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LotjaGi1g1v0780000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0780000
Transcript ID LotjaGi1g1v0780000.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Kinase family protein; TAIR: AT3G04810.1 NIMA-related kinase 2; Swiss-Prot: sp|A2ZMH2|NEK2_ORYSI Serine/threonine-protein kinase Nek2; TrEMBL-Plants: tr|I1NC81|I1NC81_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0780000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:135177961..135204046) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTTTTGTGGTTATCATGATCCGTGGAAGTAGGGCTGAGCATCGGGCGGGTTCGGGCGGGCTCGGGTGGCACACACCGGGT TTGGACGGGTTTGAACCAGACATATATCAAACTGTTACCGACCGTGGAAGCCTCGGATATCTCGGGTGCGGGTTGAATCG ATGAGCGGGTTATGCGGGTCGGTTAGTACGGGTACACCATTCTTCTCCTTCTTCCCCCTTCCTCTTCCTGGCCACATCTA TTCTTCCCTTCACGACTCTATTTCCACACTTGCCTCGTCTAGGAAACACCATTGTTAAGCATCTTAGAATGAAAAAATCT TGCAAAGATGAGATCTTTACGATCTCTAGTGGTGATAACACTGCACGACCGCCGCGACATGAAACACAAGCTCTTATAAA GCTTTGTGAACATGGGTGGCTGTGCAAGAAGAACGGTGGTCGGATGTGGAGGTTTCTGCTGCGAACGGTGGTGGTTTATG AGCAAGTGGGTACTTGGGCTGGTTTGTGGGAGAGAAGAGGTGATGGTTGTGGTAGCTTCGGATGATGAGAATTGAGAAGG AGGTTGTGGGTACTTGGGCTGGTGTGTGAAGAAGACAAGAGTTTGTTTATTTTATCATACCTCTTTATTTCTTTGCAAAG TCACGTGAAAGGCTAGTATGACAAAAAGTTGAAGCTATGTGTAGCTTGCTGGCTTGTGGCAGAAAAAAGTTGATGGCCCT CAAGCCTCATCAGTCATCACAGTATCACACTGATCAATGGTCATAGTCCCAGCCTAGTGTGACAGTCATAATAAAGCTGG CACATCACGTGTAAATAAAATAATTGATACCTCGGGTCGGTTCGAGTTTCGACGATTTTTAAATATTCAACCCGAACCCG ACCGTTTTTACCCATCTGGAACTATAGCAGCTTAACCCGATCTGATACATCCGACCCGACCCGCCCGTTAATGTTGTTTT 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GGTTTCTGTTATAAAGAATGCTTGGTAGGTTAGATTTGACGATTTAACTTGTCTTGGTGTTGGGTTACAGGAACTTACTA AAAGGGTACTGGCAGAATGGAATATCAAACTTGGCTCAAAGTTGAAACTCAGGGATGAGAATGGTAAACTGTGGCCGGTG GCTATCAGGGAAAAGGGGAACAGGAAAAGCAGGAACAAGCGTTGTTATTTAGGTGATGGATGGGGGAATTTCCTGAGGAG TCACAACATTAAAGAAGGCTACACATGTGATTTTCAGTTTGTTACTAACAAAGAAAATGTAGCCGAAGAACTGCTTGTGC GTGTACATCAACCTTCAAAATGCTCATAGTATAGGTGAAACCACATGTAAATTTGGGCATGAATCTTTTATTTTGGTTTG GACCAAGGGTTTTTAATCTCTAAAATAACTCGGTGGTTTTTTATTTTTTCATTAAAAGTAAGATGGGTTTCACTTTTATG CATGCTGTTAAAGTCTCAATGTTTGCTTTACTATCAAGACCAAGGTATTTCTATCACAACTCTTTTGAACTTTGCACACA TCTTGAACAAAATAAATTAAAAATGACAAATGGCATATAACTGTACACCCAAGCCAAGAAGTTCTACTTTGCTGAATTCA