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LotjaGi2g1v0355700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0355700
Transcript ID LotjaGi2g1v0355700.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Phosphoinositide phosphatase family protein; TAIR: AT3G51460.1 Phosphoinositide phosphatase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9C5G5|SAC7_ARATH Phosphoinositide phosphatase SAC7; TrEMBL-Plants: tr|G7K028|G7K028_MEDTR Phosphoinositide phosphatase SAC1; Found in the gene: LotjaGi2g1v0355700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:83172133..83183731) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATTTGGAGAGTCCATTTATCCAAAAAGTATTTATGATCAAACGGTGACGATGATCTCAATTCTCATAGATGCTTTTCCAT TGACCACCACGTCGTAGGGTTCTCCATAGTAGTAGGCCACGGTCTCACACATCTCTAATCTTCTGCCACGTGTACCAAAA CACCCTCGCTCCGGCGTCGTTTCAGGGGAACCAGTCACTGTTTCCGCCCTAAAGCGGCATTTGGACACCACCAATCCCAA TACTGATTCTCCCCCTCGAAATCTCATTCCATATCCAACCTTCCAAACACGCCCTTATCAAAAGAACTTATATCAAATGT TGCAAATGCATTTTCCACCAAACCGAATTTGAATCTTCAAAATCTTCAACGTGAACGTTCTTCCGATTTCACAAACCAGG TACAATTTTCCCGAGAAATGCGAGAAAATATCAGAAACCAACGGTTTCAGATCAGATCAAACTAAACTAGACCCGATTTC AGCGAATTGAACTTCGATTAGTTGCTTCGATCGATCTGTGAATTCCTGGAATGCTCAAACGATGGATTGAGATTTGAATT TTTTATGATTGTTGATTGTTGATTCCTCGTGAATGCAATGATTTGAATGAATGTTGCTTGTGATTTTCAGTAAGGTGGAG TTTCAATAATGATGGAGAAGGCAGATTCTGTGCAGAAGCTGTACACGCGGATGCGGCTCTGGGAGTTTCCGGAGCAGTAT GTGATTGAGCCGACGGATGGATCATCTGGTTCTTCTTTGGCGGTTAGCAGAGTGGATGGCTCCATGAAGCTCATCGGTTA GCTGATTTCAATTCTGCATCTTCGTGTTTTGTTTAGCTTATGTATAAATCGTTCACGGTTGATTGATCCTGTGTTGTTTT GCTTTAACAGATGAGGTTCCAGAATGCAGCTCCGTTCGAGTTCCGAAGATTTATACGATATTCGGTGTTGTTGGCATGTT GAGGCTTTTGGCTGGTGAGCAATATTAGGAGACACATAACCACAATTTGCTTATTGAAATTGTACTTATAAGTGATGATT GTATGCATTTTTCTCAAGTTTTTATTCTTGTGTATTGGACGGGTTTTATTGGTGTTCGTTTCATCTTTATATATATGATT GTGCTATAATGTGAGGTAGTTGGACTAAGGATTTTTATTTTTGAGAGATTGAAATTGATAATTAAATATTCGACTAATGA TAGTTGGTGATAGATCTTGGCACATGAATGAAAGCAAAAATTGAATAAAACACCAATGATGTTGGATGCGTTGTCGGCTG ATGTGAATTCTTTGTTGTGTTTCCTTTTATTTAATTATTTTTTAACTAAAGGCAGTGGTTTTAAGGATCATGTCAGATTG