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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0422900 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0422900.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Chaperone protein dnaJ, putative; TAIR: AT2G35720.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q39079|DNJ13_ARATH Chaperone protein dnaJ 13; TrEMBL-Plants: tr|I1J9W3|I1J9W3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0422900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:92085061..92095751) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCACTTTCATCCATTTTCTCTCATTTCTTTTCCGGTCACTTTTGCTGCCTGTGGTGACTTGTGAAGGACTCCCATTCTG CCGCATCGCTGACGTAAGCAAAAAAGAAAAACCCCAACCCTTAAACCCTTTTTCCATTCTTCATCATTCTCCTTCTTCAA AACCCTAACTAACAACCGTTCCAATTTCTCAATTCTCAACCAGGAACCACAGCAATGGACGAAGAGACCGAAGCGCCGGA CACCCGTGAACTCTACGCACTCCTCAACTTGTCGCCGGAAGCTTCCGATGAAGAAATTCGCAAAGCCTATCGTCAATGGG CACAGGCTTATCACCCTGACAAGTACCAAGCTCCTCACGTATGCATCCCCCTCTCTCTCTCTCTCACTCTATCTGCTATT TCCAATTTCCTCCTCATTGTTTTCAATTTCTTCATTTGTTTTGTGGTATCAGATGAAGGATATTGCTACTGTGAACTTTC AACGCGTCTGTGAAGCGTATGAGATTCTCTCGGATCCAAATAAGAGGCAAATTTATGATATCTATGGCATGGAAGGGTTA ACCTCTGGTTTGGAACTCGGTCCGACACTCGATAAAGCCCAAGAGATCAAGGCAGAGCTCGAGAGGTTGAAGAAGATGAA GGAGCGGGAAAAGATGGCGGCTCATTTCCAATCATCGGGTACAATTCTGGCAAACATGTCTTTGCCTGAATTTCTACGGG GTGATAGCCTCTTCAAAGGGTATTTCTCAGTTCATCATAGGTTTTATCCTTTTTATTTTATCACTCTGATTATGGCTAAT TGGTTAATAACGTTGACGATTAACTCCGCAATTAGACATTAAATATCTATTGTCTTTTTTAATTTTGTTTTGCTTAAATA GTACACATTGGGTTTAGTTTTGTGAATGAAAAATGTCGGATTAGGCGCCGCGGATTTAGCTCTTTAAGAGTCATTTTACG TGGTTAAATTAGTCGTAACTACCGTTCATTGAGAAATCAATGGTTTTCAAAGAACACCATTGTCTGTTATACACGTGCAA GTATATGATTACAATCTCAATCGTTGATTTCTCAATCAATAGTTTTCATGACTTACTTTACTCTCGAAAGTGACTCCTTC ACTTTAGAGCAGCCGAATTAAGGCGGTGAAGCGAGCTTATGTAGGTCAACCAGCTTGACTTGAATTAATTAGGAGTCGCA GTCGTAGACGGAAAAAAAGAAAAAAATCAGCGTATCATTTTATGGGAATTCTTTAATAATTGAATATTGAGTCTCTCGAA TGTTAATGTGCTGGAAGATATCATGCTTTATGTTCTTAATTTTTCAGAGCAACACCTACCTCACAGTAAAATATCAGCTG