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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0451200 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0451200.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2; TAIR: AT2G20580.1 26S proteasome regulatory subunit S2 1A; Swiss-Prot: sp|Q9SIV2|PSD2A_ARATH 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|M5VGN0|M5VGN0_PRUPE Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0451200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:86459917..86468904) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATCTTCATTTTATTCTTCACTCCCTCGCTAAATCCCTCTTTCGCTCCTCGCTAACACGCTTTTAGGGTTTCCAATTTCCT CGCTTCTCCGATGGCGCCCGACCCCAATCGCGCCGGCGCCAGCTCCAGCGCCGCCCCCAAAGACGACGCCGTCGCCAAGA AGAAGGTCGAGACCGAAGATCTGGTGAGTCTAGTAGCTCTGCTTCAAATTTTCACTCATTCCACGCTTCAATTTTGCATT CTACTTTCTCAAGGAAAAAATCAAATTCGATTCATGTTTGTGTATTCAATCTGTGTAGTCGGATGAGGATTTAGCGTTAA AGCAGCAACTGGAGTTGTATGTTGAGAGGGTTCAGGATCCCGACGCTGGGTTGCAAAAGGTTGCCCTAGAGAGCATGAGG TAGGTAAACCTAGTTTTATAGCTGTGAATTGCAGAATGGAATTTGATTTGGATAGGTTGTGTTTAAAATTGGAATGTGTG GTTGTGTTGTAGGCAAGAAATTCGAACTTCAACTAGCTCCATGACTTCAGTTCCGAAGCCGTTGAAGTTTCTGCGACCCC ATTATGGTACTCTTAAGGCATATTATGAAATTATGCCGAAATCTGATTTGAAGGTATTGTTGCTGTTCATGTGTTTTGGT GCTGCTTTTATATGAAATGAATAAATAATTGTATAATGGCATGGTTATCTGCTGGTTAATCGATTTTTCTTTCTTAATGC AGAAGTACTTGGCTGATATATTATCAGTTTTGGCCCTTACCATGTCTGCTGAGGGCGAACGAGTGAGTTTCCTGTTTTAG AAATTGGAAATCTTTGGTTGCACCTTCATTAAGACAGTTTTTAAAACCTTCCGAAACAGTTTTCGTTTGGCTAACGTTTT GTATATTGACTATTTCCCCTGACTCTGCCAGGAAAGCCTCAAGTACAGATTATTGGGTTCAGAGGGTGATATTGGTTCTT GGGGCCATGAGTATGTTAGGTAAGAATTATCTTTTTTCTGGGACACTGTTTTTGTTTTTTGGCATTGAATTGGTTCTATT ATAAGTACATCCTAGGAAAACTAAAATTCTGTTGATTCGAATCTGACTGGAAAGGAGTGGTATATATCATCAGTCTTAAT CTTACTTTATATGTTTTTATTTTGTTGTCAGGAATCTGGCTGGAGAGATTGCACAAGAGTATGCAAAAAGACAGGTTAGG CGTCTGGCTTATTTAAATGATAATGAATGTATTCAGTTAAATGTTCTGCTATAGTAAACCCTTAATAAAACAAATTCTTC CTTCTCCATTTTCTTCTACAGAAAGCATGAACGTATGTTTGTAATATATTTGCAAGGTTCAGAAAATTACCCAATATTTA