CCAGTTTTTCAAATTTACATTTATATGAATTTCTTTTGGTTCATTTGTCTTTATGGCTCAAGCAGCAGATCCTTACTACC CCATTTTTCGTTGGTCGTACTTGTTATTTTGTTACCTAATATTCATTCATATCTGATTCTGTACATCTAGTTTACACACC TGGTTTCCTCTTCTGAGTTCAGATAATGCATTATTATTCAACAGCAGACTTTAATTTGAACAATTATTTTGATGCTTCTA TATTTCATTATTGCCTGTAGGATCATATTTGCTAGTTATAACTGAGCGTGAATGTGTTGGATCTTACTTGGGGCATCCAA TTTTCAAAATTTCATCCATGAAGGTTTTTCCATGTGATCATTCTCTTAAGAATACCCCTGCCGAACAGGTATGTTTGCTA CAGCTCTACTTGTTTGCTATTTAATTCTATGTTTACTATCAGTGTGGAGCTGATAAATACAGTACCATAATTGGCAGAAG AAGACAGAGATGGAATTTTCCGGTTTACTAAATGTTGCTGAGAAGACCTCTGGTCTGTTCTTCTCGTATGAAACTAATTT 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ATTATATGTTGTCTCATGTATTTATCTTTTTTGATACATTCAATTTTCAAAATTTCGAAGTATCTGAATTGAAAGTTGAA ACCTAGATTCAATTTCTAAATGATTCTCTATGATCAGTGTGGGCTAATCATGGGGATGATATAAGTAGTCAATATTCGGG AACTCCTGCACTAAAAGGAGACTTTGTCAGGTATTTCCTTGTGAATCTTTTCAAAAAAATTCATGTTCCTCGCACAATAA GAAGATTGAGAAATTACGAATTCATAAAGGTTTTTCTATATTGAAATTACATTAGCATGGAATAATTTTATGCCATTATT GGAATGTATTATATGCTGGCTCTAGTTGTATTGTTTAAAACAGTAGTGTTTGACTCTTGCAAGTAGTATTGGTGTAGGTA TTGAACCTATTGCTACATGGTTTCCTTTGCGAAAGTTTTGAATTTTTAATGCATTTTGTTTTTTCCATGTAAGTCTGTTG CTTTTTTCTTTTGCCTCCTTTTATTACATCAACTATTATATTCAATTAGAATGACAAAACATGGGAATAACATAAATATT ATTTTGCAATTATGCAAATTTTTGCACTTTAAGGATGAACAACTTCCCTGGGTGACATAATAATTAGATTCAGCATCACC AAAGTCATATGTTGCTGTTATGATTTGAAATTTACGTATGCCTTCCCTAATGAATTTTTTTGGTGGTATTCAGATTTGGG CACCGCACAATGCAAGGGATAGTTAACGATGGTCGGAATGCTCTTCTAAGATATTATTTGAATAACTTTTGTGATGGAAC AAAACAGGTTTGTGGAGCTCATTTATCCTCATGTAATATGAGAGTTCTAGCTATGGTCTAGATTGCATTAGGTGTCTACC ATATGGTCATAACTCAATATTGTTAGGTTTTGTCCTTTGTATATTTGATTTCTCCCTTGTCCTAGTTCAAATTGTTAGAG TTTATGCTGTAGGAGATGCTAAATTTATATTCATATTTTGCTGTGGATCATATTCTTATTTCTTAAGATAGTTTATTGCA TATGTCCTTTACCCTTGCTGAATTGATCTTGGGTTGAATAATTTTTTAAGCTTTCCTGTATCTATTGTTGTTTTTAATTT TGTTGATTTGAAGTATTTATTAGTTTATCTGTAATTGATTTATGTTGTTCAAATTTTTGATTACTTGAAGGATGCAATTG ATCTCCTGCAAGGACATTATATAGTTTCTGTCGGCCGAGATAAAGCTGCCTCAGCTCAGAAAGGAGGCCTTGAAGCTATA GCTGTGAGTACAACATAGATGGAACTTATTTCTTGCTTGAAGTTTGTGGCATCAATGTTGGTTTAAGAACAAATTTAGAA ATCTCACAATTAATAAAAAAAATTGCGTTCCATTATATATCGCTAAATTCATAGTTTCATACTGATCAAACTTTAAGTAA