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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0318900 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0318900.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA-directed RNA polymerase subunit; TAIR: AT2G40030.1 nuclear RNA polymerase D1B; Swiss-Prot: sp|Q5D869|NRPE1_ARATH DNA-directed RNA polymerase V subunit 1; TrEMBL-Plants: tr|K7M0Q7|K7M0Q7_SOYBN DNA-directed RNA polymerase subunit; Found in the gene: LotjaGi3g1v0318900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:67664363..67687953) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CACCCACTCTTCTTCACTCTCACTCTCACTCTGTCACTTTCATTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTT CTGCAGAATCGGACACTCGCAATTCGGTACCTCCATTTCTCTGTTTCTGTAGTTCTGCATTTTCGTTTCATGCAAATGTT CATGTTGCATTTCGTCACCGATTCTTCATTGACATTCATTTGCTTCTGCATTTCGCATTCTCATTATTTCTCTGTCTTTT TCTGGGTTTAGGGTTTTTCGTTGCTTAGAGTGTACACACTGTTTCGCTTCTGAGGTGAGGAAGAAGTTCAAATAGCTCAT TTTGTATATTGTGTTTGTTTTTGTTATTGTTATGCCTGAATTTTTTGTTTGACTTGCTCTATGTTTTCCTTCAAAGGTGA TGATGACTTTGGGGAAGTTTTTCATGGCATTGCTTACCCTACTAGCTTTTGATTATTTTATATTTTTTTTGAAATTGTAT GAAATCATCTAACACGTTGGAATGGAAGCGAATGTGGGTAGGTTTTTGTTTTTCGAATTTTTTTGTTGAAAAATGATTTG AAGTGTCAAGGAGCTGTCTTTGAGTGGTTGGGGCTTGGGTCAGATGATGATCATCTTGCATTTTTTTTTTGGTTGGTTGC AGTGTTATCAAATAGCGACTATACGCCGCTATAGCATAGCGGATTTTTGGCTAATCGTGATGCCGCTATTACTCACTATA GCGTGCTAATAGCGGCCGAAATAGCGGATTTTTGGCTCCCCGCGGTAGTCCGCGATCGCAATTTGACAACATCGGTTGGT TGGGGGGTTTTACAGAGTAGATGAATTCTTGGGTTACTTTGTGTTTCTAAAAGAAGTGAATTAGTGAATTTATTTATGTA TGTAAAACAAATTTAAGGGGCAATGTTGTTTATAGGTGATTATTACTCTTGTAGTTGTGGTTGTAACTTGTAAGTAAGTA 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ACTGAAACAAAGTCAACACAGTGGTCAGCCTGGGAAAGTAATAAAGCAGAAACAAAAGATGGTGGTTCTCAAAGAGTCCA TGAGGATTCTTGGACTTCTCGTGATGTGATGAAAGATGATTCCCAGATGACCAACGCTTGGGATGGAAACGTGGAACAGA CCAAAACAATTTCAAATGATTGGACTGCTTGGGGGAAAAATAAATCGGAAATACAGGATAATGTGGCTGAAAAGGCCGAA GGGGAGTGTGGGAGCTCTGAAAAGTGGAAAACTGCTGTTATCCAAGAAGGCTCTTCCAAGTCCAATGCTTGGAAGTCAAA CATAGAGCAACGTAGTGATGAGGATTCTTGGACCTCTCAGAAACTGAAAGCTGATGTTATCCAGGACTCTTCCAAGCCAA GCTCTTGGGGAGCTAAACCCAAGTCGAATGACTCCTCCAATTGGGGAAGAAATAAAGATGAAATACAGGATGTTGTGTCT