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LotjaGi1g1v0775800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0775800
Transcript ID LotjaGi1g1v0775800.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Piezo-type mechanosensitive ion channel-like protein; TAIR: AT2G48060.2 piezo-type mechanosensitive ion channel component; Swiss-Prot: sp|F4IN58|PIEZO_ARATH Piezo-type mechanosensitive ion channel homolog; TrEMBL-Plants: tr|G7KZQ3|G7KZQ3_MEDTR DUF3595 family protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0775800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:134796044..134813793) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TGAATTCCTTACTAATCATTTTCCATTATGAATTATCCAATTTCATTTCATTTCCACAATTTCTTAATTAACTGATTAGG AAGAGTTAACGAATTCAGTTGCTTCCTCAAATTCAGGAGGGAGGGAAAGTGAAAACTCGACGAGGGAACACACACACACA CACACACACGTAGCTCAGAATCAACAAAGCGTAACCGCACAACTCGCCTCTCAAATCAAATCTCACTACCATTCTCTTCT CCTCTCCTCAATCTCAACACCACCACCACCAACATTCTCCGGCGTCAATCATCGACTTCTACGCTGCATTGCCATCATGA GAAGCAAAAGCTTCCATCTCACGTTCAATTTCAGGGTTTCACGCATCGATCAGGTTCTATAAATGGATGGATCTGTGTTA ATTTGTTGCTATCATGTCCAGCCACTGACTCTTGCTACTTTTCCACACTCACATTATGGCGAGGTTTATCCCTGGAATCG TGTTGCCTATGCTCCTCCTAACAGGTTCGCTTATGAATTCAATTTGAATGTAATTTACTTCAAGTATGATACTGTGTCTT TTGATTTACTTGATGAAATGTGCTTTATATTGCAATTCTGCAGATTGCATGTTAATTAGTAGTATTAATTTAGTAACTAA ATTATATTATATGAATTTGGCCCTCAAATGAGGCTAATACATCCAAATGATTCATATTACCTATATTTATTCAAGTTTTC ATAAATTCACCATACCATAGTGTTTTCTAAAACTGCTAAGCATGATTAGTTAGGGTGGTTTGCTTTTTACTAAAAATTAA AGCAACAGATTATAATGGTGAGTATACTGTATACCTATTTATATATGCTTGTTCTTGTGGTTTTGTGTATGATTATATAA TGTCAGTCACGCGGTGCGCTAGTTACAACTGTGTATAATTTATGCAAGTGATTCTGTCTTAAGTTTGAGCGGGGTTGTTA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0775800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCGAGGTTTATCCCTGGAATCGTGTTGCCTATGCTCCTCCTAACAGCATCTGTACTTAATTGGAGCTTGATATCATT GGTTGATTTAATAGCCTTCCTTTTCATTCAGTATACGGCTCATAGAAAAGGATCTCGCTTCCATCAACAATCTTTGATAC CATGGTCTGTCCTTATACTGTCCTCCTTGACACTACTCTCGCATGCCATATTTCATATTGTTTTGGCCATTGAGGGGGAT