CTCGTTTCAATTTTGTGTTCAGTAGCTAGTTACTTTCATGATTTTATCTGACTATTCATGTCTTTAATTATGTTTCTGAA CATCAGAATGGCTATGACAAGTGAAATTCAGTCTCAGTTATCCAAGCGTAATGCTGTTACATTAAGTGGCAATTTAGCAG TTGATGGGCGTGACGGTGGAGGGGCTGCTACTGCTGTATTTAGGCATCAACTGTCAGAAGTTTCGTCAATAGAATTTGTA GGTTCAGCTGGTTTACGTGCACTAGTTGGGGTGCAAACATCTCGGTGGGTAATTTGCTTTTTGCAAATAAATTTGAACAG TGCTCTTCTGTCAGTTTTAGCGGTGCTTTATATGTTTCTCGTGCGTCATATTCCAGTAATATATCATTACACTCAACTGC AACAATGGGCATAGCCATGTCTTTGAAAGATGGTTCATTGAATCTTTCGAATCTATGGACCCGCCAACTGTCAGATACAG CAAGTGGACATGTATGCTACTTTGAACTTTTCTTTCTCATGATCATAACTAGTGCACATGGATACAATTTTGGGATGTAG TAGAAAACAATCACTTTTTATTAACTGTGAAATTTGTTGATTTTAAGATAGTCAGCAAGATCTATGTTTTATAACAAGTA ATCATCCACTTGATTTTGCGAAATTCAAGGAGCACTGGAATGACCTGTCCATCGTTTCCTAGTTCCAACTGAAAAGGACA TATATTGAACTTGTAATAGATGAATATCAACAAACTTTGTATATTTGGTACATTCAGAAACCTAAATCCCTTAAAATGTT GTATTGTATCAGGATATGGCTACAATTGACCTAATACTTGGTGCATATAAGTGCTTACCGTTATAAAACAGAAAACTGTT GAATTGGTCTTTTTATTTGCTTGAGAAATATGAATCAGTTTTTGAATATTTTTTAACCTTGAGCTTTCCCTTCTCATTTG TGTTACAGATACAGCTTACTTTGGGACCACAATCATCTGTAGCTGTAGGGTGGCAAAAGAAAGATGAGAGAGGGTCAGCC TCTGGTGAAGTGAAGGTACTTCTATGTTTGACAGATGCATAACCAAGTCATTTGGGCTGAAAATGTCATTACCTTCACTA TTGACGGTTTTCCAGTATAAACTATCATTCTAAACCCCAGAAAGGGGGAGAGGGGAATTATAACCATTGATTTTGTGTAT TTAAAAATTAAAGAAGTGAGAGAAAACTAAATCAATGGTTAGATGGAGCAACTTCACACTCTCAAGTTTTTTTCCAATGG AGAGGATCCACACCCCATGCTTCCACACTTTGAATAGGGTCTTAGAGGTTGATCAATTTTTTAGTACTTTTTAATAATTT CCTATACAATATTAACTCTCTCTCAACTTCTTTAGTTTGGCACAGGTTCTTTTGAGACATCAGCTCATTATAGTCATCGA TTTTCTTCTAAATCTCTTGGCTGCATCGGGGGAAGAGTTGGGAGGTATGAAGATTGAATGTAAATTTAGTTGGGATATCT TTTTCCAGCTTATTTTTTTTTTGGTAAAGAAAAAAGTATCCCGTGCTTACATTTTTGTTTTTAAATGCTCACAATGTCAT ATAATATTGTTGGTAAAGGTTTTGGTAGTCAAATCTTATGTGTGTACTTGATAACCTAGCATAACATAACATATACAACT TTAGGTTCAAATCTTGACTCAGTCCCACTTTGTCTGACTATTTCCATTGTTTGTTTCTTTTCTGTGTTAATGAAGTGAAG TGTTAATGAAATATCTGATTTTCAATAAATGCTTATCATGTGAGAGCTTATGTCATAAGCTAACTCCGAATAAACTTATT TTTATAAGCTAATATGTGGAACTTATTGAAATATGCCAATATTTCCTATAGATAGGTTATAAGCCATTATTTTAAGTTTA