AGAAGAGCCGAAGATGATTCTTGGAGCTCTAAGAAACAGCTTAGTTCTGATGCTACCCAAGAAGACTCTTCCAAGTTCAG CTTTTGGGGAGGTAACAAAGATACAACAAAGCCAAAGTCAAATGATTGGTCCAGTTGGGGTGGAAATAGAGATGGAATAC AAGATGGTGGGTCTAAAAGAGCCCAAGATGATTCTTGGAGCTCTCAAAAAGATGTTACCAGAGAAAGCTCTTCTAAGGTT GATGCATGGGGTGCAAATAATGAGGCATCAAACCCCAAGTCAAATGATTGGTCAGCCTGGGGGAAAAATAAAGATGGAAC TCAAGATGGTGGTTCAGAGAGAGCCCAAGAGGATTCATTAAGCTTTGGTAAGTGGAAAGCTGAATCACAAGTTGAAGCTG ATACGGTGCAAGAAGACTCTTCTAAATCCAAAGCCTGGGAACGTACTTCTGACAATGTGAAGGTTGACAATAGCTCTTGG GGAAAACCCAAATTTCCAGAAACTCAAGCTTGGGATCCCCAGAAAGAGACAAATCAAGGTGCAGGTTCACGTGGGTGGGA CTCACAAATTGCTTCTGCTAATTCTGACAGTGATAGAAATTTTCAATGGGGAAAGCAAGGAAGAGAATCATTTAAGAAAA GTCGCTTTGAAGGTTCACAAGGTTGGGGATCAAATGCTGGTGATATGAAACATATGAATCGTCCTGGCAGAGTACCTGGA CCAAGGTTGGATATGTATTCATCTGAGGAACAGGATATTCTCAAGGATATTGAACCTATTGTCCAGTCCATCAGACGAAT AATGCAACAAGAAGGGTAAGTTCCCTAAGGCAGGTCTTTACAAGGTTCTTGAGTCTTGACAAAAAAAAAGGTTCTTACAA TGTTATAGAATGTTGTAATTGTAATTACATGTTATAATAAAAAGCATTTTTATGATGATAATCAAATGACAACATTTTCT TTGCATAAAACCATACGATCATCAAACCACTTTTGTTAGCTTAAACAAACAGTTTTGCTGTGGGTGTTATTCCTGTCCAT TTTAGAACCTTTACCTCTGTTCTCACCAGTTTTGCTTACTGCCACCATAGTTTTTTCAGGAAGTTACTTTTTTGTGTGAA TAAGATACCATTAGCTATCATATTACCTATCGCAGATCATTTTTGGTCAATTCTGATTGTTGATACAAGTCTATATTCTC TATTTTGGCCTTTAGAGCTTTTGATGCAGCGGAAGTCGTACTAGGATTGCAAGCGCAAATCCTAAGGAAAAGGTTTCTGG AATCCACCAGAAAGGAAATTAGCAAGCGCTAAAACCCTAGAAAATACACTGGAATCCACCAGAGAAGAAGAGAAAACTCT TAAATTTTATTATCAATCAAAACTCCCCCATAGGCTATGCCTTACAAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAAATATCCTAATAG TAAAATAAATAATATCCTAAAAGATCCTAATTGAAAATAAAAGATCCTAATTGAAAATAAATAAGTTCCTAACAAAAAAA TAATTAATATCCTAAAAGATCTTAATTACAAATAAGTAAAATTACTAAAATACTAAAATTATCTTAAAAAGCTCCTACAT CACAAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAAATATCCTATTAGTAAAATAAATAATATCCTAAAAGATCCTAATTGAAAATAAAA GATCCTAATTGAAAATAAATAAGTTCCTAACAAAAAATAATTAAGATCCTAAAAGATCTTAATTACAAATAAGTAAAATT ACTAAAATACTAAAATTATCTTAAAAAGCTCCTACATCAGTCTCCTCTTCTTGTAAAGAACTCGACCTCGAGTTCACATC ACGATAAAGGACTTCAGTTGCCTCAAAATACCAGGATCAAAAGGCTTCCAAATTAAACCAAGGAGAGTGAGTGTTGAATA TCTAATAAAAGCACATGGAAAAGAGTGTGGAGACTCCTGTTTTGAAACACTAGCATCCATCTTGTTGATGCCAGGATCAA