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LotjaGi3g1v0527900.7

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0527900
Transcript ID LotjaGi3g1v0527900.7
Related isoforms 7
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase; TAIR: AT3G13530.1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7; Swiss-Prot: sp|Q9LJD8|M3KE1_ARATH MAP3K epsilon protein kinase 1; TrEMBL-Plants: tr|K7LNY1|K7LNY1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0527900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:94462935..94484302) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGTCGCGCCAGTCGACGTCGTCTGCGTTCACCAAATCGAAGACGCTCGATAACAAATATGTACGCCCATTTTTCCCTCT TCCACTCTCATTCTCTGTTGATCTCAACGGTTTCGTGATTAATTTGAATAATTGAGAAGAAAACGAAGAAATGCTGCTTG AAATGTTACAGTTAATTGCTTTGTTTGAGTCCAATTTGCTGAATTATCGCTCTCTAGACTCTTGAATTGTGCACTGGAAA AATTCTGATTAGTGGAAGCTTTAGGTTTATGTTGTTTAAGAAACTTAGGGTGATTTATTAGAAGCTAAGAAATGATGATG ATTATAGTTAAGGCGAGGCTGCTACTGTAGAAGTTGAGACTTGACATGCAGTGGTTGTGTACTAGGAAATGTGGATGGTA GTAAGGTTAGTCAATTCAGGGTGATGGTGTGGTGTAGCTGATAGCGCGGCATTGGGTTGGGTTGGGGTGAAGGGGTAATG TGGGGTGGTGGGAGGTGGAAAAATGATATAGTGATGGTGGTTGCAAAGATGAGGTTAAAACAAGGTCTGTATGCTGGGCA AGGGCCAGATGTGGGGGGATGGTGCTTGATGGTGGCAGTTGCTAGTTGCTTAGGTTGTTAGATGTTTTTGATTCTTTTTT ATCATTGCTTACGTGTTTTAGTTAATTTTTTAGGGTTCGCATAGGGAGTGTACTGAGAGGATTATATATATGCTGTAGTT GTTGAATTTTATCTGCAAATGTTTGATTTTATGGTTCATCTTGTCTTGGTTATATATTTCAAATTTCATATGGGATTGGC TCATATTTTAATGGTTGATTGCTTTGCCTGCATGTGAGATTCGGAGCAGATGCTGGGAGATGAGATTGGGAAAGGAGCTT ATGGTCGAGTGTACAAAGGTTTGGACCTGGAGAATGGAGATTTTGTTGCAATTAAGCAAGTTTCTTTGGAGAATATTGCT 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GAAATCTTGACTCCAGTGCTAGAGTGTCTCACAAAGTTGCTCCCAAGAAATTAGGGACTTTTGGTTCTAGTGAAGGAGCT GCTTCTACATCTGGGATTGTATCTCAGACAGCATCAGGTGTACTGTCTGGTTCAGGTGTTCTAAATGCTAGACCAGGTAG TGCTACTTCATCTGGGCTACTTTCCCACATGGTTTCATCATTGAATGCAGATGTTGCAAGAGAGTACCTGGAAAAAGTGG CAGATCTTCTGCTTGAATTTGCACAAGCTGACACAACAGTGAAGTCGTACATGTGTAGCCAAAGTTTGCTTAGTCGTCTT TTCCAGATGTTCAATAGGGTGGAGCCTCCTATTTTGTTGAAGGTGTGACACAAAATTCATCTGCTATTTATTGTTAAGCA ACTTTAGCTTATATACTACATCTATAATTTCTTACCATTTATGTATTGGCATATTTTCTAGATACTGAAGTGTATCAATC ATCTGTCAACTGATCCAAATTGCTTAGAAAATCTTCAGCGTGCTGAAGCCATTAAACACTTGATACCAAATCTTGAACTC AAAGAAGGGACTCTTGTATCAGAGATACATCATGAAGTGAGTCTTACTGGCCTTCTTAATATTGTTAAAAGTTAGTTTTG