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LotjaGi2g1v0307700.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0307700
Transcript ID LotjaGi2g1v0307700.2
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Single-stranded DNA-binding protein WHY1, chloroplastic; TAIR: AT1G14410.1 ssDNA-binding transcriptional regulator; Swiss-Prot: sp|Q9M9S3|WHY1_ARATH Single-stranded DNA-binding protein WHY1, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9TLQ1|A0A0L9TLQ1_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0307700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:78213311..78225547) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACTATTCATAAGAGATATTTCATCTTGACCATTCATCTTCAATTTTAGCCTACGGTAGAGATCTAAGTTACTTCATCTGC TTTTGTCAGCATTTTCTTTTGTAAACGTGCATATTCCTCATTTTACGCTGGAGTAGTACGATCCAGCTCAAAAGTTGAAT TTGATGTCACATTCCACTGTTCCAGAGCAAGATAGGACTGCCATATCTTAGTGAAAAGAGAAGAACAGAACGACAGCAGA GAACAGATCTAAGAGCAAGTCCAAAGATGAAGATGAACCATAAATCCACCGAAATTCATGGATTAAAAAAATAATGCACG AACGAGCTTCCTTTGCGAGATTGGAGACCGGATCGTGGCGGGTCTTGGCCGGAGCGTGGCTTTTGAGGCAGATCAGGTTG TTTGGTGGTGGATCGGGGCGTTTGGCGGCATTGGGACCGGAGATGGGAGCGTTTGTGGCCAGAGAGGTAGTGACAGAGAA GAAGAAGAGAGGAAGAGGACGAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAACAGAGAAAAAGACGAACTCAGAGGAGAAGAGAAGAAA GGGTGGCTGCTAGGGTTTTTGGACCCTCTCTTTTTTTGTTCTCCAGCTGTTGTTGTCGGCCCAGATCCTCTATTCACCCA TCATCTAGGTTTTTCCTTTTGCTTCTAAACGGTTCAATCAACTTCCTTTACGCAATTTCTCTCTTTCCCAATAAATCCCA CTGTTATCCTATTCAAATGATGTCATGTTTCTCATAGAGGCATAGTTTTCTCCATTTTGTTTCTCTATAAATACTGCCTT TGTTTTGCTTGGTTCTTCTTCCCATCCTGCAACATTGCCCTATGCTCAATTCTACTTTAATTTTAGGTGGTGGCTCTGCG GAGGAGATGGTTCAAGGGACAACGATGCGGCGGTGACTGAACCTCGCGGTGCTCTGGTGCGGAGGCGAGAGGTGTGCTCT GTTGGGTTCTTTGTTTTATGAAGGTGGTTTGTTGTTTTCTTCCTAGGTATGATGTTTTTAAACTGAAGTTGAAAGCTCAA TTTGTTGTCATTCAGTTATTCTTGTGTGTAGGCTTAATTAATTTGTGGGGTTTTCATCGTTGAATGTGATTTCTGCTCCT ATTTACTTTCACCTATGACTTTTAAATTGGTAAATTGAAAAGAGAAGGGATTTGAACTTCAATCCTCAATCCTCATAATG AAACTCTTGTTTTACTTTGAAATATTTAAATGTTGGAGATTTTCTTATGCAGTTGAAGAATCATGGTTCATACTCAATAA