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LotjaGi3g1v0527900.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0527900
Transcript ID LotjaGi3g1v0527900.1
Related isoforms 7
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase; TAIR: AT3G13530.1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7; Swiss-Prot: sp|Q9LJD8|M3KE1_ARATH MAP3K epsilon protein kinase 1; TrEMBL-Plants: tr|K7LNY1|K7LNY1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0527900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:94462649..94484862) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTGCACTTTAACATACTTCTATTTTATTGAAATATATATATATATATATATATTTCCTTTTTCTTCTTCATCATCTCCTT CTTCTTCTTCATTTCATTTTAAATTATCAGTTTATGTGTATATATATATATATATACATTCTCATTAATTAATTAATTAA TTAACGTGCGTTCTCTTCTCCGGCGTCAATTCTCAATTCCTTTGCCATGCGTGGCTTCCTCCGTCGTCATCTCTGCTAGG GTTTGCTTTCTCCGATCTCCGCCGCACCACCACCACCACCGCAGAGATGTCGCGCCAGTCGACGTCGTCTGCGTTCACCA AATCGAAGACGCTCGATAACAAATATGTACGCCCATTTTTCCCTCTTCCACTCTCATTCTCTGTTGATCTCAACGGTTTC GTGATTAATTTGAATAATTGAGAAGAAAACGAAGAAATGCTGCTTGAAATGTTACAGTTAATTGCTTTGTTTGAGTCCAA TTTGCTGAATTATCGCTCTCTAGACTCTTGAATTGTGCACTGGAAAAATTCTGATTAGTGGAAGCTTTAGGTTTATGTTG TTTAAGAAACTTAGGGTGATTTATTAGAAGCTAAGAAATGATGATGATTATAGTTAAGGCGAGGCTGCTACTGTAGAAGT TGAGACTTGACATGCAGTGGTTGTGTACTAGGAAATGTGGATGGTAGTAAGGTTAGTCAATTCAGGGTGATGGTGTGGTG TAGCTGATAGCGCGGCATTGGGTTGGGTTGGGGTGAAGGGGTAATGTGGGGTGGTGGGAGGTGGAAAAATGATATAGTGA TGGTGGTTGCAAAGATGAGGTTAAAACAAGGTCTGTATGCTGGGCAAGGGCCAGATGTGGGGGGATGGTGCTTGATGGTG GCAGTTGCTAGTTGCTTAGGTTGTTAGATGTTTTTGATTCTTTTTTATCATTGCTTACGTGTTTTAGTTAATTTTTTAGG 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TATCTTGAATATTTTTTACACGGGTATTTTATTGGTTACAGAATAGGTTTTGGTTTTATACTGTTGATACTTAAAAGTTA AAAGGTATTCCATTCCTGATATAGTTTTAAACCATGTACCTTATAGTCAAATGGCTATTAAAACATTAGATGATTCTAAA ATCCCCATTTTCTTCTTTTCTGCTATCTTTGTCTGGTTTATAAACTATAAGTCATTTATGTTTCTCTATGAACGGCACAG TAATTTTGTGGTTATGCAGATGTTTCTCAACGTGGGAGGGAAAATGGAAATCTTGACTCCAGTGCTAGAGTGTCTCACAA