ATCAAGCACCTACTTAAGTGTTTAAATCGTGAGATAAACCCAAATAAGCTCTAGAAAAGCTACTCCAAATGGTCATTACA TCAAACTAACGGAACAGCTTTCTTGTATCATTTGAAAGTAACACACGTTTTTTCAGTTTATTTGGGATGTGTGTACAAAC TTATTCCATGTCATGGCCTTTCTTTTGTTGAGTATAAATTTTAACTGATTGGAAGAGAGATAATATTGGTCATGTCTCAG ATGGGAGTAATACAAGGCTTGGTTGTGGACTTGTGTTATGCCACTGTCAAATGAAAATTGAGTTCTGATGCTTGCTTTCC GTAGTGTGTAACTAACACAAATAATTTGGTATGTAGTAATAGTATTATATAACTTAGTAATGTTACATTTTGGAGGTTTA TAAACTTATTGATGCTACTAAAATTTAAACAGGGTAGAGGTAGACTGAACAATGTTTTTGGAGAAATCATTAAAAGGACT GTGATCAAAATATGTTTGCTTTTGGTTTTTGATAGATTTCATTTGCGTTGATTGATCCATCTAGCCAATACCACCTTGTA 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GGATAAGGTATTTAAAATGCTCCACAACATTAATTTCCCTGCCCGTCAAATTAATTCATCCATATACTGTTTGTGTCCAT ATTCTATATTTCTTTTGTCACATCAATGATTCCTTGGCTTTCAGTTTCCACAGTGAAGAAAGTGGTTAAAGATTTAACCT CCTACCTTAAAGCTTTCTTGCAACTTACTAGTAATCTGAAGTTCAATGCACGTCGCACGATGTTTTTTTTTTTCCTTGTT CATAATTTGTTGTATAAACTGCCATACACACTTTTTAATCTTTTCAGGGTATTTCCTGGAAGTTTGAACTCTATCGCGGG GGTCAGAAGTTAATATTTCCTGTAAGATGACACTCTTCACTCTTTACATGTCTATCTTCATAGACACTAGAAGACATTTT GGGCTTTGACTTTTATTTTGATGTTTTATGTACGATGGTTTGAGAGTCTATGTTCGTCTTGATTACTAAGATATGCCAAC TTATCTTAACATACCTATGGCTTTAGTACAAGAGATATATTATGATGAAGTTTTCTCGAGTTTAGATACAGCTGATTTTT TAAAATGAAAAACTAACTAGACATTGGTTGTTTGTTTTTGTACGTTTTTTCGATTACTTGGATTTAATCTTGCCGCTCCT ACTTTTTTGAAATGCCTTTGTGAACTTCGGTATTGTAATTAACTTCACACATCATGTACTTACTAAGAAATTATTTAGAT TATTCTGTCCATTTTATTAACTTCAGATAATAGTATGCTGTCAATCCCCATGGGATCCTGGGATCCCATCCCAGCTGTAC CCTGGGATAAAATTTCCCATCCCAGCCCAGGTGGTCGTCGCAGCCGGGATTGCAGCCTATCCCGCGCAATCCCGGCGCCG TCGTGATTCTCCCCCTTTTTTTCACGAAACTCCTGTTTTCCTAAAATGCCCTCAAAATTCAAGCGTTGGGGTTATATTTT AAGGGTATTTTCCAGTTTTCCATATGAGAAAAAAACCCTAGAAGCCTCACACTTGACCAATTCCCTCTCACTCGACTCAT TCCCTCTCTTCTCCTCTGTTCTCCTCTCCTCTGTCATGTTTTATTTCCTCTGCTCTGTTTTCTTATTTTCTCTCCTCTGT TCTCCTCTCTCTATTCTGTTTTCTTTTATCTCCTCTCCTCTGTTCGGTTTTATCTCTTCCATGTTTTGTTCACTTCATTC ATTCTCTTTTTGTTCGAAATGTGGCTTCCCCCTCTGAACCAGCCTCTGTGCCACCTTCTGGACATCCTATTCGACCTGGA CTCTTCAAGCCTACTGCTGATAACATTGACACTGATATTGCTACTATGGAAGTATGCATATATTATGAATTTCAATTAAT