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LotjaGi2g1v0255100.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0255100
Transcript ID LotjaGi2g1v0255100.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein; TAIR: AT5G15050.1 Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9LFQ0|GT14B_ARATH Beta-glucuronosyltransferase GlcAT14B; TrEMBL-Plants: tr|V7C1F9|V7C1F9_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0255100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:72095292..72106492) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GGAAGGTTTAATGTTAGAATTATCGAAAATTTAGACACATTGGAACAAATTGGGAGATTATCAATCCAACCCCACCCGAG TTGCTCGGAGAAAGCTTTATCAAATTATGAGTAACCTTATTAGCCACCCTACTAACATGAAAAAATGAGATAGAACTCAA AAAAAAGCAAGCCTGCAAATGCCTAAAACAATTATAGAGAGATAAGAGCTATGAGAGAACTCCCTAAACAAACAATCACT TTGGCCACCGTCTCCGAATCAGATTCAACATACAAGTATAGCAGATTATGCTGTAAAGTTAGCTCCATGCCACACTTAGC TGCTTTCGCCTCTACATAAGCAACACCCGAGTTTGCACACCACTTTGAGGCTTCCACCACTAGCACCGAGCCTCCACAGT CACGAATCACCGCACCCCGAGTCCAGCTAGCCCATTGTATCTTGAGCAGCGTCCACATTTAGCTTCATCTTCGCACGCGG CGGCCAGATTGCAGCACGCACAACAAGCGATGGTGAGCCGCGTAAGCGAAGAGTCTTCAGCCTCTTGATAATCCGTAGAT TCAAATGCTCTTAAACATAAAAATTAATTAAAAATCATAAAATGTAATTGATTCTATACACTTAAAGATAATAATAATAA TAATACCATATTTATTCCTGAATTAACCTTCCTCCACAAACACTCTTTGATCAATCAAACTGTTACTTTCTTAATTAATA TTGCTAAACGGTTAATCACCCAACTCTTTACCAGTTTTCATGTTTTAAACCAAACACTCTTTCCATTGGATAAAGCACAG TTTTCTTTACATAAAGCTACTTATTATGACTAATAATAACATAACATTAATTTCCCCAACCCATCCCTTTTAATTAATTA CCTCTAATCAACGCTCATGCTCCATCAAGACATAGACAACAACATATTAGGTAAAAAAACACACACAATTACCAATCTCA 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TTAATGACAATGCTGGATAATTGCTTTCCAATGAATTAAGAGCTTCCAAATTGGTTTTTCTTTCAAGATTTTTTCAACAT TTTCCCTGCCAAGACAGTAACAACGCCACCTAACACTCTTTTTATGGGTAAATGGTCACTTTGGTCCTTGAAAGTGTCCA CCGATTTCACATTCATCCCTGAATGAATTTTATCCACCTTACGGTCCCTGAATGTGGCGAATGTCATTCATATTGGTCCT TCTGTTAAAAAAACTTAACGGACGTTAATAATTTCCTTTTTTAAAGCTGAAAATTCATTAAATTAAATTAAAATAACAAA TTAACTAAAAATTTAATTAATTAAAACATAAAAAATCCTAACCACCAGCCATCACCATCATTCTTCATCTCCATTTTCTC ATCTTCTTCATCATCCTCACCAATTTTTCCATCACAATCAAACTCCACCGCAACCCAATCCCCTACCGCAAACCCCATCC