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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0030400 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0030400.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | TBC1 domain family member; TAIR: AT2G43490.4 Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q8BPQ7|SGSM1_MOUSE Small G protein signaling modulator 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0GZ87|A0A0R0GZ87_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0030400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:3283529..3297114) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAACCGTTAAAATGTGTTTAAGACATCATAATTATCCTAATAGCCTTTGGTAAGAGTCATAAGCCCTCATCAAAACCA CCATTAAATACCACAAAGAAACGGTATTCCCCCTTTCAGACTCACCAAATGGCCACCATGCCACGACGGAGCTCCTCCTC CTCCTCCTCCTCCGCCACCAAAACCTGAAACTCCTCTCACAGATCCTCTCTCTCTCGCTACCTAACCCTAACCCTAACCC TTGCTTCATTCTTCTTACCCTTTCGATTCTCTCAAATCCTCTTCTTCTATTCGCATTGCATTGCATTTTTTGCATTGCGT TTTTGGTTTGATTCCCTTTTCTTTACCCTAATTACCTTCCATTTCAGAACCTTCCTTCATTTTTCCATTTCTCGAATAGT TTGCATTTTTTCTGCGATCGAAGCAGAGATGATCTGTTTTCGGTTGAGTTTTGGAATTAGAAATGGAATGGAATGGGATG AAGCAAGCATCATGAAATTTTAGGGTTTTTGAACTGTGTTTGTGTGTGTTTGGTTGTTGACATTGGTGGTGGTGTTTTGG AGAGCTTGGTGTTTGTGTGTGTGTGTGAGAGTCTGATGAATTGTGGTGGCGAGGAAGAGAAGCAATGGAGTTGTGGAAAA GCTGGGAGTGTGAATTTCCGAAAAGTGAGTTCGATTGTTCGCGACATTGGGGATCCTTGCCTCTCTCAGTCTCCTGTAAA GGTTGTTGTAACTGTAAGATAGACTACAAACTCTTCTGGGTTTTATTGAATTCATTTGCTTTGCTTTGCTGTGCTGTGCT TGGATTCACTTCTATGAACTGAGGAGGTGATGTTGCTTAACAAGGAAAAACAAAGTATTGTTTATGAATTGACTTGTTGA ATGATCTTTCATTGTTTATTTTTTATGGAGCAGGTGAACAGAATGCTTAAGCCAGACAAGTGGCAAGCCTTGTCTGATAG 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GATGATATGATAAAGGCAAGTGCATTGATCTTTTGTTTTTATCGAGTAATTAATTACTATTATGAAAGTCACAATTGTTA TACTCCTATTACATTGTTTTTGCTTTTTATGTTTATATTGTCTGGTGTTGAGTACCTCCTTGGTCTGGATTATGTTTTGA TCTGGAAATCTGAAGTTGGTACTTGGTAGTGTATAAGCCTTTTTTTCAGAAGTTGTATTCTGCCAAGCACTTTTTATCTT CCTGATGTTTTCCCACAATCACCCCTGTAATAACTGCATATCTTGGTGTTATTGTTTAATGAGGTTTGATGTACTCTTCG TCATAGTAGTCAATAGCGGGAAATAGCGGCGCTATAGCGGCGTAGCGGAGCGGAGCGGCTCCCTGCCGCTATTGAGATGA AATAGCGGCCAACTTCACAATAGCGGTCGTAGCGGCGCGAATAGCGACCAAAATAGCGGCAGATCGCGGCCAATAGCGGG AAATAGCGACGCTATATGAACGAAGGAGAAAATGACTCACGCCCCTTGGTTTTAAATCGTTACGAAACCTTTTTATGGGC