ATTGTTTTCGCCAAACACCATGAAATTGATGGAGTGTGATTTCTGGATGAACTAGCCGTGATTGAAACAACTTCCAGTGG CATGGAATAAATTGTCTGAATTGCGAGTTAGACAAGTTGGATTGCAGTTCCTTTTTCTCAGGCATATTACCAAACAAATG GGGTGCAAACTTGGGAACAAGGACATATCGAACCTGAGGCACAACCATAAGTGTTAGATTGTAAGGTGTGAACACTGCTT CGATGCCCAAATTGACAGAGGTGTCTGGCTCAGATATAACATGGGGTACAACCTCTAAGATGTCATCAGATCTAGATAAA AGAGAACAGTGTGTTGGTGTTGGTGCGCTCTCGCTGCACAAATCATCCATCAACGTTTTTGCCTCATCTTCCAGGCCAAC AACAGAGGATGGCGCAAATGAAATTTGAGAATCAGATTCCGAAGAAGTTGCGTACATAGGTCTTGTAGAGGGACATGAAT TTGAAGTAGGTTTTGGTAGGGGTTGTGGTAAGGAAATTGGATCTGCAGTCGGTGATATGTTGGGGTAAGGATTGATAAGG TTTGGAGTAGCAGGTTGGGGGTGTGGAGTTTCGGTGGTTTTAGAGGTTGAGTACTGAACTTGGTAATAAGGATGAGATAC GGATGGTGAATGCAAAGATTGGGAAGGTAAAGATATAGCGGAACGATTGTTGTTGTTGTCGCGCGGAAACCTATGTGGTT TCCCTCTCCTGTCTCGTCCCCGGTTACCGTTGTTGGTATTGTTGATCTGCGCCGTTAAAGCCGCCGTGAACGTCGCCATA TGTTGTATCATCTGTTGTGTCATATGTTGCGTAATAGCAGTTAGGGCCGCGGTAAGAGCCACGGTAACATCCTTCAGGTC TGCTTTGGTCATTGGTTGATCTTCCATGGTTGATCAAGCAAAGAAAAGAGACAGGAGAAAGCCTGCTCTGATACCACTTG ATGCAGCGGAAGTCGTACTAGGATTGCAAGCGCAAATCCTAAGGAAAAGGTTTCTGGAATCCACCAGAAAGGAAATTAGC AAGCGCTAAAACCCTAGAAAATACACTGGAATCCACCAGAGAAGAAGAGAAAACTCTTAAATTTTATTATCAATCAAAAC TCCCATAGGCTATGCCTTACAAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAAATATCCTAATAGTAAAATAAATAATATCCTAAAAGAT CCTAATTGAAAATAAAAGATCCTAATTGAAAATAAATAAGTTCCTAACAAAAAATAATTAAGATCCTAAAAGATCTTAAT TACAAATAAGTAAAATTACTAAAATATTAAAATTATCTTAAAAAGCTCCTACATCACAAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAA ATATCCTAATAGTAAAATAAATAATATCCTAAAAGATCCTAATTGAAAATAAAAGATCCTAATTGAAAATAAATAAGTTC CTAACAAAAAATAATTAAGATCCTAAAGATCTTAATTACAAATAAGTAAAATTACTAAAATACTAAAATTATCTTAAAAA GCTCCTACATCACAAGTGCTTAAATAAGAAAAGAAAATATCCTAATAGTAAAATAAATAATATCCTAAAAGATCCTAATT GAAAATAAAAGATCCTAATTGAAAATAAATAAGTTCCTAACAAAAAATAATTAAGATCCTAAAAGATCTTAATTACAAAT AAGTAAAATTACTAAAATACTAAAATTATCTTAAAAAGCTCCTACATCAGCTTTCCTTCCCTCCTCTACTTCCTCTATGA ATTTTGTATCATAAGCTGTTTCATTCTTATCCTAATTTTCTGATAAATTCCTGGTACAGGTATAATGATGGGGATCCGCT GGGTGCTGATGACCAACAGTTTATACTGGAGAATGTCTTTGAACACCACCCAGATAAAGAAACCAAAATGGGTGCTGGAG TTGATTACGTCATGGTATCCTCTAATTCTATTTTATTGCCTTTTTAGCTTTCATCAACAGTTATACTTTATTTGATCTTA