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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0039400 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0039400.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Trehalose-6-phosphate synthase; TAIR: AT1G78580.1 trehalose-6-phosphate synthase; Swiss-Prot: sp|Q9SYM4|TPS1_ARATH Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP]-forming] 1; TrEMBL-Plants: tr|K7MCQ5|K7MCQ5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0039400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:4226128..4248246) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTTGGTGTCACCTGCATGGCTACTATCCTCAAACACCCTATGATGCTTACACGGGGATTTCCACTTCCTATTTTTCTTC TCTTCCAATCCAAAGTGATTCTCTGCCATTTCCCACTCACTCCCCTAATACTCCAATCCTATATAACCCCCCCACTCTCA CTCCAACCCAGCTAGCTGTCCTAAAACACTTCCCAAAACAGAACCTGAAAGGGCCCCAGACAACGCTGTTTCTCGCTTCA ACTCCCCGCTAGTTTTCGAGGTGATGATTCTTAATTCACCTTTGAATTTGTTCTTCTTCTTCTTCCTCCACCACCTCCAC CACTTGATTTAAACCTTTAGAATCAGATTCAGATTCACTTTGCTATCAATTATTAAAATCTTTTACGCTGTCCGTTTGTT CTTTGAAATGTTGTTCGATTCTTCTCTCAATTTCACTTCTCAAAGCTCTGCTTGTTTTGGAAATTTTGAATGAACTTCTC CAAGTAAATTTCACTCGCGCATCTTGCTGTGAATCTGTGAATCCTGCTGGTAATTCTACATCAATCTATTTTCTTTGATT TTCTGCCTATTCCTAAATTTTAATTAATTTTTTAAACATTTTTTTTTGGAATTTTGTTTGTTTATCTAAGATCTTACAAA AATGATGCAGGTGTGATTAGTTAAAGTCTTAACTTTTTCAATATTGATAGTATGCCGGGAAACAAGTACAACGGCATCCC GGACGATCACTTTCCGCCGGGGCGGTTAGAGCGCCTCATGAGAGATCGGGAATTGCGGGAATTGCGAAAAAGAGGAGTTC ATGATTCCGTAACGGAGAACGGCGGTGGCGGCGGTGAAGGGGTTGAGAAGGAGTTAAGGAAGGAAGAGGATAATAATGAA AATAATAATAGTGATAATAATGGTGTGGTTGAAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAGAGGCAAGAAGGGAAGGG 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GTTAGTTGTTCACACAGTACAGGTGCCTTTATGATCAAGTGGTCAAGATTTTATTTTTGCTGCCTCTTTTCTTCCAAATA AAAGTTAAATTTACTCACAGGTAGTGTAGGCTGTAGATTGTCCATGCTTCAAGTCAAAAGGCCCTTGTTTCATGGATTGC TTAAACTTTTAGGTTTTAAAATGTTTTGAATGACTGATAGGTGTCAATGTTCCATCTTTTAAAAAAAGAACGTTTCATTT TTTTTTTCTTTCTGGATCATTGATTATAGTTCCAATATAAGTTTATAGGAAGCCTTGATCTATGGCATGGATAATTTAAT TTTTACATATTTCTTTCATGTGATTAGATATGTATAATGTTGATCTGAGTCTGACACTTGATATTTGGCATGCTTCTTGT AGTTTGCTGGTGCAGCACAGTCTCTTGGTGCTGGAGCAATTCTTGTCAACCCTTGGAATGTTACAGAAGTTGCTACTGCA ATTGGTCGGGCTTTGAACATGACACCTGCAGAAAGAGAAAAGAGACACAAGCATAATTATGTTCATGTAATATCCCACAC