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LotjaGi3g1v0088100.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0088100
Transcript ID LotjaGi3g1v0088100.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Kinase-like protein; TAIR: AT4G13020.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|P43294|MHK_ARATH Serine/threonine-protein kinase MHK; TrEMBL-Plants: tr|I1JM63|I1JM63_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0088100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:9948929..9958817) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TCTCCTTCCTTTTTCTTCCATGGAATCAACCTTCTCTCTCTTCATGGCTTCTTCACAAATCCAAATCCTCTCTCTCTAAC CCTTTCTCTCTCCTCACCTCTCTCTCTCTCTAGAAATCAATTTTCCCCGTTTCTTTCACAAGAAAGTTCAATCGCATTGC TGATCTGTGTTTGTGTGTTCATTGATCCTCTTCATTCATCGAACAAGGTGAGTTTTCCCCCTTTCAATATTTTGTTCTTC CTCAATTTTCTTCAATTTCGTCAATTTCCAATTCTCGGTGCTGTTCTCAGAAACTGAAATGCACCTTGAATTGTGCTTTG TTTTATTGTTTTGTTTATGATCGGTGTTTTGTTTTTTGAGAGAATGAGGAATTGAAGATAAAAATGAATTTTTGTCACTG GTTTATGTTGAATTAGTAGATTATGGATTTATAACAATGAACGAAATCTGAAATTCTGTTACTTTTTGAGGTGTATTGAG CGTGGTGTTCTGTTGATATGTTGTTGTTGAACTCATAAAGGAATGATTTTTCTGGATAGATTGTGAATATAACTTTTGTT TTATGCTTTGATTTATTTGATTTTCATTGTAGGGTTGAATAAGCTATATGGGTATACAAATTTTTTTTTCCTTTACTTAT TTAGTTTGCTTGGGATAGCTAGCTTTTGAATAAAAAGTGATTATTTCCACAATTTAAGCTAATTGATACACATTAAGTTT TTATGTATTCTTTTCTGTGTTTTCTGAAATCGATTTATTTGATCTGATTGGCTTGTTAATTTTGGCACAATGTTGGCAAA TAGATTTTGATTTTCATGGATATGTTAAATAGAGTTGTCTGAGTTGAATTCACGTTTATGGTGAAAGTAAAAGTAAAGGG TATGTGAAAGGCTAAATTTTTTATGTAACAGCACACGATCATCATCATATTTTTTAGAAAGCACTACAATTTTTATTGTC 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CTTTCTGTCTTGTATCTCATTTTAAACCTTTTTAGTTTGTTTAGATCGCTACAATGTTAAATGATGATTGCATCGTGATG AGGATTTGCTCCTCTATTTATTGCTTTCTTCCTGTACTACTTACAGGGGCTAAGCCAAATCTTGAGCTGAAGCTGCAGGA TTTTGGCCCGGAACCCGATGATTGTTTTCTTGGCTTGACATTAGCTGTAAAGCCCAGTGTTTCAACCTTTGGTAAATACT ATCTTAATTATTCATTCAATTATAAAAAAAGTCACTCATAAGTTAGCAATAGCATAAATGATTGCTCTTTGACAACCCAT TTTTAGTAAATAGTGTTTTGTATTATTGTGATAGAGCACCAGAGATAAATTAATGAAATATGCATTACAGAACAAATGAC ATACAATACAACAATAGGCTTGCTGTCTCAGAGACAAAAGTCTCCTATAGGGAGTGTTCACTACCACAATCAACGATGAC TACTTCTACTTTTGTTGCTATTTCTTGTTTGCATGGCTCTATTTTCGAAGTTAAGATTTATGGTGGCTGCTTGATTGCTT TCCAAATGTGCTATCTTAAAAGTTAGGTTCAGGTTGTGCCGTTTTGGTAATGCCAAGGGCACAGATTGAAAGTAGAACTA AGTTCTGTCCAACAAAGAGCAGTTGGTTTCTTTCATTTTGAATTCTCATTTTTAATTTCAGTTAATAAATTATCTTCATG TCCTACCTGGTAAACTGTGGTTAAGTTGTACTTGACTTCCTCTTTAATCATATCATTGGCAGTCTTTGTCCTTTCGACAG CACTCACACTGGACAGATGATTTGGTTGCCTTTCTTTCAAAACTTTCAATGGTTGTGTTAAAAGAAGAGAAAAGAGAATA AATGATGTTTTTTTTCCTTTTAAAAGAGTGATAAAAAATGGGTTTAGAACCTACCTAGTTAGTAGAGGTCTTCTGGTTGA ATGCTCATTTATCCAAATGTATGTCAGTTAAACATGTTAATGAAGCAATATTCATGACTTATTTACCCATTGAAGAGAAT