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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0733200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0733200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Dirigent protein; TAIR: AT1G58170.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein; Swiss-Prot: sp|Q9C523|DIR19_ARATH Dirigent protein 19; TrEMBL-Plants: tr|I3SM95|I3SM95_LOTJA Dirigent protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0733200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:130499084..130529830) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGAGACAATTAATTAATAGTAGTTATTTAGCAATAGGGTGATGCTATGAGGTCACTGTAAAGACTTTTCATAGCTCCTAT ATTACTATAAATAGATCCTCCCTTCCTGATAGGATAGCATCACTACTCACAAGTAGGCTTATTAATTATTCTCTTACTTG CTTGATCAAATCAACCATCACCATGACCAACTCCTCCAAAACCATTTCTGCCACTCTCCTAGTTTCCCTTGCGCTTATTA CTTTTCTCTTCTCCTCCACGGTGAATGCTAGTTATTATGAAAAGATTTCCCCAACACAGCTAGGTTTCAAAGAGGAGAAG CTCACCCACCTTCGCTTCTTCTTCCATGACATCGTTACGGGCCCGAAGCCCTCCATGGTCATATCCGTCGAGTCACCCAT CAAGGATAAGTCCAAGTCTCCACTGCCCTTCGGATCCATTGTGGTGATGGAGGACCCATTGACGTTGGGTCCCGAACTCG ATTCCAACCTCATTGGAAAAGCCCAAGGGTTTTACATGACAGTAGCCCAGGAAGCTGAGCTGTACTTGGAGCTAATCATG GGAATGACATTTACGTTCATGGAGGGTGAATTTAACGGGAGCACCTTAACTGTCATGGGGCGTAACACCATATCGTCTCC CATAAGGGAGATGCCAATCGTTGGTGGGACAGGGGCTTTCAGGTTTGCACGTGGTTTTGTTCAACCAAAGACTTACCAGG TTGATTACTACAAAGGTGATGCTGTTGTCGAGTACAACGTCTATGTGTTCCATTATACATCCCCATCTTCGTTCTGGGAT GTTTAAGTATATATGTATGTGATTATATCATATTACATATGTTGTGATTAAGCTAGCTAAATAATATGTGTCACCCTCAA TATTTCATATTGGGAGATTTTTTGTTTTTTTGAGATGGTGTTGTTAATGTTAGTGTGTAATGGGTGAGAAAGGAACCAAA 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CAATAGGATTTTTTAGTTTTATCCTGTCAAAAAATTGACATTGGGATTGAATGAGATTTTTTAGCTTTTCATTCTTCATT GGGATTGAATGAAAAGCTATATTAGTACATGCTATTTCTAAGTGTCTGATTTTGTGCCATGAGTTTTTGAATGAGATTGT GACATTGGGATTGAATGAGATTTTTTAGCTTTTCTGAGTGTCTGATTTTGTGCCATGAGTTTTTGAAATGATTACAATAA ATCCATTCAGTGATGTTAAATTTCATGACCTCCCTTCATGTGTATTTTAACTGGACCCTATGTAGTTTACTCTCTATGTC TTTAAGTTTCTGTAAGATTTCACTCTACATGAAGAGAGGTAGTTTGGATCGAGGCTCGGCAAGAGAGGAAAATTGACCCC