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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0786800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0786800.6 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Translational activator GCN1; TAIR: AT1G64790.1 ILITYHIA; Swiss-Prot: sp|F4I893|ILA_ARATH Protein ILITYHIA; TrEMBL-Plants: tr|I1JRU2|I1JRU2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0786800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:135901860..135927492) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCCCAATGTCGGCGATGGAGTCACTCCACTCCCTCTCCGAATTAGTCACCACTTCCTCCACCACCCAACGCCTCCGCAT ATTCCACCGCGAAATCCCCGCCCTCCTCAATTCCTCCCCTCCAGACGACTCACCGGAGCTCGCTTCGTTGCTCACTGACA CCATTTTCCGAACAGTTCCGATTTACGATGATCGCAGATCCAGGAAAGCGGTTGATGATGTGATCATCAAAGCCCTAACT GGTGGCGGAGCTGTTTTCATGAAGACTTTTGCAGGTGCACTTGTTCAGAACATGGAGAAGCAAGTCAAGTTTCAATCTCA TGTGGGAAGTTACAGGCTGCTATGCTGGTCGTGTTTGCTTCTTAGTAAGAGCCAGTTCGCCGAGGTTTCCAAGAATGCTT TGTGTAGAGTAGCTTCTGCTCAAGCTTCTTTGCTTAAATTGGTTTTGCAGAGATCGTTTCATGAGAAACAGGCTTGCAAG AAGAAGTTCTTTCGTTTGTTTGATCAGGTTTAGCAATCACTCACTGTGTTGGTCCTTGAATTTTATCGATTCGTCATCGT TTTTGTTAGTTACAATGCTTAGAAAATGAAATAATGCTTGTAATTTCGATGCCTTTGCTTGTTTTCAGTCGCCCGATATT TGTAAAGTGTACGTGCTAGGATTGAAAAATGGGCAAATCCCGTACAAGGACAGTCCGGAATTATTGTTGTTGTTGCTGGA GTTCTCAAGCGGATCACCGTCTTTATTCAGAGAATTTAAGGTTAGTTAGTGTGCATGAGTTTTGTCCTGGTTCGTGTTTA AGTTGGGCTGATTTCGATCTTCTAGGGTTCTAATGTAATTACTTTTTTGCTTCTTACAGCCAGCATTTCTTGATATATAT GTTAATGCAATATTGAATGCGAAGGAAAAGCCAGGAAAGAGTCTTATCGAGGCGTTTCTTCCACTTTATTTGCAAATGGC 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GGTCCTGCAATAGCAGAATGTTTAAAAGATGCAAGTACTCCTGTAAGACTTGCTGCAGAACGATGCGCTGTACATGCACT CCAATTAACAAAGGGTTCAGAAAATGTTCAAGCAGCACAGAAGTATATCACTGGCTTGGATGCTAGACGACTATCAAAGC TTCCTGAATATAGGTACTTTGATGCCAGTGAAGACAGTGATGAAGATATGTCAACTAGCTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0786800.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSAMESLHSLSELVTTSSTTQRLRIFHREIPALLNSSPPDDSPELASLLTDTIFRTVPIYDDRRSRKAVDDVIIKALTGG GAVFMKTFAGALVQNMEKQVKFQSHVGSYRLLCWSCLLLSKSQFAEVSKNALCRVASAQASLLKLVLQRSFHEKQACKKK FFRLFDQSPDICKVYVLGLKNGQIPYKDSPELLLLLLEFSSGSPSLFREFKPAFLDIYVNAILNAKEKPGKSLIEAFLPL YLQMAHEDLQNIVMPSSIKMLKRNPEIVLESVGILLKSVDLDLSKYAAEILSVVLVQARHADEGRRDGALAIVGSLSKKS SNPDALDTMFNAIKAVIKGSEGRLAFPYQRVGMVNAIQELSNAPDGKYISSLSNTICDFLLSYYKDDGNEEVKIVILSAI ASWAVRSTDIIHEGLVSFLASGLKEKETLRRGFLRSLHAICKNTDAVLKMSTLLGPLVQLVKTGFTKAVQRLDGIYALLL VGKIAAVDIKAEEILVREKIWTLVSQNEPSLVPISMASKLSVEDSMACVDLLEVLLLEHSQRILSNFSVKLLLQLMIFFI CHLRWDIRRKAYDVARKIITSSPQLSGDLFLEFSKYLSLVGDKILALRLSDSDISLDPQIPFIPSVEVLVKALLIISPEA MKLAPDSFVRIILCSHHPCVLGSAKRDAVWKRLSKCLQTHGFDVIDIVSANVVNLVQVLLGPLGLKSANPLEQQAAISSL STLMLIIPGDIYTEFEEHLRNLPERFSHDMLSENDIQIFNTPEGMLSSEQGVYVAESVAAKNTKQAKGRFRMYDDEDDLD HARSNHSMKRDQPIRETAGAGKRDSGKATKKADKSKTAKEEARELLLKEEASVRDKVCEIQKNLSLMLRTLGDMAIANSV FAHSKLPSMVKFVEPLLRSPIVSDEAFETMVKLSRCIAPPLCEWALDISTALRLIVTDEVHLLLDLVPSAAEEEVNGRPS LGLFERILDGLSTSCKSGALPVDSFSFVFPIMERILLSSKKTKFHDDVLRLFYLHLDPHLPLPRIRMLSALYHVLGVVPA YQSSIGPALNELSLGLQPDEVASALYGVYSKDVHVRMACLNAVRCIPAVANRSLPQNIEVATSLWIALHDPEKSIAQVAE DIWDHYGFDFGTDFSGIFKALSHVNYNVRLAAAEALAAALDEYPDSIHECLSTLFSLYIRDMGIGDDNLDAGWLGRQGIA LALHSAADVLRTKDLPIVMTFLISRALADPNADVRGRMINAGILIIDKSGKDNVSLLFPIFENYLNKTAPDEEKYDLVRE GVVIFTGALAKHLAKDDPKVHAVVDKLLDVINTPSEAVQRAVSACLSPLMQSKQDDAAALVTRLLDQLLKSEKYGERRGA