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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0279500 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0279500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | NDX1 homeobox protein; TAIR: AT4G03090.5 sequence-specific DNA binding transcription factor ATNDX; Swiss-Prot: sp|F4JI44|NDX_ARATH Nodulin homeobox; TrEMBL-Plants: tr|Q9ZRY3|Q9ZRY3_LOTJA NDX2 homeobox protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0279500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:55838367..55864939) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAAAACTTACTAAAGAAAAAAAAGAAGGAAGGTAAGGGGGACTGGGAAAAAAAAAACTCTCGCCTCTTCTCCCCGCAGG CCGCAACCGTTGATCGCTGCCTCGCCGTGAGGTTTTTTCACACTGCTCCCACTCACTCACACTGCATGCGACCTCTTCGT TAACATTTTTCACCTTCTCCGCCGTCACCGCCACCGCCACCGTCTACCACCACTCTTCTACTTTCAGGTTCTCTCTCGTT CCTCAATCGCCTATTTACTAGTTTCTACACATAATGCTTAAACATTTAATTTTTCATTCTATTTTTCCTCTCTTCAGTCT CCTCTACATGAAGTACTACAACCAACCCTGGCAGTGCTTCTCCAGTTCTCGCATTGCATCACCGTGCTCAACCTTCCATG ACGTTAATGCTTCGTCTTATGTTATGCATTTGTACTTGAAGTCAATGCTTTTCACATTTACAATGACATTATTTGATGAT TGATTTATTTTACTTTGATTTGTAATTCTTGTCCTTATTTTAATTTCTGCTTCAATTTCTTCTTTGGTTTTTAGGATTTA GGGACCTATAGTTCATGCTGAGCAATGATTTTCATTCCCAGGTGATGCCTGTTATGTTTTTGTTCTCGCGGCTGCGGAGC TTAGGGTGGTCCGCCGTAACCAATGTCTTCTATGGCATACACGGTACGTTCCTTACGACGAGTTCTTTTAGAATCTAACA TAAATTTTTCATTTCCTCCCACATGACAGTGTTAGAAGAGAGGACTACTTTAGGAAAATAATGTGTATATTTGGCCTATA ATTGTTATTGGTACTCTGAGGATATTATTGTAAACTTGGAGATTAAATTGGAGTTCATTGGTTTATATTGCATTCCGAAA CATGACATTTGATTATATTTCATGCATTTTAAAATCTGTTCTGAACATTTGGTACCAAAGCAGAAAAATGGATGATGAAG 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GATGTCAAACTGGTACCCTAAGAGCTTGGCGGCCCAGTTTTGTTGATCTCCAGTAGTGATTCTTTGATGGAGCAACTGGC GAAGACTTTTCTGATCTGTGTACACAGTGAACTGGCGTCCCAACAAATAGGGTCTCCAATGTTGCACCGCCAAGACGATT GCCATGATTTCCTTCTCATAGGCAGATTTGATCAAGTTCCTCTCACTCAAAGCCTTGCTAAAGTAAGCTATAGGCTTACT GTTCTGTAACAGGATTGCCCCTACGCCACTGCCAGAAGCATCGCTCTCAATTACAAAAGGCTGGGAAAAATCCGGTAATG