ATACTTGCAACAAAAGAGGTGTTGTTTCAAATTTTATTCGGTTAAGTGAATTCAAATGCAGATCATATAATGAGAGAATT CGAATAAAGACAAATTGGGTTCTTATATACTTGAATGCTTGTAGTCTGACCTTGTCAACATTGAAATTATTCAGAGATTT GGAATTATTCTGTTTTTCATAACTAGGTTGGTAATGGTTTCTCTAATCTGTCATGTTTTTGTGCTCCTTAATTTATCCTT TTTGCCCCTCTTAATGTTATGATTTTGACAGGCAATTAGAGTAGATTTTTCCACTAGCAGGTTCAAACCCTGCTTCTCAA GGATGCTTCACCCACTCTTTTACCACTTGAGCTATCTAGAGGGGGGACTAATCAAATTTCATTATCTAAATAGAAGAACT GAAAATCAATTGGCTTGAAAGTGGCTTTAGTTATGCAGACTTGTATTGCATCACATTACGGAATTCTAGAATGAGCATGA TTTCTGTTTAGTTTTCTTTTCATACTTGAAGTAATCATTGTTATTGTATTTCATTCTATATATGCAAGCACACATGTTCC TGGAAGCCTATTGTTAGTATTTTGTTTGGTTTTGGTGTGGTAATTTTCAATGTTACATGTGCTCGTGTCAATTGATATTT TCTGAACCTTCATTGTTTTTAGTTTGCGTTTGGCTTGGCCGTGCTGCTGGTGTCTCATATTATGCTCAATATTATGGTTC TATCTCCAGAAAAGCTATTATTATAGGCCACGTATTGATGTCATATACAAAGTTATACTTAAAGTGTTTTTATGATCAAT ATTGTAATTACTCTAAGTTAAAGGCTGAACCTATAGTAATTTGTGACTTGTATTTTCTTTGATTTGACCAGAAGTTATAT CTTAAAGCAATGGATAAGTCATGGATTGAGATGCCACGAAATACAATGGCGTATGAGAAAGGTGTAAAGAGATTTATTGA CTTTGCCTTTGAGCGTAGTTCAATTGAGGGTAAAATTGTTTTGAAGATGTTGCTGCTGCTGTTAGGATTAGAACTTTTAT TTTCTCCTATTTCCTTATTCTAGAGTTGTTGCTGTTTTTAACTTGTGGTTGTGCTGATAATTTTTTTAGGAAATTGAAAC CGGTCGATCGTATAGTAGAGCGGAAATGTACTCCATTTCACACAAGAAAAGTGATGGCTCTTTTGTAAATGAAGAAGCAA AACAAAAGAGTGTGAGTATAGTTACAAGTTTCTATTTCCTTTGAAAATTTTATAACTATCAAATATGCTTTGTATGTTTG ATGGCATGCACGTGTTTAATTTTTTGTGTAGGATTTATTGGAGAAGGAACTTGAAAAGAATTGTTCTGAAGAGGCTGCCT ATGTTAAAGTTTTTGGGAAAGATCGCTCAGGATACGTGAGAGGCATGGGCTTTGGTGTTTGTCCATCTCAAGTGTTGGAA TCTACTAGCAGCTCTAGTAGCTCGCAATTTGCTGGCATCACATTGGCTGAATGGAATGCCATGAAATCAGAATTGCAGGA 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TGTAGAACTCTGCGGTAGTTAGAAACCGCCGCAAAACAGAGGCGGAATGAATTACAGGTTTTGCGGCGCTTTTAACCGCC GCTATATACTGCGGCAGTTATTTCAACGCTTGGATATAAGCGCCGCAGAACGGCCCCCGACGCTCGTAACTGCGGCGCTT GAGGAAACGCCCCATTATACATTCTGCGGCGGTTTTAACCACCGCAAAATGGTTCCAAAAGCGCCGCAAAATGGTTTTTT TTTTGTAGTGTAGAGACGGGACAAGGTGTGGGTTGTTGGTTGATCACATCCTCTTTGTCCATATACCCGAACCCTTTGAC AGTGCAGGTTGTGTGGCACAAAATCTGCCATGAACATGCTTATTTCTTGCGATACTGTCAAGCAGGAACATGGGTGATAG CTGGGACTTGCTGTGTAACAGTTGGCGGGCACCGCCGCTGGGGTGTGTGAAACTTAATACCGATGGGAGTCTCACGGAAG