ATTGAGTGATAAACTGAAAGTGTCATCCAGGATCTACAGTAGCTATTTTTGGTATTGTAGGATTCCAATTCTTATGTTTT AGTTTTTAACATTGATAATTTCTTTTATAAGTTCAGAGTAAGGTACTCAACTCAAACTATTAAAATTGAGCATTTGAAAG TGGGTAGCTATAGCGATCAAAAAGAGGTATTGTTGTTGTAGAGTTATATAGTTGACCCATTGATTAAATTTGACAGCCTC TTCATATTGGTATTGTTTTAATCCTAAGATTACATCTGCTATTTTAATTTTCTTTGTTTAAGTTGATGTGTGTGTCTTAT TTTGGTTGAGATCTTTCTTCTACCCACTCCCAAACGTCGACGATGATGCAATCGAAGGAAGCAATTGGGAATGGTTGTGT GTTGCAATGAGTAATGTTTCTAGGAAGATTTTTAATGATGGTAGCAACTTCTTTGATTCTACAGGGCTAGGTAAATGCTA TTGTTTTCATATATTTGATTTGATTACTTCCTCATTTCATTGTCACGGCCTTTTAACTTGTTTTCGTATTATAACTTAAA ACAATTAAATAAAGATGGACTTTCAAGGAGAAACCAACCCCAAATCGTTCATAAGCAGTTGCTATTGCACACTTCTTCCA ACCATTTGAAATCATTTTTAAAAATATGCACAAGGTTTATGTTTGTTTTGTTCAAAAGTTGATGGAAGAAATTGACTTTT ATGCGATGAGGAGGAAGAGACTACAAGCTCTGTGCATGAAACATGGCATCCCTGCTAATTTGAAGAACAAATAAATGGCG GACAAGCTTTAATTGATTTTTGAGCTCCTTATTAGTATACCTTTTTCTTCAAGTTTTTTTCCTTTTCTTTTGTTTGTTTT GATAGTTTATGATGACCTGATAGTTTATTGATTTGGTTGTTGAACATTTTTTTACCCCATTTGTTTTCTTTATAAATTTT CTTCTTCCTTTCTTTTTCTAATTCTGTTTTTTATTGGATTTGAAGATGCTAGCTTGAAATTTACTCCAAACTTAATAGAC TATTACCATTATTTAATTTTTTCACAATGAGTGTGTGCTATATTTTAAATACAATAGTAAAATTATTTAAATTAGCTAAG CACCAAAGCCCTTTGATGGCATGTAGCATAATATCCTTGAAGCCTATATTTGGAGTGGAACACTAAAATCTTCGAGGACA GATCCTTGTGATGGTGTCTTTCTCATTTCTGCATTTTTTTCTTCATTTCCATTATATGACCGCTTTATTAGACGCTTATC TAATGGTAAATGTAATTGGTTTGCAAACAGCAGTGTTTGGTGAGGAAGTACGGTTCTTTTTCAATGCTATCCATATGGTT TTTAGCAGTTGATGTCTAATCCTTGCTACTGTGAAGTTGGTATTGGATTGGATTGGATTGGATTTGAATTTTAAATTTCT TGGCTTCCCGTTTCTCACTGCTTGAGTTGTGTATAAATAATGGTCACAATGTGCAGCTGATAGTCATTCCCTTCTGCCTT GTGATATGTGTGAAACTTTCATAGCCATCCCTTTCTTTGTTGTTGTTAAATTGTGTTGATCGCTTCTCTGCATTTAAATT TGAAACCCATGATTTGTGCAATCCGATGGAAGTTTCTCTGTATAAAATACATGTGTTTGTGTTGATGCTTAGCATTGTGT TGTTTTTTCAGTGAGGCCGAGTCACCGAGAGGTGTAGATGGAGGTGCTTTCAGTTTCAGGAGCTGCAATGTGGGTGGTGA GAGTGATAGTCCCTATGATTCCAATATGGGCCTTGCTGGTGCTGTGGCTGAGGCCAAAGAAGATGGAAAACCTTCTGAGA GATGTCAAGGTCTTCAAAGCCAACCTTGCAAGCTTAACCTTTTCAGTAACGACTCCAAGCAAAACTACATGCTCAAGGTG TGCCTTCCGATCAAACTGTCCACAAATATGGTATGCATGTCGTTTAGTGTTGTTTCTTACTTATTGTGTGTTGAGTTTTG