Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0374500 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0374500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | calmodulin 1; TAIR: AT2G45670.1 calcineurin B subunit-like protein; Swiss-Prot: sp|Q8S8S2|LPCT2_ARATH Lysophospholipid acyltransferase LPEAT2; TrEMBL-Plants: tr|V7AMT1|V7AMT1_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0374500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:76717749..76727871) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAAATTAGAAGTTGGGATTGAGAGCAATGAGAAGTACTTGAGAGGAGTTTTGTTTTGTTTTTGGTCGACCTTGAGAGGA GTTCTTGACAATAAGTCAATAACACACATAGAAGAAAAAGATAAAATGTCCCCTAATTCTGAGGGAGATGAAATCTGATG AATTTATTACAATTTCTGCGATCTGCATATTCGTTCTAGTCCACTTCTCACGAAACAGGCCAATGGTCACTGTCGCACTA TAAAACCCATCAAAACCATGAAAGAATCAAATGGAATGATGCTCATGCTCCACACCACCCAAAACAACACATAAGCATTA GTCACTGTTCGTTCTCTCTTCACTCCCTTTCCCTTTTCAATGTCGGACAACAACGCCATCACCTCCCCGCTACTCTCCTC CGATCACCTAATCATCACCGTCGAATCCGACTCCGCTCCCCCCGCCGCCTCCTCACCGAATCCCTTCCGCGCGGTGGGAT GCGATGCGGAAGAGTTGACCGTGCCGCCGGCAATCACGGTGGACCCGTTCCGCAACGACAAGGCCAGGATTAAGGGAGTA TACGATTGGGTCAGGACACTGGTCTGCGTGCCGCTCATGCTGGCGCGGTTGGTGCTGTTCGGACTGTGCCTTGCGGTGGG GTTTGTGGCGACCAAGTTGGCGCTCTATGGATGGAAGGATAAGGAGAATCCCATGCCTGTGTGGAGGTGTAGAGTCATGT GGGTCACTCGAATTTGCGCTAGATGCATCCTCTTCGCTTTTGGGTAACCCTTTCAATTTCAACCCAATAGTTTCTCTTTT CTTTTTCTTCTGTTCATTCAAGATCTTACTCAGTTTTTGTTTTTTCCTTGATGGGATTTCATAGTTTTGTTCTTTTAAGC ACATACCATCTCTTTTTGAAATTGATTTAAGATGAAATTGATTTAAGATCTTGGTCAAGTTTGTGTGTGTTTGGAGAGGG TGTTTTATCTTGGTCTAAACAACCATTGATGGGAACTGTTGAATTGAATACATTCCTTTAGGTGATGGTAGTTGGAGAGA GCATATGATTGTGACTGATTCAGTTAACTGGTTTATGATTGAACTTGTTGGTTTGGTTTGACTTTATTGAAGTATATGTG ATCATTGATCTGATTAGTAATTTGATATGGTGTGATGTGGATCTCTTATAGTAAGGTCTGCATGGCGTAAAGGTCAAAAC TTGTGTCACTTGGCGACGAAAAATGCTAAGCTTTAAGCCGAGGGTTGAGGAAGCGGCTTACTTTTTATGGTTGACCGAAT TGCGATGCATGGATAACTTTTTTTGTTTTGGTTACCTATGCGTGGATAATAATTTACTTACTATGTTGATGGAGTTTATT GGTTTTAGTATCAGTTTGGAATTGGGGAGGGAGATGAATGATGTAAACACTAAACAAAAAAGAGCTTCATGTCATGTAAA TACAGAATTCACGGGTGCATCTCGCGTTATTTATGATAATTGTTTTGTTTATCATGAAGGGGGGGGGGGGACAGATAAAA