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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0120000 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0120000.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Alpha-N-acetylglucosaminidase; TAIR: AT5G13690.1 alpha-N-acetylglucosaminidase family / NAGLU family; Swiss-Prot: sp|Q9FNA3|NAGLU_ARATH Alpha-N-acetylglucosaminidase; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SYJ6|A0A151SYJ6_CAJCA Alpha-N-acetylglucosaminidase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0120000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:14670475..14685805) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGTAATTAAAAAAACATATGATAACCCAATTAAAATAGCTTTGTTTTGTTTCTTACTACGTTGTTCATCACAACGAGTTC CTCTGTGAGCCGAAGAATGTTGAGGTTCCTGTTTCTGACTTTGATTCTAACGTTTTCGGTGCCCGTGGCACTGTCTAAGA ATGAAGCCATAGAACCTCTGCTTCAGCGCTTGGACTCCAAAAGGGCACCTCCATCGGTGCAAGAAGCTGCAGCTAGAGGT GTTCTGAAAAGATTGCTTCCTACCCATTTGTCCAGTTTTCAGTTCAAGATAGTTTCTAAGGTGTTCTTCCTTTTCCTTTC TGACTTGAGTCTTTTGGATTCAATCATATGGTTGACTTTATTTTCTGGGTACCCTTTTATTATGTTCAATTGAATTTTTG GTTTTACACTGTTGCAGAAAAAAGAGAAGTGGAATATGGGTAATTTTGGAAAGTTTGATATAAATTGTGAACAAATTTAA TGCTACTAACTACATTAACCACATATCTTAAGATGCGTGAGGTAGTTATTTGGTTTTTTGGAAGCAGCATTGACTACTCT TATGTTATCCTGCCAAAGTAGTTTGTGTTATCACTGTTATGTTATTTATATTTTTTATCCATTAAGATTGCTGCTTTCAC CTAATTGTACTGCTATTTTATAATGCCAAAGTAGTTGGTATCTGAATCTACTCTTATTATTAATGATTGAATGTAAAAAT GTGATTTTTAAATTTTCAGGATGTCTGTGGTGGAGACAGTTGTTTTATGATAAACAATCACAATAAGTCAAGCCAGAATG GGCCTGAGATTATGTATGTCAAATGAAATTTATGTTGCACATTATGATTAATATTTATTTCCTTTTGAGTTCTGGGTTTT CATTAAAATTATGAGATGCTTGGATTTCTTTTATTTAAAAGTTATTTTGATTCTTCTTCTACTGCTTTTTATGTACTTAA ACTTGATTTTCATGTAGAAAATGCTAATGAAATTATTTCCAATGCTGTTCAAAAACCTTCGTTAGTCAAATGCATTTTGT TCTGTATATCATCTGGTAAGAAAATTCCACCATTATTGTGGGATAATTAGATAGGATACTTGATGCAATGGTCAGTTTTT CACTGTCATCAGTTATCTGCCCATAGATATGATCACTTGATTAGTTTTTCTTCCTCCTTTAATATTATGTGACATTGTCT TGTATATATCTTTTTCAGCATTAGTGGAACCACAGCTGTTGAGATTGCATCTGGCCTCCATTGGTATCTTAAGTATTGGT GCGGTGCTCATGTCTCGTGGGATAAGACAGGTGGCATTCAGACAGCTTCAGTCCCCGAGCCAGGGTCACTGCCCCTTTTG AAAGATGAGGGTCTGAAGATTAAACGCCCTGTTCCATGGAACTATTACCAAAATGTTGTGACTTCTAGTTGTGAGTACCA AAATTGGCTTTACATTTAACAAGACAGTTCTGTCACATTTTTCTGTACTGCACCACTCACTGAGAATTTTAACTGACGTT CAGTAGCTGACAAGTAGCAATGCTTTATAATTCGTTATGAGAAAGGATAAAACCTACGAAGAAGTTGAATTAGGTACCAT TAACAAATAGAAGATTTTCAACTAAGTAATCCTTAGGCTTGATTTGGAAGGGGAAGAAACCTACTTGCGGAATTGAAAAT TCAGTACATTATCAAGATCAGATATAGCCCCTTCTTGTTGTGTCTCTTGTCCAGGTTTGATCGATTTGGCAATTGGGAGT AGCTGGTACATCTTTCTATTATGTGTGCTGATTTATATATCTGTGGACTAATCAGTGACTGCAGCCCTTAACTGAAATTC