AGTTGCTCCCAAGAAATTAGGGACTTTTGGTTCTAGTGAAGGAGCTGCTTCTACATCTGGGATTGTATCTCAGACAGCAT CAGGTGTACTGTCTGGTTCAGGTGTTCTAAATGCTAGACCAGGTAGTGCTACTTCATCTGGGCTACTTTCCCACATGGTT TCATCATTGAATGCAGATGTTGCAAGAGAGTACCTGGAAAAAGTGGCAGATCTTCTGCTTGAATTTGCACAAGCTGACAC AACAGTGAAGTCGTACATGTGTAGCCAAAGTTTGCTTAGTCGTCTTTTCCAGATGTTCAATAGGGTGGAGCCTCCTATTT TGTTGAAGGTGTGACACAAAATTCATCTGCTATTTATTGTTAAGCAACTTTAGCTTATATACTACATCTATAATTTCTTA CCATTTATGTATTGGCATATTTTCTAGATACTGAAGTGTATCAATCATCTGTCAACTGATCCAAATTGCTTAGAAAATCT TCAGCGTGCTGAAGCCATTAAACACTTGATACCAAATCTTGAACTCAAAGAAGGGACTCTTGTATCAGAGATACATCATG AAGTGAGTCTTACTGGCCTTCTTAATATTGTTAAAAGTTAGTTTTGAACTAAAAGCTTCTATTCATTGTGCTATTCAATA TTTGAACACCTTTTTGTCAACAAATGTGATTAGTTGGTAGGTAATAAAAAACATACTTTTATTACTCATTAATTTTCTAT TCAATTATTTCTCACTGTCTTTTGTAACAAGTTTGAATAAACTTTGCTGTAGTCATGTAGCAACTAAAAGTTTGTTTTAC TTTTACCATCCAAAAAAGACAACAGTATTGAAGTCTAGCATAAATATATTGGCTTCTGGACTGTTTTTTCCAATTTACAA GTGTGGTTATCTGCGATTTTTTTGTCCTTTGTCATGTTGTGGCAGATATCCAAAGTTGGCGTGAATCTCACCTTTCAACT CTTGACAGGTTCTGAACGCACTGTTCAATTTATGCAAGATAAATAAGAGAAGACAGGAACAAGCAGCTGAAAATGGAATC ATTCCCCATTTGATGCAATTCATCACATCAAATTCTCCCCTGAAACAATATGCGTTGCCTCTGCTATGTGACATGGCTCA TGCATCTCGCAACTCAAGGGAGCAGTTAAGGGCTCATGGTGGTTTGGATGTCTATTTGAACCTTCTTGAGGATGAACTTT GGTCTGTGACAGCACTAGATTCAATTGCTGTTTGCTTAGCCCATGACAATGACAACAGGAAGGTTGAACAATCATTGCTG AAAAAGGACGCAGTTCAGAAGCTTGTGAAGTTCTTCCAGAGCTGTCCTGAGCAACATTTTGTACACATATTGGAGCCATT TTTGAAAATCATCACGTATAGTATTCTAAGTCCTTTTATTTCTTCCGTCCAGTTAATTAAGTATTTGGTTTTAGATCCTT TAATTATTTGATAAAGTAGTCTTTGGGTTGATGTTTGATAAGTTATAAACTAAGGATGTCTAGGTTGTTGCACCAAAGTT TCTTTTCTTATTGTGAAGTTGACTGGATGTAAGATGGACAAGTTTTCACTTTAGGTGCTAAATTTACGGATAGCAGAGAA TGAATTAGGATTCCACCAAATTGGCAGCCTTGTTATATCTAGGACCTGATGCCATTAGAAGTTAGATTTAGTAGCATATG ATTAATAAGAAATATAAGATATGGTGGGGCAAAATGAGAGTGTTGTTTATCTTTAGGCCAAATACTTATATAGTAAATGT AGTATAAGAGAACTGTTTGTTCAAGGTATGTGCACCAAACATTCTACAAGGATTGGGTCCCCGGTCGTTAGAGATATAGC