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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0152500 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0152500.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Kinase, putative; TAIR: AT3G51630.1 with no lysine (K) kinase 5; Swiss-Prot: sp|Q9SCU5|WNK5_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase WNK5; TrEMBL-Plants: tr|K7K3L1|K7K3L1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0152500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:20551269..20568910) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATTGCATGAAGCTTTCAATCTCTCCCTCTTTGCCTACATTTTAGCTCATTGATTTCAATTTGTGTCCTCAGTTTGCTTCC ATCTCAGTTCACAAACGCCGCGCCCGCGTGCTCGATGGTTGAACGGAACAGAACCTTCACTCCCTGTTTGTTCACTGGTT CAACAGAATGGAGCCTTCTCTCCATCACACCTTCCGCCTGCGGCAGCTTCACCGATGCCGACATAATCGTGCTTCGCAGC CTCGGCGTCCTCCTCCAGCCTTTGGTTTGGCTTCAGGTAGTCTCAATTCAGAGGTAGCTTCAGTTCTGTTTGTTCCGTTT TTAGCAGTCGCGTGTCTCCTTAAAACTCAGATTCTAGTTTTAGAAGTCTCATATTGACTAAAGATATGACGTAGATAGCC TTTATAAAAGATCTCAACTCTTGAGCTAGCTTTTGGGTTGAGTTAGACCTCTCAAATTCTAGTAGAAGCTACCGTTATGC AGACATTTGATCACCATTTTGATCATTGATTGACATGAAAAATGAATTCTAAATGTCATTCACTTTGTTACATTTTGCTT TCGGATCATTTTCTTTACTGAAGCTTTTTTGCTGTTTGATCTTCAGTTTGTCATCCTATGGTTCATTATGTGGTTATAGT CATGTTTGACACGATATTTTCTTGCTTCTTATCATATTAGCATTTGGTTTACATTTAGTTCACTTGTTTGAAGTAACTGT TGTGATTTGAGATTGAACTTGTGATTCTTTTAATAGTATTTTCTGTAGGCATTGTTTTTTCTCCCTGACATTATATTTTT TTCTAGCAAAAGTAGGTACTAATTTAGTTTGAAGATTCATTTGAGTATAACCAGTGGTTTTTTGTCTTTTGTTTTCTTAT TAAGTCTCCATTTGTCTCACTTCTCATAGTATGTTGAAACTTAGGTTTGGTATTTTACTAGTTAACAGGGTAGATTCCAT 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ATACAGTTCAGAAAAGCTTGTAAATATGAATGAGTGAATGACTACGTATCAACTGTTCCCAATAATGTGGAGTTGTGGAC CTTGTCTTTGTGGTACTCTCACAACTCACAAGTACAACATTGAAATAGTATACCTATTATCTCAGTTGCTGTTTCTTGAT AACCGGTTTGAGTAGCATATTCAATCAATGTAATATCAGTGATGGGCAAGCCTAGCAGTCATGTAGGAAATCAAGATCAG TTAATTGTATGTTGTTTTTTGAGGGTCTTGCTGTATTACCAAAGTGTTGCTTTTAAAGATAATTATTGGTTGATCATGCT GTATTTCAAATAATTATGCGTGCCATGATGCATTATCTGGTT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0152500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTACAAGGGGAGATTGGGAGGCAAAGCTCAGCTTATTGGATATGTTGAAACGGATCCATCTGGTCGATATGGACGTTT CAGGGATATTTTAGGCAAAGGAGCCATGAAGGTAGTGTATAGGGCATTTGATGAGGTACTTGGAATAGAAGTGGCTTGGA ACCAAGTTAAGCTTGGTGATGCCTTCAATTCACCTGACAAACTTCATCGCCTGTATTCAGAGAATCATCTCCTCAAGAAC TTGGACCATGACTCTATCATCACCTTCCATAATTCTTGGATTGATGTCCATTGTAGAACTTTCAACTTCATCACTGAGCT GTTCACCTCTGGCACCCTACGAGAGTATAGAAAGAAGTACCCTCAAGTAGATATCAGAGCACTGAAGAACTGGGCTCGCC AGATTCTAAGTGGTTTGGAGTATTTGCACAGCCATGATCCTCCAGTGATACACAGAGACCTCAAGTGTGACAACATCTTC GTAAATGGCCATCTGGGGCAGGTCAAGATCGGTGACTTAGGCCTTGCAGCCATTCTTAGTGGCTCCCAACAAGCCCATAG