AFGLAGVVKGFGISCLKKYRIVIILQEGLVDRNSAKSREGALLGFECLCEILGRLFEPYVIKMLPLLLVSFSDQVVAVRE AAECAARAMMSQLSAQGVKLVLPSLLKGLEDKAWRTKQSSVQLLGAMAYCAPQQLSQCLPKIVPKLTEVLTDTHPKVQSA GQMALQQVGSVIKNPEISALVPTLLKGLSDPNEYTKYSLDILLQTTFVNSIDAPSLALLVPIVHRGLRERSADTKKRASQ IVGNMCSLVTEATDMIPYIGLLLPEVKKVLVDPIPEVRSVAARAIGSLIGGMGEENFPDLVPWLFDTLKSDNSNVERSGA AQGLSEVLAALGIGFFEHVLPDIIRNCSHQKASVRDGYLTLFKFLPRSLGVQFQNYLSQVLPAILDGLADENESVRDAAL GAGHVLVEHYAATSLPLLLPVVEDGIFNDNWRIRQSSVELLGDLLFKVAGTSGKALLEGGSDDEGSSTEAHGRAIIEVLG YSKRNEVLAALYMVRTDVSLSVRQAALHVWKTIVANTPKTLREIMPVLMDTLIASLASSSSERRQVAGRSLGELVRKLGE RVLPLIIPILSRGLNDPDSSKRQGVCSGLSEVMASAGKSQLLTFMNDLILTIRTALCDSVPEVRESAGLAFSTLYKSAGL QAIDEIVPTLLHALEDDRTSDTALDGLKQILSVRTSAVLPHILPKLVHPPLSAFHAHALGALADVAGPGLDFHLGTVLPP LLSAMGSDDKEVQTSAKEAAETVVSVIDEEGIEPLISELVKGVSDSQATVRRSSSYLIGYFLKNSKLYLVDEAPNMISTL IILLSDPDTSTVSVAWEALSRVIISVPKEVLPSYIKLVRDAISTSRDKERRKRKGGPILIPGFCLPKALQPILPIFLQGL ISGSAELREQAALGLGELIEVTSEQSLKEFVIPITGPLIRIIGDRFPWQVKSAILSTLTIMIRKGGISLKPFLPQLQTTF VKCLQDSTRTIRSSAALALGKLSGLSTRVDPLVSDLLSTLQGSDGGVREAILTALKGVMKHAGKNVSSAVRDRAYSVLKD LIHHDDERVRMYAARILGILTQYLEDVQLTELIQELSSLANSPSWSPRHGSILTISSLFHHNPVPIFSSPLFPTIVDCLR VTLKDEKFPLRETSTKALGRLLLYRAQVDPPDTLLYKDVLSLLVSSTHDESSEVRRRALSAIKAVAKANPSAIMLHGTIV GPAIAECLKDASTPVRLAAERCAVHALQLTKGSENVQAAQKYITGLDARRLSKLPEYRYFDASEDSDEDMSTS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 28 | 862 | 835 | 4.03E-18 | ||
| PANTHER | 122 | 2612 | 2491 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 122 | 2612 | 2491 | 0.0 | ||
| SUPERFAMILY | 356 | 1433 | 1078 | 8.45E-21 | ||
| MobiDBLite | 789 | 839 | 51 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 1296 | 2037 | 742 | 3.06E-100 | ||
| SMART | 1329 | 1561 | 233 | 3.5E-11 | ||
| Gene3D | 1329 | 1657 | 329 | 1.7E-127 | ||
| ProSiteProfiles | 1622 | 1660 | 39 | 11.192 | ||
| SMART | 1647 | 1905 | 259 | 0.027 | ||
| Gene3D | 1659 | 1816 | 158 | 2.2E-15 | ||
| Gene3D | 1845 | 2050 | 206 | 5.3E-28 | ||
| SUPERFAMILY | 1859 | 2425 | 567 | 9.7E-67 | ||
| SMART | 1913 | 2136 | 224 | 0.015 | ||
| Gene3D | 2051 | 2212 | 162 | 2.5E-11 | ||
| Gene3D | 2228 | 2597 | 370 | 1.2E-30 | ||
| SUPERFAMILY | 2350 | 2585 | 236 | 5.53E-28 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Regulation of translation | Any process that modulates the frequency, rate or extent of the chemical reactions and pathways resulting in the formation of proteins by the translation of mRNA or circRNA. | ||
| Molecular function | Protein kinase regulator activity | Modulates the activity of a protein kinase, an enzyme which phosphorylates a protein. | ||
| Molecular function | Protein kinase binding | Interacting selectively and non-covalently with a protein kinase, any enzyme that catalyzes the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a protein substrate. | ||
| Biological process | Positive regulation of kinase activity | Any process that activates or increases the frequency, rate or extent of kinase activity, the catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule. | ||
| Molecular function | Ribosome binding | Interacting selectively and non-covalently with any part of a ribosome. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0786800.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…