CTAGTCTCTACTGTTAGTCTGTTGCACAATTAGCTTAGCCTACTGTTGTTAGCTTACTGTCAGGTAGTAAGGGATTTTTT TATAGTTTATACTAGAGATGATTTATACGTACTTCTAGCCCAGAGAATTATAAGTACTTAGAAAATCATTTTATATGTTT TTTCTCCAAATGTTATCATTCTTACTTTCTTTTCTTCATATAATTATATTGCAGAAAATCTTCCCGGATCAATACCACAT TGGCTGTTAACGGATTAACACCATTGCTCATTGCAAGGCTTGATCATCAGGATGCTATAGCTCGTCTTAATTTACTCAGG CTAATAAAGGTATGCATATATGATATTTGTTATACATTTGAGAATTCTGGTGCGCCCTACCACACGTTAACCAACCTTAA GCATTGCTTTAGTCTAAGACGCTTTAAATTCAGTCATGAAACAAGGTAAAAAACTAAGGTGGCCAAACTTTGGTGCAGGA TTTTACTTCTAGAACTATAAACCTTTTAAGTATGATGTTCATGTATGTGTGGCTTCACATACTGAAGAAAGTCTTAAACT ACATCCATATTATGCATATTTCTTTAGATAGTAATAATGTAGTGATTCCATAAGAGCTTCATTTGAGAAATTGGTTTCTC TGCAGTTGTATTTAACTTGATAAGTTTTAATAATTGAATGAGCGTATTAAGTTTCGAACGTGAGAAAGTAAACTCCTGAT GCAGATATCTCAGGTTTCCAACATATGGTTTCAAATAACATGCTCCTATTTTGTTCCTTTTTTTTCTAGTGTCATTATAT AAATTCGAAGGTGCTATCATTTCATTTATAATAAACACCAGTGTCTTTTGATCCTGATAGATGATTTGTGGATAGATTAG ATAAGCCTTCTCCAAAATGTGGAATATTAAAATTGAATGAGCGTATTAATAATTCAAATATATCTAACCATATGGGCTTA AAAGACAATCATATCTTGATATCCTCTCAAGATAGAGTGAAACATGGTTATTTTGTTTTCCCCTAGACATTACTTGGTAT AAAATATGTATGAATGTGACATCCAATGGATCTCTGCACATTGTTTTTGCAGGCTGTTTATGAGCATCATCCGCAGCCCA AGAAGCTGATTGTGGAGAACGATCTTCCTGAGAAACTTCAAAACTTAATAGGGGAACGGAGAGATGGACAAGTGTTGGTG AAACAGATGGCTACTTCATTGCTTAAAGCTCTACACATCAACACCGTATTGTAAATTTAGATTTACATGGTCATTTTCTT TAATGTATATTTAGATTTTATTGGGGAAAGATACTTATCCTTGTATATAAGTTTCCCCTTATATTTTCTCGGTTTGCTTA TTTTACTGTTTGGTTGAGTGAGAAAAATTAGCATAGGCTGAGGTATGTTTTTGACTCTCTTGGATAGTATTTTTGTTGGT GGCTGATTTTTCCGGCTTGAGTTGCCGAAATGTTTTTGCTTTTTTGGCCAACTGTATAGTTCTTTTAGTATGGATGCGAG GTGGAAAATTTTCTGGTGCTATCAAGAACTATTTGTTTATTGAAGCGGTATAGTTCTTTTAAATTTCAGGTGCTATCAGC TGTATAGCTCTTTTAAATAGGCCCTTAAAATGTATCAGGGCTTTTATTTCCTTGCGTTTAGATACCGTCAGGACGTAAAA CAAAGAGCATATATAGGAGCTTATTTAGTGCTTTTTCTAGTAGTTAAGCTCCAACAAGCATGCATTTTTATGCGCCTTTC ACTTAGCTTTTGACGTTATGCATGTTTAATTCATAAGTAGATGCACATATTCCC 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0527900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCCCCAGAGGTTATAGAAATGTCCGGGGTTTGCGCAGCTTCTGACATTTGGAGTGTTGGCTGTACGGTTATTGAACT