TTGAAATATGTTTTGAGGGCACTACCTATTCAGCAGAGATATTTGTTTGTTTTCTGTTTCTTTGATTATGTGTTTTATGA GTGTTTTTTCCTTTTGAGTTCTACAGAAGGTAGGTTCACGTCCGGTTAACCTGTAACATCATTCTCCAATGAGCACAACA ATCCCTCTCAACTACTTTTGTTCTATCCTTTATTATGCTATGAGCATCTGCTATATTACTGCCAACACATCTGTTTTTCT ATACTTTTTTCTAATTCATTTGTGTCCTGCAGCTTTGACCACTCAGTCCTTATAAAAGCCATGGAATTTTCCTTCCAATC GGCTAACACTTGACCAATGTTTCCAACCAAATCTCAGATCCACGCCTCCATACTCTAACACACATCATAGTGATATTAAT TGCCCCTTACTGTGTTATCAAACTGGTACACTTCCCCTTTGTTACCACTCAATGGCCATCACCAAGCATCATTCCTAAAT TCTAAGAAAAATTTACCTCCAAGGTTGAAGTGATATGTGGAATGATGAAACTGTGACTTGCTCCACTACAATTAATACAG CTATAGGAACTCCTTTAAGTTTCCTTTCTATTCTTATTTTCTTCACGTCTAAAAGAACTTTGCTTGAAAATCTAAATATC CCCAAAGCATTGGTTTCTAAAGCTTCTTTTTCACTGTGTTCATCAACAACTTCTATAGCCAATTCTTCATTGTCACCTAA AGATCACCAATCATAACTGCCCTGTATTGGTGTTGAGGGTGAAATCTGTCACCACATAATCATGACCCCTTCGCTTTCCT CTCCATGAATTCTTGATAAGTTAAATGGCATCAGCTTCTAGCCTTCTCCACTGAATTCCTTGGTCTCCTCCATTTGTCTT CATTGCAAAACCAGAAGATGAAGCAAAACCTCTATTTTGTGTGAAGCCTGAATCCATTGACCGTGAGTTATTACTGTTTC TGCCCATTGGCCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGGCAGATGCTGTTACTGAGACATTTTCTCCTCCTTGCACCCCAAACTC AAGAGCTACCATCAGTTACTTTTTTACAAATAATTGCCATTAAGCAGTTTCCTATTATAAAAATTTATCAATCCAATCAA CATACTCTTAAAACAGAATTGCTGAACAACCATCAGTTATCAAATATACTCTCAAAACAGAACTGCTGAACAATCATCAG TTATTTTCAAATTTCAACAAATAACTGTCATCCAGGTGTACACCTTCCAAATAGGGGGGCTTAACTGGTTTACGGACTGA GATCTGATCCATTCCTATCAGTTGCAATGGGCCATGAGCATGAAATACATGCTTTACTTATTGAGAACTAAAACTACATT TGGTATTCAAATGAAAAATTAAATTATTCTGCCAAGGATAGTGATTATGTTCCCAGCCAATGCCTTACAAGTTACAATGA 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CAAAGAATTATATCTTCACCTAACGCTTCCTCTGGCTGCTTAATATATTTATTCTTTCTTTACTAATTTGTAAACACTGC AGCTCTCAGAAATATATTCATATAACTACAATCATGTTCTGCTTTTGCTGCTTCATCGGTGTTTCTTGCACCTCTTGTAT ATTTGAATTTTTTTTTGTGCCTTGTTTAAGATGGAAGCATTCAAGGTTTATATTGTATTCGTTTTACCAAATTCATTGAT TCATACTATTTCAGAAATCAAGGTTACTGTATATGTGGGAAACTAAATGCGCTGCTATTCAAGTTTACGGAATTTCTTAA TGACTATGATAACTTGTTGTCAATTAGGATTCTTGACTTTTGTTGATAAATTTAGGTTCATTATAAACTCATTGCGGCAC ATACATGTCTTTGAAATAAAATGATCCCCACCACCTGACCTAATGTCCTAAGTTTTTCTTTTTTCAAGGAAATAAAAGGC TGCTTAGACTTTCCTTGATATAATAAGCAGCTCACAAACTGTTCAGACTTTCTTGATAGCCTCTTTCTGCCTGTAAGGAT