AACTAAAAGCTTCTATTCATTGTGCTATTCAATATTTGAACACCTTTTTGTCAACAAATGTGATTAGTTGGTAGGTAATA AAAAACATACTTTTATTACTCATTAATTTTCTATTCAATTATTTCTCACTGTCTTTTGTAACAAGTTTGAATAAACTTTG CTGTAGTCATGTAGCAACTAAAAGTTTGTTTTACTTTTACCATCCAAAAAAGACAACAGTATTGAAGTCTAGCATAAATA TATTGGCTTCTGGACTGTTTTTTCCAATTTACAAGTGTGGTTATCTGCGATTTTTTTGTCCTTTGTCATGTTGTGGCAGA TATCCAAAGTTGGCGTGAATCTCACCTTTCAACTCTTGACAGGTTCTGAACGCACTGTTCAATTTATGCAAGATAAATAA GAGAAGACAGGAACAAGCAGCTGAAAATGGAATCATTCCCCATTTGATGCAATTCATCACATCAAATTCTCCCCTGAAAC AATATGCGTTGCCTCTGCTATGTGACATGGCTCATGCATCTCGCAACTCAAGGGAGCAGTTAAGGGCTCATGGTGGTTTG GATGTCTATTTGAACCTTCTTGAGGATGAACTTTGGTCTGTGACAGCACTAGATTCAATTGCTGTTTGCTTAGCCCATGA CAATGACAACAGGAAGGTTGAACAATCATTGCTGAAAAAGGACGCAGTTCAGAAGCTTGTGAAGTTCTTCCAGAGCTGTC CTGAGCAACATTTTGTACACATATTGGAGCCATTTTTGAAAATCATCACGTATAGTATTCTAAGTCCTTTTATTTCTTCC GTCCAGTTAATTAAGTATTTGGTTTTAGATCCTTTAATTATTTGATAAAGTAGTCTTTGGGTTGATGTTTGATAAGTTAT AAACTAAGGATGTCTAGGTTGTTGCACCAAAGTTTCTTTTCTTATTGTGAAGTTGACTGGATGTAAGATGGACAAGTTTT CACTTTAGGTGCTAAATTTACGGATAGCAGAGAATGAATTAGGATTCCACCAAATTGGCAGCCTTGTTATATCTAGGACC TGATGCCATTAGAAGTTAGATTTAGTAGCATATGATTAATAAGAAATATAAGATATGGTGGGGCAAAATGAGAGTGTTGT TTATCTTTAGGCCAAATACTTATATAGTAAATGTAGTATAAGAGAACTGTTTGTTCAAGGTATGTGCACCAAACATTCTA CAAGGATTGGGTCCCCGGTCGTTAGAGATATAGCCTAGTCTCTACTGTTAGTCTGTTGCACAATTAGCTTAGCCTACTGT TGTTAGCTTACTGTCAGGTAGTAAGGGATTTTTTTATAGTTTATACTAGAGATGATTTATACGTACTTCTAGCCCAGAGA ATTATAAGTACTTAGAAAATCATTTTATATGTTTTTTCTCCAAATGTTATCATTCTTACTTTCTTTTCTTCATATAATTA TATTGCAGAAAATCTTCCCGGATCAATACCACATTGGCTGTTAACGGATTAACACCATTGCTCATTGCAAGGCTTGATCA TCAGGATGCTATAGCTCGTCTTAATTTACTCAGGCTAATAAAGGTATGCATATATGATATTTGTTATACATTTGAGAATT CTGGTGCGCCCTACCACACGTTAACCAACCTTAAGCATTGCTTTAGTCTAAGACGCTTTAAATTCAGTCATGAAACAAGG TAAAAAACTAAGGTGGCCAAACTTTGGTGCAGGATTTTACTTCTAGAACTATAAACCTTTTAAGTATGATGTTCATGTAT GTGTGGCTTCACATACTGAAGAAAGTCTTAAACTACATCCATATTATGCATATTTCTTTAGATAGTAATAATGTAGTGAT TCCATAAGAGCTTCATTTGAGAAATTGGTTTCTCTGCAGTTGTATTTAACTTGATAAGTTTTAATAATTGAATGAGCGTA TTAAGTTTCGAACGTGAGAAAGTAAACTCCTGATGCAGATATCTCAGGTTTCCAACATATGGTTTCAAATAACATGCTCC TATTTTGTTCCTTTTTTTTCTAGTGTCATTATATAAATTCGAAGGTGCTATCATTTCATTTATAATAAACACCAGTGTCT TTTGATCCTGATAGATGATTTGTGGATAGATTAGATAAGCCTTCTCCAAAATGTGGAATATTAAAATTGAATGAGCGTAT TAATAATTCAAATATATCTAACCATATGGGCTTAAAAGACAATCATATCTTGATATCCTCTCAAGATAGAGTGAAACATG GTTATTTTGTTTTCCCCTAGACATTACTTGGTATAAAATATGTATGAATGTGACATCCAATGGATCTCTGCACATTGTTT TTGCAGGCTGTTTATGAGCATCATCCGCAGCCCAAGAAGCTGATTGTGGAGAACGATCTTCCTGAGAAACTTCAAAACTT AATAGGGGAACGGAGAGATGGACAAGTGTTGGTGAAACAGATGGCTACTTCATTGCTTAAAGCTCTACACATCAACACCG TATTGTAA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0527900.