GCTTAAAATTTACCTATATTTCACGTTGTTTCGCATAGAGATCAATGCTACCAATTTGCAGTCGGGAAGTAGAATTAATG TCTCTGACTGCCAGGAACCTAAACCTGCAAAGACAACTTTTGTCACTTGGGGAGAAAAATATGAACAGATTCAGCTGTGA AATAAGAATAATCTAAGACTATGCATTAACCCACTTCAAATGCAATTAATATGCAAAAATTTCTAGCTCTAGTTTTCATC TTACTTGAGAATATATTCATTTGAATTCAATTGGATATATGATCATTTTTATGATATAAATATCTAATTTATGAATTCTA CTGTACAATATTCAAAGTCATTTTCATGTTTTTAAGAAATCAATTTATAAAAATGAAAATTTAAATATTATGTTTAGCTT AGTTATCGTAGACTTGTAAAGCTATTTGTATGACAATGTAAAAATATAAACATAAAGTAGTAAAGGAAACTGGATCAAGT TAACAATATTTTTCAAAATTAGCAGGTCCAGCATAGGTAGACTGAAAAAATATAGAAATAAAAAAATAAAACTAAAACAA TAAGAATCATTGTATGTTCTACGCTGAGTTGATCTTATTAGACTTAATGTCTCCACTGTGCTACCTGAAAACATTAGATG GAAAACTTGCTGAGTTAATCGTGTATGTTCTACGCTGGAAACGATCTTCAAAGAACTGTGAGGTTTGCTTGTCCAAAACT TGCCAACTGATCCCCTTGTCATTGCTCCCTTCAAGAATCCTGAGAGCATAACATACACAGAGAATGATCATGATTCGTGA AAGCACATCACATGCTTAATTAACTAAGTTTACACGTGAAAGCTCAGTTATCAAGCAAAGAAGGGTTCATCAGAATCTTT TTAGTAAAAAGGAACCAACAAATGAACACACCATTACAAAAGAGTAACACAAAAGAATATAATTTAACAGCATAATATTT TTTAAGGATTTGATTCTGATCAGCTGACAGTGTTATAAGTCTTATACTACCAATAAACTATATTGCACTACCTTTTCAAA AAAAAAAACAGTTAAATCTTTTCTTGGAAGTAAATATCAAGTTACTGTAGTTAAAGTACACTTTCTTATTATAAGTGTAA CGAATTATAAATCGAGAATGGATTAAATTAAAATTAATCATCTATGGAAGAAGAAGCAATTACACTACTATAATTTGGAG CAATGTAACTTATTAGGACTAGTGAATGCACCAAGTAACTCAACTACTAATTAATTAACGATAATATAAGATGACAAGAG 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TATTCCACCTATGCCATGGATTTTAAAAATTTGAGAAAACATGCACGCAAGATGGAAACTTTTCAAAAACATAATATAAA AGGCCAATATAAAATCATTCATGTGTCTTTGACCAATAGCTTAAGTTTTCAGGATAGTTGGTTTCGTGACAACTTTTAAT AAGGACAAGGACGACTACTTTCTCAAATCAATTAAATGGAACAAAGCAATGAATATAGAAAAAGAACTGTGAAATGAATA ATACCCTTTTTCATATAATAATGGCCTGTCATAGATTCCTTCACACGGGTCAAGATGAATCCATCTGTAAGATCATAGGT CATCAAAAACAAATAATGTCCCCAGAAAAAGTTTTAAAAGAAGATTACGAGAACTATAAGCTTTTGGATCAATTTTACCT TCCTATGTATTGAGAGAAACACTCCATCCAAACATGATCTGTGAAGTCCAAGATCTGGAGATTAACCAAAACCAGTTAGA GAAAACAATTGCTCATAAGATTGTACACCATATACAAAATTCACAAGCAAAAGTCTAAGGACATCAATATTCAATACCCA TTTTCCCTAGATAGTGAAAACTGGCCCAATCATCACATAAAAAATCAATGATCACCACCATGTGCAATATCACAAAATAA GTACTTAAATATTCAAAACCTAGTCTACATCAAAGAACAGTGATACATCATTTACTCAATTGCATCATAATAAACTAAGA AAGATTAACATGCTAAAAAGACTAAATTTCATCATCCAATTACAAACCAGACGTGAGTCATAGCCAAAAGCTCGACAGTA GAGCGTGAAGCAATTGGCCCATTCTCCGCAGCGTCCTTCTCTTGTTTCCACAAGCTGCAAATTGAAAGAGAAAAATTGGA