ATGTTAGGACTTCTCAGGGCCATTATAGGTCAAAATTGAAAGAATTAAGCTTCATTCTTCATTCAGATTTGCAAATTCGA CTTCTTTACCTTGCTTTTGAGAAGTTATTAGTTGTGTGTTATTGTTCAAGACTTATGATTTTTATTTCTATTATGAATGT TATGAATTTTAGGCAATATTTGACATTGTTTGCTATTTATATGTATATAGTATTAAACTATTAATGATATAAAATTACAT AAAAAAATTCAGAATAGCGGCCACCCCGCTATGCGCTATCACGCGCCGCTATCCGGGATTGACTACTATGCTCTTCGTAG GAAGGTGTAGAAATTTATGCATATTAGAGTTTATAACTTTCTTTTAATAATAACATTAATCCTTTTGTCTCAAGTAGGTT CTTACATTTACCATAATGCTGATGCATGAGCATTGCATTAACTTAAACCTGGGTGTAGTTTTACTATTTGTCTGACTAAA ACCCTATTGTTCATTTTTTTTTCTCTTTGCATGTTCTTTGCTTTTGGTAACATTTAATTTATCTTCTTTTGCCTTCCAGA ATTGTAAGTCCTTCTTTAGTGGTTTTCCTGAATCATTGCTTGAAACCAATTTCAGCATATGCTTAATTTGATCTGTTTTC ACCTTTGTTTTTCCAAATTTAACTTCACTAAGGAGTTCTTTCAATTCTTAATCCAGAAAAGAGAGAAAAGAAATCAACTG ATAGATTATTGTGCGTCTTCTTCTGACTTTAGATTCCAAATTTACATCTTGCAGATGTTCAATGACAAGATGTTGAAGAT CAATGTAAAAAGGTGCATAAGAACTGCAATCAAACTACGAAAGAAATATTTAAACAAGGTAGGTCCTAAATTAGTTATTT TCCTCCAGTTGTCTCTTCCAAAAGAGGGCACTTTGCAAGCTTTTTGCCTATTTTCTTGGTGAATGTTCAATATCCTTGTT TTAGTGTTGGAATGATCAAAGAAGTTGTGTTGGATTACTTCATCTCATTCTGATGAACTACGATACTTGTTTTATTTAAC TTTTGATGTTTCAACATTCATGCAAGAGAAGATTTAGATTTGAATCAGTTGCTTTCTAGTGTTTTCTATACTTATGTCAA TGCATTTTGAATGATCATTTCTCTAAATACATGACTTGCTTTTATTTATATTTCTATGATTTTGGTGGTGAAATTAAAGT CTCATATCTTGACAGGTAATAAAGAAAAAGAACCGGGTTTCAGAGAAAGAAGACTAGTGTAATATCTTTGCCAATTACTC TCGAGGCAGAAGCACCAAATGGCATTGAGTATCACGTATGGCTCTGCTTTTCCAAATCGGACTATGGTGTTAGATTTTTT TTAATTACTTTTCCACTTTGGATGGGAGACTTTCTAAAGTGTTTTTGCTTTTGGAGATTCATCCAGCTGTTGTACCTCCA TAGCCTTCATTTCTCTTTTTTTATGAGGTAAAACTCACTTTGTTCTGCCTTACGGCCTTACCTTGTTTGGTTCCTTAAGT TTTGATGCTTTCACATAGATTCCTAGATGGTCTTTCCCAAAGACATTTTTTGTAGTTTGTTGGTCTCAAAACTCAGTTCC GGTTCTTGGAATTTTGATGCTAGAATTATTCATGGAATAAACTGTGCTGTACAAGCCTACAAGGCTCTAGCACTAAAAGT AATGTGAATAACTATAAGGAGTAAATGAAGAAGCTCATAGGCACATATGTGATTGAAGGCAACATATACGTAATTGAAAT ATGTAATTGATCAGCACCACACAATATCAGTTTAACAATTCACTAGCTTCAGCAGCAGTGCTGTTGGTATTTCAGAAATA ATATCAATTGATTGAAAATAGGAATCTTCTTTAGAAATTTGATTATACTATTTTAGATTATTTTTTTGATGGCTAAAGTG TTGAAATCAACTGACTTGGGATTTAATACTGCATGTCTTATTATTTTTAATTTTCATGCTTAGCTTTTTGTTGTGTAATC CAGGAGTTTACCCTTTGAGGAATGTGTTTGTTTTCCTGAATATCATGTTAAAATATTTACTTCCCTTTTGAGTATTTATT TTTTCCCATTGCTTATGCTGTATTCTCTCTTTTCCTCCTCTTGATGCCAGTGAAAAGATTCACACGGGAACTTTTCATCA