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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0318900 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0318900.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA-directed RNA polymerase subunit; TAIR: AT2G40030.1 nuclear RNA polymerase D1B; Swiss-Prot: sp|Q5D869|NRPE1_ARATH DNA-directed RNA polymerase V subunit 1; TrEMBL-Plants: tr|K7M0Q7|K7M0Q7_SOYBN DNA-directed RNA polymerase subunit; Found in the gene: LotjaGi3g1v0318900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:67664363..67686856) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCTCTGCTGCTTTTGGAGATTTGTTTTATAATTATTTGCTTAATTCTGTGAAATTGTTCTTAAAGGGCAAAGATGTATGC CTGTATGGATATGTTCATACAGTGAGTGAGTATACATGGTTATGCTATACTTGGCTGCCTTTCTAGATTTTTCAGGTCCA TCATTTCTTATTTGCTTTTGTGCCTTAATTTGTTGAAAGCTGTAAGATTTGCCAATGATGACCATGATTATGAGTCATCT ATCTGTTCACAGGCACTGTAGATTTCCCTTGAAAGTGATGGAGGATAATCCAACTTCAAGTGTTTTAGATGCGGAAGTAG TTGGGATTCGATTTGGTATGGCTACACGCCAGGAAATTGTAAGTACACAATGTGTTATAATTTTCTGTATAATTTTGTGA CTATCAGATGCTGCTCCACAGAGGAGTTGAGCTCTTTGGTGATATGGCTCTAATGAGGTTAACTAGAATCTATTTTGGAC AATGTCATTGTGATGAATGCCGAGGTGATAGGAAATACTTATCAAATTTTAATGGTATTTTCTGCTGGATTGCTTTACGA ACCTTATTTGGACTGTTATTTTCGTTTTTTATATTTCTTAAAATTCATTATGTCATAGTAAATGTACATCGTGATTGTTT TTTGGTTAAAAACTTCAAAATAAACTAAAAATGCACAATCATGTATTCTCTAGATACCATATTAGAATTGGTGCTCAAGG GAAAGAAAGAAAGAAACTGTGTATTTCATTTCAGAATTGCTACTCATACAAGTGGGCTACCTAAGTATTTGCAGAAAGCT GAAGCTTCTATAAGATCTAACTAACTGACTACAATCATCATTGTAAATAACTATATCTGTCAAACATGATTCATGACAGT TACAAACTAACTACGGCTGTCAACATAACAACTGCAGAATTAAAACAGACTAACAGCATACAACAGAGCCTTCACTAAAG 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AGGAAGAGAATCATTTAAGAAAAGTCGCTTTGAAGGTTCACAAGGTTGGGGATCAAATGCTGGTGATATGAAACATATGA ATCGTCCTGGCAGAGTACCTGGACCAAGGTTGGATATGTATTCATCTGAGGAACAGGATATTCTCAAGGATATTGAACCT ATTGTCCAGTCCATCAGACGAATAATGCAACAAGAAGGGTAAGTTCCCTAAGGCAGGTCTTTACAAGGTTCTTGAGTCTT GACAAAAAAAAAGGTTCTTACAATGTTATAGAATGTTGTAATTGTAATTACATGTTATAATAAAAAGCATTTTTATGATG ATAATCAAATGACAACATTTTCTTTGCATAAAACCATACGATCATCAAACCACTTTTGTTAGCTTAAACAAACAGTTTTG CTGTGGGTGTTATTCCTGTCCATTTTAGAACCTTTACCTCTGTTCTCACCAGTTTTGCTTACTGCCACCATAGTTTTTTC AGGAAGTTACTTTTTTGTGTGAATAAGATACCATTAGCTATCATATTACCTATCGCAGATCATTTTTGGTCAATTCTGAT TGTTGATACAAGTCTATATTCTCTATTTTGGCCTTTAGAGCTTTTGATGCAGCGGAAGTCGTACTAGGATTGCAAGCGCA