TAATGGTTGTTATTGATATCGCTGGAGGGAGAATAATGATAATTCTAATAGCAGTAAAGCAGGGGCTTTGAGTAATTGGG 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TGCTAGTTGATCGTTTGAATTGAAGAAGCTAGTGGTGATTTCCCCCGATTTGATCTTCTCTCTAACAAAATGACAATCTA TCTCAATTTTCTTGGTCCTTTCGTGAAACACTAGTATTAGAATTTGGGAGGCCTAACTCAACCCAAAAGCTAGCTCAAGA GTTGAGGATTGCCTTCCCATATATAAAGGCTATTTTGGCCATATAGCCTTCCACCATGTCTCTCAGCGACACAGGTGGTG ACGCCGACATTGCAGTGTTCGCTCGGAACTAGTCAAAGGGGCTAGTGCACTGCTAGCCCGCGTGGATGCCCGGGCTGCAG AGCGTGGTGGTGGGATGTTAAGACCCAATTGCAAGGTATGAGACTTGAGTCTCACATTAGAAGTAGAGATTCTAGTGTGA GGTTTATAAGGCATTGAGCTCTCCAACTACAACGACTAGCTTTTGTGGTATGGTTCTCCTGAGTTTCTTATCAAGTTGGC CCAATGAGTCTGTTACTAGTTGGTTGTGGTAGAGAGGGGAGAAGTTGCGGACTGTTATACACCTGCAGAGTAGGTGGAAG TGTTACTGGATCATAGGGAGCATGAGATATCTATGATGTTGAAGGGTTATAGGGACAAGAGGAGGATGTGGCAAGGTGAT GTACGTCTCATATTGAGTAGAGACATGGTCAAAGAAACCCTTATAAAGGTTGGATAATTCTCATGTCTCTTATGAGTTAG CTGTTGGGGTAGAGTTAGTGCAAACCCGAATTCTAAGATTACCTATCTTTTGTGTTTCTTCTGCAATGGATATTCTATCT TATTGTTGCTTTGCATTGCTGAAGTTATGATTGTCCTCTTTTTCATTTCTACTTGTGTATATTTTATTTCCATTTGTATA TTGGTTTGTAGCTGACACATATAAATGAATTTGTAGGGCTGGCTATTTTACTCCGACTCATCATTTTGGAAGCCTCCTCA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0120000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTGAGGTTCCTGTTTCTGACTTTGATTCTAACGTTTTCGGTGCCCGTGGCACTGTCTAAGAATGAAGCCATAGAACC TCTGCTTCAGCGCTTGGACTCCAAAAGGGCACCTCCATCGGTGCAAGAAGCTGCAGCTAGAGGTGTTCTGAAAAGATTGC TTCCTACCCATTTGTCCAGTTTTCAGTTCAAGATAGTTTCTAAGGATGTCTGTGGTGGAGACAGTTGTTTTATGATAAAC AATCACAATAAGTCAAGCCAGAATGGGCCTGAGATTATCATTAGTGGAACCACAGCTGTTGAGATTGCATCTGGCCTCCA TTGGTATCTTAAGTATTGGTGCGGTGCTCATGTCTCGTGGGATAAGACAGGTGGCATTCAGACAGCTTCAGTCCCCGAGC CAGGGTCACTGCCCCTTTTGAAAGATGAGGGTCTGAAGATTAAACGCCCTGTTCCATGGAACTATTACCAAAATGTTGTG ACTTCTAGTTATTCATACGTCTGGTGGGATTGGGGAAGGTGGGAAAAAGAGGTAGACTGGATGGCACTTCAGGGGGTGAA CCTGCCCTTGGCATTTACTGGGCAAGAAGCAATCTGGCAAAAGGTTTTTAAGGATTTTAACATTAGTTCCGAAGATTTGA ATAATTTCTTTGGTGGACCTGCTTTCCTTGCTTGGGCTCGCATGGGAAATTTGCATGGCTGGGGTGGGCCTTTATCTCAA AATTGGCTTGAACAACAATTGGTCTTACAGAAACAGATAATCTCTCGAATGATGGAGCTAGGGATGACACCAGTGCTGCC ATCCTTCTCTGGAAATGTTCCAGCTGCTTTGACGAAGATATTCCCGTCGGCAAAAATAACGAGACTTGGTGATTGGAATA CTGTTGACAGTGATCCTCGCTGGTGCTGTACATACCTTCTTGATCCATCTGATCCTCTATTTGTTGAAATTGGGGAAGCT TTTATTAAGAAACAAATTAAAGAATATGGGGATGTCACCGACATCTATAACTGTGACACTTTTAACGAAAACTCCCCACC TACCAGCGATCCCGCATATATATCAACTCTTGGAGCTGCTGTATATAAAGGAATTTCCAAAGGTGACAAAGATGCTGTGT GGTTAATGCAAGGCTGGCTATTTTACTCCGACTCATCATTTTGGAAGCCTCCTCAAATGAAAGCACTTTTACATTCTGTT CCGTTGGGGAAGATGATTGTTCTTGATCTATTTGCTGATGTAAAACCAATATGGAAAACTTCCTTTCAGTTTTATGGTAC TCCTTATATATGGTGCATGCTGCATAACTTTGGTGGTAATATTGAAATGTATGGTACTTTGGACTCAATTTCTTCAGGGC