AGATATAAAATATTGTTTATATTTTACATCAATAAAACCAGGTTTCCTTGTGATGTTATTAATTTAATATGTTGAATGGA AGGGTGCATGTGGGGATTGATTCTGCCATTTATGGCTTTTCGGGTGATTTCTCTGCCAGTTTTATTAGAGAGAACACGGG GAAGGTGAAATAGGAAAAGACTAAAAAATGGGACATTGACTTCATATGTCACATGATTAACAAATCTCAGTTAGATAACC TGTTTATGCTGTCTTATTGGAAAGGAGTATATGAAGTTTTGCGTTATTTTTCCTTCTTTGAGGTTGATTTCAGTTTTGTT TTACACACACACACACCGTTTACCTTAATTTGGTTCTGAATCACAGATTTATTCGTATTGTTGTTTCCTTCTGTCCATTG CAGCTATCAGTGGATAAAACGGAAGGGAAGACCTGCACCGAGGGGAATTGCTCCAATAATTGTATCGAATCATGTTTCGT ATATTGAGCCTATCTTCTATTTCTATGAACTATTTGCCACCATTGTGGCATCTGAGTCTCATGACTCCTTACCTTTTGTT GGCACCATTATTAGAGCAATGCAGGTAATTTCATTTCATGGTTACGTTTTATGTATGCTAGGTTAAAAATACAAGAAAAC ATGCTATTCATCCATTTTCCCTACTTTTTATTTTCTTTTCAGGTCGTATATGTTAACAGGTTCTCACCATCATCAAGGAA GAAAGCTATAAGAGAAATAAAGGTACACCATGTCTATTACTTTGCTTATTTCATTTGGTCTGCCTCTTAAAATTTTCTTT GTTCTTCGATTGTATGGTTTTGTCAACTGATGCTCAGTTGCTCACTTACCTTTCTATTCTCAGTTATGTTTTTGTCACCA CTATCTTTAGTTCAGGAGTTTCATTACACCATATGCTGCCTGTAGTGCGCCTATTTTTTGAACCCATCCTCTGTAGAGTT TCTTAAAATATATTTGGTTAAAATATTTGAAATTGAGTGAGAGTCACGCAAGGCATACTAGAAGTTCTTTTTCTGCTCAT GTGCAGGAAAGTGATAGTTTTTTTTTGTTGACTTCAGTGAAGAGTTATTCGAACAATGTGTTTTAGGATACAGTGCTACG TAAATGCTTGAGATTGTAAATAAGTTATGAAAGGTCTAGTTGGCCATATAAACTGGAAGAGAACCTCCGAGTTGAGTGAG AATTTAAGGGCATGTTTGATTTTAGAAAACAATTTATATCTTCATTTCCTTTTTTCAATTCTAATTACAAAAATACCACC TTGTTTAAACTTTCCTGTTTTCAAAGTTTTGTTTTCTGTTTCCTTGACAAACCTTTGAAAATGAAAACTATGTGACATTT TTGTTATCATAACCGAATACAGGAAATGAAAACATAAAATGGAACTGGAAACCAAACAAATCATAAACATGTAAAATTGC ATTCCCTTCAGATTTTGGAACTGAATAGCAAGATGCAGGACATATTTAAATTTTTAGGACCGGACAGTAGATATGTTGGG CATGTATTTTCTTCATTTAAGTTGTCATGTTATTAAGTTTATAAACTATTTGATATAGAAATCTGCTTTCAAGGATCTGA ATAACAGAGAAGGGCTTCTTGCGATAGATTTCCTCGAGTGCTATTATTTCCTGAGGGAACCACGACTAATGGTAGGAACC TCATTTCCTTCCAACTCGGTGCATTTATCCCTGGGTACCCAATCCAGCCTGTAATTGTACGCTATCCTCATGTGCACTTC GATCAATCTTGGTAGGCAATTTGTTTATGAAGATCCTTGTATTTTTTTTACTGTTGGTTGCTGGCATAACTTATTCACCC ATGCTGTTTTACGTGCGTATTATTCAGGGGTAATGTTTCTTTGGCTAAGCTTATGTTTAGGATGTTCACCCAGTTCCACA ACTTCTTCGAGGTATACTCTCTTATGGATTGGATTTTTCTTTACAATGTTATGCGTGGAAATTCATTGTTCTTGTAGTAG GTTAACACTTTCATCTTAAATTGAACAGGTAGAATATCTTCCTGCCATTTCACCCCTGCATGATAAGGAAACTGCGGTAC