CTCTGGTTGCTCCGAGGTCAAATCAATCTGCAGTCTTGGACACTTGGCACAGGTTATGTAAACGTATTTTCTTTCTTTGT ACTTGTGTTTGAGCTTATATTGCTGGAGAAAATTGTACGCTAATCTCTTACTGCTTAGAGGAACTGGAGTTTGGAAAAAG TACACGCACTAGAAGAAAATCAGAAATAGGTGGTGGGTATGGGGGAGGGGAATATTGTAGCATATGGAAACGTATAGACT AAACTAAAGTTAATTTTTGTTGTGATATTAGTTAGCAAAAGAAATGATATATTATGGTTCATACATGCTACAACATTTTT TACTTGAATTGCTGAAACTCTTTTTTGAGGTCGAATTGCTTAAACTTACAACCGACAAAGTAGGGACTGTTCACGTCCTT ATTCATGTATTATTTTTCACCTTCAGAATGCAAACGATTCTGTTTAAACTTGGCATATCTGAAACCACACTAAACATTTA ACATCTCCCACTACTAATGTGGGTTGCCTTTATTTATTTATAAATCGACAATTCTGGCGTATCTGTCCTTGGTTTCCTGT TAAAACTTTGATATTCCCCATGTTGTACATTGAGACAGCAAAAGATTTCTTAAAATCTTGAAGCCCAGCAGCAAATTCCT CGGTGATCTCCTTAGTATCATCACCATTCAGTAATTGTTGATCAATTCCCAGAACAGCTTCATGGTTTAGGATCCTTTTG TAGTATGATTCTGTGAACTTGTAACTTGATCCAGAATCTGGGTTCAGATATACCAGTGGGTCACTTTGCCCCTTCTTTCT TGGCGGACAAAGCTTTCTCATCGTGTCTAGAAAAGCAGCATTCATGCTAGGGTCTGAGCTTCCAGTACCATTGTAATTAT ACAGCCTATCAGTAATGTAGCTACAATGTGTTCTTCCAATTGTGTGTGCTCCTGTTTTGATATGAAACAAACACATTCAT TTAGAAAAAAATAGTAAGTAATAATTTGTACTGCTGGATTTTAGGCCTGTCTTACCCAAGAGTGTTCCCATATCTAGGAC ATTCAAGCCCCTCGATTTGAAGTATGCTAGAGCTTCCTGCCATGAGACGGATGGTGATGGAATGTCTACTGATGCAGCAT CTGATCGCATTCCATCTTTTCTTCCGGTGAAAACTGGATAACCTGGTCCACCTGCCTGTTGACACAAATCCTCAAATTGG TTACAAGATCATATAGAGTTATAGACATACTAGTTTGGTGTGGAAGGAGTTGAAAGTAGGACTAGTTTGTTTCAAGATAT AAGGGTGTGCTGAAAAGTGTACCAGTTGAACAGCATCTCTGGTAGCCAGTTGGAGTATATCAGCACAGGAGACAACGCCA GGGCACTGTCTTTCCACGAAAGTTTTTATATTGTCAATCAGTACAAATGCTCCAAGCCCCCGGTTTTGCGGTGCTTTTTT CTCTGTATTTGGTCCTTCGTCCAGCAGAATTGATGCGTCACAGCCCTAGCCACAGAATATTGGTGATTTAGGTTTTGAAG TGGAAAAAAGAACTTGAGCATTTGCAACATGCTGAAAGCTAAGTGCATATGGAAAACCCTTCTATAGTTGATTATGATGT TAGAATAAATTCTGGGGAGAAACTTAGATGAGTAGTTTATGGATTTTAAAATTGATTCTGATAAAAGAGAAGCTAATTCA AATATACTGTAAGTAAATTAGATTGAACAGCAATAGTTGGTTTTTGGCTGCATGTTTCTGGGTGCAACATGGATATATTT CAAGGGTGTTGTCAAGGGTGTGGGCTACTTTATGCAATCTCTTATTTATAACCTACCTTCTGTCTCAATTGTTAATTTCC TTTTGTTTGCTGAAAAAGTTGAAAAGAGGGGAGAGATGAAAAATAAGAGTAAAGGGTAAGACAAATAAGGTACTTACTGT GATGAAACAATCTGAATATACCAAGCGGAGGAGCTTTGCTGTGATGCTTTTGTCAAATTTCCAAAACAGCTTTACTTGGT TCCTCACATACAACTCAGCATCGCGGCATATGTTGTGGGTCTTATAGTAATGCCACTCCAACTTTGGCCGTGGAGGTGTA GCCGCCGCCACAGGACTCGAGCTCAGCGCTGCAAAAGCAACAACTAGTAGGAAAGCCACACACATACTTGACCTCATTTT