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LotjaGi3g1v0299000.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0299000
Transcript ID LotjaGi3g1v0299000.2
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Dedicator of cytokinesis; TAIR: AT4G16340.1 guanyl-nucleotide exchange factors;GTPase binding;GTP binding protein; Swiss-Prot: sp|Q8SAB7|SPK1_ARATH Guanine nucleotide exchange factor SPIKE 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0IQP1|A0A0R0IQP1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0299000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:62229967..62255879) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGCTGCATCTCCGGCACCGCCGGGATTCCACTCCGGCCACCACCAGGTGGCGGAATAAGGTAGGTAGCGGTGTTTTCCA TTTTTTACTCCTTGCTCTTGGAATGCGCAAGACGGTGACGTTTTCTGCTTCGGTTTTTTGTTTTTGTGTAGTTTGATGAG AATCTGGAGCAATGGCCGCATCTCAATGAGCTGGTTCATTGCTACACCACGGATTGGGTCAAGGATGAGAACAAGTACGG CCACTACGACAGCATCGGAGCGCCGTCGTTTCAGAATCAGATATATGAGGGCCCTGACACTGACATTGAGACTGGTATTT CGCTTTTTCTCATTTCCTGTTTTCAATTTTCGTATTAGCTACTGCATTTTGAAAAGGGTTTGAAAAACACGTGTTGGAGT GTTGGGAGAGTGCATGTTGTGAATGTGAATGGCCTTATTTGCTTGAAGTATATTAATGGCACGTGGATGAGTTCTGGGTT GTGTTAATTAGTGATTAATGATTGCGGCGCGAAGTTTTTTTTTAAGTAAGAATTTAATGGTTATGCAGAAATGCGGCTTG CTAGTGCGAGACGAACGAAGGGGGAAGATATTAGTGAAGATGATGTCCCTAGTACTTCGGGAAGGCAGTTTATGGAAGCC GCTGATGGAGAACATTCGGATATTCCAAAGGTTCATTGGTTTAATTCGTGTTTTAATTCCGTTGGACGGTTCCCTGCCAG CTTGTTTTCAGAGTTTGTGGTTTATTATGTATTGAAAAGCAAATATTAGTGCTGATCTTGTTTAGCTTCTAATTTTTTTG TTCTTTTAATAACTTCATGTACAGCATTTTAGTCAATCTCCGCTTCCTGCTTATGAGCCGGCATTTGATTGGGAAAATGA GCGCTCATTGATATTTGGGCAGAGGATACCGGAAACTCCCATATCACAGTATGGCATTCCTGCGACGTTGTTTCCGAGTC 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AACTGAACACGCACATATGAAGAGCCTCAAAACACACTTGTCACACCCAATGCTGGACATTTGAAGCATGTGGTTCATTT ATAGGTGGCCTGTGGCCCAATAAACAGACTCTGATACCATGTTAGAATTTGGCTCTGATACCTCAAAGCTAGGTTTTTGG GTAGAGTTGGACCTAGTCCAAATTCTAAGATGATATCAGAGCCTTCCTATGCTCTCTGATACCCTGTTTTAAATTTTATG TTTAACTCTCAAGAAGGAGGTAGAAATAAAGCTGCCAGTTCTGGATGCTCATCTGTTTAAGGATGTATTCCTGATCATTG