GTAGAATGTTAGTGTTACTTTGATTGTTTGAATTGCTGTAGTTCTACACTTGTTTCTTTTTCAAGGGAGTCGTGGAATTT GAGTTTTTAGTATTCTATCTTGAGAAAATGTTCTAACATCTCCTGGGAACCCCTGGCTCAAACCTGCATTTTCTATGTAC TGTTTATTGAATGATATTGACACTTTTTTGAAATGCTTGAGCTTTTCCATTACTATTCTTCTTTACTTAGTACATTTTGC AAATCTAGCGGTTCAGCATATTAAATTTCTCTCATTTTCTCCTTCGTTGTTTTAGTGGTAGACATCCCTGACCATTTAAT TAATTGCCATTTCTCGCAGATATGGTCCAAAATGTATCACAGGGTATGGGAGAGGTTGGTGTACATGACTTTAAATAAAG CATCAAGGCATTTTCAAGTCTAATGTTTTGTAATGCTAACATGACAACTTACCTGCATTCTGACTTAGTGCTTTATATGA AAATGCAGAATGTGCTATTTTGCCCAGATTTTAATGATCATTCAGACCGATCAGGTGTTTCTTTGTTTCTTACCTTCTTT AACATTTACAATATAATCTTTCATAACCAATTTAGCTATGTTTACAGAGAAGAGATAGCTTATAACTTATGAAAAGAAGA GACCCTTTTATTTACATAATGGTAAAACAGATTAGGTGTTTAACATAAAGATTACACATGAAATATTTGAACCGTCATAT CAGGAATTCAGGATATAGAAAATGAACATGTCTATTTGAACAACTGCCACTTTTGAACTAATATGCTAACTGGTTGATTG AAAATATGGCATCAATCAACGAAGTACTAATAATAAGATGCTGCAAATTCTGGCTGAGAACCAATTGCTCTCTGTAAATG AGATTAAGAGCATTCGACATGACTAAGCAGCTGTGCAACAAAAAAATAAATAGTTCAGTAATCAACTCTGCATAAATCGT TGATAAAACAAACTGACCTCTACCTTTGCTTCAACTATGAAATAGAAATGGGAAAATCTAGTCCTTACATTCTATTCTGA ATTTACGCAAAGACATGAGTATTTGGGGTTGCTTTATAATTTTTTGAGTATTACTTCTGTTAACAAATGATATTAAAGTA AAATGTTATTCAGGAACTGCTTTGCATAAACATTGTTAGGAAGAACAATTATGAACTTTAAAATCACTAACTTTTTTTGT TGTTGACATAATTTGACCTGAATAATATAATCTTCTTTTTGAAATTGTGCAAAACTATGTTTATGTCATCACATCACTAA AATCAGTTTTTCCTAATGGAGAAGTCTCTCCAGTGACTAAGATGATCTCCTTAGATCTTTGTATACATCATAGTATACCT CTCTAGCTACCACTGCTTAACTAATTGGGGGGCTGGGTACCAACTTTGACACTTCTACTTTTTCTCTTTTGAGAATTTTC TTTGAAATTTCACTTTGTTTTTACTTTATAATGACGAATGGCGTTTATTGTGTGATCTAGTGTTTTGGACATTATTGTCT CCTGATCAAAACGGAGTTCATAACTCAGCAGAGACTTCCTTGTCATTGTCATTTGGGTAAGTTCTTGCTATACACTGCTT TTCCTCATCCTTATGGATGATGCCATTATCTCTCTCTTAGTGATACTTTAAAAATGTCATTGACCAAGGTAAAGCAGAAC AGAAGTTTAACTTATGCTTTTACAAAACGAGTAAAAAAAAATTGTGATCAGTTATAGGTCTTTAAGATAGGTTAGGATAG GGCATTGGTTTTATTTTATGTTTGATGTATAGTTAAAGAAGAAATATAATAGGACATAAAGTAAGTGATACTGATACATT TTGGTTTGAGTTAAAAGGGCGAACCAAAGAAAACCTATTGTTTTGACCTCATGATGCGCTACCTTAGCATACTTTTAGAC TAAAACACTTTTTTTCACAAAAAATAGCCTAAACACACTTAATAAAAAATAAAACAGGTAACCTAATGGACTCTTAACTG CATCACTACTAAGCGATGAAACGTTGTACTTTTTATGATATTAGATATTTATCACTATTTGTTGTCCAAACTGAGCAAGT GATACATGATTTGTGGTTTCCCTTATTTTGTATTCTCTTAACAGATCAGTTCAACATCCGCCAATTGGAGTTCCACAGTC AGCGGGATTTTCATTTCAGCCTTTGCAGCCTAACATCTTAACTACACCATTTTTGGCTCTGTCTTCCCCTTGCCAGCGCG GCCACTGCCTTTGAATGATTGACTGAACTTTGAACTATTAATGCACTATGATCTTGAATCTTGATGATGCATACAATAGT TTTCATTTTAGGTAAATTTTTTGTACAGCTTTGTATAGCATTTGTAATAGTTTCTCGTTATGGCGAAATAGAATGTAATT GCTGAACGAATTCTATAAGGATATTCGATTTCAATGAAAAGTATATATATTTGTTTATCATTTGTAATATGTTTTCATAT AAAAATTTCGTCCCTTTGTTATATATATTTATATTTATAATCTATGATTTATATATGAATAGAATGTGTGACCAGCTTCA