GGGTCACTACTCACTACCAAGTCTCTCTTGCTATTTTGTATAACACTAAGCTCGATTCTTAGATGTAGCCACTGCCTTGC TGCTTATATAGCGTACACTGTCCTAGTGGCATAACCGACCAAGTCATATAGAATAGAAAAATAGAGAAATATAACTCATA GAATAATGGGTTGTGTGCTCTAATTTTCCATCTACCTAGTCCAAGCATCACGGCACCGTGTGATGAAATATTAAGGCATG TAGCTGTTCACATGCACCAAGGAGTTCTGAGCATACTTCTGAAGCCATATTGATGCTACGACGTGGGTAGCAAGCAATGT GCATTCCATGTGACTTCAACTTGGATTTGGGGCCTCATTCTCTAATCACGAGATTTATTCTTTTTATGTTGCAGTGTTTC CTATAAATCGAGGAAATTATGGCTTTTAAACCATATGTGATTAACTTATTATTGATTAATTTATGGTATGGCATGTGCCA TCTGGGTCTCACTTGATGGCTGGCCTGGATGGATACTGTTCAATTCTTTCCTTTTTGTTTGAGTCTGCCCAAACGGCCAC TCAGTCCATCATCATTCTGGTTGGCCTAAAAAACTCCCAACGAAGGGAACGTCAAACTGGTTAACTAGTACCACCAAAGC AAAACCTTCACTTCTCAAGCCAACTAGCTGAACAAAGACTAAGTAGTTAAAGTTAATCATTCAATATATAAAGCTAACAG CTTGGAAGCGGCTACACAATAACCTGACAGAAGTTAAACATTCTTACTACTGCTCAATTTAATCTCTATAAATTTAAGTT TGGCCAACACTGTAAGTAAAACATTGATATAACTGCTTTCACTTTGCTCTTCTAGACTTGGAGAATCTTTTTGATCCTTT GTTGACTCGAGCGTTAGAGTGTCTTGTGTAGGGATTTGAATTTGCTGCAGTTGACTGCACTATAGTCACAAATGCAGTCC GCTTGATTAAGATAAGATGGATCAAGTTTTTAACATGTATTTAAATCCTATTCACTGAGATTAAATGTTAATCGAACCGA TCGGAATCCAAGGACTCATATTGAGTGGTTGTATGATTGTGTCAAAAGCTGACTGCAGTGAATTCAAATCCCTTTAACGG GTATTTCCCAATCATGGTCTCTTTCTGCACTACAGTGCCCTCAACCGCACTCACTATCATGCACCACCACACAGGGAGAA TCTTTCTAAAAGAACACTTTTATTTTCTAGGCTTAATACATTAGAAGACCCCTGTAATTGTAAAGGGAATCAAATCCAGA GCCTAGAAAATTTTTGCATCAAATTGGGTCCCTAAATTTTTTTTTAATTCAATTAAGGACAAAGTGTGTTAAACGCTGAC GTGTCTTGATTTTTTCCCTATCACCTTATCCACGTGGATTTTAATTTTTTTTAAATACAAAATAATGCCACATGTTATGA TTAGAAGGAAATCAATATTAATCCCTAATTAACTAATTTCAGCTCTAATTAACCAATCTCATCAATTAAGCCTCAAATAC CCAATTTGAACCCTAATTTTGCTGCAACTTCTGTTCTGAATCTCCTCCCTCCTCAACAGAAGCAACTCCTCACTGAACTC GTCATCCTCCAAATCCCATTCAACACATCTCTTCACCCTTCCCACAAACTCCATTTCTTCAACTGGTGTCGCCCCCCTCC CCTCTTTCCCACAACCTAAACATCACCCTTTTTCTTCTAAAAAAATCCACACAGCAGCATAAGATGGGAAAGAAACAGAG CAAGGAAAACCCATATCGGGAGGGAATGTGCGAGAAAGAGAGGGATAGAGAACGACGCTCGCGTGGCAGAGCTCTGGTGG CGTGTGGTGGCTAGAGGTTGAACAACGTTCGCTGCGGAGGTGACAAACCTAGATCGAGGATGTGAAATTGAGGAAACTAA CATCGGTTGGAGGTTGAGGGGTTTGCAAGGCTCGGTGGGGGTGGGTTTCTGGGTGGTGGTGGCTCGGTGGCTGGGTTTCT GAATGGTGGCGGCCGAGTTTCTCGATTGATGTTGTAGAAGAAGTGAAATCAGTCTCGGTGACTTGTTGGAATTGAGATTC AGATCTGGATATGGTTTGAAGTGGGTGTTGGGTATTTTTTTTTCTTGATAAAGGCTGTGTTTTTTCTGGGTATTGTTGGG