TAGGTGCCATCTTTCCTTGTTCACGTGTTAGGAACTGAGGACTATTTTTTGAGAAACACCCTAGTATATAATTTGCTATC TTGTTTGGTTATCCCATCCATCCATTAAGAAAATCAATCTTTTCATTTCAAAGCTTATGCAAGTTTTGTTGAACCATATG AAATTACCTCATTAAACCTAGGATAGTCGATAAGTAAAATAATGTAAACAGTTGTTCACTGCCTCAACGTATTGTCAAGG GTTATACGTTCTATTGTATATGATCTTCTATGCTGGGATTTTTATATTTTGCTTGTGAATACTATCTGAAAACAAATTAA AAGATTTGAACCTGCGAAAGTTTAGTTTGCTCATGCTCTCAGCTTGAACCTAATACTCTGCTGCTTTCAAGTTCCATTCA CAATCTTGCAAAGGATCACATAATTTTTTTCTCCTCTTTCAAACCCGGGTCAGAAGCCTAGGTGAAATCTCTTAAAAAA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0355700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATGGAGAAGGCAGATTCTGTGCAGAAGCTGTACACGCGGATGCGGCTCTGGGAGTTTCCGGAGCAGTATGTGATTGA GCCGACGGATGGATCATCTGGTTCTTCTTTGGCGGTTAGCAGAGTGGATGGCTCCATGAAGCTCATCGATGAGGTTCCAG AATGCAGCTCCGTTCGAGTTCCGAAGATTTATACGATATTCGGTGTTGTTGGCATGTTGAGGCTTTTGGCTGGATCATAT TTGCTAGTTATAACTGAGCGTGAATGTGTTGGATCTTACTTGGGGCATCCAATTTTCAAAATTTCATCCATGAAGGTTTT TCCATGTGATCATTCTCTTAAGAATACCCCTGCCGAACAGAAGAAGACAGAGATGGAATTTTCCGGTTTACTAAATGTTG CTGAGAAGACCTCTGGTCTGTTCTTCTCGTATGAAACTAATTTAACTCTGAGTGCACAACGACTGAATGACTTGGGTGAT GAATCTAGATTGCTTCCTCTGTGGAGACAGGCAGAACCTCGATATCTATGGAACAATTATATGTTAGAAGTGCTCATAGA TAACAAGCTTGACCCATACTTACTCCCTGTAGTCCAAGGCAGCTTTCATCACTTTCAAGCAGCCATCGGGAAAGATATTA TTGATATTACTTTGATTGCTAGGAGATGCACAAGAAGAAATGGAACTCGGATGTGGAGAAGAGGAGCTGATCCTGATGGG TATGTAGCCAATTTTGTGGAAACAGAACAAATTATGCATTTCAATGGGTACACAGGTTCATTTGTTCAGGTTCGTGGTTC AATTCCACTGCTCTGGCAGCAAATTGTTGACTTAACATATAAACCGAAGTTTGAATTATTGAAACCTGAAGAAGCTCCAC GAGTCGCTGAGAGGCATTTCTTAGATTTAAGAAAAAAATATGGAGCAGTGTTGGCTGTTGATCTTGTTAACAAGCATGGA GGAGAAGGGCGGCTGTGTGAAAAATTTGGCGATGCAATGCAGCATTTGGCTGGTGATGATGTAAGATATGTGCACTTTGA TTTTCATCATGTTTGTGGGCACATACATTTTGATCGTCTCTCCATCCTCTATGATCAAATTTCAGATTTTCTTGAGAGAA ACGGATATCTTCTTTTGAATGAAAAGGGAGAGAAAATGAAGGAGCAACTTGGAGTTGTTAGGACCAATTGTATTGATTGT CTAGACCGTACAAATGTTACTCAGAGCATGATAGGCCGGAATATGTTGGAATACCAGCTTAGAAGGCTTGGTGTCTTTGG TGCTGAAGAAACAATTAGTTCACATCCAAATCTTGATGAACGCTTTAAGATCTTGTGGGCTAATCATGGGGATGATATAA GTAGTCAATATTCGGGAACTCCTGCACTAAAAGGAGACTTTGTCAGATTTGGGCACCGCACAATGCAAGGGATAGTTAAC