CGAGAACAGGCTCTGTGATCATACATGTCTTCAGGGCTTCAAAAGCTTGTTGTGCCATGGGATTCCACTTGAATCCCTCC CGCTTCGTGAGGTCAGTAAGAGGCCGCGCAATTTTGCCATAGTCTTTGACAAATTTGCGATAGTACCCAGTGAGTCCCAG AAAACCTCGCACTCCTTTTACATTTTTTGGAACTGGCCACTCGATGATACTTTGCACTTTGCTGGGATCCATGGCAACTC CTTTATGAGAGACAATGTGCCCCAAATACTCTACGGACCCTTGGGCAAAAGAACACTTTTTGCGGTTGGCCACGAGTTTC TGCTCTCTCAAACGTTCCAGCACTGTTTTTAAGTGTTTCAAATGCAGGTTCCATTCAGAACTATACACTAAAATGTCATC AAAAAAGACCAATACACTACGCCTCAAGAGATCCCTGAAAACACCATTCATCAAAGCTTGAAAAGTCGCTGGAGCATTCA TTAATCCAAACGGCATCACCATGTATTCGTAATGTCCATCATGTGTGCGGAAAGCTGTTTTGTGAACGTCATCCTCCTTG ACTAACACTTGATGGTACCCGGATTTGAGATCCAATTTCGAGAAATAACGGGCTCCATGGAGTTCATCTAAAAGCTCATC AATCACCGGTATGGGATATTTGTCAGGAACGGTAACCTTATTCAGCTCTCGGTAATCCACGCACATCCTCCAAGACTTAT CCTTCTTCTTTACTAAAATAACAGGGCTTGAAAACGCACTTTGGCTGTGCCTAATGATTCCCAGTTGCAGCATATCCTTC ACCTGCTTTTCAATTTCATCTTTGTGATGATGAGAGTATCGGTATGGCCTGACATTAACAGGGCCTTGTCCAGGAACCAG AGTAATTTGATGCTCCTTTTGGCGTTTTGGGGGGAGGCCTTTGGGTGCAACAAACACATCTTCAAACGCAGCTAACAAAG ATGCCAACTGTTGACTTTGTTCCTCTGAAAGTGGTGTTGGTTCAGATGGTTGAGGGTTCAAAAACCCAAACTCTCCTGAG CCCTTGGCTGAGAGCTCGAATAGGCTTTGTAGAGCTAGTTGACTTGATTTTACCCCATTCAGGCCTTGCAAAAGTACCCA GGTCCCGTCCTGCAGGAACCTCATAGTCTGTTTGCTCCAATTCACGAGCATATCACCCAAAGTAGCGAGCCAAGTTATTC CCAGGACAAGATCAATTCCCTCGAGATCGAACAGTATAGTGTCCACTGACGCTTTGTAGTTCCCGATCTCTATGTCGACC TGCTCACACCTTCCACTAGCCATCACTTTACTTCCATCACCGAGCAAGATCTGCATCTCCAGCGTCGCATGCACGGTCCA TCCCATGGCTTCTGCTACTTGCTTGGAGATGAAATTATGAGTGGCCCCACTGTCCACCAGAATCAGGATAGGAACGCCTT GAAGAGTCCCTTGTAACTTTAGGGTATGAGCTTGAAGTGGCTCAGCCCCCAGCTTCATGATACTCAGCTCACCGTCAATC GCGGATGCTTCCTCTTCTTCCGTTGTGCCTGAGTCAGCGTCGTCGCCGCCGTCGTCCCCATCTTCCAACACCATGATCCT TAGCTGTCGATCGGAACACTGGTGGAGGGGATGGAATTTCCCCCCACATTTGAAGCACAAGCCCTTTTGTCGTCGGTCCA ACAACTCCTGGTATGGGAGGTGTCGTATTCCTCGATCTCGAGGGGCGGTGCGAACAGGAAGCTTATCCTCCTTCCGTTCT GCCTTATCTTCACGATTTTTCACCATGACCCAACCTTGCTGGTTGGACTCTCGACCCTGTGGGCCTGACCCGCTTGATGA AGAGTGGGCTGAACGGGTAAACGCACCCGACCCATAATTGGGCCGGTTCCCATATCCTTTTGACCCGTAAGAGGTCTGAC