CAGTTGACGCTCGTGTCAGTGCAAACTCAACAATGGTAGGCGTTGGTATGTGCATGGAAGGGATAGAGCATAATCCTGTT GTTTATGAGCTGATGTCTGAAATGGCATTTCGTGATGAGAAAGTTGAAGTTCTGGAATGGCTTGTGAGTTATTCCCATAG ACGATATGGTAAAGCCGTCCATCAAGTTGATGCAGCTTGGGAGATTCTTTATCATACAATTTACAACTGTGCTGATGGAA TTGCTGATCATAATCATGATTATATTGTAATGTTTCCTGATTGGGACCCATCAACAAATTCTAGCATCTCAAACAACCAG AAGAAGATTTACTTCTTACCACATGGAAATAGAAGGTATTTATTACATAAAAAGTTGTCTGATATGCCACAGCCTCATTT GTGGTATCCCACTGAAGATGTAATCAAGGCATTACAACTATTCTTAGCTGGTGGGAAGAACCTCGCTGGAAGTCTCACAT ATCGGTATGACCTTGTTGACTTAACGCGACAAGTATTATCGAAATTGGCCAACCAAGTATACGTCAAGGCAGTTACTTCT TTCCAAAACAAGAATATTGACGATTTGCACTTCCACAGCAACAAGTTCCTTCAACTGATAAAGGATATTGATGTATTGCT TGCTTCCGACGATAACTTCCTTGTGGGAACTTGGCTTGAGAGTGCTAAGAAACTGGCTGTGAATCCAAGTGAGAAAAAGC AATATGAATGGAATGCGAGGACGCAAGTGACTATGTGGTTTGATACCAATGCAACTACTCAGAGCAAGCTCCATGATTAT GCTAATAAATTTTGGAGTGGCATTCTGGAAAGCTACTATCTCCCACGAGCTTCATCCTACTTTAGTCATTTGTCAGAAAG CTTGAGACAGAATAAGAAGTTCAAGTTGATTGAGTGGCGAAAACAATGGATTTTGCAGTCAAACAAATGGCAGGAAGGTA ATGAGCTCTACCCAGTAAAGGCCAAAGGAGATGCTCTAGCCATCGCTCAAGCTCTCTATGAAAAGTATTTTGCAAAATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0120000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLRFLFLTLILTFSVPVALSKNEAIEPLLQRLDSKRAPPSVQEAAARGVLKRLLPTHLSSFQFKIVSKDVCGGDSCFMIN NHNKSSQNGPEIIISGTTAVEIASGLHWYLKYWCGAHVSWDKTGGIQTASVPEPGSLPLLKDEGLKIKRPVPWNYYQNVV TSSYSYVWWDWGRWEKEVDWMALQGVNLPLAFTGQEAIWQKVFKDFNISSEDLNNFFGGPAFLAWARMGNLHGWGGPLSQ NWLEQQLVLQKQIISRMMELGMTPVLPSFSGNVPAALTKIFPSAKITRLGDWNTVDSDPRWCCTYLLDPSDPLFVEIGEA FIKKQIKEYGDVTDIYNCDTFNENSPPTSDPAYISTLGAAVYKGISKGDKDAVWLMQGWLFYSDSSFWKPPQMKALLHSV PLGKMIVLDLFADVKPIWKTSFQFYGTPYIWCMLHNFGGNIEMYGTLDSISSGPVDARVSANSTMVGVGMCMEGIEHNPV VYELMSEMAFRDEKVEVLEWLVSYSHRRYGKAVHQVDAAWEILYHTIYNCADGIADHNHDYIVMFPDWDPSTNSSISNNQ KKIYFLPHGNRRYLLHKKLSDMPQPHLWYPTEDVIKALQLFLAGGKNLAGSLTYRYDLVDLTRQVLSKLANQVYVKAVTS FQNKNIDDLHFHSNKFLQLIKDIDVLLASDDNFLVGTWLESAKKLAVNPSEKKQYEWNARTQVTMWFDTNATTQSKLHDY ANKFWSGILESYYLPRASSYFSHLSESLRQNKKFKLIEWRKQWILQSNKWQEGNELYPVKAKGDALAIAQALYEKYFAK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| Phobius | 1 | 3 | 3 | - | – | |
| Phobius | 4 | 15 | 12 | - | – | |
| PANTHER | 6 | 798 | 793 | 0.0 | ||
| Phobius | 16 | 20 | 5 | - | – | |
| Phobius | 21 | 799 | 779 | - | – | |
| Gene3D | 25 | 141 | 117 | 3.1E-14 | ||
| Pfam | 44 | 138 | 95 | 4.7E-24 | ||
| Gene3D | 150 | 493 | 344 | 7.5E-146 | – | |
| Pfam | 155 | 491 | 337 | 1.3E-143 | ||
| Gene3D | 494 | 799 | 306 | 2.5E-80 | – | |
| Pfam | 500 | 795 | 296 | 2.1E-82 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0120000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…