GATGGTCGGAATGCTCTTCTAAGATATTATTTGAATAACTTTTGTGATGGAACAAAACAGGATGCAATTGATCTCCTGCA AGGACATTATATAGTTTCTGTCGGCCGAGATAAAGCTGCCTCAGCTCAGAAAGGAGGCCTTGAAGCTATAGCTTCATTTC CGCTGGCTTTGGGTCTGGTTTTGATCGGATTTCTTTTTGCAACCATGTCATTGAGGCAAGTTCGATATGATTTTCGGCAC TTGTTCTTTTCGCTAATGTGGGCAAGCATTAGTGTTGGTATAGCAGCATTTGTGAGGGCCAACGGCCGGGTTTTCTGCAA CAGACCTCGCCTACACAATCCCCGGGTTTAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0355700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MMEKADSVQKLYTRMRLWEFPEQYVIEPTDGSSGSSLAVSRVDGSMKLIDEVPECSSVRVPKIYTIFGVVGMLRLLAGSY LLVITERECVGSYLGHPIFKISSMKVFPCDHSLKNTPAEQKKTEMEFSGLLNVAEKTSGLFFSYETNLTLSAQRLNDLGD ESRLLPLWRQAEPRYLWNNYMLEVLIDNKLDPYLLPVVQGSFHHFQAAIGKDIIDITLIARRCTRRNGTRMWRRGADPDG YVANFVETEQIMHFNGYTGSFVQVRGSIPLLWQQIVDLTYKPKFELLKPEEAPRVAERHFLDLRKKYGAVLAVDLVNKHG GEGRLCEKFGDAMQHLAGDDVRYVHFDFHHVCGHIHFDRLSILYDQISDFLERNGYLLLNEKGEKMKEQLGVVRTNCIDC LDRTNVTQSMIGRNMLEYQLRRLGVFGAEETISSHPNLDERFKILWANHGDDISSQYSGTPALKGDFVRFGHRTMQGIVN DGRNALLRYYLNNFCDGTKQDAIDLLQGHYIVSVGRDKAASAQKGGLEAIASFPLALGLVLIGFLFATMSLRQVRYDFRH LFFSLMWASISVGIAAFVRANGRVFCNRPRLHNPRV 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 62 62 -
PANTHER 7 595 589 0.0
PANTHER 7 595 589 0.0
Phobius 63 83 21 -
Pfam 67 352 286 6.8E-86
Phobius 84 528 445 -
ProSiteProfiles 131 459 329 74.517
Phobius 529 549 21 -
TMHMM 529 551 23 -
Phobius 550 560 11 -
TMHMM 558 580 23 -
Phobius 561 580 20 -
Phobius 581 596 16 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Phosphoric ester hydrolase activity Catalysis of the reaction: RPO-R' + H2O = RPOOH + R'H. This reaction is the hydrolysis of any phosphoric ester bond, any ester formed from orthophosphoric acid, O=P(OH)3.
Molecular function Phosphatidylinositol phosphate phosphatase activity Catalysis of the reaction: phosphatidylinositol phosphate(n) + H2O = phosphatidylinositol phosphate(n-1) + phosphate. This reaction is the removal of a phosphate group from a phosphatidylinositol phosphate.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0355700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…