AAACTTCAAAGGGCATGTCTTTTCCATTTTCTTTTTAGTTGTTGTTGGAGAGTGGAGAATCTTTAACGGAAAATTTGTCT CGCTATGTCTATTATTGGAAGGAGGGTTTAAATTATTATTTGTTGCTGAATACCCTTGTCTTGTATCACATGAAGTGAAA ATCATGATCAGGGTGTTTTAGTTCTGGAAATTAGCAGTTACTAAGCAAAATCTGATGGCATGATTTTAAATTTTAATTTT TTATAAAGTCAAGTAGCTTAAACTATGACAGACAAATATTGGAATTATCTCCTTAGTTTTTTATTTGTGTGATGTCTGTT CAACAAAGGTTAGACAATATTCACAAAGATATAATACACCAAAGTCTTAGTATTTGACTTAGTCAATATATTCAGAAGGA TAGAGGGATTATTGTTCACAATATTTGGTAAATATAATATGGATGAAGGGATTATTGGTCACAAGATTTGGTAAATGTAA CAAGATATGGTTATAAATGTACCCATTGGCTGTGATGTTCCCCATATGTTGGGGTTTTGAAATTTGAAATCAAATTATAT 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CTTGGTCAATTTTTTACTGCTATTGTTTTGATCATTTGCAGTTCCACTTTTGGAGTTGATTTGGTGTTTGTTTGCTAAAA TTAGTATTTAAACATTTGAAGTTGAATCACTATTAAATAATATGAAAATAGCTATGCATTTTTATGCTTGCTACCCTTTT GGTGCATATGGCTTACTTCGTGGAGTGGATATACTTGTGATTGTGTATATGATAGCCATTTTGATCGAGAGCTGTCTTTC CTCACATGTTAAAGGGAGTCTATTTGTGTTGGAAACAATTTTTGGTAAAAATCCTTATTGATTTCATCTTGGTCTTGCTC CTCCACCTGCCTGCAATCTTAATTTGAAGTTGATGTTAATGTCATGAGAGAAGTGATAAAATCTAAATTATCTTTTTGGT TGTTAAATGGTTTGTTAACAAAGTGATCTTCAGTTCTGCTCATGCAAGGTTTAAGTAGTCTTGGTTGTTGCATGTGTTGT AGTTCTCTTTGGCATTTCCAATTCGAATCCTCTTCTTTGGTCAAAGGAATTGATGAGATGTGTATGAGCTGGAGCAGGAC ATAGAGGCCAGGGCTATTTGGCATCAGTGAGCTTGGGTCAAGGACATCTTTTAGGGGCATTTTTTCATTGTCAATGTTTA TGATTGTCTGCTGAATTCTAATGATAATATTTTCACGTTTGAAAGTAGTCATGCTATATAAGATTTGTTCAAAATGTGAT TAGATCTTCTTTTTTAGATGCCAATAGTCTCTTAAACTTATTTTTGGCTTTAGTGAATGAGGGTGCTTAAACTTAGTCAT CAACATATCTTTGCTTCACTTCCTTTAAATCTTGAAAGCATTTTTATTTATTTTTCAGTGTCAAGTCATGCTAAGATGAA AACCAAGCTCAGGTGTCCTCAGCTTGAAATGATCTATGCTTGCAGATACATCAAAGGTCACACATAGAAGAGTCATACTA TTGCAAGTATGTATTCATGTTTCAAAACAATATTACTGCTCCTTTCACTCAAAGTTTGGCCAAACTTGCACGAGATACTA TGGGATGACTTTGGTATGATGGAACTAACACTTGAAAAAAAGCAATACCCCTTTCACGGCTCCTTTTGTTTTCGCATTAT GAAATGCAACCCTGAATCACACATCAAGCTCTTAAAGTACTAAAAATTCAATTTTTTTATTTTTTTTATTGTTGTAGTCA TTTCCTAATGATGCATTGATGATCGAGAAAGAGCACCTATGTCCTATTAGTAAAATTGGTTATTGTTATTATGTCTTTTT AATTAGAAATAAAAAACAGGCTTCTCATATTCTATTGATTTCAATATTAAACTCACTTAATTTGTTCATTAAACACATTA