ATTTATCATTGATTTAGTATGTCTATATAAATATGGTATAAATTATACAAAATATAGACAAAAATTCACTATCCCAGCCA TCCCGCTTCACGAGCTGGGAACTGGGATTGACAACATAGGATAATACTGCAGTTTAAATTTCTTGTTTGACTTACTTTGT TTCTAACCTGTTATAAATGGGCTATTATTGCAGATTTTGCTATCAAAGCATTTGAACCCTGTGTTTGCTACCGGAGCATT CGTTGTTCCAGCATCTCTTTACTTTGTTGTGAAGGTGAATCAAAATCATCTTTATATTGATTCGCAACTTATTGAGCAGT TTAATTCTACACCCAGTTTATCATTAATATGCCAGCTAAAAGGAAAAATATTCTGATGTGGGCATTTGCTTTCCTCTGAC TAATGCTCATCTGGATACTGTATTTGCCTCCTGTCAAAGAGAGTGTGATTCCAAATGAACTATCATTGTAAGTAGGGTGA TATCTGAGAGGTCTATATACCAAGTTTTGTAATGAAAATATTGAATAATTGTTCTCAACATAATGGACAAGTCAACAATA TATCTAACAGTAGTTTGTTGGTTGTAAAGCGTGGTTCTTCAGAGTTTAGTTTTTAAAACAAATAATAGAAAACATAGTGC ATTTGGTGGCCCTAGGGGACTAAAGTAATGTGCACAACCAGCATCACCAAAAAATATAGCTAGTTATAATACGTGCCAAT TATTTTCCATCTATAAGTCCCTTTTCTAGTTCACAAGGTTATCAATTATTTTGCCGCTACTTTTATATTGTTGCCTAGTT TTTGTTTTGCCGTACATAAAAATGCAATGTAGAAAAAGCAAGGTCTTTGAAGCTGCGTTTTCTTTAGGGTGATAGTATGA TTATGTTCTGATTCAAACCTGGTCTTAAGATCCACTTATTTGCTGAGCTTGTGACTAGGCAGGACAATACTTATTGAAAA TAAAGAAAATACTTCTCAAAACTTTTCACTCTTGTAAGCTGTTGCGGTAGTTACAAAGATGTTGATCACTTGATCACCAC TGACCACTTCTTATTACCAAATATTTCTCACAGAAGCACTATAGGAGGACATAAGATAACTACTTTTTAGCTATTATGAC AGATATGGTTGTTTGGTTTATTGAACAGTATGGTGGTATTTAATATTTATCTCATCTTTGTGTTTGCAGAAATTTTTAAT TAAGCCATATTACCTTAAAAGGAATAAGCAGAAGGCTTTAGAGAAGGAAGAGAAAACTTCTACTCAGGTATGGGTGATTA CTCTAAAGGAGTAGTGGCATTGGCTTCTATTTTTCTGTATCATTGTTCTAGCTTGTAAGTTGTAACTAATGCCCTCATGT TTGAACATCATCTAAAATATACATTTAATCTTCAAAATATTTTATAATGGATAGTAGGATATTAAAACTATATAAAAATG ATGATAGAATCATAAAGATAGGAAATAAATACACATAATATGCCTATTTGTATTATAATAGATTTAAGTGTAACACATTA TTTTTTAAGGGAGGGGAGTGCAGGCTTTGAAATAAGGAGGGGAGAGAAGTGTAATTTAAGTTTCTCTCAAAGGAGGGTAG TCTGTGTTTCAAAATAAGAGGGGGAGAGAAGTGTAATTTAAGTTTCTCTCAAGGGAGGGTAGTCTATGTTTCAAAATAAG AGGGGGGAGTGTAATTTAAGCTTCTCTTCGGGCAGAAGGAGAGTAATATACTCTATATTTATCATATATATGTGATTAAA CTTGCAATTAAGCCATGACTAAGCCACAAAATGATTACATGTGCAATTTGAATCCCCCAGGACACCATTAATTGCATAGT CATGCGATTAAGCGATTTTAATCGCATTTTGACTTCTATGGTGCTACCAATCATGGGTTTAATGCATTTTTTTAGAGTTG TGAATCTTTAGTAATTTTAAATGTCACACAAAGGACCTTGAGTTCCCATATATTTCATATCCAAATGTCTGCTGTCAGTC