTACCTTGACAGAGTGGGTAGAAATGTAGCTGCTGGAATGACAGGAGGGTTGGCTTACCTTCTTG ATGAAGACGATACTCTAATTCCCAAGGTCTGTCCCAGAGATTCATTTTACTGTCCTTTCCCCATTTTATGCATGAAACAT ATGCCTTTGAAATTTACTTATACATACAGAAACAAAAAACTGCAGTAAAAAATATCCATAACCTACTTGAAAGCCATCAT TACTGTTGCTTGAAATGAAATCATGTTAATGTTTCGTTTGCTTATATGACACTATTCACAGGTAAACAGAGAAATTGTTA AAATTCAACGAGTAACAGCGCCAGTGGGGCAGATGAAGCTGAGAAGCCTTATTGAAGCCCATGTTGTAAGCCCCCAATTA TTTAGAAGAGTTTATGCATGTGTAATTTACACAGGCAGAAATTCATTCATAATTTTTATCAATTTTATGGGTTGATAATA ATTTTTTAACCTTTCGGTGTGAAGGAGAAAGCCGGTAGTGGCAAAGGTGCGGCTATTCTGAAGGATTGGGATAAGTATTT GTCATTATTTTGGCAGCTGGTTCCACCTAGTGAAGAAGATACCCCTGAGGCTAATGCCAAGTTTGGCACCACAACTTCAG AGCAGGTCACTTTGCAGTCTGCTTAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0664300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAACATCGTGGTGGCTGTGGAGCGGATAATGACTCTGGTGATGGTGCTGGGCTGATGACTGCAATTCCATGGGATCT ATTCGACAATTGGGCTGACAAACAAGGGATTGCTTCCTTTGATAAGTTGCACACTGGTGTTGGAATGGTTTTCCTACCCA AAAGTGTAGAACTCTTGAATGAGGCCAAGAAAGTTATTGTAAGTATTTTTCAGCAAGAAGGTCTTGAGGTGCTTGGGTGG AGGCCTGTCCCTGTAAATACTTCTATTGTAGGTTTTTATGCGAAGGAGACCATGCCCAATATACAGCAGGTATTTGTTAA GATCGGGAAAGAAGAAAATGCCGATGACATTGAACGAGAACTGTACATCTGTCGTAAATTGATTGAAAAAGCTGTAAGCT CAGAAAGTTGGGCAAATGAGCTTTATTTCTGTTCTTTATCCAATCAAACAATAGTTTACAAGGGGATGCTTCGCTCACAA GTTCTTGGGTTGTTTTATTCTGACCTTCAAAACGATCTTTATAAATCCCCCTTTGCCATTTATCATCGAAGGTATAGCAC AAATACTAGCCCCAGATGGCCTCTTGCACAACCAATGAGGCTTCTTGGTCATAATGGAGAGATCAACACCATACAGGGGA ACTTGAATTGGATGCAATCACGAGAGCCATCGTTGAAGTCACCTGTATGGCGAGGTCGTGAAAATGAAATTCGTCCATTT GGAAATCCAAAGGCATCAGACTCAGCAAATCTTGACAGTACTGCAGAATTATTAATAAGAAGTGGTCGTAGTCCTGAGGA AGCTATGATGATTCTTGTTCCCGAGGCTTATAAAAATCATCCAACTCTGACAATCAAATACCCAGAGGTGCTTGACTTTT ATGACTACTACAAGGGTCAGATGGAAGCTTGGGATGGACCTGCCTTGCTTTTATTCAGTGATGGAAAAACTGTAGGTGCT TGTCTTGATCGTAATGGACTTCGACCTGCTAGGTTTTGGCGAACATCAGACAATATGGTTTACGTTGCCTCAGAGGTTGG TGTTATACCAGTGGATGAATCAAAGGTTATCTCGAAAGGCCGATTAGGTCCAGGCATGATGATAACGGTTGATTTACTTG GTGGTCAGGTCTATGAGAATACGGAGGTTAAAAAACGAGTAGCCTTATCAAATCCATATGGGGACTGGATCAAGGAAAAT CTGCGGTCTTTGAAGGCTGAGAACTTCCTTTCAACCTCTGTTATGGAGAATGACGCAATATTAAGACAACAACAGGCATT TGGGTACTCCAGTGAAGATGTCCAGATGGTGATTGAGGCTATGGCTGGTCAGGGAAAGGAGCCAACTTTTTGCATGGGAG ATGATATTCCATTGGCAGCATTGTCTCAGAAACCTCACATGCTTTTCGATTATTTTAAGCAACGGTTTGCACAGGTCACA AATCCTGCAATTGATCCTCTTCGAGAAGGATTAGTTATGTCTCTTGAAGTGAATATAGGGAAGAGAGGGAATATATTGGA AACTGGACCTGAAAACGCATCACAGGTTATATTATCTGGTCCAGTATTGAATGAAGGGGATCTTGAATCATTATTAAACG