CCCACCCCTACCGAAACCCATTTCTCTCTACCTAATGAAATTTCCAAACCCACAAATCTGAGTAGAGATTTTCAAACCCA CAAAAAAGTTTCAACATTTTCCTCTTTTGGTTTGAAGTTTCAATCAAACCTTTGTTCTCCCCACTACAACACCTTCTCGG TAGGGTTGCGATGGCGGTTGGGAAAGGAGATGGAGCTGGGTTCGGTCTGGGTTTTGTGGCCAGGGTTGCGGTGGCGGTTG GTTTCTACGATGGGGTGCGGTGGAGGGAGGTTTCTGCGATGGGGATGAGGGTGGTGGCAGTGGGTTTGATCTGAGTTGTT CATTATATTGGCAGATGCACCCTTCTTCCTTCATTGCTCTGCTGTAAATTCATGTGCCTTGTTTTACCCACGCTATGTTT TTGTCTTCCTTCTACTGGTGGGTTTTCTCTTGGCCTTTCTAGTCGTGTGTTTGTGATGCTTGGAACCACAAGTTGTTGAG TTATCTTATCCTTTTTGGAGGATGGTGTGCTTTGATTATACATCGGGTTCTTCTAGTGCAACAGGGCTTTACTCCTTTAT CCTTAAGCTTGCAATCTTGTCTTTTGATCTTTTCCTTCTTCCTTGTCTGTCAATGGCTATAATTGATAGGGCTTTTCTTT TTTCTTGTATTTGATGAAGAAGATGAAGAAAAAAGAAGTAGGAAGAAGAAGATGGGAAGAAGGTGATTAGGATTTCGTGT TTTGATTTTTAATTGAGTTTTTGTCATTAATCAATTTTTTAGTTAATTTGTTTTTTTAAATTTAAATTAATGATTTTCAC CTAGAAAAAAAATATAAAAAATAAATTCCTTAATGTCCGTTAAAGTTTTTTTAACAGAAGGACCAATATGAATGACATTC GCCGCATTCAGGGACCGCAAGGTGGATAAAATTTATTCAGGGACGAATGTGAAGTTGGTGGACACTTTCAAGGACCAAAG TGACAATTTACCCCTCTTTTTATATATGAGAGCCTCTGTCTGGTCATACAATTTCTATGCACAAGACAACAAAGAGAGAG AGACAATGAAATAAAAGAAAAGTGTGTGGGGAAATGATTAATGTGTAGAAAGTGTAGTATTGTACAACCGTTTTCTACTT TTAAAATCTGACAAATTAGAAAAAGATATCAAAAAATATCCGGAGAGCCAAGTAGGTCAAATGTAATACTGTATTGTCTG AGAATTTGAGGCACCTAATAATGAGGTGAGGGAGATGCATCTGGACACTTTACTTTGTAGTGAATGGCTCATGTCAGCAA CTCATGTCAGCAATAGATCAAAATGTTAAGACCTGGACACAATATTAGTAACTTGATGGACACAATACCCTAACGGTCCA ATTACAGATATGACACCACCTGATTAGAGCTTAATTATAAGAAGTAGGAAAAGATCAAAAAATAAAAACACTAGTCTTGA TTGGAATATATCTTTGCAAAACTCGATCAATCATTGGTTTTGGATTCACATGAAACGCAGGAATTTCATCAGGATAGATT AATTAATCATCATCTAATTCATAACAGTAAACTCCCACGCATGGAGTGTGTAAAAGAGCTCTAATCATTGCCCTACATAC CAGCTCATGAATGATTCCTCCTCAGATTAGATGCTTAATCCAGTTGACTAGCTGTAGCAAGAAAACCACTTCTAATCAAA TTAAAGGGGATTATCAACAAAAACATTATAACAATTAAAGGGGATTAAATATATCCAGCGCTAGCTAACAAGATCACTTG AAGACTGGATAACTGATCAAATTCACTAGCTACTTAATACCTGTTCAATTCCATTTAAAGTCTAGATTGCTTTGCTAACT CTGTCAGGTAAAAACAGAAGGAAATTATATATAAAATGCCCTTACTTACCTTGGCTCTATGATTTCAATTGATCTGAGAT TCCAAATTAGAATGTGAATTTGGAAAAATGTACAGAAAGTGCAAAGGGGCTTCAGCCGAGGAGAGATGATAGCGTAACTA GCTAGTGCTAACTAAAGTAACAGAAGGTGCGTGTCATCTCTCCCGCGACAGAAGTCCCTAAACATTTCTTCTCTGAACTT