CCGGTCCATGTAACTCAGTCTCCACCGCCTTAGCCAGCGGAATCAGTCGTGATCGAGGAAGAGAAGCGAGAGCTCTCATG CTGCGCACACGAGCTCGGATATCTTCCCGGAGCCCATGGATGAAATAGCCAAAGTACTGCTCATCAGGCAGATTTGGCGT ATGGGATAATAAGCGTTCAAACTCCAACACATAATCATCGACGGAGCCTCTCTGCTGAAGATCCAAGAGCTGCTCATAGA CATCGCCTTTGTTGGCGGTTCCATAGCGCTCGAGTAACTCATTGGTGAGTTTTGCCCAAGACAAATCAGGATCCAGATGC AGGAGCGAATTGAAATAATGGACCGTCGATCCCTCCATGCACAAGTGAGCTAAATTCACCTTAACTTCTGGACTTGTTCC CATTATATGGAAATAAACCTCTGCACGAGCAATCCAGCCTGCAGGGTCTTCTCCATTGAACATGGGAAGCTCAACTTTCT TTGCAGACTTATGGAATTCATCCAGCAAACCCCCATCGAGTTTGTTCCAACCTGAAACGCCGGAAGAGCTTCCTGGCTCT GTTCCAGATCTGAGTGGGGTGGTGGTGTCTCGCACACTCCCAGAATCGTTGAGTTCCACCGTTTGTTTGGAGAATCGTTG AGTCAACAGGTCCAGCAAGCGAGCTTGGTTGCTCTCTGCCTGTTCCTGCATCGTCACGAGTGTAGTGCGGAGGTTAATAA CCTCGGTCTCAAGTGCTGCAACCTTAGCCTCCATCTTCTTCGCCGGTGGCATTCGTTGTCACCGGAGCAAGTGTTGATTG CTGGTAACCGTCTCGTAAAAGGGATCCGGCAGGTCGGACCAATTTGATAAGAACCAATGTAACAGTAGCGTGAATTAGGA ATGGAAAGTGAACAAGTACTATTTAAAGGAAATAAAAGGGAACAAATGCAGAAGCAGAGCTTCTACCCCAGAGTACAATA CTCCTATAGAGAGGATGATGCTCTCTACTCTAATGATAACTAACTAATTCTCTCCATACCCCCCTCATGCTAACAGCCAA CCTATATGAGGAATCTTACACCCGCTCTCCTCACCCTCACTCCGTAAAACCCGTAACCAACTCTTAGCCTAAACCATCTC TCACTTCCAGCTCAGCACTACTCAATGATTCCTTCCTTTTTCTTCCTTCTGACATAGACTTGCCAAACTTTGGGCCTAGC CTCACTCTTTGCAGCCCGATTGTTCAATGCAGCCCCATCATATTCTTCTTGCAAACCATACTGAATAAAGAAGAAGTGGC TCGTCCTTGACAGAGCATCTTCAAACTTTAGGTTTCTTAAGAAAATACTTGCTTGATTTTATTCAATACTGAAATCCCCT TTTATAATAAGGGTTGAGTACAAGAGAAGTAATCTAAATTAACCTATTTCTAATAAAATAAGAAACAACCAAATCTTATC TAATAAAGGAAAACAATATCATAACTAATTAAGATATAATAATTCCTAACTAATAAAGATATATAATAAAGTAGAAATAT CCTAAATTAACCTAACTTATCAAATCTGCCCTAAAATCAGCAACCGTATCAGTATGCAGTATGAATTTGTGCCATTAAGC ACATTAATGTCTTTTATTATCAGATTCTTGATTTTAATATAGTTCTCATGGTGTAGGTCTTTGACTTGTTGAAAAAAGCT TTTGATAGAGATCCTGGGCACATCCCTACTGACCAAAGTCATCCAATGGGGCTTGTACAGCTCAATGCAATGCGTCTAGT TGAAATCTTCTCTGATGATTCAAACTTTCGATCCTACATGACACTTTGTTTTGTAAGTCTATCCTTTTAAGATTATCGAG AGTTAACTTGATTTAGTACTAAAGAATTCACACCCAACGTGCCACAAATATTTTTACATGTAGTAGCAATGTTCTGTTTC CTTTCTAAAATTATACCAAATTTAATTCAAAAGAAGGTGATAAAATCTTATTCAACTATGTAGCCAATGCATTGTATGCG