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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0786800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0786800.5 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Translational activator GCN1; TAIR: AT1G64790.1 ILITYHIA; Swiss-Prot: sp|F4I893|ILA_ARATH Protein ILITYHIA; TrEMBL-Plants: tr|I1JRU2|I1JRU2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0786800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:135901860..135927489) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCAATGTCGGCGATGGAGTCACTCCACTCCCTCTCCGAATTAGTCACCACTTCCTCCACCACCCAACGCCTCCGCATATT CCACCGCGAAATCCCCGCCCTCCTCAATTCCTCCCCTCCAGACGACTCACCGGAGCTCGCTTCGTTGCTCACTGACACCA TTTTCCGAACAGTTCCGATTTACGATGATCGCAGATCCAGGAAAGCGGTTGATGATGTGATCATCAAAGCCCTAACTGGT GGCGGAGCTGTTTTCATGAAGACTTTTGCAGGTGCACTTGTTCAGAACATGGAGAAGCAAGTCAAGTTTCAATCTCATGT GGGAAGTTACAGGCTGCTATGCTGGTCGTGTTTGCTTCTTAGTAAGAGCCAGTTCGCCGAGGTTTCCAAGAATGCTTTGT GTAGAGTAGCTTCTGCTCAAGCTTCTTTGCTTAAATTGGTTTTGCAGAGATCGTTTCATGAGAAACAGGCTTGCAAGAAG AAGTTCTTTCGTTTGTTTGATCAGGTTTAGCAATCACTCACTGTGTTGGTCCTTGAATTTTATCGATTCGTCATCGTTTT TGTTAGTTACAATGCTTAGAAAATGAAATAATGCTTGTAATTTCGATGCCTTTGCTTGTTTTCAGTCGCCCGATATTTGT AAAGTGTACGTGCTAGGATTGAAAAATGGGCAAATCCCGTACAAGGACAGTCCGGAATTATTGTTGTTGTTGCTGGAGTT CTCAAGCGGATCACCGTCTTTATTCAGAGAATTTAAGGTTAGTTAGTGTGCATGAGTTTTGTCCTGGTTCGTGTTTAAGT TGGGCTGATTTCGATCTTCTAGGGTTCTAATGTAATTACTTTTTTGCTTCTTACAGCCAGCATTTCTTGATATATATGTT AATGCAATATTGAATGCGAAGGAAAAGCCAGGAAAGAGTCTTATCGAGGCGTTTCTTCCACTTTATTTGCAAATGGCACA 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CTTGGTGAACTGATAGAGGTGACAAGTGAACAATCACTCAAGGAGTTTGTCATCCCAATTACCGGGCCTCTTATCCGCAT AATAGGTGATCGCTTCCCATGGCAGGTTAAGAGTGCAATTTTGTCTACTCTAACCATCATGATAAGAAAGGGTGGGATTT CTTTAAAACCATTTCTTCCTCAGCTGCAAACGACATTTGTTAAGTGTCTACAGGATAGTACAAGAACTATTCGTTCGAGT GCTGCCCTGGCCCTTGGAAAGCTTAGTGGCCTCAGTACTAGGGTTGACCCTTTGGTTAGTGATTTGCTGTCCACTCTGCA GGGATCGGATGGTGGCGTCCGTGAAGCTATTTTGACAGCTTTGAAAGGGGTCATGAAGCATGCTGGGAAGAATGTGAGTT CTGCTGTTAGAGATCGTGCTTACAGCGTTCTCAAGGATTTAATTCATCATGATGATGAGAGAGTTCGAATGTATGCTGCA AGAATTTTGGGTATCTTGACACAGTCTTGTAACTATAATTGCAGTATCTTGAAGATGTTCAACTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0786800.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSAMESLHSLSELVTTSSTTQRLRIFHREIPALLNSSPPDDSPELASLLTDTIFRTVPIYDDRRSRKAVDDVIIKALTGG GAVFMKTFAGALVQNMEKQVKFQSHVGSYRLLCWSCLLLSKSQFAEVSKNALCRVASAQASLLKLVLQRSFHEKQACKKK FFRLFDQSPDICKVYVLGLKNGQIPYKDSPELLLLLLEFSSGSPSLFREFKPAFLDIYVNAILNAKEKPGKSLIEAFLPL YLQMAHEDLQNIVMPSSIKMLKRNPEIVLESVGILLKSVDLDLSKYAAEILSVVLVQARHADEGRRDGALAIVGSLSKKS SNPDALDTMFNAIKAVIKGSEGRLAFPYQRVGMVNAIQELSNAPDGKYISSLSNTICDFLLSYYKDDGNEEVKIVILSAI ASWAVRSTDIIHEGLVSFLASGLKEKETLRRGFLRSLHAICKNTDAVLKMSTLLGPLVQLVKTGFTKAVQRLDGIYALLL VGKIAAVDIKAEEILVREKIWTLVSQNEPSLVPISMASKLSVEDSMACVDLLEVLLLEHSQRILSNFSVKLLLQLMIFFI CHLRWDIRRKAYDVARKIITSSPQLSGDLFLEFSKYLSLVGDKILALRLSDSDISLDPQIPFIPSVEVLVKALLIISPEA MKLAPDSFVRIILCSHHPCVLGSAKRDAVWKRLSKCLQTHGFDVIDIVSANVVNLVQVLLGPLGLKSANPLEQQAAISSL STLMLIIPGDIYTEFEEHLRNLPERFSHDMLSENDIQIFNTPEGMLSSEQGVYVAESVAAKNTKQAKGRFRMYDDEDDLD HARSNHSMKRDQPIRETADKSKTAKEEARELLLKEEASVRDKVCEIQKNLSLMLRTLGDMAIANSVFAHSKLPSMVKFVE PLLRSPIVSDEAFETMVKLSRCIAPPLCEWALDISTALRLIVTDEVHLLLDLVPSAAEEEVNGRPSLGLFERILDGLSTS CKSGALPVDSFSFVFPIMERILLSSKKTKFHDDVLRLFYLHLDPHLPLPRIRMLSALYHVLGVVPAYQSSIGPALNELSL