ACCGATAAAAAATTTCTAGCTTTGTATTAAAATACATTAGAACAATGTTACCTGTTACGACAGTATTTTAGATGAAATGC AAGTACACTTGAAATGCTATATTTTTTTATAAAAAAACTAGGGAATCATCGGCATACAAAAGTAAATTGGTAATCAAAAT TGAATTGGTAATAGATCAAACGATGATAAATATTCATGGGTTTAACAAGTCAAAACTTTCATAATAAACATGTCAAGTGT AAAAACTCTGGTTTCAAAAAAAAGTGTAAAAACTCCACCGGTATATCTGTTCTGTTCCATATACACTAAAGCTTTAATAA TCAGTTTATTATCACCTATCTACTAGCAAAGTTAATAATAAAATTTGTTCATTTTAAATATAATTATTTAGATTACAAAT TACTGGTATGTAAATTAATTAGTTTATTTTGTTAAATTATAAAATTAAAAATCATAAAATGTAGAATCGCTCGTCCGTGC ATCGCACGGAAACAGGCTATTATCCTAGTACATACAATTAGTCAATTTATCTAATTCTACCATTTGGAATGGAGTTCTTA AGACGCGGGATTGCCTTCGGGAGGAGTTTTAGTTTAAGGTAGGTTCTGGTGCAACCTCTCTCTAGTATGTTGATTAGTCG AGTTATGGAGTGTTAGCTTTAGCAGCTCCCTTCGTCCATATCTCTGACACTGCCCTTGCCTCAAGGATTTGGTTTGGGAT GGAGGCTGGGATTTAACCCCCTTGCAAACTGTTATACCAAACCCGTATGTGCGAGGGCTTCTGTCTATAAGCTCCAACCT GGTTGCTCAGGTTCTGGACTGCTATCGATGGCACCAACACCCCTCAGGGGTTTATTCTGCAGCTGCGGGCGAGGCTGCGT GATCATGGTCTGAAAGCGACGAACTCAGGGGATTGGAGATGGGTATGGAGGATTCACGCGCCTGAGAAGATCAGAGTTTT TGTTTGGTTGTTATTGCATGATGCGATTCAAGGTAGTGATCGAAGATTTGCGTGCCCCCTCGCGGCATCCCCTACCTGTT TCTGGTGCTCACATGGTGTGGAGGACAAGTTTTATTGCCTCTGGGGTTATCCCCAGTCGAGGGAAGTATGGTCGCAGCTC GGTGCCCTTGCTTGGCCACGCTTTTAATGGTTAGGATGTTGGTTTTTGGGTTCGCTACTAGGCTCGATGACAACACTCGT CTCTCTTTATCGCATGCATTTGGGGCTTATGGCGCTGGCGTAATGAGATGGCTCTTGGTGAGGGTAAGTGGACAGGGGGT TTAGTTTGTGATTGGATTCGACGTGAGGAGGAAGAGCATCTTACACTCTTTGGTGATGGAGGGAGTGCAACTCGAGGTTC GTTTTTTGTTTGACCGATGGCAGCCTCCCCCTGAAGGTTTTTGCTCACTTACGGTGGATGAGGCTTTTGGGTCTGCTAAG CCTTGCATGGGAATGACTGGAGTAATGAGGGATGCTTCGGGAGCTTGGATGATTGGGTTTTGTGCTGGGATGTCGGGAGG TGACTCTTTGTCTGCGGAAATCTTGGCTATGACGTTTGGGATCCTACTTCTCTTATGTAGAAGTATATGTCCGGTTTATT GTGAGTCAAATTGTTTGGAGATTGTGAAGGTCCTCAAAGGTAATAATCGCCAGTTTCATGCTTCTGCTATGCCGTTCAAT ATATTCACTTGCTTCTCTCTAAGGATTGGGTGGTTCGCCTATGTAATATTCCCTAGGAATCGAATGGGCTGTCTGATTCC ATGGCCACTGTTGGAGCTAGACTTCAATGTAGCTTCACTATTTTGGAGGAGTCTCCAAATGTAGTGGTCCCAAGTTTGGC ATGACATTCGTTAGCTCTTTAGTTCCGTTTTCTTTTTCCCATTCAACAAAAAAAAAATTACTCCTATCACATAGATATAA ATTATGAGAGTAACTGTCACAAAAAAAAATGAGAGTACCAATAAATAGAAGAATTTTCAAACTGAAAAACTTGTTTTATT