CATCTTGGAAGTGCTTTAACCATCCCATTTTGTGTACTCTTAGCTCATCCTGAGCCCATTGAATAACAATGCATCACCTT TTCCATGTATAGAGTCAACTATAATCTATTTTTGCATTTGGAAAAGTATGTCTGGAGTATGATTTAGGGTACGTTTGGGA AAACAGCTTAATTAAGTGCTTATGGAAAAATCTAATTAGCCTATATTGAAATAAGCTGAAATTGGGTTATAGGTAAGCTT AAAAGAGTGTAGGTAGGTCATGAACTATTTACATAAGCTCTCACAAAAACTTGCATAGGCACTTATACTATAAGATAAGC TAAAATAGCTCTTCCAAACGGGGCCTGGATCTATTGGCATAATCGTGCACCCGTTGGAAAAGTTGGGAGCCAAGGGGTGC ATAACCATAAATATAAATGTAGTAATTAATTGCAACAACAGTAATGATAATATACCCTCGAGTGTCTTGATCAGCTGAGA GGGTGTAGGTGCTCTTGAGTTCGCGTCTTGATACGCAGCTACGTTCAATATTAAGAGGGAGCTCATAGTGGTTTCCAGCG GAAATTTCCTGTGGTGTCGACCAAATATAATAATAATAATAATAGTAATAATAATGTATCAAATAAATTTAGTATGTCAT ATAGATATCAAACAACCATTGTGATTTGGATTTTTGTTGAGCTGTGTTAACTAATGGAAATTGAGTTCAGTTGTGCACCT ATTTGATTGCTTTCCAGCTCCTATGTAATCCTTAGATTTTTTTTGGGTGCGTTGACAGACTGAAGAGGCCCCCATAGATG ATCTCATGGAACTTGTACAACAAATAGTTGCTTTTCACATGAAGGTATCACATTCAATTTTTTTTTGAAATTTGTGCAAT ATATGGAATACTGGGTCACAAGATGTGTTGGAGGAAGATTATGAATTACATTTTGACTAATTTATTTGTCCGCAGCACAA TGCAGAACCTGAAGCTGTTGATCTTTTGATGGAGGTAAATTTTCCAGATCCTTATTTAGGTTGCTGGTTATGACACCAGA TGGTGAACTGAACTCTGTTTTCTTTTGATGAATGTTTACTTTTAGGTTGAAGACCTTGATTTGTTGGTTGAACATGTTGA TAAAACAAATTTTAGAAGGACTTGTCTGTATCTCGCCAGTTCAGCTAGGTAAGTGGAAAAAGGTCTCGGTTCACAAAGGT TTTAAGAGAATTCAAGTAAATCCCATGATAGCCAAGAAAGAGATGAGATGGTTCATCTTTACATATGAACTTTTGATTTT ACGTCATTCTGTTTATATAGTCATTGGCTTGGCTATGAAGCTTTTTATTTTTCTGGAATCTCATTCAAGAGTGGTTTTTT ATGACATAAAGGTTTGTTGGATGGAATTTGGTTTGCAATTTGGTCTTTTTTATGAAAGCTATTTTGATTTGTAAGCATCA TTTTGCATGATAAATCAGAGGTTGTTTTGGTTTATTGCTTTTATGTTTTGTTTGGGACTTTCGGTAAATTAGTCCTCTCT CTGTCTAACAGACAAGTGATTCTTTTTTTGGTTATTTTTCAGATACCTTCCTGGACCAGATGATATGTTAGTTTCAGACA TTGCATATTCGATTTATCTAAAATTTGAAGAATATCCGAACGCAATCCAAATTGCATTGTTTCTGGATAACATGCAGGTC TGGCACTCTCGAATTCTGTTTTTAAGTTTTTTAACTCTAATTTGTGATTGATTTTCATTTCGAAGGATAGTTCTTATCGA TAATTCACTAGCTTAAATTGTTTAAAATCTGAAATTACTTCTATATTTTGTTCCTTCATGCTTTCACGGTTAGAAACTAA CTAGTTCCGGTGTTGTTGACAGTATGTGAAGCAGGTGTTCACCTCCTGTGATGATGTGCTGCGAAAGAAGCAGTTTTGTT