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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0244000 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0244000.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | O-methyltransferase; TAIR: AT4G35160.1 O-methyltransferase family protein; Swiss-Prot: sp|B6VJS4|ROMT_VITVI Trans-resveratrol di-O-methyltransferase; TrEMBL-Plants: tr|G7JUY0|G7JUY0_MEDTR Orcinol O-methyltransferase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0244000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:39713510..39732032) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TACAAATTAAATGTTATTATTCTTATTATAATGTACATGATTGGAGATTGCATTATAAATTGACGCAAGTAAGGTCATGT TTCTACCAGAAAATTGAGCTAGTAGCATAGGTAGCAAAATTATGGAATTCTGTGGTGATGTTAATGCTACTAAACTATTT CAAGCTCAATCCCACGTATTCAATCACATTTTCAGTTTCATAAACTCTCTGTCCCTTAAATGTGCAATTGACTTGTGCAT ACCAGATATCATCCATAACTATGCTCAACCCATGCCACTTTCTAAACTCATTGCTTCTCTACCAATCCACCCCTCCAAAA CCAACAGCATCCATCGCTTGATGCGAATTTTGACCCATTCTGGATTCTTCACTCAGCAGAATGTCACTGAAAATGAGCTT GAAGTGAGGTATGAGCTAACCGATGCATCTAGACTACTAATTAAGCAAAACCACCCCTTTAATATGACCTCTTACATGAA TATTGTACTTGATCCAATTTTAGTTGAGCCATGGTATCAACTCTCTGCTTGGTTCAAAAATGAAGATCCTACACCTTTTT ACACAAAACATGGGATGTCATTATGGGAATATGCTGTCCATAACCCCAAACTCGGTCACAGATTCAACGATGCCATGGCT AGTGAAACTGGATTGACTTCCAGTGCGATCATGGAGAAGTGTAAGGGGGTGTTCAAGGGATTGGAGTCATTGGTTGATGT TGGTGGAGGCATAGGGACTATGGCTAAGGCTATTGCCAAATCATTCCCACAACTTCAATGCATTGTATTTGATCTTCCAC ATGTTGTTGCTGACTTGCAAGGAAGTGAAAACATAAAATATGTTGGAGGGGACATGTTTGAGGCAATTCCTCCAACCGAT TCCATTTTATTGAAGGTAAAACGTTGTTAATGGAACTTGATTTCTGTTTTGTGGTTTTCTGCATTTAAAAATAATTTTTA 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ATAAAATTCTAATACATAAATTAAAATATTTTTATCAATAATACATGTATATATGAAAACAAAGATTAATATTTAAAATT TATTAAAGGTTATGTTAATAATTTTAAAAGTTTACTTCACATTTTGAAAATTCTACACATTAACCTGTGAAACAGAAGAA TAAAAATCGAAATATTGAAGGTCGAACCGTGTATCTCAAAAAGTAATAAATGCTGTCTTTACACTAGGCCAGCGTGAAGT TTGTGTAGTATCCTACACATTATATTATATATAATAACTTAAG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0244000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAATTCTGTGGTGATGTTAATGCTACTAAACTATTTCAAGCTCAATCCCACGTATTCAATCACATTTTCAGTTTCAT AAACTCTCTGTCCCTTAAATGTGCAATTGACTTGTGCATACCAGATATCATCCATAACTATGCTCAACCCATGCCACTTT CTAAACTCATTGCTTCTCTACCAATCCACCCCTCCAAAACCAACAGCATCCATCGCTTGATGCGAATTTTGACCCATTCT GGATTCTTCACTCAGCAGAATGTCACTGAAAATGAGCTTGAAGTGAGGTATGAGCTAACCGATGCATCTAGACTACTAAT TAAGCAAAACCACCCCTTTAATATGACCTCTTACATGAATATTGTACTTGATCCAATTTTAGTTGAGCCATGGTATCAAC TCTCTGCTTGGTTCAAAAATGAAGATCCTACACCTTTTTACACAAAACATGGGATGTCATTATGGGAATATGCTGTCCAT AACCCCAAACTCGGTCACAGATTCAACGATGCCATGGCTAGTGAAACTGGATTGACTTCCAGTGCGATCATGGAGAAGTG TAAGGGGGTGTTCAAGGGATTGGAGTCATTGGTTGATGTTGGTGGAGGCATAGGGACTATGGCTAAGGCTATTGCCAAAT CATTCCCACAACTTCAATGCATTGTATTTGATCTTCCACATGTTGTTGCTGACTTGCAAGGAAGTGAAAACATAAAATAT GTTGGAGGGGACATGTTTGAGGCAATTCCTCCAACCGATTCCATTTTATTGAAGGGTGTATTACATGATTGGAACGATGA AGAATGCTTGAAAATACTGAAGAAATGCAAGGAGGCAATCTCAAGAAAAGGTAAAAAAGGAAAGGTGATCATCATCGATG TAGTGATCAGGAATGAGAAGGAAGATAGCGAGTCTTTTGAAACAAAGCTCTTCTATGATTTGGCAATGATGACATTAGTC GATGGGAAAGAGAGAAATGAGAAAGAATGGGCCAAACTTTTTTTCTCAGTAGGCTTCAGTGACTACAAGATAAGTCCAGC ATTAGGCTTCAAATCTCTCATTGAGGTTTATCCGTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0244000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEFCGDVNATKLFQAQSHVFNHIFSFINSLSLKCAIDLCIPDIIHNYAQPMPLSKLIASLPIHPSKTNSIHRLMRILTHS GFFTQQNVTENELEVRYELTDASRLLIKQNHPFNMTSYMNIVLDPILVEPWYQLSAWFKNEDPTPFYTKHGMSLWEYAVH NPKLGHRFNDAMASETGLTSSAIMEKCKGVFKGLESLVDVGGGIGTMAKAIAKSFPQLQCIVFDLPHVVADLQGSENIKY VGGDMFEAIPPTDSILLKGVLHDWNDEECLKILKKCKEAISRKGKKGKVIIIDVVIRNEKEDSESFETKLFYDLAMMTLV DGKERNEKEWAKLFFSVGFSDYKISPALGFKSLIEVYP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PIRSF | 4 | 358 | 355 | 8.0E-126 | ||
| Gene3D | 5 | 106 | 102 | 6.0E-34 | ||
| PANTHER | 8 | 358 | 351 | 7.7E-188 | – | |
| PANTHER | 8 | 358 | 351 | 7.7E-188 | – | |
| SUPERFAMILY | 11 | 110 | 100 | 3.71E-26 | ||
| ProSiteProfiles | 20 | 358 | 339 | 81.454 | ||
| Pfam | 31 | 78 | 48 | 3.5E-13 | ||
| Gene3D | 109 | 358 | 250 | 1.6E-81 | – | |
| SUPERFAMILY | 112 | 357 | 246 | 2.92E-57 | ||
| Pfam | 131 | 340 | 210 | 2.8E-58 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | O-methyltransferase activity | Catalysis of the transfer of a methyl group to the oxygen atom of an acceptor molecule. | ||
| Molecular function | Protein dimerization activity | The formation of a protein dimer, a macromolecular structure consists of two noncovalently associated identical or nonidentical subunits. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0244000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…