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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0072600 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0072600.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Histidine containing phosphotransfer protein, putative; TAIR: AT5G39340.1 histidine-containing phosphotransmitter 3; Swiss-Prot: sp|Q6VAK3|OHP1_ORYSJ Histidine-containing phosphotransfer protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QIZ1|A0A0B2QIZ1_GLYSO Histidine-containing phosphotransfer protein 1; Found in the gene: LotjaGi3g1v0072600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:7914328..7924987) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAGAAAACATTGCTAAAATTTAAGCAACCAGAACTGTCATGTCAAGTTATTCCAATAGTACTTCAAAATAAGGAATGTTG CTTAAATACTCCAATTGTATTAAGCAACTCGATTGGGGAGGCTCTAACTTTTGTTTTTTTGATAGGTAAATGTTTTTTGA ACTCTTGATAGACAAATGTTAGTTGTTAGTAATGTTAGTAAATTAATCTTCATCATGGTTCAAACCTTTGCTCATTTTTC CTTCATCCCACCGAACTCTTATGTATTTAACTCGAGCTCTAACTAATCTTGTCTTCCATTATATAGGGAAAGAGAAAAGA AAAAAAAATGGCATACATGAAGAGTTATGCAAAGATGGATCCAAGTGGAAAAATGTGGGAAAACCAGTCGTCCCTTCCGT TGGACACAAAGCAACACACTACGCCACCACACCCTTCCCTCCCCTTCAGTGTACAACACAACAATCAATGTCTCACTCTC ACCATTAACTTTGATTCCTCGTCAATTTGTTGTTCACTTTCTATATTTGTTTAATTTTGGTTTTTGTCTGTGACGATAAT GTCTTTTCTTCTCATGTTTCAGTTGCTATCATGCTCTTTATCGAAATCAAGAATGGTTTTTTTTTTTCTTATTTGGGGAG AAAACTCCAAACCCTTGTCCAGGTAAATCATAATCACTTCATGGAAAAATTTTTTATATTCAAAATGAACCATTTTCTTA AGATTGTGTTTCAACTTTCAATCCATATTAAAATATGCATTGAATGCTTAGGAAATTTTTTCTTAATGGGTACTTGTTGA TTGGTCTTGTAAATGATTTACTTTTCTTGAATTGAGAAGCCTGGAAATGTTATATTGTTCTCTAGAAATAACAGATGCTT TTGATGTTGTGTTCTGTATTGCTCAAATAGATTGAAAGCATTTTCTTTTAATTTAGTTCAGAGGTTTAAGACAGAGAAGA 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TTATCTATTTGATTGACACACTTGCACTTAAATTCCGAACTTCACATTTTTTGAAATGCTTATTGATTTTATTGTCTTAT GTTTTATATAGTTCTGATCTAATTTTTGTTTGTGTACTTTGCTGTTCAGTTTTTCTCACAACCTGACCCTACTGAAAAAT GAGTTCGGTTATACTAAGAGGCAGTTGAGCAATTTTGTTCAGGTATATACTACATTACTTATATTTTTGGATGAAGACAT GTTCATAGCTGCATTAAACATAGCTTGTTCCTTGTTTTTTTGCGGCTTAGTTGCGAAAACATAGCTGCATTAACCTGTTT TTAGAAATGCACTTGGGGTGCGGACTGTATAAAAAGGAAATAAAAAGAGTAGGAAAGTTAGCTTTTTGGTACTTGAGTTT TCAAAGTTCGCATTGTATACTAATATGTTTGATTATTCTAATTTTTTTACAGTTGGAGAGGGATATTATCAGACTTGAGG AGAGTTCTCAACCACCAAACTAGAGTCTCTGTGCTGTTGACTCCTCCTGTTGCTTGCTAATGTGTTTGTTTCGAACTTCT GAGTTGTTGCTGAACATGTATCTCATTCACCTTTAAAAAGGATGTTCTCTTAAAAACATCATCAGCTTGCCCTTTTTAGT TTCTGTTTTTCCCTTGTATGCGCTTTTGCCAACTTGAAGATTTTATAATAGTTCTCCTTTGGTCGACACTATTGATAATT TGCTTGAGGTTCGTCTATCTTGTATTATGGTTTTTTTAGTTTCCATAAGCTGAAATTCTTGCCAAGACCAATGTTGTTTA TGGCGGATGGTGGTCTTTGGTGAAGAGCCAAAAACCCACCATATTTTGACAAATAATAATGTCGGGTCGTGGATTATCTT GGAATATCGGACATGGTGGAGGGCCAAAAACCCTCCATGAGATCCCGCCATGGCCGATATTTGATAACATTGATTAAAAC TCAAGTTATAGTACATCTATATGTGATTCCGCTTTTATCACAGCTTTTAGTAACTTGCCTAAGAGAGGTCTTTAGCAGTG TAACATACATTGTAAATGAG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0072600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACAATGTTTTTTCTGCGAGGATACTTGCATGCACAGCTGATTCGAATGTTTGATGAGGGGGTAGTTAATGATCAGTT TAGTGCAATCACGTGTCCAAGAAACAACAGGGGTCGAGCTCGAGATCACGCTGTACAGCTGATAGAAAGTTATTTGGCTG ATGTTGATGTGATCCTGTCTGAACTTTCTCGCCATGTTGATAATTCACATGTTGACTTCTATATGTTGGGTTCCCTAGCT CGTGAAGTACATGATAAGAGCACAAGCATTGGTGCAGATCATATGAGGCTTGCATGTTTTGATGTCATTGCAGCTTGTGA TGAGAGGTGCAAAAGCAGTTTTTCTCACAACCTGACCCTACTGAAAAATGAGTTCGGTTATACTAAGAGGCAGTTGAGCA ATTTTGTTCAGTTGGAGAGGGATATTATCAGACTTGAGGAGAGTTCTCAACCACCAAACTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0072600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTMFFLRGYLHAQLIRMFDEGVVNDQFSAITCPRNNRGRARDHAVQLIESYLADVDVILSELSRHVDNSHVDFYMLGSLA REVHDKSTSIGADHMRLACFDVIAACDERCKSSFSHNLTLLKNEFGYTKRQLSNFVQLERDIIRLEESSQPPN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 149 | 149 | 8.6E-51 | – | |
| PANTHER | 1 | 149 | 149 | 8.6E-51 | – | |
| Gene3D | 5 | 150 | 146 | 2.2E-21 | ||
| SUPERFAMILY | 40 | 142 | 103 | 1.62E-9 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Phosphorelay signal transduction system | A conserved series of molecular signals found in prokaryotes and eukaryotes; involves autophosphorylation of a histidine kinase and the transfer of the phosphate group to an aspartate that then acts as a phospho-donor to response regulator proteins. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0072600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…