CAGTGGAGTACTGCTGATGCACAATGGGCTCAGCTAATTGGATTTATAAGAGTGCAGTCTTGGAGGACTTTGCCTACGGA GTATTTTTTGGTCATTCAAGTATTAGCAACCTTTCTTTCTCTCATTGAAATATATGGAAATGGGTTTGGTCAAGATGCAT CTTCTGTTCTGCTGATAGGATCTCATCTCAAGGGCTTATGCTGCTTATTGTTGCCTGCTATACAATTAATTGTTGGGATT AGTCATGCATCTTGGGTTTCTTTTCCTTTTTTCATTTGCAGCAGTATTGGGCTAGTTAATTGGTCATGGACAAACAATTA TTTAGGTATCTTTCGGTGGTGGCGATACCTTCTATATTATGCTGGCTTCAATATCATCTTTTTGTACATATACCAACTTC CTATCAAATTACCAGAGACACTTAGGTGGATTTCTTACCACTTTGGGCTTTTCAAACTTTCTACAAAGTCAGAATGGTCA GAAGTTTGTAATGGTCTTTCACTTCTACTTTTCTACATCATGCTATCCTGGATTCGATGTGAGCTAGCCGAAATGGAAAT CATCCCATTAACAAGAGAAAGTGACTTGACCAAGCAGCTTCTTCCCAAAAAACACACTGATTTTGTTCATGAATCCAGGT CTGGTGTGAGGCATATTGATTTCTTATTTCGAGGAGCTGTTTCTCGATCGTTCAGCATAAACTTTCTAACATATGGATTT CCGATTTCCTTGCTAGCTCTATCATTCTGGAGTTTCCACTTTGCAAGTCTCTGCTCATTTGGATTGCTTGCTTATGTGGG ATACATCCTCTATTCCTTCCCTTCCATGTTCCGATTGCACCAACTGAATGGCATGCTTCTTGTTTTCATTCTCTTTTGGG CAGCTAGCACATATATCTTCAATGTAGCACTCACTGTCTCCGATAACAAATCATGGAAGTATATGAAGATGTGGGAAACT ATAGGCTTGTGGCATTACCCTATCCCAGGATACTTTTTGCTTGCTCAATTTGGTCTTGGCTTTCTTGTTGGCATGTGCAA TCTTGTAATTAGTTCAGTGTTATCGTGCATTACTGATCAAGGACAACTAACAGCTGATGAATCTGTAGTGGAAGAGGAAG AAGAGACTACAGTATTAGTTGTGGCTACAATAGTGTGGGGATTGCGCAAGTGCTCACATGCTGTAATACTAATATTGATA TTTCTTATTGCAATAAGACCTGGCCTCATGCATGCTGTTTATATGATTTTCTTTTTAATTTATCTTTTAAGGAATGCAGT CACTTGTAAATTACGCCAGGCAATTATCCTTTTATGTGAGGCACAGTTTGCACTTCAGTTCATTCTTCAACTTGATCTGA TCTCCAAAACATTGGATCAGAAGGGTTCTTATGCTTTTCAAATTCTGTCACAATTAGGCCTACTTAATCATATCTATTCA GTGGATTTCTTCAAAATATCGGTTCTCGCTTGCTTCTGCGCAATTCACAACAATGGGCTTCAAACACTTCTTCTATTTTC TGCTATTGTCCGGCACACATCTTGCCCCCCTGTTGGGTTTAGCATCTTGAGAGCTGGCTTGATTAAACCTGTTCGTTTAT TAGGTCATAGTCCAAGATCCAGTGAGATCCCAGGAACTCATGGGAGGAGGACAATATCTTATCTGGAGATTACAAGACAG AATTTTCTTTCTGTTTATCGGTCATGTGGCAAATACATTGCCTTCCTGACAATTCTCCTCTGTGTATACCTTTGCACACC CAACTATGCTTCATTTGGTTACTTATTCTTTCTTCTACTGTGGATAAGTGGAAGACAACTTTCGGGGAAAACTAGAAAGC ATCTATGGAATCCAATGAAAATATATGCTGTATTTGTGTTTGTCTCCATTTACAGCATTGGTGTCGTTTCCAGCTCAGAC ATGTGGTTTCCCATGATCATTGATCTTCAAACTGCATTTGGGTATAACCCAGCTGCTTCAATGTTCCAAAACATTTGGGA ATCCTTGGCTATATTGGTAGTGATGCAGCTATATAGCTATGAAAGGAGGCAGAGCAAAAGTTCTGGATCAAGTGACTTTG