TTCTTTCTGCAAGCTATCTCCTTCTTCTCATTCTGATTCATACATGCCTGTAATTTGTTCTATGTTCGAATACCATATTT ATAAGGGAGGTGGGTCTCTGAGTCAGTCTCTTGCAAGTGAATACCCAAAGACTAGTTAATTATAACTTGAGTGCTTATTC GGTGATGGCATTTACCTCCACAGAAGCTAGCTTACAGATAATTTTGATGGTTACATTAAATTAATATAACAGAACCAGTC ATATTATTAATTTTATGTATGTATTATATTAAACGGATTTTGAAATGATTGTGCGATTTAATTATGAAAATATCAAAAGG GCCAAAAGCAGCTAGGATTAAAGATGCAGAAAATTAATAATCTCTCCAACAACTACATACATGCATGTTTGGTTTTAAGT TAAACTCAACTGTGTTAACAATAATAATACAAAGAAAGAAGGGAGAGGGAGAAAGAGAGAACGTGAAACAGCTAGGGTTA CATTGTGAATATTCAGGTTACAATAGATAGCAACATAACAACTATAAATAGACAAATACTCCCTCCGGTCCTATTTATAA GCAACAAAAAAAAAAATTCACATAGTTTAAGAAATGTAGTTAAACTAGATAAAATGCATTAAATTTGTCTGAAATCAAAA TAAACTTCCAAAATTACCCTTTGTTATTAGTGTTGGAAAGTGGGAAATAGAGAGAATAATTAATGAGACACATTTTACAA GTTAGAATTAATAAGGGCATCATTGGAAAAAATTAATTAATATAGCTCAAACTTTCATTTAGTTCTTATAAAAAGGACCA AGGTTTTTCTTCTCTTTCATGCTTATAAATAGGACCGGAGGGAGTACTAAAAATGCTAAAAGACTAAGCTACCCTTAGAC CTAAATAATATAAGAAACCTAATATATCTAACAAAACCCAAACCATGTTTCGTGTGTTATGAGGCCGTACAACGCGCATT CTCAAATTTTGATGTACCAAATGTGGTTTTTAATTGAAAACCAAGCATACTTTCTGGTAAACTAATGAATGTATATGTTC CTGAGACCCGCCACCTGGTATAGCTCATCATATATATGGACCTCGAATCCATGGTGGGACAGCAAATATATATACTTTTC TAATGTGCCAAACTCTATATATTTCTGTGGAGCTTATTTGATGATTGGTGAAATTGTCAAATCACACATGATGACTATAG CAGCTAGCAGGCGTGAAAACTTTGAAGCCAGAAACCTTGGAGCCCACTTCACATGTGAACTAGGTCTTTCCACCAGATCA TATGAGGAAAGAAAGGGAAGATCTGAAAGTTATATTTTATGCTTTAGAGACTTTAGAGGGAGGATTTGGAGGTTGTTTTA ATTATACAACAATGATTGACAAACTGGAGTCTGCTAGCAAACAACACTAAATTAAGTAGAACAAAGTTACAACAACAGCA ACACTTGAACCTATAGATACAATTAACTTGATGATAGAAACCTTCTTCATACCATTCAATTCAAGAACATACATGATGCA CTAGCAATAGTAGTGAATAGTGATCAAAGACATAAAAAGAAAGAGTGTGTTTGATAAAACTTTTAAAAGAACTTTAAATA TATATAACTATAAATTAAAACTTACTTGGCTAATTTAAGACTAAAAAATTTATGATAAATGTAATCAATATTACAACGTT GTAAGTACATGTACTGAATATAATGAACTGTATGCAGAAAGAAAGAGCATGACAACTTCTGATTGAATAGAGGTTTAAGG GTATTCTGTCACAGCAGGATGGCGCTGACTATGACAATATTCATATCATAAATATATTTACCACAGCTGGGGCCATCACT CCTGCGACAGAACACCCTCATATCCCCTAGCTTATTTGCAATGGTTGTTGCCTGTTACTTCAAGGTATAAATGGATGCAT G 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0255100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAAGAAATTGAAAAACTATTACATGCATTTGAGGCATCATCATCATCATCACCATCAATCTTCCTCTGCAGAACGCAA