GCTGGGCTTTCCAAATATTCCAAAATGTTTGTCTTATGATGTCATTTTGGTTTCTTTCTTTCCTTCCATATAATGTATCC TTTTGTGTATGATGAATTGAGACATGAAAATATTTGTGTCTCTTTATATTTTCCTTTATTTAATTTTGGGAGCACTTGTG ACAGGTAAGCAGACACACCAGTTTTCAGGTAAGCAGGTGTCTTTATGTGGTTTTAAAGGATGGGCGAAGCGAAGACTTCT CATATAGAAAGTGTCTGGAAAACTTGGTAAAGAAAAAATATCCAGACCTTGCTGAGTCATTCAATGGCAAATATTTCCGG AAACCCCGTCCAAGGCAGAACCAGACCCCAACTTCAGCAGGGGATCAGACCCCAACTCCTGCGGGGGATCAACCACAAAC TACTGCGCCTGTAGAAGAATCCAAAGAGTAGAAGATTAGAGCTCTGTCCATAATATTGTACAGAAAGTGCACTGCTAAGG GAGGCAACTGAATAGGTTATCACAAGTTACATAGCTAACCAATTTTCCTGTGGAAGATGTTTCCCATTTTGTTGGCTTCT CGTCACTTATTTTTTGAAGCATGGTCATGTGAATATTTGAACTCTTGAATGATGCTAGCGCGTGATGTGCCTTTCAAACT GTTCCCTGCTCATCATTTAATCTAGCTATTTATTCAGCTTTACTATGCCAGAATGACAGCCTTCCGATTATTCAGTTCTC TCTTTCTCTCTAACCATTTGATCATATTTAATGGTTGAGATTAGAAGTGGTTCAAAATAACTCACGTGCTTCTTTTGTTC TGATATTAGATCCCGTAAAAAAAACTCTATTTTTCTTTGCAAAGCTATTATTAGACATTACTCACTTCCAG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0318900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGATAATCCAACTTCAAGTGTTTTAGATGCGGAAGTAGTTGGGATTCGATTTGGTATGGCTACACGCCAGGAAAT TTGTACAGCATCGATAAGTGACTCCTCAATTAGTCATGCTAGTCAGCTGTCAAATCCATTCCTTGGGCTGCCCCTTGAAT ATGGAAGATGTGAATCTTGTGGTACTTCTGAAGCAGGAAAATGTGAAGGCCACTTTGGATATATTGAGCTTCCAATTCCA ATATATCATCCTAACCATGTTAGTGAATTGAAGCGGGTACTGAGCCTGATTTGCTTAAACTGCTTAAAAATGAAGAAAAC CAAGTTTCCTTCTTCAAGCAGTGGTTTGGCACAGAGGTTATTATCTCCCTGCTGTCAGGATGCTAATGCTGCACAAGTTT CTATACGGGAAGTCAAAACAGCCGATGGAGCTGGTTACTTAGTACTGAAAGTATCTAAGTCAAAGATGCATGATGGTTTT TGGAGGTTTCTAGACAAGTATGGCTATCGTTATGAGGGCGATCATACTCGAGCTTTGCTTCCTTGTGAGGTGATGGAAAT TATCAAGAGATTTCCCCTAGAAACCAAGAAAAAACTGGCTGGGAAAGGATATTTTCCTCAAGATGGATATGTGTTGAAGT ATCTTCCTGTACCACCAAATTGCTTGTCTGTGCCTGTTGTTTCTGATGGCGTCAGTGTCATGTCTTCGGATCCTTCCATG ACATTTCTGAGAAAATTGCTCAGGAAGGTTGAAATCATCAGAAGTTCTAGATCTGGTGAACCAAACTTTGAGTCTCATGA AGTGGAAGCAAATGACTTACAGTCAGTGGTTGACCAGTATCTTCAAATTAGGGGCTGTGCTAAACCTGCCCGTGATATAG AAACACACTTCGGGGTCAATAAAGAGCTGAGTGATGCATCAAACAAAGCATGGCTTGATAAAATGAAAAGTCTATTTATA AGTAAGGGTTCAGGTTTTTCTTCAAGGAGTGTGATAACTGGAGATGGGTACAAGAGGACAAATGAAGTAGGAATTCCGCT TGAAATTGCCCAGAGGATAACATTTGAAGAGAGAGTAAACTTGCATAACATGTGTTTTTTACAGAAGTTGGTTGATGAAA