ATTTACCAGAAGTTGGACCCTTTCCTTTTACCAGACGTCTTTTGGTTCGTCATACTGAGAAAATATTATTCCTTGCCCTG TTTTATGCATCCTTATCACCTATTAGCGCATTTGGCTTCCTGTATCTTCTTGGTTTAATTAATTGTTCGAGATTACCAAA GTCTTCTCAGATCCCTGCAAAAGTATTTCTAGTTTATTCAGGACTTCTTATAATGGTTGAATATCTTTTCCAGATGTTGG GAGATCAGGCTGAAATGTTTCCTGGTCAAAAGTACTCTCAGTTGTCCTTAATTATGGGTTTACAGTTGTATAAGCCTGGT TTTAAAGGCTTAGAGTCAGGGTTTAGGGGAAAGGTTGTGGTTATTGTAGCATGTATACTTCAATACAATGTTTTTCGTTG GTTGGAGAAGATGCAATATGTTGATCCAAATGGAGGAAAATGGAACGAACCTTGTCCTTTGTTCAATATGGTAGATATTC CTAATGAAACTACTGCCTGTACCCCACAAAATAAACAAGCAGAAACTTCCACCTCAGCAACAATTAAAAGACTTGCAAGA AGTCGTTCATGTCCAACAGTTAATTCTGCATTATCCCAAGGAACAGATTCAGGGATTGAAGGAGACAGCACCAAAAAACT CAGACAGTTACATTTCTGGGAGAGTTCCAAGGATAGCTTGAAGTGGAATAGAAAGAGGCTTCTTTTCTTGAGAAAAGAGA GGTTAGAGATGCAGAAGACTGCTTTGAAAGTATCGTTGAAGTTCTGGATAGAAAATATGTTCACTTTATTTGGTCTTGAA ATCAACATGATTGCTTTGCTTCTTGCTAGCTTTGCTGTGTTGAATGCCATCTCCTTGCTCTATATTGCATCACTTGCTGC TTGTGTTCTTCTACATCGGCTACTTATTAAAAAGTTATGGCCTATTTTTGTTTTTCTATTTGCTTCTGTCGTCACTGTTG AATACTTGGCTATCTGGATGCGCCTCACTTTTATGAACCTAGAGATTGAAGAACATGTACCATGCCGTGACTGCTGGAGA GTATCGGATATATACTTTAGCTACTGCAGAAAGTGTTGGCTAGGAATTATTGTTGACGATCCTCGTATGCTTATTGGCTA TTATGGGGTTTTCATGTTTTCCTGTTTCAAATTCCGTGCTGACAAGTCATCTAGTCTCACCGGATTAGAGATGTATCAAA AAATACACTCTCAATGGAAGTCCGCATCTGTACTAAGTAATCTTTCATTTGAAACAAAGGGATACTGGACGTTTCTCGAC CACTTGAGGCTTTATGGTTACTGTCACTTGCTAGATTTTGTTCTTTCCTTGATTCTGATTACAGGAACTCTTGAATATGA TTTTCTACATCTTGGCTACCTTGGTTTTGCTCTGGTTTTCTTCCGAATGAGGCTAAAAATACTAAAGCAGGGAAATAACA TTTTTAGATACTTAAGGATGTATAACTTTGCTGTTATCGTTTTGTCTCTTGCATATCAATCTCCTTTTCTTGGTGACTTT AGTGAGATCAAAAGTGGTTTCATAGAATACATCAATGAATTGGTTGGATTTCAAAAGTATGATTATGGATTTCGAATTAC ATCGAGATCAGCATTAGTGGAAATCATCATATACATGTTGGTTTCACTACAGTCATACATGTTTTCATTTCCAGAGTTTG ATTATGTATCAACATACCTTGAGAAAGAGCAGATTGGTGCTATACTGCGACAGCAAGAGAAGAAAGCTGCTTGGAAGACT GCTCAGTTACGGCACATACGTAAAGCTGAAGAGCTGAAGCATCTTCGAAGCTTGCAGGTAGAAAAGATGAAATCAGAGAT GCTTAACCTTCAAAATCAGCTGCATAGTATGAGCACTGATGCGAACTATAGTAATGCTTCTCTAAAAAATGATGGTTTAA GAGAGAGAAGAAACTCTTTCCTAGAAAATGAATTCAGGAAGCAAGCTCTTGATACAAATACTGAGTCCATAGGCACATTG