AATCCTAAGGAAAAGGTTTCTGGAATCCACCAGAAAGGAAATTAGCAAGCGCTAAAACCCTAGAAAATACACTGGAATCC ACCAGAGAAGAAGAGAAAACTCTTAAATTTTATTATCAATCAAAACTCCCCCATAGGCTATGCCTTACAAGTGCTTAAAT AAGAAAAGAAAATATCCTAATAGTAAAATAAATAATATCCTAAAAGATCCTAATTGAAAATAAAAGATCCTAATTGAAAA TAAATAAGTTCCTAACAAAAAAATAATTAATATCCTAAAAGATCTTAATTACAAATAAGTAAAATTACTAAAATACTAAA ATTATCTTAAAAAGCTCCTACATCACAAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAAATATCCTATTAGTAAAATAAATAATATCCTA AAAGATCCTAATTGAAAATAAAAGATCCTAATTGAAAATAAATAAGTTCCTAACAAAAAATAATTAAGATCCTAAAAGAT CTTAATTACAAATAAGTAAAATTACTAAAATACTAAAATTATCTTAAAAAGCTCCTACATCAGTCTCCTCTTCTTGTAAA GAACTCGACCTCGAGTTCACATCACGATAAAGGACTTCAGTTGCCTCAAAATACCAGGATCAAAAGGCTTCCAAATTAAA CCAAGGAGAGTGAGTGTTGAATATCTAATAAAAGCACATGGAAAAGAGTGTGGAGACTCCTGTTTTGAAACACTAGCATC CATCTTGTTGATGCCAGGATCAAATTGTTTTCGCCAAACACCATGAAATTGATGGAGTGTGATTTCTGGATGAACTAGCC GTGATTGAAACAACTTCCAGTGGCATGGAATAAATTGTCTGAATTGCGAGTTAGACAAGTTGGATTGCAGTTCCTTTTTC TCAGGCATATTACCAAACAAATGGGGTGCAAACTTGGGAACAAGGACATATCGAACCTGAGGCACAACCATAAGTGTTAG ATTGTAAGGTGTGAACACTGCTTCGATGCCCAAATTGACAGAGGTGTCTGGCTCAGATATAACATGGGGTACAACCTCTA AGATGTCATCAGATCTAGATAAAAGAGAACAGTGTGTTGGTGTTGGTGCGCTCTCGCTGCACAAATCATCCATCAACGTT TTTGCCTCATCTTCCAGGCCAACAACAGAGGATGGCGCAAATGAAATTTGAGAATCAGATTCCGAAGAAGTTGCGTACAT AGGTCTTGTAGAGGGACATGAATTTGAAGTAGGTTTTGGTAGGGGTTGTGGTAAGGAAATTGGATCTGCAGTCGGTGATA TGTTGGGGTAAGGATTGATAAGGTTTGGAGTAGCAGGTTGGGGGTGTGGAGTTTCGGTGGTTTTAGAGGTTGAGTACTGA ACTTGGTAATAAGGATGAGATACGGATGGTGAATGCAAAGATTGGGAAGGTAAAGATATAGCGGAACGATTGTTGTTGTT GTCGCGCGGAAACCTATGTGGTTTCCCTCTCCTGTCTCGTCCCCGGTTACCGTTGTTGGTATTGTTGATCTGCGCCGTTA AAGCCGCCGTGAACGTCGCCATATGTTGTATCATCTGTTGTGTCATATGTTGCGTAATAGCAGTTAGGGCCGCGGTAAGA GCCACGGTAACATCCTTCAGGTCTGCTTTGGTCATTGGTTGATCTTCCATGGTTGATCAAGCAAAGAAAAGAGACAGGAG AAAGCCTGCTCTGATACCACTTGATGCAGCGGAAGTCGTACTAGGATTGCAAGCGCAAATCCTAAGGAAAAGGTTTCTGG AATCCACCAGAAAGGAAATTAGCAAGCGCTAAAACCCTAGAAAATACACTGGAATCCACCAGAGAAGAAGAGAAAACTCT TAAATTTTATTATCAATCAAAACTCCCATAGGCTATGCCTTACAAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAAATATCCTAATAGTA AAATAAATAATATCCTAAAAGATCCTAATTGAAAATAAAAGATCCTAATTGAAAATAAATAAGTTCCTAACAAAAAATAA TTAAGATCCTAAAAGATCTTAATTACAAATAAGTAAAATTACTAAAATATTAAAATTATCTTAAAAAGCTCCTACATCAC AAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAAATATCCTAATAGTAAAATAAATAATATCCTAAAAGATCCTAATTGAAAATAAAAGAT CCTAATTGAAAATAAATAAGTTCCTAACAAAAAATAATTAAGATCCTAAAGATCTTAATTACAAATAAGTAAAATTACTA AAATACTAAAATTATCTTAAAAAGCTCCTACATCACAAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAAATATCCTAATAGTAAAATAAA TAATATCCTAAAAGATCCTAATTGAAAATAAAAGATCCTAATTGAAAATAAATAAGTTCCTAACAAAAAATAATTAAGAT CCTAAAAGATCTTAATTACAAATAAGTAAAATTACTAAAATACTAAAATTATCTTAAAAAGCTCCTACATCAGCTTTCCT TCCCTCCTCTACTTCCTCTATGAATTTTGTATCATAAGCTGTTTCATTCTTATCCTAATTTTCTGATAAATTCCTGGTAC AGGTATAATGATGGGGATCCGCTGGGTGCTGATGACCAACAGTTTATACTGGAGAATGTCTTTGAACACCACCCAGATAA AGAAACCAAAATGGGTGCTGGAGTTGATTACGTCATGGTATCCTCTAATTCTATTTTATTGCCTTTTTAGCTTTCATCAA CAGTTATACTTTATTTGATCTTAGCTGGGCTTTCCAAATATTCCAAAATGTTTGTCTTATGATGTCATTTTGGTTTCTTT CTTTCCTTCCATATAATGTATCCTTTTGTGTATGATGAATTGAGACATGAAAATATTTGTGTCTCTTTATATTTTCCTTT ATTTAATTTTGGGAGCACTTGTGACAGGTAAGCAGACACACCAGTTTTCAGGTAAGCAGGTGTCTTTATGTGGTTTTAAA GGATGGGCGAAGCGAAGACTTCTCATATAGAAAGTGTCTGGAAAACTTGGTAAAGAAAAAATATCCAGACCTTGCTGAGT CATTCAATGGCAAATATTTCCGGAAACCCCGTCCAAGGCAGAACCAGACCCCAACTTCAGCAGGGGATCAGACCCCAACT CCTGCGGGGGATCAACCACAAACTACTGCGCCTGTAGAAGAATCCAAAGAGTAGAAGATTAGAGCTCTGTCCATAATATT GTACAGAAAGTGCACTGCTAAGGGAGGCAACTGAATAGGTTATCACAAGTTACATAGCTAACCAATTTTCCTGTGGAAGA TGTTTCCCATTTTGTTGGCTTCTCGTCACTTATTTTTTGAAGCATGGTCATGTGAATATTTGAACTCTTGAATGATGCTA GCGCGTGATGTGCCTTTCAAACTGTTCCCTGCTCATCATTTAATCTAGCTATTTATTCAGCTTTACTATGCCAGAATGAC AGCCTTCCGATTATTCAGTTCTCTCTTTCTCTCTAACCATTTGATCATATTTAATGGTTGAGATTAGAAGTGGTTCAAAA TAACTCACGTGCTTCTTTTGTTCTGATATTAGATCCCGTAAAAAAAACTCTATTTTTCTTTGCAAAGCTATTATTAGACA TTACTCACTTCCAG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0318900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATGACCATGATTATGAGTCATCTATCTGTTCACAGGCACTGTAGATTTCCCTTGAAAGTGATGGAGGATAATCCAAC TTCAAGTGTTTTAGATGCGGAAGTAGTTGGGATTCGATTTGGTATGGCTACACGCCAGGAAATTTGTACAGCATCGATAA GTGACTCCTCAATTAGTCATGCTAGTCAGCTGTCAAATCCATTCCTTGGGCTGCCCCTTGAATATGGAAGATGTGAATCT TGTGGTACTTCTGAAGCAGGAAAATGTGAAGGCCACTTTGGATATATTGAGCTTCCAATTCCAATATATCATCCTAACCA TGTTAGTGAATTGAAGCGGGTACTGAGCCTGATTTGCTTAAACTGCTTAAAAATGAAGAAAACCAAGTTTCCTTCTTCAA GCAGTGGTTTGGCACAGAGGTTATTATCTCCCTGCTGTCAGGATGCTAATGCTGCACAAGTTTCTATACGGGAAGTCAAA ACAGCCGATGGAGCTGGTTACTTAGTACTGAAAGTATCTAAGTCAAAGATGCATGATGGTTTTTGGAGGTTTCTAGACAA