GTGATGACTGTATGGGTGGGGGTGGCCTCCATCGTGATAACACTAGTTGCTTGGGGGTTTTCGTGGTATGACATGGGTGG CAACCCATTTCTTTCCAAGGTTATAACTTTGCTTGAAGGACTGTGTTGTGTGAAGTTGATTGTCTTGAGCTTAGTGCAGT GCTCGCAAGCGTAGATAATTGGCGTTATCATGTCCATGCTAGTGTTCTTAGTGAGATTCTTGATATCTTAGCTAGGAACT ACCGGATCATACTTGCCTGGGTTAGCAGAGATAGTAATGCTCCGGCAAATTGGCTTGGGCGAAGAGCATACTCGATACCC TCTCTTGGTAGTACGGTGGTTGATTTCCCCTCTTCGGAGTTAGATGGTCCTGATTCTAAAGGATTCTCTTTCTTTCTGTA CTGTTTTGCTTTTTCTTTCTTTAAACTCTTAGATGAAAAAAAGCAAATTAATTAAATATTTTGAATAATTTTATTTAAAT CATTTTTATTTTAAAATAATTTTGTGCAATGGTGTTCTGTGATAAATTGTGATTTATACGAACTTTAATGAAACACTTGC TATCCCAAATCTTTACAAACTCTAATTCGATCAAATTCATTTAAATTAATTGCAATCGTAATAAAATTTATGTAATGAAC TATGATATTAAGCTAATTTTCCCCCTTCAAAAAAATTTTAAACATAAAAAAGAGATAGCTACTAATTTGTGAGGGAGGGA TCCCTTAATTAATGATCAATACTACTCATATAATTACTATAAATTAAATTAAAATAGTAAGTCATGCATGCCGCCTACGT GAAAACAAGTTCGACGACTAGTTCCAGTCTCCAGATATAAGATAATACACGCAGCATTTTTCTTTGGTATCATCTTGAAT ATATAGGACAACATAGTCTTCATTTACATGTTTGTCATCATTTACATTTATTTTAATATTATATACGGGAGAAGTCTATT TTGACCCTTCAAGTTTTACATAAATTAGTAACGATTTATAGAATCTAATTTTTTTTATAATTATATACAATACTATAACA TGTGAAATGAAAAATTTGGCAGAGAAGTAGTTGAGTGTGGAGTAGATGAAACATGGGATATTTAGAGGACGATGGTGTTA AAGAAAGGGTCTCATTGATCATGAATTCAACTATATATGAATGAATATTGTTTAGAATGCCCAACATGCATGAAAGAGCC TTCTCAACATATTAAGTAAACTAACTAATGTCGATGTCTAATGTCTATGATAAAACATTGTTTTTTATTGTTGAGGTTTA AATAAATTAAATATTATTCATTATTTATGTCTTACGGTCAATATTATTATTCAACTCTTCATCAAAGCATGACCCATCAG ATACGGTTCTCATGTATATATTACACCTGGTCTTTCACCCATTATTTTTTCTATTGGGAGTCAAACGACCCACGTACGGT TCACGGGGGTCTTTGAGGACCATTGTGAAATCCAGAGAGTCGTGTAAGATATTTTGGGCCTTCAAGCAAAAATGTTTGCG CAATTTTTTTTTAATTAGAATCTTAAAAAAACTTAATATATTACATAAATTATTAATTTTTTATATTAATCTTTTAGTTT AATGCTTTTTTAAAAATATTGAACAATAGAACATTGAATGTCAGGAATAAAACAATGGGAAATTTTACAACACTTTGATA TTAAGTATTTCGTTTGATAATTCACTTCAAGGTAAAAATAATGAATTTTGTTTAGAGAAAAAACAATTAATAAATGAAGA ACAAACTTGTACAATATATAAATATATAAGTCATAAGAAAAACTAACGGTTATAAGTAAACACAAATTTTCTTTCTCATA TATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGGGAATGCTAATGCACACCCACTCTTTTTTTAGAAGGTGTG CATTAGCAACACACACCTTTTTCTTTTGACAAAAAACCCAGCTTTCACTTTTTAAGTTAAGTTACTTTATAAGGGCACCA