ACCCCTTATTAAAACCGCAAGTATTACCAACATTTTTTGATATAACTAAGGGGATTGACGGTTCCTTGGAGAAAGCATTA AATAAGCTTTGTGAAGCTGCAGATGAAGCTGTTAGAAATGGTTCCCAGCTTCTTATTCTTTCAGACCGTTCAGAAGCACT GGAACCAACACATCCTGCAATTCCAATACTTCTTGCTGTTGGTACTGTTCATCAGCATCTAATCCAGAATGGCCTGCGGA TGTCGGCATCAATTATAGCGGATACTGCTCAGTGCTTTAGCACTCATCAGTTTGCCTGTTTAATAGGATATGGTGCAAGT GCTGTGTGTCCATACTTGGCACTGGAGACATGCCGACAATGGCGTCTTAGTAGTAAAACTGTAAATTTGATGAGGAATGG AAAGATGCCTACTGTATCAATTGAACAAGCACAGAAGAATTACTGCAAGGCTGTAAAAGCAGGTCTTCTTAAAATTCTTT CCAAAATGGGCATCTCATTGCTTTCAAGTTACTGTGGTGCACAGATATTTGAGGTCTATGGATTAGGGAAGGAAGTTGTG GATCTTGCATTCAGAGGAAGCGTGTCAAAAATTGGTGGATTAACCTTTGATGAGCTTGCAAGAGAGACTTTGTCTTTCTG GGTGAAAGCGTTCTCTGAAGATACGGCAAAAAGATTGGAAAATTTTGGGTTTATACAGTTCAGACCAGGAGGTGAGTTTC ATGCAAATAATCCAGAAATGTCAAAGTTGCTCCACAAAGCTGTTCGTCAGAAAAGTCAAAGTTCCTTTGCAGTTTATCAG CAACATTTGGCTAACCGACCTGTGAATGTTCTTCGTGATCTTCTTGAGTTTAAAAGTGATCGTGCTCCAATACCTGTAGG AAAGGTTGAACCTGCTTCATCTATCGTGCAACGGTTTTGCACTGGGGGCATGTCACTTGGAGCTATTTCAAGAGAAACTC ATGAAGCAATTGCAATCGCAATGAATAGATTAGGTGGAAAATCAAATTCTGGGGAAGGTGGTGAGGATCCTATTCGCTGG AAACCACTTTCAGATGTCGTGGATGGTTACTCTCCAACACTTCCACATCTTAAAGGTCTTCAAAATGGGGATACTGCAAC AAGTGCCATCAAGCAGGTTGCTTCAGGAAGGTTTGGTGTCACACCAACATTCTTGGCAAATGCTGCTCAATTGGAAATCA AAATTGCACAAGGTGCGAAGCCTGGTGAAGGTGGACAATTGCCTGGGAAAAAAGTTAGCATGTACATTGCAAGGTTGAGA AATTCTAAACCAGGGGTTCCTCTTATATCTCCACCTCCTCATCATGACATTTATTCTATTGAGGATCTTGCTCAATTGAT CTTCGATCTTCATCAGGTGAATCCTAAGGCGAAGGTATCAGTAAAACTGGTGGCTGAAGCTGGAATCGGTACTGTTGCAT CTGGGGTTGCAAAGGGCAATGCTGATGTTATACAGATTTCAGGGCATGATGGGGGTACGGGAGCAAGCCCTATAAGTTCC ATCAAACATGCAGGAGGTCCTTGGGAGCTTGGACTTACAGAAACTCACCAGACACTCATTGAAAATGGACTTAGAGAAAG AGTCATTCTCCGAGTTGATGGTGGATTTAGAAGTGGAGTTGATGTCATGATGGCAGCAACAATGGGTGCTGATGAATATG GGTTTGGTTCAGTGGCAATGATTGCTACTGGATGTGTTATGGCCCGCATTTGCCACACCAATAATTGCCCTGTTGGTGTT GCTAGCCAGAGGGAAGAGTTGCGTGCACGATTTCCCGGTGTTCCTGGTGATCTTGTCAACTACTTTTTATATGTGGCTGA AGAGGTAAGAGGCACGTTGGCACAGCTGGGGTATGAGAAGTTAGATGACATAATTGGTCGAACAGACTTATTGCATCCAA GAGACATATCTCTAGTGAAAACTCAGCATCTGGATCTAAGTTATATCCTCTCTAGTGTTGGGTTACCTAAATGGAGCAGT ACAACCATCAGGAATCAGGAGACTCATACCAATGGTCCTGTTCTGGATGATGTTTTGCTAGCAGACCCAGAGGTTGCAGA TGCCATTGAAAATGAAAAGACTGTTAGTAAGACGATAAAAATATACAACATTGATCGTGCTGTTTGTGGGCGTATAGCTG GTGTCATTGCAAAGAAGTATGGTGATACTGGTTTTGCTGGACTGTTGAATATAACATTTACTGGAAGTGCTGGGCAGTCA TTTGCGTGCTTTCTGACACCTGGAATGAAAATTCGCCTTGTTGGAGAGTCTAATGATTATGTGGGGAAGGGCATGGCGGG