GTATCCAACACAAATGTGATAGGCATAGCAGGATTCTGGCATTTGGCCAAGTACAATTACAGCATTAATAGTGTGACGCA AGTTCAGTACCTTTATTGCATCATTGTACCGAGGGAAGCGAGTCAGATTGGAGCATGAGGTGCAGCTGTGTTGTGGAAAG ATAATTGTGAATAACCAAACAATTATGAACGTCAGGCACATAATAGAAGCTAAAATTAGTGAACAAGGGTAGCAACCTAC CAGAATTCTTTACAAGCAGAAGGCCAAAATGCAAGTAACAATAATAAAACTAAATGGTTAGAACTAGATCTCCTAAATGT AAATAGATATGTAATGTAGGAATACTTCAGCACAAATAGGAAAAAGGTTTTCTAGCCAAGACCTGTTCTAAATAAACTAG AAATGTTTAGTAGACGCCCAAGTAGGATGACTACACCCAAGCTAATATGAGAGAAAAAGGAAAATAAGAGAGAGAGAAAC TATAGATGTGATAAGAAGAGAAAGATTAGAGAAAAGGTGAATGTGGGGTGTCGTTCTGGTTGGGGTGTTCAAAATCAGGA TTGAACTATATTCTAGCGGGAAATAACTTATTGATCTTGAAGAATAGGATACTCCCAAATTAAAGATACTAATGTTATAA ATTAACAAAATGTAGCAGTCAGATCAGTTGATTAATTCTAGCATAAAGGTGGTTCAAAATTAGTTCGAATGTATGATGTC ACAAGGAAACTTAGATATATGTCAATTATGTTATTTACTAAAGGCACATTACTAATCACAGTATAAGGGGAAAAATAAAT TCACATTAATTTAAAGTATACATTCCACGCTCATACCGATAGAGTTCAACTCTGGAAGCTCCATAACGAGTCTCGGAAGG AAGTGGAGCAGTCATACCCTGGGCTACAGTTTGGTTGCCACAATCTTGACAAGATGGTGAATTCACCCATCTATGAGATG AGGTGAAGAAGGAAAGAAACAAAACAAAGATCAGAAACAATCAGGCAAAAGGGAAAAGGCATGATGGTTAAATGGTGCTT TTAATAGGGAGGGAAAAAAAGATGCAACTAAACCTGAAGGATTTCTTGAACCAGAAAAGAAGTTGTAGCAGGAAAGCATG ATCTTGTTCTATTTTTGATGGCTTGAAGTTCCCCTCCTGGAGTATGTTTATCAGGTTTACCAATTACAAAACAGTTGTAG CAGAGTATGAAAAGCTAAAGCGTATGAAATGGGAATCCTGAAGAAAACTTAGACATCTGATTCCTATGAATTAAGATGGT CTCTTGAAAGAGAAAAATACACCCACTTACCTTGGCCAAAGAAACCAAGGCTTTCTCCTCAAGCTCTTCAACAGGAACGG TCTTCCTAGCAGCCTCCTGACGTATTGGGTCCTCATACTGTATACATATCACAACAATCAACATATGGAATCAATTGAAA TATAACATTCATAAGGACAAGATTACCATGTGTCTTTAGCATTGAGTTTGCACTTTGCAAAGCCCCAAATCATGATTTGA CCAAAAGCTTTTTTCCCTTATAACATTTGCTCAAACCATGGCTTAGAGATTTCAAATGCAAAACTAAGTACACTGATTCA TCAACTAGGATTGGAGTTGGCCTACTTTACTTAATTTATTTAAAACTAAACCCTGTTTTCACACACACTATATGCATCTT CATGAACTAATGTATTGTGTAACTGTGTTCCTTACTGAGAAGAAAAAAATTCAATAAAATCAACTATGACAAAGTATATA ATAAGGTGAAAATTACCATGAGGACTTGTGTAACGTAAGGCCTAACTCTACCCTCAAATTGTTGAGTATCTTCGCCGGCT ACGAATTGCTGCAACATAAGTGCTTCCTCCTCTGCCTGTGCAGGTAGATATAGTGCATGTAAACAACACAGACAGAAAAT GAAAATCAAAACAAATTTGAAGACTGAAAAATGGAGGTAAACAAAGCCAACCTGCAAGAGTCTAGCCAATTCCTCATCGG AATTCAAGTGGTCGGCAGTGCTGGATTGAGGTTCAGGGTCGTCGTCGTCGATGGAGACGAGTCGTAGCTTATCGGAAATG GTGGTGAGATCGGAGTCGGTAGCGACTGCGGTGTCGTTTTCAGCTGCGTAAATCTTCTGTTGAGGAGGTGGAATTGAAGT