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTCGCGCCAGTCGACGTCGTCTGCGTTCACCAAATCGAAGACGCTCGATAACAAATATATGCTGGGAGATGAGATTGG GAAAGGAGCTTATGGTCGAGTGTACAAAGGTTTGGACCTGGAGAATGGAGATTTTGTTGCAATTAAGCAAGTTTCTTTGG AGAATATTGCTCAGGAGGATCTTAACATCATTATGCAAGAGATTGATTTGTTAAAGAATTTGAACCACAAAAACATTGTA AAGTATCTTGGATCCTTAAAGACAAAGAGTCACCTGCACATAATTCTTGAGTATGTGGAGAATGGCTCACTTGCAAATAT TATCAAGCCAAATAAATTTGGACCCTTTCCAGAATCATTGGTTGCTGTTTATATTGCCCAGGTGTTGGAAGGCTTGGTTT ATCTGCACGAGCAAGGTGGTCTTGTCAAACTTGCTGATTTTGGTGTGGCAACAAAATTAACAGAGGCTGATATTAATACC CATTCAGTTGTTGGAACACCATACTGGATGGCCCCAGAGGTTATAGAAATGTCCGGGGTTTGCGCAGCTTCTGACATTTG GAGTGTTGGCTGTACGGTTATTGAACTTCTTACATGTGTTCCTCCTTACTATGACTTGCAGCCTATGCCAGCTCTTTTCC GAATTGTACAGGATGAGCAACCTCCAATTCCTGATAGCCTTTCACCTAACATTACTGACTTTCTGCATCAGTGCTTTAAG AAGGATGCAAGACAAAGGCCTGATGCGAAAACGCTGCTGTCTCACCCCTGGATCCTAAACTGTAGACGTGTCCTGCAGTC TTCTCTTCGTCATAGCGGAACATTAAGAACTATAAAGGATGATGGTTCTGCAGTTGCAGAAGTTTCTGGTGGCGACCATA AGAGCACTGGTGAAGGATCTTCTGTGGAGAAAGAGGACTCTGCAAAAGAGTTTTCAACTGGGGAAGCTAATAGCAGGAAA TCTCATGAAGACAACGCTTCAGATTCTAATTTTTCCAACGAGAGAACAGAGAAGGAAGATGATATTCCATCAGATCAGGT TCTTACTTTAGCCATTCGTGAGAAGTCATTTCTACGAACTGGTTCTGGCAATCTCTCTTCTAGTATAGAAGTGGTTAGTG CTGAGCCAACTGGCACTGAAACTTCAAATGCTAAAGACCTTCATGAAGTCATAATGAATGGAGAAGTTGAATCTCCACAA TCAAGAGGAAAGGCTAATATGGCTGTAGGAAAAGACAGTTCTATCAATAATCGCACTAAACCATTTGCTTTTGAACCAAG AGGACAAGATAGTGGTTCCCTAAAGGCAATGAAGATACCGCCCCCTGTGGAAGGAAATGAGCTGAGTAGATTTAGTGACC CTCCAGGAGATGCCTACTTAGATGACTTATTTCATCCATCAGATAAGCAATCTGGGGAGGTTGTGGCTGAGGCATCCACA TCTACATCTACTTCACATATAGCTAAAGGTAATGTATCTATGAATGATGGTGGGAAGAATGACCTTGCCAAAGAGTTGAG GGCTACAATTGCTCGAAAGCAATGGGAGAAGGAGAGTGAAATTGGGCAGGAAAACAATGGTGGGAACCTTTTACACCGAG TGATGATAGGTGTTCTAAAAGACGATGTTATTGATATAGATGGTTTGGTCTTTGATGACAAACTTCCTGGAGAAAACCTT TTTCCTCTACAGGCCGTTGAGTTCAGCAAATTAGTTGGTTCTTTAAGAACAGAAGAATCAGAAGACGTGATTGTCTCTGC TTGTCAGAAACTTATTGGTATATTTCATCAACGCCCAGAGCAGAAGATTGTATTTGTTACCCAGCATGGTTTACTTCCTT