TGTCATAGGTACACCAGAATTTATGGCACCAGAATTGTATGAAGAAGAGTACAATGAATTGGTAGACATATACTCCTTTG GGATGTGCATGATAGAGTTGTTCACTTTGGAGTTCCCATACAGCGAGTGCTCCAACCCTGCTCAAATATACAAGAAAGTT ACTTCTGGGAAGCTGCCAGATGCATTTTACAGAATTAATGATTTGGAAGCTCAAAGGTTTGTGGGAAAGTGTTTGACAAA TGTCTCTGAGAGGTTGTCAGCAAAGGAGCTCATGTTGGACCCGTTTTTAGCCATGGACCAACTTAGCTCACCATTGCCAA GCCCAACATTACCTAAAAAACATGCTAGCCTGCTCAATTTCAATGCAGAAGTTTCCAAAGAGCAACCTTCAATGTGTGAC CAAACAAAGACCACACACATGACCATCACAGGGACAATAAATGAAGAGGATAATACAGTTTTCCTTAAAGTACAAATTTC TAACAAAACTGGGAATACAAGAAATATATACTTTCCCTTTGATATGATAAATGACACTGCTATTGAGGTGGCAATGGAGA TGGTTAAGGAACTGGAAATTAGTGACTTGGAACCAGTAGAGATTGCTGAAATGATTGAGGAGGAGATATCAACATTAGTT CCAACGTGGAGAGATTTTGGTACTTCTAAGTATCAGCGACAACACAGTTTTAACTATGAAGAAGATGATGGTATCAGTAA CCACCATCGTTTCTTCTCATTATCTTCTCGCTCTTCCTCTCACGGTTCTCTCCCAATGTTTGATTCTTCCTACAAGAACA TCCACCTTTATCAGAACCATAACACTTTTGCTCAAGATTGGAATCAAGATGATCTATCTATGAATGATGATGAAAGCTCT CAGAGCTCAATGAACTCCTTGAGGTGTTTCGATATCCACTGCTGCGACTCAGGGAATGAACATGAGCATGGTGCAACTTT TGCAGTAGGAGCAGAACTACTTTGCAGTACGCCAAAGGCCAACAACAAGTGCACAAGATTCTGTCCTCGAGAAGAGGTGA TGGAGGTTGATATCACTAAACAGTTTTGCAACATGAGAATGGATTCTCACTCTCATAGATATCATGGACCGGGACATGGA TGTCGAAGGTTGAAAAGGATACACTCGTATGTTGATGTGAGGAGACCACAACTGCAAAGATCACTGATGGAGGAGATGCA CAAGAGGAGGGTGATCAAGACGGTTGGAGCTGTTGAGAACTTTGGGTTTCAGGATCCAGAAGAAGGTGGATGTTTTTCTT GTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0152500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MYKGRLGGKAQLIGYVETDPSGRYGRFRDILGKGAMKVVYRAFDEVLGIEVAWNQVKLGDAFNSPDKLHRLYSENHLLKN LDHDSIITFHNSWIDVHCRTFNFITELFTSGTLREYRKKYPQVDIRALKNWARQILSGLEYLHSHDPPVIHRDLKCDNIF VNGHLGQVKIGDLGLAAILSGSQQAHSVIGTPEFMAPELYEEEYNELVDIYSFGMCMIELFTLEFPYSECSNPAQIYKKV TSGKLPDAFYRINDLEAQRFVGKCLTNVSERLSAKELMLDPFLAMDQLSSPLPSPTLPKKHASLLNFNAEVSKEQPSMCD QTKTTHMTITGTINEEDNTVFLKVQISNKTGNTRNIYFPFDMINDTAIEVAMEMVKELEISDLEPVEIAEMIEEEISTLV PTWRDFGTSKYQRQHSFNYEEDDGISNHHRFFSLSSRSSSHGSLPMFDSSYKNIHLYQNHNTFAQDWNQDDLSMNDDESS QSSMNSLRCFDIHCCDSGNEHEHGATFAVGAELLCSTPKANNKCTRFCPREEVMEVDITKQFCNMRMDSHSHRYHGPGHG CRRLKRIHSYVDVRRPQLQRSLMEEMHKRRVIKTVGAVENFGFQDPEEGGCFSC
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 607 | 607 | 5.6E-280 | – | |
| PANTHER | 1 | 607 | 607 | 5.6E-280 | – | |
| Gene3D | 14 | 106 | 93 | 6.8E-22 | – | |
| SMART | 25 | 283 | 259 | 4.9E-59 | ||
| ProSiteProfiles | 25 | 283 | 259 | 38.082 | ||
| SUPERFAMILY | 27 | 284 | 258 | 2.83E-62 | ||
| Pfam | 29 | 283 | 255 | 6.5E-45 | ||
| Gene3D | 108 | 285 | 178 | 1.2E-47 | – | |
| ProSitePatterns | 149 | 161 | 13 | - | ||
| Gene3D | 338 | 427 | 90 | 3.3E-6 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0152500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…