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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0142700 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0142700.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | O-glucosyltransferase rumi like; TAIR: AT5G23850.1 O-glucosyltransferase rumi-like protein (DUF821); Swiss-Prot: sp|B0X1Q4|RUMI_CULQU O-glucosyltransferase rumi homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A172J2D1|A0A172J2D1_PUEML UDP-glycosyltransferase 47; Found in the gene: LotjaGi2g1v0142700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:51847964..51858022) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATTTTCATATCAAGATCCACTTTCCCAAAATACTTCAACTAACATGAAAAATGGTTGAGGAAAAATAACTAAATTTCCA AAGATCAGCAGAGACCACAGCGACGGTAGTTCTCCTTCTTTTGTACTTTTTTCCCAAATTGTGGCCATCTGTATTCATTT TTAACACCCATCAATTCAAGAGAAACAACACTGGAAACCTTTGTCTTCGTCCTATTTGATTTCATACCACTTACATATAA ACAACCAATTATACCCTCAGGCTCAGACCCAGTCACACAGCTGTATTGCATTTGCATACTCACGAGATTCAACTTCAGAT CAAAAAGGTGGACTATTCTCCTTTTTGAATTTACACACACCTCTTTTCTTCAAGATCTCAATTATTTTCCTGTTTCCCTT TTATGTCAAGATCCTCTCTAACCCACTAATTATCCTTTTTATTTTTATATCTTTTATCCTTTTCAATCCCTGATCTATAG GGCCTTCATATGTTACAAAGTTAGACATCTTTCTGACAATTGTCAACACCAATCTCACATATAAACACAAGAAAAATTCA CAGGTTCAATTCTATCTTTGTCTTTTACATTGGTTGTTTTGATCTTCTTCTATAGATCAATCACTTCAGCAATGAACCTC TATACCAAAATTCACTCACACGATTTTCTCTTCCTCCTTCAGCTTCTTCAGCCACCATTGTGCAAAACAAGAAAGGTTTA TATTTTGCAGCTGAGAGAGATATCCAATTGGCTATATCTCAGCGACCCAGTTGAAGAATCATATCAAAGTTTCCATCTTT ACTACTTTTCAAGGATAAGAAGCTCGAAACCTCAAAAGGGTAGGGTGGGTTTAACTTGATACACAACTTAGAACACATGT TAATTCTCATAAGCAGATTATGAGAGATAATTACAACATTACAATTGGACAGGGGCAGAAGAATTTCGGATCGGGGCATT 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CAATTAAGGAGAAAGGAAGGTACAATTCAACAAGTGGAATCATGGGAGAAACAAAATATGAAATCTTAATGTATATATTT TTCCCATACTATTCTTATAGTTTCATGTTTTCCACTTTCCACATATAGGGTTCTTTTGGGGAAGACATTATCATGCCATA GTTTACTAAATAAAAATGTAGCATATTTGTGCGAATTATGATTTTTTGTACTCTACCGGAAATAGTATTTGGTTTGTTAG TTTTCTAGCTCTGAAACATACTTGTGTTTGATAGAAATGCAACAAGAGGAGATATATTGATAATTATACCCAAATTTAAG CTCAAATTACAATGAAAGAAATGGTAAAGTAAACAACTTGGTCCTGATATTAATATTTGTTGCTTGTAATTTAGCTCCTA AATTTTCTTTTGTATTTAAGTGAGCCCTTAAAATATACTAGTTCTTTGCATCAACTTTGAATCTTATAGAGATGGTTATA TGCCGTGATAGTATCTAAGGTTTACATCGGATCATGATATGAAAAGGATAACATACTAGTGCTAACCTCATGAAAACTAA ATTAGAAGCCCTGCAACAGCAACCGCCTTGTTTAACAGTCTATTTCCCTTGTAAGAGACAACGTTCTATGCTATGTCTAT TTCTTCTGTCCCATGCCTTTATCCATTTTGGAACTTCCTTCATCTGAATTGGAAAAAGACACATTATAAATAAATGCAAA ATTTAGTATGACACAATGAAATACAATGCTTCTCAATAATTAACAAAGCCAAAGCCATATCAAAGTGAAAAAGTAAAAGA AAAAACGAAAAAACGAAAAAATATGTTCTTGAATGAATCAATACCAGGACTGTGGGAAAGACTGATAGAATCATAGAACT ACCATTGGTGTTCTGACCCAGTTTATTAAAAGCTTCAGCTTCAACTGATTTAGGGTCAGAGTGTTTACCCAAATGCAGCA CAGGTCTAATGAAAATGAGAAAGAGGTTAGTAACATGAAATGTTCTTTACTAGTTAAGATAGAGTCCATGTGCTTCAGAA CAGAAGTCCAATGAAAATGAGAACAAATACAAGAAACACACTTTACTAGAAAATATAGTCAATGTCATTATGAACAGAAG TTTTAAGGAAAATGAGAACTAGAGGTTACACACAACATGCTTCACCAGCAAAGACAGAGTCAAAATGCTTCTGAACAAGT