ATGGGTGTTCCCTCTCGCCATTGGTTCAATCCTCTCCCTGTTTCTCCTCTTCGTCGTGACCCTCACTTCACCTCAAGGCA CGCCGATCCTCCCATTCTACCGCTCCGTCACCGCTTCCTACTCCGTCTTCGTTGAATCCAAGCTGCATCCTCTCCCTATC TCCGACCTCCCTCCTCCGCCGCGGTTTGCTTATCTAATCTCCGGCTCCGCCGGAGACGGAGCCGCAGCGAAGCGTGTGCT GCTGGCGCTGTACCACCCCCGTAATCAATATGTATTGCACTTGGACCTTGAGGCCTCGCCGGAGGAGCGTGCGGATCTGC ACGAGTTTGTGAAGAGCAACCCGCTGTTCCAGCGGTTTGGGAATGTGAGGATGATCGCGAAGGCGAATCTGGTTACGTAT AGGGGGCCTACCATGGTGGCGAATACCCTCCATGCGGCGGCGATTTTGCTCCGGGAGTGTGGGGATTGGGACTGGTTTAT CAATCTCAGTGCCTCTGATTATCCCCTTGTCTCACAAGATGATCTGCTGCACACGTTTTCTTACTTGCCTCGTGATCTTA ATTTCATCGATCATACTAGTGACATTGGATGGAAAGATCATCAGCGGGCGAGGCCGATTATCATTGATCCGGGGTTGTAC ATGACTAAGAAGCAAGATGTGTTCTGGATTACACAGAAGAGGAGTAGGCCAACAGCTTTCAAGCTTTTCACAGGTTCGGC TTGGATGGCACTTTCAAGATCTTTCATTGACTACTGCATATGGGGATGGGACAACCTACCACGGACTGTTCTTATGTACT ATTCTAATTTCATATCTTCCCCTGAAGGATACTTCCACACAGTTATTTGTAATGCACAAGAGTTCAGGAACACAACTGTG AATAGTGATCTACATTTCATTTCTTGGGACAATCCTCCCAAGCAACATCCTCACTACCTTATACTTGCTGACATGAAAAG CATGGTTGATAGCAACGCTCCATTTGCAAGGAAATTCCACAGAGAAGATCCAGTATTGGACCAAATTGATTCTGAACTAT TATCCAGAGGTGCTGGAATGCCTGTTCCTGGAGGTTGGTGCATAGGAAGCAGGGAGAATGGCACTGATCCCTGCTCTGTG ATCGGTAACACCACAGTCCTGAGGCCCAGCCAAGGTTCGAAAAGGCTCGAAACATTAATCAGCTCGTTGCTGTCAAATGA AAAGTTCCGGCCTCGACAATGCAAATGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0255100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MKKLKNYYMHLRHHHHHHHQSSSAERKWVFPLAIGSILSLFLLFVVTLTSPQGTPILPFYRSVTASYSVFVESKLHPLPI SDLPPPPRFAYLISGSAGDGAAAKRVLLALYHPRNQYVLHLDLEASPEERADLHEFVKSNPLFQRFGNVRMIAKANLVTY RGPTMVANTLHAAAILLRECGDWDWFINLSASDYPLVSQDDLLHTFSYLPRDLNFIDHTSDIGWKDHQRARPIIIDPGLY MTKKQDVFWITQKRSRPTAFKLFTGSAWMALSRSFIDYCIWGWDNLPRTVLMYYSNFISSPEGYFHTVICNAQEFRNTTV NSDLHFISWDNPPKQHPHYLILADMKSMVDSNAPFARKFHREDPVLDQIDSELLSRGAGMPVPGGWCIGSRENGTDPCSV IGNTTVLRPSQGSKRLETLISSLLSNEKFRPRQCK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 27 27 -
PANTHER 22 434 413 8.3E-241
PANTHER 22 434 413 8.3E-241
TMHMM 28 50 23 -
Phobius 28 48 21 -
Phobius 49 435 387 -
Pfam 89 348 260 1.4E-73

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0255100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…