TGAACCTTTTTAATGGGCATCAATTTCAATACTAAGTGTAATCTTATTGTTCCAGGGCCCTGTGATGACTATGGATAGAT ATGCTACTGCTGAAAGCTTCTATAAATTGGCAATGGCATTTGCTCCAGTTCCTGATCTTCACATAATGTGGCTGCTTCAT CTATGTGATGCGCATCAGGAAATGCAGTCATGGGCAGAAGCTGCTCAGTGTGCCGTTGCCGTTGCTGGTGTTGTGATGCA GGTAAAGACATGATTTATTTATGCATAAAGAATGCAGACTAGGAATTTTCATGATGCATAAATTATATTGATGGGCATAT TCTAGGCTCAGCTAAACATTAAATGCCAGTGTGATTAATAATTACTTTTTTTTACCTGGTGTATGTAGTCATGTTTTTCT AATTCTGGTTGTTTGTTAATGTTCTTTTCGGATTGGGTAAACTGTGACTAGACAAAACATGATTGTTGAATCAGGACAGA TACAAACTTTTGGTTACAATCGAAAGACAAATTTAGTACATTATTCCCAATTCTCCTTCAGTTAGCGAGTTATAGTGTTT CCAACTGGACAGCTCAAATTATCAATGCCCGGAAAATGAATATTTTTACTTTTTTCCCCCTTGCCTAAAGCTTTAGCTGT 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CATTTAACTCTATCAATGTTTTTTTTTTCTATCAGTAGTAGTTGATAAGTCTCACGTTGACTAGAGATATGGTTAACATA GTCCTTATGAAGGTTAGAACTTAGAACAACCCTCACCCATAAACCTAGTCCTTATGAACGTTAAAACAACCCTCACCTAT AAACTAGCTTTCGGTGTAGAGTTAGGCCTAACCCAAATTTTAAGATTATATCACACCTATCCTAGATCCGTTTATTGGAG AGCACCCATATATGGGACCCATAGATGATCTGCAAATTTCACGCTCCAGATGCTCGGCCCTAGGTTTTAGGAGTGCTGTT GAGAAGATCCCCATTGTTCTCAAGTTAAAACAATTGTCACCCAGAACTCACCCTTGAGCTAACTTTTGGGGTAGAGTTTG ACCTAACTCAAATTTTAAGAGTAGCCATTGATTCCATATTAGACCTCATTATCTTATTTCTTATTCTTCATTGTTGTGAT CTGATTTATATAGCAACACTTTTTTTATGAGCTTCACACTTACTCTGTTACTATGTTTGATGCAGGCCCTTGTTGCCAGA AATGATGGTGTTTGGAGCAAAGACCATGTTGCTTCATTACGTAAGATTTGTCCCATGGTCAGCAGTGAGATCACATCTGA AGCATCTGCTGCAGAGGTAGAGGGATATGGTGCTTCAAAACTGACAGTTGACTCTGCTGTGAAGTACCTGCAGCTTGCTA ATAAGCTCTTTTCACAAGCTGAGCTTTTTCATTTTTGTGCAAGCATTCTGGAACTTGTAATTCCAGTTTACAAAAGCAGG AGGGCTTATGGACAGCTAGCTAAATGTCACACATTACTTACCACAATCTATGAGTCGATACTTGAACAGGAATCTAGTCC AATTCCTTTTACTGATGCAACATACTACAGAGTTGGATTTTACGGTGATAGATTTGGAAAACTTGACAAAAAGGAATATA TATATCGGGAGCCACGTGATGTGCGTCTAGGGGATATAATGGAAAAGCTTAGTCACATATACGAGTCTAGAATGGATGGT AATCATACTTTGCACATTATTCCAGATTCTAGGCAAGTGAAGGCAGAGGAGTTACAGCCTGGTGTCTGCTACCTTCAGAT TACTGCCGTTGATGCAGTCATGGAAGATGAAGATTTAGGAAGTAGAAGAGAAAGAATTTTTTCTCTTTCTACTGGAAGTG TCCGTGCTCGTGTGTTTGACCGTTTCTTGTTTGATACCCCATTTACAAAAAATGGCAAGACTCAAGGTGGATTGGAAGAT