ACATCCTTGCACGTCATGTAAGTCCTGGGTTCTGTATTACTAACTAGCTTATGAGTATATCAAGTTCAAGTATCCTTCCA AGCGATAATGAATGTAACTGTTACCCCTCAGTTGTTTAACAGATTAACAGTGAAGTTATATACTCAACTCTTTTAAGCTT TATGTTTGTAAACATCAAAGTTAGTTGAAGTCTGAGACTCTGCGAAGATTCCTCTCAAATTTATTGAAGCTCTCTTTTGA TGGATTTTGTGACATTGATAATTATTTACGTGCAGGGAATTACTTTTGAGCTTGATGATACAATGGTTGCTGATGATGAG GACAGAGAAATGTTGCAGGAAATCATAAACAATTCTAAGTTAAGTGAAGGATATCTGACTCTTGCTCGTGATATTGAAGT CATGGAACCCAAGTCTCCTGAGGATATATACAAGGTGTGATTTTGATGATAAATTTACTTCTGCCATAATTAACACTGGA CTAGACATGACTTCCAGTTTGTTTCTAGTTTTTTATACATTTAATGCCCTGATATTTTAATTTTACTTAATTATATTAAT GTTGAATTTAATATAATGATATATACATGAACTATGTTCATATATTTTGGTGTTCATACTTCATATTTTAGTTTTGCAGC TTGAATTATGGTTGCTTGTCATGTCTAAGAATTTCTACTGATAAGATAAATATATGGAGATTGTGGAACAATTGATTCTG ATTATATGTATGTTTGCTGACTTTTTGTTTAAACTTAAAATGTAGATTCTGTGATGTGCTATTTTTGAGATTTTTTCAGA AGCTATTATTTTCTTACGTCTGCGAAAAACAGAAAAATTCTTTTTTTTGGTTAGTTTTTCTTTGGAAAACCTACATGATT AGTTATGATTTTTAAACATGTATTTTAGTCAGAGAAGTGCCTTTTTAGAAAAGAAACAAACAGGCCCTTAATGTCTTGCT TTGCTACAGAGTGGCCTTGTTAATTTCTTTTGGTGATTCCATCAAATTTGACTTATACTTTTGCAAATAATATTTTAGAA GACAATTTTTCTTGATGATTCATAAATGGAACTGTTTCTGATGTACTGAATAAGATAATGACTAGATAAGTTACTGGAGT TATACCTATGATTTGGTCATAATTGATGCAAAATACCAATATTTGAATTTTAAGAAATCAGGTCTTTTTGAATTTTAAGT TTGGCTATTTGTTGAGGATCCCTCATGGCTAACACAGCACTTTATCTTCCAATGCGTCTTGTATTTCAAAACGTGGCTGC GATCATATTACTAATAAATTAATAATAGATGTGCTAAAGAATGTGCTATTTTTTTGTCTGAAGTCTTTCAATTTCCTGAT TGGCTGAAAGCCTGAAACCTTACATTTTACTCTGCTTGGTTTTTACTAGGCACACTTGCTTGATGGTCGTGCTAGTGCTG GTGCCAGTGTTGATTCAGCTAGACAGAACCTTGCTGCTACTTTGGTTAATGCATTTGTGAATGCTGGTTTTGGCCAGGTA ACCTCATATTTCAAGATTGCTTTGGTTTTGGTTTACTGATTTCTTCTGTTTCTTCTGCTTGTTCCCTAATTTCAATTATT GCTGTGCAGGATAAGTTAATGACTGTTGCATCAGATTCTTCAAGTAGTGGTTCTTCTGGAAATTGGCTTTTCAAGAACAA GGAACATGGGAAGACTAGTGCTGCAGCAAGTTTGGTATTTTCACTGAATCATATCATTTTTCTTATTTATGGATCATTTA AATTTCATCTGCAATACTTATGTTATGTCATATGCATGTTATAACATAACAGGGTATGATTTTACTATGGGATGTTGACT CTGGACTTGCACAACTTGACAAATACTTCCATAGTAATGATAATCATGTCATTGCTGGTGCATTATTGGGAGTTGGAATT