TGACTGACTTGCTAGAAGTTCCTAAAACGCGCGTCATATGTTCTGTGCTTCAGCTTATAAATCAAATAGTTAAAGACAAC ACTGATTTTCAAGAAAATGCATGTCTTGTTGGATTGATTCCGGCAGTCATGAGCTTTGCAGTATCTGATCGTCCTCGAGA GATTCGTATGGAAGCGGCTTATTTTTTACAGCAGCTTTGTCAGTCAAGTTCTTTGACATTACAAATGTTTATAGCTTGCC GTGGGATACCTGTTTTGGTGGGATTTCTTGAGGCTGATTATGCCAAGTACAGGGAGATGGTTCATCTGGCTATTGATGGC ATGTGGCAGGTGTTTAAACTTCAGCAGACAACGCCTAGAAATGATTTTTGTCGGATAGCTGCAAAAAATGGGATACTCCT TAGGCTTATAAATACCCTTTATAGCTTAAATGAGTCAACTCGATTAGCTTCTATGTCTGCTGGGGGTGGATTTCTGGCTG ATGGTTCGGCTCAACGGCCACGTTCTGGTATCTTGGATCCTGCACACCCTTTTATGAATCAGAACGATGCACAGCTATCT TCAGCAGATCAGCAAGATCTCTCTAAAGTGAGGCGTGGTGTGCTGGATCATCACTTAGAGCCTATGCATGCTTCGTCTTC CCATCCTCGAAGATCAGATGCTAACTACCCAACGGATGTTGATAGACCTCAATCGAGCAATGCAGCAGCTGAATGGAAAA CTGATCCTTCTCGGGCTGAAGTTGAACCCAGACAGCAGCGTAGTAGTATTTCTGCTAACAGGACATCAACAGATAGGCCT CCAAAATTGGCAGAACCTTCTTCGAATGGGCTATCAATGACAGGAGCTACACAGCAAGAACAAGTTAGGCCTCTTCTTAG CTTGTTGGAGAAAGAGCCTCCATCTGGACGCTTTTCAGGACAGCTTGAGTATGTCCGTCAGTTTTCAGGATTAGAGAGAC ATGAAAGTGTACTCCCTTTGTTACATGCCACTGAAAAGAAAACAAATGGTGAACTAGACTTTTTGATGGCAGAATTTGCA GATGTTTCTCAACGTGGGAGGGAAAATGGAAATCTTGACTCCAGTGCTAGAGTGTCTCACAAAGTTGCTCCCAAGAAATT AGGGACTTTTGGTTCTAGTGAAGGAGCTGCTTCTACATCTGGGATTGTATCTCAGACAGCATCAGGTGTACTGTCTGGTT CAGGTGTTCTAAATGCTAGACCAGGTAGTGCTACTTCATCTGGGCTACTTTCCCACATGGTTTCATCATTGAATGCAGAT GTTGCAAGAGAGTACCTGGAAAAAGTGGCAGATCTTCTGCTTGAATTTGCACAAGCTGACACAACAGTGAAGTCGTACAT GTGTAGCCAAAGTTTGCTTAGTCGTCTTTTCCAGATGTTCAATAGGGTGGAGCCTCCTATTTTGTTGAAGATACTGAAGT GTATCAATCATCTGTCAACTGATCCAAATTGCTTAGAAAATCTTCAGCGTGCTGAAGCCATTAAACACTTGATACCAAAT CTTGAACTCAAAGAAGGGACTCTTGTATCAGAGATACATCATGAAGTTCTGAACGCACTGTTCAATTTATGCAAGATAAA TAAGAGAAGACAGGAACAAGCAGCTGAAAATGGAATCATTCCCCATTTGATGCAATTCATCACATCAAATTCTCCCCTGA AACAATATGCGTTGCCTCTGCTATGTGACATGGCTCATGCATCTCGCAACTCAAGGGAGCAGTTAAGGGCTCATGGTGGT TTGGATGTCTATTTGAACCTTCTTGAGGATGAACTTTGGTCTGTGACAGCACTAGATTCAATTGCTGTTTGCTTAGCCCA TGACAATGACAACAGGAAGGTTGAACAATCATTGCTGAAAAAGGACGCAGTTCAGAAGCTTGTGAAGTTCTTCCAGAGCT GTCCTGAGCAACATTTTGTACACATATTGGAGCCATTTTTGAAAATCATCACAAAATCTTCCCGGATCAATACCACATTG GCTGTTAACGGATTAACACCATTGCTCATTGCAAGGCTTGATCATCAGGATGCTATAGCTCGTCTTAATTTACTCAGGCT AATAAAGGCTGTTTATGAGCATCATCCGCAGCCCAAGAAGCTGATTGTGGAGAACGATCTTCCTGAGAAACTTCAAAACT TAATAGGGGAACGGAGAGATGGACAAGTGTTGGTGAAACAGATGGCTACTTCATTGCTTAAAGCTCTACACATCAACACC GTATTGTAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0527900.