GAGAGAGTAGAGCTGGAATTGAAAAACCTGCAGTGGAAGTCGAAGATCATGGTGATGAAGATGAAGATTGAGAATTGAAT TGTTGATTGAGAAAGAAGAGAACAGGAGAATACTTGGAAGCCATCGTCGGTGTCGTAATCGAGATCAACGTTGGAGTGAT TGTGAAGCACCTGGAATTTGCGAAGCACCATTTTTCTCTGCAACTGAACTGAAACCCTCCAACGATGTATCAAAAAGATG AAACAAGTGAACTCATGAGGGTGAATAGTCACGTTGGTCCCTAAAGTTACACCAGTCGGGCAAATTCGTCCCTATTCTTC CTAAATGGCTCCCGTCGTCCCTGAAGTTTGAAAACGTCGGTCACGTTGGTCCTTACCTGAGCTCCCGTTAATAAACGTTA ACAGAGATGATGAGTTGGCACGTTAAGTGCTCTGATGGCCATTCCACGTGGATCTGAGGTGTTTCCCTCCAAAATAAACA TAATGGCAAATTAGTCCCTGGTAGGTGTCACATTGTGGTTGGACCTTAAGTTGGCAAAATAGTCCTTGCCACCTTCTTCA TACCCAGTTAACGTAAGCCTCCTAAACCCAAACCTTTCATCTTCAACCCTCTGACAAGCAAGAAGAGACGAAGGCAGAGG AGAGTTGAAGAGCGTTGAAGTGCGTTGAAGGTTGAAGAGAGGCGAAGGCAGAGGACAGAGGAGCGTTGAAGGTGCTCGGT CACCGGCGTAGAAGAAGGATACAAGAGACGCTGCTCTTTTTGGGGTTTCAGTCTCACCGAGGCAAAGGTACAATCTTTCC CTATTTTTGTTCATGAAAAACCCTGAAATTGATCTCCAACATGCTTATAAGCTTAAGATAACCGTGATTTTGCTCTATAA ATTACATGTTCATCGTTTAAATGTTTCAAGGTTTGTCATTGTGGGTTAATACAATCGGGGGATTGTAATCGCTGATGAGG GTTTAG 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0780000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAATTTTGCTTTAGTATTCATTCTTTTATTTATTCATTTCTGGTCTTGTTGAAAGGACTTAACATGCTTCATTTAGT AAGTACTTTTTATCCAGGAAAGGGAAACCTATTACATATTGACGACATGGAGCAGTATGAAATACGTGAGCAAATTGGAA AAGGTGCCTTTGGTTCTGCTCTTCTTGTGAAGCATAAGCATGAGAAGAAAATATATGTGCTGAAGAAGATTCGCCTTGCC CGCCAAACTGAGCGCTCACGTAGGTCTGCACACCAGGAGATGGAGCTCATCTCCAAAATGAGAAATCCATTTATTGTAGA GTATAAAGATTCGTGGGTAGAAAAGGGTTGCTATGTGTACATTATCATTGGTTATTGTGAGGGTGGAGATATGGCGGAAG CTATAAAGAAAGCTAATGGTGTTATGTTTTCTGAGGAGAAACTGTGTAAGTGGCTTGTTCAACTTCTTATGGCCCTTGAT TACTTGCACATGAACCATATTCTTCATCGTGATGTCAAGTGTTCAAATATATTCTTGACAAAAGATCAAGACATACGTCT TGGTGATTTTGGACTTGCCAAAATGTTGACTTCAGATGATCTCGCCTCCTCTGTTGTGGGAACACCTAGCTACATGTGCC CTGAGCTCCTTGCTGATATACCTTATGGTTCTAAATCAGATATTTGGTCCTTGGGATGTTGCATTTATGAAATGGCCTCG CATAAGTCCGCTTTCAAAGCATTTGATATACAAGCCCTGATTATGAAGATTAATAAGTCGATAGTGGCTCCATTGCCAAC AAAGTATTCTAGTGCATTTCGAGGTTTGGTTAAAACCATGCTAAGGAAAAATCCAGAGCTTAGACCCAGCGCTGCAGAGT TACTTGGGCACCCACATCTTCATCCATATGTTCTTAAGATCCATCTCAAAATCAATAGCCCCAGGCAAAGTAGGCTGCCG TGTCATAGGCCAGAACCCAACTACATGAAGAAAACTAGGTTTTTGAAGCCAGAGGGTGATCCAGTGTCATACTCTGAAGA TAAGGAACATTCTTTCAACAATGACCGGACTTTAAATCCTAGTGTATCTGGAGCAGAGCAAGATTCTCTATGCTCTACCC GAGAAATAAATTGCACTTCAGATCATTTGAATCAAGGGTTAGCTGAAATGTGTGTTGGAGATAGCCATGACGTGAAGTCA