CGGTTTAGTTGAATTGGTCCTGACAAGTGTTTGATCTCAGATTCTCGATTGAATAGCTTGAATTCTTACGTAGGAACATT GGAATTGTTAGGAACTCAAGATTTATGTGTAGTATAGTATTAGAGAAGTAGATTTGTACTTCAATGGTGAGATGATGGTA GTGAATACCATGTGATTTGCTTTTGGATTGTACAGAGTGGTATCAATATTGAGGCATATGTGGCATTTGGTAACAGAAAT 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0088100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAAAGATATAAAATTTTGAGAGAGCTTGGAGATGGCTCTTGCGGTCATGTATATAAAGCCCGTGATATGAGGAGTTA CGAGATTGTTGCTGTCAAAAGATTAAAAAGAAAGTTTTCCTTCTGGGAAGAATGCACAAATTTAAGAGAAGTTAAGGCCC TTCGTAAAATGAATCACCCAAATATCATAAAGTTGAAAGAGGTTGTTAGAGAAAATAATGAGCTGTTTTTCATTTTTGAA TACATGGAATGTAATCTTTATCAATTAATAAAAGAGAGAGAAAAGCCCTTTTCAGAGGAACAGATACGGTGCTTTATGAA ACAATTGCTGCAAGGACTTAGTCACGTGCACAAGAGAGGATATTTTCACCGTGATTTAAAACCTGAAAATTTGCTGGTGA CAAATGATGTTCTTAAAATTGCTGATTTTGGACTGGCTAGAGAAGTTTCATCATTGCCTCCATATACTCAATATGTCTCT ACACGGTGGTACCGAGCTCCAGAAGTTTTGTTGCAGTCCTCATGTTATACTCCTGCTGTTGACATGTGGGCAGTTGGTGC TATATTAGTGGAGCTTTTTACTTTGACCCCCATATTTCCGGGTGAAAGTGAAATTGATCAACTGTACAAAATATACCAAA TTCTCGGTATGCCAGATTCAACTGCTTTCAGCACAGGGGCAGACAACTATCGGCTATTGGACTTTGTTGGACATGAAGTT GTTACACCTGTGAAGCTTTCCGATATCATCCCAAATGCTGGCTTGGAAGCTATAGATTTGATCACGCAACTGTTATCATG GGACCCATCAAGAAGGCCAGATGCAGATCAGTCATTGCAACATCCGTTTTTCCATGTGGACACATGGGTTCCTCGTCCAC TCAGTGATCCCCTTGAGCTGAAGCTGAGTAGCAAGAGGGCTAAGCCAAATCTTGAGCTGAAGCTGCAGGATTTTGGCCCG GAACCCGATGATTGTTTTCTTGGCTTGACATTAGCTGTAAAGCCCAGTGTTTCAACCTTTGATATGGTCCAAAATGTATC ACAGGGTATGGGAGAGAATGTGCTATTTTGCCCAGATTTTAATGATCATTCAGACCGATCAGTGTTTTGGACATTATTGT CTCCTGATCAAAACGGAGTTCATAACTCAGCAGAGACTTCCTTGTCATTGTCATTTGGATCAGTTCAACATCCGCCAATT GGAGTTCCACAGTCAGCGGGATTTTCATTTCAGCCTTTGCAGCCTAACATCTTAACTACACCATTTTTGGCTCTGTCTTC CCCTTGCCAGCGCGGCCACTGCCTTTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0088100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MERYKILRELGDGSCGHVYKARDMRSYEIVAVKRLKRKFSFWEECTNLREVKALRKMNHPNIIKLKEVVRENNELFFIFE YMECNLYQLIKEREKPFSEEQIRCFMKQLLQGLSHVHKRGYFHRDLKPENLLVTNDVLKIADFGLAREVSSLPPYTQYVS TRWYRAPEVLLQSSCYTPAVDMWAVGAILVELFTLTPIFPGESEIDQLYKIYQILGMPDSTAFSTGADNYRLLDFVGHEV VTPVKLSDIIPNAGLEAIDLITQLLSWDPSRRPDADQSLQHPFFHVDTWVPRPLSDPLELKLSSKRAKPNLELKLQDFGP EPDDCFLGLTLAVKPSVSTFDMVQNVSQGMGENVLFCPDFNDHSDRSVFWTLLSPDQNGVHNSAETSLSLSFGSVQHPPI GVPQSAGFSFQPLQPNILTTPFLALSSPCQRGHCL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SUPERFAMILY 1 285 285 5.78E-93
SMART 4 284 281 9.7E-101
ProSiteProfiles 4 284 281 48.824
Pfam 4 284 281 1.2E-73
CDD 4 284 281 2.84673E-168
PANTHER 4 430 427 9.8E-211
PANTHER 4 430 427 9.8E-211
Gene3D 4 81 78 3.2E-92
Gene3D 82 284 203 3.2E-92
ProSitePatterns 121 133 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0088100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…