GTATGGCTATCGTTATGAGGGCGATCATACTCGAGCTTTGCTTCCTTGTGAGGTGATGGAAATTATCAAGAGATTTCCCC TAGAAACCAAGAAAAAACTGGCTGGGAAAGGATATTTTCCTCAAGATGGATATGTGTTGAAGTATCTTCCTGTACCACCA AATTGCTTGTCTGTGCCTGTTGTTTCTGATGGCGTCAGTGTCATGTCTTCGGATCCTTCCATGACATTTCTGAGAAAATT GCTCAGGAAGGTTGAAATCATCAGAAGTTCTAGATCTGGTGAACCAAACTTTGAGTCTCATGAAGTGGAAGCAAATGACT TACAGTCAGTGGTTGACCAGTATCTTCAAATTAGGGGCTGTGCTAAACCTGCCCGTGATATAGAAACACACTTCGGGGTC AATAAAGAGCTGAGTGATGCATCAAACAAAGCATGGCTTGATAAAATGAAAAGTCTATTTATAAGTAAGGGTTCAGGTTT TTCTTCAAGGAGTGTGATAACTGGAGATGGGTACAAGAGGACAAATGAAGTAGGAATTCCGCTTGAAATTGCCCAGAGGA TAACATTTGAAGAGAGAGTAAACTTGCATAACATGTGTTTTTTACAGAAGTTGGTTGATGAAAATTTGTGTCTCGCCTAC AAGGAAGGTGTGTCAACATATTCACTGAGGGAGGGCTCAAAGGGGCACACATATCTTAAGCCTGGCCAGATAGTGCATAG AAGGATTATGGATGGGGACATCGTCTTCATTAACAGACCACCTACAACCCACAAACACTCATTACAAGCACTTGTGGTCT ACATCCACGATGATCACACGGTGAAGATAAATCCACTGATTTGTGGGCCTCTTGGAGCTGATTTTGATGGGGATTGTGTC CATTTATTTTATCCACAGTCACTTGCTGCTAAGGCTGAAGTAGTGGAATTATTCTCGGTGGAGAAACAGCTCCTCAGCTC TCACAGTGGTAATCTGAACCTGCAATTATCCACAGATTCCTTATTGTCACTGAAGATGTTAGTGAAGAAAGGTTTTATGG ATAGAGCAGCTGCTAATCAATTGGCAATGTTTCTTTTCTTGCCTTTGCCACGACCTGCTTTGCTGAAGGCCGGTTCTGGT GATTCTTATTGGACATCCATCCAAATTTTGCAGTGTGCTTTGCCTTTATCTTTTGATTGTACTGGGGGACGTTACTTGAT TAGGCAGAGTGATATCTTAGAATTTGATTTGAGTAGGGATGTTCTTCCTGCAGTTATAAATGAAATAGCAGCGTCAGTGT TCTTTGGGAAGGGTCCTCAAGAGGCACTGAATTTCTTTGATGTGTTACAACCGGTTTTGATGGAAAGCATATTCAGTAAT GGATTTAGCGTTGGCTTACATGATTTTTCAATATCTGGGGCCGTGAAAAGGGTTACAGACAGAAACATAGGGAAAGTTTC CCCGCTGTTGTATCAGTTGAGGTTTATATATAATGAGTTGGTGGCACAGCAATTAGAGAAGCACATGCAAGACATTGAAC TTCCTGCTATAAAATTTGTTTCAAAATCATCCCGACTTGGGGATATGATTGATTCCAAAAGTAAATCAGCTCTTGATAAG GTGACACAACAGATAGGGTTCCTTGGGCAGCAACTCTTTGTGCGAGGGCGACTGTATTCCAAGGGGTTGTTGGAGGATGT TGCGTTACATTTTAAATTAAAATGTTACTATGATGGAGATGGTTATCCCTCAGCTGAATATGGATTACTCAAAGGTTGTT TTTTCCATGGTTTGGACCCATTTGAAGAGTTAGTACATTCAATTTCCACAAGAGAGATAATGGTTCGCTCTTCAAGAGGA TTGTCTGAACCTGGAACTTTATTTAAAAACTTGATGGCCATCCTTCGGGATGTTGTAGTTTGTTATGATGGAACTGTGCG AAATGTATGTAGTAATTCCATCATTCAGTTTGAGTATGGGGTAAAAGCTGGAGACAAAACTCGGTACTTATTCCCTGCTG GTGAGCCTGTAGGTGTCTTGGCAGCAACATCAATGTCTAATCCTGCTTATAAGGCAGTCCTTGATGCTAGTCCTAGCAGC AGTTGTTCATGGGAATTGATGAAGGAAATACTTCTCTGCAAAGTCAATTTTCGAAATGAACCAATTGACCGCCGAGTAAT TTTGTACTTGAATGACTGCGATTGTGGAAGGAGGTATTGCCGAGAAAATGCAGCATATATAGTTAAAAATCAATTGAGAA