TCTTACATGTGTTCCTCCTTACTATGACTTGCAGCCTATGCCAGCTCTTTTCCGAATTGTACAGGATGAGCAACCTCCAA TTCCTGATAGCCTTTCACCTAACATTACTGACTTTCTGCATCAGTGCTTTAAGAAGGATGCAAGACAAAGGCCTGATGCG AAAACGCTGCTGTCTCACCCCTGGATCCTAAACTGTAGACGTGTCCTGCAGTCTTCTCTTCGTCATAGCGGAACATTAAG AACTATAAAGGATGATGGTTCTGCAGTTGCAGAAGTTTCTGGTGGCGACCATAAGAGCACTGGTGAAGGATCTTCTGTGG AGAAAGAGGACTCTGCAAAAGAGTTTTCAACTGGGGAAGCTAATAGCAGGAAATCTCATGAAGACAACGCTTCAGATTCT AATTTTTCCAACGAGAGAACAGAGAAGGAAGATGATATTCCATCAGATCAGGTTCTTACTTTAGCCATTCGTGAGAAGTC ATTTCTACGAACTGGTTCTGGCAATCTCTCTTCTAGTATAGAAGTGGTTAGTGCTGAGCCAACTGGCACTGAAACTTCAA ATGCTAAAGACCTTCATGAAGTCATAATGAATGGAGAAGTTGAATCTCCACAATCAAGAGGAAAGGCTAATATGGCTGTA GGAAAAGACAGTTCTATCAATAATCGCACTAAACCATTTGCTTTTGAACCAAGAGGACAAGATAGTGGTTCCCTAAAGGC AATGAAGATACCGCCCCCTGTGGAAGGAAATGAGCTGAGTAGATTTAGTGACCCTCCAGGAGATGCCTACTTAGATGACT TATTTCATCCATCAGATAAGCAATCTGGGGAGGTTGTGGCTGAGGCATCCACATCTACATCTACTTCACATATAGCTAAA GGTAATGTATCTATGAATGATGGTGGGAAGAATGACCTTGCCAAAGAGTTGAGGGCTACAATTGCTCGAAAGCAATGGGA GAAGGAGAGTGAAATTGGGCAGGAAAACAATGGTGGGAACCTTTTACACCGAGTGATGATAGGTGTTCTAAAAGACGATG TTATTGATATAGATGGTTTGGTCTTTGATGACAAACTTCCTGGAGAAAACCTTTTTCCTCTACAGGCCGTTGAGTTCAGC AAATTAGTTGGTTCTTTAAGAACAGAAGAATCAGAAGACGTGATTGTCTCTGCTTGTCAGAAACTTATTGGTATATTTCA TCAACGCCCAGAGCAGAAGATTGTATTTGTTACCCAGCATGGTTTACTTCCTTTGACTGACTTGCTAGAAGTTCCTAAAA CGCGCGTCATATGTTCTGTGCTTCAGCTTATAAATCAAATAGTTAAAGACAACACTGATTTTCAAGAAAATGCATGTCTT GTTGGATTGATTCCGGCAGTCATGAGCTTTGCAGTATCTGATCGTCCTCGAGAGATTCGTATGGAAGCGGCTTATTTTTT ACAGCAGCTTTGTCAGTCAAGTTCTTTGACATTACAAATGTTTATAGCTTGCCGTGGGATACCTGTTTTGGTGGGATTTC TTGAGGCTGATTATGCCAAGTACAGGGAGATGGTTCATCTGGCTATTGATGGCATGTGGCAGGTGTTTAAACTTCAGCAG ACAACGCCTAGAAATGATTTTTGTCGGATAGCTGCAAAAAATGGGATACTCCTTAGGCTTATAAATACCCTTTATAGCTT AAATGAGTCAACTCGATTAGCTTCTATGTCTGCTGGGGGTGGATTTCTGGCTGATGGTTCGGCTCAACGGCCACGTTCTG GTATCTTGGATCCTGCACACCCTTTTATGAATCAGAACGATGCACAGCTATCTTCAGCAGATCAGCAAGATCTCTCTAAA