CAATGGAAGAGACGCACTGTTCTTCAGACCGAGGGTTCATTTCCAGCTTTAGTAAATAGGCTAGTGGTAATCAAATCTGA GTCCCTTGAATTTTCGCCTGTAGAAAATGCAATTGGAATGATTGAAACGCGAACAGCTGCATTAAGAAATGAGCTTGAAG AGCCTCGAAGTTCTGAGGGGGATCAACTTCCACGACTCCAGAGTCTACAAAGAATCCTTCAAGGCAGTGTTGCAGTACAA GTATGTTGTAGTATTGGTTCTTATTACCTATCATATGCAATATGCATTTTGGTTGCTAAATGAGCTAAAATCCAGATATG AACATTGGATGCTTTACTTTAGGTTTCTCAATTCTGACAGCCACTGCTTTTTGTGCAGGTGAATAGTGGGGTTTTGAGTG TTTGCACAGCCTTCTTGTCTGGGGAGCCTGCAACAAGGTTGCGATCACAGGAACTGCAGCAACTTATAGCTGCTCTTCTT GAGTTCATGGCTGTATGTAAACGTGCCATCCGGGTACATTTCAGATTGATTGGTGAGGAAGATCAGGATTTCCATACGCA ACTTGTAAATGGATTTCAGTCTCTAACAGCCGAGTTATCGCACTACATTCCTGCCATTCTCTCAGAGCTATGA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0299000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTGCATCTCCGGCACCGCCGGGATTCCACTCCGGCCACCACCAGGTGGCGGAATAAGTTTGATGAGAATCTGGAGCA ATGGCCGCATCTCAATGAGCTGGTTCATTGCTACACCACGGATTGGGTCAAGGATGAGAACAAGTACGGCCACTACGACA GCATCGGAGCGCCGTCGTTTCAGAATCAGATATATGAGGGCCCTGACACTGACATTGAGACTGAAATGCGGCTTGCTAGT GCGAGACGAACGAAGGGGGAAGATATTAGTGAAGATGATGTCCCTAGTACTTCGGGAAGGCAGTTTATGGAAGCCGCTGA TGGAGAACATTCGGATATTCCAAAGCATTTTAGTCAATCTCCGCTTCCTGCTTATGAGCCGGCATTTGATTGGGAAAATG AGCGCTCATTGATATTTGGGCAGAGGATACCGGAAACTCCCATATCACATGGAATGAAGATCTCTGTAAAAATTCAGTCT TTACAATTTCAAGCAGGATTAGCTGAGCCCTTTTATGGCACAATTTGCTTATACAATAGGGAGAGAAGAGAAAAATTATC AGAAGACTTCTACTTTCATGTCTTACTGACTGAAATGCGGGATGCAAAAGTTACCTATGAACCTCGTGCAGTGTTTTACT TAGATGCGCCATCTGCTTCAGTTTGTTTGTTAATCCAGTTAGAGAAGCATACTACTGAAGAGGGCGGGGTTACTCCTTCT GTTTATTCACGCAAAGATCCAGTTCACTTGACTGAGAGAGAGAAGCAAAAATTGCAGGTGTGGTCTCAAATCATGCCTTA CAAAGAGTCCTTCGCATGGACTATTGTATCATTATTTGATAGCAGTGTTGGTACAGCTTCGGTAGGGCCTGCTTCTCCGA GCAGCCCTCTTGCTCCAAGTGTATCTGGTTCAAGTTCCCATGAAGGTGTTTTTGAGACTACTTCAAAAATCTCTTTAGAT GGAAAACTGAGTTACTCGAATGGAAATTCTGTTGTAGTTGAGGTTTCAAACTTAAATAAAGTCAAAGAAAGCTATACTGA GGAATCACTACAGGATCCCAAGCGTAAACTGCATAAACCTGTCAAAGGTGTTTTGAAACTGGAAATTGAAAAGCACAAGA TATCGCCAGCTGATTTGGAAAATGTGTCAGAAAATGGTAGCACTACCAATGATTCTGTTGACCCAGGGGATCGCATTGCA GATTCACTGGCCGGAAAGTATCCTAGTAATGGTTGTGATGATCCTCAGGGTAGTAATGGGAAAGAAGTTTCGGGCAATGG