TCTTCTTTGATTTGTCAGATGTGCATTCTATGATTGGAAATTGGGTTGTTTCATTTGCATGTGATTCAGGCTAAAGTTCT TACAGCTGTAATTTCACTCTCCCATGGAGATTTTTTGTCCTGTTGGTGTTCATCTAATCTCCCAGAGACAGAGGAGGATG CAAGCCTTGAATATGATATATTTGCTGCAGTTGGATGGATTTTGGATAATACTTCACCTGATGTAAGGAAGGTCACAGAT TTGGAATTCAATCTAATCCCTATAACAATGCCCAGGGCTTCTTTTGCTCATCATAGGACATCATTATTTGTGAAATTCTT TGCAAATCTTCACTGTTTTGTTCCCAACATATGTGAAGGTCGGTTCATTGTCTACATTCTATACATTTTTATGCCAAATT TGATTGTTCTACGGAGATATTATCCTCATATCACCCCCCCCCCCTTGTAATTTTGATCCTCAGAACAGGAAAGGAACCTT TTCGTTCTCAAGGTCTTGGAGTGCTTGCAAATGGATCAAACCAACTTGCTGCCTGGGTTTTCTTTTGCTTCTGATACTCC TACTGCCTGGAAGAACCTCCGTAATGATTGATCTCATATAACTCTTCTTGTAGAATTATGAGCAATGTATGGCTACTTTC TCACAAGTAACCTCCTTTTGTAGGCTCGTTGATAAGTCATGCCGAATCTTTGATTCCAACCTTCTTAAATGCGGAGGATG TGCGACTTTTAAGGTTATGCCTCCCTTTGTTAAATTTCGCTGTATCACTTGACACTTTTACTTCCGCATGACTGATTTTT AACTGTTGTGTCAATGGTTAATCATGTGTTAGTCATGTATATACAATACTTCATGAATGAGCATTATGGCAGCCCCTTAT GCCACTAAACATTGAAACCAGTTTTTCAAAGCTCTTGAGGAATAATGCCTTCTTGATTTTTTTAAGTGTTTTTGAGGATG ATATTGAAGAAAGTTTTTGTTTTTGTTCCCTTTCCTAGAAAGGAGAGTGATAAGTATGGAAAGAATATTGAAATTTACTT TATAAAGAAGAGAGATCAATTCTCTAGATAGTCACCATACATAGGCTGGAATTTGAGAGTCAGTTCTCTCCCAACCAAAT AACTTCCGAATTTAGTCACCATACATAGCCTGGAATTCGAGAGTCAGTTCTTTCCCAACCAAATAACTTCCGAATTTTCT GATATCCAAACTATTTCACCCCCCCTATATTTATAACTACCCACAACCAGTTTTATAATACATAACTGTAACAACAACTA ACAAATAACTGCCTCAGTGGCTTGCTGACCGCGCCCCCTGCCCTTTGTCAGCCACTGCACCAGTGGTGGATGCACCGCCG GTGGCGGTCTTCCCTGTTGTCGCTGGCTTTGGGTTCCGGCGGCTGTAGACCTTAATGACTGGGGGTTCCCACTGGCAAGT AAGGTAGATCAAATGGCGAATGATCCAGGTAGAGATAGGAGACCAATAAAAATTATAATCCAAACCATCACAGGAGATTT AGAATTAAATGATTTATTGTCGAGTTTAATTCATGACAACATTTATGATGTCATTTGATCCATGTAGCCGGCTCCACCTA GTGGGAAAAGCTTTTGCTGTTGTTTATGCTGTAATCGTTTAACTCCTAAAATATTATCCAGCATTAAACTGTCATCTGTA TCATGTTTAAATAAAATACTTCTATTTGTACTGTTTTTTGCAGGGCGTTTTTTAGTGAATTGCAATCACTGTTTATTTCT GCTGGATTTAAGCAAAATCATGTTCAAGTAAATCTTTGTCCCTTTGATTTGAGCTGTTAATATTGTTTTTTTCTTTCTTT TTCTCCTCTACTCATGTCCTTTCTTTTTATGTGTATAAATTTGTCCATATCATACTGAAAAAACTGAGGATAGTAATTTG