AAGTCAGCCTGAAGGACACAGCTGTGGATTTCATTGTTGAATACCAACAGCAGCGGAAACGGGAAGGTTCTGAAACTGAT GCAGGCCTTGTTGGTCATATTCATCTCGATGAGGTGATGTTGGAGGAGCTGAAGATCAATATGGCTGAAGTTTTCCAAAG ATGCCAGGAAAAACTTCGTTCGTTAAATCGGAAAAGGAAATATTATCAAACTTTGAAGAGCACTGAATTGTTTTTCAGTG AGTCTTGTGCTTCTCCAAATTTTTCTTCACCATGTGTGACATTCATTTCGCTAGATGGTGATGGTTTAGACAAAACCACT GAAATCCTGGCTGACGTAATCTGCCCGGTTCTGTTAGGTACAATAATCCAAGGAGACCCCCGAATTAGCTCTGCGAATAT AACCTGGATTAATCCTGACTCAAACGCATGGGTGCGCAACCCATCAAAGTCTTCTAATGGTGAATTGGCACTAGACATCA TTCTTGAGGAGGCAGCTGTTAAACAAAGTGGTGATGCTTGGAGGATAGTGCTTGATTCCTGCCTTCCTGTCCTTAACTTG ATTGATACCAGGCGTTCTATCCCTTATGCTATTAAGCAGGTTCAGGAATTACTTGGGATATCATGTACTTTTGATCAAGC AATCCAGCGTCTTGCAGCATCTGTGAAAATGGTAGCAAAAGGTGTTCTTAGAGAACATCTCATTCTGTTAGCAAGCAGCA TGACTTGTGGCGGGAATTTGGTGGGCTTTAATACAGGTGGATATAAAGCACTGGCTCGTCAATTAAATATTCAAGTACCA TTCACTGATGCAACTCTCTTTACTCCTAAGAAATGTTTTGAGCGAGCTGCTGAGAAATGCCACACTGACTCTTTATCAAG CATCGTTGCCTCCTGTTCGTGGGGTAAACCTGTGGCAGTTGGAACAGGATCAAGATTTGATGTTTTATGGGATGCGAAAG AGCAGAGAAAGTCAAATGAACTTGAAGGGATGGATGTTTACAATTTTCTTCACATGGTGAAAAGCCTTATCAATGGGGAA GAAGAAAACGATGCTTGCTTGGGTGAGGACATTGATGATTTGCTAGAAGAGGAGAATGCTGATTACGGCTTGTCCCCACA GCATACCTCCGGACTTGATGCTGTGTTTGAAGAGACTTTTGAAGCAATGAACGGTCCAGAATCCAATGGCTGGGGTGCAA CTACAGATCGGACTGAAACAAAGTCAACACAGTGGTCAGCCTGGGAAAGTAATAAAGCAGAAACAAAAGATGGTGGTTCT CAAAGAGTCCATGAGGATTCTTGGACTTCTCGTGATGTGATGAAAGATGATTCCCAGATGACCAACGCTTGGGATGGAAA CGTGGAACAGACCAAAACAATTTCAAATGATTGGACTGCTTGGGGGAAAAATAAATCGGAAATACAGGATAATGTGGCTG AAAAGGCCGAAGGGGAGTGTGGGAGCTCTGAAAAGTGGAAAACTGCTGTTATCCAAGAAGGCTCTTCCAAGTCCAATGCT TGGAAGTCAAACATAGAGCAACGTAGTGATGAGGATTCTTGGACCTCTCAGAAACTGAAAGCTGATGTTATCCAGGACTC TTCCAAGCCAAGCTCTTGGGGAGCTAAACCCAAGTCGAATGACTCCTCCAATTGGGGAAGAAATAAAGATGAAATACAGG ATGTTGTGTCTAGAAGAGCCGAAGATGATTCTTGGAGCTCTAAGAAACAGCTTAGTTCTGATGCTACCCAAGAAGACTCT TCCAAGTTCAGCTTTTGGGGAGGTAACAAAGATACAACAAAGCCAAAGTCAAATGATTGGTCCAGTTGGGGTGGAAATAG AGATGGAATACAAGATGGTGGGTCTAAAAGAGCCCAAGATGATTCTTGGAGCTCTCAAAAAGATGTTACCAGAGAAAGCT CTTCTAAGGTTGATGCATGGGGTGCAAATAATGAGGCATCAAACCCCAAGTCAAATGATTGGTCAGCCTGGGGGAAAAAT AAAGATGGAACTCAAGATGGTGGTTCAGAGAGAGCCCAAGAGGATTCATTAAGCTTTGGTAAGTGGAAAGCTGAATCACA AGTTGAAGCTGATACGGTGCAAGAAGACTCTTCTAAATCCAAAGCCTGGGAACGTACTTCTGACAATGTGAAGGTTGACA ATAGCTCTTGGGGAAAACCCAAATTTCCAGAAACTCAAGCTTGGGATCCCCAGAAAGAGACAAATCAAGGTGCAGGTTCA