ATCAAATCAACATGGAAATTCAGATTCTTATGCTGATGATTTCCATGCTTTTGACTTCCGCACTACAACAAGAAACGAGC CTTTTTTGCAACTTTTTCACTGCCTGTATGTGTATCCGTTGACTGTAAGTTTGGGTAGGAAAAGGAATTTGTTCATACGG GTTGAACTCAGGGAGGATGATGCTGATATTCGTAGACAGCCATTGGAGGCAGTGTATCCTAGAGATCCAAGTCTAGATGC ATCATTTCAGAAGTGGGGTCACACCCAAGTTGCTGCTGGGGCTAGGGTTGCTTGCTACCATGATGAAATTAAACTTTCAC TTCCTGCAATGTGGACACCCACGCACCACCTCCTATTTACTCTATTTCATGTTGATCTACAAACAAAATTGGAAGCTCCA AAGCCAGTGGTAATTGGATATGCAGCTCTTCCTTTATCATCACATGCTCAGCTGCGATCAGAAATAAATCTTCCAATTAT GAGAGAGTTGGTCCCTCATTATCTCCAGGATGCAGGACGGGAGAGATTGGATTATTTGGAAGATGGGAAAAACGTCTTCA GACTGCGTTTACGGCTATGTTCTTCTTTATACCCTATCAATGAACGTATTAGAGATTTCTTTCTTGAATACGACCGCCAC ACTCTTCGTACAAGTCCGCCTTGGGGTTCTGAACTTCTGGAGGCTATTAATAGTTTGAAGAATGTTGATTCCACTGCATT ACTTCAGTTTCTTCACCCAATTCTTAACATGCTACTTCATCTTATTGGTAATGGTGGAGAAACATTACAGGTTGCAGCTT TCCGGGCTATGGTTAATATTGTAACCAGGGTACAGCAAGAGTCGGTTGATGATGCTGAAAGAAATCATTTTCTAGTCAAC TATGTGGATTGTGCTTTTGATGATTTTGGTGGTCGACAACCACCAGTATATCCTGGATTATCCACTGTCTGGGGAAGCCT GGCACGAAGTAAGGCTAAAGGGTATCGTGTTGGACCTGTGTATGATGATGTTTTGGCAATGGCTTGGTTTTTTCTGGAGC TAATTGTTAAATCAATGGCATTGGAGAAGACTCGCCTCTTCTATCATAGTCTTCCGATAGGTGAAGATATCCCACCAATG CAGTTAAAGGATGGTGTATTCAGATGTATAATGCAGTTGTACGATTGCCTTCTTACTGAGGTGCATGAACGCTGCAAAAA GGGTTTAAGCTTAGCAAAACGGTTGAACAGTAGTTTGGCCTTCTTTTGTTATGATCTTCTATCCATTATTGAGCCACGAC AAGTTTTTGAGCTGGTATCTTTATATCTTGATAAGTTCTCTGGTGTATGTCAATCGGTTCTTCACGAATGCAAACTTACA TTTTTACAAATAATATGTGACCATGATCTTTTTGTTGAAATGCCTGGGAGAGACCCTTCAGATAGGAACTACCTTTCATC TGTATTGATACAAGAACTTTTTGTTACTTGGGATCATGAAGATTTGTCTCTACGAGCAAAGGCAGCGAGAATATTGGTTG TGCTCTTGTGCAAGCATGAGTTTGATGTCAGATACCAGAAGCCAGAAGATAAGTTGTATATTGCTCAGCTCTATTTCCCA CTTATTGGACAGATATTAGATGAAATGCCTGTTTTTTACAACCTGAATTCTGTTGAAAAGCGTGAAGTATCCATTGTGAT TCTGCAAATAGTTCGAACCCTTGATGATGCATCTCTTGTCAAGGCATGGCAGCAAAGCATTGCCCGGACTAGATTGTTTT TCAAGCTTATGGAGGAATGCTTACTTCTATTTGAGCACAAAAAGCCCTCTGATGGCATGTTACTTGGCTCAAGTTCTCGC AACCCTGTAGGGGAGGCGCCTGCGTCTCCCAAGTACTCTGATAGACTTTCTCCTGCAATCAACAACTATCTATCGGAGGC CTCAAGGCAGGAAGTCAGGCCTCAGGGAACACCTGATAGTGGATACTTATGGCAGAGAGTAAATTCACAGTTAAGCTCCC