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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0175000 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0175000.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Histidine containing phosphotransfer protein, putative; TAIR: AT3G21510.1 histidine-containing phosphotransmitter 1; Swiss-Prot: sp|Q9ZNV9|AHP1_ARATH Histidine-containing phosphotransfer protein 1; TrEMBL-Plants: tr|V7BVT0|V7BVT0_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0175000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:24293018..24307804) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGTGCTTCCTTTGTGTGTATTAATAATATGTGCTTTCCCTTTTACACGGACGGGTTCGGGCTTTGATGGATTGATATTTT CTCAACCGAGCCCGCCCGAATTTACCCACACTTAACCGTTTTCTTTCACCCGTTGACCCACCTAAACCCGCCCGCATGCA CATGTTTGACTCCGGTTTCCTCAGGTTCCGGTGGGACCGGATATTATGCCCACCCCTATAACCCACCATGACATTCACCC AATAGAAACGAAGTCATGCAAAGAAGGATCCAAGTGGGAAAATGTGGAGTCGTCCCTTCCGACGCCCTGCTCTGCCACCT GCCCCTGGCCGTTGGCCACAAAGGGACACACTACACCACCACACCCTCTCCTCTTTCCACTCTCACTCTTCTTCTTCTTC TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCAACAACTCCAATGGCTCTCACTGCTCACAAAAATCGCCTTCAATGCTTC ATCCAATCCATGTACGACGAGGTATCTCTATAAATTACCCCTTCCTTCTTCACCCACTTCACAGTTTCGCATTTTCATCT CAGAATAGAAAGTGGCTAGTTAGTTATTGTTATTCTCGCAGGGGATTGTGAATGAACAGTTCTTTCAACTCCAATCCATG AAGGAAGCTATTCGGCCAGATTTCGTTGTCAGAGCAGTCACTAGCTTCTGCGTTTGTTGCATTCGATTGTTCTCTAATCT CACCGATCTCATTTAACAATGTCACACCATTAACTTTCAATCTTCTTCACTTTCTAATTTTAGGTTAATTCTGACCCGGT GTTCTCATCTGCAGCTAAAACAAGAGGTGAATTTTCCAAAGGTTCATGTTCTGGCTCGTGAACTATATGCAAGAACCACC GGGTAACATATAACTCCATTTCCTTTTTTTTTTCGGGTGTTGTTAGAAGTCCCGCATTGGCTAGAGATATGACATAGATA 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AAGATTAAGTTTCTTATTAAAAAATTACGTGACCTCTGCTCCAGAACTTCCCTCTTTTCATTGTCACTTTTTTCTGTTCT CTCTATAGTTCGAAATCATAAACACAGGGCGCACCGGAAGAATTGTTCGCAGTGCTTCACAGTTCACAGTACTCTGCTTT TCTCTCATCCCCAGCACTCTGTTATTCATTAAGCCTTATGTAGAATTGAATTGATCTGTTGGGATCTATTAAACCATTCC CTCGTATTTCCCCTTTTTTTCTGTCTATTTCGATCTCTCACTTCCACTCGCTGCACTGTCCTGTTTCCACTAGCCCCACG AAGAATAATTGTGGAGAACACTCAATTGCACCTTTGCCTTTGGGTCATATGTATATGTGTGTGTGTGCACGTATATGTAT TGTCTATTATGGATCAAGAAAAATATGGTTCACAAGTTAAAATAGTTTACTTGATGAGGGACCCATAAGAAGTATGTTGT AAATAACATATACTAAATGTTACCTTTTATAACTAGTGAAGAGATGATTCATGTGAACTAATTTTTAACTTAGTCCACTA TAGAACTGCTCATATATAGCATTATGTACCTATATAAAGAAAAAAGTTATATTGACACCTCAAATTCTCACATCTAGAAA