TTCCTAGGTTGTTTGATTTTTTAGTGTTTTTTTCCTGGGTTGTTAGTTTCATCTTGGTTTGATTTTTTAAGTTTGATTTT CTTGGTTGTTGAAGCATGATATAAGAAGGGGAAAAAGGACGCAGTAGATCAAACTTTGTTTTTTCTGTTGAGAAGAGTAG GGGTGGTGGGTCACAGTTTTTTCGCCTTGTTCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCTTGGTTCTGCAAATTCATGTTTAGTTT CTGCATAATTTTTTCTGGTTTGTAACACTGGGCAGTAGGGATTGTTTTGAGGTTGGGTAGTCTAGGTGGCCTTTTCTTCT GTCTTTTGAGTTTTGTTTTTTTTTCCCTTTTCTCTTGTATCATTTAGGTTGAAAAAGGAGAATAGTTTATAAGTTTCAGT TGTTCATTCACGGAGATAAAAGAGAAATGTGGTGTGAGGGTGAAGAACATTGAACAATTGAAGAACATTCAAGAAATAAT TTTTTTTCTGATTATTTAATTGAGTTGGAATTAAAAATAATTTTTTATTATTTTTGTAATTAAAAAATAATAATAAAAGT CACGTGGAATTGATGACTGGGATAAAATTGTCTGCTGGTACACTTTGGCCTTAATTGAATTAAAAAAAAAATTTATAGGG ACCCAATTTGATGCAAAAAATTTCTAGGCCCTGGATTTAATTCCCTTTACAATTACAGGGGCATTCTGATGTATTAAACC TATTTTCTAATCCTGAAAGGCTGAAACCACGAGTTCATGCAACCGAATAATGTACCAATGATCACG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0030400.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAATTGTGGTGGCGAGGAAGAGAAGCAATGGAGTTGTGGAAAAGCTGGGAGTGTGAATTTCCGAAAAGTGAGTTCGAT TGTTCGCGACATTGGGGATCCTTGCCTCTCTCAGTCTCCTGTAAAGGTTGTTGTAACTGTGAACAGAATGCTTAAGCCAG ACAAGTGGCAAGCCTTGTCTGATAGTGAAGGAAAGGTGCTTGGTTTCCGGAAGGCGCTGAAATTGATTGTGTTAGGGGGT GTAGATCCTTCAATAAGACCTGAAGTTTGGGAGTTTTTACTAGGTTGCTACGCACTGAGCAGCACTGCTGAGTATCGAAG AAGGTTGAGAGCAGCTAGGAGGGAGCATTATAGTGACCTGGTTAAGCAATGTCAAACAATGCATTCAAGTGTAGGAACTG GTTCGTTGGCATATGTTGTTGGATCCAAAGTTATGGATATGAGAACTTCATCTAAACTTGAACGGGAAATGAAAGAGGCA GCAAAAGAAGGCCATCATGAAAGCTCCAATGGTTCGGTTGACCTAGCCAGTTTGAGAGCAAGCACAGATGGTGCAACTTA TGATTCTTATGGTCAACAAAACTGCAGTTCCCCAAATTTAGGGAGAGAAACAGATGGATCACATTGTGTGATTGATAGTC CTTTTGATTTTCCTGCTTTACCTGTGACCAATCTGTTTGAAAAGAGTGGTAAAGATAACAACTCAAGCACAGAGCATGGC AGTAAACTGTCTGCACGACATAGATTAAGATTTGATGATGAAATGCATACCTTTCAAATCAATGACAATGTAGACTTAAT TGGTGAATCAAATGGCCAACAACCACGGGGTATCTTGCATTCCACGAACTCTGAAATTGAAGTTGCTTCACCTGATGAGG ATGAACCAGAATTCCCATCGGACAATGCTGTTTATGAAGCTCAGATGGTAAATCAACTAAAAATATCAGATGTACCCCAG CCAGCAAGGATAAGTGCCGCAATGTCTCAAGAATGGCCTGTCGGTGAAGATAGAGTATCAGAATGGCTTTGGACCTTGCA CAGGATAGTCGTTGATGTTGTGAGGACGGATAGTCATCTTGACTTCTATGAGGATACCAGAAATTTAGCTAGAATGTCGG ATATTCTTGCTGTCTATGCATGGGTTGATCCTGCAACGGGGTATTGTCAAGGTATGAGCGATTTGCTGTCTCCCTTTGTT GTAATCTTTGAGGATAATGCAGATGCTTTTTGGTGTTTTGAGATGCTTTTAAGGAGAATGAGAGAAAATTTTCAAATGGA