CGTGGGTGGGACTCACAAATTGCTTCTGCTAATTCTGACAGTGATAGAAATTTTCAATGGGGAAAGCAAGGAAGAGAATC ATTTAAGAAAAGTCGCTTTGAAGGTTCACAAGGTTGGGGATCAAATGCTGGTGATATGAAACATATGAATCGTCCTGGCA GAGTACCTGGACCAAGGTTGGATATGTATTCATCTGAGGAACAGGATATTCTCAAGGATATTGAACCTATTGTCCAGTCC ATCAGACGAATAATGCAACAAGAAGGGTATAATGATGGGGATCCGCTGGGTGCTGATGACCAACAGTTTATACTGGAGAA TGTCTTTGAACACCACCCAGATAAAGAAACCAAAATGGGTGCTGGAGTTGATTACGTCATGGTAAGCAGACACACCAGTT TTCAGGTAAGCAGGTGTCTTTATGTGGTTTTAAAGGATGGGCGAAGCGAAGACTTCTCATATAGAAAGTGTCTGGAAAAC TTGGTAAAGAAAAAATATCCAGACCTTGCTGAGTCATTCAATGGCAAATATTTCCGGAAACCCCGTCCAAGGCAGAACCA GACCCCAACTTCAGCAGGGGATCAGACCCCAACTCCTGCGGGGGATCAACCACAAACTACTGCGCCTGTAGAAGAATCCA AAGAGTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0318900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MMTMIMSHLSVHRHCRFPLKVMEDNPTSSVLDAEVVGIRFGMATRQEICTASISDSSISHASQLSNPFLGLPLEYGRCES CGTSEAGKCEGHFGYIELPIPIYHPNHVSELKRVLSLICLNCLKMKKTKFPSSSSGLAQRLLSPCCQDANAAQVSIREVK TADGAGYLVLKVSKSKMHDGFWRFLDKYGYRYEGDHTRALLPCEVMEIIKRFPLETKKKLAGKGYFPQDGYVLKYLPVPP NCLSVPVVSDGVSVMSSDPSMTFLRKLLRKVEIIRSSRSGEPNFESHEVEANDLQSVVDQYLQIRGCAKPARDIETHFGV NKELSDASNKAWLDKMKSLFISKGSGFSSRSVITGDGYKRTNEVGIPLEIAQRITFEERVNLHNMCFLQKLVDENLCLAY KEGVSTYSLREGSKGHTYLKPGQIVHRRIMDGDIVFINRPPTTHKHSLQALVVYIHDDHTVKINPLICGPLGADFDGDCV HLFYPQSLAAKAEVVELFSVEKQLLSSHSGNLNLQLSTDSLLSLKMLVKKGFMDRAAANQLAMFLFLPLPRPALLKAGSG DSYWTSIQILQCALPLSFDCTGGRYLIRQSDILEFDLSRDVLPAVINEIAASVFFGKGPQEALNFFDVLQPVLMESIFSN GFSVGLHDFSISGAVKRVTDRNIGKVSPLLYQLRFIYNELVAQQLEKHMQDIELPAIKFVSKSSRLGDMIDSKSKSALDK VTQQIGFLGQQLFVRGRLYSKGLLEDVALHFKLKCYYDGDGYPSAEYGLLKGCFFHGLDPFEELVHSISTREIMVRSSRG LSEPGTLFKNLMAILRDVVVCYDGTVRNVCSNSIIQFEYGVKAGDKTRYLFPAGEPVGVLAATSMSNPAYKAVLDASPSS SCSWELMKEILLCKVNFRNEPIDRRVILYLNDCDCGRRYCRENAAYIVKNQLRKVSLKDTAVDFIVEYQQQRKREGSETD AGLVGHIHLDEVMLEELKINMAEVFQRCQEKLRSLNRKRKYYQTLKSTELFFSESCASPNFSSPCVTFISLDGDGLDKTT EILADVICPVLLGTIIQGDPRISSANITWINPDSNAWVRNPSKSSNGELALDIILEEAAVKQSGDAWRIVLDSCLPVLNL IDTRRSIPYAIKQVQELLGISCTFDQAIQRLAASVKMVAKGVLREHLILLASSMTCGGNLVGFNTGGYKALARQLNIQVP FTDATLFTPKKCFERAAEKCHTDSLSSIVASCSWGKPVAVGTGSRFDVLWDAKEQRKSNELEGMDVYNFLHMVKSLINGE EENDACLGEDIDDLLEEENADYGLSPQHTSGLDAVFEETFEAMNGPESNGWGATTDRTETKSTQWSAWESNKAETKDGGS QRVHEDSWTSRDVMKDDSQMTNAWDGNVEQTKTISNDWTAWGKNKSEIQDNVAEKAEGECGSSEKWKTAVIQEGSSKSNA