ATTTTCGTGAAAGGGTGAGTTTTCTAATTTTGTTTTTAGCTTTCAGATACAGTCAGAGGGATATTATGTTTATCCTTCTT GAATATTTGATTTTAACTTTAGATTACATGCTTTCATAATTTGCTTAATGCAGAAAACAATGGTCAATTGAGAATGGCAT GCTCACAATAGATAAAATTGGCATATCCAAGATGATGAGGCTGACATTGTTTATGGTCATAAAAGAAAAGAAAGTATTAG GGTTCAATTTATTTAAGAGAAAGTTAGACTGTTAGAGTCGTACCTATTGAAAGGAATTTAACCAGAACTCACCTAATAAT AATATTATGTAAACACTGCACTTTTTACCTTCCTTTTTTGTCCCTTTTTTTCAATTTGTCTTGTGTTAAGAATAAATGCA CTTGATAATTTGTTGAAGTTACTCCTTCCTTATGTGGGTATTTAGTAACTGTTCAACAATTAATATGTGGATAAATGTAG GTTAGCCGTGCTATGGCAGCTGCAATGAATACTGTCCAAACTGGACATTCATATGGAGACATAATGCTTCATATGAAAGC TCAAGAAGCAAAACAGGTGTGCACTTTTAATTATTGGTTACAATTATATCTTAATTCTAGTTAGTTAATTGCTACTCCCT CCGTTCCTAATTATAAGACATAATACAAAAAATTACGCTTATTAAGAAAACATTAAATGTGTCTAATTAGTGTATTGGTT TTTTAAAAATGCATACATTCCTCCATATTTACCCTTTGTCATTTTCTCTCACTAATTAATGGTAGGTGGTGATTAAAACT TTGGAATTGAAAACACACAATTAATGTGAGGGGTATATATGGAAGAGTAAAATACTTTTTGCTAGATTATTGTTAAAGGT CTTATATTTAGGAACATGAAAAATTTAAAATTAGGTCTTAGAGCATCTCCAATGCAAGGTTCTTAGTTCTTATTTTGGAG TTAAGAACTAAGAACTAAGAACTTTACCATTGGAGGTGCTGACATGGACTCCTTAGTTCTTAAAAATAAGAACTCAGTTC TTATATAAGATGTTTTGCTTTTTGAGTTCTTAGCTTAAAATATTAATTATTTCTCTCTCATCCAAATTACTTTATTACTT TATGAGTTTTGTTTTATTACTTTATGGAAAAAAAAAGTATAAATAATGTGGTTAGTGGGACCAAATGAATAGTAGTAAGA ACTAAGAACTCATGGTTGGAGCAAAATTACTTGAGAGTTGCTTAAACACATGTGGCAATACGGGCCCACATGAATAGTGC TAAGAACTAAGAAATAAGAACTAGCATTGGAGATTATAATTAGGAACGGAGGGAGTATTTACATTTTGAAATTTGTTTGC TTTCAATTGTATAAAATGGTCAAATACAAATTTGCAAACCAAGCACTCTGCTTTCTTGCTGTTGAAATGGCAATCTGGTT TACACTGAAGATCATCTCTTGTTATGGTATAGACCATGAATATTTTTGTTTGAAGCATGGCTTTGGAGAAAATTTCCATA GAATTAATTGCAGCAATTGAACTTATACCATTCATTTCTTAGTTCATTATAAAATGGAAATGTCATGATTGACCCAGTAA ATATTCAAAGCTACTGCTTAGGTTCGACTGATCATATTATTCTTCCATTTGGTTCTTATTGATTAGAATGTATGATCAGT AAAGAAAAAGTGAATGAACATATATTACTTCTTGTAGCTCGTATACATACCATAGGCAAACATAGTTTGTTCCTCCTTTC GTTCCTAATTATAAGACCCTATTAAGACAATTACGCATGTTAAAAAAATGCAATGAGACTAATTAATGTATTGATTCTTA ATTTTTTTACACAATCTTCCACATTTACCCTTAATTAATGTATTGGATAGCGTAGAAACAAATTATAATTACTAGTGGTA ATCAAAATTTTGGAATTACAAAAATATAATAAATACAAGGGGTATGGAAAAGGATAATAGTTTTTTCTGAAATTTCGTAG