GAATAAAACAAAAAAAATAAAAACAGAATACATAACCAAGAAAAAAGAAAGGATAGAGGGGGGTGCCTGAAACAATGGTA CACTCCATTGCCATTAAGCCATGCCCAATCCCAACCCACTCTTTCATCACAACAAAGTCCATCACTTTTAGGGGTTTCAG TCCTTCTTCTTCAGCCACACCCACCACCTCTCTCACCCTTCCATCACTCTCTGTAAAATGCCGCCAAACCGAGCTCTTTG ACTCCCCACAACGCCCTCCACCTCCGCCAGGTACTCTTCTTTCTCCAATTCACTCATTCCAACTCAATTTGGTTACTCAA TAGAAAACCCTAATTTTGCAATTGAAAAGATGATTCAATTTTCTTATGTAAAAAAATCTGAGCTTTTTGCTGTATTTCTT GTTAACCAATGATATAGAATAATGGGTAGGCTTTGAAATTGTCTAGCATTGGTGTTTTCATGATGATACTGCTTTTTGTT TTCTCTTCAAGATGTGTTTTTTTTATGTGTGTTCACTGTTCAAGTTGTAGATTTGCCGCCCAGGGTTTATGTGGATCACT CCCTTTACAAAGGCAAAGCTGTGCTGACACTATCTCCTAAACCTCCGGAATTTTCGATGTTGGATGTATGTTCTGCTTTG GATTTGTTGGTTTTGTTAATTGATGGAAGTTGTCACTGGTTTTTCTCTGTTCTGAATTTCTAATGTTTGAGTACTAATTT TGTGGAATTTTGAATATGATGTTTGGTTATGGAACATTCTGTTATGTTTTGCAGTCTGGTGCAGTTAAAGTATCTAGGGA AGGTTATATTCTCTTCCAGTTTGCTCCTGCAGTTGGTGGTGGTACACGCTTATATGATTGGAACAGAAAGCAGGTGATTA TGATTCTTCTATAACATGGGGGTTGGGGGCAATGCATACCAGAATATCTATAGATTTTAGATTCTATACATAAGTGTTCT GGTCTCTCTAATATGCAGAAATTATTTACGCATTTTGATAGTACTACACTATGTCCACGGATAACATAACACGAGGACAA CATAAGAAACAAAGCTGTTAGATTAAATTCAAAATGTTCCTCATAAAATCCAAACCTGAAACTCAAAAGTCTCTTGTTTT TGCTCTTGAAATGCAAAAATGTATGGAACATGTACTTTAGTGAGCATTTTGAATTACGATTCTATTCTGGTATGCCAGCT GTGACATAAGCTTTAATTAGTTGGAAAATGTGGACATTTCAGATGATTAATTTCTTAAATGTAAGAAATTAGTGGAGTAA TCCATATTTAAGATATCGACTAGTTTTATGTTGGCCGCCAAGGTCCAACACAACCCTCCTCCTTTACCCGGGCAAATAAA AAATTAAATGTTTTGAAATAAATTCATCTGGCATCCTAAGTTTTGAATAGGCCGTACTTGAGGAAGTTGAGGATAAGGTC ACTCTGTATAACTGAAATTTTATTTGTACTACACTAAGTTAACGGGTAACATAACACGAGGACAACATAAGAAACAAAGC TGTTAGATTAAATTCAAAATGTTATATGATATAAGTTTGATCAAATCTTAATCGTTGGGGGTATTACTCTGAGTACCTTA GAATTTTTCATAAAATCCAAACCTGAAACTCAAAAGTATCCTGTTTTTGCTCTATAAATGCAAAAATGTATGGAACATGT ACTTTAGTCAGCATTTTGAATTACGATTCTATAATGGTATGCCAGCTGTGTGTTTTTTACCCTAGAGAAACATAAGCTTT AATTAGTTGGAAAATATTCTGGTTTAGTGGACATTTGAGATGATTAATTCCTTAAATGTAAGAAATTTGTGGAGTTATCC ATATTGAAGATATCGACTAGTTTTATGTTGGCTGCCAAGGCCCAACACAGATTGACCTTGTCTATAATAAATGCTTTAAA