GATGTGAATCAATCTCTCTTAAGTGAAAAATCTGAAAGTCCATTGGTACCAGAATATATGAAGCATCCAATGGGCTCTCC TCATGGAATTGTTGAGGTAAAGGAAAGAACTAAAAACAACGATTTTTTGGATTTAGAAATACGGAATCGTTACAAACTGC CAGGAAAGAGAAATGCTTTAGTTTCAGCTGTACATTTCATAGGGAGTGGAATATCTCAGGCTCAGTCTCTTGGAAATATG GCAGTAAACAACCTAGTGAACTATCTGAAGATAGAACGAGAAGGACAAGAGCCCACTGATGATTCTTCAGAAGATGAGGA ATACTATGAGATTGAGAATCAGAATTCGGGTGCAGAACCTCTGGAGCCTACATTTTCCACAAACTCTATTAATGAGCATA CTGGGTCTGATACTTCTTGCCTTCAAATTGGTATTCTTGTCCGTCACATATGGTCTCGAATGAGGTCGAATAATGAAGTT GTTTGCTATTGCTGCTTCATTCTAATATATTTATGGAACTTCAGTTTACTTTCAGTGGTCTACCTAGCAGCTCTCTTCTT ATATGCTCTCTGTCAAAATACCGGTCCAAGTTACATATTTTGGGTTCTTATACTAATTTATACTGAAGTGTGCATTTTGC TACAGTATTTATATCAAATCATCATTCAACACACTGAGTTTGAATTCCCAATGAGCTTACTTCAAGAATTAGGATTTCCT GCAAAAAAAATAACATCGTCTTTTGTCACAAGCAACTTACCATTTTTCCTCATATATATATTCACTCTCTTGCAAATCTC CATAACCATGAAGGGTGGTGGTTGGACAATCTCTGTAGATCCCAGCTTTTTTAGGAGAAGAAATCAAAAAAGCTACTTGG AGGATGTGAAGTGCTCCACCTACCATGAGAGAGTACAGAGATTATTTTTACCACTGAGCAATGCATTGAAACTGTTAACC AGAAGCCTCTGTAGGTACTGGAAATCATTAACCTGGGGTGCAGAAACTCCCCCTTACTTTGTGCAGCTGTCTATGGAAGT TAATTTGTGGCCTAAAGAGGGAATTCAGCCGAAGAGAATTGAATCAAAAATAAATAAGCTATTGAGGATCTTGCGTCATA GGAGATGCAAAGAGGAAAAGATTTTTAATTTGCACTCTGCAAGTAGGGTTCGTGTACAGAGCATTGAAAAAAGTGAAGAG AACGAAAACTTGTGTCTTGTTATTTTTGAGGTGTTATACGCCTCTCCTCCAAATGAATTTGCTGCTGAAGAATGGTACAG CTCATTAACTCCAGCAGCAGATGTATCCTATGAAATTCAGAAAGCTCAACATGCAGGTATTTTAAAAGAAATTGGGTTTC CATATCGAATCCTTTCCGTCATTGGTGGGGGAAAAAGGGAAGTTGATCTTTATGCCTACATCTTTGGAGCTGATTTGGCT GTTTTCTTTTTAATTGCCATATTTTATGAATCAATTATGAAAGCTAACAGTGAGTTTCTTGAAGTCTATCAGCTTGAAGA TCAGTTCCCAGAAGATTTTGTATTAGTTCTCATGGTTGTCTTTTTCTTGATCGTGCTTGATCGTATTATATACCTCTGTT CATTTGCAACAGCAAAAGTTATTTTCTATTTATTCAGCCTTGTTCTCTTCACATATTCAGTCACAAAATATGCCTGGGAC ATGGATCCTTTGCGCAGATATTCTGGAAGATTAGCACTTCGTGCCATTTATTTCACAAAAGCAATCTCTCTGGTTTTGCA AGCCATACAATTTCATTTTGGGATGCCACACAAAAGCATTTTGTACAGGCAGTTTTTGACCAGTAGTGTTTCACGAATTA ATGTTATGGGGTTTCGACTATATCGCGCTATACCTTTTCTGTATGAATTGAGATGCGTGCTAGATTGGTCTTGCACGACA ACATCTTTGACTATGTACGATTGGCTAAAGTTGGAGGATATTCATGCAAGCTTGTTTCTTGTCAAATGCGATGTGGATTT