TGAATTACCTGGGGAATTATAATTCCTTTTCCTGAAATTCCTTCTTAATAGTTCTCAGTAGTGATCGTCAAAGAGTCAGA TATAGAATCAGTTCGAGGAATGAATCATGATGCTTATGGATGAGTTTGTTTCTATGCATTTTGAACTTGAAACGAAGCCG TTGTCTCCTTAATTTCCTATGGTTATATAATATAGGTTCAAGAAGCAAGGGCGGCAGCAGAGAAATCTCAGAAACTACAA CAAAATGTGGCTAATAGGAAAAGAAACAAGCAATTAGAAACAGGTGGACTGGTTATTATGAGAGCGTTATATGGGAATCA AATTTTTTTGGACAATTTGCGTTCAAGTGAAACGAGTTTCGAGTCAACTTCAGAAATCATTGATGTTACAACACCTATGA ATTTTCTAGTTAATGATTCTGGCCAACTTAAGGTATGTTTCCTTTATTTTTTTTCAATTCATGCTCTCACCAATTCACAA ATATTCTGGACAATTTTTTAATTATGAAAGTTTTAATTTTTAACAATTTTTTCTGCCTTCATATTCACATGAACAAAAAT GGTGCAGTAAATATAGGATTGAGATAAATCACAGCAAACTCCTTTGATCAGGCACAGGCATGATATGACAAAGTTGAAAT TCTGAGAAAATGATTGAACAGTAATAGAATTTATAGATAGGATGGATATTTGTTTAATTTCCTTGAGTTTTAAATCAAAG AGATTCAGGGTCCAAGAACTCGGTAAAGTAATGTCCCTATTTATGTATTTGTTGCTTAATGAGATTACTTAGTGCAGTTT TAGATTTAAAATGTCTTAGAAGTTAGAACCATTTCTCCCCTTCCACAGAGGCTCATTAATTTTACCTCTAACGTAGAAAC CCACCAAGTCTCCCAGCACACTGTTAAATAACTTTGGTATCTTGGATCAGTATTCAACACTGTAAACTCCCTTTCTAGGC CCGGGTTGCAGCAAAAACTTGCTTGAAATAAGGTCTCTGAAGTGAGAAAATTTATTCAGAATTTAGTAGTCCTGTTAGAT TTATATGTAAGCTGAAAGAAGCAACTAATTTATGTATTAAAATGTTGAGTATTGATTATTGAACCTTTACTCGTTATTAG AAATCCTGAATAATTTATCATGAATACACGGTAAAAGTTTATGCAGTTACGGTTAGGCATTTTCGTTCAACTTGTGTCCA ACCTTGTACAGCGATCTCATTTAAGCCAGTATTTGGCATACATTAACATTATATTGTTGAGGCTTTCTTGTGACTTCACA AGTTTTTGTATATGATATGAGACTTTATTATTAAATATTGAATGTCTTATTTATTGACGCAGCTTCATGAAGGTGTAAAA AAATCAGGAATCATGGGCTTTTGTGATCCATGTCCAGGAGAACGTAAACAGTTGTATGTAGAGTACGTTAATGCTGGTAA TCAACACAAGGTATTTACTGTTGCCCCTGTTACCATGTAAAAAAACTAGGATTTGACTCCTCTATAGTGAGAGACTTACT TTAAAATGTAAAGTATGCTATCATAATCGTTGATTGAGAACTCAATGGTTGAGATTGATTGAACTACATAATGTGTTACA CATGTACAAGTATGTGATCCCAACCACAACCGATGTTTTTTCAATCAACGAGTCCAATGAGTCCCTCACTTTGGAGAAGT TAAATCCAAAAAAATAATTATAAACCTCTCGTGTCGGGTTGATACTTGGGCTAATTCAAAAAATTTGAAGCAGGTTTGGG TTGGTGATTATGAAGAATTACTGATACCTCAGGGAACCCATATGATATAAAGGATCATTATACACATCAATACCATTGTT GCCTCTTTGCGGTTTTGTCTGGTTTATATTGTTGAGGTACAGCATTTTATCCGTTTAGATAGAATTAGAAGAGGTACTTT