GTCAATTGCAGTATCAAGAATGACTGTGATCCTGTGAGTTCCTTTTATTCCGCCCTATGGTCAGTATGGCATATTTTTAT ATTTTCTGTATCATATCTTATTTGATTTCTTTTCAGGCAATGGCTCTCTTAGGTGACTATACAGATAAAGAGGATGCTTC AATCAGGATTGGTGCAATTATGGGATTGGGAATTGCATATGCCGGTTCACAGAATGAGCAGGTGAGCTGTTCCCCTTTAT ATTTGTAGGAATCTTATTCCAGTAATACTGCTTGTTGAGACATGTGTGGCTTTTTATTTGCAAATGTAAGAAGTTTTGAT TTATTCTTTGATTCTTTCAGTTACGTTGCAAATTGGCACCTATACTAAATGATACGAAAGCTTCACTTGATGTGATTGCT TTCACGGCAATTTCATTGGGCTTGATCTATGTGGGTTCTTGCAATGAAGAAGTTGCTCAAGCAATCATATTTGCACTGAT GGATCGTAGTGAGTCGGAGTTGGGAGAGCCCCTCACACGACTCTTACCTCTTGGCCTTGGTCTTCTTTATCTTGGGAAGC AGGTATTTAGAATTACTTTTTTTTTTCTGTTTTGGAATTATGGTTATGGCCGTTTTTGGCAAACAACTTAATTAAGCTCT TATTCGATAAACAATCATCATATGAGATTGTTAGGACCCCATTGCAAGGTATGGGACTTGAGTCCCACATTGGAAGTATG GGATTCTAATGTGGGGTTTATAAGGCCTTGGGCTCTCCAACTACAACAGCTAGTTTTTGTGGTGTGGTTCTCCCAAGGTT CTTATCAGAGATCTTATCTTATAGGCGCTTAAATTTAATAAGTTATTTGTGTTTGGGTATATAAATGAGAAAGAGCTTAT ACAAAACTAAAGCGTTTGGATGCATCATTACACAAGTGCTTATAAGTTATAACTTGGTAGATATATAAAGCTAAAAGCTA AAGAATTAAATATTATTATCATATATTTCTAAAAGTTAAAGATAATAAATTGAACATTAGTTACCATTTCATGTCATCCA TGTTAGTAATTCTGGAGCATTGAAATTGAGATTCAAAATTTGAATCACAGCTTTACTTTAAAAAAGATACTTCTGACTCA GTGCAGAAAAGCACCCAACAGAACAACTAAACTCATGTGAGTATCTTAATCCATCGTTGACCACAGCTTGACAACGTGAG GGAGGACAACTCGACTTCCAATTTCTGTCGAGAAAAATCTATACTTCCATACTAGACAGATTGAAAAAATGTAAAAGTTA CTCAGCCAAATTGGAAAATACTTCCTTTAATGTACCCAGTAAAAATTTTAAAAAACTATTCCTTTTCGAATGTTGATAAG TGATTATAATACAACATTCGAGAGTTATTTAAACAGTGAAAAACCTAGATAAGAAGAAATTGCTAAAGTGACCAGGAACT TTGATGCCCGTGGAAGGGAGAGGAAACAAATGCCATGCCAGTGGAAGAGAAAGGAAGGTGGAGGGTTTGTCGAGAAGGAA ATATGAAATTGTGATCCAAAAATAAAATTAGGAAGATGACTTTTTCTGGAGATGGGGTTCGTGAAAGCTCCACTTTTAAG CTAAGTGGAGCTTATTTCCATTAGCTTGGGAGAATAGCTTAATAGAATAAAGGTCAAAATAGCTTATGAAGGAGCAATTA GCGCTATTTATAAGCTCTGCCAAACACGTATATAAGTGCTTATACTTTTAGATAAGCTCAAATGAGCTGTAAATAAGCTC TCCCAACCTATTTCCTTTTCTCAGCGATATTATTTATTTAATTTTTGAATAACATTTGATAGCTAGGAGGGGTTTTGCTA TTAGGTTAGTTCAAAGTCACCATGGTGTATTATTTACACTTCACACTGCCTTGTGACAACAGGAAAATGTGGAGGCAACA