ATTTGTGTCTCGCCTACAAGGAAGGTGTGTCAACATATTCACTGAGGGAGGGCTCAAAGGGGCACACATATCTTAAGCCT GGCCAGATAGTGCATAGAAGGATTATGGATGGGGACATCGTCTTCATTAACAGACCACCTACAACCCACAAACACTCATT ACAAGCACTTGTGGTCTACATCCACGATGATCACACGGTGAAGATAAATCCACTGATTTGTGGGCCTCTTGGAGCTGATT TTGATGGGGATTGTGTCCATTTATTTTATCCACAGTCACTTGCTGCTAAGGCTGAAGTAGTGGAATTATTCTCGGTGGAG AAACAGCTCCTCAGCTCTCACAGTGGTAATCTGAACCTGCAATTATCCACAGATTCCTTATTGTCACTGAAGATGTTAGT GAAGAAAGGTTTTATGGATAGAGCAGCTGCTAATCAATTGGCAATGTTTCTTTTCTTGCCTTTGCCACGACCTGCTTTGC TGAAGGCCGGTTCTGGTGATTCTTATTGGACATCCATCCAAATTTTGCAGTGTGCTTTGCCTTTATCTTTTGATTGTACT GGGGGACGTTACTTGATTAGGCAGAGTGATATCTTAGAATTTGATTTGAGTAGGGATGTTCTTCCTGCAGTTATAAATGA AATAGCAGCGTCAGTGTTCTTTGGGAAGGGTCCTCAAGAGGCACTGAATTTCTTTGATGTGTTACAACCGGTTTTGATGG AAAGCATATTCAGTAATGGATTTAGCGTTGGCTTACATGATTTTTCAATATCTGGGGCCGTGAAAAGGGTTACAGACAGA AACATAGGGAAAGTTTCCCCGCTGTTGTATCAGTTGAGGTTTATATATAATGAGTTGGTGGCACAGCAATTAGAGAAGCA CATGCAAGACATTGAACTTCCTGCTATAAAATTTGTTTCAAAATCATCCCGACTTGGGGATATGATTGATTCCAAAAGTA AATCAGCTCTTGATAAGGTGACACAACAGATAGGGTTCCTTGGGCAGCAACTCTTTGTGCGAGGGCGACTGTATTCCAAG GGGTTGTTGGAGGATGTTGCGTTACATTTTAAATTAAAATGTTACTATGATGGAGATGGTTATCCCTCAGCTGAATATGG ATTACTCAAAGGTTGTTTTTTCCATGGTTTGGACCCATTTGAAGAGTTAGTACATTCAATTTCCACAAGAGAGATAATGG TTCGCTCTTCAAGAGGATTGTCTGAACCTGGAACTTTATTTAAAAACTTGATGGCCATCCTTCGGGATGTTGTAGTTTGT TATGATGGAACTGTGCGAAATGTATGTAGTAATTCCATCATTCAGTTTGAGTATGGGGTAAAAGCTGGAGACAAAACTCG GTACTTATTCCCTGCTGGTGAGCCTGTAGGTGTCTTGGCAGCAACATCAATGTCTAATCCTGCTTATAAGGCAGTCCTTG ATGCTAGTCCTAGCAGCAGTTGTTCATGGGAATTGATGAAGGAAATACTTCTCTGCAAAGTCAATTTTCGAAATGAACCA ATTGACCGCCGAGTAATTTTGTACTTGAATGACTGCGATTGTGGAAGGAGGTATTGCCGAGAAAATGCAGCATATATAGT TAAAAATCAATTGAGAAAAGTCAGCCTGAAGGACACAGCTGTGGATTTCATTGTTGAATACCAACAGCAGCGGAAACGGG AAGGTTCTGAAACTGATGCAGGCCTTGTTGGTCATATTCATCTCGATGAGGTGATGTTGGAGGAGCTGAAGATCAATATG GCTGAAGTTTTCCAAAGATGCCAGGAAAAACTTCGTTCGTTAAATCGGAAAAGGAAATATTATCAAACTTTGAAGAGCAC TGAATTGTTTTTCAGTGAGTCTTGTGCTTCTCCAAATTTTTCTTCACCATGTGTGACATTCATTTCGCTAGATGGTGATG GTTTAGACAAAACCACTGAAATCCTGGCTGACGTAATCTGCCCGGTTCTGTTAGGTACAATAATCCAAGGAGACCCCCGA ATTAGCTCTGCGAATATAACCTGGATTAATCCTGACTCAAACGCATGGGTGCGCAACCCATCAAAGTCTTCTAATGGTGA