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSRQSTSSAFTKSKTLDNKYMLGDEIGKGAYGRVYKGLDLENGDFVAIKQVSLENIAQEDLNIIMQEIDLLKNLNHKNIV KYLGSLKTKSHLHIILEYVENGSLANIIKPNKFGPFPESLVAVYIAQVLEGLVYLHEQGGLVKLADFGVATKLTEADINT HSVVGTPYWMAPEVIEMSGVCAASDIWSVGCTVIELLTCVPPYYDLQPMPALFRIVQDEQPPIPDSLSPNITDFLHQCFK KDARQRPDAKTLLSHPWILNCRRVLQSSLRHSGTLRTIKDDGSAVAEVSGGDHKSTGEGSSVEKEDSAKEFSTGEANSRK SHEDNASDSNFSNERTEKEDDIPSDQVLTLAIREKSFLRTGSGNLSSSIEVVSAEPTGTETSNAKDLHEVIMNGEVESPQ SRGKANMAVGKDSSINNRTKPFAFEPRGQDSGSLKAMKIPPPVEGNELSRFSDPPGDAYLDDLFHPSDKQSGEVVAEAST STSTSHIAKGNVSMNDGGKNDLAKELRATIARKQWEKESEIGQENNGGNLLHRVMIGVLKDDVIDIDGLVFDDKLPGENL FPLQAVEFSKLVGSLRTEESEDVIVSACQKLIGIFHQRPEQKIVFVTQHGLLPLTDLLEVPKTRVICSVLQLINQIVKDN TDFQENACLVGLIPAVMSFAVSDRPREIRMEAAYFLQQLCQSSSLTLQMFIACRGIPVLVGFLEADYAKYREMVHLAIDG MWQVFKLQQTTPRNDFCRIAAKNGILLRLINTLYSLNESTRLASMSAGGGFLADGSAQRPRSGILDPAHPFMNQNDAQLS SADQQDLSKVRRGVLDHHLEPMHASSSHPRRSDANYPTDVDRPQSSNAAAEWKTDPSRAEVEPRQQRSSISANRTSTDRP PKLAEPSSNGLSMTGATQQEQVRPLLSLLEKEPPSGRFSGQLEYVRQFSGLERHESVLPLLHATEKKTNGELDFLMAEFA DVSQRGRENGNLDSSARVSHKVAPKKLGTFGSSEGAASTSGIVSQTASGVLSGSGVLNARPGSATSSGLLSHMVSSLNAD VAREYLEKVADLLLEFAQADTTVKSYMCSQSLLSRLFQMFNRVEPPILLKILKCINHLSTDPNCLENLQRAEAIKHLIPN LELKEGTLVSEIHHEVLNALFNLCKINKRRQEQAAENGIIPHLMQFITSNSPLKQYALPLLCDMAHASRNSREQLRAHGG LDVYLNLLEDELWSVTALDSIAVCLAHDNDNRKVEQSLLKKDAVQKLVKFFQSCPEQHFVHILEPFLKIITKSSRINTTL AVNGLTPLLIARLDHQDAIARLNLLRLIKAVYEHHPQPKKLIVENDLPEKLQNLIGERRDGQVLVKQMATSLLKALHINT VL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 1357 1357 0.0
PANTHER 1 1357 1357 0.0
SUPERFAMILY 11 269 259 5.62E-77
Gene3D 17 139 123 5.4E-34
CDD 19 258 240 7.298E-159
ProSiteProfiles 20 258 239 39.312
Pfam 21 258 238 3.7E-55
ProSitePatterns 26 49 24 -
Gene3D 140 287 148 1.5E-36
MobiDBLite 282 345 64 -
MobiDBLite 297 344 48 -
MobiDBLite 397 435 39 -
MobiDBLite 479 499 21 -
Gene3D 565 769 205 3.3E-16
SUPERFAMILY 570 1254 685 1.02E-37
SMART 598 638 41 6.2
MobiDBLite 776 805 30 -
MobiDBLite 819 898 80 -
MobiDBLite 828 852 25 -
MobiDBLite 863 898 36 -
Gene3D 1018 1359 342 5.5E-24
SMART 1101 1145 45 110.0
SMART 1147 1186 40 7.9
SUPERFAMILY 1230 1354 125 1.21E-5

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0527900.7, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…