AGGCCCAACTAGGGTGATGAAACAGTTGCGAGAATTATGGCATATTCTTGAACTGGCAGACAAAGAAATGTTCGCACACC TGTCAAAAATTGGTGCCGAGAGCCTTCATTTTGCATTTCGCATGTTGCTTGTTCTGTTCCGGAGAGAGTTATCTTTTAAC GAGGCTCTTTCAATGTGGGAGATGATGTGGGCAGCTGACTTTGATGAATCCTTGGCATATGATTTAGAAGTAAATTGTCT GGAAGCGTTGGACATACATCTTCCTAGAGACTCAAGCAATGATTTAAGAGAAGAAGTTGCAGATTCTGATGATGGTAGTG TGAAGAGTGGTTCACAATCAAATCATAATGAAAATGACAATGACAATACAAAAGCCAGCCAACAGTCAAATCATGAGAAC ACTGATGTCTCTGTATGGGATGCCAAATTGAAGTCGCTATCATCTTATCCCTTTTGTGGCTTGGCAAGGAATATGTGGCC AAGAAATGGTAGAGTTCAAATGAGCACTATGTCCTCGTTAACAAGGAAAGAAAAGGATGAGCTAGCCATATTCTGTGTCG CAGCAATTCTTGTTTTAAACCGTCAGAAAGTCATTCGAGAAACCCACTCCTTTGATGATATGATAAAGATGTTCAATGAC AAGATGTTGAAGATCAATGTAAAAAGGTGCATAAGAACTGCAATCAAACTACGAAAGAAATATTTAAACAAGGTAATAAA GAAAAAGAACCGGGTTTCAGAGAAAGAAGACTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0030400.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MNCGGEEEKQWSCGKAGSVNFRKVSSIVRDIGDPCLSQSPVKVVVTVNRMLKPDKWQALSDSEGKVLGFRKALKLIVLGG VDPSIRPEVWEFLLGCYALSSTAEYRRRLRAARREHYSDLVKQCQTMHSSVGTGSLAYVVGSKVMDMRTSSKLEREMKEA AKEGHHESSNGSVDLASLRASTDGATYDSYGQQNCSSPNLGRETDGSHCVIDSPFDFPALPVTNLFEKSGKDNNSSTEHG SKLSARHRLRFDDEMHTFQINDNVDLIGESNGQQPRGILHSTNSEIEVASPDEDEPEFPSDNAVYEAQMVNQLKISDVPQ PARISAAMSQEWPVGEDRVSEWLWTLHRIVVDVVRTDSHLDFYEDTRNLARMSDILAVYAWVDPATGYCQGMSDLLSPFV VIFEDNADAFWCFEMLLRRMRENFQMEGPTRVMKQLRELWHILELADKEMFAHLSKIGAESLHFAFRMLLVLFRRELSFN EALSMWEMMWAADFDESLAYDLEVNCLEALDIHLPRDSSNDLREEVADSDDGSVKSGSQSNHNENDNDNTKASQQSNHEN TDVSVWDAKLKSLSSYPFCGLARNMWPRNGRVQMSTMSSLTRKEKDELAIFCVAAILVLNRQKVIRETHSFDDMIKMFND KMLKINVKRCIRTAIKLRKKYLNKVIKKKNRVSEKED
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 19 | 666 | 648 | 3.5E-207 | – | |
| PANTHER | 19 | 666 | 648 | 3.5E-207 | – | |
| SUPERFAMILY | 56 | 453 | 398 | 3.4E-42 | ||
| SMART | 77 | 518 | 442 | 1.0E-25 | ||
| ProSiteProfiles | 80 | 493 | 414 | 31.403 | ||
| Gene3D | 315 | 418 | 104 | 1.4E-11 | – | |
| Pfam | 345 | 491 | 147 | 9.5E-32 | ||
| SUPERFAMILY | 430 | 661 | 232 | 2.88E-26 | ||
| MobiDBLite | 521 | 559 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 532 | 559 | 28 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0030400.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…