ATTGGCACTAGACATCATTCTTGAGGAGGCAGCTGTTAAACAAAGTGGTGATGCTTGGAGGATAGTGCTTGATTCCTGCC TTCCTGTCCTTAACTTGATTGATACCAGGCGTTCTATCCCTTATGCTATTAAGCAGGTTCAGGAATTACTTGGGATATCA TGTACTTTTGATCAAGCAATCCAGCGTCTTGCAGCATCTGTGAAAATGGTAGCAAAAGGTGTTCTTAGAGAACATCTCAT TCTGTTAGCAAGCAGCATGACTTGTGGCGGGAATTTGGTGGGCTTTAATACAGGTGGATATAAAGCACTGGCTCGTCAAT TAAATATTCAAGTACCATTCACTGATGCAACTCTCTTTACTCCTAAGAAATGTTTTGAGCGAGCTGCTGAGAAATGCCAC ACTGACTCTTTATCAAGCATCGTTGCCTCCTGTTCGTGGGGTAAACCTGTGGCAGTTGGAACAGGATCAAGATTTGATGT TTTATGGGATGCGAAAGAGAGAAAGTCAAATGAACTTGAAGGGATGGATGTTTACAATTTTCTTCACATGGTGAAAAGCC TTATCAATGGGGAAGAAGAAAACGATGCTTGCTTGGGTGAGGACATTGATGATTTGCTAGAAGAGGAGAATGCTGATTAC GGCTTGTCCCCACAGCATACCTCCGGACTTGATGCTGTGTTTGAAGAGACTTTTGAAGCAATGAACGGTCCAGAATCCAA TGGCTGGGGTGCAACTACAGATCGGACTGAAACAAAGTCAACACAGTGGTCAGCCTGGGAAAGTAATAAAGCAGAAACAA AAGATGGTGGTTCTCAAAGAGTCCATGAGGATTCTTGGACTTCTCGTGATGTGATGAAAGATGATTCCCAGATGACCAAC GCTTGGGATGGAAACGTGGAACAGACCAAAACAATTTCAAATGATTGGACTGCTTGGGGGAAAAATAAATCGGAAATACA GGATAATGTGGCTGAAAAGGCCGAAGGGGAGTGTGGGAGCTCTGAAAAGTGGAAAACTGCTGTTATCCAAGAAGGCTCTT CCAAGTCCAATGCTTGGAAGTCAAACATAGAGCAACGTAGTGATGAGGATTCTTGGACCTCTCAGAAACTGAAAGCTGAT GTTATCCAGGACTCTTCCAAGCCAAGCTCTTGGGGAGCTAAACCCAAGTCGAATGACTCCTCCAATTGGGGAAGAAATAA AGATGAAATACAGGATGTTGTGTCTAGAAGAGCCGAAGATGATTCTTGGAGCTCTAAGAAACAGCTTAGTTCTGATGCTA CCCAAGAAGACTCTTCCAAGTTCAGCTTTTGGGGAGGTAACAAAGATACAACAAAGCCAAAGTCAAATGATTGGTCCAGT TGGGGTGGAAATAGAGATGGAATACAAGATGGTGGGTCTAAAAGAGCCCAAGATGATTCTTGGAGCTCTCAAAAAGATGT TACCAGAGAAAGCTCTTCTAAGGTTGATGCATGGGGTGCAAATAATGAGGCATCAAACCCCAAGTCAAATGATTGGTCAG CCTGGGGGAAAAATAAAGATGGAACTCAAGATGGTGGTTCAGAGAGAGCCCAAGAGGATTCATTAAGCTTTGGTAAGTGG AAAGCTGAATCACAAGTTGAAGCTGATACGGTGCAAGAAGACTCTTCTAAATCCAAAGCCTGGGAACGTACTTCTGACAA TGTGAAGGTTGACAATAGCTCTTGGGGAAAACCCAAATTTCCAGAAACTCAAGCTTGGGATCCCCAGAAAGAGACAAATC AAGGTGCAGGTTCACGTGGGTGGGACTCACAAATTGCTTCTGCTAATTCTGACAGTGATAGAAATTTTCAATGGGGAAAG CAAGGAAGAGAATCATTTAAGAAAAGTCGCTTTGAAGGTTCACAAGGTTGGGGATCAAATGCTGGTGATATGAAACATAT GAATCGTCCTGGCAGAGTACCTGGACCAAGGTTGGATATGTATTCATCTGAGGAACAGGATATTCTCAAGGATATTGAAC CTATTGTCCAGTCCATCAGACGAATAATGCAACAAGAAGGGTATAATGATGGGGATCCGCTGGGTGCTGATGACCAACAG