GTGAGGCGTGGTGTGCTGGATCATCACTTAGAGCCTATGCATGCTTCGTCTTCCCATCCTCGAAGATCAGATGCTAACTA CCCAACGGATGTTGATAGACCTCAATCGAGCAATGCAGCAGCTGAAGCTGTGTCACTGGGGAAGAGTTTGAATCTCACTT CGAGGGAATCTTCAGTAGTTGCATTGAAAGAGCGAGAGAATGTGGATCGTTGGAAAACTGATCCTTCTCGGGCTGAAGTT GAACCCAGACAGCAGCGTAGTAGTATTTCTGCTAACAGGACATCAACAGATAGGCCTCCAAAATTGGCAGAACCTTCTTC GAATGGGCTATCAATGACAGGAGCTACACAGCAAGAACAAGTTAGGCCTCTTCTTAGCTTGTTGGAGAAAGAGCCTCCAT CTGGACGCTTTTCAGGACAGCTTGAGTATGTCCGTCAGTTTTCAGGATTAGAGAGACATGAAAGTGTACTCCCTTTGTTA CATGCCACTGAAAAGAAAACAAATGGTGAACTAGACTTTTTGATGGCAGAATTTGCAGATGTTTCTCAACGTGGGAGGGA AAATGGAAATCTTGACTCCAGTGCTAGAGTGTCTCACAAAGTTGCTCCCAAGAAATTAGGGACTTTTGGTTCTAGTGAAG GAGCTGCTTCTACATCTGGGATTGTATCTCAGACAGCATCAGGTGTACTGTCTGGTTCAGGTGTTCTAAATGCTAGACCA GGTAGTGCTACTTCATCTGGGCTACTTTCCCACATGGTTTCATCATTGAATGCAGATGTTGCAAGAGAGTACCTGGAAAA AGTGGCAGATCTTCTGCTTGAATTTGCACAAGCTGACACAACAGTGAAGTCGTACATGTGTAGCCAAAGTTTGCTTAGTC GTCTTTTCCAGATGTTCAATAGGGTGGAGCCTCCTATTTTGTTGAAGATACTGAAGTGTATCAATCATCTGTCAACTGAT CCAAATTGCTTAGAAAATCTTCAGCGTGCTGAAGCCATTAAACACTTGATACCAAATCTTGAACTCAAAGAAGGGACTCT TGTATCAGAGATACATCATGAAGTTCTGAACGCACTGTTCAATTTATGCAAGATAAATAAGAGAAGACAGGAACAAGCAG CTGAAAATGGAATCATTCCCCATTTGATGCAATTCATCACATCAAATTCTCCCCTGAAACAATATGCGTTGCCTCTGCTA TGTGACATGGCTCATGCATCTCGCAACTCAAGGGAGCAGTTAAGGGCTCATGGTGGTTTGGATGTCTATTTGAACCTTCT TGAGGATGAACTTTGGTCTGTGACAGCACTAGATTCAATTGCTGTTTGCTTAGCCCATGACAATGACAACAGGAAGGTTG AACAATCATTGCTGAAAAAGGACGCAGTTCAGAAGCTTGTGAAGTTCTTCCAGAGCTGTCCTGAGCAACATTTTGTACAC ATATTGGAGCCATTTTTGAAAATCATCACAAAATCTTCCCGGATCAATACCACATTGGCTGTTAACGGATTAACACCATT GCTCATTGCAAGGCTTGATCATCAGGATGCTATAGCTCGTCTTAATTTACTCAGGCTAATAAAGGCTGTTTATGAGCATC ATCCGCAGCCCAAGAAGCTGATTGTGGAGAACGATCTTCCTGAGAAACTTCAAAACTTAATAGGGGAACGGAGAGATGGA CAAGTGTTGGTGAAACAGATGGCTACTTCATTGCTTAAAGCTCTACACATCAACACCGTATTGTAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0527900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAPEVIEMSGVCAASDIWSVGCTVIELLTCVPPYYDLQPMPALFRIVQDEQPPIPDSLSPNITDFLHQCFKKDARQRPDA