GAGATTAGAATATAAGGGAGAGAAATGAATGATATGATTGGTAATGCGTTAGAAAAGAAGAGGGAGACAGAAATAGAATG TGAGTGAAAATTGGACGGAAGAGAAAGTGAGGTGTGAATGTATCAAAACTATAATAAAATCTGTAATGTTCAAGGAAAAG TTTCCAACTTTTTTACATTTGTCTCTTAGAATGGCATGAATGTTAATTTTCAAATTTTAGTGGCTAATTTCATAATCATT AATGCTTTAACTCATTATTACTTACAGATTAATTAATGCTTAATTAATGATTAATTCACATTGACAGTTTCTATCTCCAT TCTCCTCATTCTGCTCATTTATTTCAGAGCTTTTGTTTGTTTCTATGCATTTGGGTTTTGAACAAAGGAAACTTCCCCTT CCTCTCTGACAATGGCATGAATATTAATTTGCAAATTAGTGTTTCATGAGAATTTCTGCTGAATTTAGTTAGGGCATGTG ACAGCCAGTTTCATATATTTGAGAGTTTTTTTTTTTGTCTATGTCTATGCATTTGGGTTTCATATCTGGAATTAAAAAAA GTACATCCTCTCAATGCTAGATAGTCTCTTCCAACCAAAGCGCTAATAATCCTTATGTTTTTGCTACTCAGAGGGAGCTA TATTATGCTTTTAACGAAAAATGACAAACTGGGTTCTAAAAGGATTCTTGCATGGACATCTGTTTTGAATGTTTGATGAG GTAAAATAATTCCTTTGTAGGTGATTTAATTTTCATTCGTGTTTAACTATTTTCCAGGGATAATTCTAGTGTTCCCATCC TTCCTCTTCAAAATTCTGCCTTTCTCCCCTAATTTTCTTTTGTGAGATTGACCTTAAGAGCTCGTTGTAGATGCAGTAAT TTACAGCTTGTCTCTGATAATGGCATGAATGTTATTTTGCAAATTTCAGTGGCTTATTTCATAAAAATTCATGCTGAATT CAGGGTAACTGACAGACAGTTTCTATCTCTACTCGTTCTGCTCATTTTGTGTGCTTTTGTTGCTGTCAATGCATTTGGGC CTTAAGTTAAGGAAACTTCTCCCTTTACGTTTGTCTCTGAAAATGACATGTGTGTTAATTTACAAATTTTAGGGGCTAAT TTAATAAAAATTCATGCTGAATCCAGGGTAACCGACAGAAAATTTCTATCTCTACTCATTCTGCTCATCTATTTTAGAGC TTTTGTTGTCTCTGTGCATTTGGGTTTTAAATCTGGAATCAAAGGTACCACTTCTCATGCAAAATAGACTCGTCCAACTG AAGCGCTAATCTTCCTTTTAGTTTTGCTTCTCTACGGAGCTACATTCCTGCTTTTTATAAACAATGGCTATGCCTATTCT GAAAGGACTCTTGCAAGAATACCTGATTTCATTGCTTGAGGAGGTAAAAACATTCTAGGTGATTTAGTTTTTATCCATGT TTAAGTGTTTGCCAGGGATCTCTCAAGTGTTCTCATCCTTCCTCTTCAAAATTCTGCCTTTGTTCCCTAATTTTCTTTTG TGAGGACTGAGGATGACCTAAAGTGCTCGTTGTAGATGGAGTGACTTACTGCTTTTCTCAGTATTTGAAAATTCAAATTA CATTTTAATTCCCTTCCTTTGAATTGTTTCAATATATTTTTTTCTTTCTAAAACTGGGATCAACTTCCAATGCAGAAAGT CAAGTGATTTAACTCTGTTTTGCATTTCAGGTGTACATGAATATAATCTTGTTCTGGTCTAGCACTTTTCTCCTGATTTT AAATCACTGTTTTGAAAGAATGTTCATATGTTTGACTGTGTTCTTTTCTTTCCATTACTTGCAGGGGGTAGTTAATAGTC AGTTTAATGCAATCTTGTGTCCGATAAACAACAGGGACCGAGCTCGAGATCATGCCGTGCAGCTAATAGAAACTTATTTG GCCGATGTTGATATGATCCTTTCTGAACTTTCTCTCCATGTGTAATGCTTCTGCTCATTTCATAGTTTTCTATTTTCAAG CTGATTATCTAACTAATTTTTCTTACTAGCCTTTTTATATTTACAGTGATAATTCACAAGTTGACCTCTATATGTTGGCT ACCCTAGCTCATGAAATACAGGATAAGAGCACCAGGTATATTGCAATTTCTATCTTACAGATATGCTGGGTCTTAAAACA GGCATCCTATTCAGACACTATGCATCTTGATAATTTTGACTGTGACAGTGAATGCCTGAACAAGGTAGATGTTTGTGAAA 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TGCTTTTCTTGAGTCCAATTTGGTCAAATAAATGCATAGATTGTCTCCAATGCTCCAGTTCCATCTCCCATCCATAGACG