TGCTCAAGAATGGGCAGGAACTTTTGTAAGGTATGTGTATTAGTATTTAGATTTTGTTAACATGTTCCATGAAAGTAATT GTTAGTTGGTGGTTGTTCATAAATCTATTGGCAGCTGTTTGCTTGTTCTTAATTGGTCGTATATGAAGGCTTATGTTGTT TTTTTAGGAATAGTAGAAAGGATGTGTAATTGTCAGTGGAAGAATATATCTAAAGCTTTGACTTTCGGGAATGAACCACG TTACCTTATGAATCTTCAACTATTTGCAGTGAACTAAATGATACTGTTATTGAGGCACAACTAAGGACAAGACAAGTTCC GCCCCGGCTACCAACCAAGACAGCAATTGAACGTTTTCTGCAGTCAACTAATAGACTGCTCATTTTGGTACGGTGTCTCA AAATGTAACTTGTGACTTCTGTGAATGTCTTCTTGTTTCCTCCTTCTCTTTTACTCCTCACTTGAGTGTCTCATACTAGA TTCTGCTTTCTTCATTTCATGGACATATACAGTTAAATAACATGTTAAACTGTGCAAGAGTATGGTATTTTATTTGGATG CAAAGTGCCAGATTGGCATTGAACTTAAAATTAGTGTTTAGGTGGAAAAGGAGGAAAGTGAGAAATTCAGCTGTCAATAA TATTAGATTGTTTCGAGGTATCTGTGATACAAAATATTAATCCCATAGTTCTATTAAATATATAATTAAGTGAAATACTA GTATAATGCTACATGATCATAAGTACTCTGATACGATATCAAGAACCTAACTATCCAAAAAAGTTCAGTTATTAGATTAG GTGAAGGCTCATGAATGGTTTCCATCTAAATGCCGTATGTTGAGTGTGTGATTGTGTTGGATTTACAGTTGTCTCAAGAG TCAAGACTTTCTCACAGTGATGCTTAATTCAGAAGTTCATTTTTCCATTATTTTGCAACCCCCTCCATGGAATAATTGGA TATGTTTGATTGTTTTAAAATGATTCACTAACCATAAATCATCACCTAACGTCTATTATGGATTTTAGTATTTAACATTT CTCTGACATTGGCTACACACTCTGCAGGGATTCAGTGGAACTTTAACTGAACCAGTCGAGAAAACAGGTGATCAGATTAA AGAAATGGAACTTAAGGTGCACCCTGAACTGAGACAACCCTTGATGGCGCTTTGCAGTGATCCAAATACCACAGTGGTTG TGCTCAGTGGAAGTGGCAGAAAAGTCCTGGATGATGTAATTCTTAGCACATTACTTTCTTTCCCAGTGAACTATAACATA AATCCACTATTAACATATTCCTATACAGAACTTCAAAGAATATGACATGTGGTTGGCTGCGGAGAACGGGATGTTTTTAC AACCTTCAAAAGGTGAATGGATGACAACTATGCCAGAGCATCTGAATATGGAATGGGTTGACAGCGTAAAGGTGCTCATT TTGAAGTTTTAAGGGCTTGTTTGATTTCCTTATCTGTTTTCTTAATCTACAAACTATTTTCTTAAACAATGTTGAATTTT TTTCTGAAGAAGAAACGAAAAAAAAAATAGTTTGAGAGATATGTTTTTCAAAACTGCAAGACATGTGACTTGAAAACTAA AAACATGTATTCCTTCCTTCATGTTATTGACATTCATTGCTGATCCTGCATTTCAGCATGTTCTTGAGTACTTCACAGAA AGAACACCTCGGTCACATTTCGATTATGAAGAAAGGGAAACTTCACTTGTATGGAATTACAAATATGCAGGTGCTTGAAT TATTCTCACCGAAAATTTATTTCTGTATTGTTTTCCAGCTTTCTTTCCTGTTACTGATCTTATAATCTCAACCAGATGTT GAGTTTGGAAAACTTCAAGCAAGGGACATGCTGCAGCATCTCTGGACAGGTCCGATTTCTAATGCTTCAGTTGAAGTTGT TCAAGGGAGCCGATCGGTTGAGGTTCGAGCTGTTGGTGTTACAAAGGTAACCTATAGTTCATAACAATGGACCTCTCTTT GTTATATTTTCACATGAACTTTTTCATACAGGTATAATGTCTAATCTAAATTCTTTTTGTAATCAGGGAGCAGCTATTGA CCGCATCCTGGGGGAGATAGTCCACAGTAAATCCATGACATCGCCGATCGATTATGTTCTTTGTATAGGACATTTTCTGG