KTLLSHPWILNCRRVLQSSLRHSGTLRTIKDDGSAVAEVSGGDHKSTGEGSSVEKEDSAKEFSTGEANSRKSHEDNASDS NFSNERTEKEDDIPSDQVLTLAIREKSFLRTGSGNLSSSIEVVSAEPTGTETSNAKDLHEVIMNGEVESPQSRGKANMAV GKDSSINNRTKPFAFEPRGQDSGSLKAMKIPPPVEGNELSRFSDPPGDAYLDDLFHPSDKQSGEVVAEASTSTSTSHIAK GNVSMNDGGKNDLAKELRATIARKQWEKESEIGQENNGGNLLHRVMIGVLKDDVIDIDGLVFDDKLPGENLFPLQAVEFS KLVGSLRTEESEDVIVSACQKLIGIFHQRPEQKIVFVTQHGLLPLTDLLEVPKTRVICSVLQLINQIVKDNTDFQENACL VGLIPAVMSFAVSDRPREIRMEAAYFLQQLCQSSSLTLQMFIACRGIPVLVGFLEADYAKYREMVHLAIDGMWQVFKLQQ TTPRNDFCRIAAKNGILLRLINTLYSLNESTRLASMSAGGGFLADGSAQRPRSGILDPAHPFMNQNDAQLSSADQQDLSK VRRGVLDHHLEPMHASSSHPRRSDANYPTDVDRPQSSNAAAEAVSLGKSLNLTSRESSVVALKERENVDRWKTDPSRAEV EPRQQRSSISANRTSTDRPPKLAEPSSNGLSMTGATQQEQVRPLLSLLEKEPPSGRFSGQLEYVRQFSGLERHESVLPLL HATEKKTNGELDFLMAEFADVSQRGRENGNLDSSARVSHKVAPKKLGTFGSSEGAASTSGIVSQTASGVLSGSGVLNARP GSATSSGLLSHMVSSLNADVAREYLEKVADLLLEFAQADTTVKSYMCSQSLLSRLFQMFNRVEPPILLKILKCINHLSTD PNCLENLQRAEAIKHLIPNLELKEGTLVSEIHHEVLNALFNLCKINKRRQEQAAENGIIPHLMQFITSNSPLKQYALPLL CDMAHASRNSREQLRAHGGLDVYLNLLEDELWSVTALDSIAVCLAHDNDNRKVEQSLLKKDAVQKLVKFFQSCPEQHFVH ILEPFLKIITKSSRINTTLAVNGLTPLLIARLDHQDAIARLNLLRLIKAVYEHHPQPKKLIVENDLPEKLQNLIGERRDG QVLVKQMATSLLKALHINTVL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 1 113 113 4.8E-26
Pfam 1 89 89 6.5E-16
SUPERFAMILY 1 90 90 2.41E-24
ProSiteProfiles 1 89 89 16.796
PANTHER 1 1216 1216 4.0E-226
PANTHER 1 1216 1216 4.0E-226
MobiDBLite 113 176 64 -
MobiDBLite 128 175 48 -
MobiDBLite 228 266 39 -
MobiDBLite 310 330 21 -
Gene3D 396 601 206 2.8E-16
SUPERFAMILY 400 596 197 2.21E-21
SMART 429 469 41 6.2
MobiDBLite 613 636 24 -
MobiDBLite 650 683 34 -
MobiDBLite 659 683 25 -
MobiDBLite 708 757 50 -
MobiDBLite 722 757 36 -
Gene3D 877 1218 342 4.6E-24
SUPERFAMILY 887 1214 328 2.36E-28
SMART 960 1004 45 110.0
SMART 1006 1045 40 7.9

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0527900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…