WKSNIEQRSDEDSWTSQKLKADVIQDSSKPSSWGAKPKSNDSSNWGRNKDEIQDVVSRRAEDDSWSSKKQLSSDATQEDS SKFSFWGGNKDTTKPKSNDWSSWGGNRDGIQDGGSKRAQDDSWSSQKDVTRESSSKVDAWGANNEASNPKSNDWSAWGKN KDGTQDGGSERAQEDSLSFGKWKAESQVEADTVQEDSSKSKAWERTSDNVKVDNSSWGKPKFPETQAWDPQKETNQGAGS RGWDSQIASANSDSDRNFQWGKQGRESFKKSRFEGSQGWGSNAGDMKHMNRPGRVPGPRLDMYSSEEQDILKDIEPIVQS IRRIMQQEGYNDGDPLGADDQQFILENVFEHHPDKETKMGAGVDYVMVSRHTSFQVSRCLYVVLKDGRSEDFSYRKCLEN LVKKKYPDLAESFNGKYFRKPRPRQNQTPTSAGDQTPTPAGDQPQTTAPVEESKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 23 | 1406 | 1384 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 23 | 1406 | 1384 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 25 | 133 | 109 | 3.1E-7 | – | |
| SUPERFAMILY | 29 | 1252 | 1224 | 6.87E-168 | – | |
| Pfam | 62 | 302 | 241 | 6.0E-12 | ||
| SMART | 229 | 528 | 300 | 9.8E-50 | ||
| Pfam | 346 | 499 | 154 | 3.2E-32 | ||
| Gene3D | 347 | 494 | 148 | 1.5E-39 | – | |
| Gene3D | 374 | 429 | 56 | 1.5E-39 | – | |
| Pfam | 503 | 648 | 146 | 2.8E-8 | ||
| Pfam | 777 | 1190 | 414 | 1.6E-10 | ||
| MobiDBLite | 1324 | 1379 | 56 | - | – | |
| MobiDBLite | 1328 | 1354 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 1355 | 1373 | 19 | - | – | |
| MobiDBLite | 1434 | 1739 | 306 | - | – | |
| MobiDBLite | 1458 | 1482 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 1483 | 1508 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 1509 | 1545 | 37 | - | – | |
| MobiDBLite | 1576 | 1599 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 1628 | 1648 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1668 | 1698 | 31 | - | – | |
| Gene3D | 1752 | 1845 | 94 | 3.7E-19 | – | |
| Pfam | 1769 | 1838 | 70 | 5.4E-22 | – | |
| MobiDBLite | 1853 | 1895 | 43 | - | – | |
| MobiDBLite | 1861 | 1888 | 28 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity | Catalysis of the reaction: nucleoside triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1). Utilizes a DNA template, i.e. the catalysis of DNA-template-directed extension of the 3'-end of an RNA strand by one nucleotide at a time. Can initiate a chain 'de novo'. | ||
| Biological process | Transcription, DNA-templated | The cellular synthesis of RNA on a template of DNA. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0318900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…