GAATAGAGCCAGCCACCAACAAGGGCAAAAACAGACAAAAATGACGAAGTTCTGCAATGGGATATGTTTATTCTTTGTTT TAATGTGTGTCATATGGGCTCCAATGCTGATGTACAGTAGCGGTAACCCAACAAACATTGCGAACCCGATCAAAGATGCC AGTGCTCGGGTTCATATAAAGACATTAAGTGGAAGGTTGACATTGTTTGAGACTACTTTGTGCGAAATTATATCGTGGGA AACCCTTGAAGCACGAACAAGTTTGGACCCCAAGGGTTATCTTAGCACATATAATGAGAAAGACATTCAACTAATTTGCT GTCAATCAGATGCAAGTACATTGTGGCTTGTTCCACCTATTGTACAGGCCAGATTTATGAAGTCCCTTAGCTGGAACATG GACCTTGCTTTCTCCTGGGAATTCACCAGAGATAGGCCTAGAGGAAAGGAAGTAGTGAAGTATGAATTAACCATACAGGA GCAGGATCTTCCTAAATCTTCAGAAGTTACTGAAGTTTTCAATGGTACTTCCAATAGTTTCTCAGCGTTCAATATTTACC CTAGATATTTTCGGGTCACAGGCTCTGGAGATGTGCGGTCCTTGGAACAGTCGGTGGAGCTAGTTAGTGGGGATCTTGTT CTCAACCGTGGCAATCCAGAATGGTGGTCTTTTTATGATCTTGACATCTCTGATGCACATGGATGTGGGAAGTTCCCAGG ACCGATGGCGATAATTGTATCTGAAGAAACCCCACAGGGCATTATCGGTGACACTCTCAGCAAGTTCAGCATCTGGGGTC TTTACATCACCTTTGTGCTTGCGGTTGGACGATTTATCAGATTACAATGTTCTGACTTGCGAATGAGAATTCCTTTTGAG AACCTTCCTTCTTGCGACAGATTGATGGCACTGTGTGAAGATATATACGCTGCACGAGCAGAAGGAGAGCTAGAAGTGGA AGAGGTTCTGTATTGGACGCTTGTTAAAATTTATCGCACTCCACACATGCTGTTAGAGTATACACAGGCTGAATAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0775800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MARFIPGIVLPMLLLTASVLNWSLISLVDLIAFLFIQYTAHRKGSRFHQQSLIPWSVLILSSLTLLSHAIFHIVLAIEGD QWSTADAQWAQLIGFIRVQSWRTLPTEYFLVIQVLATFLSLIEIYGNGFGQDASSVLLIGSHLKGLCCLLLPAIQLIVGI SHASWVSFPFFICSSIGLVNWSWTNNYLGIFRWWRYLLYYAGFNIIFLYIYQLPIKLPETLRWISYHFGLFKLSTKSEWS EVCNGLSLLLFYIMLSWIRCELAEMEIIPLTRESDLTKQLLPKKHTDFVHESRSGVRHIDFLFRGAVSRSFSINFLTYGF PISLLALSFWSFHFASLCSFGLLAYVGYILYSFPSMFRLHQLNGMLLVFILFWAASTYIFNVALTVSDNKSWKYMKMWET IGLWHYPIPGYFLLAQFGLGFLVGMCNLVISSVLSCITDQGQLTADESVVEEEEETTVLVVATIVWGLRKCSHAVILILI FLIAIRPGLMHAVYMIFFLIYLLRNAVTCKLRQAIILLCEAQFALQFILQLDLISKTLDQKGSYAFQILSQLGLLNHIYS VDFFKISVLACFCAIHNNGLQTLLLFSAIVRHTSCPPVGFSILRAGLIKPVRLLGHSPRSSEIPGTHGRRTISYLEITRQ NFLSVYRSCGKYIAFLTILLCVYLCTPNYASFGYLFFLLLWISGRQLSGKTRKHLWNPMKIYAVFVFVSIYSIGVVSSSD MWFPMIIDLQTAFGYNPAASMFQNIWESLAILVVMQLYSYERRQSKSSGSSDFDLPEVGPFPFTRRLLVRHTEKILFLAL