AGGAGTCCTTGTCTTGGGATAAGTTTTATAAACTCAACATTAATGAAAATTATCAAATATTTGCATGGTTTTATTTTTTA TGAACACATTAATGATCAATTCGTAGCTACCTACATGTTTGTTCAGAATTGCAATTTGAAGTATGCCTACTTTAGTCTGG AAAATGCCTTCAACTGTTGCATAACAAAATTAACCAATTCTCAAACTATATTATATGGTTACCATGTAGCTTCTCCTCAA CATAGTGACTTGAAATGTGAAGTTTGATTTCCTGTAGGAGGCTCAGAAGGGTGGTAACTTAAAGGAAAGAATCTCCAAGA ACTCTGCATTTCCAGACATGGACCAAGTCCAACATCATACCAGAGCTTATGACACAAATGAAGGCAATGGAAATAGGCAG AATCAGGTAGAAACTAAAGGTATCTCGGGTAAAACTGCATCAGGACGAGCAAGAAATATAGACAAGGATGCTCCGAAAAT TGAAACAAGTGGTTCAGATACTAGTTCTGCTAAAGGAAAGAATGTTGTTGACCATATGGATAGTAGTGAACTATCAAAGC 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ATGCTAGTTCTCCGTGATTTGGTCATTGCTACTCAGGTCAATATGTCGTGCTTATTGGTGAGCGATCAGAGGAGATTGGC AGAGGAAAGGTGTTTCAGATGCACGGTATGTGGCATGGGATGAGTTTGGATGAATTTGCAATCTGTGTTGTGGATGTTTA TGAGCTTAAGGTTGATAACGGGTCGTGGCTACTCTACCCATCAGAAGCCACCGGCACCACATTTGCAGACGCTGAAGAAA AGTTAGGTGTCATGAGAGTGTTATGGGATTTGAGCAGAGTCTTTGTGTTGCGATTATAATGAGTTTACTATGCTTCAGTG GTTGCAGCTGTTCCTTTGCAACCCGCTGCAATCTTCACCAATCTTCCTTGCGCTTCCCTGTATGCCGTGGACATTATTAG CTGAGAAGAACAAACATACCAAATAGAAAGATAGTTTTAGGATGTATGAATAAAAGCCTTAGGTGGCACCAAAAGTAGTT AAGGTCTGTCTGATTACTACAGTTTTTAATTTTTCAAAACAGGAAGAAAAACTCATTTCATATGAACTGTTATTAAAATC TGTCCTTAATTTTATTTTATTTTATTTTAAATTAAAATCCCAAAATGTACCCAAAACATTTTCTACTTTTTGTTTTAGTC TTCTAGTCACAGG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0279500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGGATTGCTAAGGAGGAACCATCAAGCAATGCTTCTCAGGCAATAGGCTTGATATCCATTGTGAAGGAATTGCAAGG GGTTACCTCTAGGGAGCTTAATAAATTATTGAGGGACTCTTCAACTTTTACCATTCACTACTTTACTGAAAAAGGATCTC TGCTGAAGATTGATATGGAAAAGCTTGCCGGGTCTCTTCCATTGCACCTTGTTTTAGTACTAATGTCAGATGATGGAGGT GAAGCCAAGTTCAGATACTTATTATGTGGCGTTCGACTCTTGCATTCCTTGTGTGATTTAGCGTCCCGAAATTATAAATT CGAGCAGATTTTTCTGGGTGATGCTAAAGTGGCGGAACAGCTGCTTGACTTGGTTTTCTACACGCTAATTGGTCTTGGTG GTTACAGACAGGAAGACCATGCTCCTAATCATATGGACCTTATGAGTTCAACTCTTGTTGCGTGCAATTTATATCTATTA ACAGGGTTTTTATCGCCACAGTGGCAAGAAATGGTTCCTGTGTTGCTTGAGCACCCCAAGGTTGACGTATTTATAGATGC