TATATATTTTTTCCTCAGTTATCCTATGCTAAACGAACTGGTATCATTGTCCATGATTTGCTTTTCAGAAGGCATAATTA ATCCCAATTCACAATTGCTATCTTAATGATTCTAGTTTTGTGGCTTATATTGCCTTTGCGTCTGCATGTTTGGGAGAAAT AAAGATATGATTTCATTTCCCTTTAAGACAGCTCATTAGGTAAAGATGTGGGATGTGCAAGGAGAGTAAATGGGTTTGAA GTCCACACTACACTCCTCCTTTCTCGTCCCCTTCTCTCTCTCCATTTGACCTATTGTGTTCTTGAATGAAAAAAACTGAT TTCTTTGGATTTATGATTGGCCTTGCTTGAATGCAGGTATTCTCACTATCAGTAAATGAAATGGGAGCTCTAATTAGCCT TGGTGCAAGGGGGTCCTGTGAATTTGTACGTGATCCTTTTAAGGGAAAAAGGTAGTTTCTATGCTGAAGTAATGAATTAT CCAACATAACATATTGAAAAGTTTCTCAGCGTTGCATGCTTTATATTGAAATAAAATTTGAATTTGCTTTCCACATGGGA AGGGATAATATGATCATGTGTGTGGATCCACGTATGTTCAATAGATTTTACAATTTTTTTGTTGATTTGATTTTCCGAAG GGACATGAGTTGAGCATTTTGGAAATTGTCTTTTTATGCAGTGATGAAGGTAAAATCAGAAAAGTTTTGAAGGTGGAGCC ACTTCTGGATGGTTCTGGTCACTTGTTTAACTTAAGTAATTCCCTTTCCTCATAAACTTTATTGCTGTTGTTTTGTCAAA TTGATTTTAGTTTCCTTCCATCTTGCAGTTGTACAGACGATATACTATTGGATTGATTCAATCCTCTATTTTCTGTGCTG CAAATAGCTTACTTAGGGATGCAATATTTTGATAATGATAAACAACGCAATCACTTTAAGGAATGAGTTATTTGACCTAT TTTTATTACAATACCTGTAATATTGGTGGTAAACATTTATTTTAATTCTGACTTTGTTTTGGCGATTTTCAAAGGTGTTC AAAACAAGCTCAAGAATGTGGACGAAAGCATCTTTGTTCCTGTTACAAAAGCAGAGTTAGCAGTTTTTAACTCACTTTTC AATGTATGATCTCTCTCCCCTAATGGCAGAATATGCATTGCCATGATTCTCTGATTGTGCAATGGGTAGATGTAGTTGCT GAATGATAAGACTAAAATGACAAGGGTCTAACTCTACCTATGGTTTTTTATTGAATTGCATTATAATATTAACAACCTGA AATTCCTAGATGCAACCTTACTTGATTACTTTAGAGACAAGTTTATTTTGGAAGAACTTTTTTCCATAACAGAAATGGGT GATATTTATACCAGAAAACAGGAAAGAATTAAATCTATTTCATGTAATACACTTAACCTTCACCGTAAGAAAATGACTTG TCTACCAAAATTACGAATATGTTTTGCAGCAAGAAATCATCGAAGTCTTATAAAATTTCTGCTTTCAAATCAAGCATACA ATTTATAATTTGGAATGAGAAGCTCCTGATTATGTTTATTGTATATGGTGAAATAGCACTATAATATGTTTTTTTGTTTT GAGTAAAAATGCAATTTGGTCTTTATGAACTCACCTGGTTAATATTTGACTAATTTTGATTGTACTTTTGCTGGTTTTTA ATGCAGTTTATCTTGCCATACCTTCTAGGTTGGAATGCTTTTGGAAACTCCATAAAGCCAGGGGTATATAGCCGAGTGCA TAATGCCAGCCAAGATACGGAGCAGAATATGAATGGAACAGTTGGGGATAATTTGTGAATATGAATGGAACAGTTAGGGA TAATTTGTGAAGTTAAGAGCAGAGGAGGAATTGCAGCGCCCTGTGAGAGCTTCTCAACTAAATTGTGTTAAAATTCTTCA TAGTATTATTAGAACACTCATTCTTAATCCTCATTTTTCCTCAAAGTTAGGTCCATAATGGCAAGTGGGATTGCTGGATT