TTTATACTGGAGAATGTCTTTGAACACCACCCAGATAAAGAAACCAAAATGGGTGCTGGAGTTGATTACGTCATGGTAAG CAGACACACCAGTTTTCAGGTAAGCAGGTGTCTTTATGTGGTTTTAAAGGATGGGCGAAGCGAAGACTTCTCATATAGAA AGTGTCTGGAAAACTTGGTAAAGAAAAAATATCCAGACCTTGCTGAGTCATTCAATGGCAAATATTTCCGGAAACCCCGT CCAAGGCAGAACCAGACCCCAACTTCAGCAGGGGATCAGACCCCAACTCCTGCGGGGGATCAACCACAAACTACTGCGCC TGTAGAAGAATCCAAAGAGTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0318900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEDNPTSSVLDAEVVGIRFGMATRQEICTASISDSSISHASQLSNPFLGLPLEYGRCESCGTSEAGKCEGHFGYIELPIP IYHPNHVSELKRVLSLICLNCLKMKKTKFPSSSSGLAQRLLSPCCQDANAAQVSIREVKTADGAGYLVLKVSKSKMHDGF WRFLDKYGYRYEGDHTRALLPCEVMEIIKRFPLETKKKLAGKGYFPQDGYVLKYLPVPPNCLSVPVVSDGVSVMSSDPSM TFLRKLLRKVEIIRSSRSGEPNFESHEVEANDLQSVVDQYLQIRGCAKPARDIETHFGVNKELSDASNKAWLDKMKSLFI SKGSGFSSRSVITGDGYKRTNEVGIPLEIAQRITFEERVNLHNMCFLQKLVDENLCLAYKEGVSTYSLREGSKGHTYLKP GQIVHRRIMDGDIVFINRPPTTHKHSLQALVVYIHDDHTVKINPLICGPLGADFDGDCVHLFYPQSLAAKAEVVELFSVE KQLLSSHSGNLNLQLSTDSLLSLKMLVKKGFMDRAAANQLAMFLFLPLPRPALLKAGSGDSYWTSIQILQCALPLSFDCT GGRYLIRQSDILEFDLSRDVLPAVINEIAASVFFGKGPQEALNFFDVLQPVLMESIFSNGFSVGLHDFSISGAVKRVTDR NIGKVSPLLYQLRFIYNELVAQQLEKHMQDIELPAIKFVSKSSRLGDMIDSKSKSALDKVTQQIGFLGQQLFVRGRLYSK GLLEDVALHFKLKCYYDGDGYPSAEYGLLKGCFFHGLDPFEELVHSISTREIMVRSSRGLSEPGTLFKNLMAILRDVVVC YDGTVRNVCSNSIIQFEYGVKAGDKTRYLFPAGEPVGVLAATSMSNPAYKAVLDASPSSSCSWELMKEILLCKVNFRNEP IDRRVILYLNDCDCGRRYCRENAAYIVKNQLRKVSLKDTAVDFIVEYQQQRKREGSETDAGLVGHIHLDEVMLEELKINM AEVFQRCQEKLRSLNRKRKYYQTLKSTELFFSESCASPNFSSPCVTFISLDGDGLDKTTEILADVICPVLLGTIIQGDPR ISSANITWINPDSNAWVRNPSKSSNGELALDIILEEAAVKQSGDAWRIVLDSCLPVLNLIDTRRSIPYAIKQVQELLGIS CTFDQAIQRLAASVKMVAKGVLREHLILLASSMTCGGNLVGFNTGGYKALARQLNIQVPFTDATLFTPKKCFERAAEKCH TDSLSSIVASCSWGKPVAVGTGSRFDVLWDAKERKSNELEGMDVYNFLHMVKSLINGEEENDACLGEDIDDLLEEENADY GLSPQHTSGLDAVFEETFEAMNGPESNGWGATTDRTETKSTQWSAWESNKAETKDGGSQRVHEDSWTSRDVMKDDSQMTN AWDGNVEQTKTISNDWTAWGKNKSEIQDNVAEKAEGECGSSEKWKTAVIQEGSSKSNAWKSNIEQRSDEDSWTSQKLKAD VIQDSSKPSSWGAKPKSNDSSNWGRNKDEIQDVVSRRAEDDSWSSKKQLSSDATQEDSSKFSFWGGNKDTTKPKSNDWSS WGGNRDGIQDGGSKRAQDDSWSSQKDVTRESSSKVDAWGANNEASNPKSNDWSAWGKNKDGTQDGGSERAQEDSLSFGKW KAESQVEADTVQEDSSKSKAWERTSDNVKVDNSSWGKPKFPETQAWDPQKETNQGAGSRGWDSQIASANSDSDRNFQWGK