AGGGTCTTATATTGTGGGACTCCAAGTATGTCTCTAAAGGGTCTTATTATTAGGGTCAAAGGGAGTATTATCTGCTCTAA CAATCCATATTCCTGTCAAATTCCTTCATGCTACTCAGTACTACTAATCCATGTAATACTTGTTCTCTACCTACCTGCCT ATATTGGCCACATTCTTCCATTGAAGTTCTCATTTTTCTCACTTTTTTTCGTTTTATCTGATTATTGAAGCGATTTAATA AACATAATTTGTCACTAGTCAACATCTTCTTTTTTGCAACTTGAGATGTTATTTGAATAATTGAGGGTGAGAAGATAAGC GAATTCTGCAGTGATTTTAGAATTGATATTAAGAGAAGTAAAAGTTTTTGAACTTTTGTGTTAAGTTGAATACCTGCATG TTTAGTTTCCTGCTGAAAAGGTTCCAAATCACGATTAGGCAAATGCTACAAGAGAGAAGCTTTGTTTTTCTCAATGAAGA GGAAACTGAACGTGTTGTTTATTCTACGTGTGACACTCACCAAATTCTTCACCATTATACTTCAAAACTGATCTCATTTT ATCATCCAAACAAAATCTGCTTACCTGAACTACACTTTAACAGTTTTCATGCACCAAACAACTATTCAGGCACTCTTGCA TGTGTTTAGATGCTTTCTCTAGGTCTTGTTTGTATAAAATCATGATAATTTTAGCAACTTTATGGAATGAGGGTTGCAGT AGCCAACTCTTAATGTATAATATGGCCATATCAGGTGTCTGGATTATATTAAATATTTTCTCGTCTGTTATGACATGTGC TGAAATTTTCAAGTCTTCCTGGGTGTATTCTTATATTTTTCCCATAGGTTTTGATATTGTTCTGCTTCACCTGTTTTTAG TGCAACATAGCAATCCAGTTTTGTAGACAATGACATTTTAACTCATTGACTTTTTGCAGGAGAACCCCTCAAGTTATATG GTTGAAATGGCCAAGGTGGAATCAGTGAGTCTCTAAAAACAATGAGCTTGATTTAATGTTGTAGTTTTTGAAATACATCA TTTAACTACTATTTTTTTGGATTTTTTTTATACCAGTTTGATCTAGTCTGTCTTGTGTTAATTCAATTATACTGCTTGCA ATATTGGAAGGAAGGATAAAAGACATTTGTGTTTCTTTTCAGTTATTTCATATCAGCAGCTCGGAAGCTGTGGACTTTCT GGACAAATTCTTGGCTATGAATCCTGATCCAAGGTACTATATCACATTCTTGGTAGTTCTTGTAATCCTTTTTTGGTCAG TTGAAGGGGGAACAAAGTTACAAATTGATATTTTATATTTAGTGGTAAACAACTGAATATTAAATAATTGCTAGAACAGT TTGTTTTTAAAGTACTGATGTTAAAAATTAAGCACAAAGTACATTGACTACCAATGTTGACCTTTTACTTCAGTTGACCA TATTAGTTATAATGAAATCACCATGTTTGTCGGAAATATGTGTGGAAATACTTATGGCTGCTTACTTCCTATAATTCTAT GCAAAACTTCTCTAAGAAGTAATAATTCTTCACAGGAAGTGAAGTGTAAGGGTTGAAATAATTTTGAGCCAACAGTTACC TTTAAGTTTTGTAGCTGCTTACTCTCGTGTCTCTCTGGGGCAAGGACAACATGAAATGAGGATATCGGCTTTAGAATATG AATCTACCATGGTCCGAGTATATAACATGAAATTATATCTTCGGTTGGGCCTGTATGAGGTGCTTGGTGCAGAGACATCT TCACTCAAATTGGAGGACTGAACAAGAAGTCTATGTTTGGTAGCTGGAACGAGACATGCATCTAAAATTCCCTCTTTTTA ACTCAGATGCTTTATGGGATGCTCTTTAAACATATGTGTGTGTAATATCCTGACAGTTGTATGTTTGACTGTTTGAGATA GCCAATTGCAAGTATAAGGTGATTACAATTGTGGGACCAACTCTACTAATCCTATACAGATGCCTCCCTCATAGAGTTTT AGAAACAGCATATGGAGAACCAGTTAATCCCCCTTCTGTTGATGGGAGTTGTTGGTGACTCTTTCGCACAGTGAAAAACC