GCTGAAGTTTCAAAGACTTTTAATGAAAAAATTAGGAAGTATTGTGACATGACACTACTATCATGTGCCTATGCTGGAAC TGGGAATGTTCTCAAGGTAAAATCTTATGAATTAGTTACTATATACTTTGAATACATTTCTGCTACAACTTTTTTTTTTT GGTTTCTTATGCTTCTTTCATGCAGGTTCAAAATCTATTGGGTCATTGTTCACAACATCTCGATAAAGGTGAAGCACACC AGGGACCTGCAGTGCTTGGAATTGCTATGGTAGCAATGGCTGAAGAATTAGGTGTTGAGATGGCAATTCGATCATTGGAA CATCTTCTACAATATGGAGAGCAAAATATTCGCCGGGCTGTTCCTCTGGCACTTGGTCTACTGTGTATATCAAATCCAAA GGTAAAATGGGTTTGCACCCCTGCCTTTTATCACTTTGGTAATTTCAAGTCTGAAACACATAATGACCTTGCTCCGAAAA GATAGCTAAGTTAAACCTCTAGTAAAATTGCTTAGGCAAGATGTCACTTTTGTCTACTTTTGGTAATCCTTTACTGTATC ATCACAGGTCAATGTTATGGATACCTTAAGCAGACTTAGCCATGACACTGATTCAGAAGTTGCAATGGTAAGATGGTAGA GCTACTTTACTTTAATCATTATGGTATATCTCTTGATCTATAATCTATATGTAAAAAAACATTTTGTATGCTAACAGGCT GCAGTTATCTCCTTGGGTCTAATCGGTGCTGGAACAAACAATGCTCGAATCGCTGGCATGCTTCGCAATCTTTCAAGCTA TTACTACAAGGATACCAGCCTTCTATTTTGTGTATGCTTCATACAAATTCATCCTTATTTTTTTAATTTCCGGTGTTTCA GTGCTCACTGGTTTACTTTTCCTACAGGTGCGGATTGCCCAAGGTCTTGTACATTTGGGAAAGGGTTTATTAACGCTTAA TCCATACCATTCTGATCGCTTCTTACTATCACCGTGAGTAAATCCTTATTTGCCAATCTCCTTTTATCTGTCATAAATCC AACCTTGTGTTGTGAGCTAGCAAGCCAAATTAGTTGGTGATTTCAAATGACACGTACTGCTTTCTTGTAACAATTTGTAA TTGTCATTTTTCCTTTCATGTTTTACAGGACAGCACTTGCTGGACTAATTACCATGTTGCATGCATGCCTTGACATGAAA GCTATCGTGTTGGGAAAATATCACTATGTCCTCTACTTCCTCGTTTTGGCAATGCAGGTTTGAGTCTCATTTCCTCTTTG ATTGATTCCCCCCCCCCCCTCCATTTCAAGTTAATCTAAGACTCTTTTTGAAGATGGGCTTATCTTATAGCTTATGCGCT TACACAAGTATCTATGACTTATTAGCTGTTTTGAGCTTATTTTCATGAATATGCATTTATACTTAACTATAACCTATTTT GAGATTATTTCATTAAGCTTCTCAACTTAGCTTATGAATAAGCGCTTATTACATTAAGGCTTATTGCCATAAGACTTAAT TTGTTTTTGGTTGCAACAGCCGAGGATGTTGTTGACTGTGGATGAGAACTTGAAGCCTCTGTCAGTGCCTGTTCGGGTTG GTCAAGCAGTCGATGTTGTCGGACAAGCAGGTCGTCCTAAGACAATTACTGGCTTTCAGACCCACTCAACCCCTGTTCTC CTGGCTGCTGGGGATAGGGCAGAGCTGGCAACAGAAAAGTAATGTACCACTGCCTTAAAATTTTCAAAACACGATTTTGT TGTCTTTCAAATACTAACAGTTGATTTTTCTGCAGATACATTCCCCTGTCACCCATTCTAGAAGGTTTTGTAATTTTGAA