CTAGCCAGCCATATTCGTTGAGAGAAGCTCTTGCTCAAGCACAGTCCTCTAGGATTGGAGCTTCTGCTCAAGCACTTCGA GAATCACTACACCCACTATTGAGGCAGAAATTGGAACTTTGGGAGGAAAACTTGAGTGCTGCTGTCAGTCTTCAGGTTTT GGAGGTGGCTGAAAAGTTCTCTACGATGGCAGCATCGCATAGCATTACCACTGATTATGGAAAACTTGATTGCATCACAG CAGTATTCACGGGCTTTCTATCGAGAAATCAGCCACTCGCTTTTTGGAAAGCTTTTTTTCCTGTATTTAACAATGTGTTT GATTTACATGGGGCAACTCTAATGGCAAGGGAAAATGATCGTTTTCTAAAGCAAGTCACTTTCCATGTCCTTCGGCTTGC TGTTTTTCGAAATGAAAACATCAGGAAAAGGGCAGTTGTTGGGCTTCAAATACTTGTGAGGTGTTCATTTCATTACTTTA TGCAGACAGCAAGATTAAGAGTAATGTTGATTATCACATTATCAGAGCTAATGTCTGATGTGCAAGTGACTCAAATGCGA TCTGATGGAAGCCTAGAAGAGAGTGGTGAAGCAAGACGACTTAGGAAATCTTTAGAAGAAATGAAGGATGAAACTGAAAG TGCTTGCCTGTTGAAGGAGTGTGGATTACAAGAGAGTGCTCTTGTGGCCATACCAGAAAAAGTGACAGAGAATAGGTGGT CCTGGTCAGAAGTGAAATATCTCTCTGACAGTTCTCTTTTGGCCCTTGATGCTAGCTTGGAGCATGCACTGTTGGGCCCT GTGATGACTATGGATAGATATGCTACTGCTGAAAGCTTCTATAAATTGGCAATGGCATTTGCTCCAGTTCCTGATCTTCA CATAATGTGGCTGCTTCATCTATGTGATGCGCATCAGGAAATGCAGTCATGGGCAGAAGCTGCTCAGTGTGCCGTTGCCG TTGCTGGTGTTGTGATGCAGGTGAATAGTGGGGTTTTGAGTGTTTGCACAGCCTTCTTGTCTGGGGAGCCTGCAACAAGG TTGCGATCACAGGAACTGCAGCAACTTATAGCTGCTCTTCTTGAGTTCATGGCTGTATGTAAACGTGCCATCCGGGTACA TTTCAGATTGATTGGTGAGGAAGATCAGGATTTCCATACGCAACTTGTAAATGGATTTCAGTCTCTAACAGCCGAGTTAT CGCACTACATTCCTGCCATTCTCTCAGAGCTATGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0299000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLHLRHRRDSTPATTRWRNKFDENLEQWPHLNELVHCYTTDWVKDENKYGHYDSIGAPSFQNQIYEGPDTDIETEMRLAS ARRTKGEDISEDDVPSTSGRQFMEAADGEHSDIPKHFSQSPLPAYEPAFDWENERSLIFGQRIPETPISHGMKISVKIQS LQFQAGLAEPFYGTICLYNRERREKLSEDFYFHVLLTEMRDAKVTYEPRAVFYLDAPSASVCLLIQLEKHTTEEGGVTPS VYSRKDPVHLTEREKQKLQVWSQIMPYKESFAWTIVSLFDSSVGTASVGPASPSSPLAPSVSGSSSHEGVFETTSKISLD GKLSYSNGNSVVVEVSNLNKVKESYTEESLQDPKRKLHKPVKGVLKLEIEKHKISPADLENVSENGSTTNDSVDPGDRIA DSLAGKYPSNGCDDPQGSNGKEVSGNGSNQHGNSDSYADDFHAFDFRTTTRNEPFLQLFHCLYVYPLTVSLGRKRNLFIR VELREDDADIRRQPLEAVYPRDPSLDASFQKWGHTQVAAGARVACYHDEIKLSLPAMWTPTHHLLFTLFHVDLQTKLEAP KPVVIGYAALPLSSHAQLRSEINLPIMRELVPHYLQDAGRERLDYLEDGKNVFRLRLRLCSSLYPINERIRDFFLEYDRH