AGCTTTTGGATCAGTTCGAATGGTTGTTAGGTGTCTTGAGAATACACTGGCAGCTTATTATAAGGATATTTCCATAGAAC CAAGTCTGACTGCTGAACGAGTTGTTTATTATCTCTGCCAGCAGTGTGAAGCTTCTCTGCAGTTTATTCAGTCACTATGT CAACAAAAACTATTTATGGAGCGCCTGCTTAAGAATAAGGAATTATGTGGAAAGGGGAGCATTCTTTTTCTTGCTCAGTC CATCTTAAAGCTACACATTCAACCATCTTTTACAAATAGAATCATGGCAGCTATTTCAAGGCTAAAAGCTAAAACACTAT CAATTCTTCTGAGTTTGTGTGAAGCGGAAAGAATTTCTTACCTTGATGAAGTCGCCAGCTCAACACAAAGTTTAGATTTG GCTAAATCTGTTGCTTTAGAGGTCTTTGACTTGTTGAAAAAAGCTTTTGATAGAGATCCTGGGCACATCCCTACTGACCA AAGTCATCCAATGGGGCTTGTACAGCTCAATGCAATGCGTCTAGTTGAAATCTTCTCTGATGATTCAAACTTTCGATCCT ACATGACACTTTGTTTTGCTAAAGTTCTTACAGCTGTAATTTCACTCTCCCATGGAGATTTTTTGTCCTGTTGGTGTTCA TCTAATCTCCCAGAGACAGAGGAGGATGCAAGCCTTGAATATGATATATTTGCTGCAGTTGGATGGATTTTGGATAATAC TTCACCTGATGTAAGGAAGGTCACAGATTTGGAATTCAATCTAATCCCTATAACAATGCCCAGGGCTTCTTTTGCTCATC ATAGGACATCATTATTTGTGAAATTCTTTGCAAATCTTCACTGTTTTGTTCCCAACATATGTGAAGAACAGGAAAGGAAC CTTTTCGTTCTCAAGGTCTTGGAGTGCTTGCAAATGGATCAAACCAACTTGCTGCCTGGGTTTTCTTTTGCTTCTGATAC TCCTACTGCCTGGAAGAACCTCCGCTCGTTGATAAGTCATGCCGAATCTTTGATTCCAACCTTCTTAAATGCGGAGGATG TGCGACTTTTAAGGGCGTTTTTTAGTGAATTGCAATCACTGTTTATTTCTGCTGGATTTAAGCAAAATCATGTTCAAGAG GCTCAGAAGGGTGGTAACTTAAAGGAAAGAATCTCCAAGAACTCTGCATTTCCAGACATGGACCAAGTCCAACATCATAC CAGAGCTTATGACACAAATGAAGGCAATGGAAATAGGCAGAATCAGGTAGAAACTAAAGGTATCTCGGGTAAAACTGCAT CAGGACGAGCAAGAAATATAGACAAGGATGCTCCGAAAATTGAAACAAGTGGTTCAGATACTAGTTCTGCTAAAGGAAAG AATGTTGTTGACCATATGGATAGTAGTGAACTATCAAAGCCAAATGAAAAGATTGAACTTGCACTGAGGAAAACACGAAA GCGAACTATAATGAATGATGAACAGGTGTTACTGATTGAGAAGGCACTCTTAAATGAGCCTGATATGCAGCGTAATGCAG CTTCACTTCAATCATGGGCTGATAAATTAAGTGCTCATGGTTCTGAGGTTACATCTTCACAGCTTAAAAACTGGTTGAAC AATCGAAAGGCTAGGCTAGCTCGCACGCGTAAGGATGTTCGACCAGTAGCAGCCAATGTTGACAATCCAGTTGCAGACAA GCAAAAAAGGCCACTATTGGGGTTGTATGGCTCACCAGACAGTGCAGGTCAATATGTCGTGCTTATTGGTGAGCGATCAG AGGAGATTGGCAGAGGAAAGGTGTTTCAGATGCACGGTATGTGGCATGGGATGAGTTTGGATGAATTTGCAATCTGTGTT GTGGATGTTTATGAGCTTAAGGTTGATAACGGGTCGTGGCTACTCTACCCATCAGAAGCCACCGGCACCACATTTGCAGA