GGAAGGTGAATTGAATGTTCATTTATTAATGTTATGTTCTGAAAATTTACTTTTTTTTATATTTGTTTATCTCATTTTTT TATATCCATTTTCAGTTTGTTGTAAATTTTTTCCAATAATAGCAATACTGTCTAGCCTCTGCTTGCTCATCACATTATTG TGCTACATGCTGCAAGAACTTTTATGTGTAAAAACAAAAAAGCTGAAGCCGAAAATGTGAATGTTATAGGATGAAATTCA AAGAAGCTTTTAATAAACTAGAAAGAGAAACTTCCGAGATGAACTTAACATTATTGATTGTAACAGGATGAAGACATTTA CTCCTTTTTTGAGCCGGATCTTCCTTCCATCGGTGTTAGCCTTCCCCGAAGTAAGGTATCAACAACAGATGCTGTTAAGT TTCCTGTTGATAGGAGACAGTCTTTGAAGACCCCGGCTAGTAAAAATGGAGCAAAGGCTTCACAAAACAAGGCACTGAGG GCAGTGACAAACTCTGAGAAGAAAGCAAACAACCATGTCTGCAGTGCGCCACGACGCCCCGCGCCACCTGAAAAGACATC ATGGAACGTCCTTGATCTAAAGAAAGAGAATTATTTCTCATGTGCTGTTGGAAGACATAGAACAAATGCTCGGTACACTC TTGGTTCACCAGATGATGTGGTTGGTTTTCTGATGGAATTAGCGGATGCATCATTGTACTCTTCTCCACCAAGTTAAAAC ACCCCCACCCCAAGATTGTTCTAACTTCTTCTACCCCTGGAAATGGGGATATAACAATAGTTGGTCTCTAATTTAAAGAT AAAGTATATAGGCCTTAGAGTTTCAACAATAATTATTATTGTATATTAGTACTTCCTTCAGTTTTGTTTACTCTAATCTA TGTTATGCTCTAGGGTGTTGTCATTCACCATTTTTCTAGCAAATGCTAGCTTCATGCTCATAAGGATAAACTTTTCAACA AACTAGACGATCCTCTGCAGTTTGGTTTCCAACTGCAAAGATATTAGCCTTAGATTTTTATTTTTAAGTGCAATAAAATG TATGTATGAGTAGGTTAAACATACGATAGTCAACCTCTTATCAATCGGTTTTGGGGAAATTCGTGGGAAACAAAACTATT ATTTAATTTTAGCTTACATATCCCCATATGCTTAAGGTC
CDS sequence (LotjaGi3g1v0039400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCGGGAAACAAGTACAACGGCATCCCGGACGATCACTTTCCGCCGGGGCGGTTAGAGCGCCTCATGAGAGATCGGGA ATTGCGGGAATTGCGAAAAAGAGGAGTTCATGATTCCGTAACGGAGAACGGCGGTGGCGGCGGTGAAGGGGTTGAGAAGG AGTTAAGGAAGGAAGAGGATAATAATGAAAATAATAATAGTGATAATAATGGTGTGGTTGAAGGTGGTGGTGGTGGTGGT GGTGGTGGTGAGAGGCAAGAAGGGAAGGGATATAGGCAGAGGCTATTGGTGGTGGCGAACAGGTTGCCAGTGTCAGCGGT TAGGAAAGGTGAGGATTCGTGGTCTCTCGAGATCAGTGCTGGTGGCCTCGTCAGCGCTCTGTTAGGTGTAAAGGAGTTTG AGGCAAGGTGGATAGGTTGGGCCGGTGTCAATGTACCAGATGAAATTGGACAGAAGGCACTTACTAAAGCATTGGCTGAA AAGAGGTGTATCCCAGTATTTCTTGATGAAGAAATTGTTCATCAATATTACAATGGCTACTGCAACAACATCCTGTGGCC CCTTTTCCATTACCTTGGGCTTCCACAAGAAGATCGTCTTGCCACCACGCGTAGTTTTCAGTCTCAATTTGCAGCATATG AGAAAGCAAACCAAATGTTTGCTGATGTTGTGAACCAGCATTATGAAGAGGGTGATGTTGTATGGTGCCATGATTACCAT CTCATGTTCCTTCCAAAATGCTTAAAGAAATACAACAGCAACATGAAAGTTGGATGGTTTCTCCACACCCCATTCCCGTC TTCTGAAATTCACAGGACACTGCCGTCTCGTTCAGAGCTCCTTCATTCTGTTCTTGCAGCTGATTTAGTTGGCTTTCACA CCTATGATTATGCAAGACACTTTGTTAGTGCTTGTACTCGTATCCTTGGGCTTGAAGGTACACCTTATGGTGTTGAATAT