TLRTSPPWGSELLEAINSLKNVDSTALLQFLHPILNMLLHLIGNGGETLQVAAFRAMVNIVTRVQQESVDDAERNHFLVN YVDCAFDDFGGRQPPVYPGLSTVWGSLARSKAKGYRVGPVYDDVLAMAWFFLELIVKSMALEKTRLFYHSLPIGEDIPPM QLKDGVFRCIMQLYDCLLTEVHERCKKGLSLAKRLNSSLAFFCYDLLSIIEPRQVFELVSLYLDKFSGVCQSVLHECKLT FLQIICDHDLFVEMPGRDPSDRNYLSSVLIQELFVTWDHEDLSLRAKAARILVVLLCKHEFDVRYQKPEDKLYIAQLYFP LIGQILDEMPVFYNLNSVEKREVSIVILQIVRTLDDASLVKAWQQSIARTRLFFKLMEECLLLFEHKKPSDGMLLGSSSR NPVGEAPASPKYSDRLSPAINNYLSEASRQEVRPQGTPDSGYLWQRVNSQLSSPSQPYSLREALAQAQSSRIGASAQALR ESLHPLLRQKLELWEENLSAAVSLQVLEVAEKFSTMAASHSITTDYGKLDCITAVFTGFLSRNQPLAFWKAFFPVFNNVF DLHGATLMARENDRFLKQVTFHVLRLAVFRNENIRKRAVVGLQILVRCSFHYFMQTARLRVMLIITLSELMSDVQVTQMR SDGSLEESGEARRLRKSLEEMKDETESACLLKECGLQESALVAIPEKVTENRWSWSEVKYLSDSSLLALDASLEHALLGP VMTMDRYATAESFYKLAMAFAPVPDLHIMWLLHLCDAHQEMQSWAEAAQCAVAVAGVVMQVNSGVLSVCTAFLSGEPATR LRSQELQQLIAALLEFMAVCKRAIRVHFRLIGEEDQDFHTQLVNGFQSLTAELSHYIPAILSEL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 32 1421 1390 0.0
PANTHER 32 1421 1390 0.0
MobiDBLite 377 434 58 -
MobiDBLite 380 395 16 -
MobiDBLite 412 434 23 -
Pfam 457 628 172 2.4E-28
CDD 458 630 173 1.16066E-36
ProSiteProfiles 459 620 162 32.167
SUPERFAMILY 654 1247 594 4.87E-6
ProSiteProfiles 1378 1504 127 7.038
Gene3D 1408 1499 92 4.5E-16
Pfam 1417 1495 79 2.8E-20
PANTHER 1419 1500 82 0.0
PANTHER 1419 1500 82 0.0

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Guanyl-nucleotide exchange factor activity Stimulates the exchange of guanyl nucleotides associated with a GTPase. Under normal cellular physiological conditions, the concentration of GTP is higher than that of GDP, favoring the replacement of GDP by GTP in association with the GTPase.
Biological process Small GTPase mediated signal transduction Any series of molecular signals in which a small monomeric GTPase relays one or more of the signals.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0299000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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