FYASLSPISAFGFLYLLGLINCSRLPKSSQIPAKVFLVYSGLLIMVEYLFQMLGDQAEMFPGQKYSQLSLIMGLQLYKPG FKGLESGFRGKVVVIVACILQYNVFRWLEKMQYVDPNGGKWNEPCPLFNMVDIPNETTACTPQNKQAETSTSATIKRLAR SRSCPTVNSALSQGTDSGIEGDSTKKLRQLHFWESSKDSLKWNRKRLLFLRKERLEMQKTALKVSLKFWIENMFTLFGLE INMIALLLASFAVLNAISLLYIASLAACVLLHRLLIKKLWPIFVFLFASVVTVEYLAIWMRLTFMNLEIEEHVPCRDCWR VSDIYFSYCRKCWLGIIVDDPRMLIGYYGVFMFSCFKFRADKSSSLTGLEMYQKIHSQWKSASVLSNLSFETKGYWTFLD HLRLYGYCHLLDFVLSLILITGTLEYDFLHLGYLGFALVFFRMRLKILKQGNNIFRYLRMYNFAVIVLSLAYQSPFLGDF SEIKSGFIEYINELVGFQKYDYGFRITSRSALVEIIIYMLVSLQSYMFSFPEFDYVSTYLEKEQIGAILRQQEKKAAWKT AQLRHIRKAEELKHLRSLQVEKMKSEMLNLQNQLHSMSTDANYSNASLKNDGLRERRNSFLENEFRKQALDTNTESIGTL DVNQSLLSEKSESPLVPEYMKHPMGSPHGIVEVKERTKNNDFLDLEIRNRYKLPGKRNALVSAVHFIGSGISQAQSLGNM AVNNLVNYLKIEREGQEPTDDSSEDEEYYEIENQNSGAEPLEPTFSTNSINEHTGSDTSCLQIGILVRHIWSRMRSNNEV VCYCCFILIYLWNFSLLSVVYLAALFLYALCQNTGPSYIFWVLILIYTEVCILLQYLYQIIIQHTEFEFPMSLLQELGFP AKKITSSFVTSNLPFFLIYIFTLLQISITMKGGGWTISVDPSFFRRRNQKSYLEDVKCSTYHERVQRLFLPLSNALKLLT RSLCRYWKSLTWGAETPPYFVQLSMEVNLWPKEGIQPKRIESKINKLLRILRHRRCKEEKIFNLHSASRVRVQSIEKSEE NENLCLVIFEVLYASPPNEFAAEEWYSSLTPAADVSYEIQKAQHAGILKEIGFPYRILSVIGGGKREVDLYAYIFGADLA VFFLIAIFYESIMKANSEFLEVYQLEDQFPEDFVLVLMVVFFLIVLDRIIYLCSFATAKVIFYLFSLVLFTYSVTKYAWD MDPLRRYSGRLALRAIYFTKAISLVLQAIQFHFGMPHKSILYRQFLTSSVSRINVMGFRLYRAIPFLYELRCVLDWSCTT TSLTMYDWLKLEDIHASLFLVKCDVDLNRASHQQGQKQTKMTKFCNGICLFFVLMCVIWAPMLMYSSGNPTNIANPIKDA SARVHIKTLSGRLTLFETTLCEIISWETLEARTSLDPKGYLSTYNEKDIQLICCQSDASTLWLVPPIVQARFMKSLSWNM DLAFSWEFTRDRPRGKEVVKYELTIQEQDLPKSSEVTEVFNGTSNSFSAFNIYPRYFRVTGSGDVRSLEQSVELVSGDLV LNRGNPEWWSFYDLDISDAHGCGKFPGPMAIIVSEETPQGIIGDTLSKFSIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPFE NLPSCDRLMALCEDIYAARAEGELEVEEVLYWTLVKIYRTPHMLLEYTQAE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 19 19 -
PANTHER 4 2451 2448 0.0
PANTHER 4 2451 2448 0.0
TMHMM 13 35 23 -
Phobius 20 40 21 -
Phobius 41 51 11 -
Phobius 52 77 26 -
TMHMM 55 77 23 -
Phobius 78 107 30 -
Phobius 108 125 18 -
TMHMM 108 130 23 -
Phobius 126 136 11 -
TMHMM 137 159 23 -
Phobius 137 157 21 -
Phobius 158 162 5 -
Phobius 163 181 19 -