TATAGCTCACTGTGTTCATATATAATAGGACCAAGTCATTGGAGCTTGTAGTGGTTTTTGAACCTATGCTTTTGTGCAAG TTATTCCTTTCTTTTTTAACTAGCAACCGAGGGCTTCCTGCAGTGTAGTAGTTTCTTTTGGATATGTTTGTTTATATATG GTCTCTCTGTAATTTTCCTTGTTATTACCACTAATAACTGCTAAATTTTGTGGTAATACTTCAGTGTTATTTTGTGGGAA TTGATAAGGTCTATGTCCTGCTTGCAGTGGTCGTGTTCAATATCGTGACTTTTTGAGGGTTTTAAGAATTAAGGCTTGCC CTCTATCTCGAAAGGTTAGTTATCTAATAGCTCAATATTTCTTTAATATTGTTATTAAAATCCCTCTAGATTATTGTTCT AACCCTGATTTTTTATGTTAAATTCAATAATATCATGTGCATGACACGCTTTTTGATAAATTACAATCATAATGCTGTGA TATTATTGTTTGAGTTTGTAATTTTGAGATAAAGTTTTCTGTACTAGTTTTTTCTTCCTTTTCTTCTCTGCTCCATTCTT TTAGCTTTTAGCAGGATTCTCTCTGGCTGCCAAAGCCTGAACTTCCATGTGACCTGAGTTCTTTCTGCTGCCTTTTTGGC CTTTCATTGTTGTATTGATTATATTTTATTACAGGTATTTGTATTCATTGATGTGGAGAAGAGTGGGACGATTACATTCA GACAGGTGACTATCAGCAATATTACAGATGACATCTGTTTGGATTTTAGGGCAAAAATCTAGTGACTGCTGCTTTAATTT CAAAATGTCCTTGTTGATTATGACATTCACGTCTTAAACACATGTTTGTATGTTGCTTCCAGTTCTTGTTTGGATCTGCG CATGTCATGAAGCAGCCAGGGTTCCGTCAAGCCTGTGAAGTTGCGTTTGCAGAGTGTGGTGGTGCAGTAAAGCCCTACAT TGTTGAACAAGAAGTATTATGATCTATCATATCATACTCCTATTTGCCTTCACTACATGTTGGATTAACATTAACTCGTT CTTCTTTCTGTGTCCCTTTGAATTCAGTTACGAGATTTTGTCCAATCTGCTATCCCGAGCTGGAATGAGGATGAGGTAAC TTACTCATTGATTTAACTAAACACCTGTTCCCTTCCGTGTTCCTGTTACTAGAATTTTGTTTAATCTTATTGCAGTTTGA CTGATGTTAACTGGTTACTTGTAGGTCCATGATTTTTTCATGTTATTTGATAAAGATAACGACGGGAAAATTGACAAGGA TGAATTTCTTTCATGCCTCAGTAGAAATCCTCTTCTGATAGCTTTCTTTACACCTCAACCACAGCACAAGGAAACCGGTT GTAATGGAGTGTTAGACATAGTGTGATGGGTGGATCTTACATGGGTGGATCTTACATTTGATTAAAATATGTGGCTTTTT AGGATGAGTACAAAGAAAGGAAAAGGGTAAGTATAGGATGCAGAGGCCTCTATTTTTCTTACTCTTATTTATTTTGTACC TTGACCTGATTAATTACTCGTAAAGCGTAATTATTTGGTTAAGATCTGTGTTGTCCTGCCTTATTTTGACAAGGCAGTTA CACAACTAGATTTCAGTTGAATTCTAGGTGTTGTGATCACATTGATCCGACATGAGTTTTGGTTCAGGGACCATAATGAC ATTTTGGGTCAATGTAGTTTTGTGCTAGGTTTGATTTGAACCACCGTGTCTTTCGTTTGTACCAGTGTATTTTTCATAGA TATCAACATGACGATGACGATATTAATGTAATTGGTCCTGGGTTTTTTTGAGAAGGTGGAATCTTGTGAAGGAATGATTT GCAGTGTTAGAAATTCTTGGATTAAGCTTTCAGTTGTATCATGGTAATTTTGATTTATGCTACCCCCCCCCCCCCCACAC ACACTTAAATCTTGATCAATATTATCATTTGGCATATAGTTTTGTTTTACTGTAAATTTCAAACTTCCATTAGAAAATGA