QGRESFKKSRFEGSQGWGSNAGDMKHMNRPGRVPGPRLDMYSSEEQDILKDIEPIVQSIRRIMQQEGYNDGDPLGADDQQ FILENVFEHHPDKETKMGAGVDYVMVSRHTSFQVSRCLYVVLKDGRSEDFSYRKCLENLVKKKYPDLAESFNGKYFRKPR PRQNQTPTSAGDQTPTPAGDQPQTTAPVEESKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 1384 | 1383 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 1384 | 1383 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 4 | 112 | 109 | 3.0E-7 | – | |
| SUPERFAMILY | 8 | 1231 | 1224 | 6.64E-168 | – | |
| Pfam | 41 | 281 | 241 | 5.9E-12 | ||
| SMART | 208 | 507 | 300 | 9.8E-50 | ||
| Pfam | 325 | 478 | 154 | 3.2E-32 | ||
| Gene3D | 326 | 473 | 148 | 1.5E-39 | – | |
| Gene3D | 353 | 408 | 56 | 1.5E-39 | – | |
| Pfam | 482 | 627 | 146 | 2.7E-8 | ||
| Pfam | 756 | 1169 | 414 | 1.6E-10 | ||
| MobiDBLite | 1302 | 1366 | 65 | - | – | |
| MobiDBLite | 1306 | 1332 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 1333 | 1351 | 19 | - | – | |
| MobiDBLite | 1352 | 1366 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1412 | 1717 | 306 | - | – | |
| MobiDBLite | 1436 | 1460 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 1461 | 1486 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 1487 | 1523 | 37 | - | – | |
| MobiDBLite | 1554 | 1577 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 1606 | 1626 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1646 | 1676 | 31 | - | – | |
| Gene3D | 1730 | 1823 | 94 | 3.6E-19 | – | |
| Pfam | 1747 | 1816 | 70 | 5.4E-22 | – | |
| MobiDBLite | 1831 | 1873 | 43 | - | – | |
| MobiDBLite | 1839 | 1866 | 28 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity | Catalysis of the reaction: nucleoside triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1). Utilizes a DNA template, i.e. the catalysis of DNA-template-directed extension of the 3'-end of an RNA strand by one nucleotide at a time. Can initiate a chain 'de novo'. | ||
| Biological process | Transcription, DNA-templated | The cellular synthesis of RNA on a template of DNA. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0318900.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…