CGGTTATTTCCATTTCTTTTTCATTTCCTAGTGAGGACACCCTCCCATGTAATTTGTAAATGAATTCTATCAAGTTAAAA GTTTTTTTTTCTAAATAAACTGAAACTTATAAAAAAATGAAAAATAAATTCATTTTGTGTTTTTTTTTTAAATGGAG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0307700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTGGATTCTGGTGCAGTTAAAGTATCTAGGGAAGGTTATATTCTCTTCCAGTTTGCTCCTGCAGTTGGTGGTGGTAC ACGCTTATATGATTGGAACAGAAAGCAGGTATTCTCACTATCAGTAAATGAAATGGGAGCTCTAATTAGCCTTGGTGCAA GGGGGTCCTGTGAATTTGTACGTGATCCTTTTAAGGGAAAAAGTGATGAAGGTAAAATCAGAAAAGTTTTGAAGGTGGAG CCACTTCTGGATGGTTCTGGTCACTTGTTTAACTTAAGTGTTCAAAACAAGCTCAAGAATGTGGACGAAAGCATCTTTGT TCCTGTTACAAAAGCAGAGTTAGCAGTTTTTAACTCACTTTTCAATTTTATCTTGCCATACCTTCTAGGTTGGAATGCTT TTGGAAACTCCATAAAGCCAGGGGTATATAGCCGAGTGCATAATGCCAGCCAAGATACGGAGCAGAATATGAATGGAACA GTTGGGGATAATTTGTGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0307700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLDSGAVKVSREGYILFQFAPAVGGGTRLYDWNRKQVFSLSVNEMGALISLGARGSCEFVRDPFKGKSDEGKIRKVLKVE PLLDGSGHLFNLSVQNKLKNVDESIFVPVTKAELAVFNSLFNFILPYLLGWNAFGNSIKPGVYSRVHNASQDTEQNMNGT VGDNL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 1 150 150 2.4E-59
PANTHER 2 156 155 1.9E-84
SUPERFAMILY 2 153 152 3.61E-50
Pfam 2 119 118 4.4E-44
PANTHER 2 156 155 1.9E-84

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function DNA binding Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid).
Molecular function Single-stranded DNA binding Interacting selectively and non-covalently with single-stranded DNA.
Biological process Regulation of transcription, DNA-templated Any process that modulates the frequency, rate or extent of cellular DNA-templated transcription.
Biological process Defense response Reactions, triggered in response to the presence of a foreign body or the occurrence of an injury, which result in restriction of damage to the organism attacked or prevention/recovery from the infection caused by the attack.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0307700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…