CACAGTTCTTCCACAAAGGAGATGCAAAGTTTAATGAATTAGAAACATTAGAATTTGGTAAGAAGATGGAGTTACAAAGT AAACTAGGAAACTCATAAAGCCCCATTGAGTTGGCTGCTCCTTCAAACAAAATTTGGTTGTTGACCTGAGATTTCAAAAA ACATTTAGATGGATAAAACTCAATATAGATGAAATTATCTCTAGCAAGATTTTTAGTAA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0142700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAATCGTTGCCAAGATCCACCGTGATTCTGGTTTTTCCCGGCATCCTAATCGTTGGCGCGTTGCTGTACACGCGCTT CATCGACATGAATGAGGTCCTTCCAGCAGATTCATCTCCCAAACCAACACTAATTAGCAAGACAACACACGATGTACCAA ACCAACTCCAAAAGCAAATAGAGATACCATTAAACTGTAGTGGATACAACAACCTCAGTAAAAGATGTCCTACAAACTAC CCCTTCTCATGGAACAATCCAGACAAATCATTGAGCCCTACGTGTCCCGACTACTTCCGTTGGATCCACGAGGATTTACG GCCATGGGCCCAGACAGGCATAACGCAGAAGATGGTGGAGAAGGCAAAAGCAACAGCAAATTTCAAGTTGGTGATATTGA ATGGAAAGGCTTATTTGGAGACGTATGAGAAGTCTTTCCAGACAAGGGATGTTTTCACACTGTGGGGGATTCTGCAATTG TTGAGAAAGTACCCTGGAATGGTGCCTGATTTGGAGCTCATGTTTGATTGTGTGGATTGGCCTGTGGTTTTAGCTGAAGG GCATAATGCTAGGGATCCACCACCGCTCTTTCGTTATTGTGGCAATGATGCCACATTGGATATTGTCTTCCCTGATTGGT CCTTTTGGGGATGGCCTGAGGTTAATATAAAGCCATGGGAAGTTTTATTGGGAGAGTTAAAAGAGGGCAACAAGAAGACA ACATGGATGAACAGAGAGCCCCATGCTTACTGGAAAGGCAATCCCGCTGTTGCTGAAACTAGACAAGATCTCATGAAATG CAATGTTTCTGACAAACAAGATTGGAATGCTCGTTTATATGCCCAGGATTGGATTCGTGAATCACAAGAAGGGTACAAGA AATCAGACTTGGCAAGCCAATGCAATCACAGGTATAAGGTTTACATCGAAGGTTCTGCTTGGTCTGTCAGTGAAAAGTAC ATTCTGGCATGTGATTCTGTCACTTTAATTGTAAAACCCCATTACTATGACTTTTTCACAAGAGGGTTAATACCAGTGCA CCACTACTGGCCCATCAAGGAAGATGATAAATGCAAGTCCATTAAGTTTGCAGTGGATTGGGGCAATAGTCACAAGGAAA AGGCACAGAAAATTGGAAAAGCGGCAAGTGATTTCATTCAAGATGAGTTGAAGATGGATTATGTGTATGACTACATGTTT CACCTCCTAAGTTCTTATGCTAAACTCTTTAGATATAAACCATCCATTAGTGCTCAAGCTATTGAGCTATGTGTCGAGTC AATGGTTTGTAATGCAGAAAGATTTGAAAAGAAATTTATGATGGAATCATTGGTCAAGGGTCCTAAAAACACCATGCCAT GCACCATGCCTCCCCCTTATGATCCTCCATCCTTCAATGCACAATTAAGGAGAAAGGAAGGTACAATTCAACAAGTGGAA TCATGGGAGAAACAAAATATGAAATCTTAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0142700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKSLPRSTVILVFPGILIVGALLYTRFIDMNEVLPADSSPKPTLISKTTHDVPNQLQKQIEIPLNCSGYNNLSKRCPTNY PFSWNNPDKSLSPTCPDYFRWIHEDLRPWAQTGITQKMVEKAKATANFKLVILNGKAYLETYEKSFQTRDVFTLWGILQL LRKYPGMVPDLELMFDCVDWPVVLAEGHNARDPPPLFRYCGNDATLDIVFPDWSFWGWPEVNIKPWEVLLGELKEGNKKT TWMNREPHAYWKGNPAVAETRQDLMKCNVSDKQDWNARLYAQDWIRESQEGYKKSDLASQCNHRYKVYIEGSAWSVSEKY ILACDSVTLIVKPHYYDFFTRGLIPVHHYWPIKEDDKCKSIKFAVDWGNSHKEKAQKIGKAASDFIQDELKMDYVYDYMF HLLSSYAKLFRYKPSISAQAIELCVESMVCNAERFEKKFMMESLVKGPKNTMPCTMPPPYDPPSFNAQLRRKEGTIQQVE SWEKQNMKS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 6 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 7 | 24 | 18 | - | – | |
| Phobius | 7 | 25 | 19 | - | – | |
| Phobius | 26 | 489 | 464 | - | – | |
| PANTHER | 48 | 485 | 438 | 4.3E-232 | – | |
| PANTHER | 48 | 485 | 438 | 4.3E-232 | – | |
| Pfam | 92 | 483 | 392 | 5.4E-190 | ||
| SMART | 167 | 413 | 247 | 9.5E-150 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0142700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…