AAGTAATTTTGCAATCTACCCTCTCTCTCCAATCCAAACTTTGCAGAACTCTCTCTCGCCCACTCAACCTTCCATTGCAG CACCATAACCTCCTCACGTCTTCATCTCTGCCAATCCTTCTCCCCTGATTTGAGTAATTTTGGATATTGGGTATTTATCC GTTTGGAAAATTTGGGTATTAGTTATTGGGTATTTACTACTAAAACTACAGGAAGCTTCACCAATCACCACTCTCTTACT CATTGTAATTTCGCAATCCCTCTCGCACTCACTAATTTCAGAGAGCAGCAAAGCAGGAAGCTTCGTCACTATACTGAAGA TTGTGATTCTATATTTGAATTTTTAATAGAATCAAAAGGTGTACCTAGTTTATGCATAATACAACACCACTGAACTTGGA TTGGTATCTGCAACAGAGCCAAATAAAGGCATCATTTTTTAATTTTAGGAAAGGTACTTGGAAAATGTTGTGTTCATATA AAACAATCAACCATGATATTTTCTTAATAATGCCAGGACTAGAGCCAAATGTTTAAGATTTGATAACGCGCTAGCTTTTG GCTTTATATCAGAAAACTACAAGAAGGGATTCCACAACTTCCAGGACCAGTTTTAGTAGTAAAGAATCAAAACTCAAATT ATTCAAATTATTAGTAGTTTTAGTAGTAAATACCCAAATTTTCCAAATGTGTAAATACCCAATATCCAAATTCCTCAAAT TAAGGGAGAAGGTTGACAGAGATGGTGCTGCAATGGAAGGAAGAGTGCAGATCATCGGAAAATGTTGAGTGGGAGAGAGA GAATTCTGCAAAGTTTGGATTGGAGAGAAAGGGTAGATTGTAAAATTACTTTGGTGCCCTTATAAAGTAACTTAACTTAA AAAGTGAAAGCTGGGTTTTTTGTCAAAAGAAAAAGGTGTGTGTTGCTAATGCACACCTTCTAAAAAAAGAGTGGGTGTGC ATTAGCATTCCCCATATATATATATATATATATATATATATATTTGTGTGTGTGATAATTTATTTTTAGGGGCCTAAAAC AATTGAGGGGTCTCAGGCCATTGCCTCAATTGTCTCAGGCCATACACGGTCTTGGTGGAATCCTTCGGAATTATCCTTGA ATGACCTCTGACTATGGTAGAATTTAACCTGTGGTTATATTTGAATGTTTGTTAGCATTCAAGTCCCAACTAGGGCGACA ATATGGCTCAAACCCACAGGTCGACCTGGCAAAGTTGGGTTGGGTGAGGTAAAAGATTATGACTCGTGAATCCGCCAACA CGTTTATTTGCACGGGTCAATTTGTTGCCAAGTGAGTCAACACTCAAACCAACTTCATTTTTTTTTTTGGAAAAAATATA AGCTTTAATATGTTTTTGGTCCTTATGATATACCTTCTTGTTTTTAATCCTTTTAAAATATTTTTCAGTTTTTTACCCTC AACATATTAAATGTTCTGTTTTTAATCCTTGATGTCAAGTTTTTCATCGAAAACGAAGATTACAATGAAAATATCACCAG AAACAGAACCTATAAGGCCCAAAAAGTTTAAATCAACAACCAAGAAGAGCAAGGTACATGTTGATAGTGGTGGTGAAGCA GTGTCTATAGTGCATGAGATTGATGATAACTATCAAACTGAAGAACTTCTTAGTGATGCATATGATGAAGACAATGATGA TTCTACTACAGCAAGATTTGAGTGGTTTAAGAAGGCAGATATGACACAAACTCTCATAGATGTAAGGGGTTCTTGGAACT GCTTTTCTTAGTATTGAATAAAAAATTGACGTAAAGGATTAAAAACATAATGTTTGATATATTGAGGATGAAAAATGGAA TTTTTTTTAAAAGGGCTAAAATTGGAAAGGGGTATATTTTAAGGAACAAAAATATATTTAAGCCAAAAATATATGTTTTA ATGTTTTTAAGTGTTTTGAGTGGGGTTTGGTGAACTCACTCACACGTCGAACCACAAAGCCTTCAAATTATGTTAATTTG