TCACAATTTTTCTGCCTGGTACCTTCACTTCTTTTTATGTTGTTATTCTCTTATTTTATTACACCCCAAAAAATGTATGA AATAAGGGCATTTTAGGATGTGACTAGTATTTTGTCTACCTGTAGGCGTTGTGATTTAATGTTTTTACATTTCAGAGCCT ACCCGTTTAATGTGACCTTAGTGTCTCGATGGATGAGTCTCATGACTGTCAACTTTGAGAATACCTTGGGAAACCAAAGA AATGTTTTTACATTTCAGTTTTCATTTAGGTTAGTGATTTGTGGTGAATACCGATACTGATTACACCAATATTGGCGCAA TAACAGAATAAAATTGAGTGCTTTTCAGTTTTCATTTCTTGTTGTTACTTCCTTTTTCTTTTACCATCAAAGGCACTGAT TATCTTTTTGTAGCTTGACATTAAAAGGCCTGATGATTGTCTCATGCGACTTCCAATTGATCCATGAATGCCCATTAGTC TTACGTTGTTTCATCAGTAGAAGGATTTCTCGCCTTGTTTATCACAATTAAACTTTTAATGTTGTGGTAACAGTTGGATA AGAGTGTAAAGAAAAATTCAGTCAACCATTTCAAAGATGTGAAAATATCAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0422900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACGAAGAGACCGAAGCGCCGGACACCCGTGAACTCTACGCACTCCTCAACTTGTCGCCGGAAGCTTCCGATGAAGA AATTCGCAAAGCCTATCGTCAATGGGCACAGGCTTATCACCCTGACAAGTACCAAGCTCCTCACATGAAGGATATTGCTA CTGTGAACTTTCAACGCGTCTGTGAAGCGTATGAGATTCTCTCGGATCCAAATAAGAGGCAAATTTATGATATCTATGGC ATGGAAGGGTTAACCTCTGGTTTGGAACTCGGTCCGACACTCGATAAAGCCCAAGAGATCAAGGCAGAGCTCGAGAGGTT GAAGAAGATGAAGGAGCGGGAAAAGATGGCGGCTCATTTCCAATCATCGGGTACAATTCTGGCAAACATGTCTTTGCCTG AATTTCTACGGGGTGATAGCCTCTTCAAAGGAATGGCTATGACAAGTGAAATTCAGTCTCAGTTATCCAAGCGTAATGCT GTTACATTAAGTGGCAATTTAGCAGTTGATGGGCGTGACGGTGGAGGGGCTGCTACTGCTGTATTTAGGCATCAACTGTC AGAAGTTTCGTCAATAGAATTTGTAGGTTCAGCTGGTTTACGTGCACTAGTTGGGGTGCAAACATCTCGTAATATATCAT TACACTCAACTGCAACAATGGGCATAGCCATGTCTTTGAAAGATGGTTCATTGAATCTTTCGAATCTATGGACCCGCCAA CTGTCAGATACAGCAAGTGGACATATACAGCTTACTTTGGGACCACAATCATCTGTAGCTGTAGGGTGGCAAAAGAAAGA TGAGAGAGGGTCAGCCTCTGGTGAAGTGAAGTTTGGCACAGGTTCTTTTGAGACATCAGCTCATTATAGTCATCGATTTT CTTCTAAATCTCTTGGCTGCATCGGGGGAAGAGTTGGGAGTTCTTCCCTTGAGATTGAAGTCGGTGGTGGGAGGAAGTTA TCCAAATTTAGCACTGTCCGTTGGATGTATGTAATAGGAATTCAGGGTATTTCCTGGAAGTTTGAACTCTATCGCGGGGG TCAGAAGTTAATATTTCCTATTTTGCTATCAAAGCATTTGAACCCTGTGTTTGCTACCGGAGCATTCGTTGTTCCAGCAT CTCTTTACTTTGTTGTGAAGAAATTTTTAATTAAGCCATATTACCTTAAAAGGAATAAGCAGAAGGCTTTAGAGAAGGAA