GLQPDEVASALYGVYSKDVHVRMACLNAVRCIPAVANRSLPQNIEVATSLWIALHDPEKSIAQVAEDIWDHYGFDFGTDF SGIFKALSHVNYNVRLAAAEALAAALDEYPDSIHECLSTLFSLYIRDMGIGDDNLDAGWLGRQGIALALHSAADVLRTKD LPIVMTFLISRALADPNADVRGRMINAGILIIDKSGKDNVSLLFPIFENYLNKTAPDEEKYDLVREGVVIFTGALAKHLA KDDPKVHAVVDKLLDVINTPSEAVQRAVSACLSPLMQSKQDDAAALVTRLLDQLLKSEKYGERRGAAFGLAGVVKGFGIS CLKKYRIVIILQEGLVDRNSAKSREGALLGFECLCEILGRLFEPYVIKMLPLLLVSFSDQVVAVREAAECAARAMMSQLS AQGVKLVLPSLLKGLEDKAWRTKQSSVQLLGAMAYCAPQQLSQCLPKIVPKLTEVLTDTHPKVQSAGQMALQQVGSVIKN PEISALVPTLLKGLSDPNEYTKYSLDILLQTTFVNSIDAPSLALLVPIVHRGLRERSADTKKRASQIVGNMCSLVTEATD MIPYIGLLLPEVKKVLVDPIPEVRSVAARAIGSLIGGMGEENFPDLVPWLFDTLKSDNSNVERSGAAQGLSEVLAALGIG FFEHVLPDIIRNCSHQKASVRDGYLTLFKFLPRSLGVQFQNYLSQVLPAILDGLADENESVRDAALGAGHVLVEHYAATS LPLLLPVVEDGIFNDNWRIRQSSVELLGDLLFKVAGTSGKALLEGGSDDEGSSTEAHGRAIIEVLGYSKRNEVLAALYMV RTDVSLSVRQAALHVWKTIVANTPKTLREIMPVLMDTLIASLASSSSERRQVAGRSLGELVRKLGERVLPLIIPILSRGL NDPDSSKRQGVCSGLSEVMASAGKSQLLTFMNDLILTIRTALCDSVPEVRESAGLAFSTLYKSAGLQAIDEIVPTLLHAL EDDRTSDTALDGLKQILSVRTSAVLPHILPKLVHPPLSAFHAHALGALADVAGPGLDFHLGTVLPPLLSAMGSDDKEVQT SAKEAAETVVSVIDEEGIEPLISELVKGVSDSQATVRRSSSYLIGYFLKNSKLYLVDEAPNMISTLIILLSDPDTSTVSV AWEALSRVIISVPKEVLPSYIKLVRDAISTSRDKERRKRKGGPILIPGFCLPKALQPILPIFLQGLISGSAELREQAALG LGELIEVTSEQSLKEFVIPITGPLIRIIGDRFPWQVKSAILSTLTIMIRKGGISLKPFLPQLQTTFVKCLQDSTRTIRSS AALALGKLSGLSTRVDPLVSDLLSTLQGSDGGVREAILTALKGVMKHAGKNVSSAVRDRAYSVLKDLIHHDDERVRMYAA RILGILTQSCNYNCSILKMFN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 122 | 2410 | 2289 | 0.0 | ||
| PANTHER | 122 | 2410 | 2289 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 194 | 733 | 540 | 4.03E-17 | ||
| SUPERFAMILY | 356 | 1419 | 1064 | 2.71E-20 | ||
| MobiDBLite | 795 | 823 | 29 | - | – | |
| Coils | 814 | 834 | 21 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 1262 | 2023 | 762 | 2.47E-101 | ||
| Gene3D | 1313 | 1643 | 331 | 1.4E-127 | ||
| SMART | 1315 | 1547 | 233 | 3.5E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 1608 | 1646 | 39 | 11.192 | ||
| SMART | 1633 | 1891 | 259 | 0.027 | ||
| Gene3D | 1645 | 1802 | 158 | 2.0E-15 | ||
| Gene3D | 1839 | 2036 | 198 | 5.0E-28 | ||
| SUPERFAMILY | 1851 | 2413 | 563 | 3.7E-66 | ||
| SMART | 1899 | 2122 | 224 | 0.015 | ||
| Gene3D | 2037 | 2198 | 162 | 1.8E-10 | ||
| Gene3D | 2209 | 2416 | 208 | 2.9E-18 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Regulation of translation | Any process that modulates the frequency, rate or extent of the chemical reactions and pathways resulting in the formation of proteins by the translation of mRNA or circRNA. | ||
| Molecular function | Protein kinase regulator activity | Modulates the activity of a protein kinase, an enzyme which phosphorylates a protein. | ||
| Molecular function | Protein kinase binding | Interacting selectively and non-covalently with a protein kinase, any enzyme that catalyzes the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a protein substrate. | ||
| Biological process | Positive regulation of kinase activity | Any process that activates or increases the frequency, rate or extent of kinase activity, the catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule. | ||
| Molecular function | Ribosome binding | Interacting selectively and non-covalently with any part of a ribosome. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0786800.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…