CAAGGGAAGCTGACTCGAGTAGCCGCATTTCCAATTGGGATAGACTCAGAACGGTTTATACGTGCACTTGACCTTCCCAA AGTAAAGGAGCACATTAAAGAATTACAAGAAAGATTTAAGGGCAGAAAGGTAATGTTAGGCGTCGACCGCCTTGATATGA TCAAAGGCATCCCTCAGAAAATTCTCGCGTTTGAAAAGTTTTTGGAAGAAAATCCTAGTTGGCATGATAAAGTCGTTTTG CTTCAAATTGCTGTGCCAACAAGAACAGATGTTCCAGAGTATCAAAAGCTTACAAGTCAGGTTCATGAAATTGTTGGTCG CATCAATGGCAGATTTGGATCATTGATTACTGTTCCTATACATCACCTGGATCGCTCTCTTGACTTTCATGCATTGTGTG CTTTGTATGCTGTTACTGATGTAGCGCTAGTCACATCTTTGAGGGATGGAATGAATCTTGTCAGCTATGAATTTGTGGCC TGCCAAGAGAAAAAGAAAGGAGTTCTCATACTTAGTGAATTTGCTGGTGCAGCACAGTCTCTTGGTGCTGGAGCAATTCT TGTCAACCCTTGGAATGTTACAGAAGTTGCTACTGCAATTGGTCGGGCTTTGAACATGACACCTGCAGAAAGAGAAAAGA GACACAAGCATAATTATGTTCATGTAATATCCCACACTGCTCAAGAATGGGCAGGAACTTTTGTAAGTGAACTAAATGAT ACTGTTATTGAGGCACAACTAAGGACAAGACAAGTTCCGCCCCGGCTACCAACCAAGACAGCAATTGAACGTTTTCTGCA GTCAACTAATAGACTGCTCATTTTGGGATTCAGTGGAACTTTAACTGAACCAGTCGAGAAAACAGGTGATCAGATTAAAG AAATGGAACTTAAGGTGCACCCTGAACTGAGACAACCCTTGATGGCGCTTTGCAGTGATCCAAATACCACAGTGGTTGTG CTCAGTGGAAGTGGCAGAAAAGTCCTGGATGATAACTTCAAAGAATATGACATGTGGTTGGCTGCGGAGAACGGGATGTT TTTACAACCTTCAAAAGGTGAATGGATGACAACTATGCCAGAGCATCTGAATATGGAATGGGTTGACAGCGTAAAGCATG TTCTTGAGTACTTCACAGAAAGAACACCTCGGTCACATTTCGATTATGAAGAAAGGGAAACTTCACTTGTATGGAATTAC AAATATGCAGATGTTGAGTTTGGAAAACTTCAAGCAAGGGACATGCTGCAGCATCTCTGGACAGGTCCGATTTCTAATGC TTCAGTTGAAGTTGTTCAAGGGAGCCGATCGGTTGAGGTTCGAGCTGTTGGTGTTACAAAGGGAGCAGCTATTGACCGCA TCCTGGGGGAGATAGTCCACAGTAAATCCATGACATCGCCGATCGATTATGTTCTTTGTATAGGACATTTTCTGGGGAAG GATGAAGACATTTACTCCTTTTTTGAGCCGGATCTTCCTTCCATCGGTGTTAGCCTTCCCCGAAGTAAGGTATCAACAAC AGATGCTGTTAAGTTTCCTGTTGATAGGAGACAGTCTTTGAAGACCCCGGCTAGTAAAAATGGAGCAAAGGCTTCACAAA ACAAGGCACTGAGGGCAGTGACAAACTCTGAGAAGAAAGCAAACAACCATGTCTGCAGTGCGCCACGACGCCCCGCGCCA CCTGAAAAGACATCATGGAACGTCCTTGATCTAAAGAAAGAGAATTATTTCTCATGTGCTGTTGGAAGACATAGAACAAA TGCTCGGTACACTCTTGGTTCACCAGATGATGTGGTTGGTTTTCTGATGGAATTAGCGGATGCATCATTGTACTCTTCTC CACCAAGTTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0039400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPGNKYNGIPDDHFPPGRLERLMRDRELRELRKRGVHDSVTENGGGGGEGVEKELRKEEDNNENNNSDNNGVVEGGGGGG GGGERQEGKGYRQRLLVVANRLPVSAVRKGEDSWSLEISAGGLVSALLGVKEFEARWIGWAGVNVPDEIGQKALTKALAE