TCGGTAAAATATCTGAGAATACAAGATTGGATACACATGGGTACCCTATTGATTCAAGACTCATTCACATGACAAAGAGC CTGCTAAAGTGTGTGCAGCAGTGTTTCTGAGATAGATAAGCTTGTTCGTTGTTTTGCTTCTTAATCATTTTATAGTTAAA TGAATAATAAATTAATTAAATTTTTAGATTGACAAACAATATGATTGAAAATTATAAAACTGCAATTAAAATATGATATT TGTCATATTATTTTATTGTAACATAAATATTATTTAAACTGTAAAAATATTTATGTTAAATTACACATGGAGGAATGCTA AAATTATTTAAAATTTAGTACACATAATCAACATGACATGGTTTAATGTTTAGGGGTTTTACAGATATTTGTCACACTAC CTTCTTTTTAGACATTTCCATTAATTTTTTCTCTTTCAAATCA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0374500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCGGACAACAACGCCATCACCTCCCCGCTACTCTCCTCCGATCACCTAATCATCACCGTCGAATCCGACTCCGCTCC CCCCGCCGCCTCCTCACCGAATCCCTTCCGCGCGGTGGGATGCGATGCGGAAGAGTTGACCGTGCCGCCGGCAATCACGG TGGACCCGTTCCGCAACGACAAGGCCAGGATTAAGGGAGTATACGATTGGGTCAGGACACTGGTCTGCGTGCCGCTCATG CTGGCGCGGTTGGTGCTGTTCGGACTGTGCCTTGCGGTGGGGTTTGTGGCGACCAAGTTGGCGCTCTATGGATGGAAGGA TAAGGAGAATCCCATGCCTGTGTGGAGGTGTAGAGTCATGTGGGTCACTCGAATTTGCGCTAGATGCATCCTCTTCGCTT TTGGCTATCAGTGGATAAAACGGAAGGGAAGACCTGCACCGAGGGGAATTGCTCCAATAATTGTATCGAATCATGTTTCG TATATTGAGCCTATCTTCTATTTCTATGAACTATTTGCCACCATTGTGGCATCTGAGTCTCATGACTCCTTACCTTTTGT TGGCACCATTATTAGAGCAATGCAGGTCGTATATGTTAACAGGTTCTCACCATCATCAAGGAAGAAAGCTATAAGAGAAA TAAAGAGAAGGGCTTCTTGCGATAGATTTCCTCGAGTGCTATTATTTCCTGAGGGAACCACGACTAATGGTAGGAACCTC ATTTCCTTCCAACTCGGTGCATTTATCCCTGGGTACCCAATCCAGCCTGTAATTGTACGCTATCCTCATGTGCACTTCGA TCAATCTTGGGGTAATGTTTCTTTGGCTAAGCTTATGTTTAGGATGTTCACCCAGTTCCACAACTTCTTCGAGGTAGAAT ATCTTCCTGCCATTTCACCCCTGCATGATAAGGAAACTGCGGTACATTTTCGTGAAAGGGTTAGCCGTGCTATGGCAGCT GCAATGAATACTGTCCAAACTGGACATTCATATGGAGACATAATGCTTCATATGAAAGCTCAAGAAGCAAAACAGGAGAA CCCCTCAAGTTATATGGTTGAAATGGCCAAGGTGGAATCATTATTTCATATCAGCAGCTCGGAAGCTGTGGACTTTCTGG ACAAATTCTTGGCTATGAATCCTGATCCAAGTGGTCGTGTTCAATATCGTGACTTTTTGAGGGTTTTAAGAATTAAGGCT TGCCCTCTATCTCGAAAGGTATTTGTATTCATTGATGTGGAGAAGAGTGGGACGATTACATTCAGACAGTTCTTGTTTGG ATCTGCGCATGTCATGAAGCAGCCAGGGTTCCGTCAAGCCTGTGAAGTTGCGTTTGCAGAGTGTGGTGGTGCAGTAAAGC CCTACATTGTTGAACAAGAATTACGAGATTTTGTCCAATCTGCTATCCCGAGCTGGAATGAGGATGAGGTCCATGATTTT TTCATGTTATTTGATAAAGATAACGACGGGAAAATTGACAAGGATGAATTTCTTTCATGCCTCAGTAGAAATCCTCTTCT