TMHMM 164 183 20 -
Phobius 182 192 11 -
Phobius 193 211 19 -
TMHMM 196 215 20 -
Phobius 212 238 27 -
Phobius 239 258 20 -
Phobius 259 300 42 -
Phobius 301 320 20 -
Phobius 321 331 11 -
TMHMM 329 351 23 -
Phobius 332 353 22 -
Phobius 354 364 11 -
TMHMM 364 386 23 -
Phobius 365 386 22 -
Phobius 387 405 19 -
TMHMM 401 423 23 -
Phobius 406 430 25 -
Phobius 431 473 43 -
Phobius 474 503 30 -
TMHMM 475 497 23 -
Phobius 504 651 148 -
Phobius 652 680 29 -
TMHMM 652 681 30 -
Phobius 681 700 20 -
TMHMM 701 723 23 -
Phobius 701 723 23 -
Phobius 724 742 19 -
TMHMM 738 760 23 -
Phobius 743 760 18 -
Phobius 761 794 34 -
TMHMM 795 817 23 -
Phobius 795 819 25 -
Phobius 820 830 11 -
Phobius 831 850 20 -
TMHMM 832 854 23 -
Phobius 851 1042 192 -
Phobius 1043 1067 25 -
TMHMM 1043 1065 23 -
Phobius 1068 1078 11 -
Phobius 1079 1098 20 -
TMHMM 1080 1099 20 -
Phobius 1099 1203 105 -
TMHMM 1202 1224 23 -
Phobius 1204 1222 19 -
Phobius 1223 1227 5 -
Phobius 1228 1245 18 -
TMHMM 1228 1245 18 -
Phobius 1246 1256 11 -
Phobius 1257 1274 18 -
TMHMM 1258 1277 20 -
Phobius 1275 1301 27 -
Phobius 1302 1321 20 -
Phobius 1322 1599 278 -
Coils 1380 1400 21 -
Phobius 1600 1626 27 -
TMHMM 1606 1628 23 -
Phobius 1627 1637 11 -
Phobius 1638 1658 21 -
TMHMM 1640 1662 23 -
Phobius 1659 1909 251 -
TMHMM 1695 1717 23 -
Phobius 1910 1933 24 -
TMHMM 1911 1933 23 -
Phobius 1934 1952 19 -
Phobius 1953 1973 21 -
TMHMM 1953 1975 23 -
Phobius 1974 1979 6 -
TMHMM 1980 1999 20 -
Phobius 1980 1999 20 -
Phobius 2000 2010 11 -
Phobius 2011 2033 23 -
TMHMM 2012 2034 23 -
Phobius 2034 2123 90 -
Pfam 2063 2449 387 8.4E-111
TMHMM 2124 2146 23 -
Phobius 2124 2145 22 -
Phobius 2146 2368 223 -
TMHMM 2369 2386 18 -
Phobius 2369 2386 18 -
Phobius 2387 2451 65 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Mechanosensitive ion channel activity Enables the transmembrane transfer of an ion by a channel that opens in response to a mechanical stress.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0775800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…