TTGAAGGTTTTTACGTCATTTTTTAATGTTTTGTTACTTTCTCGCTTACCCACCAACCCGTCACCGGGTGGGCAAGTTAA TTTTCCCAACACACATTCTCAAGCCGGCTAACTCGTGCTTGACCCCACTTTTAGGCCAGTTGAGTGTGAGGCAAAGTGGA ACGGGTTGTCCACACATTGCTACACGTAGTGCAAATAGACATTTGCATTCACTTTAACATAAAAATTGAAGGAACTTCTC TATATAAAATTGGTTTCACATTCTGTCTCAAGTGTAAACACTCTCAAGGTTGTCCTCGAATTGAAACTCTCTCTCTCTTC ATAATTATTAAATAAGTTGAACCCTTTGAATATTTATAATAAAAAATATATTGTTAGCCCAAAATTTCACCATGTGTGAA ATTGCAATTGAGATCAAAATATTTGAGGAATAATTATGTTAAGGAATAATTGTAGCTGGGAATGGTTTCTGATATGTTAA GAGTTATGTCTATTGTAGTTTTAGGACCACGATGTGCCCTGCCCATAGTTTAATATCTTTGTGGCATTATTTGTTGGTCA TGTTTGATGTACCATGGGTTAGCAACTCTTGTGCTATGTTAATTCAATTTGCCTATAAAAAATTAGAATATTGAGTGTTA ATTACCCTTACAAAATAATAAATGACTCGTGCATTAAAATTTTTACTTTCACTAGAAGTTCAATTTTTTTATTCTGTCAA TTTCTATATTTCTGATCAACTTGTTTTTGTTTGTTTTTATTTGCATATGCAATATATATCTATGGGTTCATAACTCACTT ATTTTATTCATTTTTTTATCCTTATTATTTATTTTATCATATGAATGACATAAGACAATGAATTAATAACTTCAGTCAAT TTGACCAGCGCCTGCACACTGATCACGCAACATATTTATTTTCAGCCATGCTTGTCATATATGTCACTCCAAAGACTTTT CTCAATCCAACAGAGTATAAATAGATCCTCTATTCCTCGGATAGCATAAGTACTAGGTTGGTTAGTTGCTATAAGCCATT AGCTATTTTCTTACTTGCTTGGCCCTCTTCATCGACCATCACTATGACAAACTCCAAAGCCCTCTGTTCCACTTTCCTCA TTAATTTTCTCCTATTCTTCTCCATGGTGAGTGCTAGTTACTATGAAAATCTCTCCCCAACACACTTAGGTTTCAAAGAG GAGAAGCTCACACACATACGCTTCTTTTTCCATGACATCGTTACGGGCCCAAAGCCCACCATGGTCATATCTGTCGAGTC ACCCCTCAAGGGCAGCTCCAAGTCTCCATTGCCCTTCGGATCCATTGTGGTGCTTGAGGACCCACTGACGTTGGGACCCG AACTTGATTCCAAACTTATTGGAAAAGCCCAAGGGTTTTACATAACAGTGGCCCAAGAGGCTGAGCTGTACTTGGAGTTA ATTATGGGGATGACATTTACGTTCATGGAAGGGAAATTTAATGGGAGCACCATCACTGTCATGGGGCGCAATACCATATC ATCTCCCGTGAGGGAGATGCCAATCACTGGTGGGACTGGGGCTTTCAGATTTGCTCGTGGTTTTGTTCAACCAAAGACTC ACCAGGTCGATTACTACAAAGGTGATGCTGTTGTCGAATACAACGTCTACGTGTTCCACTATTCTTCCACCTCTTCATCC CAGGAGGTTTTTAGCGACGGAACCCAATTCATGGCAGACCCGATACTTAGCAAAAATTAAGATAGTTAGTTTGTATGCCC TTAAAAGGCTATTTCCACTTGGCAGTTTAAATTCTGAATTTATATAGTTGTATGTTGACGTTGAAGTTTATAAAACCCTG CATCAAGTTTGCTTTTTTTTTCTTCTCTAAAATGAGATGTAAAAAGGTGCACAAGTTTTATAGGCTGCAAGTGGAGAATA ATTCTGTATTTATTTTTCTAAAATAAACTGAAATTAATTTAACTTAATGAATAGATTATGAGAACATCTCTCATAAATGA