GGAGAATCCAGATTATAGGGAAGAGTGA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0451200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAACTTGTACAACAAATAGTTGCTTTTCACATGAAGCACAATGCAGAACCTGAAGCTGTTGATCTTTTGATGGAGGT TGAAGACCTTGATTTGTTGGTTGAACATGTTGATAAAACAAATTTTAGAAGGACTTGTCTGTATCTCGCCAGTTCAGCTA GATACCTTCCTGGACCAGATGATATGTTAGTTTCAGACATTGCATATTCGATTTATCTAAAATTTGAAGAATATCCGAAC GCAATCCAAATTGCATTGTTTCTGGATAACATGCAGTATGTGAAGCAGGTGTTCACCTCCTGTGATGATGTGCTGCGAAA GAAGCAGTTTTGTTACATCCTTGCACGTCATGGAATTACTTTTGAGCTTGATGATACAATGGTTGCTGATGATGAGGACA GAGAAATGTTGCAGGAAATCATAAACAATTCTAAGTTAAGTGAAGGATATCTGACTCTTGCTCGTGATATTGAAGTCATG GAACCCAAGTCTCCTGAGGATATATACAAGGCACACTTGCTTGATGGTCGTGCTAGTGCTGGTGCCAGTGTTGATTCAGC TAGACAGAACCTTGCTGCTACTTTGGTTAATGCATTTGTGAATGCTGGTTTTGGCCAGGATAAGTTAATGACTGTTGCAT CAGATTCTTCAAGTAGTGGTTCTTCTGGAAATTGGCTTTTCAAGAACAAGGAACATGGGAAGACTAGTGCTGCAGCAAGT TTGGGTATGATTTTACTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCACAACTTGACAAATACTTCCATAGTAATGATAATCATGT CATTGCTGGTGCATTATTGGGAGTTGGAATTGTCAATTGCAGTATCAAGAATGACTGTGATCCTGCAATGGCTCTCTTAG GTGACTATACAGATAAAGAGGATGCTTCAATCAGGATTGGTGCAATTATGGGATTGGGAATTGCATATGCCGGTTCACAG AATGAGCAGTTACGTTGCAAATTGGCACCTATACTAAATGATACGAAAGCTTCACTTGATGTGATTGCTTTCACGGCAAT TTCATTGGGCTTGATCTATGTGGGTTCTTGCAATGAAGAAGTTGCTCAAGCAATCATATTTGCACTGATGGATCGTAGTG AGTCGGAGTTGGGAGAGCCCCTCACACGACTCTTACCTCTTGGCCTTGGTCTTCTTTATCTTGGGAAGCAGGAAAATGTG GAGGCAACAGCTGAAGTTTCAAAGACTTTTAATGAAAAAATTAGGAAGTATTGTGACATGACACTACTATCATGTGCCTA TGCTGGAACTGGGAATGTTCTCAAGGTTCAAAATCTATTGGGTCATTGTTCACAACATCTCGATAAAGGTGAAGCACACC AGGGACCTGCAGTGCTTGGAATTGCTATGGTAGCAATGGCTGAAGAATTAGGTGTTGAGATGGCAATTCGATCATTGGAA CATCTTCTACAATATGGAGAGCAAAATATTCGCCGGGCTGTTCCTCTGGCACTTGGTCTACTGTGTATATCAAATCCAAA GGTCAATGTTATGGATACCTTAAGCAGACTTAGCCATGACACTGATTCAGAAGTTGCAATGGCTGCAGTTATCTCCTTGG GTCTAATCGGTGCTGGAACAAACAATGCTCGAATCGCTGGCATGCTTCGCAATCTTTCAAGCTATTACTACAAGGATACC AGCCTTCTATTTTGTGTGCGGATTGCCCAAGGTCTTGTACATTTGGGAAAGGGTTTATTAACGCTTAATCCATACCATTC TGATCGCTTCTTACTATCACCGACAGCACTTGCTGGACTAATTACCATGTTGCATGCATGCCTTGACATGAAAGCTATCG