GATAGCTTTCTTTACACCTCAACCACAGCACAAGGAAACCGGTTGTAATGGAGTGTTAGACATAGTGTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0374500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSDNNAITSPLLSSDHLIITVESDSAPPAASSPNPFRAVGCDAEELTVPPAITVDPFRNDKARIKGVYDWVRTLVCVPLM LARLVLFGLCLAVGFVATKLALYGWKDKENPMPVWRCRVMWVTRICARCILFAFGYQWIKRKGRPAPRGIAPIIVSNHVS YIEPIFYFYELFATIVASESHDSLPFVGTIIRAMQVVYVNRFSPSSRKKAIREIKRRASCDRFPRVLLFPEGTTTNGRNL ISFQLGAFIPGYPIQPVIVRYPHVHFDQSWGNVSLAKLMFRMFTQFHNFFEVEYLPAISPLHDKETAVHFRERVSRAMAA AMNTVQTGHSYGDIMLHMKAQEAKQENPSSYMVEMAKVESLFHISSSEAVDFLDKFLAMNPDPSGRVQYRDFLRVLRIKA CPLSRKVFVFIDVEKSGTITFRQFLFGSAHVMKQPGFRQACEVAFAECGGAVKPYIVEQELRDFVQSAIPSWNEDEVHDF FMLFDKDNDGKIDKDEFLSCLSRNPLLIAFFTPQPQHKETGCNGVLDIV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 72 | 72 | - | – | |
| PANTHER | 55 | 507 | 453 | 1.4E-124 | – | |
| PANTHER | 55 | 507 | 453 | 1.4E-124 | – | |
| Phobius | 73 | 98 | 26 | - | – | |
| TMHMM | 74 | 96 | 23 | - | – | |
| Phobius | 99 | 117 | 19 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 117 | 329 | 213 | 4.32E-18 | – | |
| Phobius | 118 | 139 | 22 | - | – | |
| CDD | 127 | 335 | 209 | 1.5507E-82 | – | |
| Phobius | 140 | 529 | 390 | - | – | |
| Pfam | 151 | 256 | 106 | 7.0E-12 | ||
| SMART | 152 | 262 | 111 | 9.0E-19 | ||
| Gene3D | 353 | 506 | 154 | 1.4E-19 | – | |
| SUPERFAMILY | 357 | 513 | 157 | 2.89E-23 | ||
| SMART | 403 | 431 | 29 | 32.0 | ||
| CDD | 405 | 498 | 94 | 1.34073E-9 | ||
| ProSiteProfiles | 405 | 434 | 30 | 5.587 | ||
| ProSiteProfiles | 472 | 507 | 36 | 14.513 | ||
| Pfam | 476 | 503 | 28 | 1.0E-7 | ||
| SMART | 476 | 504 | 29 | 7.2E-5 | ||
| ProSitePatterns | 485 | 497 | 13 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Calcium ion binding | Interacting selectively and non-covalently with calcium ions (Ca2+). | ||
| Molecular function | Transferase activity, transferring acyl groups | Catalysis of the transfer of an acyl group from one compound (donor) to another (acceptor). |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0374500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…