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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0299000 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0299000.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Dedicator of cytokinesis; TAIR: AT4G16340.1 guanyl-nucleotide exchange factors;GTPase binding;GTP binding protein; Swiss-Prot: sp|Q8SAB7|SPK1_ARATH Guanine nucleotide exchange factor SPIKE 1; TrEMBL-Plants: tr|K7MCT0|K7MCT0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0299000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:62229635..62256352) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAAGAGACATGAGGTCCGACACCTCTTCCATATGAACCCTCTTTGGCGTTTTCTCCCAACAGACTTGTTTTGACTCATT TCTCTTCTCACTTCTCAGCACCACTTGCATTCATTCAGGTACCAACTCCTCTTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCT CTCTTTCTCTCTCTAGCTTTCTCTCTCTAACCCAATCTTCACAATGCTCATTCCTCTGCTTCCAGATCCAGCGAATGCTC CTGCTCCTGCACTGTGATACCTGAACGTCGTCGCTTCTCGTCGTGGTTCTCGAGTTTCCGATCCCCGCCGGTGGAGAAAC CCTAGATCCGCGATGCTGCATCTCCGGCACCGCCGGGATTCCACTCCGGCCACCACCAGGTGGCGGAATAAGGTAGGTAG CGGTGTTTTCCATTTTTTACTCCTTGCTCTTGGAATGCGCAAGACGGTGACGTTTTCTGCTTCGGTTTTTTGTTTTTGTG TAGTTTGATGAGAATCTGGAGCAATGGCCGCATCTCAATGAGCTGGTTCATTGCTACACCACGGATTGGGTCAAGGATGA GAACAAGTACGGCCACTACGACAGCATCGGAGCGCCGTCGTTTCAGAATCAGATATATGAGGGCCCTGACACTGACATTG AGACTGGTATTTCGCTTTTTCTCATTTCCTGTTTTCAATTTTCGTATTAGCTACTGCATTTTGAAAAGGGTTTGAAAAAC ACGTGTTGGAGTGTTGGGAGAGTGCATGTTGTGAATGTGAATGGCCTTATTTGCTTGAAGTATATTAATGGCACGTGGAT GAGTTCTGGGTTGTGTTAATTAGTGATTAATGATTGCGGCGCGAAGTTTTTTTTTAAGTAAGAATTTAATGGTTATGCAG AAATGCGGCTTGCTAGTGCGAGACGAACGAAGGGGGAAGATATTAGTGAAGATGATGTCCCTAGTACTTCGGGAAGGCAG 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Protein sequence (LotjaGi3g1v0299000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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| ProSiteProfiles | 1378 | 1827 | 450 | 54.662 | ||
| Gene3D | 1379 | 1532 | 154 | 1.7E-32 | ||
| CDD | 1385 | 1818 | 434 | 1.37019E-115 | – | |
| Gene3D | 1697 | 1824 | 128 | 9.2E-28 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Guanyl-nucleotide exchange factor activity | Stimulates the exchange of guanyl nucleotides associated with a GTPase. Under normal cellular physiological conditions, the concentration of GTP is higher than that of GDP, favoring the replacement of GDP by GTP in association with the GTPase. | ||
| Biological process | Small GTPase mediated signal transduction | Any series of molecular signals in which a small monomeric GTPase relays one or more of the signals. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0299000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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