TTCTACAAGCCAGCCGTTTCCCGAACTCATAGTGTTACCAAGACTGCAAGACTTACTTCATCGAAAGCATCTGCCACCCC GAAGAAATCAATGGAACCCTCGAAGACTCATAAGCTTCCTGTTTCGCACAATAGGAAACAACCTGTCCATGCAACTCGCA GAGTATCATTGCCATTGCCAAGAAGTTGTGTCATTCAGCAGCCTCCCCGCAGGCCCAGTATTGATTTACTTGGCCATGTG AATTCGCCCAATATTTCGGTTAACTCTCCCCGTATTGATAAGATGGCAGAGTTCCCATTAGCATCATATGAAGATCAATC GTTTCCCATCAATAGATCTTCACCAACCTCTGTGCAGGGTTCCTCAGGATACCCTCCTTGTGGCAATGATTCAACTTTGA TAGACAAATGCACAGTCGAGGTATGTGACAGAGCCTACGTTAGGCCTAGTTGTAGGGATGCTTGGCAGGGAATCAAGGTC AAACACAGCATGTTCACTGTAAATGATGAGGGAAAAAGTCGCTCTTCTGATCAAAATGGAACTGGTAGAGCATCAAGCCA CAACTCTTCAGACTTGCGCCGCCGACAGTTTGATACTTCATCGTTCCAACAAAGGGCTGAAGCCTTAGAAGGGCTGCTTG AATTTAGTGCAAGATTACTACATCAGCAAAGGTATGACGAACTTGGGGTTTTGTTAAAACCGTTTGGGCCCGGAAAAGCT TCCCCAAGGGAAACTGCAATTTGGTTAAGCAAGAGCCTCAAAGAGAACGCTTTCAACCGTGAAGAATCCGCCTAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0780000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEFCFSIHSFIYSFLVLLKGLNMLHLVSTFYPGKGNLLHIDDMEQYEIREQIGKGAFGSALLVKHKHEKKIYVLKKIRLA RQTERSRRSAHQEMELISKMRNPFIVEYKDSWVEKGCYVYIIIGYCEGGDMAEAIKKANGVMFSEEKLCKWLVQLLMALD YLHMNHILHRDVKCSNIFLTKDQDIRLGDFGLAKMLTSDDLASSVVGTPSYMCPELLADIPYGSKSDIWSLGCCIYEMAS HKSAFKAFDIQALIMKINKSIVAPLPTKYSSAFRGLVKTMLRKNPELRPSAAELLGHPHLHPYVLKIHLKINSPRQSRLP CHRPEPNYMKKTRFLKPEGDPVSYSEDKEHSFNNDRTLNPSVSGAEQDSLCSTREINCTSDHLNQGLAEMCVGDSHDVKS FYKPAVSRTHSVTKTARLTSSKASATPKKSMEPSKTHKLPVSHNRKQPVHATRRVSLPLPRSCVIQQPPRRPSIDLLGHV NSPNISVNSPRIDKMAEFPLASYEDQSFPINRSSPTSVQGSSGYPPCGNDSTLIDKCTVEVCDRAYVRPSCRDAWQGIKV KHSMFTVNDEGKSRSSDQNGTGRASSHNSSDLRRRQFDTSSFQQRAEALEGLLEFSARLLHQQRYDELGVLLKPFGPGKA SPRETAIWLSKSLKENAFNREESA 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 28 125 98 2.6E-22
SUPERFAMILY 43 301 259 9.17E-81
PANTHER 43 658 616 7.2E-302
PANTHER 43 658 616 7.2E-302
CDD 45 300 256 1.49259E-130
SMART 46 304 259 3.2E-80
ProSiteProfiles 46 304 259 45.912
Pfam 46 299 254 2.0E-64
ProSitePatterns 52 75 24 -
Gene3D 126 313 188 6.1E-57
ProSitePatterns 167 179 13 -
MobiDBLite 336 354 19 -
MobiDBLite 336 365 30 -
MobiDBLite 412 449 38 -
MobiDBLite 412 430 19 -
MobiDBLite 569 587 19 -
MobiDBLite 569 598 30 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0780000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…