GGGTGAGCTAGTTGTGACTCCAGTCGACAATACAGGTTTTCAGCCTGAGGATGCAGCTATTGTGGGCAACACTTGCTTGT ATGGGGCAACTGGTGGACAGGTTTTCATTAGAGGGAAGGCTGGGGAAAGATTTGCTGTCAGAAACTCACTTGCTGAAGCT GTGGTTGAAGGCACAGGAGATCATTGTTGTGAGTACATGACCGGTGGCAGCGTGGTTGTCTTGGGAAAAGTGGGTAGAAA TGTAGCTGCTGGAATGACAGGAGGGTTGGCTTACCTTCTTGATGAAGACGATACTCTAATTCCCAAGGTAAACAGAGAAA TTGTTAAAATTCAACGAGTAACAGCGCCAGTGGGGCAGATGAAGCTGAGAAGCCTTATTGAAGCCCATGTTGAGAAAGCC GGTAGTGGCAAAGGTGCGGCTATTCTGAAGGATTGGGATAAGTATTTGTCATTATTTTGGCAGCTGGTTCCACCTAGTGA AGAAGATACCCCTGAGGCTAATGCCAAGTTTGGCACCACAACTTCAGAGCAGGTCACTTTGCAGTCTGCTTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0664300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEHRGGCGADNDSGDGAGLMTAIPWDLFDNWADKQGIASFDKLHTGVGMVFLPKSVELLNEAKKVIVSIFQQEGLEVLGW RPVPVNTSIVGFYAKETMPNIQQVFVKIGKEENADDIERELYICRKLIEKAVSSESWANELYFCSLSNQTIVYKGMLRSQ VLGLFYSDLQNDLYKSPFAIYHRRYSTNTSPRWPLAQPMRLLGHNGEINTIQGNLNWMQSREPSLKSPVWRGRENEIRPF GNPKASDSANLDSTAELLIRSGRSPEEAMMILVPEAYKNHPTLTIKYPEVLDFYDYYKGQMEAWDGPALLLFSDGKTVGA CLDRNGLRPARFWRTSDNMVYVASEVGVIPVDESKVISKGRLGPGMMITVDLLGGQVYENTEVKKRVALSNPYGDWIKEN LRSLKAENFLSTSVMENDAILRQQQAFGYSSEDVQMVIEAMAGQGKEPTFCMGDDIPLAALSQKPHMLFDYFKQRFAQVT NPAIDPLREGLVMSLEVNIGKRGNILETGPENASQVILSGPVLNEGDLESLLNDPLLKPQVLPTFFDITKGIDGSLEKAL NKLCEAADEAVRNGSQLLILSDRSEALEPTHPAIPILLAVGTVHQHLIQNGLRMSASIIADTAQCFSTHQFACLIGYGAS AVCPYLALETCRQWRLSSKTVNLMRNGKMPTVSIEQAQKNYCKAVKAGLLKILSKMGISLLSSYCGAQIFEVYGLGKEVV DLAFRGSVSKIGGLTFDELARETLSFWVKAFSEDTAKRLENFGFIQFRPGGEFHANNPEMSKLLHKAVRQKSQSSFAVYQ QHLANRPVNVLRDLLEFKSDRAPIPVGKVEPASSIVQRFCTGGMSLGAISRETHEAIAIAMNRLGGKSNSGEGGEDPIRW KPLSDVVDGYSPTLPHLKGLQNGDTATSAIKQVASGRFGVTPTFLANAAQLEIKIAQGAKPGEGGQLPGKKVSMYIARLR NSKPGVPLISPPPHHDIYSIEDLAQLIFDLHQVNPKAKVSVKLVAEAGIGTVASGVAKGNADVIQISGHDGGTGASPISS IKHAGGPWELGLTETHQTLIENGLRERVILRVDGGFRSGVDVMMAATMGADEYGFGSVAMIATGCVMARICHTNNCPVGV ASQREELRARFPGVPGDLVNYFLYVAEEVRGTLAQLGYEKLDDIIGRTDLLHPRDISLVKTQHLDLSYILSSVGLPKWSS TTIRNQETHTNGPVLDDVLLADPEVADAIENEKTVSKTIKIYNIDRAVCGRIAGVIAKKYGDTGFAGLLNITFTGSAGQS FACFLTPGMKIRLVGESNDYVGKGMAGGELVVTPVDNTGFQPEDAAIVGNTCLYGATGGQVFIRGKAGERFAVRNSLAEA VVEGTGDHCCEYMTGGSVVVLGKVGRNVAAGMTGGLAYLLDEDDTLIPKVNREIVKIQRVTAPVGQMKLRSLIEAHVEKA GSGKGAAILKDWDKYLSLFWQLVPPSEEDTPEANAKFGTTTSEQVTLQSA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ProSiteProfiles | 1 | 373 | 373 | 17.488 | ||