CGCTGAAGAAAAGTTAGGTGTCATGAGAGTGTTATGGGATTTGAGCAGAGTCTTTGTGTTGCGATTATAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0279500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRIAKEEPSSNASQAIGLISIVKELQGVTSRELNKLLRDSSTFTIHYFTEKGSLLKIDMEKLAGSLPLHLVLVLMSDDGG EAKFRYLLCGVRLLHSLCDLASRNYKFEQIFLGDAKVAEQLLDLVFYTLIGLGGYRQEDHAPNHMDLMSSTLVACNLYLL TGFLSPQWQEMVPVLLEHPKVDVFIDAAFGSVRMVVRCLENTLAAYYKDISIEPSLTAERVVYYLCQQCEASLQFIQSLC QQKLFMERLLKNKELCGKGSILFLAQSILKLHIQPSFTNRIMAAISRLKAKTLSILLSLCEAERISYLDEVASSTQSLDL AKSVALEVFDLLKKAFDRDPGHIPTDQSHPMGLVQLNAMRLVEIFSDDSNFRSYMTLCFAKVLTAVISLSHGDFLSCWCS SNLPETEEDASLEYDIFAAVGWILDNTSPDVRKVTDLEFNLIPITMPRASFAHHRTSLFVKFFANLHCFVPNICEEQERN LFVLKVLECLQMDQTNLLPGFSFASDTPTAWKNLRSLISHAESLIPTFLNAEDVRLLRAFFSELQSLFISAGFKQNHVQE AQKGGNLKERISKNSAFPDMDQVQHHTRAYDTNEGNGNRQNQVETKGISGKTASGRARNIDKDAPKIETSGSDTSSAKGK NVVDHMDSSELSKPNEKIELALRKTRKRTIMNDEQVLLIEKALLNEPDMQRNAASLQSWADKLSAHGSEVTSSQLKNWLN NRKARLARTRKDVRPVAANVDNPVADKQKRPLLGLYGSPDSAGQYVVLIGERSEEIGRGKVFQMHGMWHGMSLDEFAICV VDVYELKVDNGSWLLYPSEATGTTFADAEEKLGVMRVLWDLSRVFVLRL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 11 | 763 | 753 | 0.0 | ||
| MobiDBLite | 589 | 609 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 589 | 651 | 63 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 662 | 729 | 68 | 10.009 | ||
| SMART | 664 | 733 | 70 | 0.002 | ||
| CDD | 666 | 730 | 65 | 0.00163381 | ||
| PANTHER | 762 | 844 | 83 | 0.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | Single-stranded DNA binding | Interacting selectively and non-covalently with single-stranded DNA. | ||
| Biological process | Flower development | The process whose specific outcome is the progression of the flower over time, from its formation to the mature structure. The flower is the reproductive structure in a plant, and its development begins with the transition of the vegetative or inflorescence meristem into a floral meristem. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0279500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…