GAGAAAACTTCTACTCAGGTTCAAGAAGCAAGGGCGGCAGCAGAGAAATCTCAGAAACTACAACAAAATGTGGCTAATAG GAAAAGAAACAAGCAATTAGAAACAGGTGGACTGGTTATTATGAGAGCGTTATATGGGAATCAAATTTTTTTGGACAATT TGCGTTCAAGTGAAACGAGTTTCGAGTCAACTTCAGAAATCATTGATGTTACAACACCTATGAATTTTCTAGTTAATGAT TCTGGCCAACTTAAGCTTCATGAAGGTGTAAAAAAATCAGGAATCATGGGCTTTTGTGATCCATGTCCAGGAGAACGTAA ACAGTTGTATGTAGAGTACGTTAATGCTGGTAATCAACACAAGGTTTGGGTTGGTGATTATGAAGAATTACTGATACCTC AGGGAACCCATATGATATAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0422900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDEETEAPDTRELYALLNLSPEASDEEIRKAYRQWAQAYHPDKYQAPHMKDIATVNFQRVCEAYEILSDPNKRQIYDIYG MEGLTSGLELGPTLDKAQEIKAELERLKKMKEREKMAAHFQSSGTILANMSLPEFLRGDSLFKGMAMTSEIQSQLSKRNA VTLSGNLAVDGRDGGGAATAVFRHQLSEVSSIEFVGSAGLRALVGVQTSRNISLHSTATMGIAMSLKDGSLNLSNLWTRQ LSDTASGHIQLTLGPQSSVAVGWQKKDERGSASGEVKFGTGSFETSAHYSHRFSSKSLGCIGGRVGSSSLEIEVGGGRKL SKFSTVRWMYVIGIQGISWKFELYRGGQKLIFPILLSKHLNPVFATGAFVVPASLYFVVKKFLIKPYYLKRNKQKALEKE EKTSTQVQEARAAAEKSQKLQQNVANRKRNKQLETGGLVIMRALYGNQIFLDNLRSSETSFESTSEIIDVTTPMNFLVND SGQLKLHEGVKKSGIMGFCDPCPGERKQLYVEYVNAGNQHKVWVGDYEELLIPQGTHMI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 538 | 538 | 1.1E-267 | ||
| Phobius | 1 | 362 | 362 | - | – | |
| Gene3D | 3 | 90 | 88 | 7.3E-24 | ||
| SUPERFAMILY | 8 | 83 | 76 | 8.24E-24 | ||
| SMART | 11 | 72 | 62 | 5.9E-22 | ||
| ProSiteProfiles | 12 | 80 | 69 | 20.19 | ||
| CDD | 12 | 69 | 58 | 2.48283E-18 | ||
| Pfam | 13 | 77 | 65 | 8.0E-21 | ||
| PRINTS | 14 | 32 | 19 | 2.4E-18 | ||
| PRINTS | 32 | 47 | 16 | 2.4E-18 | ||
| PRINTS | 52 | 72 | 21 | 2.4E-18 | ||
| ProSitePatterns | 57 | 76 | 20 | - | ||
| PRINTS | 72 | 91 | 20 | 2.4E-18 | ||
| Coils | 94 | 117 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 362 | 384 | 23 | - | – | |
| Phobius | 363 | 383 | 21 | - | – | |
| Phobius | 384 | 539 | 156 | - | – | |
| Pfam | 386 | 533 | 148 | 2.8E-40 | ||
| Coils | 397 | 430 | 34 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0422900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…