| CDD | 1 | 391 | 391 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1482 | 1482 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 1 | 400 | 400 | 3.76E-135 | ||
| Gene3D | 1 | 511 | 511 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 1482 | 1482 | 0.0 | – | |
| Pfam | 1 | 396 | 396 | 5.8E-165 | ||
| Gene3D | 401 | 773 | 373 | 0.0 | ||
| SUPERFAMILY | 418 | 1196 | 779 | 6.41E-254 | – | |
| Pfam | 423 | 715 | 293 | 3.7E-106 | ||
| Gene3D | 449 | 1174 | 726 | 0.0 | ||
| Pfam | 774 | 1158 | 385 | 5.5E-160 | ||
| CDD | 777 | 1172 | 396 | 6.10981E-167 | ||
| Gene3D | 1196 | 1471 | 276 | 7.7E-110 | ||
| SUPERFAMILY | 1209 | 1471 | 263 | 1.07E-85 | ||
| CDD | 1215 | 1465 | 251 | 6.65104E-138 | ||
| Pfam | 1240 | 1422 | 183 | 8.2E-75 | ||
| MobiDBLite | 1467 | 1490 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 1473 | 1490 | 18 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. | ||
| Biological process | Glutamate biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of glutamate, the anion of 2-aminopentanedioic acid. | ||
| Biological process | Nitrogen compound metabolic process | The chemical reactions and pathways involving organic or inorganic compounds that contain nitrogen. | ||
| Molecular function | Glutamate synthase activity | Catalysis of the formation of L-glutamine and 2-oxoglutarate from L-glutamate, using NADH, NADPH or ferredoxin as hydrogen acceptors. | ||
| Molecular function | Oxidoreductase activity | Catalysis of an oxidation-reduction (redox) reaction, a reversible chemical reaction in which the oxidation state of an atom or atoms within a molecule is altered. One substrate acts as a hydrogen or electron donor and becomes oxidized, while the other acts as hydrogen or electron acceptor and becomes reduced. | ||
| Molecular function | Oxidoreductase activity, acting on the CH-NH2 group of donors | Catalysis of an oxidation-reduction (redox) reaction in which a CH-NH2 group acts as a hydrogen or electron donor and reduces a hydrogen or electron acceptor. | ||
| Biological process | Oxidation-reduction process | A metabolic process that results in the removal or addition of one or more electrons to or from a substance, with or without the concomitant removal or addition of a proton or protons. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0664300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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