KRCIPVFLDEEIVHQYYNGYCNNILWPLFHYLGLPQEDRLATTRSFQSQFAAYEKANQMFADVVNQHYEEGDVVWCHDYH LMFLPKCLKKYNSNMKVGWFLHTPFPSSEIHRTLPSRSELLHSVLAADLVGFHTYDYARHFVSACTRILGLEGTPYGVEY QGKLTRVAAFPIGIDSERFIRALDLPKVKEHIKELQERFKGRKVMLGVDRLDMIKGIPQKILAFEKFLEENPSWHDKVVL LQIAVPTRTDVPEYQKLTSQVHEIVGRINGRFGSLITVPIHHLDRSLDFHALCALYAVTDVALVTSLRDGMNLVSYEFVA CQEKKKGVLILSEFAGAAQSLGAGAILVNPWNVTEVATAIGRALNMTPAEREKRHKHNYVHVISHTAQEWAGTFVSELND TVIEAQLRTRQVPPRLPTKTAIERFLQSTNRLLILGFSGTLTEPVEKTGDQIKEMELKVHPELRQPLMALCSDPNTTVVV LSGSGRKVLDDNFKEYDMWLAAENGMFLQPSKGEWMTTMPEHLNMEWVDSVKHVLEYFTERTPRSHFDYEERETSLVWNY KYADVEFGKLQARDMLQHLWTGPISNASVEVVQGSRSVEVRAVGVTKGAAIDRILGEIVHSKSMTSPIDYVLCIGHFLGK DEDIYSFFEPDLPSIGVSLPRSKVSTTDAVKFPVDRRQSLKTPASKNGAKASQNKALRAVTNSEKKANNHVCSAPRRPAP PEKTSWNVLDLKKENYFSCAVGRHRTNARYTLGSPDDVVGFLMELADASLYSSPPS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 87 | 87 | - | – | |
| PANTHER | 13 | 929 | 917 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 13 | 929 | 917 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 14 | 39 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 49 | 64 | 16 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 93 | 561 | 469 | 2.89E-156 | – | |
| TIGRFAM | 94 | 559 | 466 | 1.1E-187 | ||
| Pfam | 94 | 559 | 466 | 1.2E-186 | ||
| CDD | 94 | 559 | 466 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 134 | 557 | 424 | 1.2E-178 | – | |
| Gene3D | 336 | 544 | 209 | 1.2E-178 | – | |
| SUPERFAMILY | 591 | 925 | 335 | 1.88E-24 | ||
| CDD | 592 | 811 | 220 | 3.76132E-56 | – | |
| Gene3D | 594 | 777 | 184 | 4.2E-13 | ||
| Pfam | 613 | 818 | 206 | 5.7E-55 | ||
| Gene3D | 681 | 763 | 83 | 4.2E-13 | – | |
| MobiDBLite | 860 | 879 | 20 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. | ||
| Molecular function | Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase (UDP-forming) activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + D-glucose-6-phosphate = UDP + alpha,alpha-trehalose-6-phosphate. | ||
| Biological process | Trehalose biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of trehalose, a disaccharide isomeric with sucrose and obtained from certain lichens and fungi. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0039400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…