CCTTATGTTCCCTGTTTTGACCCTAGATCAATCTGATCCTCTCTAATCCTAAATGCTGTCAGTGTCTACCACCACCAGCC ATATTTGACTTTGCACGCTTTTGTGGTCTGAATTACAAACTCAAATTCTTTCCCTCCACACCCTCTTGAGTTTAAGGGGG CTTTTAGAGTAACTATTATAGCTAGGTATTTAATATATATTTAGTGTAATCAGCGTGTTATCTATATTTAATTATCTTTC CCAAACTCCTATATTGATTAATGATCTTTCCTTATTGTCAATATTTACCACTATATATTCTCTTGTATTCTATAAGAATT GCAAATAATATCTCTATATTCCTTCCATATAATTTTAACAAGGTCGTCCTATGTGTTTTGAAGTCAGTTCTTTCCTTTTT GTTCTGTAATTGTATCTTGATGTTGCCACATTCTCTTATTTTAATACCACAGTGCTTTGTTACATGCAAAAGCAAAACCT ATTATTGTTTTTCTATTAGAGCATAGACTAAATAGTTGTTTTACAATGTAAACATTTTTTGCTACTTGATTGACTCACTT GCACTTAAATTCAGAACTTCATTCGTGAAATGCTTATACATTTTCTATCGGGAAGCCATGATGTTATTGTCTTATGTTAT GTTGATGTAGTTCCAATCTAATTTTTGTTTCTGTACTTTATTGTTCAGATTTTCTCAAACCCTGACCTGGCTTAAACATG AGTTTGATAACACCAAGAACAAGTTGAGCTCCCTTGTTCAGGTATACTACATCACTTATTTTTTTGGATGACTTGTTATT TTGCATCTCAGTTGCAAAATCTACCCTAAAGAACATAACTGCATAAACTAGTACTTAAAAATGCACTTGGGGTGCTGACT 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0175000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTTGATGAGGGGGTAGTTAATAGTCAGTTTAATGCAATCTTGTGTCCGATAAACAACAGGGACCGAGCTCGAGATCA TGCCGTGCAGCTAATAGAAACTTATTTGGCCGATGTTGATATGATCCTTTCTGAACTTTCTCTCCATGTTGATAATTCAC AAGTTGACCTCTATATGTTGGCTACCCTAGCTCATGAAATACAGGATAAGAGCACCAGCATTGGTGCAGAGCATATGACT GTTGCATGTTTTGATGTCATTAAAGCTTGTGAGGAGCGGCGCAAAAAAAGATTTTCTCAAACCCTGACCTGGCTTAAACA TGAGTTTGATAACACCAAGAACAAGTTGAGCTCCCTTGTTCAGATGGAGAAGAGGATCGTCAGACTTGAGGAGAGTTCAC AACCACCTAACTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0175000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFDEGVVNSQFNAILCPINNRDRARDHAVQLIETYLADVDMILSELSLHVDNSQVDLYMLATLAHEIQDKSTSIGAEHMT VACFDVIKACEERRKKRFSQTLTWLKHEFDNTKNKLSSLVQMEKRIVRLEESSQPPN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 133 | 133 | 5.0E-52 | – | |
| PANTHER | 1 | 133 | 133 | 5.0E-52 | – | |
| Gene3D | 1 | 134 | 134 | 1.4E-24 | ||
| SUPERFAMILY | 22 | 126 | 105 | 3.97E-14 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Phosphorelay signal transduction system | A conserved series of molecular signals found in prokaryotes and eukaryotes; involves autophosphorylation of a histidine kinase and the transfer of the phosphate group to an aspartate that then acts as a phospho-donor to response regulator proteins. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0175000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…