GTTTGGATAAAGTTGAAATTCAAATCAACACATAAAACAACACCCACCACGGGTATTCACTTCTGGCAACAGTACTTATC ACCTCGTCACAGGTTGTTTTTTTTTTGTAGTGATGAATTTTTTTTGAAAGTTTACAGTGATGAATTTTTTTTTTTGAAAC TAGTGATGAATTTACTTTCAAAAGAAAAAAAAATACTAATTGATTGAAAAGTCAATAGATGAAATTTTAAAAAACTTTAA TTTATTATATATCCTATTATCTTATCA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0733200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACCAACTCCTCCAAAACCATTTCTGCCACTCTCCTAGTTTCCCTTGCGCTTATTACTTTTCTCTTCTCCTCCACGGT GAATGCTAGTTATTATGAAAAGATTTCCCCAACACAGCTAGGTTTCAAAGAGGAGAAGCTCACACACATACGCTTCTTTT TCCATGACATCGTTACGGGCCCAAAGCCCACCATGGTCATATCTGTCGAGTCACCCCTCAAGGGCAGCTCCAAGTCTCCA TTGCCCTTCGGATCCATTGTGGTGCTTGAGGACCCACTGACGTTGGGACCCGAACTTGATTCCAAACTTATTGGAAAAGC CCAAGGGTTTTACATAACAGTGGCCCAAGAGGCTGAGCTGTACTTGGAGTTAATTATGGGGATGACATTTACGTTCATGG AAGGGAAATTTAATGGGAGCACCATCACTGTCATGGGGCGCAATACCATATCATCTCCCGTGAGGGAGATGCCAATCACT GGTGGGACTGGGGCTTTCAGATTTGCTCGTGGTTTTGTTCAACCAAAGACTCACCAGGTCGATTACTACAAAGGTGATGC TGTTGTCGAATACAACGTCTACGTGTTCCACTATTCTTCCACCTCTTCATCCCAGGAGGTTTTTAGCGACGGAACCCAAT TCATGGCAGACCCGATACTTAGCAAAAATTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0733200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTNSSKTISATLLVSLALITFLFSSTVNASYYEKISPTQLGFKEEKLTHIRFFFHDIVTGPKPTMVISVESPLKGSSKSP LPFGSIVVLEDPLTLGPELDSKLIGKAQGFYITVAQEAELYLELIMGMTFTFMEGKFNGSTITVMGRNTISSPVREMPIT GGTGAFRFARGFVQPKTHQVDYYKGDAVVEYNVYVFHYSSTSSSQEVFSDGTQFMADPILSKN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 29 | 29 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 29 | 29 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 29 | 29 | - | – | |
| Phobius | 1 | 29 | 29 | - | – | |
| Phobius | 1 | 9 | 9 | - | – | |
| PANTHER | 5 | 197 | 193 | 3.2E-83 | – | |
| PANTHER | 5 | 197 | 193 | 3.2E-83 | – | |
| TMHMM | 10 | 32 | 23 | - | – | |
| Phobius | 10 | 21 | 12 | - | – | |
| Phobius | 22 | 29 | 8 | - | – | |
| Phobius | 30 | 223 | 194 | - | – | |
| Pfam | 48 | 196 | 149 | 2.7E-51 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0733200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…