TGTTGGGAAAATATCACTATGTCCTCTACTTCCTCGTTTTGGCAATGCAGCCGAGGATGTTGTTGACTGTGGATGAGAAC TTGAAGCCTCTGTCAGTGCCTGTTCGGGTTGGTCAAGCAGTCGATGTTGTCGGACAAGCAGGTCGTCCTAAGACAATTAC TGGCTTTCAGACCCACTCAACCCCTGTTCTCCTGGCTGCTGGGGATAGGGCAGAGCTGGCAACAGAAAAATACATTCCCC TGTCACCCATTCTAGAAGGTTTTGTAATTTTGAAGGAGAATCCAGATTATAGGGAAGAGTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0451200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MELVQQIVAFHMKHNAEPEAVDLLMEVEDLDLLVEHVDKTNFRRTCLYLASSARYLPGPDDMLVSDIAYSIYLKFEEYPN AIQIALFLDNMQYVKQVFTSCDDVLRKKQFCYILARHGITFELDDTMVADDEDREMLQEIINNSKLSEGYLTLARDIEVM EPKSPEDIYKAHLLDGRASAGASVDSARQNLAATLVNAFVNAGFGQDKLMTVASDSSSSGSSGNWLFKNKEHGKTSAAAS LGMILLWDVDSGLAQLDKYFHSNDNHVIAGALLGVGIVNCSIKNDCDPAMALLGDYTDKEDASIRIGAIMGLGIAYAGSQ NEQLRCKLAPILNDTKASLDVIAFTAISLGLIYVGSCNEEVAQAIIFALMDRSESELGEPLTRLLPLGLGLLYLGKQENV EATAEVSKTFNEKIRKYCDMTLLSCAYAGTGNVLKVQNLLGHCSQHLDKGEAHQGPAVLGIAMVAMAEELGVEMAIRSLE HLLQYGEQNIRRAVPLALGLLCISNPKVNVMDTLSRLSHDTDSEVAMAAVISLGLIGAGTNNARIAGMLRNLSSYYYKDT SLLFCVRIAQGLVHLGKGLLTLNPYHSDRFLLSPTALAGLITMLHACLDMKAIVLGKYHYVLYFLVLAMQPRMLLTVDEN LKPLSVPVRVGQAVDVVGQAGRPKTITGFQTHSTPVLLAAGDRAELATEKYIPLSPILEGFVILKENPDYREE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 713 | 713 | 0.0 | – | |
| Pfam | 1 | 173 | 173 | 3.8E-61 | ||
| PANTHER | 1 | 713 | 713 | 0.0 | – | |
| Phobius | 1 | 524 | 524 | - | – | |
| Gene3D | 176 | 631 | 456 | 1.2E-120 | ||
| SUPERFAMILY | 229 | 579 | 351 | 4.03E-27 | ||
| Pfam | 307 | 337 | 31 | 3.0E-4 | ||
| Phobius | 525 | 543 | 19 | - | – | |
| Phobius | 544 | 554 | 11 | - | – | |
| Phobius | 555 | 575 | 21 | - | – | |
| Phobius | 576 | 589 | 14 | - | – | |
| Phobius | 590 | 608 | 19 | - | – | |
| Phobius | 609 | 619 | 11 | - | – | |
| Phobius | 620 | 637 | 18 | - | – | |
| Phobius | 638 | 713 | 76 | - | – | |
| Pfam | 657 | 710 | 54 | 3.4E-32 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0451200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…